检索结果-内蒙古大学图书馆

中国中药杂志 2021年第23期46卷 6243-6250页

作者：马婧任越赵博文林力张燕玲北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488 中国中医科学院西苑医院基础医学研究所中药药理北京市重点实验室北京100091

血府逐瘀汤为活血化瘀的经典方剂,在临床上应用广泛且疗效显著,然而其发挥活血功效的物质基础尚不清晰,因此该研究基于活血功效关键靶点进行血府逐瘀汤有效成分群的辨识研究。研究通过检索中药化学成分数据库收集血府逐瘀汤化学成分,基... 详细信息

血府逐瘀汤为活血化瘀的经典方剂,在临床上应用广泛且疗效显著,然而其发挥活血功效的物质基础尚不清晰,因此该研究基于活血功效关键靶点进行血府逐瘀汤有效成分群的辨识研究。研究通过检索中药化学成分数据库收集血府逐瘀汤化学成分,基于实验室前期获得的活血功效关键靶点构建其分子对接模型,与血府逐瘀汤成分进行对接,挑选每个靶点打分值前5且含量可测的活性成分作为方剂的潜在活血有效成分群。关键药效成分以及高含量成分为中药发挥药效的核心,中药整体活性在一定程度上可表征关键药效成分以及高含量成分的活性。研究以抗血小板聚集药效部分表征活血功效,通过寻找血府逐瘀汤潜在有效成分群的来源中药进行体内活性实验以验证有效成分群的准确性。结果显示,基于中药成分数据库筛选获得血府逐瘀汤210个化学成分,与活血功效关键靶点进行分子对接,挑选每个靶点打分值前5且含量可测的活性成分,最终选择川芎嗪、毛蕊花糖苷、柚皮苷、橙皮苷、甘草苷、新橙皮苷、羟基红花黄色素A、阿魏酸、梓醇、甘草酸作为血府逐瘀汤发挥活血功效的潜在有效成分群。将其来源中药川芎、地黄、枳壳、甘草及红花进行抗血小板聚集活性验证,血小板聚集率为9.82%±5.11%。与空白组相比,实验组可显著抑制二磷酸腺苷(adenosine diphosphate,ADP)诱导的血小板聚集(P<0.01),验证了有效成分群的准确性。该研究为血府逐瘀汤的物质基础研究提供了指导,同时也为经典名方的开发利用提供了研究思路。

关键词：血府逐瘀汤活血功效分子对接有效成分群

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基于靶标活性谱的理气功效和活血功效靶点分析

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中国中药杂志 2021年第15期46卷 3970-3979页

作者：马婧任越张嘉宁林力张燕玲北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488 中国中医科学院西苑医院基础医学研究所/中药药理北京市重点实验室北京100091

活血中药和理气中药,二者在中医临床上常常配伍使用,然而2类中药功效发挥作用的机制尚不清晰。中药靶标活性谱是能够标示中药活性成分及其作用靶标、作用强度的图谱,可用于中药功效作用机制的探索。该研究基于中药成分数据库获得常用活... 详细信息

活血中药和理气中药,二者在中医临床上常常配伍使用,然而2类中药功效发挥作用的机制尚不清晰。中药靶标活性谱是能够标示中药活性成分及其作用靶标、作用强度的图谱,可用于中药功效作用机制的探索。该研究基于中药成分数据库获得常用活血中药集、理气中药集及非活血、理气的阴性集化学成分。通过活血中药化学成分与DrugBank数据库中化学成分的相似度分析获得活血中药化学成分预测靶标,以两者的相似值作为活血中药化学成分与预测靶点的活性值,进而对成分-靶标活性值赋予权重。将每味中药作用于同一靶点的活性值进行融合,分别构建活血、理气、阴性中药靶标活性谱。选取活血、理气中药作用活性值大于阴性中药的靶点作为功效潜在作用靶点,分别构建蛋白-蛋白相互作用网络,进行拓扑、GO、KEGG富集分析,确定活血、理气功效的关键靶点。结果显示,基于DrugBank数据库收集获得成分-靶点活性信息,共包含4 499个化合物、627个靶点及11 295条作用关系。活血功效蛋白-蛋白相互作用网络包含206个节点和1 728条边,理气功效蛋白-蛋白相互作用网络包含230个节点和986条边。通过拓扑、GO、KEGG富集分析发现,活血中药主要通过作用于VEGF/VEGFR2介导的信号级联通路、ERK信号通路、钙信号通路、PI3K-AKT信号通路发挥抗炎、神经保护、血管生成等药效进而产生活血功效,关键靶点为丝裂原活化蛋白激酶3(mitogen activated protein kinases 3,MAPK3)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src,SRC)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen activated protein kinases 1,MAPK1)、人表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、磷脂酰肌醇-3-激酶亚基α(phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform,PIK3CA)、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferators-activated receptor gamma,PPARG)、内皮型一氧化氮合酶(nitric oxide synthase 3,NOS3)、前列腺素G/H合成酶2(prostaglandin G/h synthetase 2,PTGS2)、基质金属蛋白酶9(matrix metalloproteinase-9,MMP9)、血管内皮细胞生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)。理气中药主要通过作用于MAPK信号通路、PI3K-AKT信号通路发挥抗炎、神经保护等药效进而产生理气功效,关键靶点为丝裂原活化蛋白激酶8(mitogen activated protein kinases 8,MAPK8)、SRC、丝裂原活化蛋白激酶14(mitogen activated protein kinases 14,MAPK14)、PIK3CD、EGFR、RAC-α丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶(RAC-alpha serine/threonine-protein kinase,AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶3(mitogen activated protein kinases 3,MAPK3)。研究基于靶标活性谱进行了理气、活血功效的靶点分析,为中药功效靶标研究提供了借鉴,也为临床应用提供一定的科学依据。

关键词：靶标活性谱理气活血数据挖掘网络药理学

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金属组学研究概况及其在矿物药研究中的应用前景

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中国中药杂志 2021年第9期46卷 2142-2148页

作者：马瑜璐房方刘圣金张志杰林瑞超奥·乌力吉吴德康段金廒南京中医药大学药学院江苏省中药资源产业化过程协同创新中心中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心国家中医药管理局中药资源循环利用重点研究室江苏南京210023 中国中医科学院中药研究所北京100700 北京中医药大学中药学院北京102488 内蒙古民族大学内蒙古通辽028000

金属组学是近年来兴起的一门前沿交叉学科,正处于蓬勃发展阶段,其目标是系统研究生物体系内金属元素的含量、分布、化学种态、结构特征和功能等,也是研究生命体内自由或络合全部金属元素存在状态及其功能的综合学科。金属组学是研究无... 详细信息

金属组学是近年来兴起的一门前沿交叉学科,正处于蓬勃发展阶段,其目标是系统研究生物体系内金属元素的含量、分布、化学种态、结构特征和功能等,也是研究生命体内自由或络合全部金属元素存在状态及其功能的综合学科。金属组学是研究无机元素生物学行为的理想工具,矿物药研究中的诸多问题可以通过金属组学研究得到实现和解决。金属组学为矿物药研究提供了强有力的理论基础和技术支撑,其理论和方法为矿物药的深入研究提供了借鉴和启示,也为矿物药研究提供了新思路、开辟了新途径。利用金属组学理论和方法开展矿物药研究,对揭示矿物药的功效物质物质基础及作用机制、促进矿物药基础研究进程、充分开发利用药用矿产资源和弘扬祖国传统矿物药宝库具有重要的意义。该文介绍了金属组学的概念、学术发展概况、研究内容、研究方法等,同时探讨金属组学在矿物药无机元素成分特征分析及其质量控制、矿物药物质基础及作用机制研究方面的应用前景,以期为矿物药研究工作者提供参考。

关键词：金属组学矿物药无机元素金属元素金属离子物质基础作用机制

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中药中CYP酶抑制成分的发现

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中国中药杂志 2020年第4期45卷 923-931页

作者：赵亚楠陈艳昆陈茜乔连生张景芳蔡涟漪裴艳玲张燕玲北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室北京102488 河北鑫民和质检技术服务有限公司河北保定071200

随着中药以及中药与西药联合用药的广泛普及,其产生的药物-药物相互作用(drug-drug interaction,DDI)被认为是引起治疗效果减弱或药物毒副作用的主要原因。CYP酶负责大量药物的代谢,CYP3A4和CYP2D6是CYP酶的最主要的2个亚型,负责代谢超... 详细信息

随着中药以及中药与西药联合用药的广泛普及,其产生的药物-药物相互作用(drug-drug interaction,DDI)被认为是引起治疗效果减弱或药物毒副作用的主要原因。CYP酶负责大量药物的代谢,CYP3A4和CYP2D6是CYP酶的最主要的2个亚型,负责代谢超过80%以上经CYP代谢的药物。由于CYP酶的抑制是导致DDI最重要的一个因素。因此,发现中药中CYP3A4和CYP2D6的潜在抑制剂对于预防不良DDI的发生有重大意义。该文建立了一种快速且成本较低的CYP3A4和CYP2D6抑制成分的计算预测方法,即支持向量机(SVM)和分子对接技术,用来预测和筛选药物。首先利用SVM分别建立2个靶点的12个定性模型,并挑选最优的模型来预测在中药化学成分数据库(TCMD)的化合物。随后利用分子对接技术建立对接模型,通过分析药物与靶点相互作用的关键氨基酸,与SVM模型结合,发现CYP3A4和CYP2D6的潜在抑制剂。根据分子模拟的结果,astin D和表小檗碱(epiberberine)分别对CYP3A4和CYP2D6存在抑制作用。astin D只存在于紫菀的astins家族,而表小檗碱是中药黄连的活性成分,因此,这些潜在抑制剂的来源中药紫菀和黄连,应当在药物联合用药过程中警示DDI的发生。该计算方法利用SVM和分子对接模型为筛查中药中CYP酶抑制剂成分提供技术支持。该研究也有助于认识目前存在于中药中CYP酶介导的DDI,为进一步开展药物联合用药的预警提供研究思路。

关键词：药物-药物相互作用(DDI) CYP450 支持向量机分子对接中药

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基于VEGFR,FGFR探讨中药方剂对COVID-19后遗症肺纤维化的干预作用

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中国中药杂志 2020年第7期45卷 1481-1487页

作者：边亚倩马婧任越张燕玲乔延江北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

自2020年2月以来,随着疫情防控力度的加强,大批新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者治愈出院。肺纤维化是冠状病毒肺炎的后遗症之一,其不仅引起呼吸困难和肺功能指标的恶化,还具有死亡率高、预后不良的特点,严重影响患者的生活质量。血管内... 详细信息

自2020年2月以来,随着疫情防控力度的加强,大批新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者治愈出院。肺纤维化是冠状病毒肺炎的后遗症之一,其不仅引起呼吸困难和肺功能指标的恶化,还具有死亡率高、预后不良的特点,严重影响患者的生活质量。血管内皮生长因子受体(vascular endothelial growth factor receptor,VEGFR)、成纤维生长因子受体(fibroblast growth factor receptor,FGFR)通过介导参与肺纤维化进程的信号转导通路,抑制成纤维细胞增殖、活化与迁移,影响肺纤维的发生发展。基于中医整体观念指导下的中药方剂对肺纤维化具有良好的治疗效果,因此基于VEGFR和FGFR探讨中药对COVID-19后遗症肺纤维化的干预作用具有重要意义。该研究运用分子对接技术,通过构建VEGFR和FGFR靶点的对接模型,以原配体-CDCOKER ENERGY打分值的80%为阈值筛选方剂中的活性成分,并寻找其来源中药。通过检索成分命中率高于30%中药的性味归经及功效信息,构建中药-归经网络及中药-功效网络,结合《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第七版)》中2首、《中医疫病名方精选》中9首针对疫病恢复期的方剂,探讨了中药方剂治疗肺纤维化的规律。研究结果显示,基于VEGFR和FGFR靶点筛选获得潜在抗肺纤维化的活性成分分别为959,1 047个。VEGFR和FGFR靶点成分命中率达到30%以上的中药为黄芩、南沙参、半夏、薏苡仁、陈皮、白扁豆、白芍、桑叶、党参、玉竹、芦根、柴胡、黄芪、人参、西洋参、玄参、当归、丹参。分析上述中药性味归经及功效信息可知,治疗肺纤维化的中药主归肺(degree=14)、脾(degree=8)经,功效以补虚(degree=9)为主。结合恢复期推荐处方进行分析,上述中药在恢复期方剂中均有出现,其中以气阴两虚处方与补中益气汤命中中药数目最多。本次新型冠状病毒肺炎的主要证候为湿热蕴肺,内蕴邪热久羁,易于耗气伤津,临床观察显示,恢复期患者多处于余邪未尽、正气尚未恢复的阶段,主要表现为肺脾气虚,结合该研究分析,新型冠状病毒肺炎患者在此阶段,应当注重扶正祛邪,健脾益肺,进而缓解病毒导致的肺纤维化症状。研究结果旨在为中医药治疗COVID-19恢复期后遗症肺纤维化提供数据参考,并为临床用药提供指导。

关键词：新型冠状病毒肺炎肺纤维化分子对接血管内皮细胞生长因子受体成纤维生长因子受体中药方剂

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基于系统中药学的丹参组分功效研究

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中国中药杂志 2020年第14期45卷 3251-3258页

作者：任越霍梦琪马婧凤雯晴乔延江张燕玲北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

该研究旨在基于系统中药学的理论,利用文献挖掘、生物网络构建的技术,探讨建立丹参中2类代表性物质丹参酮类与丹酚酸类的功效系统,从中药功效系统的基本单元、基本单元间结构、关系、研究对象的边界、系统的功能展开中药功效系统研究,... 详细信息

该研究旨在基于系统中药学的理论,利用文献挖掘、生物网络构建的技术,探讨建立丹参中2类代表性物质丹参酮类与丹酚酸类的功效系统,从中药功效系统的基本单元、基本单元间结构、关系、研究对象的边界、系统的功能展开中药功效系统研究,从而在分子层面阐释2类成分表征的整体功效。该研究运用文献挖掘收集了2类成分功效系统的元素,依据生物过程划定了功效系统的边界,依据KEGG中元素之间的相互作用(关系)构建了功效系统的结构,并从药理、药效和功效3个层次分析了功效系统的功能,揭示中药功效系统的科学内涵。丹参组分功效研究结果显示,丹酚酸类功效系统中作用靶点(元素)201个,靶点集(边界)划分为12类,依据元素之间的相互作用(关系)构建的通路网络(结构)12个;丹参酮类功效系统中作用靶点(元素)189个,靶点集(边界)划分为11类,依据元素之间的相互作用(关系)构建的通路网络(结构)11个。基于丹酚酸类与丹参酮类功效系统中元素、边界、关系、结构,对功效系统的功能辨识研究发现,二者在药理、药效层次上功能不同,但在功效层次上功能相同,均产生活血祛瘀、清心除烦、安神的功效。该研究基于系统中药学构建了丹参中2类组分的功效系统,建立了中药还原论与整体论的桥梁,从本质上阐释2类组分表征的整体功效。

关键词：系统中药学丹参丹参酮类丹酚酸类功效系统

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基于系统中药学的中药功效标志物发现与应用

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中国中药杂志 2020年第14期45卷 3245-3250页

作者：霍梦琪彭莎任越舒展张燕玲乔延江北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

中药质量标志物是近年来提出的中药质量控制的新概念,是中药现代研究的热点问题。中药的功效是在中医药理论指导下对中药治疗作用的高度概括,在此基础上发掘中药的功效标志物对中药现代化发展具有重要意义。然而传统的基于中药宏观层面... 详细信息

中药质量标志物是近年来提出的中药质量控制的新概念,是中药现代研究的热点问题。中药的功效是在中医药理论指导下对中药治疗作用的高度概括,在此基础上发掘中药的功效标志物对中药现代化发展具有重要意义。然而传统的基于中药宏观层面的单味药材和饮片研究,或者基于靶点生物学效应的药物研究策略与中药多种成分及对靶点的弱作用、低选择性的整体性作用特点存在较大差异,因此如何从分子层面选取代表性成分表征中药整体功效特点是建立中药功效标志物的研究难点。该研究将质量标志物的概念和方法引入中药功效研究中,以系统中药学的研究方法,以代表性的研究成果为例,论述了中药功效标志物的内涵及其发现和确定的原则、常用研究思路和方法,为中药功效标志物的研究和发现提供新的思路。

关键词：系统中药学网络药理学功效标志物数据挖掘中药质量控制

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基于系统中药学的金银花清热解毒功效标志物研究

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中国中药杂志 2020年第14期45卷 3275-3281页

作者：彭莎霍晓乾霍梦琪刘亚楠张燕玲乔延江北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

金银花的清热解毒功效历史悠久,历版《中国药典》对其功效的描述较为稳定,是研究功效标志物的优良载体。该文以系统中药学理论为指导,以金银花清热解毒功效系统为研究示例,明确了金银花清热解毒功效系统的元素(活性成分),划定了边界(信... 详细信息

金银花的清热解毒功效历史悠久,历版《中国药典》对其功效的描述较为稳定,是研究功效标志物的优良载体。该文以系统中药学理论为指导,以金银花清热解毒功效系统为研究示例,明确了金银花清热解毒功效系统的元素(活性成分),划定了边界(信号通路),建立了结构(系统动力学模型),辨识了其药理、药效和功效相应的系统功能(清热解毒功效),探讨系统动力学模型在发现中药功效标志物中的应用。通过建立生物体内白细胞介素-1(interleukin 1,IL-1)、白细胞介素-6(interleukin 6,IL-6)相关动力学模型,通过动态网络预测金银花中不同成分及成分组合在IL-1,IL-6信号通路中相关因子的表达,以期发现金银花清热解毒功效标志物。研究结果表明在IL-1通路中,绿原酸较低浓度下,与芳樟醇组合对IL-1下游Jun氨基末端激酶(Jun N-terminal kinase,JNK)抑制率更高;在IL-6通路中,绿原酸浓度越大,与木犀草素组合对IL-6下游C反应蛋白(C-reactive protein,CRP)抑制率更高;提示基于IL-1信号通路的金银花清热解毒功效的潜在功效标志物为绿原酸和芳樟醇,基于IL-6信号通路的金银花清热解毒功效的潜在功效标志物为绿原酸和木犀草素。该研究为中药功效标志物的发现提供了方法学指导。

关键词：系统中药学金银花清热解毒 IL-1 IL-6 功效标志物

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基于系统中药学的丹参活血化瘀功效标志物研究

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中国中药杂志 2020年第14期45卷 3259-3265页

作者：马婧陈茜边亚倩陈紫军乔延江张燕玲北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

活血化瘀中药在临床上应用广泛,然而由于中药成分的多样性与人体相互作用的复杂性,难以应用传统质控成分表征其整体功效。系统中药学是研究中药功效的有效手段,体现了整体论与还原论的辨证统一。丹参为活血化瘀的常用中药,该研究基于系... 详细信息

活血化瘀中药在临床上应用广泛,然而由于中药成分的多样性与人体相互作用的复杂性,难以应用传统质控成分表征其整体功效。系统中药学是研究中药功效的有效手段,体现了整体论与还原论的辨证统一。丹参为活血化瘀的常用中药,该研究基于系统中药学的理论,构建了"功效-药理药效-靶点-成分"多维网络,探讨了丹参活血化瘀功效标志物的发现。首先,对活血化瘀功效系统进行研究,基于中药功效-药理数据库获得了活血化瘀功效(功能)相关性最大的药理药效(边界),然后应用DrugBank数据库获得相应药理作用的药物靶标集(结构),运用STRING数据库构建活血化瘀相关靶标的蛋白-蛋白互作网络(关系),通过评价靶点拓扑参数筛选网络中的关键靶点(元素)。最后基于分子对接进行丹参酚酸类及丹参酮类成分辨识,预测丹参活血化瘀功效标志物。该研究结果表明丹参活血化瘀功效的潜在标志物为丹酚酸B、丹酚酸A、丹参酮Ⅱ_A、丹参酮Ⅰ,其中,丹酚酸B、丹酚酸A、丹参酮Ⅱ_A已有文献报道其具有活血化瘀功效相关的抗血小板聚集、抗血栓、保护心脑血管等药理药效。该研究基于系统中药学,初步探讨了丹参活血化瘀功效标志物,为功效标志物的发现提供了研究方法,为中药整体质量控制提供了参考。

关键词：系统中药学功效标志物活血化瘀丹参

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基于系统中药学的黄芪补气潜在功效标志物的发掘

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中国中药杂志 2020年第14期45卷 3266-3274页

作者：边亚倩李晶彭莎吕恬仪张燕玲乔延江北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

黄芪为补气之圣药,具有补气升阳,益卫固表的功效。随着黄芪化学成分研究的日益深入,其在临床上的应用也更加广泛。该研究基于系统中药学的理论,从分子层面表征黄芪补气功效,发掘黄芪补气功效标志物。通过TCMSP及ChEMBL数据库构建黄芪有... 详细信息

黄芪为补气之圣药,具有补气升阳,益卫固表的功效。随着黄芪化学成分研究的日益深入,其在临床上的应用也更加广泛。该研究基于系统中药学的理论,从分子层面表征黄芪补气功效,发掘黄芪补气功效标志物。通过TCMSP及ChEMBL数据库构建黄芪有效成分-靶点数据库,明确黄芪补气功效系统所涉及的靶点(元素)。根据靶点间的关系构建蛋白互作网络,并依据分子复合物检测算法(MCODE)划分网络模块(结构),以黄芪发挥补气功效(功能)的药理作用划定其补气功效系统的边界。从成分、靶点、药效层次上探讨表征黄芪补气功效成分。结果表明,黄芪中的常春藤皂苷元、槲皮素、毛蕊异黄酮、刺芒柄花素、华良姜素、异鼠李素、黄芪皂苷Ⅲ、黄芪异黄烷苷等8个关键成分可作用于17个关键靶点构成的8个功能模块,参与G蛋白偶联受体信号通路、脂质代谢过程、氮化合物代谢的正调控、细胞程序性死亡调控、脂肪酸代谢过程的调节等生命过程,产生调节机体免疫功能、强心、保护心肌细胞、改善物质代谢、抗氧化等药理作用,进而发挥补气的功效。该研究基于系统中药学的理论,从分子网络的水平发掘了黄芪补气的功效标志物,为中药药效物质基础阐释及中药质量控制研究提供了新思路。今后可聚焦于这些成分进行配伍研究,进而对黄芪补气功效展开更深入的研究,并加强相应疾病的药理机制及相关制剂的开发。

关键词：系统中药学黄芪补气功效标志物

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