检索结果-内蒙古大学图书馆

中国卫生统计 2024年第4期41卷 501-506页

作者：王文杰李康谢宏宇哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081 浙江大学医学院附属妇产科医院临床研究中心

目的提出深度堆叠降噪自编码嵌套聚类(stacked denoising auto encoder embedded cluster, SDAEC)算法并用于单细胞mRNA测序(single cell mRNA sequence, scRNA-seq)数据的批次效应移除,对其移除批次效应性能进行评估。方法基于单细... 详细信息

目的提出深度堆叠降噪自编码嵌套聚类(stacked denoising auto encoder embedded cluster, SDAEC)算法并用于单细胞mRNA测序(single cell mRNA sequence, scRNA-seq)数据的批次效应移除,对其移除批次效应性能进行评估。方法基于单细胞数据具有高维度、高稀疏性及高度非线性误差特点,通过将单细胞Louvain聚类算法嵌入堆叠降噪自动编码器(stacked denoising auto encoder, SDAE)算法中,形成SDAEC算法,用于单细胞测序数据的批次效应移除。结合实际卵巢癌组织scRNA-seq数据,利用分布邻域嵌入(t-distributed stochastic neighbor embedding, tSNE)、 k最近邻批次效应检测(k-nearest-neighbor batch-effect test, kBET)、调整兰德系数(adjusted rand index, ARI)、标准化互信息(normalized mutual information, NMI)、平均轮廓宽度(average silhouette width, ASW)评价其移除批次效应性能。结果利用SDAEC方法对scRNA-seq数据批次效应移除性能高于Combat、相互最近邻(mutual nearest neighbors, MNN)、分布匹配残差网络(maximum mean discrepancy distribution-matching residual networks, MMD-ResNet)和基于零膨胀负二项的方差提取法(zero-inflated negative binomial-based wanted variation extraction, ZINB-WaVE)。结论 SDAEC算法能够移除scRNA-seq数据的批次效应,提高scRNA-seq数据下游分析的有效性,具有实际应用价值。

关键词：深度堆叠降噪自编码嵌套聚类单细胞测序批次效应卵巢癌

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多状态Markov模型在阿尔茨海默病自然史中的应用

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中国卫生统计 2024年第2期41卷 227-230,234页

作者：秦瑶韩红娟刘龙陈杜荣王浩基崔靖白文琳余红梅山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 030001 山西医科大学基础医学院数学教研室山西医科大学公共卫生学院儿少卫生学教研室重大疾病风险评估山西省重点实验室

目的将多状态Markov模型应用于阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)自然史研究,为慢性病自然史研究提供方法学借鉴。方法基于美国公共数据库ADNI,构建正常认知(normal cognition,NC)-轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)... 详细信息

目的将多状态Markov模型应用于阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)自然史研究,为慢性病自然史研究提供方法学借鉴。方法基于美国公共数据库ADNI,构建正常认知(normal cognition,NC)-轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)-AD多状态Markov模型,估计不同状态间的转移强度、转移概率、影响因素和各状态的逗留时间,绘制生存曲线,并进行模型拟合优度评价。结果性别、年龄、FAQ、MMSE、CDRSB、ADAS13、TMT-B-Time是AD自然史中重要的影响因素;NC与MCI状态的平均逗留时间分别为7.502年,11.621年。多状态Markov模型拟合结果较好。结论多状态Markov模型在AD等多状态慢性病转归研究中具有很好的应用价值。

关键词：多状态Markov模型阿尔茨海默病慢性病自然史

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多元纵向测量的潜在过程模型在轻度认知障碍逆转研究中的应用

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中国卫生统计 2024年第1期41卷 64-67,71页

作者：秦瑶韩红娟刘龙陈杜荣马艺菲崔靖白文琳张荣余红梅山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 030001 山西医科大学基础医学院数学教研室山西医科大学公共卫生学院儿少卫生学教研室重大疾病风险评估山西省重点实验室

目的将多元纵向测量的潜在过程模型应用于轻度认知障碍向认知正常逆转的研究,为慢性病纵向研究提供方法学借鉴。方法基于多个纵向认知标记物共同代表同一个潜在认知过程的假设,构建多元纵向测量的潜在过程模型,捕捉潜在认知过程随时... 详细信息

目的将多元纵向测量的潜在过程模型应用于轻度认知障碍向认知正常逆转的研究,为慢性病纵向研究提供方法学借鉴。方法基于多个纵向认知标记物共同代表同一个潜在认知过程的假设,构建多元纵向测量的潜在过程模型,捕捉潜在认知过程随时间的变化轨迹,量化不同纵向认知标记物解释潜在认知过程的贡献,讨论不同认知标记物用以衡量认知功能的敏感性,及其协变量效应。参数估计采用极大似然法,采用残差分析和不同纵向认知标记物解释潜在认知过程所占百分比进行拟合优度评价。结果性别(P=0.004),受教育年限(P=0.002),随访时间(P<0.001)和随访时间的二次方(P<0.001)与潜在认知过程显著相关。性别(P=0.048)与受教育年限(P=0.013)的不同纵向认知标记物之间有统计学差异。残差分析和潜在过程解释纵向测量变异的比例说明模型拟合良好。结论多元纵向数据潜在过程模型在痴呆等慢性病研究中具有很好的应用价值。

关键词：潜在过程纵向数据轻度认知障碍逆转

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多种倾向评分方法的SAS软件实现与比较

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中国卫生统计 2022年第3期39卷 465-469,473页

作者：张洪璐于泽洋宋德胜黄慧杰李长平天津医科大学流行病与卫生统计学教研室 300070

倾向评分(propensity score, PS)由Rosenbaum和Rubin于1983年提出,是一种对观察性研究、非随机化干预性研究或随机化失败的研究中混杂因素进行校正的方法,广泛应用于经济学、医学等领域。本文主要介绍三种倾向评分分析方法的SAS 9.4软... 详细信息

倾向评分(propensity score, PS)由Rosenbaum和Rubin于1983年提出,是一种对观察性研究、非随机化干预性研究或随机化失败的研究中混杂因素进行校正的方法,广泛应用于经济学、医学等领域。本文主要介绍三种倾向评分分析方法的SAS 9.4软件实现,分别是倾向评分匹配、分层和加权,这三种方法可有效均衡混杂因素的组间分布差异,从而减少混杂偏倚,获得干预效应的有效估计。

关键词：混杂因素观察性研究倾向评分 SAS软件干预性研究随机化三种方法

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基于分组的轨迹模型及其SAS实现

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中国卫生统计 2024年第3期41卷 462-467页

作者：宋福曼王思婷乔亲群刘媛媛陈佳庚马骏天津医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室、天津市环境营养与人群健康重点实验室 300070

目的对基于分组的轨迹模型(group-based trajectory modeling,GBTM)的基本原理、适用性及SAS软件程序进行介绍。方法使用SAS软件中的PROC TRAJ过程步,构建不同数据类型的GBTM模型。结果选取多项前瞻性数据,根据数据类型构建了CNORM、ZI... 详细信息

目的对基于分组的轨迹模型(group-based trajectory modeling,GBTM)的基本原理、适用性及SAS软件程序进行介绍。方法使用SAS软件中的PROC TRAJ过程步,构建不同数据类型的GBTM模型。结果选取多项前瞻性数据,根据数据类型构建了CNORM、ZIP等单轨迹及双轨迹模型,在此基础上将协变量纳入模型,观察影响发展轨迹的因素。结论GBTM为解决纵向数据复杂性和结果可解释性之间的平衡问题提供了有价值的工具,同时SAS软件可以很好地实现轨迹模型的构建,并为模型的不断拓展提供了较为方便的实现形式。

关键词：基于分组的轨迹模型轨迹分析纵向数据

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基于潜变量混合增长模型的中国中老年抑郁症状发展轨迹与痴呆症关系研究

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现代预防医学 2023年第7期50卷 1171-1175页

作者：熊屹立刘声悦杨金燕葛晓燕锦州医科大学口腔医学院西南医科大学口腔医学院锦州医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室

目的探讨中国中老年抑郁症状发展变化趋势的异质性，揭示不同抑郁组别变化轨迹，以及其与痴呆症状之间的关系，以期为医护人员在临床前期为抑郁症状人群实施干预措施提供科学建议。方法数据来源于中国健康与养老追踪调查（CHARLS）项... 详细信息

目的探讨中国中老年抑郁症状发展变化趋势的异质性，揭示不同抑郁组别变化轨迹，以及其与痴呆症状之间的关系，以期为医护人员在临床前期为抑郁症状人群实施干预措施提供科学建议。方法数据来源于中国健康与养老追踪调查（CHARLS）项目，采用潜变量混合增长模型构建抑郁评分模型，对不同抑郁组别变化轨迹进行分类，采用Cox比例风险模型探究不同抑郁组别变化轨迹与痴呆症状之间的关系。结果研究纳入受试者1 996例，其抑郁症状呈现出三种不同的轨迹变化，分别定义为抑郁低危人群、抑郁高危人群、抑郁晚发人群。与抑郁低危人群相比，抑郁高危人群更容易出现中老年人群痴呆症状（HR=1.227,95%CI:1.052～1.429）；与抑郁低危人群相比，抑郁晚发人群也更容易出现中老年人群痴呆症状（HR=1.332,95%CI:1.120～1.584）。结论中老年人抑郁发展轨迹存在异质性，潜变量增长混合模型有助于精准区分痴呆风险人群，今后应积极检查情感状态，对于出现抑郁症状患者应早期干预和治疗，并定期随访其认知功能，以便及时调整治疗方案，延缓痴呆的发生。

关键词：潜变量增长混合模型痴呆症抑郁症状中老年人

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中国痴呆症疾病负担研究及未来预测分析

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现代预防医学 2023年第3期50卷 402-407页

作者：熊屹立于宝乙刘声悦薛巧娣唐文君葛晓燕锦州医科大学口腔医学院锦州医科大学公共卫生学院锦州医科大学第一临床医学院锦州医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室

目的分析1990—2019年我国痴呆症疾病负担变化趋势和现状，并对未来25年疾病负担进行预测，以期为痴呆症疾病的科学防控和延缓发生发展提供科学依据。方法应用年龄-时期-队列模型(age-period-cohort,APC)分析年龄、时期和队列因素对... 详细信息

目的分析1990—2019年我国痴呆症疾病负担变化趋势和现状，并对未来25年疾病负担进行预测，以期为痴呆症疾病的科学防控和延缓发生发展提供科学依据。方法应用年龄-时期-队列模型(age-period-cohort,APC)分析年龄、时期和队列因素对痴呆症发病和死亡风险影响；应用Nordpred模型对未来25年疾病负担进行预测。结果我国痴呆症整体疾病负担自1990年以来呈现上升趋势，女性高于男性。年龄-时期-队列模型分析显示，痴呆症发病率呈现低龄化趋势，在70～74岁组后明显上升。死亡风险在75～79岁组后明显上升。发病风险随时期变化单调上升，2015—2019年发病风险最高，死亡风险随时期变化近似“S”型，2005—2010年死亡风险最高。越晚出生的队列发病风险较高，死亡风险较低。Nordpred模型预测显示，在未来25年内，ASIR值将继续增加，ASMR值平稳下降，但每年新增发病和死亡人数将持续增加。结论 1990年以来我国痴呆症疾病负担居高不下，未来发病和死亡人数将持续上升，女性人群和老年人群疾病负担重，低龄人群发病风险急剧上升。

关键词：痴呆症疾病负担年龄-时期-队列模型 Nordpred模型

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1990-2019年全球宫颈癌疾病负担分析

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中华肿瘤防治杂志 2024年第4期31卷 210-215页

作者：卫飞雪冯瑞梅高雪丁玲雷立健王彤山西医科大学公共卫生学院流行病学与卫生统计学教研室煤炭环境致病与防治教育部重点实验室山西太原030001

目的通过分析全球、各区域和不同国家近30年宫颈癌疾病负担的变化趋势,以识别在消除宫颈癌方面取得进展的国家以及需要进一步努力的国家和地区,从而为实现世界卫生组织(WHO)提出的消除宫颈癌的全球目标提供借鉴。方法采用线性回归模... 详细信息

目的通过分析全球、各区域和不同国家近30年宫颈癌疾病负担的变化趋势,以识别在消除宫颈癌方面取得进展的国家以及需要进一步努力的国家和地区,从而为实现世界卫生组织(WHO)提出的消除宫颈癌的全球目标提供借鉴。方法采用线性回归模型分析全球疾病负担2019数据库中1990-2019年全球、6个WHO分区以及204个国家宫颈癌发病、死亡及伤残调整生命年(DALY)的时间变化趋势。结果全球宫颈癌新发病例数从1990年的335 642例增长至2019年的565 541例,年增长率为2.3%,死亡病例数从184 527例增长至280 479例,年增长率为1.7%。1990-2019年全球和除西太平洋地区以外的WHO区域宫颈癌年龄标化发病率、标化死亡率和标化DALY率均呈降低趋势,年降低率为0.1%~1.2%。在204个国家中,过去30年有43个国家宫颈癌标化发病率和20个国家宫颈癌标化死亡率呈增长趋势,这些国家主要集中在非洲地区,尤其是撒哈拉以南地区。结论全球宫颈癌绝对负担的增加以及在非洲等部分国家标化发病率和死亡率的增加提示亟需在这些地区制定和实施相关政策,以提高疫苗接种率、宫颈癌筛查覆盖率以及宫颈病变的治疗率,从而尽快实现在全球范围内消除宫颈癌这一宏伟目标。

关键词：宫颈癌发病死亡伤残调整生命年时间趋势分析

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单细胞RNA测序数据批次效应校正方法

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中国卫生统计 2023年第1期40卷 153-156页

作者：王文杰李康谢宏宇哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150086 浙江大学医学院附属妇产科医院

传统的“bulk”RNA测序通过测量一个细胞群中基因的平均表达水平来描述一个组织的整体状态,掩盖了单个细胞的信号及组织内细胞异质性。单细胞RNA测序(single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)是近年来新兴的检测技术,通过单个细胞的转录... 详细信息

传统的“bulk”RNA测序通过测量一个细胞群中基因的平均表达水平来描述一个组织的整体状态,掩盖了单个细胞的信号及组织内细胞异质性。单细胞RNA测序(single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)是近年来新兴的检测技术,通过单个细胞的转录图谱分析其分子状态[1],在描绘细胞微环境,阐述相关生物学机制,识别新的治疗靶点等方面取得了前所未有的进展[2]。scRNA-seq数据通常由多批次实验数据整合而成,批次效应主要来源于实验数据的获取时间、操作人员、试剂批次、设备及检测技术平台等方面。批次效应可能是高度非线性的,它的存在使得下游分析复杂化,结果难以解释。因此,有效地移除scRNA-seq数据批次效应至关重要。

关键词：批次效应分子状态生物学机制细胞微环境数据整合细胞群校正方法整体状态

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内蒙古地区心血管病高危人群发生冠状动脉粥样硬化性心脏病的危险因素

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中华疾病控制杂志 2024年第3期28卷 310-315,367页

作者：苗宇闫涛张子英郭淑怡王靖宇闫金利许蕾王雅张春发钟武志张楠张星光内蒙古医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室呼和浩特010110 内蒙古医科大学基础医学院药理学教研室呼和浩特010110 内蒙古自治区人民医院应急管理科呼和浩特010110 内蒙古医科大学公共卫生学院卫生检验与检疫学教研室呼和浩特010110

目的探讨内蒙古地区心血管病高危人群冠状动脉粥样硬化性心脏病(coronary heart disease,CHD)发病的相关危险因素,为制定适合内蒙古地区CHD的防治策略提供科学依据。方法采用前瞻性队列研究方法,利用多阶段分层整群抽样方法。于2015年1... 详细信息

目的探讨内蒙古地区心血管病高危人群冠状动脉粥样硬化性心脏病(coronary heart disease,CHD)发病的相关危险因素,为制定适合内蒙古地区CHD的防治策略提供科学依据。方法采用前瞻性队列研究方法,利用多阶段分层整群抽样方法。于2015年12月在内蒙古地区6个盟市开展调查,每年随访1次,直至2021年12月。基线调查包括一般情况、疾病史及治疗史、体格检查和实验室检测,随访调查包括心血管健康状况及临床终点事件收集。采用Cox回归模型分析影响CHD的发病因素。结果最终纳入37726名研究对象,多因素Cox回归模型分析表明:增龄(HR>1.00,P<0.001)、吸烟(HR=1.20,P<0.001)、饮酒(HR=1.41,P<0.001)、超重或肥胖(HR=1.19,P<0.001)、高血压(HR=1.41,P<0.001)、糖尿病(HR=1.22,P<0.001)、血脂异常(HR=2.20,P<0.001)为CHD发病的危险因素;高教育水平(HR<1.00,P<0.001)、非重体力劳动类型(HR<1.00,P<0.001)为CHD发病的保护因素。结论在内蒙古地区,增龄、吸烟、饮酒、血脂异常、高血压、糖尿病、超重或肥胖为CHD发病的危险因素,高教育水平、非重体力劳动为CHD发病的保护因素。

关键词：冠状动脉粥样硬化性心脏病影响因素高危人群队列研究

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