检索结果-内蒙古大学图书馆

中国比较医学杂志 2016年第5期26卷 40-48页

作者：徐玉雪邱彬魏强雍伟东中国医学科学院医学实验动物研究所北京协和医学院比较医学中心卫生部人类疾病比较医学重点实验室国家中医药管理局人类疾病动物模型三级实验室北京100021

目的通过分析野生型小鼠(WT)与Fkbp51基因敲除(KO)小鼠肝脏、海马RNA表达谱系之间的差异,研究Fkbp51基因在代谢通路和神经通路中的作用。方法利用第二代测序技术对Fkbp51KO与WT小鼠的肝脏与海马mRNA进行表达谱测序,将测序结果用BRB-Arra... 详细信息

目的通过分析野生型小鼠(WT)与Fkbp51基因敲除(KO)小鼠肝脏、海马RNA表达谱系之间的差异,研究Fkbp51基因在代谢通路和神经通路中的作用。方法利用第二代测序技术对Fkbp51KO与WT小鼠的肝脏与海马mRNA进行表达谱测序,将测序结果用BRB-Array Tools进行分析,筛选出小鼠肝脏与海马的差异基因,然后分别利用在线工具DAVID对差异基因进行GO本体分析,STRING数据库对其进行蛋白质的相互作用网络分析,并利用Genecard对基因进行注释。结果 (1)Fkbp51的缺失,在肝脏中造成类固醇生物合成及代谢、脂类物质代谢以及氧化还原反应等相关基因表达水平的变化;(2)在海马中造成机械刺激探测、学习或记忆、突触传递的调节、PPAR信号通路、肌萎缩性脊髓侧索硬化症(ALS)等相关基因表达水平的变化;(3)在肝脏与海马中,Fkbp51的缺失同时造成了11个基因的共差异表达,这11个基因的蛋白网络互作图显示:HMGCS2与INSIG1及相关蛋白形成网络,而USP2与PER、CRY、DBP等相关蛋白形成另一个网络。这两个网络既参与代谢也参与神经调节。结论Fkbp51在代谢与神经中的作用既是相互独立又是相互联系的。

关键词： Fkbp51基因敲除小鼠肝脏神经系统 RNA-seq

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一种gRNA快速合成及检测方法的建立

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中国实验动物学报 2015年第3期23卷 267-271,290页

作者：杜建勇邓然高虹雍伟东中国医学科学院医学实验动物研究所北京协和医学院比较医学中心卫生部人类疾病比较医学重点实验室国家中医药管理局人类疾病动物模型三级实验室北京100021

目的建立一种gRNA快速合成及检测的方法。方法设计引物并利用PCR技术迅速扩增gRNA的DNA模板片段,然后通过体外转录纯化得到gRNA;最后通过体外反应迅速对gRNA和Cas9酶切效率及特异性进行检测。结果体外合成的gRNA特异性强,活性高,在靶点... 详细信息

目的建立一种gRNA快速合成及检测的方法。方法设计引物并利用PCR技术迅速扩增gRNA的DNA模板片段,然后通过体外转录纯化得到gRNA;最后通过体外反应迅速对gRNA和Cas9酶切效率及特异性进行检测。结果体外合成的gRNA特异性强,活性高,在靶点上成功切开DNA双链。结论成功建立gRNA快速合成及检测的方法,为后续转染或显微注射筛选有活性gRNA节约了时间。

关键词： CRISPR/Cas9 PCR扩增体外转录体外检测

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自然衰老过程中SD大鼠免疫系统结构功能的变化

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中国实验动物学报 2018年第1期26卷 95-100页

作者：朱华于品徐艳峰李彦红黄澜韩云林秦川卫生部人类疾病比较医学重点实验室国家中医药管理局人类疾病动物模型三级实验室中国医学科学院医学实验动物研究所北京协和医学院比较医学中心北京100021

目的观察自然衰老SD大鼠免疫系统结构和功能的改变,并探讨其可能的机制。方法 SD大鼠60只,饲养于SPF环境中。分别在6、12、18、24月龄安乐10只动物,以淋巴细胞转化实验和NK细胞杀伤实验判断淋巴细胞功能;用免疫荧光法测定外周血淋巴细... 详细信息

目的观察自然衰老SD大鼠免疫系统结构和功能的改变,并探讨其可能的机制。方法 SD大鼠60只,饲养于SPF环境中。分别在6、12、18、24月龄安乐10只动物,以淋巴细胞转化实验和NK细胞杀伤实验判断淋巴细胞功能;用免疫荧光法测定外周血淋巴细胞亚群。CBA法检测血清中细胞因子含量,比色法检测血清中超氧化物歧化酶(SOD)和丙二醛(MDA)。并对胸腺、脾进行组织病理学观察。结果随年龄增长大鼠淋巴细胞转化能力降低。CD8阳性T细胞数减少。脾细胞对NK靶细胞杀伤能力降低。血清中IL-2的量减少,IL-6、IL-10含量升高,SOD减少,MDA增多。胸腺脏器系数降低。胸腺萎缩,脾髓窦扩张,淋巴滤泡萎缩,髓外造血增多。脾中8-OHd G+细胞主要位于红髓区,成簇分布。胸腺中阳性细胞主要存在于髓质中,从皮质到髓质阳性细胞逐渐增多。结论提示免疫系统的增龄性退化与其氧化损伤的累积有一定关系,为衰老免疫损伤学说提供了实验依据。

关键词： SD大鼠衰老脾胸腺

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Fkbp51基因敲除对小鼠肝脏转录组基因可变剪接的影响

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中国比较医学杂志 2017年第5期27卷 31-36页

作者：周志强杨志伟雍伟东中国医学科学院医学实验动物研究所北京协和医学院比较医学中心卫生部人类疾病比较医学重点实验室国家中医药管理局人类疾病动物模型三级实验室北京100021

目的通过分析Fkbp51基因敲除(knock out,KO)与野生型(wild type,WT)小鼠肝脏表达谱,研究Fkbp51基因敲除对肝脏组织基因可变剪接的影响。方法利用二代测序对Fkbp51 KO与WT小鼠肝脏进行表达谱测序,用Top Hat对RNA测序结果进行可变剪接分析... 详细信息

目的通过分析Fkbp51基因敲除(knock out,KO)与野生型(wild type,WT)小鼠肝脏表达谱,研究Fkbp51基因敲除对肝脏组织基因可变剪接的影响。方法利用二代测序对Fkbp51 KO与WT小鼠肝脏进行表达谱测序,用Top Hat对RNA测序结果进行可变剪接分析,筛选出KO与WT小鼠肝组织中差异的内含子保留(intron retetion,RI)和外显子跳跃(exon skipping,SE)。通过在线工具DAVID对这些差异可变剪接体进行基因功能(gene ontology,GO)和代谢通路(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,同时用NCBI基因数据库对这些基因进行注释。结果 (1)Fkbp51缺失可导致小鼠肝脏mRNA可变剪接发生变化;(2)Fkbp51基因敲除造成小鼠肝脏mRNA可变剪接表达量的变化;(3)通过GO与KEGG分析,我们发现这些发生差异可变剪切的基因主要与脂肪相关衍生物的代谢、免疫、胆汁酸分泌等通路相关。(4)与差异内含子保留相关的基因主要与肌动蛋白细胞骨架调控,氨基酸及其衍生物代谢相关。结论 Fkbp51基因敲除能够改变基因组中mRNA的可变剪切,进而影响小鼠肝脏的代谢功能。

关键词： Fkbp51基因敲除小鼠肝脏 RNA-seq 可变剪接内含子保留外显子跳跃

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游离SIVmac239病毒与T细胞介导两种方式感染内皮细胞的效果比较

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中国比较医学杂志 2016年第6期26卷 1-5,10页

作者：黄丹丛喆徐珮薛婧魏强北京协和医学院比较医学中心中国医学科学院医学实验动物研究所卫生部人类疾病比较医学重点实验室国家中医药管理局人类疾病动物模型三级实验室北京100021

目的比较游离病毒感染与T细胞介导的感染方式对SIV感染内皮细胞的影响,探索SIVmac239感染内皮细胞的主要途径,从而为SIV入侵血脑屏障的机制提供理论基础。方法采用游离SIV病毒直接感染内皮细胞和SIV感染的CEMx174细胞与内皮细胞共培养... 详细信息

目的比较游离病毒感染与T细胞介导的感染方式对SIV感染内皮细胞的影响,探索SIVmac239感染内皮细胞的主要途径,从而为SIV入侵血脑屏障的机制提供理论基础。方法采用游离SIV病毒直接感染内皮细胞和SIV感染的CEMx174细胞与内皮细胞共培养的两种方式,通过巢式PCR、间接免疫荧光法、Western blotting以及ELISA检测内皮细胞的感染程度。结果两种感染方式都能在内皮细胞内检测到前病毒DNA,感染细胞与内皮细胞共培养时,内皮细胞内前病毒DNA含量,SIV P27蛋白表达量和细胞培养上清液中P27含量远高于游离病毒直接感染的方式。结论细胞介导的感染方式相较于游离病毒直接感染方式对内皮细胞的感染能力更强,可能是SIV病毒入侵血脑屏障的主要途径。

关键词： SIV 艾滋病脑病内皮细胞 P27

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实验动物品系数据库的建立

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中国比较医学杂志 2015年第4期25卷 78-83页

作者：孔琪夏霞宇秦川中国医学科学院医学实验动物研究所北京协和医学院比较医学中心卫生部人类疾病比较医学重点实验室国家中医药管理局人类疾病动物模型三级实验室

目的基于国内外部分实验动物数据库和文献,收集整理世界上现有的200多种共计26 000多个品系的实验动物数据,建立关系型检索数据库,使其成为世界上最大最全的实验动物品系数据库。方法构建基于My SQL数据库软件的中小型数据库,建立检索... 详细信息

目的基于国内外部分实验动物数据库和文献,收集整理世界上现有的200多种共计26 000多个品系的实验动物数据,建立关系型检索数据库,使其成为世界上最大最全的实验动物品系数据库。方法构建基于My SQL数据库软件的中小型数据库,建立检索界面、录入界面和数据库接口。结果本文建立了实验动物品系数据库,已经收录小鼠品系数据21 596条;大鼠品系数据2062条;猴品系数据13条;地鼠品系数据2条;犬品系数据5条;兔品系数据5条。以后会逐步完善数据,实现实验动物品系数据库的定期更新。讨论该数据库的建立方便我国科研人员查阅和使用国内外实验动物品系资源,为引进欧美日等发达国家的实验动物品系资源提供链接。

关键词：实验动物品系数据库小鼠资源

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FKBP51参与高脂诱导的线粒体损伤

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中国比较医学杂志 2018年第4期28卷 1-6页

作者：刘明邱彬王婷婷邓然刘云波雍伟东中国医学科学院医学实验动物研究所北京协和医学院比较医学中心卫生部人类疾病比较医学重点实验室国家中医药管理局人类疾病动物模型三级实验室北京100021

目的通过高脂喂养C57BL/6J小鼠,探究小鼠高脂饮食对线粒体结构和功能的影响。方法随机选取4周龄雄性C57BL/6J小鼠,分别进行正常饮食和高脂饮食饲养6周后通过体重和HE染色确认高脂诱导的肥胖表型,利用二代测序技术对正常饮食和高脂饮食... 详细信息

目的通过高脂喂养C57BL/6J小鼠,探究小鼠高脂饮食对线粒体结构和功能的影响。方法随机选取4周龄雄性C57BL/6J小鼠,分别进行正常饮食和高脂饮食饲养6周后通过体重和HE染色确认高脂诱导的肥胖表型,利用二代测序技术对正常饮食和高脂饮食小鼠肝脏mRNA表达谱测序并用BRB-Array Tools筛选差异基因,对差异基因进行GO本体分析和KEGG通路分析,应用透射电镜和western blotting技术检测高脂饮食下小鼠肝脏线粒体显微结构及相关功能蛋白的表达情况。结果与正常饮食组小鼠相比,高脂饮食组小鼠体重显著增加,肝脏中脂肪沉积明显增多。利用DAVID在线工具对差异基因进行GO本体分析及KEEG通路分析,发现这些主要基因变化与线粒体相关。通过透射电镜观察,发现高脂饮食组小鼠线粒体变形、增大甚至破裂坏死。此外,高脂饮食组小鼠肝脏线粒体中线粒体融合蛋白(mitofusin 1,MFN1)和抗增殖蛋白1(prohibitin1,PHB1)的相对表达量显著增加,而FKBP51的表达量显著降低。结论 FKBP51通过影响线粒体形态与结构来参与高脂诱导的线粒体损伤。

关键词： FKBP51 线粒体损伤高脂

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CEMx174细胞中SAMHD1蛋白表达与SIVmac239病毒水平的相关性研究

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中国比较医学杂志 2016年第4期26卷 41-45页

作者：彭灵娟丛喆薛婧宋铭晶魏强北京协和医学院比较医学中心中国医学科学院医学实验动物研究所卫生部人类疾病比较医学重点实验室国家中医药管理局人类疾病动物模型三级实验室北京100021

目的研究SIV在感染CEMx174细胞过程中,SAMHD1在基因和蛋白水平的变化与病毒水平之间的相关性。方法 SIVmac239病毒感染CEMx174细胞后,每天收集上清和细胞,应用Taq Man探针实时荧光定量RT-PCR方法,检测细胞内SAMHD1 mRNA的相对表达量的变... 详细信息

目的研究SIV在感染CEMx174细胞过程中,SAMHD1在基因和蛋白水平的变化与病毒水平之间的相关性。方法 SIVmac239病毒感染CEMx174细胞后,每天收集上清和细胞,应用Taq Man探针实时荧光定量RT-PCR方法,检测细胞内SAMHD1 mRNA的相对表达量的变化;用Western blot检测SAMHD1蛋白与SIVmac239P27蛋白表达量的变化,并分析其相关性。结果 CEMx174细胞感染SIVmac239后,细胞中的SAMHD1 mRNA基于内参基因GAPDH的相对表达量逐渐增加,前3 d分别增加了14%,16%,42%,随后开始迅速增加,第4天达到了200%,第6天更是达到了890%;细胞中SAMHD1蛋白的表达量在感染后第1、2天时变化不大,随后逐渐降低,到第5、6天时,几乎检测不到,呈现逐渐下降的趋势。结论 CEMx174细胞感染SIVmac239后,SAMHD1基因表达上调,与上清中病毒载量水平正相关,细胞内SAMHD1蛋白水平与SIVmac239 P27蛋白水平呈负相关。

关键词： SAMHD1 HIV-1 SIV 实时荧光定量RT-PCR

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SAMHD1限制HIV/SIV病毒复制功能研究的最新进展

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中国比较医学杂志 2015年第10期25卷 71-74页

作者：彭灵娟丛喆魏强北京协和医学院比较医学中心中国医学科学院医学实验动物研究所卫生部人类疾病比较医学重点实验室国家中医药管理局人类疾病动物模型三级实验室北京100021

SAMHD1是宿主限制性天然免疫分子,主要在髓系细胞及静息CD4+T细胞中表达,通过降低胞内d NTP水平限制HIV-1的复制和感染。近来研究发现SAMHD1还能够促进HIV/SIV病毒的基因重组、降解病毒基因组RNA以及抑制病毒在细胞间的传播,在病毒的感... 详细信息

SAMHD1是宿主限制性天然免疫分子,主要在髓系细胞及静息CD4+T细胞中表达,通过降低胞内d NTP水平限制HIV-1的复制和感染。近来研究发现SAMHD1还能够促进HIV/SIV病毒的基因重组、降解病毒基因组RNA以及抑制病毒在细胞间的传播,在病毒的感染、复制、包装、传播等整个生命过程中都发挥着一定的作用。目前这一天然抗病毒蛋白分子已经成为HIV研究领域的新热点,本文将就SAMHD1抗HIV病毒研究的最新进展做一综述。

关键词： SAMHD1 HIV-1 Vpx

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恒河猴BST-2基因编码区单核苷酸多态性及其对蛋白结构和功能的影响

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中国比较医学杂志 2015年第7期25卷 20-24页

作者：董志会王卫丛喆熊圣文骆杨陈霆魏强北京协和医学院比较医学中心中国医学科学院医学实验动物研究所卫生部人类疾病比较医学重点实验室国家中医药管理局人类疾病动物模型三级实验室北京100021

目的筛查恒河猴BST-2基因编码区单核苷酸多态性(coding-region single nucleotide polymorphism,c SNP),研究其对蛋白结构和功能的影响。方法提取恒河猴外周血RNA,RT-PCR扩增,单克隆测序比对,确定猴BST-2的c SNP位点;通过蛋白质结构分... 详细信息

目的筛查恒河猴BST-2基因编码区单核苷酸多态性(coding-region single nucleotide polymorphism,c SNP),研究其对蛋白结构和功能的影响。方法提取恒河猴外周血RNA,RT-PCR扩增,单克隆测序比对,确定猴BST-2的c SNP位点;通过蛋白质结构分析软件对蛋白结构进行分析;比较不同基因型猴体内SHIVSF162 p 3复制水平的差异。结果序列比对发现8个非同义突变位点;经Psipred软件预测,其中G41A、T128C、C129和A333C c SNP位点可影响BST-2蛋白二级结构。在SHIVSF162 p 3感染平台期,参考基因型猴(DLQ)病毒复制水平要高于GLQ型猴(P<0.05),其他基因型猴之间无显著差异。结论 c SNP(G41A)可能影响BST-2的抗病毒功能,这为后续研究提供参考信息。

关键词： BST-2 cSNP 蛋白质结构恒河猴

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