检索结果-内蒙古大学图书馆

药学学报 2025年第2期60卷 514-525页

作者：黄钰莹陈颖王宝纬关范圆郑语嫣范菁王金铃胡秀华王晓晖北京中医药大学北京中医药研究院中药现代研究中心北京102488 安徽科技学院生物医学与健康学院安徽滁州233100 北京中医药大学中药学院北京102488 北京中医药大学生命科学学院北京102488

Auxin/indole-3-acetic acid(Aux/IAA)是植物中一个重要的基因家族,在生长素信号传导中扮演着关键的角色,参与了植物的生长、发育以及对逆境胁迫的响应和调节过程。本研究通过分析丹参(Salvia miltiorrhiza)不同羽状复叶的转录组数据筛... 详细信息

Auxin/indole-3-acetic acid(Aux/IAA)是植物中一个重要的基因家族,在生长素信号传导中扮演着关键的角色,参与了植物的生长、发育以及对逆境胁迫的响应和调节过程。本研究通过分析丹参(Salvia miltiorrhiza)不同羽状复叶的转录组数据筛选了潜在的与叶片发育相关的基因SmIAA7,设计特异引物成功从丹参中克隆了SmIAA7,并进行生物信息学分析、原核表达和纯化、亚细胞定位、生长素及非生物胁迫下的诱导表达分析。SmIAA7基因全长684 bp,编码227个氨基酸,蛋白分子质量25.3 kD。保守结构域分析表明SmIAA7含有超家族保守结构域Aux_IAA(pfam02309),序列分析及系统进化树结果表明SmIAA7和其他植物中的IAA7以及IAA14同源性较高,可能参与植物的生长发育并响应逆境胁迫。构建原核表达载体pET28a-SmIAA7并在大肠杆菌Rosetta(DE3)菌株中成功表达SmIAA7重组蛋白,纯化得到可溶性重组蛋白。亚细胞定位实验结果表明SmIAA7定位于植物细胞的细胞核中。实时荧光定量PCR结果表明,SmIAA7基因能够响应生长素的诱导导致表达水平升高。干旱、低温以及盐胁迫均能够显著提高SmIAA7基因的表达水平。本研究为进一步揭示SmIAA7在丹参叶片发育、信号传递及逆境防御中的作用奠定基础。

关键词：丹参 SmIAA7 原核表达亚细胞定位表达分析

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小鼠骨髓和腹膜腔来源巨噬细胞的功能差异

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细胞与分子免疫学杂志 2024年第3期40卷 215-221页

作者：黄镘静罗扬淦卢姿含王伟玲郝逗逗廖晗婧朱枝祥北京中医药大学中药学院北京100029 北京中医药大学北京中医药研究院中药现代研究中心北京100029

目的研究骨髓来源巨噬细胞和腹膜腔巨噬细胞的功能差异,为免疫学研究和免疫调节药物评价中巨噬细胞的选择提供依据。方法利用巨噬细胞集落刺激因子(M-CSF)诱导骨髓单核细胞分化为巨噬细胞,利用巯基乙酸盐培养基诱导腹膜炎获得腹膜腔巨... 详细信息

目的研究骨髓来源巨噬细胞和腹膜腔巨噬细胞的功能差异,为免疫学研究和免疫调节药物评价中巨噬细胞的选择提供依据。方法利用巨噬细胞集落刺激因子(M-CSF)诱导骨髓单核细胞分化为巨噬细胞,利用巯基乙酸盐培养基诱导腹膜炎获得腹膜腔巨噬细胞,两种巨噬细胞在分别经过酵母多糖(zymosan)、脂多糖(LPS)、雷西莫特(R848)和非甲基化的胞嘧啶鸟嘌呤二核苷酸寡聚体(CpG)四种Toll样受体(TLR)配体诱导后,实时荧光定量PCR测定巨噬细胞肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素6(IL-6)、巨噬细胞炎性蛋白1α(MIP-1α)和单核细胞趋化蛋白1(MCP-1)mRNA水平,ELISA检测巨噬细胞培养上清液TNF-α、IL-6、MIP-1α、MCP-1含量,流式细胞术分析细胞表面共刺激分子CD80、CD86、CD40和主要组织相容性复合体Ⅱ(MHCⅡ)的表达。结果两种巨噬细胞在经过不同TLR配体诱导后,炎症因子和趋化因子的mRNA表达水平均有不同程度的增加,腹膜腔巨噬细胞TNF-α、IL-6、MIP-1α、MCP-1分泌水平以及表面CD86和MHCⅡ表达显著高于骨髓来源巨噬细胞。结论骨髓来源巨噬细胞和腹膜腔巨噬细胞均表达炎症因子、趋化因子、共刺激分子和MHCⅡ,腹膜腔巨噬细胞具有更加完整的巨噬细胞功能,在免疫学研究和免疫调节药物评价中可以优选腹膜腔巨噬细胞。

关键词：单核细胞巨噬细胞功能差异 Toll样受体(TLR)配体

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红花水提物及羟基红花黄色素A对原发性痛经寒凝血瘀证大鼠的作用及机制研究

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北京中医药大学学报 2024年第10期47卷 1397-1407页

作者：王然孙颖焦伯阳李春李军屠鹏飞北京中医药大学中药学院北京102488 北京中医药大学北京中医药研究院中药现代研究中心北京中医药大学中医学院北京大学药学院天然药物及仿生药物国家重点实验室

目的探讨红花水提物及其主要单体成分羟基红花黄色素A改善大鼠原发性痛经寒凝血瘀证的药效及调控机制。方法取42只6~8周龄雌性SPF级SD大鼠,按随机数字表法分为空白组、模型组、布洛芬组(0.04 g/kg)、羟基红花黄色素A组(0.01 g/kg)和红... 详细信息

目的探讨红花水提物及其主要单体成分羟基红花黄色素A改善大鼠原发性痛经寒凝血瘀证的药效及调控机制。方法取42只6~8周龄雌性SPF级SD大鼠,按随机数字表法分为空白组、模型组、布洛芬组(0.04 g/kg)、羟基红花黄色素A组(0.01 g/kg)和红花水提物低(0.06 g/kg)、中(0.20 g/kg)、高(0.40 g/kg)剂量组,每组6只。采用冰水浴刺激联合苯甲酸雌二醇及缩宫素建立大鼠模型。造模第7天开始灌胃相应药物,连续6 d。干预结束后,进行扭体反应测试;称量大鼠体质量及子宫、卵巢质量,计算脏器指数;酶联免疫吸附测定(ELISA)检测大鼠子宫前列腺素E2(PGE2)、前列腺素F2α(PGF2α)含量,血浆中血栓素B_(2)(TXB_(2))、6-酮-前列腺素F1α(6-ketoPGF1α)含量;放射免疫法检测大鼠血清中雌二醇(E2)含量;苏木精-伊红染色法检测子宫组织病理状态;免疫组织化学法检测子宫组织环氧合酶(COX-2)表达;免疫荧光法检测大鼠卵巢组织卵泡刺激素受体(FSH-R)表达;蛋白质印迹法检测大鼠子宫促性腺激素释放激素受体(GnRH-R)、FSH-R表达。结果与空白组比较,模型组大鼠子宫、卵巢指数增加,子宫PGE2、PGF2α升高,血浆中TXB_(2)升高、6-keto-PGF1α降低,血清中E2升高,可见子宫组织形态紊乱,子宫COX-2表达升高,卵巢FSH-R表达升高,子宫GnRH-R、FSH-R表达升高(P<0.05)。与模型组比较,红花水提物低剂量组子宫指数降低(P<0.05);红花水提物中、高剂量组扭体次数减少,子宫、卵巢指数降低,PGE2、TXB_(2)降低,6-keto-PGF1α升高,子宫GnRH-R蛋白表达降低(P<0.05);红花水提物高剂量组PGF2α降低,子宫组织FSH-R表达降低(P<0.05);羟基红花黄色素A组大鼠扭体次数减少,子宫、卵巢指数降低,PGE2、PGF2α、TXB_(2)含量降低,子宫GnRH-R、FSH-R蛋白表达降低(P<0.05);红花水提物各剂量及羟基红花黄色素A组血清E_(2)含量降低,子宫形态得到改善,子宫COX-2、卵巢FSH-R蛋白表达降低(P<0.05)。结论红花及羟基红花黄色素A能够改善原发性痛经寒凝血瘀证大鼠的病理状态,其机制可能与调控下丘脑-垂体-卵巢轴有关。

关键词：红花羟基红花黄色素A 原发性痛经寒凝血瘀证下丘脑-垂体-卵巢轴大鼠

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中药诱导细胞周期阻滞抗肿瘤研究进展

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中国实验方剂学杂志 2023年第2期29卷 222-234页

作者：刘亚鑫魏雪娇黄惠铭欧阳里山谢锦欣王龙燕刘东晓屠鹏飞胡仲冬北京中医药大学中药学院中药现代研究中心北京100029

癌症患病率和死亡率逐年上升,已成为当今世界上造成死亡的主要原因之一。癌症的诱因多种多样,遗传、辐射、致癌物等都可能诱发癌症,细胞周期调控的异常也是诱因之一。细胞周期是一个复杂的事件序列,细胞通过该事件重复其内容并分裂。细... 详细信息

癌症患病率和死亡率逐年上升,已成为当今世界上造成死亡的主要原因之一。癌症的诱因多种多样,遗传、辐射、致癌物等都可能诱发癌症,细胞周期调控的异常也是诱因之一。细胞周期是一个复杂的事件序列,细胞通过该事件重复其内容并分裂。细胞周期有高度的组织性和条理性,以确保遗传物质的完整性。该过程依赖于许多基因和蛋白的共同调节,当这些物质发生改变时,细胞周期出现异常,导致细胞增殖失去管控,细胞凋亡被抑制,最终导致肿瘤的发生。目前,肿瘤的治疗手段有传统的手术切除、放射治疗和化学药物治疗及靶向治疗等。中药来源广泛、不良反应小,是中医药文化的瑰宝,值得进一步地研究和开发。越来越多的研究发现,多种中药能够通过诱导细胞周期阻滞发挥抗肿瘤作用,从而提升肿瘤中晚期患者的生存质量,延长患者生存期。该文首先介绍了细胞周期各时期的特点和相关调控因子,列举了细胞周期异常导致肿瘤发生的临床和实验实例,接着综述了国内外靶向细胞周期抗肿瘤热点药物,如周期蛋白依赖性激酶(CDK)抑制剂、细胞分裂周期因子25(CDC25)抑制剂、ATR丝氨酸/苏氨酸激酶(ATR)抑制剂和细胞周期检查点激酶1(CHK1)抑制剂等,最后从细胞周期G0/G1期、S期和G2/M期3个方面切入,总结了近些年来中药通过诱导细胞周期阻滞发挥抗肿瘤作用的相关研究,以期为中药抗肿瘤作用研究提供一定的参考。

关键词：中药抗肿瘤细胞周期研究进展

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基于HPLC-Q-Exactive Orbitrap-MS技术的异绿原酸A体内代谢产物分析

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中国中药杂志 2024年第15期49卷 4220-4229页

作者：刘文静曹耘畅冯素香麻秋娟李军宋月林河南中医药大学药学院河南郑州450046 北京中医药大学北京中医药研究院中药现代研究中心北京100029 河南中医药大学中医药科学院河南郑州450046

异绿原酸A(ICA)为茵陈等多种中药的主要药效成分。该研究旨在鉴定口服给药ICA的大鼠血浆、尿液和粪便中的代谢产物,并推测其潜在的代谢途径。ICA灌胃大鼠后,收集不同时间点(段)的血浆、尿液和粪便样品,利用高效液相色谱-四极杆静电场轨... 详细信息

异绿原酸A(ICA)为茵陈等多种中药的主要药效成分。该研究旨在鉴定口服给药ICA的大鼠血浆、尿液和粪便中的代谢产物,并推测其潜在的代谢途径。ICA灌胃大鼠后,收集不同时间点(段)的血浆、尿液和粪便样品,利用高效液相色谱-四极杆静电场轨道阱质谱(HPLC-Q-Exactive Orbitrap-MS)技术,结合对照品比对保留时间、裂解规律总结和文献数据,对生物样品中代谢产物进行结构鉴定。从大鼠样品中初步鉴定了ICA的39个代谢产物(M1~M39),其中31个来自于血浆(M1~M10、M12~M24、M26~M28、M30、M34~M35、M38~M39)、34个来自于尿液(M1~M11、M13~M15、M19~M25、M27~M39)、11个来自于粪便(M2~M3、M6、M15、M21~M23、M32、M34、M36~M37),主要代谢途径包括水解、葡萄糖醛酸化、甲基化和磺酸化反应等。该研究揭示了ICA在大鼠血浆、尿液和粪便中的代谢情况,对深入阐明其药理活性成分提供参考。

关键词：异绿原酸A HPLC-Q-Exactive Orbitrap-MS 代谢产物代谢途径

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八味沉香丸不同提取物的药效比较与成分研究

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中国中药杂志 2025年

作者：王嘉童康露璐周凤格桑罗布梁亚娜杨国栋高小力武慧超柴兴云北京中医药大学北京中医药研究院中药现代研究中心西藏甘露医药科技有限责任公司北京中医药大学中医学院民族医药学研究所

将八味沉香丸组方药材分别经回流水提取，70%乙醇回流提取，70%乙醇回流提取后再以纯水提取，分别得到3种提取物（ST、CT、CST）；采用小鼠急性心肌缺血（AMI）和对氯苯基丙氨酸（PCPA）致小鼠失眠2种模型，分别对ST(760 mg·kg-1)... 详细信息

将八味沉香丸组方药材分别经回流水提取，70%乙醇回流提取，70%乙醇回流提取后再以纯水提取，分别得到3种提取物（ST、CT、CST）；采用小鼠急性心肌缺血（AMI）和对氯苯基丙氨酸（PCPA）致小鼠失眠2种模型，分别对ST(760 mg·kg-1)、CT(620 mg·kg-1)、CST(1 040 mg·kg-1)进行药效评价，并采用Western blot探索其助眠作用机制；采用UPLC-Q-Exactive-MS技术鉴定不同提取物特征时段的主要化学成分。结果显示，CT和CST显著提高心梗小鼠的心脏射血分数（ejection fraction， EF）和短轴缩短率（fractional shortening， FS），降低左室舒张末内径（left ventricular internal dimension at end-diastole， LVIDd）和左室收缩末内径（left ventricular internal dimension at end-systole， LVIDs）；ST在各指标中均无显著改善。CT显著缩短失眠小鼠睡眠潜伏期，延长睡眠维持时间；ST未缩短睡眠潜伏期，但显著延长了睡眠维持时间；CST未缩短小鼠睡眠潜伏期，也未延长小鼠睡眠维持时间；CT和ST均能上调脑组织谷氨酸脱羧酶67（glutamic acid decarboxylase 67， GAD67）蛋白的表达。从CT中共鉴定出2-（2-苯乙基）色酮、6-甲氧基-2-（2-苯乙基）色酮等15个主要化学成分，从ST中共鉴定出诃子次酸等6个化学成分。该结果提示色酮及萜类为八味沉香丸潜在的抗心肌缺血药效物质，鞣质、酚酸类为潜在的助眠药效物质。该研究丰富了八味沉香丸的药理和化学研究，为其二次开发、质量标准提升和临床应用提供了依据和参考。

关键词：八味沉香丸抗心肌缺血助眠药效物质 GAD67

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UPLC-Q-TOF-MS结合分子量印迹和质量亏损过滤策略快速筛选并鉴定血竭中黄酮类化学成分

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中国中药杂志 2023年第4期48卷 993-1004页

作者：赵依佳李军宋青青屠鹏飞北京中医药大学中药学院、中药现代研究中心北京100029

血竭为名贵活血化瘀中药,现有研究表明其药效成分群为黄酮类化合物。血竭中黄酮类化合物化学结构的多样性为其化学成分轮廓深入表征带来了巨大的挑战。为了系统表征血竭化学成分轮廓,该研究首先采集化学成分质谱信息,进一步利用分子量印... 详细信息

血竭为名贵活血化瘀中药,现有研究表明其药效成分群为黄酮类化合物。血竭中黄酮类化合物化学结构的多样性为其化学成分轮廓深入表征带来了巨大的挑战。为了系统表征血竭化学成分轮廓,该研究首先采集化学成分质谱信息,进一步利用分子量印迹(molecular weight imprinting,MWI)以及质量亏损过滤(mass defect filtering,MDF)方法处理高分辨数据集,实现血竭中黄酮类化合物的快速鉴定。采用UPLC-Q-TOF-MS采集正离子模式下m/z 100~1000质谱数据;根据前期文献报道中的血竭黄酮类化合物,建立[M+H]+质荷比的数据库,以±10×10^(-3)为误差范围构建分子量印迹,快速检索已知黄酮类化合物,并结合MS2数据确证化学结构。通过已知血竭黄酮类化合物建立MDF的“五点筛选框”,获取可能的目标成分,进一步结合诊断离子(DFI)、中性丢失(NL)和质谱裂解规律,推断化学结构。最终从血竭提取物中初步鉴定了70个黄酮类化合物,包括黄烷氧化同系物类5个、黄烷类12个、二氢查尔酮类1个、黄酮二聚体类49个、三聚体类1个以及其他类型2个。该研究阐明了血竭中黄酮类化学成分组成,同时也表明高分辨质谱技术结合MWI与MDF等数据后处理方法可以实现中药化学成分组成的快速表征。

关键词：血竭黄酮分子量印迹质量亏损过滤 UPLC-Q-TOF-MS

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基于转录组学分析醒脾胶囊治疗功能性消化不良的作用机制

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中国实验方剂学杂志 2025年第11期31卷 164-172页

作者：朱镕鑫黄明月王可妍刘相凝吕迎兰王港芮芳芳邓琼董健藤王勇李春北京中医药大学中医学院证候与方剂基础研究北京市重点实验室证候与方剂基础研究教育部重点实验室北京100029 北京中医药大学东直门医院北京100700 北京中医药大学中医药研究院中药现代研究中心北京100029

目的:探讨醒脾胶囊对功能性消化不良(FD)的改善作用及潜在机制。方法:将60只SPF级雄性SD新生大鼠(7日龄)随机分为正常组、模型组、醒脾胶囊低、高剂量组(0.135、0.54 g·kg^(-1))和多潘立酮组(3 mg·kg^(-1)),每组12只。除正常... 详细信息

目的:探讨醒脾胶囊对功能性消化不良(FD)的改善作用及潜在机制。方法:将60只SPF级雄性SD新生大鼠(7日龄)随机分为正常组、模型组、醒脾胶囊低、高剂量组(0.135、0.54 g·kg^(-1))和多潘立酮组(3 mg·kg^(-1)),每组12只。除正常组外,各组大鼠采用碘乙酰胺灌胃法制备FD模型。各给药组灌胃相应药液,正常组和模型组大鼠灌胃等体积蒸馏水,1次/d,连续7d。观察大鼠一般生存状况,测定大鼠饮水量、进食量;治疗结束后测定胃排空率和小肠推进率;采用苏木素-伊红(HE)染色检查大鼠十二指肠病理损伤;采用免疫荧光法检测大鼠结肠结闭合蛋白(Occludin)、闭锁连接蛋白-1(ZO-1)表达;末次给药后采用转录组学测序技术检测模型组与正常组、醒脾胶囊高剂量组与模型组十二指肠组织的差异表达基因,并进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;采用蛋白免疫印迹法(Western blot)、免疫荧光法和实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)对转录组学结果进行验证并筛选醒脾胶囊活性成分与关键靶点进行分子对接。结果:与正常组比较,模型组大鼠一般生存状况较差,饮水量、进食量、胃排空率和小肠推进率均明显降低(P<0.05);十二指肠病理见炎性浸润;结肠Occludin、ZO-1荧光强度显著降低(P<0.01)。与模型组比较,醒脾胶囊高剂量组大鼠一般生存状况明显改善,饮水量、进食量、胃排空率和小肠推进率均明显升高(P<0.05);十二指肠病理见炎性浸润减少;结肠Occludin、ZO-1荧光强度显著升高(P<0.01)。转录组学结果表明,醒脾胶囊可能通过Slc5a1、Abhd6等关键基因调控磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路而发挥治疗作用。验证结果显示,与正常组比较,模型组大鼠PI3K、Akt蛋白磷酸化水平明显升高(P<0.05),白细胞介素(IL)-1β蛋白表达水平显著升高(P<0.01);IL-6、IL-1β荧光强度显著升高(P<0.01);Slc5a1、Abhd6、Mgam、Atp1a1、Slc7a8、Cdr2、Chrm3、Slc5a9等关键基因的m RNA水平显著升高(P<0.01)。与模型组比较,醒脾胶囊高剂量组大鼠PI3K、Akt蛋白磷酸化水平明显降低(P<0.05),IL-1β蛋白表达水平显著降低(P<0.01);IL-6、IL-1β荧光强度显著降低(P<0.01);Slc5a1、Abhd6、Mgam、Atp1a1、Slc7a8、Cdr2、Chrm3、Slc5a9的m RNA水平明显降低(P<0.05)。加权基因共表达网络分析和分子对接结果显示,醒脾胶囊成分E-橙花叔醇、Z-橙花叔醇与ABDH6蛋白结合良好,linarionoside A、缬草苦苷、克氏千里光碱与Slc5a1蛋白结合良好。结论:醒脾胶囊能够通过多靶点有效改善FD大鼠的一般生存状况和胃肠动力,其具体机制可能与抑制PI3K/Akt信号通路减轻十二指肠低度炎症有关,E-橙花叔醇、Z-橙花叔醇、linarionoside A、缬草苦苷、克氏千里光碱可能为其关键活性成分。

关键词：醒脾胶囊功能性消化不良转录组学十二指肠低度炎症磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路分子对接

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氯化钠诱导白木香悬浮细胞合成苯乙基色酮类成分的LC-MS分析

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中国中药杂志 2023年第9期48卷 2480-2489页

作者：杜宇张晓雪张泽坤王雯静张蓓蓓张明亮王阳葛祥宇史社坡北京中医药大学中药学院、中药现代研究中心北京100029

采用超高效液相色谱-串联四极杆静电场轨道阱质谱(UPLC-Q-Exactive-MS)结合超高效液相色谱-串联三重四极杆质谱(UPLC-QQQ-MS/MS)对氯化钠诱导的白木香悬浮细胞中苯乙基色酮类成分进行定性和定量分析。UPLC-Q-Exactive-MS和UPLC-QQQ-MS/M... 详细信息

采用超高效液相色谱-串联四极杆静电场轨道阱质谱(UPLC-Q-Exactive-MS)结合超高效液相色谱-串联三重四极杆质谱(UPLC-QQQ-MS/MS)对氯化钠诱导的白木香悬浮细胞中苯乙基色酮类成分进行定性和定量分析。UPLC-Q-Exactive-MS和UPLC-QQQ-MS/MS均采用Waters T3色谱柱(2.1 mm×50 mm,1.8μm),以0.1%甲酸水溶液(A)-乙腈(B)为流动相分别进行梯度洗脱色谱分离,质谱分析均采用电喷雾正离子模式采集。利用UPLC-Q-Exactive-MS从氯化钠诱导的白木香悬浮细胞样品中鉴定出苯乙基色酮类化合物47个,其中简单苯乙基色酮及其苷22个、四羟基四氢苯乙基色酮10个、三元氧环四氢苯乙基色酮15个。通过UPLC-QQQ-MS/MS技术对氯化钠诱导处理后白木香悬浮细胞中25个苯乙基色酮进行了定量。通过2种液质联用技术快速、高效地对氯化钠诱导白木香悬浮细胞中苯乙基色酮类成分进行定性、定量分析,为利用体外培养等生物技术制备沉香中主要的药效和香味物质苯乙基色酮提供重要参考。

关键词：白木香悬浮细胞沉香苯乙基色酮 LC-MS

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桔梗特异DNA条形码筛选、种质资源鉴定及遗传多样性分析

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药学学报 2024年第1期59卷 243-252页

作者：王馨石玥满金辉黄钰莹张晓芹安克露何高洁刘子齐关范圆郑语嫣王晓晖魏胜利北京中医药大学中药学院北京102488 北京中医药大学北京中医药研究院中药现代研究中心北京102488 北京中医药大学生命科学院北京102488 黑龙江诺初中药材种植有限公司黑龙江哈尔滨150600

中药材桔梗为桔梗科植物桔梗的干燥根,具有多种药理作用,是常用的大宗中药材。本研究利用Illumina HiSeq X Ten平台对6份来自不同产地的桔梗进行叶绿体基因组测序,筛选特异性DNA条形码,基于特异性DNA条形码对不同产区的桔梗样品的种质... 详细信息

中药材桔梗为桔梗科植物桔梗的干燥根,具有多种药理作用,是常用的大宗中药材。本研究利用Illumina HiSeq X Ten平台对6份来自不同产地的桔梗进行叶绿体基因组测序,筛选特异性DNA条形码,基于特异性DNA条形码对不同产区的桔梗样品的种质资源和遗传多样性进行分析。6份桔梗叶绿体基因组全长为172260~172275 bp,均呈现典型的环状四分体结构,编码141个基因。根据比较基因组学分析和扩增效率分析发现trnG-UCC和ndhG_ndhF可作为潜在的桔梗种内种质资源鉴定的特异性DNA条形码。对来自9省15个产地305份桔梗样品的trnG-UCC和ndhG_ndhF进行PCR扩增和序列分析,结果表明trnG-UCC和ndhG_ndhF分别有5和11个变异位点,分别鉴定到5和7个单倍型;两段序列联合分析鉴定13个单倍型(Hap1~Hap13),其中占比最多的是Hap4,其次是Hap1。3个产地拥有的特异单倍型,可作为该产地的DNA分子标签与其他产地的桔梗种质资源进行区分。单倍型多样性、核苷酸多样性和遗传距离分别为0.94、4.79×10^(-3)和0.0000~0.0203,表明桔梗在物种水平上有较高的遗传多样性,种内各单倍型之间亲缘关系比较接近。本研究为桔梗产地鉴定、种质资源保护利用和分子育种等工作奠定基础。

关键词：桔梗叶绿体基因组 DNA条形码种质资源遗传多样性

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