检索结果-内蒙古大学图书馆

2007年全国高性能计算学术年会

作者：陈虹夏芳郑纬民清华大学计算机科学与技术系北京市 100084 北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京市 100088 北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京市 100088 清华大学计算机科学与技术系北京市 100084

在大规模科学计算应用中,计算程序往往产生大量结构复杂、缺乏说明信息的数值模拟数据,这对于科学家组织和管理的组织与管理这些数据已经成为一个重要瓶颈问题。本文以典型数值模拟程序及其结果数据为应用背景,给出了面向数值模拟元数... 详细信息

在大规模科学计算应用中,计算程序往往产生大量结构复杂、缺乏说明信息的数值模拟数据,这对于科学家组织和管理的组织与管理这些数据已经成为一个重要瓶颈问题。本文以典型数值模拟程序及其结果数据为应用背景,给出了面向数值模拟元数据的定义与分类,提出了识别各种数据文件特征的方法。采用UNIX pthread线程编程技术,通过在数据访问接口中嵌入线程任务模块的方式,实现了元数据在线提取和自动入库功能,即在每个输出时间步输出计算结果到文件系统的同时,将元数据存储到数据库中。同时,还设计了一个科学计算元数据管理原型系统,用户通过Web页面可以浏览和查询元数据,并进一步获取和分析分布式的数值模拟数据,对其感兴趣的数据进行空间范围查询和物理量值域范围的查询和可视化,从而提高了对计算结果的分析和评估能力。

关键词：元数据科学计算数值模拟数据管理线程编程

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大规模并行计算机作业调度评价

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计算机工程与应用 2006年第10期42卷 79-83页

作者：罗红兵张晓霞魏勇北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京100080

大规模并行计算机的作业调度直接关系到其计算能力的发挥,因而相应的研究具有十分重要的意义。论文通过对国外现有作业调度评价体系的研究,建立了更能反映并行作业特点的作业调度策略评价体系,在此基础上设计并实现了一个作业模拟调度... 详细信息

大规模并行计算机的作业调度直接关系到其计算能力的发挥,因而相应的研究具有十分重要的意义。论文通过对国外现有作业调度评价体系的研究,建立了更能反映并行作业特点的作业调度策略评价体系,在此基础上设计并实现了一个作业模拟调度环境。模拟调度环境采用事件驱动的工作模式,支持FCFS、大作业优先、小作业优先、长作业优先、短作业优先、GANG等调度策略。模拟测试结果表明,GANG调度策略优于所有测试的空间共享调度策略;同时在空间共享调度策略中,短作业优先策略和大作业优先策略具有较好的性能。

关键词：大规模并行计算机作业调度调度评价

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有向图并行计算中一种新的结点调度算法

有向图并行计算中一种新的结点调度算法

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2006年全国高性能计算学术会议(HPC 2006)

作者：张爱清莫则尧北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京100088

在有向图并行计算中,给定图剖分后,如何设计结点调度方案使并行执行时间最短,是典型的NP完全问题.针对此问题,本文提出一种新的基于顺逆交替迭代技术的启示性调度算法,并给出该算法的并行实现.严格的理论分析证明,新算法在结点等权重的... 详细信息

在有向图并行计算中,给定图剖分后,如何设计结点调度方案使并行执行时间最短,是典型的NP完全问题.针对此问题,本文提出一种新的基于顺逆交替迭代技术的启示性调度算法,并给出该算法的并行实现.严格的理论分析证明,新算法在结点等权重的假设下,从任何初始调度方案出发,均可以收敛到局部最优解.使用500个处理器的模型测试和使用128个处理器的粒子输运实际应用测试表明,比较于当前有向图并行计算研究中广泛采用的多种调度算法,新算法调度效果改进显著.

关键词：有向图并行计算结点调度算法顺逆交替迭代技术

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多水平图排序算法在动态负载平衡中的应用

多水平图排序算法在动态负载平衡中的应用

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2006年全国高性能计算学术会议(HPC 2006)

作者：刘旭莫则尧曹小林中国工程物理研究院研究生部北京100088 北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京100088 北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京100088

本文将多水平图排序算法应用到动态负载平衡领域,提出一种具有V-循环结构的图剖分算法.该算法是一种线性时间复杂度的方法.在文中的4个算例中,这种多水平方法的剖分质量与当前质量最佳的剖分算法相当.另外针对负载变化,本文提出了一种... 详细信息

本文将多水平图排序算法应用到动态负载平衡领域,提出一种具有V-循环结构的图剖分算法.该算法是一种线性时间复杂度的方法.在文中的4个算例中,这种多水平方法的剖分质量与当前质量最佳的剖分算法相当.另外针对负载变化,本文提出了一种图重排序算法,在试验中有较好的结果.

关键词：多水平图排序算法图剖分算法图重剖分问题动态负载平衡

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激光成丝不稳定性三维并行数值模拟研究

激光成丝不稳定性三维并行数值模拟研究

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2006年全国高性能计算学术会议(HPC 2006)

作者：陈军莫则尧李斌郑春阳应用物理与计算数学研究所高性能计算中心&计算物理实验室北京100088 应用物理与计算数学研究所第四研究室北京100088

本文实现了全三维非线性流体力学与激光传播耦合并行模拟程序,用来研究高强度激光在稀疏等离子体中的激光成丝不稳定性.并行数值结果表明,在64台处理机上取得了较好的并行加速比.

关键词：并行计算成丝不稳定性等离子体激光成丝不稳定性三维并行

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LARED-P程序在JASMIN上的移植

LARED-P程序在JASMIN上的移植

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2006年全国高性能计算学术会议(HPC 2006)

作者：曹小林莫则尧张爱清北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心计算物理实验室北京100088

设计、集成了粒子量网格数据片类,以使得JASMIN框架可支持粒子类模拟方法.设计、实现了LARED-P时间步进算法类和用户网格片数值子程序类.通过组合使用这几个类和JASMIN底层类库,开发了面向对象的粒子云网格法LARED-P程序.与原LARED-P程... 详细信息

设计、集成了粒子量网格数据片类,以使得JASMIN框架可支持粒子类模拟方法.设计、实现了LARED-P时间步进算法类和用户网格片数值子程序类.通过组合使用这几个类和JASMIN底层类库,开发了面向对象的粒子云网格法LARED-P程序.与原LARED-P程序相比,新程序具有负载平衡功能、重启动功能,而且基于网格片的数据结构能有效提高Cache命中率.在64个处理器上,新程序模拟包含3百万个网格、2千万个粒子的物理模型时,获得了80的并行效率.

关键词： LARED-P JASMIN 粒子量网格数据片软件测试

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微喷射粒子团簇探测算法及其应用

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计算物理 2006年第4期23卷 441-446页

作者：张颖陈其峰曹小林蔡灵仓陈栋泉卢铁城四川大学物理系辐射物理及技术教育部重点实验室四川成都610064 流体物理研究所冲击波物理与爆轰波物理实验室四川绵阳621900 北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心计算物理实验室北京100088

在团簇多重标号技术基础上,提出了团簇探测的新算法,并以此作为大尺度二维和三维分子动力学模拟冲击加载金属材料微喷射粒子团簇分析的子程序.以二维为例描述了算法的逻辑结构,测试分析了算法的运行效率,并将其应用到二维分子动力学模... 详细信息

在团簇多重标号技术基础上,提出了团簇探测的新算法,并以此作为大尺度二维和三维分子动力学模拟冲击加载金属材料微喷射粒子团簇分析的子程序.以二维为例描述了算法的逻辑结构,测试分析了算法的运行效率,并将其应用到二维分子动力学模拟冲击加载金属Cu和Al微喷射粒子的团簇统计分析中,对微喷射粒子团簇尺寸分布得到一些规律性认识.

关键词：多重标号技术微喷团簇探测算法

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有向图并行计算中的多目标剖分算法

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计算机学报 2005年第12期28卷 2045-2051页

作者：金光浩莫则尧中国工程物理研究院研究生部北京100088 北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京100088

在以离散网格为基础的某些数值模拟中,网格间的数据依赖关系可以抽象为有向图.如何剖分这些有向图成多个子图,将各子图对应的数值模拟任务映射到不同的处理机,是该类数值模拟并行计算的基础.剖分算法中,需要综合考虑连通性、并行度、负... 详细信息

在以离散网格为基础的某些数值模拟中,网格间的数据依赖关系可以抽象为有向图.如何剖分这些有向图成多个子图,将各子图对应的数值模拟任务映射到不同的处理机,是该类数值模拟并行计算的基础.剖分算法中,需要综合考虑连通性、并行度、负载平衡、通信开销四个目标.文章在传统有向图剖分算法的基础上,提出了一个权衡这四个目标的有向图多目标剖分区域分解算法.应用于二维非结构网格上的柱对称中子输运并行计算中,通量扫描并行算法在该区域剖分算法上获得的并行效率比原来的无向图区域剖分算法高50%以上.

关键词：有向图图剖分并行计算

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短距离作用势分子动力学并行计算研究

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华中科技大学学报（自然科学版） 2005年第z1期33卷 5-7页

作者：曹小林莫则尧北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心计算物理实验室北京100088

针对传统短距离作用势中链表存储数据结构所导致的非规则数据访问问题,提出了块-单元紧凑存储数据结构的解决方法.设计并实现了一个集成以上数据结构、基于实测的高维动态负载平衡方法的短距离作用势分子动力学并行软件.该软件已应用于... 详细信息

针对传统短距离作用势中链表存储数据结构所导致的非规则数据访问问题,提出了块-单元紧凑存储数据结构的解决方法.设计并实现了一个集成以上数据结构、基于实测的高维动态负载平衡方法的短距离作用势分子动力学并行软件.该软件已应用于高温高压微喷射模拟和液晶相模拟两个领域,可以在几百个处理机上模拟包含1×106～1×108个粒子的二维和三维问题,其中程序的并行效率在80%以上.与传统存储数据结构方法相比,本方法提高执行性能5%,其性能约为所用处理机峰值性能的15%以上.

关键词：分子动力学块-单元紧凑存储数据结构并行软件

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多分辨率并行等值面绘制

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计算机应用 2005年第9期25卷 2188-2191页

作者：艾志玮王弘堃北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京100088

文中介绍一个多分辨率并行等值面绘制系统的设计与实现。通过显示调度策略实现基于多层次细节的实时等值面绘制。着重讲述并行处理、网格简化和多分辨率显示技术。实验结果表明,该系统能在并行分布式环境下动态生成等值面的多分辨率模型... 详细信息

文中介绍一个多分辨率并行等值面绘制系统的设计与实现。通过显示调度策略实现基于多层次细节的实时等值面绘制。着重讲述并行处理、网格简化和多分辨率显示技术。实验结果表明,该系统能在并行分布式环境下动态生成等值面的多分辨率模型,实现等值面的远程快速绘制。

关键词：并行处理可视化等值面多层次细节

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