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基于VEGFR,FGFR探讨中药方剂对COVID-19后遗症肺纤维化的干预作用

中国中药杂志 2020年第7期45卷 1481-1487页

作者：边亚倩马婧任越张燕玲乔延江北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

自2020年2月以来,随着疫情防控力度的加强,大批新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者治愈出院。肺纤维化是冠状病毒肺炎的后遗症之一,其不仅引起呼吸困难和肺功能指标的恶化,还具有死亡率高、预后不良的特点,严重影响患者的生活质量。血管内... 详细信息

自2020年2月以来,随着疫情防控力度的加强,大批新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者治愈出院。肺纤维化是冠状病毒肺炎的后遗症之一,其不仅引起呼吸困难和肺功能指标的恶化,还具有死亡率高、预后不良的特点,严重影响患者的生活质量。血管内皮生长因子受体(vascular endothelial growth factor receptor,VEGFR)、成纤维生长因子受体(fibroblast growth factor receptor,FGFR)通过介导参与肺纤维化进程的信号转导通路,抑制成纤维细胞增殖、活化与迁移,影响肺纤维的发生发展。基于中医整体观念指导下的中药方剂对肺纤维化具有良好的治疗效果,因此基于VEGFR和FGFR探讨中药对COVID-19后遗症肺纤维化的干预作用具有重要意义。该研究运用分子对接技术,通过构建VEGFR和FGFR靶点的对接模型,以原配体-CDCOKER ENERGY打分值的80%为阈值筛选方剂中的活性成分,并寻找其来源中药。通过检索成分命中率高于30%中药的性味归经及功效信息,构建中药-归经网络及中药-功效网络,结合《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第七版)》中2首、《中医疫病名方精选》中9首针对疫病恢复期的方剂,探讨了中药方剂治疗肺纤维化的规律。研究结果显示,基于VEGFR和FGFR靶点筛选获得潜在抗肺纤维化的活性成分分别为959,1 047个。VEGFR和FGFR靶点成分命中率达到30%以上的中药为黄芩、南沙参、半夏、薏苡仁、陈皮、白扁豆、白芍、桑叶、党参、玉竹、芦根、柴胡、黄芪、人参、西洋参、玄参、当归、丹参。分析上述中药性味归经及功效信息可知,治疗肺纤维化的中药主归肺(degree=14)、脾(degree=8)经,功效以补虚(degree=9)为主。结合恢复期推荐处方进行分析,上述中药在恢复期方剂中均有出现,其中以气阴两虚处方与补中益气汤命中中药数目最多。本次新型冠状病毒肺炎的主要证候为湿热蕴肺,内蕴邪热久羁,易于耗气伤津,临床观察显示,恢复期患者多处于余邪未尽、正气尚未恢复的阶段,主要表现为肺脾气虚,结合该研究分析,新型冠状病毒肺炎患者在此阶段,应当注重扶正祛邪,健脾益肺,进而缓解病毒导致的肺纤维化症状。研究结果旨在为中医药治疗COVID-19恢复期后遗症肺纤维化提供数据参考,并为临床用药提供指导。

关键词：新型冠状病毒肺炎肺纤维化分子对接血管内皮细胞生长因子受体成纤维生长因子受体中药方剂

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基于系统中药学的丹参组分功效研究

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中国中药杂志 2020年第14期45卷 3251-3258页

作者：任越霍梦琪马婧凤雯晴乔延江张燕玲北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

该研究旨在基于系统中药学的理论,利用文献挖掘、生物网络构建的技术,探讨建立丹参中2类代表性物质丹参酮类与丹酚酸类的功效系统,从中药功效系统的基本单元、基本单元间结构、关系、研究对象的边界、系统的功能展开中药功效系统研究,... 详细信息

该研究旨在基于系统中药学的理论,利用文献挖掘、生物网络构建的技术,探讨建立丹参中2类代表性物质丹参酮类与丹酚酸类的功效系统,从中药功效系统的基本单元、基本单元间结构、关系、研究对象的边界、系统的功能展开中药功效系统研究,从而在分子层面阐释2类成分表征的整体功效。该研究运用文献挖掘收集了2类成分功效系统的元素,依据生物过程划定了功效系统的边界,依据KEGG中元素之间的相互作用(关系)构建了功效系统的结构,并从药理、药效和功效3个层次分析了功效系统的功能,揭示中药功效系统的科学内涵。丹参组分功效研究结果显示,丹酚酸类功效系统中作用靶点(元素)201个,靶点集(边界)划分为12类,依据元素之间的相互作用(关系)构建的通路网络(结构)12个;丹参酮类功效系统中作用靶点(元素)189个,靶点集(边界)划分为11类,依据元素之间的相互作用(关系)构建的通路网络(结构)11个。基于丹酚酸类与丹参酮类功效系统中元素、边界、关系、结构,对功效系统的功能辨识研究发现,二者在药理、药效层次上功能不同,但在功效层次上功能相同,均产生活血祛瘀、清心除烦、安神的功效。该研究基于系统中药学构建了丹参中2类组分的功效系统,建立了中药还原论与整体论的桥梁,从本质上阐释2类组分表征的整体功效。

关键词：系统中药学丹参丹参酮类丹酚酸类功效系统

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基于系统中药学的丹参活血化瘀功效标志物研究

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中国中药杂志 2020年第14期45卷 3259-3265页

作者：马婧陈茜边亚倩陈紫军乔延江张燕玲北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

活血化瘀中药在临床上应用广泛,然而由于中药成分的多样性与人体相互作用的复杂性,难以应用传统质控成分表征其整体功效。系统中药学是研究中药功效的有效手段,体现了整体论与还原论的辨证统一。丹参为活血化瘀的常用中药,该研究基于系... 详细信息

活血化瘀中药在临床上应用广泛,然而由于中药成分的多样性与人体相互作用的复杂性,难以应用传统质控成分表征其整体功效。系统中药学是研究中药功效的有效手段,体现了整体论与还原论的辨证统一。丹参为活血化瘀的常用中药,该研究基于系统中药学的理论,构建了"功效-药理药效-靶点-成分"多维网络,探讨了丹参活血化瘀功效标志物的发现。首先,对活血化瘀功效系统进行研究,基于中药功效-药理数据库获得了活血化瘀功效(功能)相关性最大的药理药效(边界),然后应用DrugBank数据库获得相应药理作用的药物靶标集(结构),运用STRING数据库构建活血化瘀相关靶标的蛋白-蛋白互作网络(关系),通过评价靶点拓扑参数筛选网络中的关键靶点(元素)。最后基于分子对接进行丹参酚酸类及丹参酮类成分辨识,预测丹参活血化瘀功效标志物。该研究结果表明丹参活血化瘀功效的潜在标志物为丹酚酸B、丹酚酸A、丹参酮Ⅱ_A、丹参酮Ⅰ,其中,丹酚酸B、丹酚酸A、丹参酮Ⅱ_A已有文献报道其具有活血化瘀功效相关的抗血小板聚集、抗血栓、保护心脑血管等药理药效。该研究基于系统中药学,初步探讨了丹参活血化瘀功效标志物,为功效标志物的发现提供了研究方法,为中药整体质量控制提供了参考。

关键词：系统中药学功效标志物活血化瘀丹参

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基于系统中药学的金银花清热解毒功效标志物研究

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中国中药杂志 2020年第14期45卷 3275-3281页

作者：彭莎霍晓乾霍梦琪刘亚楠张燕玲乔延江北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

金银花的清热解毒功效历史悠久,历版《中国药典》对其功效的描述较为稳定,是研究功效标志物的优良载体。该文以系统中药学理论为指导,以金银花清热解毒功效系统为研究示例,明确了金银花清热解毒功效系统的元素(活性成分),划定了边界(信... 详细信息

金银花的清热解毒功效历史悠久,历版《中国药典》对其功效的描述较为稳定,是研究功效标志物的优良载体。该文以系统中药学理论为指导,以金银花清热解毒功效系统为研究示例,明确了金银花清热解毒功效系统的元素(活性成分),划定了边界(信号通路),建立了结构(系统动力学模型),辨识了其药理、药效和功效相应的系统功能(清热解毒功效),探讨系统动力学模型在发现中药功效标志物中的应用。通过建立生物体内白细胞介素-1(interleukin 1,IL-1)、白细胞介素-6(interleukin 6,IL-6)相关动力学模型,通过动态网络预测金银花中不同成分及成分组合在IL-1,IL-6信号通路中相关因子的表达,以期发现金银花清热解毒功效标志物。研究结果表明在IL-1通路中,绿原酸较低浓度下,与芳樟醇组合对IL-1下游Jun氨基末端激酶(Jun N-terminal kinase,JNK)抑制率更高;在IL-6通路中,绿原酸浓度越大,与木犀草素组合对IL-6下游C反应蛋白(C-reactive protein,CRP)抑制率更高;提示基于IL-1信号通路的金银花清热解毒功效的潜在功效标志物为绿原酸和芳樟醇,基于IL-6信号通路的金银花清热解毒功效的潜在功效标志物为绿原酸和木犀草素。该研究为中药功效标志物的发现提供了方法学指导。

关键词：系统中药学金银花清热解毒 IL-1 IL-6 功效标志物

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基于系统中药学的中药功效标志物发现与应用

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中国中药杂志 2020年第14期45卷 3245-3250页

作者：霍梦琪彭莎任越舒展张燕玲乔延江北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

中药质量标志物是近年来提出的中药质量控制的新概念,是中药现代研究的热点问题。中药的功效是在中医药理论指导下对中药治疗作用的高度概括,在此基础上发掘中药的功效标志物对中药现代化发展具有重要意义。然而传统的基于中药宏观层面... 详细信息

中药质量标志物是近年来提出的中药质量控制的新概念,是中药现代研究的热点问题。中药的功效是在中医药理论指导下对中药治疗作用的高度概括,在此基础上发掘中药的功效标志物对中药现代化发展具有重要意义。然而传统的基于中药宏观层面的单味药材和饮片研究,或者基于靶点生物学效应的药物研究策略与中药多种成分及对靶点的弱作用、低选择性的整体性作用特点存在较大差异,因此如何从分子层面选取代表性成分表征中药整体功效特点是建立中药功效标志物的研究难点。该研究将质量标志物的概念和方法引入中药功效研究中,以系统中药学的研究方法,以代表性的研究成果为例,论述了中药功效标志物的内涵及其发现和确定的原则、常用研究思路和方法,为中药功效标志物的研究和发现提供新的思路。

关键词：系统中药学网络药理学功效标志物数据挖掘中药质量控制

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基于系统中药学的黄芪补气潜在功效标志物的发掘

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中国中药杂志 2020年第14期45卷 3266-3274页

作者：边亚倩李晶彭莎吕恬仪张燕玲乔延江北京中医药大学中药学院国家中医药管理局中药信息工程重点实验室中药制药与新药开发关键技术教育部工程研究中心北京102488

黄芪为补气之圣药,具有补气升阳,益卫固表的功效。随着黄芪化学成分研究的日益深入,其在临床上的应用也更加广泛。该研究基于系统中药学的理论,从分子层面表征黄芪补气功效,发掘黄芪补气功效标志物。通过TCMSP及ChEMBL数据库构建黄芪有... 详细信息

黄芪为补气之圣药,具有补气升阳,益卫固表的功效。随着黄芪化学成分研究的日益深入,其在临床上的应用也更加广泛。该研究基于系统中药学的理论,从分子层面表征黄芪补气功效,发掘黄芪补气功效标志物。通过TCMSP及ChEMBL数据库构建黄芪有效成分-靶点数据库,明确黄芪补气功效系统所涉及的靶点(元素)。根据靶点间的关系构建蛋白互作网络,并依据分子复合物检测算法(MCODE)划分网络模块(结构),以黄芪发挥补气功效(功能)的药理作用划定其补气功效系统的边界。从成分、靶点、药效层次上探讨表征黄芪补气功效成分。结果表明,黄芪中的常春藤皂苷元、槲皮素、毛蕊异黄酮、刺芒柄花素、华良姜素、异鼠李素、黄芪皂苷Ⅲ、黄芪异黄烷苷等8个关键成分可作用于17个关键靶点构成的8个功能模块,参与G蛋白偶联受体信号通路、脂质代谢过程、氮化合物代谢的正调控、细胞程序性死亡调控、脂肪酸代谢过程的调节等生命过程,产生调节机体免疫功能、强心、保护心肌细胞、改善物质代谢、抗氧化等药理作用,进而发挥补气的功效。该研究基于系统中药学的理论,从分子网络的水平发掘了黄芪补气的功效标志物,为中药药效物质基础阐释及中药质量控制研究提供了新思路。今后可聚焦于这些成分进行配伍研究,进而对黄芪补气功效展开更深入的研究,并加强相应疾病的药理机制及相关制剂的开发。

关键词：系统中药学黄芪补气功效标志物

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金属组学研究概况及其在矿物药研究中的应用前景

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中国中药杂志 2021年第9期46卷 2142-2148页

作者：马瑜璐房方刘圣金张志杰林瑞超奥·乌力吉吴德康段金廒南京中医药大学药学院江苏省中药资源产业化过程协同创新中心中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心国家中医药管理局中药资源循环利用重点研究室江苏南京210023 中国中医科学院中药研究所北京100700 北京中医药大学中药学院北京102488 内蒙古民族大学内蒙古通辽028000

金属组学是近年来兴起的一门前沿交叉学科,正处于蓬勃发展阶段,其目标是系统研究生物体系内金属元素的含量、分布、化学种态、结构特征和功能等,也是研究生命体内自由或络合全部金属元素存在状态及其功能的综合学科。金属组学是研究无... 详细信息

金属组学是近年来兴起的一门前沿交叉学科,正处于蓬勃发展阶段,其目标是系统研究生物体系内金属元素的含量、分布、化学种态、结构特征和功能等,也是研究生命体内自由或络合全部金属元素存在状态及其功能的综合学科。金属组学是研究无机元素生物学行为的理想工具,矿物药研究中的诸多问题可以通过金属组学研究得到实现和解决。金属组学为矿物药研究提供了强有力的理论基础和技术支撑,其理论和方法为矿物药的深入研究提供了借鉴和启示,也为矿物药研究提供了新思路、开辟了新途径。利用金属组学理论和方法开展矿物药研究,对揭示矿物药的功效物质物质基础及作用机制、促进矿物药基础研究进程、充分开发利用药用矿产资源和弘扬祖国传统矿物药宝库具有重要的意义。该文介绍了金属组学的概念、学术发展概况、研究内容、研究方法等,同时探讨金属组学在矿物药无机元素成分特征分析及其质量控制、矿物药物质基础及作用机制研究方面的应用前景,以期为矿物药研究工作者提供参考。

关键词：金属组学矿物药无机元素金属元素金属离子物质基础作用机制

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关于藏族药新药注册监管策略的思考

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中国中药杂志 2022年第19期47卷 5383-5388页

作者：梁丹边巴次仁于江泳唐健元周跃华华桦陈维武艾彦伶周刚张磊王停张永文邹冲梁伟雄夏结来赵耐青孙晓波魏玮王保和丁红王国辰普穷次仁格桑平措王国强成都中医药大学附属医院四川成都610075 国家药品监督管理局北京100037 国家药品监督管理局药品审评中心北京100022 四川省中医药科学院转化药理与临床应用研究所四川省中医药转化医学中心四川省道地药材系统开发工程技术研究中心四川省道地药材形成原理与品质评价工程研究中心国家中医药管理局中药质量生物评价重点研究室四川成都610041 西藏宇正健康科技有限公司西藏拉萨850000 上海中医药大学上海201203 北京中医药大学北京100029 南京中医药大学江苏南京210023 江苏省中医院江苏南京210004 广东省中医院广东广州510120 中国人民解放军空军军医大学陕西西安710038 复旦大学上海200433 中国医学科学院药用植物研究所北京100094 中国中医科学院望京医院北京100102 天津中医药大学第二附属医院天津300150 中华中医药学会北京100029 西藏自治区藏医院西藏拉萨850002

藏族医药是我国传统医学的重要组成部分,有其独特的理论经验和治疗优势。在“传承精华,守正创新”的发展背景下,监管部门也应针对藏族医药的特点给出清晰合理的导向,探索符合藏族药物特色的注册管理机制,建立并完善药品质量控制、临床... 详细信息

藏族医药是我国传统医学的重要组成部分,有其独特的理论经验和治疗优势。在“传承精华,守正创新”的发展背景下,监管部门也应针对藏族医药的特点给出清晰合理的导向,探索符合藏族药物特色的注册管理机制,建立并完善药品质量控制、临床验证与评价的标准体系,加快藏族药物新药研发和成果转化。该文立足药品供给侧结构性改革的需求,基于藏族医药与新药研发现状,针对当前藏族药物新药注册监管所面临的困惑进行思考并提出建议,希望有助于藏族药物新药注册监管策略的完善和民族药产业的高质量发展。

关键词：藏族药药品注册监管医院制剂人用经验

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基于活血化瘀功效的温苦肝、寒苦肝性效关系研究

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中国中药杂志 2019年第2期44卷 212-217页

作者：李晶吴东雪候宁刘敏张燕玲乔延江北京中医药大学国家中医药管理局中药信息工程重点实验室北京100102

活血化瘀中药是临床上常用的一类功能相同的药物,且多性属寒温,是研究中药药性和功效关系的优良载体。所以为了探讨活血化瘀中药的寒温差异与其功效的内在联系,该文通过数据库检索获取温苦肝、寒苦肝组合的主要有效成分及作用靶点,应用C... 详细信息

活血化瘀中药是临床上常用的一类功能相同的药物,且多性属寒温,是研究中药药性和功效关系的优良载体。所以为了探讨活血化瘀中药的寒温差异与其功效的内在联系,该文通过数据库检索获取温苦肝、寒苦肝组合的主要有效成分及作用靶点,应用Cytoscape 3. 5. 1平台构建蛋白互作网络,采用Bin GO插件对识别出的功能模块进行功能注释和统计分析,结果表明苦-肝组合主要通过参与细胞周期、脂质代谢、血液循环等生命过程而发挥活血祛瘀的功效;寒性蛋白网络主要通过EDNRA等靶点参与血管收缩、通过PLAU等靶点调节凝血,从而发挥凉血消痈的功效;温性蛋白网络主要通过P2RY12等靶点参与调节血小板活化,从而发挥活血行气、通经止痛的功效。该研究从分子网络水平阐释了苦-肝组合的共性特征和温、寒的特异性特征,为中药的药性与功效的内在联系研究提供了新思路。

关键词：药性组合蛋白互作网络功能模块活血化瘀

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基于药性组合的姜黄、郁金、莪术的性效关系研究

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中国中药杂志 2019年第2期44卷 229-234页

作者：吴东雪候宁李晶刘敏张燕玲乔延江北京中医药大学国家中医药管理局中药信息工程重点实验室北京100102

姜黄、郁金、莪术均来源于姜科植物,为同一植物的不同药用部分,但三者药性不同,从而产生的功效、针对的症状亦不相同,姜黄、莪术的药性组合均为温辛肝、温苦肝,郁金的药性组合为寒心肝、寒苦肝、寒辛心、寒苦心,对比分析郁金与姜黄、莪... 详细信息

姜黄、郁金、莪术均来源于姜科植物,为同一植物的不同药用部分,但三者药性不同,从而产生的功效、针对的症状亦不相同,姜黄、莪术的药性组合均为温辛肝、温苦肝,郁金的药性组合为寒心肝、寒苦肝、寒辛心、寒苦心,对比分析郁金与姜黄、莪术的性效关系的相关性和差异性,阐释三者作用机制的异同点。该文以姜黄、郁金、莪术为研究载体,通过TCMD,TCMSP,Ch EMBL数据库获取其有效成分及作用靶点,构建蛋白互作网络,对网络进行模块聚类分析。姜黄、郁金的对比研究表明,姜黄性温,通过P2RY12,GNG2等基因调节血液凝固发挥通经止痛功效;郁金性寒,通过LDLR,APOB,PRKCA,SOD1,TP53等基因调节脂质代谢、血浆脂蛋白水平、血小板活化、氧化应激反应、凋亡等过程发挥清心凉血的功效。姜黄、郁金的对比研究表明,莪术性温,通过GRIA2,GRIA4等基因调节神经系统过程发挥其破血逐瘀的功效;郁金性寒,通过CALM1,LPL,APOB,SOD1,TP53等基因调节血小板活化、脂质代谢、血浆脂蛋白、氧化应激、凋亡过程发挥清心凉血的功效。姜黄、郁金、莪术三者均为辛苦味,归肝经,其活血功效可能与参与脂质代谢、血液凝固、血红蛋白、血小板脱粒等过程有关。通过对3味中药的网络进行聚类分析,有利于阐释药性组合与功效的内在联系,为药性与功效规律的研究奠定基础。

关键词：姜黄郁金莪术蛋白互作网络药性组合性效关系

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