检索结果-内蒙古大学图书馆

世界科学技术-中医药现代化 2013年第3期15卷 471-481页

作者：张燕玲杨晔杨珍乔延江北京中医药大学中药信息工程研究中心/北京市中药基础与新药研发重点实验室北京100102

目的:构建内皮素受体A(Endothelins A Receptor,ETA)的拮抗剂药效团模型,用以搜索中草药数据库,寻找中药ETA受体拮抗剂。方法:以对鼠主动脉平滑肌细胞的内皮素受体A有抑制作用的36个化合物为研究对象,分别利用HipHop定性药效团模型和Hyp... 详细信息

目的:构建内皮素受体A(Endothelins A Receptor,ETA)的拮抗剂药效团模型,用以搜索中草药数据库,寻找中药ETA受体拮抗剂。方法:以对鼠主动脉平滑肌细胞的内皮素受体A有抑制作用的36个化合物为研究对象,分别利用HipHop定性药效团模型和HypoGen定量药效团模型构建方法,建立ETA受体拮抗剂药效团模型,利用数据库搜索方法对药效团模型进行优劣评判。并用所获得的最优定性和定量药效团模型对中药化学成分数据库进行筛选。结果:获得最优定性药效团模型具有以下6个特征:1个芳环基团、1个负离子基团、3个疏水基团及1个氢键受体,其综合评判指数CAI值为103.94。最优定量药效团模型具有以下6个特征:1个芳环基团、1个负离子基团、2个疏水基团、1个氢键受体以及1个排除体积,其综合评判指数CAI值为45.96,表明所构建动物模型具有一定的可靠性,且利用定量药效团模型筛选中药化学成分数据库命中16个化学成分。结论:本文所构建的定性和定量药效团模型筛选效率较高,可分别开展活性化合物筛选和活性预测研究,有助于指导发现中药ETA受体拮抗剂。

关键词：内皮素受体A 定性药效团定量药效团

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ET_B受体拮抗剂三维药效团的构建

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世界科学技术-中医药现代化 2012年第4期14卷 1786-1792页

作者：杨珍张燕玲乔延江北京中医药大学中药信息工程研究中心/北京市"中药基础与新药研究重点实验室" 北京100102

本文以对在CHO细胞中表达的人类ETB受体有拮抗作用的28个化合物为训练集,利用Catalyst计算所得ETB受体拮抗剂的最优药效团模型由两个氢键受体、一个芳环基团和一个疏水基团组成。最优模型的Fixed cost、Total cost和△Cost值分别为114.... 详细信息

本文以对在CHO细胞中表达的人类ETB受体有拮抗作用的28个化合物为训练集,利用Catalyst计算所得ETB受体拮抗剂的最优药效团模型由两个氢键受体、一个芳环基团和一个疏水基团组成。最优模型的Fixed cost、Total cost和△Cost值分别为114.792、136.967和38.081。训练集化合物活性的实测值与预测值相关系数为0.870,偏差值为1.198,有效活性命中率A%和综合评价指数CAI值分别为84%和2.389。该模型对测试集化合物也有较好的预测能力,所命中测试集化合物的实际活性值和预测活性值的线性相关系数为0.736。研究结果表明所构建的药效团模型具有一定的可靠性,可以用来进行数据库的搜索,寻找新型的ETB受体拮抗剂。

关键词：心血管疾病 ETB拮抗剂三维药效团

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基于QSPR研究绿原酸类化合物与血清白蛋白的结合

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世界科学技术-中医药现代化 2012年第4期14卷 1773-1778页

作者：高静张燕玲乔延江北京中医药大学中药信息工程研究中心/北京市"中药基础与新药研究重点实验室" 北京100102

本文选取32个小分子化学成分和9个天然产物化学成分为训练集，利用Dragon软件计算分子描述符，应用WEKA软件中CfsSubsetEval评价方法和BestFirst—D1-N5搜索方法进一步筛选描述符，利用LinearRegression方法建立了分子结构与其血清蛋白... 详细信息

本文选取32个小分子化学成分和9个天然产物化学成分为训练集，利用Dragon软件计算分子描述符，应用WEKA软件中CfsSubsetEval评价方法和BestFirst—D1-N5搜索方法进一步筛选描述符，利用LinearRegression方法建立了分子结构与其血清蛋白结合常数值logK的定量结构一性质相关性模型（相关系数为0．9557）。应用该模型对10个绿原酸类化合物的logK进行预测，结果显示绿原酸的logK预测值为4．51，与文献报道的logK值在4～7范围内基本相符。研究结果为进一步探讨绿原酸与血清蛋白的结合情况提供指导，为研究药物与血清蛋白的结合提供思路。

关键词：分子描述符线性回归模型绿原酸血清白蛋白

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基于中药有效成分族辨识的血府逐瘀汤配伍研究

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世界科学技术-中医药现代化 2012年第4期14卷 1793-1797页

作者：张燕玲黄明峰王元明高静乔延江北京中医药大学中药信息工程研究中心/北京市"中药基础与新药研究重点实验室" 北京100102

本文利用中药有效成分族辨识技术,针对血府逐瘀汤中668个化学成分进行了活性辨识,命中化合物达到213个、命中靶标为20个。采用Cytoscape软件建立药物-靶点相互作用网络模型,并探讨其多成分-多靶点-多疾病相关关系。研究结果表明,血府逐... 详细信息

本文利用中药有效成分族辨识技术,针对血府逐瘀汤中668个化学成分进行了活性辨识,命中化合物达到213个、命中靶标为20个。采用Cytoscape软件建立药物-靶点相互作用网络模型,并探讨其多成分-多靶点-多疾病相关关系。研究结果表明,血府逐瘀汤活性成分可调控ACE、AngII、TNFα、COX2、5-LOX等靶点,涉及炎症和心血管受体,与高血压、心绞痛等多种疾病相关,揭示血府逐瘀汤治疗冠心病可能的作用机理,并提示其可能具有新功效的研究前景。

关键词：有效成分族辨识血府逐瘀汤方剂配伍

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黄酮类化合物结构对大孔树脂静态吸附影响的研究

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世界科学技术-中医药现代化 2012年第4期14卷 1895-1898页

作者：周英新王耘刘永刚马群北京中医药大学中药信息工程研究中心北京100102 北京中医药大学中药学院/北京市中药基础与新药研究重点实验室北京100102

目的:建立相同实验条件下芦丁、黄芩苷的静态吸附动力学方程,阐释黄酮类化合物结构对大孔树脂静态吸附的影响。方法:室温条件下,将等摩尔浓度的芦丁和黄芩苷溶液分别在AB-8树脂上进行静态吸附,分别采集相同时间点的样品,利用HPLC测定浓... 详细信息

目的:建立相同实验条件下芦丁、黄芩苷的静态吸附动力学方程,阐释黄酮类化合物结构对大孔树脂静态吸附的影响。方法:室温条件下,将等摩尔浓度的芦丁和黄芩苷溶液分别在AB-8树脂上进行静态吸附,分别采集相同时间点的样品,利用HPLC测定浓度,计算不同时间段的静态吸附量,绘制出静态吸附曲线,采用回归方法建立芦丁、黄芩苷的静态吸附动力学方程。结果:芦丁静态吸附方程为Y=4.715×X2+0.013×X1×X2;黄芩苷静态吸附方程为Y=4.921×X10.006×X2。二者的吸附动力学方程类型不同,在静态吸附上存在明显差异,表明结构对大孔树脂静态吸附具有显著性影响。结论:研究化合物结构与大孔树脂吸附影响的内在关系,对优化大孔树脂纯化工艺、提高提取效率和选择性具有理论价值和指导意义。

关键词：大孔树脂黄酮类化合物结构静态吸附吸附动力学方程

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苗药与中药药性理论之比较

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世界科学技术-中医药现代化 2012年第4期14卷 1812-1816页

作者：李飞雁顾浩郑虎占王学勇史新元乔延江遵义医药高等专科学校遵义563002 北京中医药大学中药信息工程研究中心北京100102 北京中医药大学中药信息工程研究中心/北京市"中药基础与新药研究重点实验室" 北京100102

中药与苗药在漫长的医药实践中形成了各自独特的理论体系。文章从药性层面对两类药物进行比较,探讨两类药物药性的共性特征与个性差异,从而进一步认识药性理论的形成过程与科学内涵。同时,归纳总结了苗药区别于中医药的理论特色,对丰富... 详细信息

中药与苗药在漫长的医药实践中形成了各自独特的理论体系。文章从药性层面对两类药物进行比较,探讨两类药物药性的共性特征与个性差异,从而进一步认识药性理论的形成过程与科学内涵。同时,归纳总结了苗药区别于中医药的理论特色,对丰富和发展我国民族医药理论具有参考价值。

关键词：苗药中药药性理论共性特征个性差异

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基于活血功效靶标的血府逐瘀汤有效成分群辨识研究

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中国中药杂志 2021年第23期46卷 6243-6250页

作者：马婧任越赵博文林力张燕玲北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488 中国中医科学院西苑医院基础医学研究所中药药理北京市重点实验室北京100091

血府逐瘀汤为活血化瘀的经典方剂,在临床上应用广泛且疗效显著,然而其发挥活血功效的物质基础尚不清晰,因此该研究基于活血功效关键靶点进行血府逐瘀汤有效成分群的辨识研究。研究通过检索中药化学成分数据库收集血府逐瘀汤化学成分,基... 详细信息

血府逐瘀汤为活血化瘀的经典方剂,在临床上应用广泛且疗效显著,然而其发挥活血功效的物质基础尚不清晰,因此该研究基于活血功效关键靶点进行血府逐瘀汤有效成分群的辨识研究。研究通过检索中药化学成分数据库收集血府逐瘀汤化学成分,基于实验室前期获得的活血功效关键靶点构建其分子对接模型,与血府逐瘀汤成分进行对接,挑选每个靶点打分值前5且含量可测的活性成分作为方剂的潜在活血有效成分群。关键药效成分以及高含量成分为中药发挥药效的核心,中药整体活性在一定程度上可表征关键药效成分以及高含量成分的活性。研究以抗血小板聚集药效部分表征活血功效,通过寻找血府逐瘀汤潜在有效成分群的来源中药进行体内活性实验以验证有效成分群的准确性。结果显示,基于中药成分数据库筛选获得血府逐瘀汤210个化学成分,与活血功效关键靶点进行分子对接,挑选每个靶点打分值前5且含量可测的活性成分,最终选择川芎嗪、毛蕊花糖苷、柚皮苷、橙皮苷、甘草苷、新橙皮苷、羟基红花黄色素A、阿魏酸、梓醇、甘草酸作为血府逐瘀汤发挥活血功效的潜在有效成分群。将其来源中药川芎、地黄、枳壳、甘草及红花进行抗血小板聚集活性验证,血小板聚集率为9.82%±5.11%。与空白组相比,实验组可显著抑制二磷酸腺苷(adenosine diphosphate,ADP)诱导的血小板聚集(P<0.01),验证了有效成分群的准确性。该研究为血府逐瘀汤的物质基础研究提供了指导,同时也为经典名方的开发利用提供了研究思路。

关键词：血府逐瘀汤活血功效分子对接有效成分群

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基于靶标活性谱的理气功效和活血功效靶点分析

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中国中药杂志 2021年第15期46卷 3970-3979页

作者：马婧任越张嘉宁林力张燕玲北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488 中国中医科学院西苑医院基础医学研究所/中药药理北京市重点实验室北京100091

活血中药和理气中药,二者在中医临床上常常配伍使用,然而2类中药功效发挥作用的机制尚不清晰。中药靶标活性谱是能够标示中药活性成分及其作用靶标、作用强度的图谱,可用于中药功效作用机制的探索。该研究基于中药成分数据库获得常用活... 详细信息

活血中药和理气中药,二者在中医临床上常常配伍使用,然而2类中药功效发挥作用的机制尚不清晰。中药靶标活性谱是能够标示中药活性成分及其作用靶标、作用强度的图谱,可用于中药功效作用机制的探索。该研究基于中药成分数据库获得常用活血中药集、理气中药集及非活血、理气的阴性集化学成分。通过活血中药化学成分与DrugBank数据库中化学成分的相似度分析获得活血中药化学成分预测靶标,以两者的相似值作为活血中药化学成分与预测靶点的活性值,进而对成分-靶标活性值赋予权重。将每味中药作用于同一靶点的活性值进行融合,分别构建活血、理气、阴性中药靶标活性谱。选取活血、理气中药作用活性值大于阴性中药的靶点作为功效潜在作用靶点,分别构建蛋白-蛋白相互作用网络,进行拓扑、GO、KEGG富集分析,确定活血、理气功效的关键靶点。结果显示,基于DrugBank数据库收集获得成分-靶点活性信息,共包含4 499个化合物、627个靶点及11 295条作用关系。活血功效蛋白-蛋白相互作用网络包含206个节点和1 728条边,理气功效蛋白-蛋白相互作用网络包含230个节点和986条边。通过拓扑、GO、KEGG富集分析发现,活血中药主要通过作用于VEGF/VEGFR2介导的信号级联通路、ERK信号通路、钙信号通路、PI3K-AKT信号通路发挥抗炎、神经保护、血管生成等药效进而产生活血功效,关键靶点为丝裂原活化蛋白激酶3(mitogen activated protein kinases 3,MAPK3)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src,SRC)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen activated protein kinases 1,MAPK1)、人表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、磷脂酰肌醇-3-激酶亚基α(phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform,PIK3CA)、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferators-activated receptor gamma,PPARG)、内皮型一氧化氮合酶(nitric oxide synthase 3,NOS3)、前列腺素G/H合成酶2(prostaglandin G/h synthetase 2,PTGS2)、基质金属蛋白酶9(matrix metalloproteinase-9,MMP9)、血管内皮细胞生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)。理气中药主要通过作用于MAPK信号通路、PI3K-AKT信号通路发挥抗炎、神经保护等药效进而产生理气功效,关键靶点为丝裂原活化蛋白激酶8(mitogen activated protein kinases 8,MAPK8)、SRC、丝裂原活化蛋白激酶14(mitogen activated protein kinases 14,MAPK14)、PIK3CD、EGFR、RAC-α丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶(RAC-alpha serine/threonine-protein kinase,AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶3(mitogen activated protein kinases 3,MAPK3)。研究基于靶标活性谱进行了理气、活血功效的靶点分析,为中药功效靶标研究提供了借鉴,也为临床应用提供一定的科学依据。

关键词：靶标活性谱理气活血数据挖掘网络药理学

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基于中药有效成分族辨识的血府逐瘀汤配伍研究

基于中药有效成分族辨识的血府逐瘀汤配伍研究

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中华中医药学会中药分析分会第五届学术交流会

作者：张燕玲黄明峰王元明高静乔延江北京中医药大学中药信息工程研究中心北京市“中药基础与新药研究重点实验室”

血府逐瘀汤具有活血祛瘀,行气止痛之功效;其临床疗效确切、基础研究较为雄厚,主要用于治疗高血压、冠心病心绞痛、脑外伤后遗症等。血府逐瘀汤共计含有化学成分668个,利用中药有效成分族辨识技术将有助于揭示血府逐瘀汤作用机理。利用... 详细信息

血府逐瘀汤具有活血祛瘀,行气止痛之功效;其临床疗效确切、基础研究较为雄厚,主要用于治疗高血压、冠心病心绞痛、脑外伤后遗症等。血府逐瘀汤共计含有化学成分668个,利用中药有效成分族辨识技术将有助于揭示血府逐瘀汤作用机理。利用本实验室已建立的共计58个药效团辨识模型,通过将药效团模型与化学成分的多个构象进行一一匹配,通过搜索能够与药效团匹配的化合物而辨识血府逐瘀汤有效成分,共获得213个化学成分。其中柴胡所含成分21个、当归所含成分13个、地黄所含成分32个、赤芍所含成分1个、红花所含成分12个、桃仁所含成分1个、枳壳所含成分14个、甘草所含成分112个、川芎所含成分4个、牛膝所含成分2个、桔梗所含成分1个。这213个化学成分命中靶标为20个,包括ACE、AngⅡ、TNFα、COX、5-LOX等靶点,涉及炎症和心血管受体,涉及高血压、心绞痛等多种疾病,采用Cytoscape软件建立药物-靶点相互作用网络模型,并探讨其多成分-多靶点-多疾病相关关系。研究结果体现了药物间的协同作用,这些治疗靶点相互影响、相互补充,形成一个效应网络,共同发挥其活血祛瘀、行气止痛的疗效,可进一步揭示血府逐瘀汤治疗冠心病可能的作用机理,并有助于提示其可能具有新功效的研究前景。

关键词：有效成分族辨识血府逐瘀汤方剂配伍

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