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Theoretical Studies on the Mechanism of the Proton-transfer-coupled Electron Transfer Reactions Between Menaquinone Q_A and Ubiquinone Q_B in the Bacterial Photosynthetic Reaction Center of Rhodopseudomona viridis

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Acta Botanica Sinica 2002年第12期44卷 1409-1417页

作者：马淑华徐红张汝波屈正旺张兴康张启元中国科学院化学研究所分子科学中心分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100080

The mechanism of the proton_transfer_coupled electron transfer (PT_ET) reactions between the menaquinone Q A (MQ 1) and ubiquinone Q B (UQ 1) in the bacterial photosynthetic reaction center of Rhodopseudomona viridis was studied by using the B3LYP/6_31G(d) method. The changes of standard Gibbs free energy ΔG 0 of all possible reactions followed the ET reaction (1) were calculated. The results indicated that: (1) according to the ΔG 0 values of corresponding reactions, UQ 1 could not accept two electrons from MQ - 1 continually without the coupled proton transfer reactions. Because of ΔG 0 2b 0, ΔG 0 3b 0 and ΔG 0 4b 0, the corresponding PT_ET reactions could take place along with reactions (2b), (3b) and (4b) sequentially; (2) on the gaseous condition, the first and second transferred protons (H +(1) and H +(2)) from the surrounding amino acid residues or water molecules will combine with the oxygen No.7 and oxygen No.8 of UQ 1, respectively. On the condition of protein surroundings (by SCRF model, ε =4.0), the results are converse but the energy difference between the combination of H +(1) and H +(2) with UQ - 1 is quite small. The difference of ΔG 0 values between the corresponding reactions in gaseous surroundings and the SCRF model is not significant; (3) the PT_ET reactions between MQ 1 - and UQ 1 - should be as follows: MQ 1 -+UQ 1→MQ 1+UQ 1 - (1) UQ 1 - ( O (7) )+H +( HisL 190)→UQ 1H(2b) ( Gas ) or UQ 1 - ( O (8) )+H +(H 2O)→UQ 1H (2b') ( SCRF ) or UQ 1 - ( O (8) )+H + ( ArgL 217)→UQ 1H(2b') ( SCRF ) MQ 1 -+UQ 1H→MQ 1+UQ 1H - (3b) ( Gas ) MQ 1 -+UQ 1H→MQ 1+UQ 1H -(3b') ( SCR F) UQ 1H -+H +(H 2O)→UQ 1H 2(4b) ( Gas ) or UQ 1H -+H + ( ArgL 217)→UQ 1H 2 (4b) ( Gas ) or UQ 1H -+H + ( HisL 190)→UQ 1H 2 (4b') ( SCRF )

关键词： Rhodopseudomena viridis electron transfer proton transfer Q A and Q B DFT

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分化诱导剂PMDH的合成及晶体结构

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物理化学学报 2002年第6期18卷 545-549页

作者：宋相志刘广章士伟北京大学物理化学研究所分子动态与稳态国家重点实验室北京100871

合成了分化诱导剂1,5-二[3,3’-（5,5-二甲基乙内酰脲）]戊烷（PMDH）,对合成方法和路线进行了优化,并通过元素分析。质谱、核磁和红外进行了表征.利用单晶X时线衍射仪测定了化合物的晶体结构,晶体属于三斜晶系,空间群为P1,晶体学参数为... 详细信息

合成了分化诱导剂1,5-二[3,3’-（5,5-二甲基乙内酰脲）]戊烷（PMDH）,对合成方法和路线进行了优化,并通过元素分析。质谱、核磁和红外进行了表征.利用单晶X时线衍射仪测定了化合物的晶体结构,晶体属于三斜晶系,空间群为P1,晶体学参数为:α=0.874（4）nm,b=1.1146（2）nm,c=1.720（3）nm,α=87.20（3）°,β=89.77（3）°,γ=85.12（3）°,V=1.6686（6）nm,Z=4.最终偏离因子R1=0.0651.分子中的碳链连接两个乙内酰脲五元环,五元环与和它相连的两个碳基氧原子呈平面结构,分子间存在较强的氢键.

关键词：合成六亚甲基二乙酰胺 1,5-二[3,3'-(5,5-二甲基乙内酰脲)]戊烷 PMDH 抗癌活性分化诱导剂晶体结构抗癌机理

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新型含磷酰基的脂溶性自由基捕捉剂的合成及其ESR研究

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高等学校化学学报 2002年第2期23卷 333-335页

作者：徐英凯陈中伟孙健刘科陈巍施伟王红梅张兴康刘扬中国科学院化学研究所分子科学研究中心分子动态和稳态结构国家重点实验室北京100080

Synthesis of a novel α phosphorus containing spin trap, DEPPEPO[5 (diethoxyphosphoryl) 5 phenylethyl 1 pyrroline] N oxide and evaluation of its ability to spin trap the hydroxyl and the superoxide anion radicals were described in the present article. The ability for trapping an active superoxide anion radicals generated in the HX/XO system and the stability of their spin adduct of DEPPEPO were analyzed. In addition, the effects of 5 phenylethyl and 5 phenyl substituted analogues of DMPO on the stereochemistry of the corresponding spin adducts were systematically illustrated.

关键词：自旋捕捉电子自旋共振超氧阴离子自由基脂溶性自由基捕捉剂检测 5-(二乙氧磷酰基)-5-苯乙基-1-吡咯啉N-氧化物

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单个蓝藻细胞的光谱

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物理化学学报 2002年第8期18卷 673-675页

作者：应丽贞黄旭黄波赵进东赵新生北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室北京大学生命科学学院北京100871

利用共焦显微和光栅光谱技术,得到了蓝藻AnabaenastrainPCC7120完整藻丝体中的单细胞吸收和荧光发射光谱.发现了前人未观察到的不同异形胞之间有显著光谱差异的现象,该现象可能与异形胞不同发育阶段的藻胆体和光系统的演化相关联.

关键词：蓝藻单个细胞异形胞共焦显微术吸收光谱荧光发射光谱光栅光谱发育

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Ar_2H^+分子振动光谱的理论计算

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Chinese Journal of Chemical Physics 2002年第3期15卷 188-192页

作者：李巍屈军艳赵新生北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及物理化学研究所北京100871

基于近期由本组提供的Ar2 H+ 分子的基态势能面 ,应用含时波包演化方法 ,计算了总角动量J =0时的振动光谱 ,并对其中的一些谱峰进行了指认 .与现有的abinitio结果进行比较 ,这个新势能面包含了关于Ar2 H+

关键词： Ar2H^+ 分子振动光谱理论计算光谱指认含时波包演化动力学质子溶剂化分子簇势能面

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离子注入GaN的拉曼散射研究

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物理学报 2002年第3期51卷 629-634页

作者：张纪才戴伦秦国刚应丽贞赵新生山东曲阜师范大学物理系北京大学人工微结构与介观物理国家重点实验室北京大学物理学院北京100871 北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室

研究了离子注入前后GaN的拉曼散射光谱 ,特别是其中几个在各种离子注入后都存在的拉曼散射峰 ,如 2 98,36 2和 6 6 1cm- 1 峰的性质 ,峰值强度随注入元素原子量、注入剂量和退火温度的变化关系 .上述三个拉曼散射峰的强度都随注入元素... 详细信息

研究了离子注入前后GaN的拉曼散射光谱 ,特别是其中几个在各种离子注入后都存在的拉曼散射峰 ,如 2 98,36 2和 6 6 1cm- 1 峰的性质 ,峰值强度随注入元素原子量、注入剂量和退火温度的变化关系 .上述三个拉曼散射峰的强度都随注入元素原子量的增加而降低 .当注入剂量增大时 ,36 2和 6 6 1cm- 1 峰值强度减少 ,而 2 98cm- 1 峰值强度却增大 .随退火温度的升高 ,这三个拉曼散射峰的强度先增加后降低 .对所观察到的实验现象和这三个峰的起源进行了分析和讨论 .

关键词：离子注入 GaN 拉曼散射局域振动氮化镓

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卟啉双荧光行为的初步研究

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中国科学（B辑） 2002年第4期32卷 316-322页

作者：冯娟艾希成张建平张兴康徐广智向俊锋中国科学院化学研究所分子科学中心分子动态和稳态结构国家重点实验室北京100080 中国科学院理化技术研究所北京100101

采用基态吸收光谱及荧光光谱研究了5,10,15,20-四对溴苯基锌卟啉（ZnTPPBr）的双荧光行为,并分别通过它与C_(60)及二茂铁（Fc）的双分子荧光猝灭反应,发现S2态荧光猝灭行为可部分转移并保留在S1态中,从而影响S1态的荧光猝灭规律.这个结... 详细信息

采用基态吸收光谱及荧光光谱研究了5,10,15,20-四对溴苯基锌卟啉（ZnTPPBr）的双荧光行为,并分别通过它与C_(60)及二茂铁（Fc）的双分子荧光猝灭反应,发现S2态荧光猝灭行为可部分转移并保留在S1态中,从而影响S1态的荧光猝灭规律.这个结果与化学诱导动态电子极化（CIDEP）中前体所产生的自由基对或三重态的自旋极化会转移并保留在产物中的现象类似,并为研究寿命短,荧光量子产率低的高级激发态提供了一种新的思路.

关键词：双荧光行为双分子荧光猝灭自旋极化 CIDEP 吸收光谱荧光光谱 5,10,15,20-四对溴苯基锌卟啉碳60 二茂铁

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新型含哒嗪酮基双酰肼类化合物的3D-QSAR研究

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物理化学学报 2002年第6期18卷 513-516页

作者：邹霞娟来鲁华金桂玉黄桂琴北京大学化学学院物理化学研究所分子动态与稳定结构国家重点实验室北京100871 南开大学化学院元素有机化学研究所元素有机化学国家重点实验室天津300071

用比较分子场分析方法对1-芳基-1,4-二氢-3-酰肼羰基-6-甲基-4-哒嗪酮类化合物进行了三维定量构效关系研究,发现影响其促进黄瓜子叶生根活性的主要为立体能.立体能与静电能之比为0.733:0.267.所得到的模型交叉验证值rcv2=0.643,相关系数... 详细信息

用比较分子场分析方法对1-芳基-1,4-二氢-3-酰肼羰基-6-甲基-4-哒嗪酮类化合物进行了三维定量构效关系研究,发现影响其促进黄瓜子叶生根活性的主要为立体能.立体能与静电能之比为0.733:0.267.所得到的模型交叉验证值rcv2=0.643,相关系数r2=0.977,F=102.622,s=0.041,表明模型具有较好的预测能力.研究结果对3-酰肼羰基-4-哒嗪酮类化合物的改性或新类似物的合成具有指导意义.

关键词：哒嗪酮基双酰肼类化合物 3-酰肼羰基-4-哒嗪酮黄瓜子叶生根活性三维定量构效关系 3D-QSAR 比较分子力场农药

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溶剂对菁染料激发态异构化无势垒反应的影响

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科学通报 2002年第18期47卷 1390-1394页

作者：冯娟张慧娟艾希成徐四川孙照勇张建平张兴康徐广智向俊锋阎文鹏中国科学院化学研究所分子科学中心分子动态和稳态结构国家重点实验室北京100080 中国科学院理化技术研究所北京100101

采用基态吸收光谱、荧光光谱、皮秒时间分辨荧光光谱和飞秒瞬态吸收光谱,研究了溶剂的空间位阻及多羟基官能团对3,3’-二（3-磺丙基）噻菁三乙胺盐激发态异构化无势垒反应的影响.结果表明:与长链单羟基醇类溶剂不同,由于受溶剂立体阻碍... 详细信息

采用基态吸收光谱、荧光光谱、皮秒时间分辨荧光光谱和飞秒瞬态吸收光谱,研究了溶剂的空间位阻及多羟基官能团对3,3’-二（3-磺丙基）噻菁三乙胺盐激发态异构化无势垒反应的影响.结果表明:与长链单羟基醇类溶剂不同,由于受溶剂立体阻碍或所含羟基数目的影响,基态漂白信号具有不同的“短时间”行为.另外,荧光寿命与溶剂黏度并不呈现通常的线性关系;但在同一种溶剂中荧光寿命仍具有波长相关性,即随着检测波长向长波方向移动,瞬态组分寿命增长.以上结果与飞秒荧光上转换技术测定的结果一致,进一步证明了染料激发态的异构化是一个无势垒过程.

关键词：菁染料激发态异构化无势垒反应光异构化反应空间位移多羟基官能团荧光寿命

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1,8-二羟基-3-甲基-苯并[d,e]蒽酮的2DNMR研究

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波谱学杂志 2002年第3期19卷 253-257页

作者：王红梅陈巍徐英凯王鹏施伟温美娟刘扬中国科学院化学研究所分子动态与稳态国家重点实验室北京科学技术大学化学系北京100083 北京科学技术大学化学系

从中药芦荟 (Aloevera)中分离得到一个蒽酮类新化合物 .通过UV、IR、HREI MS、1 HNMR和 1 3CNMR及 2DNMR(1 H 1 HCOSY、HMBC、HMQC和J resolved)方法 ,鉴定其结构为 :1 ,8 二羟基 3 甲基苯并 [d,e]蒽酮 .文章的侧重点在于讨论该化合物... 详细信息

从中药芦荟 (Aloevera)中分离得到一个蒽酮类新化合物 .通过UV、IR、HREI MS、1 HNMR和 1 3CNMR及 2DNMR(1 H 1 HCOSY、HMBC、HMQC和J resolved)方法 ,鉴定其结构为 :1 ,8 二羟基 3 甲基苯并 [d,e]蒽酮 .文章的侧重点在于讨论该化合物的1 H和1

关键词： 1,8-二羟基-3-甲基-苯并[d,e]蒽酮芦荟 2DNMR 归属中药分离核磁共振分析

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