检索结果-内蒙古大学图书馆

Ar_2H^+分子振动光谱的理论计算

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Chinese Journal of Chemical Physics 2002年第3期15卷 188-192页

作者：李巍屈军艳赵新生北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及物理化学研究所北京100871

基于近期由本组提供的Ar2 H+ 分子的基态势能面 ,应用含时波包演化方法 ,计算了总角动量J =0时的振动光谱 ,并对其中的一些谱峰进行了指认 .与现有的abinitio结果进行比较 ,这个新势能面包含了关于Ar2 H+

关键词： Ar2H^+ 分子振动光谱理论计算光谱指认含时波包演化动力学质子溶剂化分子簇势能面

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靛红类双功能抑制剂:调控SARS-3CL蛋白酶聚集状态与活性(英文)

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物理化学学报 2012年第10期28卷 2418-2422页

作者：周璐金凤刘莹尚尔昌魏平李春梅来鲁华北京大学化学与分子工程学院物理化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京分子科学国家实验室北京100871 复旦大学药学院上海201203 北京大学定量生物学中心北京100871

1-(2-萘甲基)靛红-5-甲酰胺类化合物通过与底物口袋结合来抑制SARS-3CL蛋白酶的活性,而SARS-3CL蛋白酶自身的N端8肽是作用于蛋白二聚界面的抑制剂.本文设计同时占据SARS-3CL蛋白酶底物口袋和二聚界面的双功能抑制剂,通过固相多肽合成方... 详细信息

1-(2-萘甲基)靛红-5-甲酰胺类化合物通过与底物口袋结合来抑制SARS-3CL蛋白酶的活性,而SARS-3CL蛋白酶自身的N端8肽是作用于蛋白二聚界面的抑制剂.本文设计同时占据SARS-3CL蛋白酶底物口袋和二聚界面的双功能抑制剂,通过固相多肽合成方法制备由1-(2-萘甲基)靛红-5-甲酸和N端8肽组成的化合物,得到不同长度连接链的6个目标产物.用显色底物方法测定化合物对SARS-3CL蛋白酶的抑制活性,其中化合物3的活性最高,IC50值(半抑制率)为3.8μmol·L-1,连接偶数甘氨酸的活性明显要好于连接奇数甘氨酸的化合物.用超速离心沉降速率方法研究了化合物3对SARS-3CL蛋白酶聚集状态与活性的调控作用,其同时具有诱导与抑制二聚的双重能力,综合调控结果是抑制SARS-3CL蛋白酶的二聚.这项研究给应用合成的化合物研究酶活性调节机制提供了一个示例.

关键词：靛红类衍生物调控 SARS-3CL蛋白酶二聚双功能抑制剂

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基于三维石墨烯衬底的纳米片状水合氧化钌:电化学沉积制备以及柔性超级电容器储能应用（英文）

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无机材料学报 2019年第4期34卷 455-462页

作者：王远林杰常郑林天全钱猛黄富强中国科学院上海硅酸盐研究所高性能陶瓷和超微结构国家重点实验室上海200050 中国科学院大学北京100049 北京大学化学与分子工程学院北京分子科学国家实验室稀土材料化学及应用国家重点实验室北京100871

可穿戴设备的快速发展刺激了对柔性高面容量储能设备的迫切需求。本工作采用一种简单的无粘结剂阴极电沉积方法将纳米片状RuO_x·nH_2O沉积固定在三维石墨烯骨架上,以提高RuO_x·nH_2O的利用效率,实现了更优良的电极导电性,并... 详细信息

可穿戴设备的快速发展刺激了对柔性高面容量储能设备的迫切需求。本工作采用一种简单的无粘结剂阴极电沉积方法将纳米片状RuO_x·nH_2O沉积固定在三维石墨烯骨架上,以提高RuO_x·nH_2O的利用效率,实现了更优良的电极导电性,并缩短了质子和电子的扩散传输路径。在2 m V?s-1时,它的面容量高达3.78 F?cm^(-2),主要归因于材料的纳米层状结构有利于电解质进入活性物质RuO_x·nH_2O的内部。另外,以这种电极材料制备得到的全固态柔性超级电容器,在10mA?cm^(-2)的电流密度下,能量密度达到0.1m Wh?cm^(-2),功率密度达到2.4mW?cm^(-2),超过大部分文献报道。

关键词：纳米片状RuOx·nH2O 电化学沉积超级电容器

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菌紫质中视黄醛超快异构化反应的动态光谱分析

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高等学校化学学报 2008年第1期29卷 140-143页

作者：吴义室钟声艾希成胡坤生张建平中国科学院化学研究所北京分子科学国家实验室分子动态与稳态结构化学国家重点实验室北京100080 中国人民大学理学院化学系北京100872 中国科学院生物物理研究所北京100101

利用飞秒时间分辨吸收光谱方法研究了菌紫质(BR)光循环中视黄醛超快异构化反应过程.发展了结合全局拟合的奇异值分解(SVD)分析方法,建立了超快异构化反应动力学模型,解析了几个重要的中间态I460,J625和K590的物种相关差异光谱(SADS)和... 详细信息

利用飞秒时间分辨吸收光谱方法研究了菌紫质(BR)光循环中视黄醛超快异构化反应过程.发展了结合全局拟合的奇异值分解(SVD)分析方法,建立了超快异构化反应动力学模型,解析了几个重要的中间态I460,J625和K590的物种相关差异光谱(SADS)和布居动力学,确定了光致异构化反应过程.同时明确了700nm附近存在的受激荧光来自于弗兰克-康登跃迁态(H中间态)的贡献,其衰减寿命为0.04ps.这些结果对深入认识H态在超快异构化反应过程中的作用具有参考价值.

关键词：菌紫质超快异构化奇异值分解受激发射

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HL-LH2中色素分子间的单重激发态能量传递

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高等学校化学学报 2008年第1期29卷 149-153页

作者：赵晓辉梁俊马菲苏文杰王鹏付立民艾希成张建平中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京分子科学国家实验室北京100080 中国人民大学理学院化学系北京100872 河北大学物理科学与技术学院保定071002

采用飞秒时间分辨吸收光谱手段观测了在500和800nm激发下高光培养的紫色光合细菌Rhodopseu—domonas（Rps）．palustris外周捕光天线LH2（HL—LH2）中不同共轭链长类胡萝卜素（Carotenoid，简称Car）和细菌叶绿素α（Bacteriachlorophy... 详细信息

采用飞秒时间分辨吸收光谱手段观测了在500和800nm激发下高光培养的紫色光合细菌Rhodopseu—domonas（Rps）．palustris外周捕光天线LH2（HL—LH2）中不同共轭链长类胡萝卜素（Carotenoid，简称Car）和细菌叶绿素α（Bacteriachlorophyll α，简称BChl α）的特征吸收光谱，光谱动力学分析结果表明，HL—LH2中不同Car分子间可能存在复杂的单重激发态能量平衡过程，Car分子同时向BChl α分子发生多途径的单重激发态能量传递，B800主要接受来自Car的S2和S1态能量；B850则主要接受来自长共轭链Car（共轭双键数目n=13）的S1态和B800的激发态能量，整个能量传递过程在3～5ps内完成．

关键词：外周捕光天线细菌叶绿素类胡萝卜素激发态能量传递时间分辨光谱

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基于药效团模型的DHODH抑制剂构效关系研究

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高等学校化学学报 2010年第5期31卷 938-946页

作者：鲍红娟唐亚林徐筱杰向俊锋郑智慧路新华中国科学院化学研究所分子动态与稳态国家重点实验室北京分子科学国家重点实验室北京100190 北京大学化学与分子工程学院北京100871 华北制药集团新药研究开发有限责任公司石家庄050015

利用药效团模型研究二氢乳清酸脱氢酶（Dihydroorotate dehydrogenase,DHODH）抑制剂的构效关系,为DHODH抑制剂的虚拟筛选提供新的方法.以31个具有DHODH抑制活性的化合物为训练集化合物,半数抑制浓度（IC50）范围为7~63000 nmol/L,利用C... 详细信息

利用药效团模型研究二氢乳清酸脱氢酶（Dihydroorotate dehydrogenase,DHODH）抑制剂的构效关系,为DHODH抑制剂的虚拟筛选提供新的方法.以31个具有DHODH抑制活性的化合物为训练集化合物,半数抑制浓度（IC50）范围为7~63000 nmol/L,利用Catalyst/HypoGen算法构建DHODH抑制剂药效团模型,通过对训练集化合物多个构象进行叠合,提取药效团特征及三维空间限制构建药效团模型.利用基于CatScramble的交叉验证方法及评价模型对已知活性化合物的活性预测能力,确定较优药效团模型.模型包含1个氢键受体、3个疏水中心,表征了受体配体相互作用时可能发生的氢键相互作用、疏水相互作用和π-π相互作用,4个药效特征在三维空间的排列概括了DHODH抑制剂产生活性的结构特点.所得较优模型对训练集化合物及测试集化合物的计算活性值与实验活性值的相关系数分别为0.8405和0.8788.利用药效团模型对来源于微生物的系列化合物进行虚拟筛选,筛选出59个预测活性较好的化合物,可作为进一步药物研发的候选化合物.

关键词： DHODH抑制剂构效关系药效团模型虚拟筛选

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泉生热袍菌结构基因组的选靶研究

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物理化学学报 2005年第5期21卷 499-503页

作者：裴剑锋来鲁华北京大学化学与分子工程学院分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100871 北京大学理论生物学中心北京100871

对泉生热袍菌进行了结构基因组的选靶研究,从泉生热袍菌的蛋白组中挑选了20个蛋白质作为第一批进行结构测定的目标,以发现新的蛋白质折叠模式.选靶研究主要使用了BLAST搜索,PSI-BLAST搜索和ProtoNet数据库搜索等方法.另外,还用PredictPr... 详细信息

对泉生热袍菌进行了结构基因组的选靶研究,从泉生热袍菌的蛋白组中挑选了20个蛋白质作为第一批进行结构测定的目标,以发现新的蛋白质折叠模式.选靶研究主要使用了BLAST搜索,PSI-BLAST搜索和ProtoNet数据库搜索等方法.另外,还用PredictProtein程序对选中的蛋白质进行了二级结构和外形预测.选中的20个蛋白质中有8个被克隆、表达和纯化,其中2个得到了单晶并收集了X衍射数据.实验结果和最近一些文献报道的结果表明,挑选的一些蛋白质具有新的折叠模式,表明了这种选靶策略的有效性.

关键词：泉生热袍菌结构基因组选靶蛋白质结构 BLAST PSI-BLAST ProtoNet

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钒氧阴离子团簇与小分子碳氢化合物反应的实验和理论研究(英文)

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物理化学学报 2010年第7期26卷 1761-1767页

作者：马嘉璧吴晓楠赵艳霞何圣贵丁迅雷中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室中国科学院研究生院

为了在分子层次上揭示相关催化反应的机理,人们对过渡金属氧化物团簇与碳氢化合物分子反应进行了大量研究.相比于过渡金属氧化物团簇阳离子,阴离子对一些碳氢化合物的活性弱得多,因此研究还很少.在本工作中,我们通过激光溅射产生钒氧团... 详细信息

为了在分子层次上揭示相关催化反应的机理,人们对过渡金属氧化物团簇与碳氢化合物分子反应进行了大量研究.相比于过渡金属氧化物团簇阳离子,阴离子对一些碳氢化合物的活性弱得多,因此研究还很少.在本工作中,我们通过激光溅射产生钒氧团簇阴离子VxOy-,产生的团簇在接近热碰撞条件下与烷烃(C2H6和C4H10)以及烯烃(C2H4和C3H6)在一个快速流动反应管中进行反应,飞行时间质谱用来检测反应前后的团簇分布.在VxOy-与烷烃的反应中,生成了产物V2O6H-和V4O11H-;在与烯烃的反应中,产生了相应的吸附产物V4O11X-(X=C2H4或C3H6).密度泛函理论计算表明:V2O6-和V4O1-1可以活化烷烃(C2H6和C4H10)的C-H键,也可以与烯烃(C2H4和C3H6)发生3+2环化加成反应形成一个五元环结构(-V-O-C-C-O-),C-H键活化与环加成反应都需经历可以克服的反应能垒.理论计算与实验观测结果相符合.V2O6-和V4O1-1团簇都具有氧原子自由基(O·或O-)的成键特征,活性O-物种也经常出现在钒氧催化剂表面,因而本研究在分子水平上,揭示了表面活性氧物种与碳氢化合物反应的机理.

关键词：密度泛函理论钒氧团簇飞行时间质谱 C—H键活化多相催化

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蛋白质相互作用预测、设计与调控

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物理化学学报 2012年第10期28卷 2363-2380页

作者：张长胜来鲁华北京大学化学与分子工程学院物理化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京分子科学国家实验室北京100871 北京大学定量生物学中心北京100871 北京大学-清华大学生命科学联合中心北京100871

蛋白质相互作用是生命活动在分子水平上的基本事件.蛋白质相互作用的三维图像可以给出关键生命活动过程的分子细节.了解蛋白质相互作用的原理有助于揭示生命活动的机制,并在此基础上开展有重要价值的蛋白质设计.本文对于蛋白质相互作用... 详细信息

蛋白质相互作用是生命活动在分子水平上的基本事件.蛋白质相互作用的三维图像可以给出关键生命活动过程的分子细节.了解蛋白质相互作用的原理有助于揭示生命活动的机制,并在此基础上开展有重要价值的蛋白质设计.本文对于蛋白质相互作用预测、设计和调控研究的近期进展进行了总结归纳,介绍了作者实验室在相关领域的研究进展,并对今后的研究方向进行了展望.主要包括:(1)蛋白质相互作用网络、蛋白质相互作用机制和蛋白质复合物结构计算分析;(2)基于序列、结合位点以及复合物结构的蛋白质相互作用预测;(3)蛋白质相互作用设计方法;(4)利用化学分子调控蛋白质相互作用的方法;(5)针对蛋白质相互作用的蛋白质药物设计方法.

关键词：蛋白质相互作用相互作用预测蛋白质-蛋白质对接蛋白质相互作用设计蛋白质药物药物设计

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气体放电法氧化高浓度亚硫酸盐

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物理化学学报 2004年第6期20卷 656-658页

作者：任家荣刘霁欣李瑞年尉继英赵璧英谢有畅北京大学化学与分子工程学院分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100871 北京理工大学应用物理系北京100081

使用气体放电等离子体对较高浓度的亚硫酸钠进行氧化,在不同电压和频率条件下进行了实验,发现在很低的功耗下,取得了很好的氧化效果.使用交直流叠加电源,亚硫酸钠的转化率随着交流电压的升高而升高.在一定的频率范围内,改变频率对亚硫... 详细信息

使用气体放电等离子体对较高浓度的亚硫酸钠进行氧化,在不同电压和频率条件下进行了实验,发现在很低的功耗下,取得了很好的氧化效果.使用交直流叠加电源,亚硫酸钠的转化率随着交流电压的升高而升高.在一定的频率范围内,改变频率对亚硫酸钠的转化率影响不大.

关键词：亚硫酸盐气体放电氧化交直流叠加电源非热等离子体

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