检索结果-内蒙古大学图书馆

广东农业科学 2024年第2期51卷 112-123页

作者：敖广宇陈庚华夏燚琳罗文华南农业大学动物科学学院/广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室/农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室广东广州510642

【目的】腹脂过度沉积会降低肉鸡抗病力和屠宰率。RNA可变剪接是影响基因功能的重要调控方式,对肉鸡腹脂沉积过程的RNA可变剪接事件进行系统分析,有助于进一步了解肉鸡腹脂沉积的分子调控机理。【方法】利用高脂饲喂肉鸡和普通饲喂肉鸡... 详细信息

【目的】腹脂过度沉积会降低肉鸡抗病力和屠宰率。RNA可变剪接是影响基因功能的重要调控方式,对肉鸡腹脂沉积过程的RNA可变剪接事件进行系统分析,有助于进一步了解肉鸡腹脂沉积的分子调控机理。【方法】利用高脂饲喂肉鸡和普通饲喂肉鸡肝脏组织和腹脂组织的转录组测序结果,鉴定高脂饲喂过程中肉鸡腹脂和肝脏组织的差异表达和差异剪接基因。采用GO功能注释、KEGG通路富集分析和Metascape富集分析对显著差异剪接基因进行分析,并对显著差异剪接事件进行可视化处理,以及分析调控这些差异剪接事件的剪接因子。【结果】对高脂饲喂肉鸡与普通饲喂肉鸡的腹脂和肝脏组织进行转录组测序,在腹脂组织中发现233个显著差异表达基因和349个显著差异剪接基因,对显著差异剪接基因进行富集分析,发现显著差异剪接基因主要富集于细胞分裂、细胞生长等细胞增殖相关生物学进程,还富集于甘油磷脂代谢和胰岛素信号通路等脂肪生成相关通路。在肝脏组织中发现276个显著差异表达基因和224个显著差异剪接基因,对显著差异剪接基因进行富集分析,发现显著差异剪接基因主要富集于蛋白质乙酰化、蛋白质内部氨基酸乙酰化和mRNA加工等细胞代谢相关生物进程,还富集于胰岛素信号通路、胰高血糖素信号通路、AMPK信号通路等脂肪生成相关通路。在腹脂和肝脏的显著差异剪接基因中,共筛选到影响肉鸡腹脂沉积性状的相关候选基因4个,包括GPAT4、RELCH、CYP39A1和PPARA。【结论】研究结果初步揭示高脂饲喂下肉鸡腹脂和肝脏组织的RNA可变剪接调控规律。推断高脂饲喂可能通过影响基因可变剪接过程,进而激活前脂肪细胞的增殖和脂肪生成相关细胞代谢,从而导致肉鸡的腹脂沉积现象;剪接因子对靶基因的调控显著参与影响肉鸡的腹脂沉积过程。

关键词：杏花鸡高脂饲料腹脂沉积转录组可变剪接差异表达基因

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ARG2基因在ALV-J感染DF-1细胞中的作用研究

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黑龙江畜牧兽医 2024年第7期 74-80页

作者：赵永霞赵昌滨梁锦萍李红梅华南农业大学动物科学学院广州510642 农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室广州510642 广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室广州510642

为了研究线粒体相关基因精氨酸酶2(arginase-2,ARG2)在J亚群禽白血病病毒(J subgroup leukosis virus,ALV-J)感染中的作用,试验采用qRT-PCR方法分别检测感染ALV-J后试验组鸡不同器官和DF-1细胞中ARG2基因的表达情况,分析ARG2基因和ALV-... 详细信息

为了研究线粒体相关基因精氨酸酶2(arginase-2,ARG2)在J亚群禽白血病病毒(J subgroup leukosis virus,ALV-J)感染中的作用,试验采用qRT-PCR方法分别检测感染ALV-J后试验组鸡不同器官和DF-1细胞中ARG2基因的表达情况,分析ARG2基因和ALV-J感染之间是否有联系;设计ARG2基因的过表达载体(过表达ARG2组)和干扰片段(干扰ARG2组)转染DF-1细胞,并以pcDNA3.1或Si-NC为对照,采用qRT-PCR方法检测ARG2基因的过表达和干扰效率;采用qRT-PCR、Western-blot和间接免疫荧光试验检测过表达或干扰ARG2基因后感染ALV-J的DF-1细胞中gp85基因及Env蛋白表达情况,从而综合分析ARG2基因对ALV-J复制的影响。结果表明:与对照组相比,试验组鸡的脾脏、法氏囊中ARG2基因相对表达量极显著降低(P<0.01),而肾脏中ARG2基因相对表达量极显著升高(P<0.01)。同时在体外试验中,ARG2基因在感染后第6,12小时时相对表达量降低(P>0.05或P<0.05),而在第24,48,74,108小时相对表达量显著或极显著升高(P<0.05或P<0.01)。与对照组相比,过表达ARG2组ARG2基因相对表达量极显著升高(P<0.01),干扰ARG2组ARG2基因相对表达量降低(P>0.05或P<0.05),并选择干扰片段SI-ARG2-001进行后续试验。过表达ARG2基因后,与对照组相比,过表达ARG2组第12,24小时的gp85基因相对表达量显著或极显著升高(P<0.05或P<0.01),Env蛋白表达量显著上调(P<0.05),Env免疫荧光信号强度增强;干扰ARG2基因后,与对照组相比,干扰ARG2组第6,12,48小时的gp85基因相对表达量显著或极显著降低(P<0.05或P<0.01),Env蛋白表达量显著下调(P<0.05),Env免疫荧光信号强度减弱。说明ARG2基因可以促进ALV-J在DF-1细胞中的复制。

关键词：线粒体相关基因精氨酸酶2(ARG2) J亚群禽白血病病毒(ALV-J) 病毒复制 DF-1细胞

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中国地方品种杏花鸡的群体全基因组选择印记分析

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中国家禽 2023年第3期45卷 30-37页

作者：孔少芬罗威郑茗聂庆华华南农业大学动物科学学院广东广州510642 广东省农业动物基因组学和分子育种重点实验室农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室广东广州510642 广东省农业科学院动物科学研究所畜禽育种国家重点实验室广东省畜禽育种与营养研究重点实验室广东广州510640

试验旨在挖掘杏花鸡品种的群体特征性选择印记,筛选杏花鸡特征性基因和核心基因。研究基于已报道的来源于22个群体的157只鸡的全基因组数据,通过窗口内群体间遗传分化系数(ZFst)及群体内杂合度(ZHp),对其中的杏花鸡群体(n=9)进行全基因... 详细信息

试验旨在挖掘杏花鸡品种的群体特征性选择印记,筛选杏花鸡特征性基因和核心基因。研究基于已报道的来源于22个群体的157只鸡的全基因组数据,通过窗口内群体间遗传分化系数(ZFst)及群体内杂合度(ZHp),对其中的杏花鸡群体(n=9)进行全基因组选择印记分析,挖掘杏花鸡群体特征性选择印记,对候选基因进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,蛋白相互作用网络分析和核心基因的筛选。结果显示:通过ZFst与ZHp,分别鉴定到172个杏花鸡群体基因组潜在受选择基因,其中包含29个共同受选择基因,包括COL3A1、LMO3、TBC1D14、COL22A1、EP300、TMTC3、KCNE5、PAICS、SGK1、DERA、GPR20、LHFPL6、PREX1、PIK3C2G、HEPACAM2、KITLG、KIAA0232、SMAD1、RIMKLB、SLIT2、LONRF1、NXT2、LDB2、TSNARE1、ABLIM2、VPS50、TCF12、ACSL4与FOXJ2;两种方法共鉴定到的受选择基因进行GO分析,分别富集到68条、82条和16条通路,主要涉及磷和含磷化合物代谢、细胞分化的调节、连接酶活性、转录因子复合体等;杏花鸡特征性核心相关基因为EP300和SMAD1,EP300和SMAD1均参与杏花鸡的肌肉和脂肪的发育和代谢过程。研究表明筛选出的群体特征性基因和核心基因可能通过调节磷代谢和细胞分化等途径影响杏花鸡的形态、肉质和风味。

关键词：杏花鸡遗传多样性基因组选择印记核心基因

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基于全基因组重测序的罗坑鸡遗传结构分析及特征位点挖掘

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中国畜牧杂志 2024年第10期60卷 100-105页

作者：严霞莫玙孔少芬罗威王春兰陈细浩钟澜罗成龙蔡柏林聂庆华广东省农业科学院动物科学研究所广东省畜禽育种与营养研究重点实验室广东广州510000 猪禽种业全国重点实验室广东广州510000 华南农业大学动物科学学院广东广州510000 广东省农业动物基因组学和分子育种重点实验室农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室广东广州510000 韶关市畜牧研究所广东韶关512000

本文旨在研究新资源罗坑鸡与其他著名广东地方品种鸡的遗传关系和挖掘罗坑鸡的特征性位点。对20个罗坑鸡血样进行DNA提取和30×全基因组重测序。同时,将这些数据与本课题组已有的5个广东鸡种(共77只)样本的数据相结合,采用系统进化... 详细信息

本文旨在研究新资源罗坑鸡与其他著名广东地方品种鸡的遗传关系和挖掘罗坑鸡的特征性位点。对20个罗坑鸡血样进行DNA提取和30×全基因组重测序。同时,将这些数据与本课题组已有的5个广东鸡种(共77只)样本的数据相结合,采用系统进化树、主成分分析和祖先血缘成分分析等方法分析群体结构,采用群体分化指数分析方法挖掘罗坑鸡的特征位点。结果表明:系统进化树显示所有罗坑鸡在进化上明显聚为一类,与其他广东鸡种有明显分群;主成分分析发现罗坑鸡的遗传成分与其他广东鸡种有明显区分,但群体内的均一性较差;祖先血缘成分分析揭示罗坑鸡存在血缘混杂现象,纯血个体占比较少;群体分化指数分析发现罗坑鸡具有特异性的分化位点,可用于品种鉴定和提纯。本研究结果表明,罗坑鸡与其他5个品种在核基因组水平上有明显差异;存在血缘混杂现象;有独特的特异性位点。本研究结果将填补目前对于罗坑鸡研究的空白,并为未来罗坑鸡种质资源创新利用做了理论支撑。

关键词：罗坑鸡全基因组重测序系统进化树主成分分析血缘成分分析群体分化指数

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中国地方家鸡群体遗传与表型多样性及其保护现状

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养禽与禽病防治 2023年第8期 29-35页

作者：罗威郑茗唐盈盈林楚晓黎镇晖罗成龙张细权聂庆华广东省农业科学院动物科学研究所畜禽育种国家重点实验室广东省畜禽育种与营养研究重点实验室广州510645 广东省农业动物基因组学和分子育种重点实验室农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室广州510640

我国是全球地方家鸡遗传资源最为丰富的国家之一,以我国地方鸡种或以我国优良地方鸡种结合国外高生产性能的商业鸡种杂交选育而成的黄羽肉鸡在我国的肉鸡产业中占据着重要地位,因此加强国内主要地方鸡种的保种、开发及利用具有重要的经... 详细信息

我国是全球地方家鸡遗传资源最为丰富的国家之一,以我国地方鸡种或以我国优良地方鸡种结合国外高生产性能的商业鸡种杂交选育而成的黄羽肉鸡在我国的肉鸡产业中占据着重要地位,因此加强国内主要地方鸡种的保种、开发及利用具有重要的经济意义,而充分了解国内主要地方鸡种的群体遗传与表型多样性可为地方鸡种的保种、开发及利用提供重要的理论支撑。同时,我国地方家鸡所累计的丰富遗传与表型多样性,如斗鸡的肌肉发达、体型大、斗性强和河田鸡的鹿角冠等特色性状表型,也是人类了解遗传变异与表型变异关系的良好素材。本文就我国地方家鸡的起源、丰富的遗传与表型多样性及目前的保种现状进行综述,旨在为我国地方家鸡品种的保种、开发与利用提供参考。

关键词：中国地方家鸡群体遗传多样性群体表型多样性保种现状

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基于ASReml的江村黄鸡毛囊性状的遗传参数估计

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养禽与禽病防治 2023年第6期 38-40页

作者：廖家浩李卓航谭量天郑茗聂庆华华南农业大学动物科学学院广州510642 广东省农业动物基因组学和分子育种重点实验室农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室广州510642

本研究以广州市江丰实业股份有限公司所培育的江村黄鸡作为实验材料,屠宰测定个体屠体重以及背部和腿部2个部位的毛囊密度及其大小性状,评价毛囊性状与屠体重,体斜长间的遗传相关和表型相关,为种鸡选育和生产管理提供一定参考依据。结... 详细信息

本研究以广州市江丰实业股份有限公司所培育的江村黄鸡作为实验材料,屠宰测定个体屠体重以及背部和腿部2个部位的毛囊密度及其大小性状,评价毛囊性状与屠体重,体斜长间的遗传相关和表型相关,为种鸡选育和生产管理提供一定参考依据。结果表明,屠体重、背部毛囊大小、背部毛囊密度、腿部毛囊大小和腿部毛囊密度的遗传力分别为0.325、0.506、0.137和0.151,性状间遗传相关在-0.283~0.843之间,表型相关在-0.121~0.233之间。结论表明,背部毛囊密度、大小属于中高遗传力性状,腿部毛囊密度、大小属于低遗传力性状,背部毛囊大小和腿部毛囊大小、体斜长和屠体重之间的表型相关极显著。

关键词：黄羽肉鸡毛囊密度毛囊大小遗传参数

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鱼腥味鸡蛋的形成:从营养到遗传

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中国家禽 2021年第3期43卷 83-88页

作者：张思雨郑茗聂庆华华南农业大学动物科学学院广东广州510642 农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室广东省农业动物基因组学和分子育种重点实验室广东广州510642

鸡蛋的鱼腥味问题从首次提出到目前为止已接近一个世纪。鱼腥味影响鸡蛋的品质和风味,降低消费者的购买欲望,给蛋鸡养殖带来经济损失。文章概括了鱼腥味鸡蛋的形成机制,阐述了影响鱼腥味鸡蛋形成的因素,总结目前研究存在的问题,展望未... 详细信息

鸡蛋的鱼腥味问题从首次提出到目前为止已接近一个世纪。鱼腥味影响鸡蛋的品质和风味,降低消费者的购买欲望,给蛋鸡养殖带来经济损失。文章概括了鱼腥味鸡蛋的形成机制,阐述了影响鱼腥味鸡蛋形成的因素,总结目前研究存在的问题,展望未来研究方向,以期为相关研究提供参考。

关键词：鸡蛋鱼腥味含黄素单氧化酶3 三甲胺氧化三甲胺

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不同品种鸡腹脂游离脂肪酸差异比较及转录组分析

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中国家禽 2025年第2期47卷 1-11页

作者：赵国玺符蓉李秋梅邹佳佳雷芷琳张细权华南农业大学动物科学学院广东广州510642 农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室广东广州510642

为挖掘鸡腹脂中游离脂肪酸的候选基因,试验以上市日龄的杏花鸡、沙栏鸡、清远麻鸡、胡须鸡、怀乡鸡、文昌鸡和固始鸡为研究对象,测定其游离脂肪酸的组成及含量,并选取游离脂肪酸差异较大的鸡进行转录组测序分析。结果显示:胡须鸡腹脂中... 详细信息

为挖掘鸡腹脂中游离脂肪酸的候选基因,试验以上市日龄的杏花鸡、沙栏鸡、清远麻鸡、胡须鸡、怀乡鸡、文昌鸡和固始鸡为研究对象,测定其游离脂肪酸的组成及含量,并选取游离脂肪酸差异较大的鸡进行转录组测序分析。结果显示:胡须鸡腹脂中的C18∶1n9c、C16∶0和C18∶0显著高于其它6个品种鸡(P<0.05);清远麻鸡腹脂中的C18∶2n6c显著高于其它6个品种鸡(P<0.05);沙栏鸡腹脂中的C16∶1n7显著高于固始鸡、杏花鸡和清远麻鸡(P<0.05)。此外,杏花鸡腹脂中的C20∶4n6不仅显著高于固始鸡、怀乡鸡、文昌鸡、沙栏鸡(P<0.05),且杏花鸡腹脂中的C20∶4n6与固始鸡差异最大,C18∶3n3与固始鸡差异倍数也较大(P<0.05),其差异游离脂肪酸与差异基因显著富集在α-亚麻酸代谢等通路中(P<0.05)。ABHD3、PINK1、ACOX1、OSBPL2、GPD2、STAU1、ALDH2、CIDEA、TLCD1、IGFBP2、IRS2基因的下调与C18∶3n3/C20∶4n6的含量极显著负相关(P<0.01)。结果表明,不同品种鸡腹脂中主要的脂肪酸含量存在差异,通过对固始鸡与杏花鸡进行代谢组与转录组联合分析,在腹脂中发现11个与风味有关的C20∶4n6和C18∶3n3的形成有关基因,为后续研究与风味有关的游离脂肪酸提供理论依据。

关键词：鸡腹脂游离脂肪酸风味候选基因

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优质鸡肤色的形成机理及候选基因研究进展

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中国家禽 2020年第6期42卷 1-7页

作者：任团辉张细权华南农业大学动物科学学院广东广州510642 农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室广东省农业动物基因组学和分子育种重点实验室广东广州510642

家禽的色素沉积相关性状是研究其遗传进化的良好模型。同时,鸡的皮肤色素沉积和着色能够满足消费者对不同颜色的需求。文章对近年来鸡皮肤色素沉积机制和相关基因的研究成果进行梳理和评述,重点总结了鸡的黄色皮肤色素沉积相关基因和机... 详细信息

家禽的色素沉积相关性状是研究其遗传进化的良好模型。同时,鸡的皮肤色素沉积和着色能够满足消费者对不同颜色的需求。文章对近年来鸡皮肤色素沉积机制和相关基因的研究成果进行梳理和评述,重点总结了鸡的黄色皮肤色素沉积相关基因和机制的研究成果,为培育满足消费者需求的优质黄羽肉鸡提供理论基础,也为研究家禽肤色性状调控机制提供参考。

关键词：鸡肤色类胡萝卜素黑色素分子机制

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转录组测序揭示细胞周期通路参与鸡腹脂沉积

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遗传 2019年第10期41卷 962-973页

作者：陈家辉任学义李丽敏卢诗意程湉谭量天梁少东何丹林罗庆斌聂庆华张细权罗文华南农业大学动物科学学院广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室

近年来,随着生长性状和饲料转化率的提高,中国地方品种肉鸡腹脂率不断增加,大大降低了肉鸡的品质。过多的腹脂沉积不仅降低了肉鸡的屠宰率和抗病力,而且由于脂肪较难处理,导致其被随意丢弃,污染环境。为了挖掘与中国地方品种肉鸡腹脂沉... 详细信息

近年来,随着生长性状和饲料转化率的提高,中国地方品种肉鸡腹脂率不断增加,大大降低了肉鸡的品质。过多的腹脂沉积不仅降低了肉鸡的屠宰率和抗病力,而且由于脂肪较难处理,导致其被随意丢弃,污染环境。为了挖掘与中国地方品种肉鸡腹脂沉积相关的基因和调控通路,本研究对杏花鸡分别进行高脂和普通饲料的喂养,检测腹脂沉积情况,并利用转录组测序检测高脂饲养对肝脏和腹脂组织中基因表达的影响。结果表明,喂养两周后高脂组肉鸡腹脂重和腹脂率显著增加,且腹脂细胞的直径和面积也显著增大。对两组鸡的腹脂和肝脏进行转录组测序,发现在腹脂中显著差异表达基因主要富集于细胞周期通路、PPAR(peroxisome proliferator-activated receptor)信号通路和ECM(extracellular matrix)受体信号通路中;而在肝脏中,显著差异表达基因同样显著富集于细胞周期通路中,同时也显著富集于类固醇生物合成和PPAR信号通路中。通过分析腹脂和肝脏组织中共同差异表达的基因,发现这些基因同样显著富集于细胞周期中。进一步以鸡肝癌细胞系LMH(chicken hepatoma cell)细胞和鸡前脂肪细胞系ICP(immortalized chicken preadipocytes)细胞进行体外验证,利用高脂培养基和普通培养基进行培养,结果发现48h后,高脂培养基可显著促进细胞周期进程,增加处于S期的细胞数。同时,qRT-PCR结果发现高脂培养基可显著促进细胞周期相关基因的表达。综上所述,本研究通过基因表达差异分析,发现高脂饲养可能通过激活鸡脂肪组织的细胞周期来促进前脂肪细胞增殖,进而增加腹脂沉积。该研究结果为进一步了解优质肉鸡腹脂沉积的机制提供了理论依据。

关键词：杏花鸡高脂饲料腹脂沉积细胞周期差异表达基因

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