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病毒疫苗制备用不同核型VERO细胞系在裸鼠体内致癌/致瘤性的系统实验研究(英文)

Acta Genetica Sinica 2004年第7期31卷 647-660页

作者：张德礼季梁李六金黄高升北京大学医学部公共卫生学院清华大学生物信息学研究所生物信息学教育部重点实验室清华大学信息科学技术学院清华信息科学与技术国家实验室清华大学自动化系智能技术与系统国家重点实验室北京100084 第四军医大学基础部病理学教研室中国癌症研究基金会肿瘤学研究所第四军医大学动物保健品研制中心实验动物研究中心

生产疫苗用细胞系可能具有致瘤性 ,一些常用的细胞系需要检查不同代次有无致癌性。在建立传代细胞种子库与工作库基础上 ,对研制生产病毒活疫苗所用 8株VERO细胞系在 2 19只裸鼠进行了致癌 (瘤 )实验。本研究结果表明 ,VERO细胞染色体... 详细信息

生产疫苗用细胞系可能具有致瘤性 ,一些常用的细胞系需要检查不同代次有无致癌性。在建立传代细胞种子库与工作库基础上 ,对研制生产病毒活疫苗所用 8株VERO细胞系在 2 19只裸鼠进行了致癌 (瘤 )实验。本研究结果表明 ,VERO细胞染色体核型可发生变异 ,亚四倍体JA株与超二倍体KA株具有强的致癌性 ,不能用于致弱活病毒疫苗制备 ,但可替代HeLa细胞系用作恶性肿瘤阳性对照细胞。筛出无致瘤性的YB、JC、M和JB株亚二倍体VERO细胞系 ,可替代BHK 2 1细胞用于狂犬病减毒活疫苗制备。VERO细胞系染色体遗传相对稳定 ,不同代次变化不大。研究发现细胞染色体遗传特征决定致瘤性质并具有种属特异性 ,不同核型细胞致瘤性不同 ,细胞染色体数目变异大小和致癌性成正相关 ,通过体内外交替选育可在裸鼠体内快速选育成功高变异率肿瘤细胞系。高变异率HeLa或VERO细胞系移植于裸鼠可能产生恶性横纹肌样瘤。因此 ,应当强调疫苗生产用细胞系致瘤性评价的重要性。

关键词：非洲绿猴肾细胞系 VERO 裸鼠致癌毒理致瘤性

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人类肿瘤组织中非编码RNA-NC28和NC119的鉴定及表达

引用

中国医学科学院学报 2007年第5期29卷 618-621页

作者：孙贞媛袁艳华刘长宁赵屹黄洁夫桑新亭毛一雷卢欣王歈常永生赵海涛中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院肝脏外科北京100730 北京大学临床肿瘤学院生物诊疗中心北京100036 中国科学院计算技术研究所生物信息学研究组北京100080 中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的寻找并验证与肿瘤相关的非编码RNA。方法采用RT-PCR和Northern blot分析非编码RNA在肿瘤组织及细胞系中的表达情况。结果RT-PCR在实体肿瘤和细胞系中鉴定了2个非编码RNA-NC28和NC119的表达,Northernblot检测发现NC28转录子长度大约... 详细信息

目的寻找并验证与肿瘤相关的非编码RNA。方法采用RT-PCR和Northern blot分析非编码RNA在肿瘤组织及细胞系中的表达情况。结果RT-PCR在实体肿瘤和细胞系中鉴定了2个非编码RNA-NC28和NC119的表达,Northernblot检测发现NC28转录子长度大约为1800个核苷酸,NC119转录子长度大约为1200个核苷酸。结论这两种非编码RNA具有一定的肿瘤共享性,非编码RNA在肿瘤发生发展中可能发挥一定作用。

关键词：肿瘤非编码RNA 肿瘤特异性差异表达表达序列标签

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从病毒细胞遗传进化的生物循环选育到新基因识别与验证

从病毒细胞遗传进化的生物循环选育到新基因识别与验证

引用

2003年中国科协“生物信息学与进化计算”青年科学家论坛

作者：张德礼李衍达黄高升方福德季梁朱关福北京大学医学部公共卫生学院营养与食品卫生学系，北京大学人类疾病基因研究中心，北京，100083 清华大学信息科学与技术国家实验室生物信息学研究部，清华大学生物信息学研究所生物信息学教育部重点实验室，清清华大学信息科学与技术国家实验室生物信息学研究部，清华大学生物信息学研究所生物信息学教育部重点实验室，清华大学信息科学技术学院自动化系智能技术与系统国家重点实验室，北京，100084 第四军医大学基础部病理学教研室，西京医院病理科，中国癌症研究基金会肿瘤研究所，西安，710032 中国医学科学院基础医学研究所，中国协和医科大学基础医学院医学分子生物学国家重点实验室，北京，710032

初步建立了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物循环选育作用的理论与技术体系并得到实际应用。发现细小病毒超高增殖的交替选育规律又在不同实验体系基因与染色体水平分别得到验证，从而发现了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物... 详细信息

初步建立了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物循环选育作用的理论与技术体系并得到实际应用。发现细小病毒超高增殖的交替选育规律又在不同实验体系基因与染色体水平分别得到验证，从而发现了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物循环的选育规律，提出了相关选育机制与方法，初步建立了这种选育作用的理论与技术体系并得到实际应用，它正是联系高效水貂细小病毒疫苗研制、痘苗病毒重组质粒转染技术创新、细胞系致癌毒理学安全性评价、异类肿瘤在体实验转化现象确立与横纹肌样瘤起源之谜初步揭示的纽带与桥梁，具有广泛的科学指导和实用意义。实际应用：(1)安全高效的水貂肠炎病毒细胞培养灭活疫苗的首次研制成功和长期广泛应用;(2)在对痘苗病毒重组质粒转染技术的探索性研究中首次简化了基因转染技术;(3)恶性横纹肌样瘤(MRT)在模型动物体内的首次发现和成功复制，为阐明其起源之谜提供了机会。从染色体遗传变异角度初步阐明了MRT的发生、发展规律，从比较医学角度揭示了MRT的组织细胞起源;(4)解了传代细胞(CCL)致癌毒理实验的难题，揭示了遗传变异率与致癌(瘤)的关系。在基因识别新方法与功能基因分离方面取得重要进展。建立了从计算机软件分析、人工干预分析及与实验生物学相结合角度来发现人类新基因的方法，并证明它是加速基因克隆和鉴定的一条有效途径。电子克隆百余人类新基因(还用合作开发的软件计算机识别800个人类新基因候选对象)，部分基因编码序列已被实验证实和引用，其中几个新克隆基因已在动物实验中显示出明显的生物学功能活性。发现了美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因组注释项目公布的人类基因模式参考序列(REFSEQ)存在各种类型的多种/处错误，这一结果提示应慎重使用NCBI的REFSEQ数据库。

关键词：病毒细胞生物循环基因识别遗传进化

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互操作性本体:智能精准医学的基础

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中国医学伦理学 2021年第3期34卷 265-279页

作者：何勇群谢江安万灵杨啸林朱彦周伟李元放陆伟胜吴健民刘开永王海河刘清平余红 University of Michigan Medical School Ann ArborMI 48109 重庆邮电大学生物信息学院重庆400065 南京昂吉网智网络技术有限公司江苏南京211199 中国医学科学院基础医学研究所北京100005 中国中医科学院中医药信息研究所北京100700 国家人口健康科学数据中心北京100700 Faculty of Information Technology Monash UniversityClaytonVic 3800 北京大学肿瘤医院癌症生物信息学中心北京100142 安徽医科大学公共卫生学院安徽合肥230032 哈尔滨医科大学大庆分校黑龙江大庆163319 广州中医药大学广东广州510006 贵州大学医学院/贵州省人民医院/国家卫生健康委员会肺脏免疫性疾病诊治重点实验室贵州贵阳550002

近年来,互联网与物联网等技术的快速发展为探寻精准医学与人工智能之间的关联应用提供了战略机遇。然而,如何组织、集成和共享复杂异构的生物医学数据业已成为阻碍该领域发展的严重技术挑战。本体因其能够提供知识与元数据层面的语义基... 详细信息

近年来,互联网与物联网等技术的快速发展为探寻精准医学与人工智能之间的关联应用提供了战略机遇。然而,如何组织、集成和共享复杂异构的生物医学数据业已成为阻碍该领域发展的严重技术挑战。本体因其能够提供知识与元数据层面的语义基础而推动了生物医学人工智能的发展,而基于互操作性的本体对异构知识与数据的整合和分析发挥着关键性的作用。将人工智能与精准医疗的有机集合称之为智能精准医疗,并提出一个“河马假设”,用以阐明互操作性本体与智能精准医疗之间的正相关关系及如何发挥协同增效作用;同时,提出和展示了使用可扩展本体开发的原理和工具来实现本体的互操作性,进而支持智能精准医疗的应用与发展。此外,还对国内外互操作性本体的研究现状、本体中国的成立与发展以及医学伦理在智能精准医疗中的重要性等进行了综述和深入探讨。

关键词：本体互操作性本体生物医学大数据精准医学人工智能本体中国

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