检索结果-内蒙古大学图书馆

中国生物化学与分子生物学报 2024年第9期40卷 1308-1316页

作者：刘丹张洁郭正阳薛丽香王羽晴北京大学第三医院医学创新研究院基础医学研究中心北京100191 北京大学第三医院生物样本库北京100191

细胞周期检测对于了解细胞增殖状态、细胞功能研究、药物筛选与评估等领域具有重要意义。流式细胞仪分析细胞周期是目前较为经典且广泛应用的检测手段之一。碘化丙啶(propidium iodide,PI)单染是最常用的基于流式的检测细胞周期方法,然... 详细信息

细胞周期检测对于了解细胞增殖状态、细胞功能研究、药物筛选与评估等领域具有重要意义。流式细胞仪分析细胞周期是目前较为经典且广泛应用的检测手段之一。碘化丙啶(propidium iodide,PI)单染是最常用的基于流式的检测细胞周期方法,然而,该方法在使用过程有诸多处理因素会对检测结果造成影响。此外,不同免疫细胞亚群在不同细胞周期阶段的分布差异也有助于研究免疫反应,了解疾病状态。本文以B16-F10细胞系为例,采用PI单染法,从固定条件、上机条件和软件分析3个角度,评价多种处理因素对细胞周期检测结果的影响。根据结果分析,在进行细胞周期检测时,建议取3×10^(6)个细胞,用300μL预冷PBS重悬细胞后逐滴滴入700μL预冷的无水乙醇,放置于4℃或-20℃过夜固定,低速收样,收样速率为每秒400~600颗粒数,去黏连后需收集至少3000个细胞。另外,通过EdU、PI双指标染色可以精确划分细胞周期,而细胞表面标志物染色联合Ki-67和PI染色法,可在不进行细胞分选的情况下进行不同免疫细胞亚群周期分析。本文较为系统的探讨了PI单染法检测细胞周期的影响因素,提供了标准的实验操作流程。建立了EdU联合PI检测细胞周期和针对不同免疫细胞亚群周期分析方案,拓宽了细胞周期检测方式。

关键词：流式细胞术细胞周期碘化丙啶免疫细胞亚群

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不同氧气浓度对毛囊神经嵴干细胞增殖和分化影响的实验研究

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中华神经外科杂志 2021年第6期37卷 591-597页

作者：刘维海王艳张一博陈素华陈新薛丽香杨军北京大学第三医院神经外科 100191 北京大学第三医院医学创新研究院基础医学研究中心 100191 北京大学第三医院中心实验室 100191 北京大学医学部精准神经外科与肿瘤研究中心 100191 北京大学第三医院生物样本库 100191

目的探讨不同氧气浓度对毛囊神经嵴干细胞(hfNCSC)的增殖和分化的影响,明确适宜hINCSC增殖、维持其未分化状态的氧气条件。方法显微解剖分离SD大鼠触须部的毛囊Bugle区组织,在1%(低氧组).3%(中度低氧组)、20%(常氧组)3种氧气浓度下进行h... 详细信息

目的探讨不同氧气浓度对毛囊神经嵴干细胞(hfNCSC)的增殖和分化的影响,明确适宜hINCSC增殖、维持其未分化状态的氧气条件。方法显微解剖分离SD大鼠触须部的毛囊Bugle区组织,在1%(低氧组).3%(中度低氧组)、20%(常氧组)3种氧气浓度下进行hfNCSC的原代培养,培养第10.13天时采用CCK-8法分别检测3组细胞的增殖活性;培养第13天时采用免疫荧光染色方法检测神经干细胞标志物Nestin,神经嵴来源干细胞标志物Sox10及神经元标志物β-Ⅲ Tubulin的表达;采用实时定量PCR法检测培养第13天时HIF-2α,0c14、Nanog、Lin28、Sox2、KLF4、Nestin、Sox10、Slug以及PAX3在hfNCSC中的表达水平;采用蛋白质免疫印迹法检测培养第13天时***2的表达情况。结果(1)CCK-8结果显示,培养第10天时,中度低氧组细胞的增殖活性最高(相对吸光度值为1.868±0.147),其与低氧组(1.580±0.107)和常氧组(1.451±0.037)相比,差异均有统计学意义(均P<0.01);培养第13天时,仍以中度低氧组细胞的增殖活性最高(相对吸光度值为5.322±1.111),其与低氧组(4.117±0.672)相比差异无统计学意义(P=0.088),而与常氧组(1.535±0.119)相比差异有统计学意义(P<0.001)。(2)免疫荧光染色检测结果显示,不同氧气浓度下,Nestin,Sox10,β-Ⅲ Tubulin均有表达,Nestin、β-Ⅲ Tubulin均定位于细胞质,Sox10定位于细胞核和细胞质。(3)实时定量PCR结果显示.0c14,Nanog、Lin28、HIF-2α,Sox10,Slug、PAX3在中度低氧组的表达水平最高,且与另外两组的差异均有统计学意义(均P<0.05);Nestin、Sox2、KLF4在低氧组表达水.平最高,且与另外两组的差异均有统计学意义(均P<0.01)。(4)蛋白质免疫印迹结果显示,0ct4、Sox2在中度低氧组的表达高于另外两组。结论低氧有利于提高hfNCSC的增殖能力并维持其未分化状态,其中3%的氧气浓度更适合hfNCSC的增殖以及未分化状态的维持。

关键词：细胞低氧细胞增殖细胞分化基因表达毛囊神经嵴干细胞

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基于样本科学的生物样本库建设

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科学通报 2021年第15期66卷 1812-1820页

作者：尹忠楠董熹璇薛丽香董尔丹北京大学第三医院医学创新研究院基础医学研究中心北京100191 北京大学第三医院生物样本库北京100191 北京大学第三医院中心实验室北京100191 北京大学第三医院血管医学研究所国家卫生健康委员会心血管分子生物学与调节肽重点实验室分子心血管学教育部重点实验室北京100191

生物样本库在现代临床与基础医学研究中的作用日趋重要,基于临床生物样本资源的研究日益增多,这极大推动了转化医学研究前进的步伐.当前国内外样本库建设更关注生物样本的标准化、规范化、信息化管理,但临床生物样本的精度、活性及多维... 详细信息

生物样本库在现代临床与基础医学研究中的作用日趋重要,基于临床生物样本资源的研究日益增多,这极大推动了转化医学研究前进的步伐.当前国内外样本库建设更关注生物样本的标准化、规范化、信息化管理,但临床生物样本的精度、活性及多维度利用对于临床诊疗及后续科学研究具有重要意义.换言之,未来生物样本库的"内涵"建设更需要聚焦于样本本身的科学研究,即样本科学.因此,在精准医学时代背景下基于精准样本科学的生物样本库建设变得更加迫切.目前,基于样本本身的科学研究正处于探索阶段,本文从精准样本科学角度入手,以动静脉中样本组分以及肿瘤不同部位之间的差异为例,归纳了目前针对不同样本来源部位的样本科学研究进展;同时针对生物样本活性,阐述了样本采集及后续处理环节对于保持其样本活性及发挥后续治疗与科研作用的重要性.本文旨在倡导基于临床样本的精准度与活性的样本科学研究,提出"一样多用"以及"多样一用"的多维度利用模式,倡导一种基于精准样本科学带动下的新型生物样本库建设模式.

关键词：生物样本库生物样本精准样本科学多维度分析

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血管痉挛性心绞痛诊断与治疗共识和最新进展

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内科急危重症杂志 2025年第1期31卷 1-20页

作者：汪道文袁祖贻何祚雯方唯一高炜杨跃进于波黄东蒋建刚蒋学俊张静张奇惠汝太国际欧亚科学院湖北省暴发性心肌炎质量控制中心中国老年医学学会心血管病分会中国医药生物技术协会组织生物样本库分会西安交通大学第一附属医院心血管病院西安交通大学第一附属医院心内科中华医学会心血管病分会中国医师协会心血管病分会中国老年医学会心血管病分会华中科技大学同济医学院附属同济医院上海市胸科医院北京大学医学部第三医院中国医学科学院和中国协和医科大学阜外医院哈尔滨医科大学附属第二医院复旦大学附属中山医院武汉大学人民医院阜外华中心血管病医院同济大学东方医院

血管痉挛性心绞痛(VSA)是由心肌表层冠状动脉局部或弥漫性痉挛所致的心绞痛,是一类严重威胁人类健康的临床疾病。虽然国内外已有多部指南或共识发表,但在诊断和治疗方面多沿用传统方法,既不能改善VSA患者易误诊和漏诊的现状,也无法减少... 详细信息

血管痉挛性心绞痛(VSA)是由心肌表层冠状动脉局部或弥漫性痉挛所致的心绞痛,是一类严重威胁人类健康的临床疾病。虽然国内外已有多部指南或共识发表,但在诊断和治疗方面多沿用传统方法,既不能改善VSA患者易误诊和漏诊的现状,也无法减少其心血管事件风险,尤其是对VSA的本质认识不足。本文结合最新研究结果,提出心肌炎症是VSA的重要原因和治疗靶点这一新理念,重点介绍了针对心肌炎症的检查与干预药物在VSA诊治中的最新进展,以期提高VSA的救治水平。

关键词：血管痉挛性心绞痛冠状动脉痉挛炎症心肌炎症抗炎治疗

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大数据时代的疾病样本库

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中华胃肠外科杂志 2015年第1期18卷 6-8页

作者：张连海季加孚北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所生物样本库恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室 100142

大数据时代，研究者更关注样本的生物信息数据与疾病临床信息的相关性，通过大样本的关联分析，来预测疾病的发生、发展与转归。疾病样本库便是关联疾病临床信息与样本生物学信息的桥梁与核心，相关信息的数量多少和多样性，尤其是样本... 详细信息

大数据时代，研究者更关注样本的生物信息数据与疾病临床信息的相关性，通过大样本的关联分析，来预测疾病的发生、发展与转归。疾病样本库便是关联疾病临床信息与样本生物学信息的桥梁与核心，相关信息的数量多少和多样性，尤其是样本及其信息的质量和标准化程度，将决定并影响大数据预测的结果。因此，建立疾病样本库的质量管理制度、确立相关质量检测的方法以及实现样本库质量的持续改进是疾病研究的迫切需求。

关键词：生物样本库疾病质量管理

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人表皮生长因子受体2阳性乳腺癌的两种转基因动物模型研究进展

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中华实验外科杂志 2022年第7期39卷 1409-1412页

作者：林素雯韩馨乐钟福波林哲广江淑琪韦伟方征宇北京大学香港科技大学医学中心生物医学研究所 518036 北京大学深圳医院智能化生物样本库 518036 北京大学深圳医院甲乳外科 518036

乳腺癌约占女性癌症的30%,40年至今乳腺癌的发病率总体呈上升趋势,其中人表皮生长因子受体2(Her-2)的高表达约在20%的乳腺癌患者中存在,且与不良预后密切相关。动物模型被广泛应用于肿瘤研究,在众多用于Her-2+乳腺癌研究的动物模型中,... 详细信息

乳腺癌约占女性癌症的30%,40年至今乳腺癌的发病率总体呈上升趋势,其中人表皮生长因子受体2(Her-2)的高表达约在20%的乳腺癌患者中存在,且与不良预后密切相关。动物模型被广泛应用于肿瘤研究,在众多用于Her-2+乳腺癌研究的动物模型中,转基因小鼠应用非常广泛,可用于研究肿瘤的发生发展、转移、复发等相关机制以及肿瘤相关信号通路的作用,有助于Her-2+乳腺癌的治疗靶点筛选以及新药研发。目前,转基因小鼠主要通过组织特异性启动子来构建,本文列举了由两类启动子驱动且适用于Her-2+乳腺癌研究的转基因小鼠模型,对其原理、应用以及优缺点进行了深入的分析。

关键词：人表皮生长因子受体2阳性乳腺癌研究进展

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不同保存条件对组织样本总RNA提取的影响

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中国医药生物技术 2024年第2期19卷 187-192页

作者：董熹璇尹忠楠薛丽香陈伊凡北京大学第三医院生物样本库/医学创新研究院基础医学研究中心 100191

RNA是重要的生物医学研究对象,分离获得质量合格的RNA是研究RNA生物学功能的重要前提[1]。目前常用的RNA检测方法,如实时定量PCR、Northern blot、转录组测序等,都对RNA的质量有很高的要求。真核生物体内的RNA多以单链形式存在,稳定性较... 详细信息

RNA是重要的生物医学研究对象,分离获得质量合格的RNA是研究RNA生物学功能的重要前提[1]。目前常用的RNA检测方法,如实时定量PCR、Northern blot、转录组测序等,都对RNA的质量有很高的要求。真核生物体内的RNA多以单链形式存在,稳定性较差,容易在样本采集、预处理和存储过程中发生降解[2]。

关键词：实时定量PCR 样本采集存储过程总RNA提取生物医学研究组织样本转录组测序保存条件

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组织样本RNA完整性影响因素的研究进展

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实用器官移植电子杂志 2023年第5期11卷 484-488页

作者：陈雷陈奕霖张鑫梁玮孙博许蜜蝶同济大学附属同济医院临床研究中心生物样本库中国医药生物技术协会组织生物样本库分会青年工作组上海200065 北京大学第一医院生物样本库中国医药生物技术协会组织生物样本库分会青年工作组北京100034 同济大学附属同济医院临床研究中心生物样本库上海200065 上海交通大学医学院附属新华医院生物样本库中国医药生物技术协会组织生物样本库分会青年工作组上海200092 北京大学第一医院生物样本库北京100034 复旦大学附属肿瘤医院病理科组织库中国医药生物技术协会组织生物样本库分会青年工作组上海200032

生物样本库是医学研究的基石,其保藏样本的质量会对下游研究结果产生重要影响^([1-2])。随着样本科学、分子生物学和组学研究的发展,基因表达分析的可靠性受RNA质量影响已成为共识。RNA完整性作为判断组织样本质量的关键指标,是评价组... 详细信息

生物样本库是医学研究的基石,其保藏样本的质量会对下游研究结果产生重要影响^([1-2])。随着样本科学、分子生物学和组学研究的发展,基因表达分析的可靠性受RNA质量影响已成为共识。RNA完整性作为判断组织样本质量的关键指标,是评价组织样本质量的重要依据^([3]),也是下游生物信息分析,特别是基因组学研究的基础和保障。因此了解影响组织样本RNA完整性的因素至关重要。

关键词：生物样本库 RNA完整性生物信息分析基因表达分析组织样本分子生物学基因组学研究样本质量

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中华急诊医学杂志 2024年第8期33卷 1117-1127页

作者：迟骋李雯莉陆玉成华实北京大学人民医院急诊科北京100044 新疆医科大学第一附属医院急救·创伤中心急诊内科乌鲁木齐830011 临沂市人民医院生物样本库临沂276000 临沂市人民医院脑肿瘤与功能神经外科临沂276000

目的探讨免疫细胞分化对脓毒性ARDS肺泡-毛细血管屏障损伤的影响。方法基于转录组数据构建脓毒性ARDS的WGCNA网络,并筛选ARDS相关基因(ARDS-related genes,ARGs)。基于单细胞测序数据构建脓毒性ARDS分化轨迹和细胞通讯,并筛选免疫分化... 详细信息

目的探讨免疫细胞分化对脓毒性ARDS肺泡-毛细血管屏障损伤的影响。方法基于转录组数据构建脓毒性ARDS的WGCNA网络,并筛选ARDS相关基因(ARDS-related genes,ARGs)。基于单细胞测序数据构建脓毒性ARDS分化轨迹和细胞通讯,并筛选免疫分化相关基因(immunodifferentiation-related genes,IDRGs)。Lasso回归分析构建ARDS的免疫相关风险评分(risk Score,RS)。ESTIMATE、CIBERSORT和ssGSEA评估免疫微环境。Metascape、GSVA和GO富集分析展示信号通路和生物学过程。结果免疫细胞、成纤维细胞和内皮细胞通过24条信号通路进行细胞通讯。由DSTN、SNRPA和FGL2组成的RS在正常、单纯脓毒症和脓毒性ARDS的患者中差异表达,涉及免疫细胞、内皮细胞和成纤维细胞的分化,影响脓毒性ARDS的免疫浸润和免疫功能。脓毒性ARDS相关免疫细胞包含记忆B细胞、浆细胞、CD8+T和M0。DSTN与M0负相关(r=-0.29,P<0.05),SNRPA与CD8+T正相关(r=0.28,P<0.05),FGL2与记忆B细胞正相关(r=0.32,P<0.05)。RS组间差异表达的免疫细胞包括CD4幼稚型T细胞、CD4记忆激活T细胞、调节T细胞、γ-δT细胞、M0、激活的树突状细胞。富集分析提示DSTN、SNRPA和FGL2的差异表达影响了免疫细胞的分化、免疫功能的激活、抗原的呈递,以及肌动蛋白丝的解聚/切断。结论DSTN、SNRPA和FGL2通过调控免疫细胞、成纤维细胞和内皮细胞的分化,影响脓毒性ARDS的免疫性肺泡-毛细血管屏障损伤,是预测脓毒性ARDS进展的潜在标志物。

关键词：脓毒性ARDS 细胞分化细胞通讯 DSTN SNRPA FGL2

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临床生物样本库管理系统建设与应用

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中国医药生物技术 2023年第5期18卷 471-475页

作者：尹忠楠杨小雪张春竹薛丽香北京大学第三医院医学创新研究院基础医学研究中心生物样本库 100191 北京大学第三医院信息管理与大数据中心 100191

临床生物样本作为国家战略性资源一直受到广泛重视[1]。样本库信息管理系统对于实体生物样本和样本关联临床信息的管理至关重要。临床样本合法规范的管理可以有效地促进基于样本的下游科学研究[2]。但目前各地生物样本库的信息管理系统... 详细信息

临床生物样本作为国家战略性资源一直受到广泛重视[1]。样本库信息管理系统对于实体生物样本和样本关联临床信息的管理至关重要。临床样本合法规范的管理可以有效地促进基于样本的下游科学研究[2]。但目前各地生物样本库的信息管理系统缺乏统一的模式,功能模块也各不相同,因此不利于后续的开放共享。北京大学第三医院生物样本库以样本科学为导向建设信息管理系统,系统中不仅记录生物样本库中存储的生物材料包括离体器官、组织、细胞、血液、分泌物、排泄物及其衍生的生物大分子等样本信息,同时兼顾生物样本关联患者的诊疗信息、护理、病理、随访、伦理审批、知情同意等数据及图像信息[3-4](图1)。该系统在样本库运行过程中,根据需要不断完善与添加模块,集成医院数据中心(hospital data repository,HDR)实现临床治疗信息的规范化收集,对生物样本库管理系统实现了生物样本的质量控制,有效准确地追踪样本实体从产生到应用的全过程,实现全闭环管理,形成完整的样本全生命周期管理的标准化流程,提升了生物样本的科研价值。此文旨在介绍北医三院生物样本库管理系统建设情况及应用案例,以期为其他样本库的建设提供参考借鉴。

关键词：信息管理系统医院数据中心生物样本样本库北医三院全生命周期管理离体器官标准化流程

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