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中国防痨杂志 2016年第10期38卷 869-873页

作者：王桂荣黄海荣首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室北京市耐药结核病研究重点实验室 101149

目前文献报道证实的非结核分枝杆菌（nontuberculous mycobacteria，NTM）及其亚群有170多种。人类接触的环境中NTM无处不在，包括自然界的水环境、城市供水系统、饮用水系统、灰尘和土壤等。环境中的NTM对于人类和动物是重要的条件致... 详细信息

目前文献报道证实的非结核分枝杆菌（nontuberculous mycobacteria，NTM）及其亚群有170多种。人类接触的环境中NTM无处不在，包括自然界的水环境、城市供水系统、饮用水系统、灰尘和土壤等。环境中的NTM对于人类和动物是重要的条件致病菌。为提高对NTM的认识，作者综述了NTM在环境中的分布和影响因素，以及减少NTM暴露量的方法等。

关键词：非结核分枝杆菌环境微生物学疾病传播综合预防

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评价高强度荧光噬菌体法在检测结核分枝杆菌对异烟肼、利福平和链霉素敏感性中的诊断价值

评价高强度荧光噬菌体法在检测结核分枝杆菌对异烟肼、利福平和链...

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中华医学会结核病学分会2016年全国结核病学术大会

作者：于霞谷蕴婷姜广路马异峰赵立平孙照刚黄海荣北京市结核病胸部肿瘤研究所首都医科大学附属北京胸科医院耐药结核病研究北京市重点实验室国家结核病临床实验室

目的评价高强度荧光噬菌体φ2GFP 10在结核分枝杆菌耐药性检测中的诊断价值.方法 φ2GFP 10是一种能够表达高强度绿色荧光蛋白的噬菌体,可以直接在荧光显微镜下观察药敏试验结果.以MGIT960药敏试验结果为金标准,评价荧光噬菌体药敏试...

目的评价高强度荧光噬菌体φ2GFP 10在结核分枝杆菌耐药性检测中的诊断价值.方法 φ2GFP 10是一种能够表达高强度绿色荧光蛋白的噬菌体,可以直接在荧光显微镜下观察药敏试验结果.以MGIT960药敏试验结果为金标准,评价荧光噬菌体药敏试验方法在1 28株结核分枝杆菌临床分离株中的诊断价值.结果以MGIT960药敏试验结果为金标准,荧光噬菌体法对异烟肼,利福平和链霉素耐药性检测的敏感性分别为100％,98.2％和89.3％,特异性分别为85.1％,98.6％和95.8％.荧光噬菌体法和MGIT960药敏试验在检测异烟肼,利福平和链霉素耐药性上的一致性分别为92.2％,98.4％和93.0％.结论荧光噬菌体法可以在2天报告利福平和链霉素的药敏试验结果,在3天内报告异烟肼的药敏试验结果,且检测三种药物的成本仅为20元/人份.荧光噬菌体药敏试验方法可以作为一种快速、经济的结核分枝杆菌药敏试验筛查方法.

关键词：

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中国肺结核患者中牛分枝杆菌的感染状况研究

中国肺结核患者中牛分枝杆菌的感染状况研究

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中国防痨协会2016年全国学术大会

作者：王桂荣姜广路陈素婷于霞王晓波赵立平马异峰董玲玲黄海荣 101149 首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室北京市耐药结核病研究重点实验室

目的确定牛分枝杆菌在中国肺结核患者中的感染状况.方法首先对源于2007-2009年全国耐药基线调查分离到的4069株分枝杆菌,通过对硝基苯甲酸培养基(PNB)和噻吩-2羧酸肼培养基(TCH)进行菌种初步鉴定,然后同时采用Spoligotyping技术和多位... 详细信息

目的确定牛分枝杆菌在中国肺结核患者中的感染状况.方法首先对源于2007-2009年全国耐药基线调查分离到的4069株分枝杆菌,通过对硝基苯甲酸培养基(PNB)和噻吩-2羧酸肼培养基(TCH)进行菌种初步鉴定,然后同时采用Spoligotyping技术和多位点PCR技术进行牛分枝杆菌鉴定.由于牛分枝杆菌在含丙酮酸钠的罗氏培养基上生长更旺盛,对来自北京胸科医院的1828个临床样品同时接种于普通罗氏培养基和含4.5 mg/ml丙酮酸钠的罗氏培养基上,对于在含丙酮酸钠的罗氏培养基上生长更旺盛的菌株通过多位点PCR技术进行牛分枝杆菌鉴定.结果全国耐药基线调查分离到的菌株中仅有1株被鉴定为BCG,该菌株的基因型为SB0120 (ST482);来自北京胸科医院的样品中未分离到牛分枝杆菌.结论牛分枝杆菌在中国肺结核患者中不具有重要公共卫生意义,所以在日常实验室检测和肺结核治疗中不需要特意考虑牛分枝杆菌.

关键词：肺结核牛分枝杆菌感染

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中国首株副瘰疬分枝杆菌临床分离株的生物学特征和毒力研究

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结核病与肺部健康杂志 2016年第1期5卷 27-31页

作者：王桂荣刘冠于霞陈素婷梁倩尚媛媛郑素华黄海荣首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室北京市耐药结核病研究重点实验室 101149 首都医科大学附属北京胸科医院流行病研究室 101149

目的对中国肺病患者体内首次分离到的1株副瘰疬分枝杆菌进行了生物学特征与毒力研究,以提高对该分枝杆菌的认识.方法 2013年对源于2007 2008年全国耐药基线调查的140株非结核分枝杆菌（NTM）,通过联合测定16S rRNA、16S～23S rRNA间隔... 详细信息

目的对中国肺病患者体内首次分离到的1株副瘰疬分枝杆菌进行了生物学特征与毒力研究,以提高对该分枝杆菌的认识.方法 2013年对源于2007 2008年全国耐药基线调查的140株非结核分枝杆菌（NTM）,通过联合测定16S rRNA、16S～23S rRNA间隔区（ITS）和hs筇5基因序列进行菌种鉴定,分离到1株副瘰疬分枝杆菌.通过开展一系列标准生化试验,包括生长试验、硝酸还原酶测定、芳基硫酸酯酶测定、碲酸钠还原试验、吐温水解试验、尿素酶试验,以及在50 mg/ml对硝基苯甲酸（PNB）、10 mg/ml噻吩-2-羧酸肼（TCH）、5％ NaCl和麦康凯琼脂上进行生长试验,阐明其生物学特征.通过Alamar blue微量稀释法测定其对利福平、乙胺丁醇、异烟肼、阿米卡星、磺胺甲恶唑、氧氟沙星、对氨基水杨酸、利福喷丁、卷曲霉素、头孢西丁、亚胺培南、米诺环素、多西环素、克拉霉素、阿奇霉素、美罗培南、甲氧苄氨嘧啶、利福布汀、利奈唑胺、链霉素、丙硫异烟胺、莫西沙星和左氧氟沙星共23种抗生素的药物敏感性.为了研究副瘰疬分枝杆菌的毒力,通过尾静脉和腹腔注射两种途径感染C57BL/6小鼠,在小鼠感染后的第2、4、8周取肺脏和脾脏检测细菌载量和病理组织学变化,确定其对小鼠的致病性.结果该株副瘰疬分枝杆菌在37℃生长旺盛,菌落光滑并呈半球形,呈黄至橘黄色.在体外对利福布丁、利福喷丁、克拉霉素、阿奇霉素、头孢西丁和莫西沙星敏感.在C57BL/6小鼠感染后的第2周,病理组织学结果显示小鼠肺组织出现局限性炎症反应,表现为外周支气管炎性渗出.在感染后的第4和第8周,肺组织表现为外周支气管炎性渗出伴有大量炎性细胞聚集,部分组织有肉芽肿生成,但无坏死.在小鼠感染的8周时间内,肺组织和脾组织中细菌载量呈逐渐上升趋势.结论该副瘰疬分枝杆菌在体外对利福布汀、利福喷丁、克拉霉素、阿奇霉素、头孢西丁和莫西沙星敏感;可在小鼠体内感染扩增,并可引起小鼠肺组织病变.

关键词：分枝杆菌,瘰疬药物敏感性试验实验,动物小鼠

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北京家族结核分枝杆菌鉴定方法的研究进展

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中国防痨杂志 2016年第2期38卷 148-153页

作者：郭立娟黄海荣高飞王桂荣内蒙古医科大学研究生学院呼和浩特010059 首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室北京市耐药结核病研究重点实验室内蒙古自治区第四医院

结核病仍是严重威胁人类健康的全球公共卫生问题之一。北京家族结核分枝杆菌是我国大部分地区流行的主要菌株。作者论述了插入序列IS6110-限制性片段长度多态性（IS6110-RFLP）、间隔区寡核苷酸分型（Spoligotyping）、长序列多态性（LS... 详细信息

结核病仍是严重威胁人类健康的全球公共卫生问题之一。北京家族结核分枝杆菌是我国大部分地区流行的主要菌株。作者论述了插入序列IS6110-限制性片段长度多态性（IS6110-RFLP）、间隔区寡核苷酸分型（Spoligotyping）、长序列多态性（LSP）以及单核苷酸多态性（SNP）等多种北京家族结核分枝杆菌分型技术，并讨论了各技术的优缺点，以便对北京家族结核分枝杆菌的鉴定提供可靠依据。

关键词：分枝杆菌,结核基因型

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脓肿分枝杆菌gyrA和gyrB基因突变与左氧氟沙星和莫西沙星耐药的相关性

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中华结核和呼吸杂志 2015年第7期38卷 507-510页

作者：陈素婷聂文娟尚媛媛梁倩付育红马异峰初乃惠黄海荣首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室耐药结核病研究北京市重点实验室 101149

目的分析脓肿分枝杆菌gyrA和gyrB基因的突变形式及其与左氧氟沙星和莫西沙星耐药的相关性.方法纳入菌株为2008至2012年首都医科大学附属北京胸科医院分离的、且经16SrRNA、rpoB基因、hsp65和ITS（Internal Transcribed Spacer）测序... 详细信息

目的分析脓肿分枝杆菌gyrA和gyrB基因的突变形式及其与左氧氟沙星和莫西沙星耐药的相关性.方法纳入菌株为2008至2012年首都医科大学附属北京胸科医院分离的、且经16SrRNA、rpoB基因、hsp65和ITS（Internal Transcribed Spacer）测序鉴定为脓肿分枝杆菌临床分离株.用微孔板阿尔玛蓝染色方法测定脓肿分枝杆菌临床分离株对左氧氟沙星和莫西沙星的***扩增临床分离株的gyrA和gyrB基因,并对扩增产物进行测序和序列比对分析.结果 70株脓肿分枝杆菌临床分离株,包括45株脓肿亚种和25株马赛亚种,其中68株对左氧氟沙星耐药（10株对莫西沙星耐药）,交叉耐药率为14.3％（10株/68株）.不论是脓肿亚种还是马赛亚种,所有临床分离株gyrA基因的喹诺酮耐药决定区（QRDR）序列第83位为丙氨酸,而gyrB基因QRDR第447位和464位分别是精氨酸和天冬酰胺.马赛亚种临床株的gyrB基因的第541位氨基酸不同于脓肿亚种临床株,存在苏氨酸置换成丝氨酸的亚种间氨基酸多态性,可用于脓肿分枝杆菌亚种鉴定,但未发现与左氧氟沙星和莫西沙星耐药相关的氨基酸突变.结论脓肿分枝杆菌gyrA和gyrB基因的突变形式与左氧氟沙星和莫西沙星耐药没有明确的相关性.

关键词：分枝杆菌属喹诺酮类基因

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CRISPR-Cas9系统在真核细胞领域内的研究进展

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标记免疫分析与临床 2016年第10期23卷 1218-1225页

作者：肖婧张宗德申阿东北京市结核病胸部肿瘤研究所首都医科大学附属北京胸科医院分子生物学实验室耐药结核病研究北京市重点实验室北京101149 首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所儿科学国家重点学科教育部儿科重大疾病研究重点实验室国家呼吸系统疾病临床医学研究中心儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室北京100045

CRISPR-Cas免疫系统在天然状态下保护细菌和古生菌免受外来质粒或噬菌体的入侵。研究者们根据Ⅱ型CRISPRCas系统开发了全新的基因编辑工具——CRISPR-Cas9,它利用与靶序列互补的向导RNA引导Cas9酶定点切割DNA,该技术具有设计简单、操作... 详细信息

CRISPR-Cas免疫系统在天然状态下保护细菌和古生菌免受外来质粒或噬菌体的入侵。研究者们根据Ⅱ型CRISPRCas系统开发了全新的基因编辑工具——CRISPR-Cas9,它利用与靶序列互补的向导RNA引导Cas9酶定点切割DNA,该技术具有设计简单、操作方便、特异性强、效率高等优势,成为新一代基因组编辑技术。本文综述了CRISPR-Cas系统的技术发展史、最新分类和作用原理,重点介绍了近几年来CRISPR-Cas9系统应用于真核细胞领域的研究进展。

关键词： CRISPR-Cas9系统真核细胞基因编辑基因调节

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四川盆地结核分枝杆菌群体遗传学特征的研究

四川盆地结核分枝杆菌群体遗传学特征的研究

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首届京津冀临床流行病学和循证医学协同发展促进会暨2016北京医学会临床流行病学和循证医学分会第二届学术年会

作者：李卫民李颖付育红原梅董玲玲黄海荣高基民首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室温州医科大学检验医学院生命科学学院浙江省模式生物技术与应用重点实验室

探讨在中国四川盆地流行的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)群体遗传学特征.结果表明北京谱系和欧美谱系MTB在四川盆地以“互相对抗”形式流行;两谱系MTB遗传分化存在差异;欧美谱系MTB的侵入可能与一次历史事件(约720年前... 详细信息

探讨在中国四川盆地流行的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)群体遗传学特征.结果表明北京谱系和欧美谱系MTB在四川盆地以“互相对抗”形式流行;两谱系MTB遗传分化存在差异;欧美谱系MTB的侵入可能与一次历史事件(约720年前的一次战争)有关。

关键词：结核分枝杆菌群体遗传学北京谱系欧美谱系

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四川盆地结核分枝杆菌群体遗传学特征的研究

四川盆地结核分枝杆菌群体遗传学特征的研究

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中国防痨协会2016年全国学术大会

作者：李卫民李颖付育红原梅董玲玲黄海荣高基民 101149 首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室温州医科大学检验医学院生命科学学院浙江省模式生物技术与应用重点实验室

目的:探讨在中国四川盆地流行的结核分枝杆菌群体遗传学特征. 方法:对收集自四川盆地(重庆和四川地区)的413株Mtb行长序列多态性(LSP)谱系鉴定;采用x2检验分析不同谱系Mtb在人群中的分布差异.对上述菌株行15位点数目可变串联重复序列... 详细信息

目的:探讨在中国四川盆地流行的结核分枝杆菌群体遗传学特征. 方法:对收集自四川盆地(重庆和四川地区)的413株Mtb行长序列多态性(LSP)谱系鉴定;采用x2检验分析不同谱系Mtb在人群中的分布差异.对上述菌株行15位点数目可变串联重复序列(VNTR)基因分型,评价各位点的分辨力.构建N-J树分析其系统进化;构建最小跨度树以模拟群体菌株的遗传结构;采用分子方差分析该地区不同谱系菌株的遗传分化;采用贝叶斯模型计算最近共祖年代. 结果:通过LSP可将413株Mtb菌株分为两大谱系,其中北京谱系占56.2％(232/413);欧美谱系占43.8％(181/413).两谱系Mtb在人群中的分布(性别、年龄、民族及耐药性)差异无统计学意义(P＞0.05).北京谱系Mtb的N-J树呈放射状分布,最小跨度树中有72.4％(168/232)的菌株被划分到同一"克隆复合群".欧美谱系Mtb的N-J树呈枝状分布,最小跨度树中呈现出多个"克隆复合群".北京谱系Mtb在重庆和四川两地区间有显著的遗传分化(FST=0.01891,P＜0.05),而欧美谱系Mtb遗传分化不显著(FST=0.00519,P＞0.05).欧美谱系Mtb中最大克隆复合群(共71株)的最近共祖年代为723年(95％CI:517～946年). 结论:北京谱系和欧美谱系Mtb在四川盆地以"互相对抗"形式流行;两谱系Mtb遗传分化存在差异;欧美谱系Mtb的侵入可能与一次历史事件(约720年前的一次战争)有关.

关键词：结核分枝杆菌长序列多态性群体遗传学地区差异

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四川盆地结核分枝杆菌群体遗传学特征研究

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中华流行病学杂志 2015年第4期36卷 374-378页

作者：李颖付育红原梅董玲玲黄海荣李卫民高基民温州医科大学检验医学院生命科学学院浙江省模式生物技术与应用重点实验室 325035 首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室

目的探讨四川盆地（重庆、四川地区）流行的结核分枝杆菌（MTB）群体遗传学特征。方法对413株源自四川盆地的MTB进行长序列多态性（LSP）谱系鉴定，采用3（2检验分析不同谱系MTB在人群中的分布差异。对菌株进行15位点数目可变串联重复... 详细信息

目的探讨四川盆地（重庆、四川地区）流行的结核分枝杆菌（MTB）群体遗传学特征。方法对413株源自四川盆地的MTB进行长序列多态性（LSP）谱系鉴定，采用3（2检验分析不同谱系MTB在人群中的分布差异。对菌株进行15位点数目可变串联重复序列基因分型，评价各位点的分辨力。构建N—J树分析其系统进化；构建最小跨度树以模拟群体菌株的遗传结构；采用分子方差分析不同谱系MTB的群体问遗传分化；采用贝叶斯模型计算菌株最近共祖年代。结果通过LSP可将413株MTB分为两大谱系，其中北京谱系占56．2％（232／413），欧美谱系占43．8％（181／413）。两谱系MTB在人群中的分布（性别、年龄、民族以及菌株耐药性）差异无统计学意义（P〉0．05）。北京谱系MTB的N—J树呈放射状分布，最小跨度树中有72．4％（168／232）的菌株被划分到同一“克隆复合群”；欧美谱系MTB的N—J树呈枝状分布，最小跨度树中呈现出多个“克隆复合群”。北京谱系MTB在该地区有显著的群体间遗传分化（F ST=0．01891，P〈0．05），而欧美谱系MTB群体间遗传分化不显著（F ST=0．00519，P〉0．05）。欧美谱系MTB中最大菌株复合群的最近共祖年代为723（95％CI：517-946）年。结论北京谱系和欧美谱系MTB在四川盆地以“互相对抗”形式流行；两谱系MTB的群体间遗传分化存在差异；欧美谱系MTB的侵入可能与一次历史事件（约720年前的战争）有关。

关键词：结核分枝杆菌长序列多态性欧美谱系群体遗传学

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