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贝达喹啉、氯法齐明和德拉马尼对常见致病性非结核分枝杆菌体外抑菌活性及耐药机制的研究进展

中国防痨杂志 2020年第8期42卷 880-884页

作者：孙晴黄海荣王桂荣首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室北京市耐药结核病研究重点实验室 101149

近年来,非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)引起的感染呈逐渐上升趋势,严重威胁人类健康。NTM致病的菌种繁多,不同菌种NTM对药品的敏感性各异,使其治疗存在较大困难。因此,寻找NTM病治疗效果较佳的药品非常有必要。NTM... 详细信息

近年来,非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)引起的感染呈逐渐上升趋势,严重威胁人类健康。NTM致病的菌种繁多,不同菌种NTM对药品的敏感性各异,使其治疗存在较大困难。因此,寻找NTM病治疗效果较佳的药品非常有必要。NTM种属分布常具有地域特点,在多数地区鸟-胞内分枝杆菌复合群、脓肿分枝杆菌和堪萨斯分枝杆菌为较常见的致病菌种。贝达喹啉(bedaquiline,Bdq)、氯法齐明(clofazimine,Cfz)及德拉马尼(delamanid,Dlm)因对治疗NTM病体现出了良好的治疗潜力而受到广泛关注。为了提高对抗NTM药品敏感性及耐药机制的认识,作者就Bdq、Cfz和Dlm对以上常见致病性NTM的体外抑菌活性及耐药相关机制进行综述。

关键词：分枝杆菌非典型性贝达喹啉氯法齐明德拉马尼体外研究微生物敏感性试验药理作用分子作用机制综述文献(主题)

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第二次实时荧光定量核酸扩增检测在结核病诊断中的增值成本效益分析

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中华结核和呼吸杂志 2019年第6期42卷 432-437页

作者：王淑琦孙晴姜广路付育红尚媛媛黄海荣王桂荣首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室北京市耐药结核病研究重点实验室 101149

目的探讨第二次实时荧光定量核酸扩增(Xpert MTB/RIF,Xpert)检测在结核病诊断中的增值成本效益。方法连续纳入2015年3月至2018年3月在1周内连续进行了2次Xpert检测的2 896例疑似结核病患者,其中包括2 402例疑似肺结核患者(肺结核组),男1... 详细信息

目的探讨第二次实时荧光定量核酸扩增(Xpert MTB/RIF,Xpert)检测在结核病诊断中的增值成本效益。方法连续纳入2015年3月至2018年3月在1周内连续进行了2次Xpert检测的2 896例疑似结核病患者,其中包括2 402例疑似肺结核患者(肺结核组),男1 523例,女879例,年龄平均46岁。收集患者临床检测标本,其中痰标本2 144例,BALF 258例。疑似肺外结核494例(肺外结核组),男318例,女176例,平均年龄42岁,收集胸腔积液标本157例,脑脊液标本106例,尿液标本34例,骨结核脓液标本197例。所有标本进行2次Xpert检测并行涂片镜检、液体快速培养(BACTEC MGIT 960),培养阳性菌进行药敏试验。肺结核组和肺外结核组标本分别根据涂片检查结果,分为肺结核涂阳组、肺结核涂阴组和肺外结核涂阳组、肺外结核涂阴组。使用χ2检验比较第1次和第2次Xpert检测的增值成本效益,t检验评估不同群体成本之间差异的显著性。结果2 896例疑似结核病患者标本中,2次Xpert检测结果中任一次阳性者1 639例(包含2次检测均为阳性者,全文同),第1次Xpert检测阳性1 502例(91.6%),第2次检测阳性者增加了137例(8.4%)。第2次Xpert检测的增值效能涂阴组(108/727, 14.9%)显著高于涂阳组(29/912, 3.2%),两组比较差异有统计学意义(χ2=221.404, P<0.001);肺外结核组(23/206, 11.2%)高于肺结核组(114/433, 8.0%),差异有统计学意义(χ2=2.422, P=0.012)。药敏试验结果显示,2 896例标本中371例为利福平耐药,其中91.4%(339/371)由第1次Xpert检出,第2次Xpert检出率增加了8.1%(30/371)。第2次检测的增值成本效益显著:以650元/次测算,肺结核组第1次和第2次检测的平均成本分别为0.12万元和0.22万元(P<0.001),增值成本为1.37万元;肺外结核组第1次和第2次检测的平均成本分别为0.18万元和0.31万元(P<0.001),增值成本为1.40万元(与同肺结核组增值成本比较,P<0.001)。在肺结核和肺外结核患者标本检测中,涂阴患者第2次Xpert检测的增值成本效益低于涂阳患者。结论第2次Xpert检测对结核病诊断有显著的增值成本效益。

关键词：结核诊断成本及成本分析

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与结核分枝杆菌谱系2流行优势相关的临床特征研究

与结核分枝杆菌谱系2流行优势相关的临床特征研究

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中国防痨协会第33届全国学术大会暨中国防痨科技奖颁奖大会

作者：秦李祎张立群孙孟言朱晨迪尹金风杨文英杨阳薛云龙吕平欣李卫民首都医科大学附属北京胸科医院国家结核病临床实验室北京市结核病胸部肿瘤研究所结核科耐药结核病研究北京市重点实验室临床流行病学北京市重点实验室首都医科大学附属北京胸科医院影像科

目的探讨结核分枝杆菌(MTB)谱系2的亚谱系2.3 (Lineage2.3简称L2.3)及其分支的临床特征,以期解释其在我国及欧亚大陆的传播优势。方法连续不间断纳入首都医科大学附属北京胸科医院2019年4月至2019年7月间结核病患者临床分离MTB菌株以及... 详细信息

目的探讨结核分枝杆菌(MTB)谱系2的亚谱系2.3 (Lineage2.3简称L2.3)及其分支的临床特征,以期解释其在我国及欧亚大陆的传播优势。方法连续不间断纳入首都医科大学附属北京胸科医院2019年4月至2019年7月间结核病患者临床分离MTB菌株以及对应人口学、临床和影像学数据资料。对分离的MTB菌株进行了全基因组序列、遗传进化分析和谱系鉴定;建立了与肺结核活动性相关损伤的胸部CT量化评分体系,控制因治疗引起的混杂。采用多元logistic回归分析L2及其分支与其对应的临床、影像学特征的相关性。以P<0.05为差异有统计学意义。结果期间完成了纳入的235株MTB菌株的全基因组序列分析。其中226株L2 (96.2%)和9株L4 (3.8%)。L2包括211株L2.3和15株L2.2。L2.3包括1～6个分支,其中分支4和6较多,分别为78株和92株。CT量化评分一致性良好(Cohen's kappa:0.70,P<0.001;Weighted kappa:0.82,P<0.001;ICC:0.73,P<0.001),发现与初治患者相比,复治患者的空洞相关变量评分更高,复治近期治疗出现实变的可能更小。其中133株L2对应患者临床资料完整,多元logistic回归分析显示,与L2.2相比,感染L2.3的4分支的患者具有显著年龄偏高(≥50岁)(OR:12.52,95%CI:2.29～68.26)、CT实变可能更高(OR:10.99,95%CI:1.99～62.50)、咯血症状出现可能更低(OR:0.10,95%CI:0.02～0.59)、实质受累程度更低(OR:0.99,95%CI:0.98～1.00)的特征;感染L2.3的6分支的患者具有显著空洞表现(OR:15.87,95%CI:1.90～125.00)但咯血症状出现的可能较低(OR:0.04,95%CI:0.01～0.23)的特征。结论结核分枝杆菌L2.3的传播优势可能与其优势分支引起的空洞等临床和影像特征密切相关。

关键词：结核分枝杆菌(MTB)谱系2 全基因组序列分析 CT影像量化评分空洞咯血

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贝达喹啉,氯法齐明和德拉马尼对常见致病性非结核分枝杆菌体外抑菌活性及耐药机制的研究进展

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结核病与胸部肿瘤 2020年第4期 319-323页

作者：孙晴黄海荣王桂荣首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室北京市耐药结核病研究重点实验室101149

非结核分枝杆菌(non-uberculous mycobacteria,NTM)系指除结核分枝杆菌复合群和麻风分枝杆菌以外的分枝杆菌。NTM常存在于自然环境中,为机会性致病菌。近年来,NTM引起的感染呈逐渐.上升趋势,严重威胁人类健康1。NTM感染肺、淋巴结、皮... 详细信息

非结核分枝杆菌(non-uberculous mycobacteria,NTM)系指除结核分枝杆菌复合群和麻风分枝杆菌以外的分枝杆菌。NTM常存在于自然环境中,为机会性致病菌。近年来,NTM引起的感染呈逐渐.上升趋势,严重威胁人类健康1。NTM感染肺、淋巴结、皮肤等器官和组织的疾病称为NTM病,以肺部受感染多见。NTM病往往作为继发性或伴随性疾病,患者通常伴随慢性基础疾病或免疫系统的损害,如患有慢性阻塞性肺疾病(COPD)、恶性肿瘤、艾滋病(AIDS)等疾病。NTM病在临床表现及影像学、实验室检查结果等方面与结核病相比无明显差异,但二者的治疗方案却大相径庭。

关键词：非结核分枝杆菌结核分枝杆菌复合群麻风分枝杆菌氯法齐明体外抑菌活性耐药机制免疫系统结核病

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SYBR GreenⅠ荧光PCR熔解曲线鉴定鸟分枝杆菌方法的建立及初步应用

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临床检验杂志 2020年第4期38卷 251-257页

作者：王赛赛潘丽萍姜广路李自慧贾红彦孙琦张宗德刘洋首都医科大学附属北京胸科医院&北京市结核病胸部肿瘤研究所流行病学研究室北京101149 首都医科大学附属北京胸科医院&北京市结核病胸部肿瘤研究所耐药结核病研究北京市重点实验室北京101149 首都医科大学附属北京胸科医院&北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室北京101149

目的基于SYBR GreenⅠ荧光染料建立鉴定鸟分枝杆菌(Mycobacterium avium,MA)的荧光PCR熔解曲线法,为临床鉴定MA提供简单、准确性高的分子生物学检测方法。方法以MA的特异性插入序列IS1311为检测靶标设计引物,在60℃的退火温度下,建立鉴... 详细信息

目的基于SYBR GreenⅠ荧光染料建立鉴定鸟分枝杆菌(Mycobacterium avium,MA)的荧光PCR熔解曲线法,为临床鉴定MA提供简单、准确性高的分子生物学检测方法。方法以MA的特异性插入序列IS1311为检测靶标设计引物,在60℃的退火温度下,建立鉴定MA的SYBR GreenⅠ荧光PCR熔解曲线方法,并对MA等21种分枝杆菌标准株和金黄色葡萄球菌等5种常见致病菌进行检测,评价方法的特异性、检测限;以hsp65、16S rDNA普通PCR扩增产物测序分析为“金标准”,鉴定200株分枝杆菌临床分离株,评估建立方法鉴定MA的准确性。结果SYBR GreenⅠ荧光PCR熔解曲线方法在30个循环内能准确鉴定出21种分枝杆菌标准株和5种致病菌中的MA,检测限为5.6×10-2 ng/μL。200株分枝杆菌临床分离株中,以PCR测序鉴定出16株MA和184株其他分枝杆菌,以SYBR GreenⅠ荧光PCR熔解曲线方法鉴定出15株MA和185株非MA;本研究建立的方法和测序方法对MA的鉴定率差异无统计学意义(P>0.05);两法符合率为99.5%(199/200),一致性较高(Kappa值>0.75,P<0.01);建立方法的敏感性为93.8%(15/16),特异性为100.0%(184/184),阳性预测值为100.0%(15/15),阴性预测值为99.5%(184/185)。结论以MA特异性重复序列IS1311为基础建立的SYBR GreenⅠ荧光PCR熔解曲线方法,具有较高的灵敏度和特异性,为MA的临床检测提供新的途径。

关键词：鸟分枝杆菌 SYBR GreenⅠ荧光PCR熔解曲线测序

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SYBR Green I荧光PCR熔解曲线鉴定鸟分枝杆菌方法的建立及初步应用

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结核病与胸部肿瘤 2020年第4期 277-283页

作者：王赛赛潘丽萍姜广路李自慧贾红彦孙琦张宗德刘洋首都医科大学附属北京胸科医院/北京市结核病胸部肿瘤研究所流行病学研究室 101149 首都医科大学附属北京胸科医院/北京市结核病胸部肿瘤研究所耐药结核病研究北京市重点实验室 101149 首都医科大学附属北京胸科医院/北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室 101149

目的基于SYBR Green I荧光染料建立鉴定鸟分枝杆菌(Mycobacterium ***)的荧光PCR熔解曲线法,为临床鉴定MA提供简单、准确性高的分子生物学检测方法。方法以MA的特异性插人序列ISI311为检测靶标设计引物,在60 C的退火温度下,建立鉴定MA的... 详细信息

目的基于SYBR Green I荧光染料建立鉴定鸟分枝杆菌(Mycobacterium ***)的荧光PCR熔解曲线法,为临床鉴定MA提供简单、准确性高的分子生物学检测方法。方法以MA的特异性插人序列ISI311为检测靶标设计引物,在60 C的退火温度下,建立鉴定MA的SYBRGreenI荧光PCR熔解曲线方法,并对MA等21种分枝杆菌标准株和金黄色葡萄球菌等5种常见致病菌进行检测,评价方法的特异性、检测限;以hsp65、16S rDNA普通PCR扩增产物测序分析为“金标准”,鉴定200株分枝杆菌临床分离株,评估建立方法鉴定MA的准确性。结果SYBRGreenI荧光PCR熔解曲线方法在30个循环内能准确鉴定出21种分枝杆菌标准株和5种致病菌中的MA.检测限为5.6x 102 ng/μL。200株分枝杆菌临床分离株中,以PCR测序鉴定出16株MA和184株其他分枝杆菌,以SYBR Green I荧光PCR熔解曲线方法鉴定出15株MA和185株非MA;本研究建立的方法和测序方法对MA的鉴定率差异无统计学意义(P>0.05);两法符合率为99.5%(199/200),一致性较高(Kappa值>0.75,P<0.01);建立方法的敏感性为93.8%(15/16),特异性为100.0%(184/184),阳性预测值为100.0%(15/15),阴性预测值为99.5%(184/185)。结论以MA特异性重复序列ISI311为基础建立的SYBR Green I荧光PCR熔解曲线方法,具有较高的灵敏度和特异性,为MA的临床检测提供新的途径。

关键词：鸟分枝杆菌 SYBR Green I荧光PCR熔解曲线测序

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美罗培南对非结核分枝杆菌的体外抑菌效果评价

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中国防痨杂志 2019年第3期41卷 302-307页

作者：于霞罗晶晶赵立平徐洋梁倩马异峰董玲玲黄海荣首都医科大学附属北京胸科医院、北京市结核病胸部肿瘤研究所、国家结核病临床实验室、耐药结核病研究北京市重点实验室 101149 大连市友谊医院肿瘤内科

目的评价美罗培南(meropenem,MEM)对非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)的体外抑菌效果。方法收集首都医科大学附属北京胸科医院2015年1月至2016年12月分离的NTM临床分离株,共计207株。采用微孔板AlamarBlue法测定MEM对... 详细信息

目的评价美罗培南(meropenem,MEM)对非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)的体外抑菌效果。方法收集首都医科大学附属北京胸科医院2015年1月至2016年12月分离的NTM临床分离株,共计207株。采用微孔板AlamarBlue法测定MEM对纳入的207株NTM临床分离株的体外抑菌效果。同时,评价其对46种NTM标准株[30株快生长分枝杆菌(rapidly growing mycobacterium,RGM)和16株慢生长分枝杆菌(slowly growing mycobacterium,SGM)]的体外抑菌情况。结果在30株RGM标准菌株中,26.7%(8/30)的菌种对MEM耐药。MEM对偶发和脓肿分枝杆菌临床分离株的耐药率分别为33.3%(11/33)和82.5%(33/40)。在16株SGM标准株,56.3%(9/16)的菌株对MEM耐药。在SGM临床分离株中,MEM对戈登分枝杆菌、胞内分枝杆菌、鸟分枝杆菌和堪萨斯分枝杆菌的耐药率分别依次为20.0%(2/10)、63.9%(23/36)、72.7%(16/22)和95.6%(43/45)。结论MEM对于大多数RGM菌种和部分SGM菌种都显示出一定的体外抑菌活性,其中对偶发分枝杆菌和戈登分枝杆菌则显示出相对较好的体外抑菌活性。

关键词：分枝杆菌,非典型性微生物敏感性试验结果评价(卫生保健) 美罗培南

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第二次实时荧光定量核酸扩增检测在结核病诊断中的增值成本效益分析

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结核病与胸部肿瘤 2019年第3期 185-190页

目的探讨第二次实时荧光定量核酸扩增(Xpert MTB/RIF,Xpert)检测在结核病诊断中的增值成本效益。方法连续纳入2015年3月至2018年3月在1周内连续进行了2次Xpert检测的2896例疑似结核病患者,其中包括2402例疑似肺结核患者(肺结核组),男152... 详细信息

目的探讨第二次实时荧光定量核酸扩增(Xpert MTB/RIF,Xpert)检测在结核病诊断中的增值成本效益。方法连续纳入2015年3月至2018年3月在1周内连续进行了2次Xpert检测的2896例疑似结核病患者,其中包括2402例疑似肺结核患者(肺结核组),男1523例,女879例,年龄平均46岁。收集患者临床检测标本,其中痰标本2144例,BALF 258例。疑似肺外结核494例(肺外结核组),男318例,女176例,平均年龄42岁,收集胸腔积液标本157例,脑脊液标本106例,尿液标本34例,骨结核脓液标本197例。所有标本进行2次Xpert检测并行涂片镜检、液体快速培养(BACTEC MGIT 960),培养阳性菌进行药敏试验。肺结核组和肺外结核组标本分别根据涂片检査结果,分为肺结核涂阳组、肺结核涂阴组和肺外结核涂阳组、肺外结核涂阴组。使用X2检验比较第1次和第2次Xpert检测的增值成本效益,/检验评估不同群体成本之间差异的显著性。结果28%例疑似结核病患者标本中,2次Xpert检测结果中任一次阳性者1639例(包含2次检测均为阳性者,全文同),第1次Xpert检测阳性1502例(91.6%),第2次检测阳性者增加了137例(8.4%)。第2次X pert检测的增值效能涂阴组(108/727,14.9%)显著高于涂阳组(29/912,3.2%),两组比较差异有统计学意义(χ^2=221.404,P<0.001);肺外结核组(23/206,11.2%)髙于肺结核组(114/433,8.0%),差异有统计学意义(χ^2=2.422,P=0.012)。药敏试验结果显示,2896例标本中371例为利福平耐药,其中91.4%(339/371)由第1次Xpert检出,第2次Xpert检出率增加了8.1%(30/371)。第2次检测的增值成本效益显著:以650元/次测算,肺结核组第1次和第2次检测的平均成本分别为0.12万元和0.22万元(P<0.001),增值成本为1.37万元;肺外结核组第1次和第2次检测的平均成本分别为0.18万元和0.31万元(P<0.001),增值成本为1.40万元(与同肺结核组增值成本比较,P<0.001)。在肺结核和肺外结核患者标本检测中,涂阴患者第2次Xpert检测的增值成本效益低于涂阳患者。结论第2次Xpert检测对结核病诊断有显著的增值成本效益。

关键词：结核诊断成本及成本分析

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新型冠状病毒肺炎疫情联防联控策略评价与开放离鄂通道影响的预测

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应用概率统计 2020年第3期36卷 321-330页

作者：宋鹏飞陈灿贻楼元姜慧李卫民朱利平西安交通大学数学与统计学院西安710049 中国人民大学统计与大数据研究院北京100872 俄亥俄州立大学数学系俄亥俄哥伦布43210 首都医科大学附属北京胸科医院北京101149 北京市结核病胸部肿瘤研究所耐药结核病研究北京市重点实验室北京101149 首都医科大学临床流行病学北京重点实验室北京100069 中国人民大学统计与大数据研究院中国人民大学国家发展与战略研究院北京100872

我们利用传播动力学模型,基于国家卫健委公布的确诊人数、痊愈人数和因病死亡人数,得到如下三个结论.1、中国政府采取的联防联控机制已经对新型冠状病毒肺炎疫情防控起到了显著效果.湖北省的基本再生数从2月3日之前的3.86(即一个感染者... 详细信息

我们利用传播动力学模型,基于国家卫健委公布的确诊人数、痊愈人数和因病死亡人数,得到如下三个结论.1、中国政府采取的联防联控机制已经对新型冠状病毒肺炎疫情防控起到了显著效果.湖北省的基本再生数从2月3日之前的3.86(即一个感染者在感染周期内将导致3.86人感染)逐渐降为2月8日之后的0.42;浙江、广东、河南、湖南、江西、安徽、北京和上海等六省二市的基本再生数从1月30日之前的3.68降为2月4日之后的0.18.2、无症状感染者和有症状感染者在确诊前的感染力接近.新型冠状病毒肺炎疫情防控的难点在于隔离并及时收治无症状感染者.湖北省无症状感染者人数从2月5日的最高点(23,068人)逐步回落到2月29日的2,935人,湖北省的疫情防控形势依然非常严峻;浙江、广东、河南、湖南、江西、安徽、北京和上海六省二市无症状感染者人数在2月29日已经回落至5~21人之间,这些地区新型冠状病毒肺炎疫情已经得到了初步控制.3、选择放松离鄂通道交通管制措施的时机需要非常谨慎.传播动力学模型预测,如果在5月中旬或6月中旬放松离鄂通道交通管制措施,允许每天从湖北输入10万无症状人群到浙江、广东、河南、湖南、江西、安徽、北京和上海等六省二市,则一个半月后输入地感染人数将累计增加5.5人或1.3人.但如果选择在3月中旬或4月中旬放松离鄂通道交通管制措施,一个半月以后输入地感染人数将累计增加93人或22人.

关键词：新型冠状病毒 SEIR模型基本再生数无症状感染者预测

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美罗培南对非结核分枝杆菌的体外抑菌效果评价

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结核病与胸部肿瘤 2019年第3期 191-196页

作者：于霞罗晶晶赵立平徐洋梁倩马异峰董玲玲黄海荣首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室耐药结核病研究北京市重点实验室101149 大连市友谊医院肿瘤内科

目的评价美罗培南(meropenem,MEM)对非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)的体外抑菌效果。方法收集首都医科大学附属北京胸科医院2015年1月至2016年12月分离的NTM临床分离株,共计207株。采用微孔板Alamar Blue法测定MEM... 详细信息

目的评价美罗培南(meropenem,MEM)对非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)的体外抑菌效果。方法收集首都医科大学附属北京胸科医院2015年1月至2016年12月分离的NTM临床分离株,共计207株。采用微孔板Alamar Blue法测定MEM对纳入的207株NTM临床分离株的体外抑菌效果。同时,评价其对46种N TM标准株[30株快生长分枝杆菌(rapidly growing mycobacterium,RGM)和16株慢生长分枝杆菌(slowly growing mycobacterium,SGM)]的体外抑菌情况。结果在30株RGM标准菌株中,26.7%(8/30)的菌种对M EM耐药。MEM对偶发和脓肿分枝杆菌临床分离株的耐药率分别为33.3%(11/33)和82.5%(33/40)。在16株SGM标准株,56.3%(9/16)的菌株对MEM耐药。在SGM临床分离株中,MEM对戈登分枝杆菌、胞内分枝杆菌、鸟分枝杆菌和堪萨斯分枝杆菌的耐药率分别依次为20.0%(2/10)、63.9%(23/36)、72.7%(16/22)和95.6%(43/45)。结论MEM对于大多数RGM菌种和部分SGM菌种都显示出一定的体外抑菌活性,其中对偶发分枝杆菌和戈登分枝杆菌则显示出相对较好的体外抑菌活性。

关键词：分枝杆菌,非典型性微生物敏感性试验结果评价(卫生保健) 美罗培南

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