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中国化学会第26届学术年会化学生物分会场

作者：曲鹏赵新生北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及化学学院化学生物学系北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及化学学院化学生物学系

＜正＞DNA分子的杂交解链作为其重要生物学行为受到广泛关注,其中,具有二级结构的DNA分子杂交解链行为参与了许多生命过程,并越来越多地应用于分析检测领域。但对于具有二级结构的双链杂交解链动力学,由于体系中物种复杂,而很难被直接... 详细信息

＜正＞DNA分子的杂交解链作为其重要生物学行为受到广泛关注,其中,具有二级结构的DNA分子杂交解链行为参与了许多生命过程,并越来越多地应用于分析检测领域。但对于具有二级结构的双链杂交解链动力学,由于体系中物种复杂,而很难被直接观察。我们搭建了单分子双色符合光谱仪

关键词：单分子双色符合光谱 DNA 杂交解链

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微量水促进甲烷催化裂解制单壁碳纳米管

微量水促进甲烷催化裂解制单壁碳纳米管

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第十四届全国催化学术会议

作者：隗罡吴建梅刘霁欣朱月香谢有畅北京大学物理化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室

碳纳米管(CNTs)是21世纪非常重要的新型材料。单壁碳纳米管(SWCNTs)的性能与多壁碳纳米管(MWCNTs)相比,在很多方面尤其突出。多壁碳纳米管已经实现大规模工业化生产。而大规模经济地制备单壁碳纳米管的方法研究,依旧面临不小的挑战[1]... 详细信息

碳纳米管(CNTs)是21世纪非常重要的新型材料。单壁碳纳米管(SWCNTs)的性能与多壁碳纳米管(MWCNTs)相比,在很多方面尤其突出。多壁碳纳米管已经实现大规模工业化生产。而大规模经济地制备单壁碳纳米管的方法研究,依旧面临不小的挑战[1]。从而使单壁碳纳米管的大量应用受到了限制。我们较早的研究发现[2],微量水可显著促进催化化学气相沉积法(CCVD)制备高纯

关键词： SWCNTs CH4 CCVD

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基于蛋白质相互作用及网络的药物设计

基于蛋白质相互作用及网络的药物设计

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第八届海内外生命科学论坛

作者：来鲁华北京大学化学学院北京大学理论生物学中心分子动态与稳态结构国家重点实验室(北京)

蛋白质相互作用及蛋白质网络研究是后基因时代药物设计的新关注点.作者的实验室针对蛋白质-蛋白质相互作用规律进行了研究;发展了进行蛋白质界面分析及分类的方法;建立了定量计算蛋白质-蛋白质结合自由能的统计平均势方法,发现蛋白质界... 详细信息

蛋白质相互作用及蛋白质网络研究是后基因时代药物设计的新关注点.作者的实验室针对蛋白质-蛋白质相互作用规律进行了研究;发展了进行蛋白质界面分析及分类的方法;建立了定量计算蛋白质-蛋白质结合自由能的统计平均势方法,发现蛋白质界面上存在着弱的氢键作用模式;发展了可用于非同源蛋白质连续功能位点的嫁接方法,并在实际体系的研究中取得了成功.

关键词：蛋白质作用网络界面分析平均势方法蛋白质功能设计后基因时代药物设计

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针对磷脂氢谷胱甘肽过氧化物酶别构位点的激活剂设计

针对磷脂氢谷胱甘肽过氧化物酶别构位点的激活剂设计

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中国化学会第29届学术年会

作者：李瑽解晓雯来鲁华北京大学化学与分子工程学院分子动态与稳态国家重点实验室北京大学定量生物学中心

磷脂过氧氢谷胱甘肽过氧化物酶(PHGPx)能还原氧化受损的细胞膜及细胞内的各种活性氧物种(ROS),在胚胎发育、抗氧化和精子生成中有不可替代的作用[1]。激活PHGPx的保护作用对治疗炎症、癌症等疾病可能有很好的效果。而通过别构调控,激活... 详细信息

磷脂过氧氢谷胱甘肽过氧化物酶(PHGPx)能还原氧化受损的细胞膜及细胞内的各种活性氧物种(ROS),在胚胎发育、抗氧化和精子生成中有不可替代的作用[1]。激活PHGPx的保护作用对治疗炎症、癌症等疾病可能有很好的效果。而通过别构调控,激活目的蛋白的功能是一种新兴的药物设计思路[2]。目前,还没有报道可以激活PHGPx活性的化合物。本文基于活性PHGPx晶体结构[3],预测了可能的别构调控位点,并进行了激活剂的虚拟筛选,通过体外测活实验挑选出7个表现出较明显的激活效果的小分子化合物。其中最强的激活剂的AC50为58±5μM,最大激活是原酶活性的约2倍,并在细胞实验中也表现出对PHGPx的激活。这些小分子化合物,验证了针对别构位点进行药物设计,特别是激活剂设计的可能性。同时,我们为找到更有效、副作用更小的抑制炎症的方法提供了新的策略。

关键词：磷脂过氧氢谷胱甘肽过氧化物酶(PHGPx) 别构位点激活剂

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眼见为实-生命运动的单分子动态检测

眼见为实-生命运动的单分子动态检测

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第九届全国化学动力学会议

作者：梁璋仪徐宁张幼怡赵新生北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及化学学院化学生物学系分子心血管学教育部重点实验室及北京大学第三医院血管医学研究所分子心血管学教育部重点实验室及北京大学第三医院血管医学研究所北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及化学学院化学生物学系

＜正＞肾上腺素受体（adrenergic receptor,AR）因与心血管疾病密切相关而引起人们广泛关注。我们对荧光标记的单个α1A-AR分子在激动剂刺激下在活细胞中的内陷行为和运动进行了观测。用Cy3标记的二抗和单克隆一抗,在活细胞（HEK293A）... 详细信息

＜正＞肾上腺素受体（adrenergic receptor,AR）因与心血管疾病密切相关而引起人们广泛关注。我们对荧光标记的单个α1A-AR分子在激动剂刺激下在活细胞中的内陷行为和运动进行了观测。用Cy3标记的二抗和单克隆一抗,在活细胞（HEK293A）表面特异性

关键词：单分子检测活细胞肾上腺受体

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生物运动的单分子动态观测

生物运动的单分子动态观测

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第四届全国化学生物学学术会议暨国际化学与生物/医学交叉研讨会

肾上腺素受体(adrenergic receptor,AR)因与心血管疾病密切相关而引起人们广泛关注。我们对荧光标记的单个α1A-AR分子在激动剂刺激下在活细胞中的内陷行为和运动进行了观测。用Cy3标记的二抗和单克隆一抗,在活细胞(HEK293A)表面特异性... 详细信息

肾上腺素受体(adrenergic receptor,AR)因与心血管疾病密切相关而引起人们广泛关注。我们对荧光标记的单个α1A-AR分子在激动剂刺激下在活细胞中的内陷行为和运动进行了观测。用Cy3标记的二抗和单克隆一抗,在活细胞(HEK293A)表面特异性标记α1A-AR,用落射式荧光显微镜进行观察。用苯肾

关键词：单分子检测活细胞肾上腺受体

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单分子双色符合光谱研究DNA杂交动力学

单分子双色符合光谱研究DNA杂交动力学

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第五届全国化学生物学学术会议

＜正＞我们搭建了单分子双色符合光谱仪（Single molecule two color coincidence spectrometer）, 并应用于 DNA 杂交动力学的研究。在发卡型 DNA 分子的两端分别标记染料和淬灭剂,而在其对应杂交链上标记另外一种染料分子,同时用双色... 详细信息

＜正＞我们搭建了单分子双色符合光谱仪（Single molecule two color coincidence spectrometer）, 并应用于 DNA 杂交动力学的研究。在发卡型 DNA 分子的两端分别标记染料和淬灭剂,而在其对应杂交链上标记另外一种染料分子,同时用双色激光激发,挑选出两种染料同时发光的单分子荧光信号（图1）。将含有双染料标记的双链 DNA 分子和游离染料分子混合,增加游

关键词：单分子双色符合光谱 DNA 杂交解链

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基于蛋白质结构和动力学的别构分子理性设计研究——北京大学分子设计实验室近年研究进展

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药学进展 2020年第8期44卷 564-572页

作者：刘培王立铭刘莹来鲁华北京大学化学与分子工程学院分子动态与稳态结构国家重点实验室北京分子科学国家研究中心北京大学定量生物学中心北京大学-清华生命科学联合中心

别构药物具有高选择性和抗耐药性的优势。相对于正构药物较为成熟的研究策略,目前别构调控分子的发现存在很大挑战。总结笔者实验室在别构调控研究领域取得的进展,包括别构位点的理论计算预测方法、别构调控分子理性设计的成功示例,并... 详细信息

别构药物具有高选择性和抗耐药性的优势。相对于正构药物较为成熟的研究策略,目前别构调控分子的发现存在很大挑战。总结笔者实验室在别构调控研究领域取得的进展,包括别构位点的理论计算预测方法、别构调控分子理性设计的成功示例,并讨论了别构药物研发领域面临的挑战以及新的发展动向。

关键词：基于结构的方法理性设计别构调控分子

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应用连续动态左心功能指标的变化辅助CPET评价个体化精准运动整体方案管控慢病疗效的临床研究Ⅰ--组群间分析

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中国应用生理学杂志 2022年第6期38卷 595-603页

作者：张艳芳孙兴国王继楠台文琦周晴晴宋雅陈嘉豪黄疆颉奔徐凡石超刘方张也李浩谢友红重庆医科大学附属康复医院重庆400050 国家心血管病中心中国医学科学院阜外医院北京协和医学院心血管疾病国家重点实验室心血管疾病国家临床医学研究中心北京100037 北京大学第三医院北京100191

目的:探讨研究连续动态左心功能指标变化评价个体化精准运动整体方案强化管控3个月后的长期慢病患者心血管功能的改善情况。方法:选取2018年至2021年由我们团队强化管控的长期心脑血管代谢慢病为主的患者21例,签署知情同意书后完成症状... 详细信息

目的:探讨研究连续动态左心功能指标变化评价个体化精准运动整体方案强化管控3个月后的长期慢病患者心血管功能的改善情况。方法:选取2018年至2021年由我们团队强化管控的长期心脑血管代谢慢病为主的患者21例,签署知情同意书后完成症状限制性极限心肺运动试验(CPET)和无创左右心功能同步检测仪(N-ISCFD)连续记录50 s心电图、桡动脉脉搏波、颈静脉脉搏波和心音图数据,根据CPET及连续功能学监测下滴定结果制定以个体化适度运动强度为核心的整体方案进行3个月强化管控后再重复N-ISVCD数据收集。所有N-ISCFD的50 s数据按阜外医院优化报告模式进行分析计算52项左心功能学指标;强化管控前后的数据比较采用配对t检验统计学分析组群变化情况。结果:21例长期慢病患者(16男5女),年龄为(54.05±12.77,29~75)岁,BMI为(25.53±4.04,16.62~31.7)kg/m^(2)。与强化管控前基础值比较,患者3个月强化管控后①一般指标:体重、BMI、收缩压和舒张压均显著降低(P<0.01);②CPET核心指标Peak VO_(2)从(64.93±24.22,26.96~103.48)%Pred提高为(85.22±30.31,43.95~140.48)%Pred(P<0.01),显著平均提升(35.09±27.87,0.12~129.35)%;其他AT、Peak VO_(2)/HR、Peak Work Rate、OUEP、FVC、FEV_(1)、FEV_(3)/FVC%和MVV也均较管控前显著升高(P<0.01);而Lowest VE/VCO_(2)和VE/VCO_(2)Slope则显著降低(P<0.01);③左右心功能核心指标:射血分数(EF)从(0.60±0.12,0.40~0.88)%显著提高为(0.66±0.09,0.53~0.87)%(P<0.01),平均提升(12.39±14.90,-12.32~41.11)%;总阻力(TPR)从(1579.52±425.45,779.46~2409.61)G/(cm^(4)·s)显著降低为(1340.44±261.49,756.05~1827.01)G/(cm^(4)·s)(P<0.01),平均降低(12.00±17.27,-37.79~28.61)%;其他左心搏指数(LSI),心脏总功率(CTP),射流压力(EP),左室舒张末期血量(LVEDV)等指标也均显著改善(P<0.05)。结论:CPET和连续功能学监测可安全有效制定慢病患者个体化运动整体方案,长期强化管控可安全有效地显著改善患者组群的整体功能状态,而连续动态记录左心功能指标的改变可以辅助CPET简便评价心血管功能变化。

关键词：整体整合生理学医学心肺运动试验个体化精准运动强化管控方案心血管功能慢性病管控

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D型TNF结合肽的计算设计

D型TNF结合肽的计算设计

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中国化学会第29届学术年会

作者：杨为张长胜来鲁华北京大学化学与分子工程学院分子动态与稳态国家重点实验室北京大学-清华大学联合中心

肿瘤坏死因子(TNF)是治疗风湿性关节炎等自身免疫疾病的靶标[1]。目前临床上使用的以TNF为靶标的药物都是蛋白质药物。对体内蛋白酶敏感,半衰期短、给药方式有限等一直是制约蛋白质药物使用和发展的因素。D型氨基酸对体内蛋白酶有着天... 详细信息

肿瘤坏死因子(TNF)是治疗风湿性关节炎等自身免疫疾病的靶标[1]。目前临床上使用的以TNF为靶标的药物都是蛋白质药物。对体内蛋白酶敏感,半衰期短、给药方式有限等一直是制约蛋白质药物使用和发展的因素。D型氨基酸对体内蛋白酶有着天然的抗性[2]。发展D型氨基酸组成的TNF结合肽,可以有效提高药物在体内的半衰期,与现有药物相比具有明显优势。我们在前期工作中通过计算设计与实验获得了与TNF结合的L型多肽[3]。本文将L型蛋白质计算设计方法扩展到D型蛋白质设计,设计了可以与TNF结合的D型螺旋肽。选择10条D型肽序列进行合成与活性测定,其中有4条序列在表面等离子共振结合实验和基于细胞的活性测试中表现出活性。所发展的D型蛋白质/多肽药物计算设计方法,可以广泛用于针对其他靶标D型蛋白质药物的开发以及现有蛋白质药物的改造。

关键词：肿瘤坏死因子蛋白质设计非天然氨基酸 D型氨基酸

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