目的:基于网络药理学与分子对接技术探讨莪术奥酮二醇(Zedoarondiol)治疗动脉粥样硬化跨内皮迁移(transendothelial migration of atherosclerosis,TEMA)的作用机制。方法:采用OMIM和GeneCards数据库检索TEMA的靶点。通过PharmMapper和S...
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目的:基于网络药理学与分子对接技术探讨莪术奥酮二醇(Zedoarondiol)治疗动脉粥样硬化跨内皮迁移(transendothelial migration of atherosclerosis,TEMA)的作用机制。方法:采用OMIM和GeneCards数据库检索TEMA的靶点。通过PharmMapper和Swiss Target Prediction数据库检索Zedoarondiol的作用靶点。利用Venny 2.1软件获取TEMA与Zedoarondiol的交集靶点,通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络。借助Network Analyzer插件对PPI网络进行拓扑分析,并根据Degree值筛选核心靶点。利用DAVID数据库进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析。最后,通过PyRx AutoDock Vina软件进行分子对接验证。结果:通过检索得到TEMA靶点1340个,Zedoarondiol靶点215个,两者的交集靶点58个。Zedoarondiol治疗TEMA的核心靶点包括原癌基因酪氨酸蛋白激酶Src(SRC)、磷脂酰肌醇3-激酶调节亚基1(phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit 1,PIK3R1)、蛋白酪氨酸磷酸酶非受体型11(protein tyrosine phosphatase nonreceptor 11,PTPN11)等。GO分析结果主要包括肽基酪氨酸磷酸化、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶的正向调节等。KEGG分析结果主要包括Ras信号通路、血脂和动脉粥样硬化、VEGF信号通路、PI3K-Akt信号通路等。分子对接结果显示,Zedoarondiol与核心靶点(PIK3R1、SRC、PTPN11)的结合能均小于-5 kcal·mol^(-1)。结论:Zedoarondiol可能通过调节Ras、VEGF、PI3K-Akt等信号通路,以及SRC、PIK3R1、PTPN11等靶点,从而发挥治疗TEMA的作用。
目的应用CiteSpace和VOSviewer软件对近20年中冠心病与勃起功能障碍研究领域的研究现状、热点及趋势进行可视化分析。方法以Web of Science核心合集数据库为数据来源,利用可视化分析软件CiteSpace和VOSviewer对2004年1月至2021年10月中...
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目的应用CiteSpace和VOSviewer软件对近20年中冠心病与勃起功能障碍研究领域的研究现状、热点及趋势进行可视化分析。方法以Web of Science核心合集数据库为数据来源,利用可视化分析软件CiteSpace和VOSviewer对2004年1月至2021年10月中冠心病与勃起功能障碍的相关研究进行可视化分析,探讨相关研究的作者、国家/机构分布以及对关键词进行分析。结果纳入文献549篇,发文量于2012年之前呈波动上升趋势,2012年之后有下降趋势。各国发文量存在明显差异,发文量前15名国家中有12个为欧美及发达国家。作者/机构间形成了多个较稳定的合作团队,但各团队合作并不紧密。关键词分析发现涉及药物治疗、临床试验、荟萃分析、结局指标等多维度、多层次的研究类型。结论近20年关于冠心病与勃起功能障碍的研究内容较丰富,目前研究热点趋势为总结临床经验和文献研究,潜在机制有待进一步探究。
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