检索结果-内蒙古大学图书馆

中国中药杂志 2020年第4期45卷 923-931页

作者：赵亚楠陈艳昆陈茜乔连生张景芳蔡涟漪裴艳玲张燕玲北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室北京102488 河北鑫民和质检技术服务有限公司河北保定071200

随着中药以及中药与西药联合用药的广泛普及,其产生的药物-药物相互作用(drug-drug interaction,DDI)被认为是引起治疗效果减弱或药物毒副作用的主要原因。CYP酶负责大量药物的代谢,CYP3A4和CYP2D6是CYP酶的最主要的2个亚型,负责代谢超... 详细信息

随着中药以及中药与西药联合用药的广泛普及,其产生的药物-药物相互作用(drug-drug interaction,DDI)被认为是引起治疗效果减弱或药物毒副作用的主要原因。CYP酶负责大量药物的代谢,CYP3A4和CYP2D6是CYP酶的最主要的2个亚型,负责代谢超过80%以上经CYP代谢的药物。由于CYP酶的抑制是导致DDI最重要的一个因素。因此,发现中药中CYP3A4和CYP2D6的潜在抑制剂对于预防不良DDI的发生有重大意义。该文建立了一种快速且成本较低的CYP3A4和CYP2D6抑制成分的计算预测方法,即支持向量机(SVM)和分子对接技术,用来预测和筛选药物。首先利用SVM分别建立2个靶点的12个定性模型,并挑选最优的模型来预测在中药化学成分数据库(TCMD)的化合物。随后利用分子对接技术建立对接模型,通过分析药物与靶点相互作用的关键氨基酸,与SVM模型结合,发现CYP3A4和CYP2D6的潜在抑制剂。根据分子模拟的结果,astin D和表小檗碱(epiberberine)分别对CYP3A4和CYP2D6存在抑制作用。astin D只存在于紫菀的astins家族,而表小檗碱是中药黄连的活性成分,因此,这些潜在抑制剂的来源中药紫菀和黄连,应当在药物联合用药过程中警示DDI的发生。该计算方法利用SVM和分子对接模型为筛查中药中CYP酶抑制剂成分提供技术支持。该研究也有助于认识目前存在于中药中CYP酶介导的DDI,为进一步开展药物联合用药的预警提供研究思路。

关键词：药物-药物相互作用(DDI) CYP450 支持向量机分子对接中药

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基于VEGFR,FGFR探讨中药方剂对COVID-19后遗症肺纤维化的干预作用

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中国中药杂志 2020年第7期45卷 1481-1487页

作者：边亚倩马婧任越张燕玲乔延江北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

自2020年2月以来,随着疫情防控力度的加强,大批新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者治愈出院。肺纤维化是冠状病毒肺炎的后遗症之一,其不仅引起呼吸困难和肺功能指标的恶化,还具有死亡率高、预后不良的特点,严重影响患者的生活质量。血管内... 详细信息

自2020年2月以来,随着疫情防控力度的加强,大批新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者治愈出院。肺纤维化是冠状病毒肺炎的后遗症之一,其不仅引起呼吸困难和肺功能指标的恶化,还具有死亡率高、预后不良的特点,严重影响患者的生活质量。血管内皮生长因子受体(vascular endothelial growth factor receptor,VEGFR)、成纤维生长因子受体(fibroblast growth factor receptor,FGFR)通过介导参与肺纤维化进程的信号转导通路,抑制成纤维细胞增殖、活化与迁移,影响肺纤维的发生发展。基于中医整体观念指导下的中药方剂对肺纤维化具有良好的治疗效果,因此基于VEGFR和FGFR探讨中药对COVID-19后遗症肺纤维化的干预作用具有重要意义。该研究运用分子对接技术,通过构建VEGFR和FGFR靶点的对接模型,以原配体-CDCOKER ENERGY打分值的80%为阈值筛选方剂中的活性成分,并寻找其来源中药。通过检索成分命中率高于30%中药的性味归经及功效信息,构建中药-归经网络及中药-功效网络,结合《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第七版)》中2首、《中医疫病名方精选》中9首针对疫病恢复期的方剂,探讨了中药方剂治疗肺纤维化的规律。研究结果显示,基于VEGFR和FGFR靶点筛选获得潜在抗肺纤维化的活性成分分别为959,1 047个。VEGFR和FGFR靶点成分命中率达到30%以上的中药为黄芩、南沙参、半夏、薏苡仁、陈皮、白扁豆、白芍、桑叶、党参、玉竹、芦根、柴胡、黄芪、人参、西洋参、玄参、当归、丹参。分析上述中药性味归经及功效信息可知,治疗肺纤维化的中药主归肺(degree=14)、脾(degree=8)经,功效以补虚(degree=9)为主。结合恢复期推荐处方进行分析,上述中药在恢复期方剂中均有出现,其中以气阴两虚处方与补中益气汤命中中药数目最多。本次新型冠状病毒肺炎的主要证候为湿热蕴肺,内蕴邪热久羁,易于耗气伤津,临床观察显示,恢复期患者多处于余邪未尽、正气尚未恢复的阶段,主要表现为肺脾气虚,结合该研究分析,新型冠状病毒肺炎患者在此阶段,应当注重扶正祛邪,健脾益肺,进而缓解病毒导致的肺纤维化症状。研究结果旨在为中医药治疗COVID-19恢复期后遗症肺纤维化提供数据参考,并为临床用药提供指导。

关键词：新型冠状病毒肺炎肺纤维化分子对接血管内皮细胞生长因子受体成纤维生长因子受体中药方剂

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基于系统中药学的丹参组分功效研究

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中国中药杂志 2020年第14期45卷 3251-3258页

作者：任越霍梦琪马婧凤雯晴乔延江张燕玲北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

该研究旨在基于系统中药学的理论,利用文献挖掘、生物网络构建的技术,探讨建立丹参中2类代表性物质丹参酮类与丹酚酸类的功效系统,从中药功效系统的基本单元、基本单元间结构、关系、研究对象的边界、系统的功能展开中药功效系统研究,... 详细信息

该研究旨在基于系统中药学的理论,利用文献挖掘、生物网络构建的技术,探讨建立丹参中2类代表性物质丹参酮类与丹酚酸类的功效系统,从中药功效系统的基本单元、基本单元间结构、关系、研究对象的边界、系统的功能展开中药功效系统研究,从而在分子层面阐释2类成分表征的整体功效。该研究运用文献挖掘收集了2类成分功效系统的元素,依据生物过程划定了功效系统的边界,依据KEGG中元素之间的相互作用(关系)构建了功效系统的结构,并从药理、药效和功效3个层次分析了功效系统的功能,揭示中药功效系统的科学内涵。丹参组分功效研究结果显示,丹酚酸类功效系统中作用靶点(元素)201个,靶点集(边界)划分为12类,依据元素之间的相互作用(关系)构建的通路网络(结构)12个;丹参酮类功效系统中作用靶点(元素)189个,靶点集(边界)划分为11类,依据元素之间的相互作用(关系)构建的通路网络(结构)11个。基于丹酚酸类与丹参酮类功效系统中元素、边界、关系、结构,对功效系统的功能辨识研究发现,二者在药理、药效层次上功能不同,但在功效层次上功能相同,均产生活血祛瘀、清心除烦、安神的功效。该研究基于系统中药学构建了丹参中2类组分的功效系统,建立了中药还原论与整体论的桥梁,从本质上阐释2类组分表征的整体功效。

关键词：系统中药学丹参丹参酮类丹酚酸类功效系统

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基于系统中药学的中药功效标志物发现与应用

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中国中药杂志 2020年第14期45卷 3245-3250页

作者：霍梦琪彭莎任越舒展张燕玲乔延江北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

中药质量标志物是近年来提出的中药质量控制的新概念,是中药现代研究的热点问题。中药的功效是在中医药理论指导下对中药治疗作用的高度概括,在此基础上发掘中药的功效标志物对中药现代化发展具有重要意义。然而传统的基于中药宏观层面... 详细信息

中药质量标志物是近年来提出的中药质量控制的新概念,是中药现代研究的热点问题。中药的功效是在中医药理论指导下对中药治疗作用的高度概括,在此基础上发掘中药的功效标志物对中药现代化发展具有重要意义。然而传统的基于中药宏观层面的单味药材和饮片研究,或者基于靶点生物学效应的药物研究策略与中药多种成分及对靶点的弱作用、低选择性的整体性作用特点存在较大差异,因此如何从分子层面选取代表性成分表征中药整体功效特点是建立中药功效标志物的研究难点。该研究将质量标志物的概念和方法引入中药功效研究中,以系统中药学的研究方法,以代表性的研究成果为例,论述了中药功效标志物的内涵及其发现和确定的原则、常用研究思路和方法,为中药功效标志物的研究和发现提供新的思路。

关键词：系统中药学网络药理学功效标志物数据挖掘中药质量控制

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基于系统中药学的丹参活血化瘀功效标志物研究

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中国中药杂志 2020年第14期45卷 3259-3265页

作者：马婧陈茜边亚倩陈紫军乔延江张燕玲北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

活血化瘀中药在临床上应用广泛,然而由于中药成分的多样性与人体相互作用的复杂性,难以应用传统质控成分表征其整体功效。系统中药学是研究中药功效的有效手段,体现了整体论与还原论的辨证统一。丹参为活血化瘀的常用中药,该研究基于系... 详细信息

活血化瘀中药在临床上应用广泛,然而由于中药成分的多样性与人体相互作用的复杂性,难以应用传统质控成分表征其整体功效。系统中药学是研究中药功效的有效手段,体现了整体论与还原论的辨证统一。丹参为活血化瘀的常用中药,该研究基于系统中药学的理论,构建了"功效-药理药效-靶点-成分"多维网络,探讨了丹参活血化瘀功效标志物的发现。首先,对活血化瘀功效系统进行研究,基于中药功效-药理数据库获得了活血化瘀功效(功能)相关性最大的药理药效(边界),然后应用DrugBank数据库获得相应药理作用的药物靶标集(结构),运用STRING数据库构建活血化瘀相关靶标的蛋白-蛋白互作网络(关系),通过评价靶点拓扑参数筛选网络中的关键靶点(元素)。最后基于分子对接进行丹参酚酸类及丹参酮类成分辨识,预测丹参活血化瘀功效标志物。该研究结果表明丹参活血化瘀功效的潜在标志物为丹酚酸B、丹酚酸A、丹参酮Ⅱ_A、丹参酮Ⅰ,其中,丹酚酸B、丹酚酸A、丹参酮Ⅱ_A已有文献报道其具有活血化瘀功效相关的抗血小板聚集、抗血栓、保护心脑血管等药理药效。该研究基于系统中药学,初步探讨了丹参活血化瘀功效标志物,为功效标志物的发现提供了研究方法,为中药整体质量控制提供了参考。

关键词：系统中药学功效标志物活血化瘀丹参

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基于系统中药学的金银花清热解毒功效标志物研究

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中国中药杂志 2020年第14期45卷 3275-3281页

作者：彭莎霍晓乾霍梦琪刘亚楠张燕玲乔延江北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

金银花的清热解毒功效历史悠久,历版《中国药典》对其功效的描述较为稳定,是研究功效标志物的优良载体。该文以系统中药学理论为指导,以金银花清热解毒功效系统为研究示例,明确了金银花清热解毒功效系统的元素(活性成分),划定了边界(信... 详细信息

金银花的清热解毒功效历史悠久,历版《中国药典》对其功效的描述较为稳定,是研究功效标志物的优良载体。该文以系统中药学理论为指导,以金银花清热解毒功效系统为研究示例,明确了金银花清热解毒功效系统的元素(活性成分),划定了边界(信号通路),建立了结构(系统动力学模型),辨识了其药理、药效和功效相应的系统功能(清热解毒功效),探讨系统动力学模型在发现中药功效标志物中的应用。通过建立生物体内白细胞介素-1(interleukin 1,IL-1)、白细胞介素-6(interleukin 6,IL-6)相关动力学模型,通过动态网络预测金银花中不同成分及成分组合在IL-1,IL-6信号通路中相关因子的表达,以期发现金银花清热解毒功效标志物。研究结果表明在IL-1通路中,绿原酸较低浓度下,与芳樟醇组合对IL-1下游Jun氨基末端激酶(Jun N-terminal kinase,JNK)抑制率更高;在IL-6通路中,绿原酸浓度越大,与木犀草素组合对IL-6下游C反应蛋白(C-reactive protein,CRP)抑制率更高;提示基于IL-1信号通路的金银花清热解毒功效的潜在功效标志物为绿原酸和芳樟醇,基于IL-6信号通路的金银花清热解毒功效的潜在功效标志物为绿原酸和木犀草素。该研究为中药功效标志物的发现提供了方法学指导。

关键词：系统中药学金银花清热解毒 IL-1 IL-6 功效标志物

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基于系统中药学的黄芪补气潜在功效标志物的发掘

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中国中药杂志 2020年第14期45卷 3266-3274页

作者：边亚倩李晶彭莎吕恬仪张燕玲乔延江北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

黄芪为补气之圣药,具有补气升阳,益卫固表的功效。随着黄芪化学成分研究的日益深入,其在临床上的应用也更加广泛。该研究基于系统中药学的理论,从分子层面表征黄芪补气功效,发掘黄芪补气功效标志物。通过TCMSP及ChEMBL数据库构建黄芪有... 详细信息

黄芪为补气之圣药,具有补气升阳,益卫固表的功效。随着黄芪化学成分研究的日益深入,其在临床上的应用也更加广泛。该研究基于系统中药学的理论,从分子层面表征黄芪补气功效,发掘黄芪补气功效标志物。通过TCMSP及ChEMBL数据库构建黄芪有效成分-靶点数据库,明确黄芪补气功效系统所涉及的靶点(元素)。根据靶点间的关系构建蛋白互作网络,并依据分子复合物检测算法(MCODE)划分网络模块(结构),以黄芪发挥补气功效(功能)的药理作用划定其补气功效系统的边界。从成分、靶点、药效层次上探讨表征黄芪补气功效成分。结果表明,黄芪中的常春藤皂苷元、槲皮素、毛蕊异黄酮、刺芒柄花素、华良姜素、异鼠李素、黄芪皂苷Ⅲ、黄芪异黄烷苷等8个关键成分可作用于17个关键靶点构成的8个功能模块,参与G蛋白偶联受体信号通路、脂质代谢过程、氮化合物代谢的正调控、细胞程序性死亡调控、脂肪酸代谢过程的调节等生命过程,产生调节机体免疫功能、强心、保护心肌细胞、改善物质代谢、抗氧化等药理作用,进而发挥补气的功效。该研究基于系统中药学的理论,从分子网络的水平发掘了黄芪补气的功效标志物,为中药药效物质基础阐释及中药质量控制研究提供了新思路。今后可聚焦于这些成分进行配伍研究,进而对黄芪补气功效展开更深入的研究,并加强相应疾病的药理机制及相关制剂的开发。

关键词：系统中药学黄芪补气功效标志物

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大柴胡汤功效标志物的发现及其作用机制解析研究

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中国中药杂志 2022年第8期47卷 2200-2210页

作者：刘亚楠吕恬仪任越徐裕彬张媛魏胜利张燕玲北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室北京102488 北京中医药大学中药学院北京102488 中药材规范化生产教育部工程研究中心北京102488 河北橘井药业有限公司河北安国071000

大柴胡汤为经典名方之一,具有和解少阳、内泻热结之效。目前在临床上应用广泛,疗效显著,然而其质控指标及作用机制尚不明确。因此该研究利用文献挖掘、分子生物学、网络药理学多种技术,明确大柴胡汤的功效标志物及其作用机制,从而有效... 详细信息

大柴胡汤为经典名方之一,具有和解少阳、内泻热结之效。目前在临床上应用广泛,疗效显著,然而其质控指标及作用机制尚不明确。因此该研究利用文献挖掘、分子生物学、网络药理学多种技术,明确大柴胡汤的功效标志物及其作用机制,从而有效控制质量,确保临床疗效。首先,研究基于中药质量标志物(Q-marker)“五原则”对大柴胡汤功效标志物进行预测分析。其次,采用脂多糖(LPS)诱导RAW264.7细胞构建体外炎症模型,以Griess法评价大柴胡汤功效标志物的抗炎活性,验证功效标志物的有效性。利用中药系统药理学数据库(TCMSP)、ChEMBL与SwissTargetPrediction平台获取功效标志物的潜在作用靶点,构建大柴胡汤功效标志物的蛋白互作网络。利用拓扑、GO、KEGG富集分析构建“关键靶点-信号通路-生物过程”网络,进而阐释大柴胡汤功效标志物的作用机制。研究结果显示柴胡皂苷B;、黄芩苷、黄芩素、汉黄芩苷、新橙皮苷、柚皮苷、橙皮苷、芍药苷8个化合物可作为大柴胡汤的潜在功效标志物。抗炎活性评价结果显示潜在功效标志物均可有效抑制NO的释放,具有较好的抗炎活性。网络药理学研究结果表明大柴胡汤功效标志物可能通过作用于MAPK、NF-κB信号通路调节炎症反应;作用于HIF-1、PI3K-AKT信号通路调节糖类代谢;作用于AMPK、PI3K-AKT信号通路调节脂质代谢。该研究利用文献挖掘结合分子生物实验确定大柴胡汤的功效标志物,并运用网络药理学从分子水平探讨其作用机制,旨在为大柴胡汤质量控制研究提供参考,并为其临床应用提供科学依据。

关键词：大柴胡汤质量标志物功效标志物作用机制网络药理学

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天山雪莲对乳腺癌的潜在治疗作用及基于网络药理学的机制探讨

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中国中药杂志 2021年第18期46卷 4824-4832页

作者：吴琪马婧舒展任越李德志张燕玲北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488 北京雪莲生物科技有限公司北京101200

女性乳腺癌作为全球最常见癌症,其发病主要受体内雌激素的影响。天山雪莲作为妇科常用中药,对雌激素所致的疾病具有一定调节作用,然而目前尚未有研究报道天山雪莲对乳腺癌的治疗作用。因此,该研究基于体外实验结合网络药理学探讨天山雪... 详细信息

女性乳腺癌作为全球最常见癌症,其发病主要受体内雌激素的影响。天山雪莲作为妇科常用中药,对雌激素所致的疾病具有一定调节作用,然而目前尚未有研究报道天山雪莲对乳腺癌的治疗作用。因此,该研究基于体外实验结合网络药理学探讨天山雪莲对乳腺癌的潜在治疗作用。研究测定了天山雪莲水提物对MDA-MB-231乳腺癌细胞增殖及迁移的抑制活性,结果显示天山雪莲水提物可显著抑制乳腺癌细胞的增殖(IC_(50)=6.47 mg·mL^(-1)),对乳腺癌细胞的迁移也具有抑制作用。研究通过TCMD数据库获得天山雪莲化学成分39个,利用反向找靶技术筛选获取天山雪莲的潜在作用靶点160个,借助OMIM数据库收集乳腺癌疾病靶点1001个,对两者取交集获得天山雪莲治疗乳腺癌潜在靶点45个;将交集靶点导入STRING数据库中获得交集靶点互作关系并运用Cytoscape构建交集靶点蛋白互作网络;对蛋白互作网络进行拓扑、GO、KEGG分析,获得天山雪莲治疗乳腺癌关键作用靶点8个、关键通路101条、生物过程85条。结果表明,天山雪莲可能通过调控细胞周期,抑制癌细胞增殖、迁移、黏附,以及调节雌激素受体发挥抗乳腺癌的作用。该研究利用体外实验及网络药理学探究了天山雪莲对乳腺癌的潜在治疗作用机制,为天山雪莲的进一步开发提供新的方向。

关键词：网络药理学天山雪莲乳腺癌作用机制

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基于特征图谱及网络药理学的大柴胡汤质量标志物研究

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药学学报 2022年第5期57卷 1477-1485页

作者：吕恬仪刘亚楠任越徐裕彬张媛魏胜利张燕玲北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室北京102488 中药材规范化生产教育部工程研究中心北京102488 河北橘井药业有限公司河北安国071000

大柴胡汤临床应用广泛、疗效确切,为治疗胆囊炎的经典方剂。然而其成分多样、作用复杂,传统质控指标难以反映其整体功效。因此本研究基于特征图谱和网络药理学预测大柴胡汤质量标志物,以期对大柴胡汤整体质量进行有效控制。研究首先利... 详细信息

大柴胡汤临床应用广泛、疗效确切,为治疗胆囊炎的经典方剂。然而其成分多样、作用复杂,传统质控指标难以反映其整体功效。因此本研究基于特征图谱和网络药理学预测大柴胡汤质量标志物,以期对大柴胡汤整体质量进行有效控制。研究首先利用虚拟筛选技术获得35个大柴胡汤潜在药效成分。其次采用高效液相色谱-二极管阵列检测器(HPLC-DAD)建立15批大柴胡汤的特征图谱,结合对照品,指认化学成分。初步将芍药内酯苷、芍药苷、柚皮苷、橙皮苷、新橙皮苷、黄芩苷、汉黄芩苷、柴胡皂苷b^(2)、柴胡皂苷b^(1)定为大柴胡汤潜在质量标志物。最后利用网络药理学技术手段,构建“成分-靶点-通路-生命过程”网络图,探究其治疗胆囊炎的作用机制,进而明确质量标志物的准确性。结果显示潜在质量标志物可作用于多靶点从而达到抗炎、调节代谢等目的,进而联合治疗胆囊炎。质量标志物与大柴胡汤主要药理作用吻合,可表征大柴胡汤的整体功效。该研究结合特征图谱及网络药理学,挖掘大柴胡汤的质量标志物,为大柴胡汤的质量控制及评价提供依据。

关键词：大柴胡汤质量标志物虚拟筛选特征图谱网络药理学

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