检索结果-内蒙古大学图书馆

物理化学学报 2019年第5期35卷 546-554页

作者：卜佩璇何晨晖赵新生北京大学化学与分子工程学院化学生物学系分子动态与稳态结构国家重点实验室北京分子科学国家研究中心北京100871 北京大学生物动态光学成像中心北京100871 北京大学生命科学学院北京100871

本文用单分子探测研究了外膜蛋白OmpT在Tween-20与十二烷基-β-D-麦芽糖苷(DDM)胶束中的折叠。我们制备了单分散的OmpT,观察到OmpT在不同浓度尿素的Tween-20和DDM胶束中的折叠与去折叠。OmpT在Tween-20胶束中形成的折叠态与其在DDM中折... 详细信息

本文用单分子探测研究了外膜蛋白OmpT在Tween-20与十二烷基-β-D-麦芽糖苷(DDM)胶束中的折叠。我们制备了单分散的OmpT,观察到OmpT在不同浓度尿素的Tween-20和DDM胶束中的折叠与去折叠。OmpT在Tween-20胶束中形成的折叠态与其在DDM中折叠形成的天然OmpT结构相似,但稳定性和酶活性均低于天然OmpT。与此相比,在Tween-20中OmpA只在低浓度尿素中折叠,OmpC不折叠。荧光相关光谱(FCS)结果表明折叠的外膜蛋白与去垢剂胶束形成复合体。在β桶折叠机器(BAM)复合体存在时,OmpT比OmpA和OmpC的折叠更加高效。三种外膜蛋白在Tween-20和BAM复合体存在下的折叠结果表明,OmpT比OmpA与OmpC更容易折叠。人们猜测不同性质的外膜蛋白与BAM复合体作用的方式不同,本文的研究结果为这种猜测提供了支持。由于Tween-20常被用于防止单分子实验中的非特异性吸附,本文的结果也提醒人们要注意蛋白与Tween-20相互作用对实验结果的影响。

关键词：单分子FRET 荧光相关谱 OmpT折叠 Tween-20 DDM

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低温加氢催化剂的设计：理论与实践(英文)

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物理化学学报 2010年第4期26卷 869-876页

作者：陈经广齐随涛 HUMBERT Michael P MENNING Carl A 朱月香 Department of Chemical Engineering Center for Catalytic Science and Technology(CCST)University of DelawareNewarkDE 19716USA 西安交通大学化工系西安710049 北京大学化学与分子工程学院北京分子科学国家实验室分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100871

简要总结了我们在C=C及C=O双键低温加氢双金属催化剂方面的最新研究成果.首先,我们以环己烯加氢为探针反应,证明了平行使用多种研究手段的重要性,包括单晶表面的基础研究与DFT计算,多晶表面的合成与表征,负载型催化剂的制备与性能测试等... 详细信息

简要总结了我们在C=C及C=O双键低温加氢双金属催化剂方面的最新研究成果.首先,我们以环己烯加氢为探针反应,证明了平行使用多种研究手段的重要性,包括单晶表面的基础研究与DFT计算,多晶表面的合成与表征,负载型催化剂的制备与性能测试等.其次,总结了双金属催化剂在其他加氢反应,如丙烯醛C=O双键的选择性加氢,苯的低温加氢,以及乙炔的选择性加氢等反应中的应用.最后,讨论了利用金属碳化物代替贵金属Pt以减少双金属催化剂中Pt用量的可能性.

关键词：加氢双金属催化剂金属碳化物 DFT计算

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高密度噬菌体抗体芯片对细胞表面蛋白的识别

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物理化学学报 2006年第7期22卷 777-779页

作者：岑晓东王文娟赵新生汪玄沈悌谭涛超毕群朱圣庚北京大学生命科学学院北京100871 北京大学化学与分子工程学院化学生物学系分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100871 北京协和医院北京100730

采用正常人和白血病患者的白细胞对人源噬菌体抗体库进行淘选,以获得对两种细胞表面蛋白特异的抗体.通过pVIII展示系统,使抗体以多价展示于重组噬菌体颗粒表面,从上述两组中各挑选出48个克隆分别固定于环氧基片上,并以空白噬菌体和牛血... 详细信息

采用正常人和白血病患者的白细胞对人源噬菌体抗体库进行淘选,以获得对两种细胞表面蛋白特异的抗体.通过pVIII展示系统,使抗体以多价展示于重组噬菌体颗粒表面,从上述两组中各挑选出48个克隆分别固定于环氧基片上,并以空白噬菌体和牛血清白蛋白作为对照,制成高密度噬菌体抗体芯片.取来自3名正常人和3名白血病患者的白细胞裂解物样品,用荧光染料Cy3标记,与噬菌体抗体芯片反应,对微阵共聚焦扫描得到的荧光图谱进行分析.在白血病白细胞表面蛋白的识别图谱中有8组斑点显著不同于正常图谱.由此表明,噬菌体抗体芯片可用于识别细胞表面蛋白.

关键词：噬菌体抗体库 pⅧ展示系统高密度噬菌体抗体芯片白血病白细胞表面蛋白

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生物分子液-液相分离的物理化学机制

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物理化学学报 2020年第1期36卷 154-168页

作者：张长胜来鲁华北京大学化学与分子工程学院物理化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京分子科学国家研究中心北京100871 北京大学定量生物学中心北京大学-清华大学生命科学联合中心北京100871

近年来,有关生物分子通过液-液相分离机制进行组织定位、功能调控的研究发展迅速。相分离产生的聚集体在众多细胞活动事件中发挥了关键作用。这些聚集体的生物功能是以相分离的物理化学性质为基础的。本文将从相分离聚集体的基本性质、... 详细信息

近年来,有关生物分子通过液-液相分离机制进行组织定位、功能调控的研究发展迅速。相分离产生的聚集体在众多细胞活动事件中发挥了关键作用。这些聚集体的生物功能是以相分离的物理化学性质为基础的。本文将从相分离聚集体的基本性质、相图、微观结构,相分离的统计热力学、实验和分子模拟研究等方面阐释相分离物理化学机制研究相关进展。对于生物分子相分离的重要功能体系进行了列举和归纳,收集了相分离研究的模式体系,探讨了生物分子相分离的生物功能同物理化学机制之间的关系,总结了生物分子相分离的调控机制和调控分子的设计方法,并对生物分子相分离物理化学机制研究的未来发展方向进行了展望。

关键词：生物分子液-液相分离液态聚集体天然无序蛋白质多价作用分子聚集的计算模拟相分离调控

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双光子敏化Eu^(3+)高效发光活细胞成像纳米生物探针(英文)

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物理化学学报 2012年第10期28卷 2480-2486页

作者：符小艺邵光胜韩荣成马严薛富民杨帆付立民张建平王远北京分子科学国家实验室分子动态与稳态国家重点实验室北京大学化学与分子工程学院北京100871 华南理工大学材料科学与工程学院广州510640 中国人民大学化学系北京100872

将Eu(tta)3dpbt(dpbt:2-(N,N-diethylanilin-4-yl)-4,6-bis(3,5-dimethylpyrazol-1-yl)-1,3,5-triazine;tta:thenoyltrifluoroacetonato)包埋在甲基丙烯酸甲酯-苯乙烯共聚物、正辛基三甲氧基硅及其水解缩合产物组成的杂化基质中,制备了Eu(tta)3dpbt质量分数为40%的荧光纳米粒子,其平均粒径为45nm.所制备的发光纳米粒子在水中分散稳定性高、光稳定性好、细胞毒性低、长波敏化Eu3+发光性能优良,适宜作为生物分析的发光标记物.所制备的发光纳米粒子的可见区激发峰位于415nm,激发峰尾部延展至475nm,其发光量子产率为0.31(λex=415nm,T=23°C),最大双光子激发作用截面为5.0×105GM(λex=830nm,1GM=10-50cm4·s·photo-1×particle-1).以转铁蛋白修饰上述发光纳米粒子表面制备的纳米生物探针被成功应用于活的HeLa肿瘤细胞的特异性标记和双光子激发Eu3+发光成像.

关键词：发光铕配合物双光子激发纳米生物探针细胞成像

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SH2结构域:一个潜在的药靶

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生命的化学 2008年第4期28卷 194-196页

作者：傅用增来鲁华北京大学化学与分子工程学院分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100871

众多包含SH2结构域(Src homology 2 domain)的蛋白质在细胞内信号传导过程中起到重要作用,它们通过SH2结构域特异性结合包含磷酸化酪氨酸的蛋白质。SH2结构域保守的结构特征和重要的功能使它成为一种潜在的药物作用靶标。基于其结合靶... 详细信息

众多包含SH2结构域(Src homology 2 domain)的蛋白质在细胞内信号传导过程中起到重要作用,它们通过SH2结构域特异性结合包含磷酸化酪氨酸的蛋白质。SH2结构域保守的结构特征和重要的功能使它成为一种潜在的药物作用靶标。基于其结合靶蛋白序列设计的SH2结构域的抑制剂为治疗胞内信号通路异常引起的疾病提供了很好的方向。本文简述了SH2结构域的结构特征,结合特异性和抑制剂设计的进展。

关键词： SH2结构域磷酸化酪氨酸多肤类似物基于结构的药物设计

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基于药效团模型的DHODH抑制剂构效关系研究

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高等学校化学学报 2010年第5期31卷 938-946页

作者：鲍红娟唐亚林徐筱杰向俊锋郑智慧路新华中国科学院化学研究所分子动态与稳态国家重点实验室北京分子科学国家重点实验室北京100190 北京大学化学与分子工程学院北京100871 华北制药集团新药研究开发有限责任公司石家庄050015

利用药效团模型研究二氢乳清酸脱氢酶（Dihydroorotate dehydrogenase,DHODH）抑制剂的构效关系,为DHODH抑制剂的虚拟筛选提供新的方法.以31个具有DHODH抑制活性的化合物为训练集化合物,半数抑制浓度（IC50）范围为7~63000 nmol/L,利用C... 详细信息

利用药效团模型研究二氢乳清酸脱氢酶（Dihydroorotate dehydrogenase,DHODH）抑制剂的构效关系,为DHODH抑制剂的虚拟筛选提供新的方法.以31个具有DHODH抑制活性的化合物为训练集化合物,半数抑制浓度（IC50）范围为7~63000 nmol/L,利用Catalyst/HypoGen算法构建DHODH抑制剂药效团模型,通过对训练集化合物多个构象进行叠合,提取药效团特征及三维空间限制构建药效团模型.利用基于CatScramble的交叉验证方法及评价模型对已知活性化合物的活性预测能力,确定较优药效团模型.模型包含1个氢键受体、3个疏水中心,表征了受体配体相互作用时可能发生的氢键相互作用、疏水相互作用和π-π相互作用,4个药效特征在三维空间的排列概括了DHODH抑制剂产生活性的结构特点.所得较优模型对训练集化合物及测试集化合物的计算活性值与实验活性值的相关系数分别为0.8405和0.8788.利用药效团模型对来源于微生物的系列化合物进行虚拟筛选,筛选出59个预测活性较好的化合物,可作为进一步药物研发的候选化合物.

关键词： DHODH抑制剂构效关系药效团模型虚拟筛选

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寡聚核苷酸中鸟苷对四甲基罗丹明的荧光猝灭

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中国科学（B辑） 2009年第10期39卷 1210-1217页

作者：曲鹏陈旭东周晓雪李勋赵新生北京分子科学国家实验室动态与稳态结构国家重点实验室北京大学化学与分子工程学院化学生物学系北京100871

具有核苷特异性的荧光猝灭技术在生物领域具有广泛应用.为了更好地理解这一过程的机理及其影响因素,研究了核苷对四甲基罗丹明(TMR)染料的分子间猝灭和在同一条寡聚核苷酸链中的分子内猝灭.与以前的研究结果一致,脱氧单磷酸鸟苷(dGMP)... 详细信息

具有核苷特异性的荧光猝灭技术在生物领域具有广泛应用.为了更好地理解这一过程的机理及其影响因素,研究了核苷对四甲基罗丹明(TMR)染料的分子间猝灭和在同一条寡聚核苷酸链中的分子内猝灭.与以前的研究结果一致,脱氧单磷酸鸟苷(dGMP)可以有效地猝灭TMR,而其他单磷酸腺苷对其的猝灭可以忽略.由斯特恩-沃尔默图获得TMR和dGMP的双分子猝灭常数为Ks=52.3L/mol.将TMR标记在寡聚核苷酸末端,可以观测到其荧光通过光致电子传递有效地被鸟苷猝灭,我们利用荧光相关光谱的方法测定了这一过程的猝灭速率常数.此外,所得的数据还显示鸟苷附近的碱基会对分子内的猝灭过程产生显著的位阻效应.这些结果将有助于设计寡聚核苷酸荧光探针和理解G猝灭过程.

关键词：四甲基罗丹明(TMR) 鸟苷荧光寡聚核苷酸 G猝灭光致电子传递(PET) 荧光相关光谱(FCS)

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趋化因子受体在炎症诱导痛觉中的作用

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中国生物化学与分子生物学报 2006年第2期22卷 101-105页

作者：万五洲张宁北京大学化学与分子工程学院化学生物学系分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100871

趋化因子受体最早是在研究白细胞迁移过程中发现的,它在大鼠和小鼠的背根神经节外周感觉神经细胞上也有表达.在炎症情况下,激活的趋化因子受体可以诱导神经细胞上一类重要的镇痛受体———μ-鸦片受体的异源性脱敏,抑制其功能;同时,激... 详细信息

趋化因子受体最早是在研究白细胞迁移过程中发现的,它在大鼠和小鼠的背根神经节外周感觉神经细胞上也有表达.在炎症情况下,激活的趋化因子受体可以诱导神经细胞上一类重要的镇痛受体———μ-鸦片受体的异源性脱敏,抑制其功能;同时,激活的趋化因子受体还可以增强一类对于痛觉感受非常关键的受体———辣椒素受体的敏感性,使其敏化.趋化因子受体诱导的这2种效应可以通过Gi蛋白信号传导通路增强生物体对痛觉的敏感度.这些结果提示,趋化因子受体可能是免疫系统和神经系统之间交叉调节的桥梁.

关键词：趋化因子受体 μ-鸦片受体辣椒素受体炎症痛觉

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碳纳米管网络导电特征的导电型原子力显微镜研究

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物理学报 2009年第12期58卷 8473-8477页

作者：赵华波李震李睿张朝晖张岩刘宇李彦北京大学物理学院人工微结构与介观物理国家重点实验室北京100871 北京大学化学与分子工程学院物理与化学重点实验室北京100871

利用导电型原子力显微镜对大范围碳纳米管(CNT)网络的导电性能进行成像观察.研究发现:在几十微米的成像范围内,每根CNT本身的电阻远小于CNT之间的接触电阻,以致于在电压偏置的网络中不同的CNT呈现电位不同的等位体;CNT的导电性能虽不因... 详细信息

利用导电型原子力显微镜对大范围碳纳米管(CNT)网络的导电性能进行成像观察.研究发现:在几十微米的成像范围内,每根CNT本身的电阻远小于CNT之间的接触电阻,以致于在电压偏置的网络中不同的CNT呈现电位不同的等位体;CNT的导电性能虽不因与其他CNT的交叠接触而改变,但是如果缠绕成束,则半导体性CNT趋于呈现金属性CNT的导电特征.

关键词：导电型原子力显微镜碳纳米管网络碳管纳米电导

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