检索结果-内蒙古大学图书馆

遗传 2021年第2期43卷 142-159页

作者：李金玉杨姗崔玉军王涛滕越天津大学生命科学学院天津300110 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所北京100071 病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

具有最小基因组的细菌只包含维持自我生命复制所必需的基因,其作为一种潜在的工业生产平台具有诸多优势。由于高通量DNA测序和合成技术的发展,目前已经构建了多种缩减基因组的菌株。本文首先介绍了最小基因组的概念,其次总结了细菌必需... 详细信息

具有最小基因组的细菌只包含维持自我生命复制所必需的基因,其作为一种潜在的工业生产平台具有诸多优势。由于高通量DNA测序和合成技术的发展,目前已经构建了多种缩减基因组的菌株。本文首先介绍了最小基因组的概念,其次总结了细菌必需基因的相关研究进展,然后梳理了人工缩减与合成微生物基因组的相关工作,最后探讨了在设计和组装基因组的过程中遇到的技术障碍和限制,以期为人工合成基因组的实验与应用提供理论参考。

关键词：细菌最小基因组必需基因合成生物学人工设计

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云南省西部地区宿主和媒介感染伯氏疏螺旋体的基因多样性调查与分析

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中国人兽共患病学报 2024年第3期40卷 208-213页

作者：何志海和仙孙毅蒋宝贵邵宗体张云李玉琼浦恩念姚明国王帆别双双高子厚江佳富杜春红云南省地方病防治所云南省自然疫源性疾病防控重点实验室大理671000 深圳市光明区疾病预防控制中心深圳518106 云南省迪庆州疾病预防控制中心香格里拉674400 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的了解云南省西部地区宿主动物和媒介蜱感染伯氏疏螺旋体的基因多样性,为进一步掌握该地区莱姆病菌株的特性奠定基础。方法对采用伯氏疏螺旋体5S~23S rRNA间隔区基因筛查阳性的云南西部地区采集的家畜、小型兽类、蜱虫样本,进行伯氏... 详细信息

目的了解云南省西部地区宿主动物和媒介蜱感染伯氏疏螺旋体的基因多样性,为进一步掌握该地区莱姆病菌株的特性奠定基础。方法对采用伯氏疏螺旋体5S~23S rRNA间隔区基因筛查阳性的云南西部地区采集的家畜、小型兽类、蜱虫样本,进行伯氏疏螺旋体鞭毛蛋白基因(FLA基因)和16S rRNA基因的检测,综合分析病原体的基因信息,了解当地流行株的生物学特性及流行特征。结果共检测301份样本,共检出7种基因型伯氏疏螺旋体,其中宿主动物共检出5种:***(阿弗西尼疏螺旋体)、***(伽氏疏螺旋体)、*** s.s.(狭义伯氏疏螺旋体)、***(日本疏螺旋体)、***(法雷斯疏螺旋体);媒介蜱检出7种:***(阿弗西尼疏螺旋体)、***(伽氏疏螺旋体)、*** s.s.(狭义伯氏疏螺旋体)、***(日本疏螺旋体)、***(法雷斯疏螺旋体)、***(中华基因型伯氏疏螺旋体)及未定种Borrelia sp.。***、***和*** s.s.为优势流行株,占总阳性的85.04%(256/301)。不同地区、不同来源的相同基因型株基因序列存在种内差异,同一地区的宿主和媒介中检出的相同基因型螺旋体具有较高的同源性和较近的遗传进化关系。结论云南西部地区宿主和媒介感染伯氏疏螺旋体基因型具有较高的多样性特征,存在多种致病基因型,给当地人群的健康造成一定危害,需加强防范。

关键词：云南西部伯氏疏螺旋体宿主动物蜱多样性

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CRF01_AE/CRF07_BC重组毒株近似全长基因组序列和系统进化分析

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中华医院感染学杂志 2023年第12期33卷 1761-1768页

作者：刘志朱博赵锦李思其张冬施玉婷韩芹芹李林昆明理工大学生命科学与技术学院云南昆明650500 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物与生物安全国家重点实验室北京100071 深圳市疾病预防控制中心广东深圳518055

目的鉴定我国深圳地区人类免疫缺陷病毒-Ⅰ型(HIV-1)新型二代毒株(CRF01_AE/CRF07_BC),了解重组毒株的流行特征及新型重组模式。方法对深圳市2011-2016年新确诊的未接受抗逆转录病毒治疗的HIV-1感染者血浆样本进行近似全长基因组扩增和... 详细信息

目的鉴定我国深圳地区人类免疫缺陷病毒-Ⅰ型(HIV-1)新型二代毒株(CRF01_AE/CRF07_BC),了解重组毒株的流行特征及新型重组模式。方法对深圳市2011-2016年新确诊的未接受抗逆转录病毒治疗的HIV-1感染者血浆样本进行近似全长基因组扩增和测序,选取第一代重组毒株作为母本的第二代独特重组毒株作为研究对象;获得的近似全长基因组序列使用Quality Control工具进行质量检测和基因型初步分析,基于近似全长序列使用最大似然法构建系统进化树;随后使用jpHMM和RIP工具进行重组断点分析,并构建Neighbor-Joining系统进化树验证重组断点,并对来自不同母本的重组片段进行同源性分析。结果从我国深圳地区HIV-1感染者中发现了两种新型二代独特重组毒株(CRF01_AE/CRF07_BC):LS13810和LS4017并获得其近似全长基因组序列;其中LS13810近似全长基因组以CRF01_AE为骨架,分别在病毒的pol和tat区插入两个来自于CRF07_BC的片段;而LS4017近似全长基因组的5′半分子来源于CRF07_BC,而3′半分子主要来源于CRF01_AE,3′半分子的gp120区插入了部分CRF07_BC片段。结论深圳市已经出现了完全由一代重组毒株重组形成的第二代独特重组毒株,重组毒株正在向更加复杂的形式演变,当地乃至我国均亟需建立能准确监测重组毒株发生和流行情况的分子监测策略,以应对毒株重组模式变化和重组毒株流行为HIV-1感染的精准防控和诊断、治疗带来的挑战。

关键词：人类免疫缺陷病毒近似全长基因组独特重组毒株亚型系统进化分析

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鼠疫耶尔森菌核酸检测试剂国家参考品的研制

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中国生物制品学杂志 2024年第10期37卷 1185-1189,1199页

作者：张园园闫子恒赵爱华杨瑞馥赵勇魏东中国食品药品检定研究院国家卫生健康委员会生物技术检定方法及其标准化重点实验室北京102629 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的研制鼠疫耶尔森菌(以下简称鼠疫菌)核酸检测试剂国家参考品,以期用于鼠疫菌核酸检测试剂的评价和质量控制。方法选择5株鼠疫菌[EV株、0614F株、otten株、Tjiusidej(R)株、田鼠型201株]和10株阴性菌(3株小肠结肠炎耶尔森菌、牛种布鲁... 详细信息

目的研制鼠疫耶尔森菌(以下简称鼠疫菌)核酸检测试剂国家参考品,以期用于鼠疫菌核酸检测试剂的评价和质量控制。方法选择5株鼠疫菌[EV株、0614F株、otten株、Tjiusidej(R)株、田鼠型201株]和10株阴性菌(3株小肠结肠炎耶尔森菌、牛种布鲁菌104M株、炭疽芽孢杆菌、伤寒沙门菌、土拉热弗朗西丝菌LVS株、假结核耶尔森菌、霍乱弧菌和志贺菌),经培养、收获、灭活,获得参考品原液,进行普通PCR扩增法验证后,制备成1套由5支阳性参考品、10支阴性参考品、1支最低检出限参考品(EV株阳性参考品经冻干制备而成)和1支重复性参考品(制备方法同最低检出限参考品)组成的国家参考品。采用荧光定量PCR法检测国家参考品的阴阳性符合率、均匀性和稳定性,并组织4家单位进行协作验证。结果阳性参考品原液经普通PCR扩增,均可见相应目的基因条带;阴性参考品原液未扩增出相应基因条带。荧光定量PCR法检测国家参考品阴阳性符合率均为100%。重复3次检测10支最低检出限参考品的3a基因Ct值差异无统计学意义(F=1.567,P=0.193)。与未经冻融的参考品比较,反复冻融3次的最低检出限参考品及阳性参考品3a基因Ct值差异无统计学意义(t分别为0.416和0.079,P均>0.05)。与未经高温保存的参考品比较,37℃放置5 d的最低检出限参考品Ct值差异有统计学意义(t=7.109,P=0.002),4和25℃条件下差异无统计学意义(t分别为0.341和0.751,P均>0.05);4、25、37℃放置5 d的阳性参考品Ct值差异均无统计学意义(t分别为2.442、0.373和-0.043,P均>0.05)。4家单位检测阳性和阴性参考品的符合率均为100%;2家单位检测最低检出限参考品的最低检出限为1×10^(2)个/mL,另2家为1×10^(3)个/mL;4家单位对重复性参考品检测结果的CV值<10.0%。结论本研究研制的鼠疫菌核酸检测试剂国家参考品具有良好的均匀性和冻融稳定性,于4和25℃下放置具有良好的加速稳定性,可用于鼠疫菌核酸检测试剂的评价和质量控制。

关键词：鼠疫耶尔森菌核酸检测试剂国家参考品

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FoxO1在小鼠感染流感病毒H1N1中的作用及机制

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免疫学杂志 2022年第2期38卷 145-150页

作者：李佳佳宫赛赛何志利孙娅坤程洋袁顺宗罗德炎吕树娟王慧安徽医科大学基础医学院合肥230032 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 中国人民解放军总医院第五医学中心北京100071

目的探讨叉头盒转录因子O1(forkhead box O1,FoxO1)在小鼠抵抗流感病毒H1N1感染中发挥的作用及机制。方法用琼脂糖凝胶电泳鉴定小鼠的基因型后,将小鼠分为2组:条件性敲除NKp46^(+)细胞中FoxO1基因的Foxo1^(△NK)组小鼠,以及对照组WT小... 详细信息

目的探讨叉头盒转录因子O1(forkhead box O1,FoxO1)在小鼠抵抗流感病毒H1N1感染中发挥的作用及机制。方法用琼脂糖凝胶电泳鉴定小鼠的基因型后,将小鼠分为2组:条件性敲除NKp46^(+)细胞中FoxO1基因的Foxo1^(△NK)组小鼠,以及对照组WT小鼠;2组小鼠使用滴鼻法同1天感染流感病毒H1N1,每天记录小鼠体质量及2组小鼠的死亡情况;在2组小鼠体质量及状态差异明显的第10天取样,HE染色法观察肺组织病理;Luminex液相芯片技术检测肺组织匀浆上清中36种细胞因子的表达情况;流式细胞术检测肺组织免疫细胞的比例变化。结果与WT组相比,感染流感病毒后Foxo1^(△NK)组小鼠死亡率增加,体质量下降更加严重;肺组织病理显示炎症反应减弱;肺组织匀浆上清中的细胞因子表达水平下降,ENA-78、IFN-α、IL-4、IL-5显著降低;肺组织免疫细胞中CD3^(+)NKp46^(+)NKT细胞比例显著下降。结论FoxO1基因的缺失加重了小鼠流感感染进程,可能是通过抑制依赖FoxO1基因调控的CD3^(+)NKp46^(+)NKT细胞相关免疫反应。

关键词：叉头盒转录因子O1 NKT细胞甲型流感病毒免疫反应

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创伤弧菌天然溶血素的制备及其活性研究

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昆明理工大学学报（自然科学版） 2023年第3期48卷 136-144页

作者：王亚茹凤梓涵李世青徐健皓袁兵王景林刘丽袁媛昆明理工大学生命科学与技术学院云南昆明650500 军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 中国人民解放军第96110部队医院疾病预防控制科宁夏银川750021

创伤弧菌溶血素(*** Hemolysin, VVH)是创伤弧菌重要的致病因子之一,但目前国内外重组表达的VVH多为包涵体形式.本研究建立了创伤弧菌培养上清中分泌型溶血素的纯化制备方法,并评价了胆固醇及雌二醇对天然VVH溶血活性的影响,为进一步深... 详细信息

创伤弧菌溶血素(*** Hemolysin, VVH)是创伤弧菌重要的致病因子之一,但目前国内外重组表达的VVH多为包涵体形式.本研究建立了创伤弧菌培养上清中分泌型溶血素的纯化制备方法,并评价了胆固醇及雌二醇对天然VVH溶血活性的影响,为进一步深入研究VVH蛋白的生物学功能及致病机制奠定了基础.研究采用硫酸铵沉淀法结合脱盐柱、阴离子层析及疏水相互作用纯化制备出天然VVH,用溶血试验验证了蛋白活性,评价了胆固醇、雌二醇对创伤弧菌YJ016培养上清以及天然VVH溶血活性的影响.结果显示:从创伤弧菌培养上清中纯化制备的天然VVH纯度较高,其具有良好的溶血活性(2μg/HU),100μg/mL的胆固醇或雌二醇均能有效抑制VVH的溶血活性.本研究成功建立了制备天然VVH的有效方法,为创伤弧菌重症感染的致病机制、防控与治疗研究奠定了基础,同时对其他致病弧菌溶血素的制备也具有借鉴意义.

关键词： VVH 天然蛋白纯化溶血活性胆固醇雌二醇

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凝血相关分子在病毒感染方面的研究进展

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病毒学报 2021年第4期37卷 1011-1017页

作者：李佳佳罗德炎王慧安徽医科大学合肥230032 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

从生物进化角度,天然免疫系统、凝血系统、获得性免疫系统依次产生,且三者存在千丝万缕的联系。以病毒为研究对象对凝血系统作为免疫系统的一个独立部分进行研究,分两部分:感染初期,通过对凝血系统的调控来加强天然免疫和获得性免疫的对... 详细信息

从生物进化角度,天然免疫系统、凝血系统、获得性免疫系统依次产生,且三者存在千丝万缕的联系。以病毒为研究对象对凝血系统作为免疫系统的一个独立部分进行研究,分两部分:感染初期,通过对凝血系统的调控来加强天然免疫和获得性免疫的对话,以此"通畅气血""增强免疫力",清除体内病毒;感染末期合并细菌感染,对凝血系统进行快速干预,既调动该系统自身的免疫力,也疏通天然免疫和获得性免疫的交流通道,有效逆转DIC状态挽救生命,为此,首先要了解各凝血相关分子在抗病毒感染中的作用。本综述分别介绍了多种病毒侵入后,所导致机体凝血功能紊乱的特点,以及在感染过程中凝血相关分子与免疫关联性特征,即病毒毒力分子如何通过调节凝血相关分子的表达,来影响免疫细胞的功能。同时,病毒毒力因子导致免疫系统的改变,又是如何间接影响凝血相关反应。将为包括新型冠状病毒在内的所有病毒的防控提供新的思路。

关键词：病毒感染凝血因子炎症免疫

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动物鼠疫周期流行的生态位影响因素研究进展

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中国人兽共患病学报 2021年第6期37卷 556-562页

作者：秦婧靓杨瑞馥崔玉军病原微生物生物安全国家重点实验室军事医学研究院微生物流行病研究所北京100071 安徽医科大学基础医学院合肥230032

鼠疫是由鼠疫耶尔森菌引发的烈性传染病,曾在历史上发生过3次大规模的流行,导致数亿人死亡。作为鼠疫自然疫源地最丰富的国家之一,中国拥有独特的鼠疫研究资源。在鼠疫自然疫源地中,动物间鼠疫呈现流行与静息周期性交替的特征。了解其... 详细信息

鼠疫是由鼠疫耶尔森菌引发的烈性传染病,曾在历史上发生过3次大规模的流行,导致数亿人死亡。作为鼠疫自然疫源地最丰富的国家之一,中国拥有独特的鼠疫研究资源。在鼠疫自然疫源地中,动物间鼠疫呈现流行与静息周期性交替的特征。了解其转换机制对鼠疫防控具有重要意义。现有研究表明,疫源地生态位变化是导致动物间流行周期性转换的可能触发因素。本文从宿主动物、蚤类媒介、土壤、鼠疫耶尔森菌及人类活动5个主要方面,梳理总结了鼠疫自然疫源地生态位变化与动物间鼠疫周期性流行的相关性研究进展,以期为鼠疫防控工作提供借鉴。

关键词：鼠疫鼠疫耶尔森菌疫源地生态位流行期静息期

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质粒基因注释可视化系统VPA V1.0的研建

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军事医学 2022年第3期46卷 167-172页

作者：穆凯孙岩松周冬生赵月峨杨慧盈殷喆王鹏军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的建立临床医学研究中便捷易用的质粒基因注释可视化系统,用于直观展示质粒结构与基因分布。方法运用Perl语言编写VPA系统4个主要模块(文件配置模块、颜色系统模块、图形生成模块和出错帮助模块),生成Perl脚本***。结果构建了质粒基... 详细信息

目的建立临床医学研究中便捷易用的质粒基因注释可视化系统,用于直观展示质粒结构与基因分布。方法运用Perl语言编写VPA系统4个主要模块(文件配置模块、颜色系统模块、图形生成模块和出错帮助模块),生成Perl脚本***。结果构建了质粒基因注释可视化系统VPA,该系统可实现多种类别、不同长度质粒的基因注释可视化显示,展示信息丰富全面、操作简单便捷。结论VPA系统可适用于目前细菌研究中常见的大部分质粒基因注释工作,为细菌的比较基因组学和结构基因组学提供了更直观的图像展示,并为其他相关可视化系统的开发提供了参考模型。

关键词： VPA系统质粒基因注释可视化

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下调自噬相关蛋白ATG4B抑制贝氏柯克斯体细胞内增殖

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军事医学 2022年第8期46卷 569-575页

作者：张家宁付梦姣焦俊欧阳譞于永慧赵明亮张珊温博海熊小路孙岩松军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的研究宿主细胞自噬相关基因4B(ATG4B)对贝氏柯克斯体胞内生长繁殖的影响。方法用ATG4B特异小干扰RNA(siRNA)处理宿主细胞(THP-1和Vero),以非特异siRNA和无siRNA处理的细胞为对照;逆转录实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和Western印迹检测抑... 详细信息

目的研究宿主细胞自噬相关基因4B(ATG4B)对贝氏柯克斯体胞内生长繁殖的影响。方法用ATG4B特异小干扰RNA(siRNA)处理宿主细胞(THP-1和Vero),以非特异siRNA和无siRNA处理的细胞为对照;逆转录实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和Western印迹检测抑制效果;Western印迹分析细胞自噬标识蛋白(p62和LC3)的量变;qRT-PCR检测贝氏柯克斯体感染细胞中细菌增殖水平;共聚焦显微镜观察贝氏柯克斯体感染细胞中细菌寄生囊泡发育状况。结果与对照组比较,ATG4B特异siRNA处理组的细胞自噬标识蛋白p62和LC3-Ⅱ明显增多,细菌繁殖量更低,细菌寄生囊泡为散在分布小囊泡而不是单一成熟大囊泡。结论宿主细胞ATG4B表达下调可部分阻断自噬,自噬的部分阻断使贝氏柯克斯体寄生囊泡发育受阻,进而抑制贝氏柯克斯体胞内生长繁殖,为阐明宿主细胞的自噬促进贝氏柯克斯体繁殖的致病机制提供了新的依据。

关键词：贝氏柯克斯体自噬相关基因4B 小干扰RNA 胞内寄生感染细胞增殖

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