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中国化学会第29届学术年会

作者：刘培王倩刘莹来鲁华北京分子科学国家实验室分子动态与稳态结构国家重点实验室北京大学化学与分子工程学院

癌细胞为了满足快速增殖的需求,其代谢过程不同于正常细胞,更倾向于通过糖酵解途径进行代谢。磷酸甘油酸脱氢酶(PHGDH)是催化生物体内合成丝氨酸第一步反应的关键酶,在人的黑色素瘤1和乳腺癌细胞2中均被发现有过表达,并且PHGDH对于这些... 详细信息

癌细胞为了满足快速增殖的需求,其代谢过程不同于正常细胞,更倾向于通过糖酵解途径进行代谢。磷酸甘油酸脱氢酶(PHGDH)是催化生物体内合成丝氨酸第一步反应的关键酶,在人的黑色素瘤1和乳腺癌细胞2中均被发现有过表达,并且PHGDH对于这些细胞的生长和生存必不可少。因此,以PHGDH作为靶标设计抑制剂有望成为治疗癌症的一种新策略。别构抑制剂在提供新的结合位点、提高选择性、改善耐药突变的影响等方面优于底物竞争型抑制剂。本文通过结合位点探测程序Cavity以及人工挑选,预测了PHGDH的潜在别构口袋,分别针对这些口袋进行虚拟筛选,购买化合物进行酶活测定,初步得到作用于5个不同别构口袋的先导化合物,其中对III号口袋活性最好的化合物(5-1)的半数抑制常数IC50为3.0.M。我们对此化合物进行了结构修饰,合成了29个新化合物以探索结构与活性关系,深入研究正在进行之中。

关键词：磷酸甘油酸脱氢酶别构抑制剂虚拟筛选酶活测定合成

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小分子对白三烯A4水解酶活性调控的研究

小分子对白三烯A4水解酶活性调控的研究

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第五届全国化学生物学学术会议

作者：蒋小蕗周璐位灯国刘莹来鲁华北京分子科学国家实验室分子动态与稳态结构国家重点实验室北京大学化学与分子工程学院

白三烯 A水解酶(Leukotriene A hydrolase,LTA4H)是一种含锌的双功能蛋白酶,具有水解酶和氨肽酶两种活性。作为水解酶,LTA4H 能够专一性的催化环氧化物白三烯 A(LTA) 水解生成白三烯 B(LTB)。LTB是炎症细胞的化学诱导和激活剂,被认为是... 详细信息

白三烯 A水解酶(Leukotriene A hydrolase,LTA4H)是一种含锌的双功能蛋白酶,具有水解酶和氨肽酶两种活性。作为水解酶,LTA4H 能够专一性的催化环氧化物白三烯 A(LTA) 水解生成白三烯 B(LTB)。LTB是炎症细胞的化学诱导和激活剂,被认为是许多急性和慢 -}生炎症的重要化学介质,抑制 LTAH 的活性,也即抑制 LTB的生物合成,很有可能有效的治

关键词：白三烯 A 水解酶双功能激活/抑制

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苯磺酸修饰中孔炭作为高效生物柴油催化剂

苯磺酸修饰中孔炭作为高效生物柴油催化剂

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中国化学会第28届学术年会

作者：耿靓隗罡王羽朱月香北京大学化学与分子工程学院分子动态与稳态结构国家重点实验室北京分子科学国家实验室

以γ-氧化铝为模板,酚醛树脂为碳源合成薄壁中孔炭材料。用重氮盐法对中孔炭进行苯磺酸修饰。所得炭基磺酸化固体酸材料具备高的比表面积(～1000m2/g),孔径双峰分布,以及较高的强酸位密度(1.86mmolH+/g)。

关键词：中孔炭炭基固体酸氧化铝模板重氮盐修饰酯化反应

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薄壁中孔炭材料的可控制备

薄壁中孔炭材料的可控制备

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中国化学会第28届学术年会

作者：隗罡朱月香谢有畅北京大学化学与分子工程学院分子动态与稳态结构国家重点实验室北京分子科学国家实验室

＜正＞自1999年以来,以有序中孔炭为代表的中孔炭材料在催化、吸附、能源等领域引起广泛关注。然而有序中孔炭材料受到使用价格昂贵的有序模板作为原料的限制,至今仍不能得到大规模商业化应用。本文采

关键词：中孔炭炭材料高比表面积模板法可控制备

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盐浓度对纳米金颗粒表面DNA解链温度的影响

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云南民族大学学报（自然科学版） 2008年第3期17卷 193-196页

作者：葛静陈春来赵新生北京分子科学国家实验室分子动态与稳态结构国家重点实验室北京大学化学与分子工程学院化学生物学系北京100871

对比了盐浓度对固定在纳米金颗粒表面的和溶液中的DNA解链温度的影响.结果显示,在这两种体系中,解链温度对钠离子浓度的对数值都呈现线性关系,并且在实验误差范围内,直线的斜率相同.

关键词：纳米金颗粒 DNA 盐浓度解链温度

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寡聚酰胺PyPyPyβDp与DNA相互作用的荧光动力学

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中国科学（B辑） 2005年第4期35卷 275-279页

作者：张慧娟王津吴义室袁谷艾希成汪力张建平中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100080 北京大学化学与分子工程学院北京100871 中国科学院物理研究所凝聚态物理中心北京100080

通过稳态吸收光谱、荧光光谱和时间分辨荧光光谱对寡聚酰胺分子PyPyPyβDp(简称PPP)的光物理性质进行了详细研究.发现PPP的激发态性质受溶剂环境影响较大,在TKMC缓冲液中,PPP有较弱的荧光,其荧光寿命为16ps;随着溶剂极性逐渐降低,荧光... 详细信息

通过稳态吸收光谱、荧光光谱和时间分辨荧光光谱对寡聚酰胺分子PyPyPyβDp(简称PPP)的光物理性质进行了详细研究.发现PPP的激发态性质受溶剂环境影响较大,在TKMC缓冲液中,PPP有较弱的荧光,其荧光寿命为16ps;随着溶剂极性逐渐降低,荧光光谱蓝移,荧光强度增加,相应荧光寿命增长.通过对PPP与DNA双螺旋分子相互作用的荧光动力学研究表明,PPP与DNA相互作用后,荧光强度增强,荧光寿命从16ps增加到32ps,证实了存在PPP与双螺旋DNA的结合相互作用.

关键词：寡聚酰胺(PPP) 小牛胸腺DNA(ctDNA) 时间分辨荧光光谱识别动力学分子相互作用 DNA双螺旋荧光动力学寡聚酰胺 Dp 光物理性质

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5-羟甲基糠醛催化选择氧化合成2,5-呋喃二甲醛反应

5-羟甲基糠醛催化选择氧化合成2,5-呋喃二甲醛反应

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第八届全国催化剂制备科学与技术研讨会

作者：聂俊芳刘海超北京大学化学与分子工程学院分子动态与稳态结构国家重点实验室北京分子科学国家实验室北京100871

5-羟甲基糠醛(HMF)是重要的生物质基平台分子,其来源丰富,可以转化为液体燃料和重要的化学品。本文主要概述在HMF催化选择氧化制备2,5-呋喃二甲醛(DFF)方面的研究进展。分别研究了二氧化钛负载五氧化二钒(V2O5/TiO2)、活性炭负载钌(Ru/C... 详细信息

5-羟甲基糠醛(HMF)是重要的生物质基平台分子,其来源丰富,可以转化为液体燃料和重要的化学品。本文主要概述在HMF催化选择氧化制备2,5-呋喃二甲醛(DFF)方面的研究进展。分别研究了二氧化钛负载五氧化二钒(V2O5/TiO2)、活性炭负载钌(Ru/C)和具有分子筛结构的MnO2等催化剂的反应活性和选择性。

关键词：催化剂性能表征选择性 2,5-呋喃二甲醛

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功能蛋白质设计

功能蛋白质设计

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中国化学会第29届学术年会

作者：来鲁华北京大学化学与分子工程学院北京分子动态与稳态国家重点实验室分子科学国家实验室

设计具有特定结构或功能的蛋白质一方面可以揭示蛋白质结构与功能关系的规律,另一方面可以创造具有潜在应用价值的蛋白质。蛋白质-蛋白质相互作用在生命过程中发挥了重要作用,许多蛋白质相互作用被认为是重要的药物设计靶标,针对这些关... 详细信息

设计具有特定结构或功能的蛋白质一方面可以揭示蛋白质结构与功能关系的规律,另一方面可以创造具有潜在应用价值的蛋白质。蛋白质-蛋白质相互作用在生命过程中发挥了重要作用,许多蛋白质相互作用被认为是重要的药物设计靶标,针对这些关键作用的蛋白质药物研发近年了受到很多关注,也是发展最快的药物类型。我们致力于发展创造自然界中不存在的新型蛋白质相互作用对的设计方法,主要包括基于关键作用残基的嫁接方法、基于靶蛋白质结构的结合蛋白全新设计方法和基于蛋白质-蛋白质对接计算的虚拟筛选方法,相关设计方法在一些重要生物体系的蛋白质设计中得到了成功应用。我们还将相关的设计策略应用到金属结合蛋白质的设计中,成功地设计得到了与铀酰离子具有超强结合活性的蛋白质、与锌离子结合的蛋白质等。相关设计方法有望在更多的功能蛋白质设计中得到应用。

关键词：蛋白质设计蛋白质结构与功能蛋白质-蛋白质相互作用金属结合蛋白质设计

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单个金纳米花的表面增强拉曼效应

单个金纳米花的表面增强拉曼效应

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2011中国材料研讨会

作者：李琦江媛媛吴雪军徐东升北京大学化学与分子工程学院分子动态与稳态国家重点实验室北京分子科学国家实验室

由中心致密的金核和金核表面的片状结构组装而成的金纳米花以其独特的光吸收和表面局域等离子体共振效应而受到广泛的关注。其较大的表面积以及由于片状结构的存在而产生的热点(HotSpot)效应使得其在细胞和生物体的拉曼成像方面具有潜... 详细信息

由中心致密的金核和金核表面的片状结构组装而成的金纳米花以其独特的光吸收和表面局域等离子体共振效应而受到广泛的关注。其较大的表面积以及由于片状结构的存在而产生的热点(HotSpot)效应使得其在细胞和生物体的拉曼成像方面具有潜在的应用价值。本论文对表观尺寸为80nm的金纳米花的表面增强拉曼散射(SERS)效应进行了研究,结果表明金纳米花的SERS效应没有明显的方向依赖性,而对单个金纳米花的SERS增强因子的估算显示其数值可以达到～106。结合实验结果,根据Mie散射理论对金纳米花与光的相互作用进行了理论模拟,模拟的金纳米花消光光谱与实验结果基本吻合,而且模拟结果表明金纳米花的外层片状结构处存在明显的局域电场增强。

关键词：金纳米花表面增强拉曼光谱

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基于系统的药物设计

基于系统的药物设计

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中国化学会第30届学术年会-第二十五分会：化学信息学与化学计量学

作者：来鲁华北京大学化学与分子工程学院北京分子动态与稳态国家重点实验室分子科学国家实验室

人类疾病与复杂因素相关,近年来生命科学的发展,特别是深度测序和各种组学数据为建立复杂疾病的模型并开展基于系统的药物设计提供了机遇。我们将基于蛋白质结构的药物设计拓展到基于系统的药物设计研究,提出了针对疾病相关分子网络寻... 详细信息

人类疾病与复杂因素相关,近年来生命科学的发展,特别是深度测序和各种组学数据为建立复杂疾病的模型并开展基于系统的药物设计提供了机遇。我们将基于蛋白质结构的药物设计拓展到基于系统的药物设计研究,提出了针对疾病相关分子网络寻找关键结点和最优控制方案的方法,发展了多靶标药物设计方法、针对蛋白质别构位点以及无序蛋白质的药物设计方法,研究了网络拓扑结构与组合给药效果的关系等。我们近年来从系统生物学角度对于中药的分子机制进行了探讨,并探索了如何针对特定疾病或特定靶标进行草药选择与组方设计。

关键词：系统生物学药物设计生物网络中药分子机理

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