检索结果-内蒙古大学图书馆

中华胃肠外科杂志 2015年第1期18卷 6-8页

作者：张连海季加孚北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所生物样本库恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室 100142

大数据时代，研究者更关注样本的生物信息数据与疾病临床信息的相关性，通过大样本的关联分析，来预测疾病的发生、发展与转归。疾病样本库便是关联疾病临床信息与样本生物学信息的桥梁与核心，相关信息的数量多少和多样性，尤其是样本... 详细信息

大数据时代，研究者更关注样本的生物信息数据与疾病临床信息的相关性，通过大样本的关联分析，来预测疾病的发生、发展与转归。疾病样本库便是关联疾病临床信息与样本生物学信息的桥梁与核心，相关信息的数量多少和多样性，尤其是样本及其信息的质量和标准化程度，将决定并影响大数据预测的结果。因此，建立疾病样本库的质量管理制度、确立相关质量检测的方法以及实现样本库质量的持续改进是疾病研究的迫切需求。

关键词：生物样本库疾病质量管理

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生物样本库冷冻组织样本质量评估

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山东医药 2019年第27期59卷 5-8页

作者：倪雅楠胡颖王易雪宋丽洁陈萌张连海北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所生物样本库恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室

目的对比反复冻融对冷冻生物样本质量的影响,探讨冷冻生物样本质量评估方法.方法-80℃冻存的胃、胰腺、肝、结肠肿瘤组织样本各1份,将同一组织样本在低温条件下平均切分为2份,A组组织样本未经冻融,B组为组织样本反复冻融,使用紫外分光... 详细信息

目的对比反复冻融对冷冻生物样本质量的影响,探讨冷冻生物样本质量评估方法.方法-80℃冻存的胃、胰腺、肝、结肠肿瘤组织样本各1份,将同一组织样本在低温条件下平均切分为2份,A组组织样本未经冻融,B组为组织样本反复冻融,使用紫外分光光度计、生物芯片分析系统Agilent 2200测定DNA、RNA质量及完整性,采用HE染色法确定组织样本肿瘤含量.结果A组胃、胰腺、肝、结肠肿瘤组织RNA纯度(OD值)均在标准范围内,RIN≥7,5S、18S、28S条带清晰可见.B组除肝脏肿瘤组织外OD值均小于1.4,RIN≤5.6,28S、18S条带出现不同程度降解.A、B两组肿瘤组织RNA浓度、纯度比较,P均<0.01.A、B两组样本DNA纯度(OD值)均在标准范围内,电泳条带无明显差别,A、B两组肿瘤组织DNA纯度、浓度数值间比较,P均>0.05.两组样本肿瘤组织含量均达到总组织的80%以上,为合格的肿瘤生物样本.结论与未经冻融的样本相比,反复冻融后肿瘤组织RNA的纯度和浓度均降低,RNA发生不同程度降解.RNA质量可很好的反应组织样本的质量,冰冻切片HE染色法则可判定取材部位的准确性,两者相结合能很好的反映出组织样本的质量.

关键词：肿瘤组织标本冻融肿瘤组织标本反复冻融肿瘤组织标本生物样本库冷冻组织样本质量控制

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生物样本质量的影响因素与评估

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中国医药生物技术 2013年第1期8卷 69-72页

作者：胡颖张连海宋丽洁王易雪季加孚北京大学肿瘤医院北京市肿瘤防治研究所生物样本库恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室 100142

样本质量是整个样本库的核心，样本应该在尽可能严格的条件下进行采集、处理、保存、运输以及后期加工。样本库的工作就是尽可能地将对样本质量的影响降低到最小，除了严格质量管理的制度外，新技术的不断研发、理论研究的不断丰富将有... 详细信息

样本质量是整个样本库的核心，样本应该在尽可能严格的条件下进行采集、处理、保存、运输以及后期加工。样本库的工作就是尽可能地将对样本质量的影响降低到最小，除了严格质量管理的制度外，新技术的不断研发、理论研究的不断丰富将有助于评估影响样本质量的因素，从而制定或改进有关样本的标准流程以尽量减少样本质量的变化，保持样本的原有性质。

关键词：生物样本质量管理影响因素评估后期加工

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单中心大样本Epstein-Barr病毒相关性胃癌亚型的临床病理及分子特征分析

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北京大学学报（医学版） 2019年第3期51卷 451-458页

作者：杨阳刘毅强王晓红季科李忠武白健杨爱蓉胡颖韩海勃李子禹步召德吴晓江张连海季加孚北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室胃肠肿瘤中心北京100142 中华医学会外科学分会中国医师协会外科医师分会肿瘤外科医师委员会约翰·霍普金斯大学医学院美国外科学院英国皇家外科学院亚洲外科学会中国人民政治协商会议第十三届全国委员会中国民主同盟中国民主同盟中央卫生与健康委员会北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室病理科北京100142 北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室生物样本库北京100142 和瑞基因科技有限公司北京102206 国际胃癌学会中国抗癌协会中国抗癌协会医院管理分会中国医疗保健国际交流促进会中华医学会

目的: Epstein-Barr病毒相关性胃癌(Epstein-Barr virus associated gastric cancer, EBVaGC)与常见胃癌(非Epstein-Barr病毒相关性胃癌,Epstein-Barr virus non-associated gastric cancer, EBVnGC)不同,具有独特的临床病理特征,本研究采用单中心大样本探讨中国EBVaGC的临床病理及分子特征。方法:回顾分析2003—2018年北京大学肿瘤医院EBVaGC与EBVnGC两组患者的临床病理特征和预后。分析公共数据库胃癌数据集,筛选显著差异表达基因,并在本组病例中验证重要基因的表达及其与预后的相关性。结果: 3 241例胃癌患者纳入研究,EBVaGC为163例,占总数的5.0%。与EBVnGC相比,EBVaGC男性常见,平均年龄低,多见于残胃癌,常为低分化腺癌、Lauren混合型,较少出现淋巴结转移,EBVaGC患者的5年生存率为63.2%,优于EBVnGC的59.6%( P <0.05)。为挖掘EBVaGC的分子特征,对癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)胃癌数据集( n =240)进行分析,筛选到7 404个显著差异表达基因,涉及细胞增殖、凋亡、侵袭转移等功能,其中侵袭转移相关基因 SALL4 下调、免疫检查点相关基因 PD-L1 上调是EBVaGC重要的分子特征。大样本验证显示,SALL4在EBVaGC中多为阴性(1/92,1.1%,低于EBVnGC的303/1 727,17.5%),PD-L1在EBVaGC中多为阳性(81/110,73.6%,高于EBVnGC的649/2 350,27.6%),SALL4阴性和PD-L1阳性患者的预后较好。结论: EBVaGC作为独特的胃癌亚型,较少出现转移且预后良好,该亚型具有特征性分子背景,其中侵袭转移相关基因 SALL4 的下调以及免疫检查点相关基因 PD-L1 的上调是重要的分子特征。

关键词： Epstein-Barr病毒感染胃肿瘤临床病理特征预后

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长链非编码RNA HOTAIR在食管鳞癌患者血清中的表达及临床意义

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兰州大学学报（医学版） 2020年第5期46卷 49-54页

作者：王宇薛誉王嫣董欣李苏宜中国科学技术大学附属第一医院安徽省立医院(西区)安徽省肿瘤医院肿瘤内科三病区安徽合肥230022 大连医科大学肿瘤干细胞研究院辽宁大连116044 北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室分子肿瘤学研究室北京100142 北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所生物样本库北京100142 中国医学科学院肿瘤医院检验科北京100021

目的研究长链非编码RNA HOTAIR在食管鳞癌患者与正常人群血清中的表达差异,分析血清HOTAIR的表达在食管鳞癌中的临床意义。方法选取北京大学肿瘤医院临床样本库存放的84例原发性食管鳞癌患者血清标本及32例中国医学科学院肿瘤医院门诊... 详细信息

目的研究长链非编码RNA HOTAIR在食管鳞癌患者与正常人群血清中的表达差异,分析血清HOTAIR的表达在食管鳞癌中的临床意义。方法选取北京大学肿瘤医院临床样本库存放的84例原发性食管鳞癌患者血清标本及32例中国医学科学院肿瘤医院门诊年龄、性别匹配的正常人群血清。用酚氯仿法提取血清总RNA,用去除基因组DNA的逆转录试剂盒进行逆转录反应,反应体系中加入人工合成的仓鼠Gadd7 RNA作为外源性参考基因。用TB Green实时荧光定量PCR对目的基因扩增检测,并计算HOTAIR在食管鳞癌患者中的相对表达量。应用SPSS 17.0软件分析HOTAIR的相对表达量与食管鳞癌患者临床病理特征的关系。结果食管鳞癌患者血清HOTAIR的相对表达量约为正常人群的22.53倍,差异有统计学意义(P<0.001)。食管鳞癌血清HOTAIR的相对表达量与患者性别、年龄、淋巴结转移情况无关(P>0.05),但与肿瘤T分期呈正相关关系(P<0.001),与病理级别及分化程度呈负相关关系(P=0.009)。结论HOTAIR在食管鳞癌患者血清中的表达量明显高于正常人群,且与肿瘤T分期及分化程度明显相关,检测血清中HOTAIR的表达情况可能成为诊断食管鳞癌的新手段。

关键词：食管鳞癌长链非编码RNA HOTAIR

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