检索结果-内蒙古大学图书馆

高等学校化学学报 2005年第3期26卷 546-549页

作者：任天瑞沈斌裴剑锋汪永生向文胜国家生物化学工程技术研究中心中国科学院过程工程研究所北京大学化学与分子工程学院分子动态与稳态结构国家重点实验室北京大学理论生物学中心中国科学院计算机网络信息中心北京100080

采用 DISCOtech方法 ,用 7个大鼠 γ-氨基丁酸 (GABA) A 受体抑制剂和 1 1个家蝇 GABAA 受体抑制剂分别建立了其药效团模型 ;用 Co MFA方法建立了 2 2个大鼠 GABAA 受体抑制剂和 2 9个家蝇 GABAA 受体抑制剂的 3 D-QSAR模型 ,模型的交... 详细信息

采用 DISCOtech方法 ,用 7个大鼠 γ-氨基丁酸 (GABA) A 受体抑制剂和 1 1个家蝇 GABAA 受体抑制剂分别建立了其药效团模型 ;用 Co MFA方法建立了 2 2个大鼠 GABAA 受体抑制剂和 2 9个家蝇 GABAA 受体抑制剂的 3 D-QSAR模型 ,模型的交叉验证相关系数分别为 0 .5 2 6和 0 .679,验证了药效团模型的合理性。

关键词： GABAA受体药效团模型三维定量构效关系(3D-QSAR) 比较分子力场分析(CoMFA)

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片断分子的建立和正则轨道的定域化

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计算机与应用化学 2005年第3期22卷 161-167页

作者：虞海江马艳平刘向文中国科学技术大学计算机系安徽合肥230026 中国科学院化学研究所分子动态稳态国家重点实验室北京100080

为了研究共轭分子的芳香性,我们建立了新的作用能分解法。该方法的核心是为任何一个共轭分子提供一个π和σ体系彻底分离的轨道基组{Φ_m^(P-π),Φ_l^(P-σ),Φ_t^P}。为此,放射形环炔烃分子(D_(3h)对称的)必须分割成3个乙炔片断(A,C,E... 详细信息

为了研究共轭分子的芳香性,我们建立了新的作用能分解法。该方法的核心是为任何一个共轭分子提供一个π和σ体系彻底分离的轨道基组{Φ_m^(P-π),Φ_l^(P-σ),Φ_t^P}。为此,放射形环炔烃分子(D_(3h)对称的)必须分割成3个乙炔片断(A,C,E)和3个乙烯片断(B,D,F),它的{Φ_m^(P-π),Φ_l^(P-σ),Φ_t^P}是由6个片断的轨道基组{ψ_k^(P-π),ψ_n^(P-σ),φ_s^('P)}(P=A,B,…,F)叠加而成。FMP-L和FMP-R(P=A,B,…,F)是片断P的两个片断分子,设它们C-H_R键的键长分别是r_R(P)和r_L(P)。在定域化后,单占据轨道φ_s^('P)和参考氢原子H_R占据轨道φ_h^('H)的总电子数∑q_(?)(P)+∑q_h(P)总是正确的,与r_R(P)和r_L(P)的取值无关。但是,{φ_s^('P)的空间取向取决于r_L(P)和r_R(P)的值。在片断A和B中,R_V(A)=(-V/T)=1.95153+0.50869*r_R^V(A),R_V(B)=1.94556+0.54823*r_R^V(B),设R_V=2,则r_R^V(A)=0.09528nm,r_R^V(B)=0.09930nm。另外,有条件地优化FMP-R可算得:r_R^O(A)=0.10658nm,r_R^O(B)=0.10888nm。当r_R^V(P)和r_R^O(P)确定后,可得到;q_S^V(A)=6.05124-56.5228*r_L^V(A),q_S^V(B)=5.17915-47.0804*r_L^V(B);q_S^O(A)=5.81883-49.0924*r_L^O(A),q_S^O(B)=4.70043-39.0818*r_L^O(B)。然后设q_S(P)=q_h(P)=(1/4)(∑q_S(P)+∑q_h(P)),可得到:r_L^V(A)=0.08937nm,r_L^V(B)=0.08678nm;r_L^O(A)=0.09816nm,r_L^O(B)=0.09297nm,再由r_R^V(P)和r_L^V(P)计算的{Φ_m^(P-π),Φ_l^(P-σ),Φ_t^P}中,每一对成键单占据轨道Φ_t^P的电子占据数Q_t比较均匀合理,它的12个单占据轨道的电子总占据数为∑Q_t=12.3。另外,在由{Φ_m^(P-π),Φ_l^(P-σ),Φ_t^P}~V算得的FUL态中,轨道分布也是更好地满足FUL态的基本特征。所以r_R^V(P)和r_L^V(P)比r_R^O(P)和r_L^O(P)更为合理。

关键词：轨道定域化片断分子片断分子轨道轨道电子占据数能量分解

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PtCo双金属的环己烯加氢和歧化催化反应研究

PtCo双金属的环己烯加氢和歧化催化反应研究

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第十二届全国催化学术会议

作者：林伟王松蕊朱月香谢有畅北京大学化学与分子工程学院分子动态与稳态结构国家重点实验室(北京)

利用氢气同时还原由浸渍法制备的复合氧化物得到PtCo双金属催化剂,并研究了其对低温环己烯加氢和歧化反应的催化性能,结果表明其催化反应活性均高于单金属Co或Pt催化剂.

关键词：双金属催化剂环己烯加氢歧化复合氧化

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分子水平上低碳烷烃催化选择氧化的初步研究

分子水平上低碳烷烃催化选择氧化的初步研究

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第十届全国青年催化学术会议

作者：刘海超北京大学化学与分子工程学院分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100871

作为从模型催化剂入手,获得分子水平上对催化剂活性位认识的一个例子,本文简要介绍了我们通过研究结构和组成明确的三个Re-Sb复合氧化物晶体在烷烃选择氨氧化中表现出的不同催化性能,发现了SbRe2O6的特定(100)晶面结构以及NH3与这个晶... 详细信息

作为从模型催化剂入手,获得分子水平上对催化剂活性位认识的一个例子,本文简要介绍了我们通过研究结构和组成明确的三个Re-Sb复合氧化物晶体在烷烃选择氨氧化中表现出的不同催化性能,发现了SbRe2O6的特定(100)晶面结构以及NH3与这个晶面相互作用在催化活化烷烃C-H键过程中所起的决定作用,并以此指导开发新型选择氧化催化剂.

关键词：选择氧化低碳烷烃催化剂活性位催化剂构效关系分子水平

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寡聚酰胺PyPyPyβDp与DNA相互作用的荧光动力学

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中国科学（B辑） 2005年第4期35卷 275-279页

作者：张慧娟王津吴义室袁谷艾希成汪力张建平中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100080 北京大学化学与分子工程学院北京100871 中国科学院物理研究所凝聚态物理中心北京100080

通过稳态吸收光谱、荧光光谱和时间分辨荧光光谱对寡聚酰胺分子PyPyPyβDp(简称PPP)的光物理性质进行了详细研究.发现PPP的激发态性质受溶剂环境影响较大,在TKMC缓冲液中,PPP有较弱的荧光,其荧光寿命为16ps;随着溶剂极性逐渐降低,荧光... 详细信息

通过稳态吸收光谱、荧光光谱和时间分辨荧光光谱对寡聚酰胺分子PyPyPyβDp(简称PPP)的光物理性质进行了详细研究.发现PPP的激发态性质受溶剂环境影响较大,在TKMC缓冲液中,PPP有较弱的荧光,其荧光寿命为16ps;随着溶剂极性逐渐降低,荧光光谱蓝移,荧光强度增加,相应荧光寿命增长.通过对PPP与DNA双螺旋分子相互作用的荧光动力学研究表明,PPP与DNA相互作用后,荧光强度增强,荧光寿命从16ps增加到32ps,证实了存在PPP与双螺旋DNA的结合相互作用.

关键词：寡聚酰胺(PPP) 小牛胸腺DNA(ctDNA) 时间分辨荧光光谱识别动力学分子相互作用 DNA双螺旋荧光动力学寡聚酰胺 Dp 光物理性质

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电势控制在DNA定性和定量检测中的应用

电势控制在DNA定性和定量检测中的应用

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第四届全国化学生物学学术会议暨国际化学与生物/医学交叉研讨会

作者：翟林魏芳赵新生北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室化学学院化学生物学系北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室化学学院化学生物学系北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室化学学院化学生物学系

DNA芯片已经得到了广泛的应用。同时,它也存在着一些问题和缺点,比如较低的单点错配分辨率。为了解决以上问题,我们实验室发展了电势扫描和发卡型DNA分子设计技术相结合的方法, 可以有效地解决单点错配分辨的问题。如图1所示,在电势扫... 详细信息

DNA芯片已经得到了广泛的应用。同时,它也存在着一些问题和缺点,比如较低的单点错配分辨率。为了解决以上问题,我们实验室发展了电势扫描和发卡型DNA分子设计技术相结合的方法, 可以有效地解决单点错配分辨的问题。如图1所示,在电势扫描过程中,发卡型探针的扫描曲线具有典

关键词： DNA 定性和定量

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表面DNA杂交的动力学研究

表面DNA杂交的动力学研究

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第四届全国化学生物学学术会议暨国际化学与生物/医学交叉研讨会

作者：陈旭东魏芳赵新生北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室化学学院化学生物学系北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室化学学院化学生物学系北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室化学学院化学生物学

我们实验室发明了利用发卡式探针设计与电场扫描技术进行DNA片断检测的方法,可以有效地进行中间单个碱基错配的分辨。同时也发现了与常规认识不同的DNA在表面进行杂交的动力学和热力学现象。

关键词：共振能量传递染料分子动力学研究 DNA

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基于FRET以及SPHD的蛋白质传感器研究

基于FRET以及SPHD的蛋白质传感器研究

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第四届全国化学生物学学术会议暨国际化学与生物/医学交叉研讨会

作者：郭素廖玮魏芳赵新生北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及化学学院化学生物学系北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及化学学院化学生物学系北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及化学学院化学生物学系北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及化学学院化学生物学系

蛋白质在基底表面的变性问题是制约蛋白质传感器技术发展的重要原因之一。DDI(DNA-Directed Immobilization)方法可以比较显著地改善上述问题,但也存在着由于DNA错配及蛋白质误识别引起的不可忽略的背景信号。我们通过引入FRET(Fluoresc... 详细信息

蛋白质在基底表面的变性问题是制约蛋白质传感器技术发展的重要原因之一。DDI(DNA-Directed Immobilization)方法可以比较显著地改善上述问题,但也存在着由于DNA错配及蛋白质误识别引起的不可忽略的背景信号。我们通过引入FRET(Fluorescence Resonance Energy Transfer),即荧光共振能量传递,以及SPHD(Scanning Potential Hairpin Denaturation)技术,即在电位扫描下检测荧光信号,

关键词：传感器

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FRET和单分子检测研究小热休克蛋白亚单元交换和解离

FRET和单分子检测研究小热休克蛋白亚单元交换和解离

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第九届全国化学动力学会议

作者：关英华曹傲能来鲁华赵新生北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及化学学院化学生物学系北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及化学学院化学生物学系北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及化学学院化学生物学系北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及化学学院化学生物学系

＜正＞小热休克蛋白（Small Heat Shock Protein,sHsp）普遍存在于自然界,具有热保护和分子伴侣的功能。有证据表明蛋白质错误折叠而引发的疾病有些是由小热休克蛋白的突变体造成的。小热休克蛋白sHsp16．5是其中的一种。其晶体结构为... 详细信息

＜正＞小热休克蛋白（Small Heat Shock Protein,sHsp）普遍存在于自然界,具有热保护和分子伴侣的功能。有证据表明蛋白质错误折叠而引发的疾病有些是由小热休克蛋白的突变体造成的。小热休克蛋白sHsp16．5是其中的一种。其晶体结构为由12个二聚体组成的正八面体结构,二聚体内部的结合比二聚体之间要紧密。实验表明高温下小热休克蛋白分子之间有亚单元的交换反应。这与其热保护和分子伴侣的功能机理相关。本文在系综水平和单个分子上对其交换过程进行了研究。

关键词：小热休克蛋白荧光共振能量传递单个分子检测

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N-溴代琥珀酰亚胺修饰菌紫质中色氨酸的光谱学研究

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生物物理学报 2005年第6期21卷 404-408页

作者：王哲琛钟声张建平胡坤生山东大学生命科学学院中国科学院生物物理研究所北京100101 中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100080

采用紫外-可见吸收光谱和荧光光谱方法研究了菌紫质(Bacteriorhodopsin,bR)中的8个色氨酸(Tryptophan,Trp)残基在被N-溴代琥珀酰亚胺(N-bromosuccinimide,NBS)修饰过程中的残基数目及对应的光谱变化。研究结果显示:随着NBS/bR摩尔比例... 详细信息

采用紫外-可见吸收光谱和荧光光谱方法研究了菌紫质(Bacteriorhodopsin,bR)中的8个色氨酸(Tryptophan,Trp)残基在被N-溴代琥珀酰亚胺(N-bromosuccinimide,NBS)修饰过程中的残基数目及对应的光谱变化。研究结果显示:随着NBS/bR摩尔比例增加逐渐被修饰的Trp残基有4个左右,如果NBS过量,则Trp残基的修饰个数最终可达6～7个;伴随化学修饰出现Trp残基特征荧光峰值下降及峰位蓝移。研究结果揭示了bR中Trp残基可能的三种结构分布,对于进一步弄清bR中Trp-视黄醛(Retinal)偶联能量传递、单独Trp残基的荧光寿命和Trp残基在膜蛋白结构和功能中的作用具有积极而重要的意义。

关键词：菌紫质(bR) Trp残基 N-溴代琥珀酰亚胺(NBS) 紫外-可见吸收荧光

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