检索结果-内蒙古大学图书馆

遗传 2013年第4期35卷 547-548页

作者：肖安张雨田张博北京大学生命科学学院细胞增殖与分化教育部重点实验室北京100871

斑马鱼（Daniorerio）是目前遗传发育研究领域最为活跃的模式脊椎动物之一，有多个大型研究计划正在进行中。本文选择其中的一部分进行简要介绍。1斑马鱼基因组测序计划斑马鱼基因组测序计划始于2001年，最初由英国Sanger研究所主持，... 详细信息

斑马鱼（Daniorerio）是目前遗传发育研究领域最为活跃的模式脊椎动物之一，有多个大型研究计划正在进行中。本文选择其中的一部分进行简要介绍。1斑马鱼基因组测序计划斑马鱼基因组测序计划始于2001年，最初由英国Sanger研究所主持，现在转由参考基因组协会（GenomeReferenceConsortium，GRC）主导，跟人类、小鼠两个基因组计划一起成为GRC的三个主要目标。测序数据来自基于克隆图谱测序法和全基因组鸟枪法的整合结果。随着测序进度的发展，主持单位会定期更新斑马鱼基因组的拼装，

关键词：斑马鱼基因组测序资源基因组计划脊椎动物全基因组定期更新研究所

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斑马鱼核心数据库简介

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遗传 2013年第4期35卷 545-546页

作者：肖安张博北京大学生命科学学院细胞增殖与分化教育部重点实验室北京100871

本文主要介绍斑马鱼（Daniorerio）研究工作中经常用到的生物信息学数据库，主要包括物种专用综合数据库ZFIN，以及通用基因组注释数据库Ensembl、Vega和UCSCGenomeBrowser。1斑马鱼模式物种综合数据库ZFIN斑马鱼模式物种数据库ZFIN（Ze... 详细信息

本文主要介绍斑马鱼（Daniorerio）研究工作中经常用到的生物信息学数据库，主要包括物种专用综合数据库ZFIN，以及通用基因组注释数据库Ensembl、Vega和UCSCGenomeBrowser。1斑马鱼模式物种综合数据库ZFIN斑马鱼模式物种数据库ZFIN（ZebrafishModelOrganismDatabase，原名ZebrafishInformationNetworks）是斑马鱼的核心数据库。ZFIN由美国UniversityofOregon维护，收集的信息主要可分为以下几个方面：

关键词：生物信息学数据库斑马鱼综合数据库基因组注释 Vega 物种

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《遗传》与中国斑马鱼遗传发育研究共同成长

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遗传 2012年第9期34卷 1079-1081页

作者：张博李绍武北京大学生命科学学院细胞增殖与分化教育部重点实验室北京100871 中国科学院遗传与发育生物学研究所北京100101

进入21世纪以来，一个小小的身影在遗传发育研究领域显得越来越活跃，这就是斑马鱼（Danio rerio）。同果蝇、小鼠等经典实验材料相比，斑马鱼作为模式动物的研究历史并不长，它正式进入遗传发育研究领域仅有30余年。不过。

关键词：《遗传》斑马鱼发育中国实验材料模式动物果蝇小鼠

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拟南芥中含有WD40 Repeats结构域的新基因SPG1的分子功能研究

拟南芥中含有WD40 Repeats结构域的新基因SPG1的分子功能研究

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从植物科学到农业发展——2012全国植物生物学大会

作者：郭梁张泉苏都莫日根北京大学生命科学学院细胞增殖分化教育部重点实验室

双受精是高等植物生殖发育的基础。花粉萌发和花粉管伸长是双受精前两个重要的过程。目前为止,对于花粉萌发和花粉管伸长背后的分子调控网络还知之甚少。前人只是报道了一些对于花粉萌发和花粉管伸长所必须的基因。本文将会全面的介绍... 详细信息

双受精是高等植物生殖发育的基础。花粉萌发和花粉管伸长是双受精前两个重要的过程。目前为止,对于花粉萌发和花粉管伸长背后的分子调控网络还知之甚少。前人只是报道了一些对于花粉萌发和花粉管伸长所必须的基因。本文将会全面的介绍一个可以抑制花粉萌发但却是花粉管伸长所必须的拟南芥新基因SPG1。氨基酸序列同源分析显示在植物界中广泛存在与SPG1相似度很高的一类蛋白。选择模式生物拟南芥为研究材料对SPG1基因功能做了全面的研究。RT-PCR、GUS和GFP的实验结果说明SPG1只在花粉中表达,而且随着小孢子发育过程逐渐积累(从两细胞开始表达);通过构建过表达植株和点突变SPG1过表达植株,发现SPG1在营养细胞核和细胞质都有信号,伴随着花粉成熟过程逐渐在营养细胞核积累,而且细胞核和细胞质的变化是由SPG1上的出核信号介导;SPG1敲除突变体spg1的开裂花药中的花粉非常容易在花药上萌发(营养和生殖生长以及种子发育与野生型均没有明显的区别);体外和体内的萌发实验表明SPG1可以显著抑制花粉的萌发;通过遗传实验和苯胺蓝特异标记花粉管实验,统计和观察花粉管在体内的伸长情况,实验发现spg1花粉管开始伸长较快,到达1/3角果后逐渐落后于野生型花粉管;spg1可以在只有蔗糖的固体培养基上萌发,而且适度的EGTA并不可以抑制spg1萌发。综上所述,SPG1既可以抑制花粉快速萌发避免提前在花药中萌发而且有助于花粉管更快的到达角果下面的胚珠完成受精。

关键词：花粉萌发伸长

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花粉中过表达Why2维持线粒体DNA拷贝数并且影响线粒体的形态和功能

花粉中过表达Why2维持线粒体DNA拷贝数并且影响线粒体的形态和功能

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从植物科学到农业发展——2012全国植物生物学大会

作者：蔡强张泉苏都莫日根北京大学生命科学学院教育部细胞增殖与分化重点实验室

自然界中,被子植物细胞中的线粒体DNA拷贝数通常维持在一个恒定的水平。然而它们的花粉在成熟过程中普遍存在一个线粒体DNA拷贝数的下调过程。到目前为止,有关这个生物学现象的分子机制还不是很清楚。经过对花粉发育过程中的转录本分析... 详细信息

自然界中,被子植物细胞中的线粒体DNA拷贝数通常维持在一个恒定的水平。然而它们的花粉在成熟过程中普遍存在一个线粒体DNA拷贝数的下调过程。到目前为止,有关这个生物学现象的分子机制还不是很清楚。经过对花粉发育过程中的转录本分析,我们发现在伴随着线粒体DNA拷贝数的下调,与线粒体DNA相关的蛋白的转录包括Why2都发生了下调。我们利用农杆菌侵染转化法在拟南芥花粉中特异过表达线粒体DNA结合蛋白Why2。通过对过表达植株的成熟花粉的DAP工压片染色观察,我们发现与野生型(Col-0)相比,过表达植株的花粉细胞质DAPI荧光信号得到很明显的保留。透射电镜观察表明过表达植株的花粉线粒体形态出现明显变化包括线粒体嵴更加丰富以及产生了一个高电子密度的核区。通过实时荧光定量PCR,我们进一步发现由于过表达植株花粉中线粒体DNA拷贝数的维持导致线粒体基因组编码的与呼吸链有关的基因转录发生了明显的上调。同时过表达花粉相比野生型(Col-0)更能耐受活性氧的损伤。这些研究结果表明,在拟南芥花粉发育过程中,Why2在线粒体DNA拷贝数的调控途径中起重要作用。

关键词：拟南芥花粉线粒体 DNA拷贝数

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拟南芥中线粒体单链结合蛋白的功能研究

拟南芥中线粒体单链结合蛋白的功能研究

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从植物科学到农业发展——2012全国植物生物学大会

作者：沈兆瑞张泉苏都莫日根北京大学生命科学学院细胞增殖分化教育部重点实验室

线粒体单链结合蛋白(mitochondrial Single-stranded binding protein)在果蝇线粒体DNA重组和修复过程中起着重要的作用,而在拟南芥中,MTSSB的功能尚未被报道。拟南芥中MTSSB是一个含有SSB结构域的核基因转录蛋白,定位于线粒体。过表达... 详细信息

线粒体单链结合蛋白(mitochondrial Single-stranded binding protein)在果蝇线粒体DNA重组和修复过程中起着重要的作用,而在拟南芥中,MTSSB的功能尚未被报道。拟南芥中MTSSB是一个含有SSB结构域的核基因转录蛋白,定位于线粒体。过表达的株系35S::MTSSB与野生型相比,表现出矮小的表型,叶片面积、果荚长度以及种子数都远小于对照组Col-0。并且对植株生长周期的统计表明,35S::MTSSB的开花期延迟,生长周期延长。进一步分析得出,35S::MTSSB的mtDNA拷贝数为350±9.0,比Col-0的61±5.0高出5.83倍左右,并且过表达株系的线粒体基因的转录水平有明显的上调。对线粒体功能的分析发现,35S::MTSSB的线粒体呼吸效率下降约50%。一系列的结果表明线粒体单链结合蛋白对植物线粒体的拷贝数以及呼吸功能方面的维持起着重要的作用。

关键词：线粒体呼吸效率拟南芥

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拟南芥中线粒体单链结合蛋白的功能研究

拟南芥中线粒体单链结合蛋白的功能研究

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2012全国植物生物学大会

作者：沈兆瑞张泉苏都莫日根北京大学生命科学学院细胞增殖分化教育部重点实验室北京100871

线粒体单链结合蛋白(mitochondrial Single-stranded binding protein)在果蝇线粒体DNA重组和修复过程中起着重要的作用,而在拟南芥中,MTSSB的功能尚未被报道。

关键词：线粒体呼吸效率拟南芥

来源：评论

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拟南芥中含有WD40 Repeats结构域的新基因SPG1的分子功能研究

拟南芥中含有WD40 Repeats结构域的新基因SPG1的分子功能研究

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2012全国植物生物学大会

作者：郭梁张泉苏都莫日根北京大学生命科学学院细胞增殖分化教育部重点实验室北京100871

双受精是高等植物生殖发育的基础。花粉萌发和花粉管伸长是双受精前两个重要的过程。目前为止，对于花粉萌发和花粉管伸长背后的分子调控网络还知之甚少。前人只是报道了一些对于花粉萌发和花粉管伸长所必须的基因。

关键词：花粉萌发伸长

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人工锌指核酸酶介导的基因组定点修饰技术

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遗传 2011年第7期33卷 665-683页

作者：肖安胡莹莹王唯晔杨志芃王展翔黄鹏佟向军张博林硕北京大学生命科学学院细胞增殖与分化教育部重点实验室北京100871

锌指核酸酶(ZFN)由锌指蛋白(ZFP)结构域和Fok I核酸内切酶的切割结构域人工融合而成,是近年来发展起来的一种可用于基因组定点改造的分子工具。ZFN可识别并结合特定的DNA序列,并通过切割这一序列的特定位点造成DNA的双链断裂(DSB)。在... 详细信息

锌指核酸酶(ZFN)由锌指蛋白(ZFP)结构域和Fok I核酸内切酶的切割结构域人工融合而成,是近年来发展起来的一种可用于基因组定点改造的分子工具。ZFN可识别并结合特定的DNA序列,并通过切割这一序列的特定位点造成DNA的双链断裂(DSB)。在此基础上,人们可以对基因组的特定位点进行各种遗传操作,包括基因打靶、基因定点插入、基因修复等,从而能够方便快捷地对基因组实现靶向遗传修饰。这种新的基因组定点修饰方法的突出优势是适用性好,对物种没有选择性,并且可以在细胞和个体水平进行遗传操作。文章综述了ZFN技术的研究进展及应用前景,重点介绍ZFN的结构与作用机制、现有的靶点评估及锌指蛋白库的构建与筛选方法、基因组定点修饰的策略,以及目前利用这一技术已成功实现突变的物种及内源基因,为开展这一领域的研究工作提供参考。

关键词：锌指核酸酶锌指蛋白基因组定点修饰基因打靶分子工具

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斑马鱼突变体和转基因鱼系命名规则简介

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遗传 2012年第9期34卷 1219-1220页

作者：肖安杨志芃张博北京大学生命科学学院细胞增殖与分化教育部重点实验室北京100871

本文简要介绍斑马鱼（Danio rerio）突变体和转基因鱼系的命名规则，内容主要译自《ZFIN斑马鱼命名指南》的相应部分（https：／／***／display／general／ZFIN＋Zebmfish＋Nomenclature＋Guidelines），并对其进行了较大幅度的整理，... 详细信息

本文简要介绍斑马鱼（Danio rerio）突变体和转基因鱼系的命名规则，内容主要译自《ZFIN斑马鱼命名指南》的相应部分（https：／／***／display／general／ZFIN＋Zebmfish＋Nomenclature＋Guidelines），并对其进行了较大幅度的整理，添加了更多的细节与解释。

关键词：命名规则转基因鱼斑马鱼突变体 display

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