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第三届中国猪业科技大会暨中国畜牧兽医学会2019年学术年会

作者：汪楷庭付璐孟庆利武建亮周海深丁向东国家畜禽工程实验室农业部动物遗传育种与繁殖重点开放实验室中国农业大学动物科技学院北京中育种猪有限责任公司

近年来随着基因组测序相关技术的飞速发展,我们可以利用测序数据进行高精度基因定位,为重要经济性状遗传解析奠定基础。本研究以778头北京中育种猪有限责任公司的法系大白猪为样本,采集它们2016年5月至2018年末的繁殖数据,并选择总产仔... 详细信息

近年来随着基因组测序相关技术的飞速发展,我们可以利用测序数据进行高精度基因定位,为重要经济性状遗传解析奠定基础。本研究以778头北京中育种猪有限责任公司的法系大白猪为样本,采集它们2016年5月至2018年末的繁殖数据,并选择总产仔数(Total number of piglets bom,TNB),产活仔数(Number of piglets bom alive,NBA),出生窝重(Weight of piglets born,WPB),校正21日窝重(Correct Weight of piglets aged21 days,CW21)和胎间距(Calving Interval,CI)等5种繁殖性状。芯片数据由所选样本个体经KPS PorcineChip检测得到,利用基因型填充技术,基于350头10X测序深度个体作为参考群体,将芯片填

关键词：繁殖性状大白猪全基因组关联分析

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猪整合素β_1基因CRS-PCR多态性与产仔数的关联性分析

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遗传 2012年第7期34卷 879-886页

作者：郭良勇傅金銮王爱国中国农业大学动物科学技术学院畜禽育种国家工程实验室农业部畜禽遗传育种重点开放实验室北京100193

文章采用CRS-RFLP技术对长白猪、大白猪和杜洛克猪3个品种的整合素β1基因第5外显子T32207C位点及第7外显子A35230G位点进行单核苷酸多态性分析,并将基因多态性与猪的产仔数进行关联分析。结果表明:32207多态位点的基因型效应对3个品种... 详细信息

文章采用CRS-RFLP技术对长白猪、大白猪和杜洛克猪3个品种的整合素β1基因第5外显子T32207C位点及第7外显子A35230G位点进行单核苷酸多态性分析,并将基因多态性与猪的产仔数进行关联分析。结果表明:32207多态位点的基因型效应对3个品种的总产仔数(TNB)和产活仔数(NBA)影响均不显著;35230多态位点的基因型效应对大白猪和长白猪头胎、二胎及所有胎次的TNB和NBA的影响达到显著(P<0.05)或者极显著水平(P<0.01),基因型GG、AG与AA对产仔数的影响存在差异,其效应为GG,AG>AA。可见整合素β1基因35230位点的G等位基因对大白猪和长白猪的产仔数性状有显著影响。

关键词： CRS-PCR 整合素β1基因多态性产仔数猪

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利用古代DNA信息研究黄河流域家猪的起源驯化

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科学通报 2012年第12期57卷 1011-1018页

作者：王志向海袁靖罗运兵赵兴波中国农业大学动物科技学院畜禽育种国家工程实验室农业部动物遗传育种与繁殖重点开放实验室北京100193 中国社会科学院考古研究所北京100710 武汉大学历史学院武汉430077

猪的起源驯化一直是人们关注的科学问题.古DNA技术可为家猪起源驯化研究提供更为直接的科学证据.已有研究表明,中国家猪在黄河中下游流域曾发生过独立的驯化过程,但黄河上游的古代猪样品研究尚属空白.本研究选取黄河流域的3个遗址出土... 详细信息

猪的起源驯化一直是人们关注的科学问题.古DNA技术可为家猪起源驯化研究提供更为直接的科学证据.已有研究表明,中国家猪在黄河中下游流域曾发生过独立的驯化过程,但黄河上游的古代猪样品研究尚属空白.本研究选取黄河流域的3个遗址出土的14个古代猪样本为实验材料,通过DNA提取、PCR扩增和DNA测序,结合现代不同品种家猪、野猪及黄河中下游猪古DNA序列信息,系统分析了我国家猪的起源驯化关系.实验共获得5个古代猪样本mtDNAD-loop 179bp的DNA序列,包括2个湖北青龙泉遗址样本和3个青海喇家遗址样本.序列比对分析发现,湖北青龙泉遗址与青海喇家遗址的样本分别共享1种单倍型.结合现代不同品种猪、野猪及黄河中下游猪古DNA序列信息,发现湖北青龙泉遗址样本与山西贾湖遗址的部分古代样本具有相同的单倍型,青海喇家遗址的样本与山西高红遗址和陶寺遗址的另外部分样本具有相同的单倍型,并且这2个单倍型对应于中国现代猪种的2个主单倍型,说明黄河上游与中下游的猪具有相同的驯化中心.本研究填补了黄河流域上游古代猪DNA研究的空白,为中国家猪的起源驯化研究提供了新的科学佐证.

关键词：古DNA 猪黄河流域起源驯化

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家鸡起源于黄河流域的古DNA证据

家鸡起源于黄河流域的古DNA证据

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第十七次全国动物遗传育种学术讨论会

作者：向海王曦 Michi Hofreiter 赵兴波袁靖高建强于保全罗运兵周慧蔡大伟张有文陈晓勇中国农业大学畜禽育种国家工程实验室农业部动物遗传育种与繁殖重点开放实验室动物科技学院北京 100193 Department of Biology(Area 2) the University of YorkWentworth WayHeslington(A 中国社会科学院考古研究所北京 100710 河北省文物研究所河北石家庄 050031 河北省徐水县文物管理所河北徐水 072550 湖北省文物考古研究所湖北武汉430077 吉林大学边疆考古研究中心吉林长春130023

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畜禽基因组选择研究进展

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科学通报 2011年第25期56卷 2212-2222页

作者：张哲张勤丁向东中国农业大学动物科技学院农业部动物遗传育种与繁殖重点开放实验室畜禽育种国家工程实验室北京100193

基因组选择是同时对高密度全基因组标记的选择,也是一种标记辅助选择.此方法能够在提高育种值估计准确性的同时,通过早期选种缩短世代间隔、降低近交、加速遗传进展.随着畜禽高密度全基因组SNP芯片的问世,基因组选择方法正在影响着传统... 详细信息

基因组选择是同时对高密度全基因组标记的选择,也是一种标记辅助选择.此方法能够在提高育种值估计准确性的同时,通过早期选种缩短世代间隔、降低近交、加速遗传进展.随着畜禽高密度全基因组SNP芯片的问世,基因组选择方法正在影响着传统的畜禽遗传评估体系.在多数奶业发达国家,基因组选择方法正逐渐取代传统奶牛遗传评估方法,成为奶牛遗传评估的"标准"方法.近年来,针对基因组选择的方法、影响因素、应用策略和育种方案的研究大量涌现.基因组选择已经成为当前动物、植物及水产生物遗传育种领域的研究热点.本文综述了基因组选择的计算方法、准确性的来源及影响因素以及基因组选择在畜禽遗传育种中的应用现状,同时对当前存在的问题进行总结,并对基因组选择的理论发展和应用前景进行展望.

关键词：基因组选择基因组育种值标记辅助选择畜禽育种

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猪EPHA1基因多态性及其与产仔数的关联性分析

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中国畜牧杂志 2011年第21期47卷 1-5页

作者：田明明王爱国傅金銮中国农业大学动物科学技术学院畜禽育种国家工程实验室农业部畜禽遗传育种重点开放实验室北京100193

研究利用PCR-SSCP技术对大白、长白和杜洛克猪EPHA1基因外显子多态性及其与产仔数的关系进行了研究。结果表明：在第15外显子上检测到一个发生G→C颠换的突变位点,形成3种基因型。对于大白猪,3-6胎的GG型个体的产活仔数（NBA）比CC型个... 详细信息

研究利用PCR-SSCP技术对大白、长白和杜洛克猪EPHA1基因外显子多态性及其与产仔数的关系进行了研究。结果表明：在第15外显子上检测到一个发生G→C颠换的突变位点,形成3种基因型。对于大白猪,3-6胎的GG型个体的产活仔数（NBA）比CC型个体高出1.66头（P〈0.05）;在所有胎次中,GG型个体的总产仔数（TNB）比CC型个体高出0.2头（P〈0.01）。对于长白猪,第2胎GG型个体的TNB和NBA分别比CC型个体高出1.41头（P〈0.05）和1.46头（P〈0.05）;所有胎次中,GC型个体TNB比CC型个体高出0.67头（P〈0.05）。对于杜洛克猪,3种基因型个体的TNB和NBA差异不显著（P〉0.05）。对于试验大白猪群体而言,该多态位点GG基因型可作为TNB性状的标记基因型。

关键词： PCR-SSCP EPHA1 产仔数猪

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影响仔猪血清免疫球蛋白浓度及早期发育性能的因素研究

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中国畜牧杂志 2011年第7期47卷 18-20页

作者：郑杰王俊玲翟丽维魏荣贵薛明黄海鹏王楚端农业部畜禽遗传育种重点开放实验室畜禽育种国家工程实验室中国农业大学动物科技学院北京100193 北京市畜牧兽医总站北京100107 全国畜牧总站北京100125 长春中医药大学吉林长春130117

本研究采用酶联免疫吸附分析法(ELISA)对长白、大白和杜洛克3个品种初生仔猪血清中IgA、IgM、IgG浓度进行了测定,并对其影响因素及其对早期仔猪体重的影响进行分析。结果表明:品种和胎次对仔猪血清IgA浓度的影响差异极显著(P0.05)。品... 详细信息

本研究采用酶联免疫吸附分析法(ELISA)对长白、大白和杜洛克3个品种初生仔猪血清中IgA、IgM、IgG浓度进行了测定,并对其影响因素及其对早期仔猪体重的影响进行分析。结果表明:品种和胎次对仔猪血清IgA浓度的影响差异极显著(P<0.01),品种效应对IgM浓度有显著影响(P<0.05),初生重对IgG浓度影响极显著(P<0.01),性别对免疫球蛋白浓度无显著影响(P>0.05)。品种及初生重对仔猪7日龄体重、14日龄体重、0-7日龄日增重、0-14日龄日增重影响极显著(P<0.01)。仔猪血清IgG浓度与7日龄体重存在正相关关系,相关系数为0.1562(P<0.01)。

关键词： IgA IgM IgG ELISA 仔猪

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全基因组关联研究理论及其在流行病中的应用

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中华流行病学杂志 2011年第10期32卷 1043-1045页

作者：卢昕阚飙刘剑锋张勤中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 中国农业大学动物科技学院农业生物技术国家重点实验室农业部畜禽遗传育种重点开放实验室

全基因组关联研究（GWAS）利用遍布于全基因组范围的分子标记（主要为单核苷酸多态性，SNP）并借助强大统计学工具，对影响某些复杂性状如疾病易感的遗传变异进行鉴定和分析。

关键词：全基因组关联研究流行病

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非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中与杂合子相伴产生的非目的条带的鉴定

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农业生物技术学报 2010年第3期18卷 616-622页

作者：王晓通连林生赵春江邓学梅吴常信中国农业大学农业生物技术国家重点实验室农业部畜禽遗传育种重点开放实验室云南农业大学动物科技学院中国科学院海洋研究所

研究旨在鉴定两条在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中总是伴随杂合子出现的非目的条带。实验切胶回收了目的条带和非目的条带,以此为模板进行第二次PCR扩增,然后将PCR产物按不同组合进行混合并施加不同处理再次进行电泳,另外,人工合成了四条... 详细信息

研究旨在鉴定两条在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中总是伴随杂合子出现的非目的条带。实验切胶回收了目的条带和非目的条带,以此为模板进行第二次PCR扩增,然后将PCR产物按不同组合进行混合并施加不同处理再次进行电泳,另外,人工合成了四条包含该缺失位点的寡核苷酸单链,对条带形成的过程进行了模拟。结果表明以两条非目的条带为模板的第2次PCR产物的电泳结果均有4条带,与杂合子样本4条带的迁移率完全一致,以2条目的条带为模板的第2次PCR产物电泳条带的迁移率分别与其本身保持一致;将以2条目的条带为模板的第2次PCR产物混合并经过变性复性后,其结果出现非目的条带和目的条带,也与杂合子样本4条带的迁移率完全一致,而如果只是简单混合并未经过变性复性处理,其电泳结果只出现目的条带。另外,在利用寡核苷酸单链进行模拟的实验中发现,异源双链迁移率较低,形成了非目的条带,而正常双链迁移率较高,形成目的条带。结果提示,这种与杂合子相伴产生的非目的条带,并不是非特异性扩增的结果,而是由于模板为缺失突变杂合子,在复性过程中,PCR产物中的一部分碱基缺失的正负单链会与不缺失的正负单链发生互补,而在发生碱基缺失的位置,会有突环产生,产生的突环进而导致杂合双链迁移率降低,最终形成了两条迁移率较低的非目的条带。

关键词：非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳非目的条带碱基缺失 DNA突环

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基于EM和规则算法的半同胞家系单倍型推断方法

基于EM和规则算法的半同胞家系单倍型推断方法

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第十五次全国动物遗传育种学术讨论会

作者：丁向东张勤农业生物技术国家重点实验室畜禽育种国家工程实验室农业部动物遗传育种与繁殖重点开放实验室中国农业大学动物科技学院

引言单倍型(Haplotype)是指同一染色体上多个基因座位等位基因的组合,它能同时利用多个基因座位的遗传信息,比单基因座位分析更有效力,在进化、基因定位、基因组选择等研究领域有广阔的应用前景。目前,

关键词：单倍型推断 EM算法半同胞家系最小重组原则

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