检索结果-内蒙古大学图书馆

生物化学与生物物理进展 2023年第9期50卷 2175-2184页

作者：马斐越李慧刘雪梅台福敏邵宁生高波郑晓飞军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所北京市放射生物学重点实验室北京100850 军事科学院军事医学研究院军事认知与脑科学研究所北京100850

目的研究肝癌细胞特异性膜蛋白VASN(vasorin)的核酸适配体V4-2与靶向端粒酶逆转录酶(human telomerase reverse transcriptase,hTERT)的脱氧核酶(DNAzyme,Dz)偶联形成的偶联物V4-2-Dz在体外和肝癌细胞内的靶RNA切割活性,为脱氧核酶递送... 详细信息

目的研究肝癌细胞特异性膜蛋白VASN(vasorin)的核酸适配体V4-2与靶向端粒酶逆转录酶(human telomerase reverse transcriptase,hTERT)的脱氧核酶(DNAzyme,Dz)偶联形成的偶联物V4-2-Dz在体外和肝癌细胞内的靶RNA切割活性,为脱氧核酶递送提供新策略。方法Mfold网站预测V4-2-Dz的二级结构,通过体外切割实验检测V4-2-Dz的切割活性,通过流式细胞术和激光共聚焦实验检测V4-2-Dz和肝癌细胞HepG2结合的能力,利用RT-qPCR和MTT法分析V4-2-Dz作用于HepG2细胞对h TERT mRNA表达水平和细胞增殖的影响。结果体外切割实验表明,V4-2-Dz具有切割hTERT RNA活性;流式细胞术和激光共聚焦实验结果显示,V4-2-Dz可以特异结合并进入HepG2细胞,V4-2-Dz可显著降低HepG2细胞中hTERT mRNA水平并抑制细胞增殖。结论VASN蛋白的核酸适配体与端粒酶逆转录酶的脱氧核酶偶联物V4-2-Dz具有靶向肝癌细胞递送和切割活性,基于适配体和脱氧核酶的偶联物为肿瘤药物研究提供新的思路。

关键词： VASN蛋白适配体端粒酶逆转录酶脱氧核酶肝癌

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基于机器学习的在体电子顺磁共振波谱分类和辐射剂量预测方法研究

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生物医学工程学杂志 2024年第5期41卷 995-1002页

作者：熊广为陈博马蕾贾泷澎陈淑年吴可宁静朱斌郭俊旺军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所北京100850 长安大学智能制造系统研究所西安710061 北京市放射生物学重点实验室北京100850

核与辐射突发事件发生后,在体电子顺磁共振(in-vivo EPR)方法可对伤员辐射剂量进行现场、快速、无创检测。对in-vivo EPR波谱分析,目前常采用人工标记峰值并计算信号强度,存在工作量大、受主观因素干扰等问题。本研究利用支持向量机(SVM... 详细信息

核与辐射突发事件发生后,在体电子顺磁共振(in-vivo EPR)方法可对伤员辐射剂量进行现场、快速、无创检测。对in-vivo EPR波谱分析,目前常采用人工标记峰值并计算信号强度,存在工作量大、受主观因素干扰等问题。本研究利用支持向量机(SVM)技术,建立了一种对in-vivo EPR波谱进行自动分类识别的方法,可批量自动识别并筛除in-vivo EPR测量时因振动、牙表面水干扰而产生的无效波谱。本研究利用遗传算法优化神经网络(GA-BPNN)建立了一种波谱分析方法,可对in-vivo EPR波谱中的辐射诱发信号进行自动识别,并预测伤员受到辐射的剂量。实验结果表明,本研究建立的SVM和GA-BPNN波谱处理方法可有效地完成in-vivo EPR波谱自动分类和剂量预测,可满足核事故应急剂量评估的需求。本研究探索了机器学习方法在电子顺磁共振(EPR)波谱处理领域的应用,提高了EPR波谱处理的智能化水平,为提升大批量EPR波谱处理效率提供了支撑。

关键词：在体电子顺磁共振辐射剂量波谱分类支持向量机遗传算法优化神经网络

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snoRNA在电离辐射诱导的DNA损伤中的作用及研究进展

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中华放射医学与防护杂志 2024年第5期44卷 450-455页

作者：邓佳荣张文成沈丽萍王治东南华大学衡阳医学院军事科学院研究生协作培养基地衡阳421001 军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所放射生物学研究室北京100850

核仁小RNA(small nucleolus RNA,snoRNA)是一类在真核生物中普遍存在的非编码RNA,根据其结构特征,可分为两大类:box C/D snoRNA和box H/ACA snoRNA,分别介导RNA 2′⁃O⁃甲基化和假尿嘧啶化修饰。近期研究发现,snoRNA还影响mRNA前体(pre⁃m... 详细信息

核仁小RNA(small nucleolus RNA,snoRNA)是一类在真核生物中普遍存在的非编码RNA,根据其结构特征,可分为两大类:box C/D snoRNA和box H/ACA snoRNA,分别介导RNA 2′⁃O⁃甲基化和假尿嘧啶化修饰。近期研究发现,snoRNA还影响mRNA前体(pre⁃mRNA)的可变剪接,能够通过生成miRNA来介导基因沉默,并通过与蛋白质相互作用调节其功能活性。在电离辐射的生物效应中,DNA损伤与修复过程是至关重要的生物学基础。然而,目前关于snoRNA在电离辐射引起的DNA损伤中的作用的研究还相当有限。本综述旨在概述snoRNA的生物学功能及其在电离辐射诱导的DNA损伤修复中可能的调控角色,以期为探究snoRNA的功能及机制提供新思路。

关键词：核仁小RNA 电离辐射 DNA损伤反应

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基于模糊多目标决策的辐射探测器抛投方案优选

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机械设计与研究 2024年第5期40卷 223-228页

作者：贾泷澎马蕾熊广为陈博吴可宁静朱斌郭俊旺军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所北京放射生物学重点实验室(No.BZ0325) 北京100850 长安大学智能制造系统研究所西安710064

针对核与辐射环境应急监测中新型智能化仪器研制需求,本文将模糊层次分析法、熵值法和改进的灰色综合关联分析法三者结合,提出了一种组合赋权和改进的灰色关联分析综合评价方法,对多个辐射探测器的抛投装置最优设计进行了模糊多目标决... 详细信息

针对核与辐射环境应急监测中新型智能化仪器研制需求,本文将模糊层次分析法、熵值法和改进的灰色综合关联分析法三者结合,提出了一种组合赋权和改进的灰色关联分析综合评价方法,对多个辐射探测器的抛投装置最优设计进行了模糊多目标决策。通过对抛投装置建立多层次评价模型,采用层次分析法确定主观权重、熵值法确定客观权重,将两者组合赋权得到各层以及相关指标的组合权重,运用具有区间模糊数的灰色关联法确定关联度系数,最终计算出各方案的灰色综合关联度评价值,以此评价得出最优抛投方案。利用此方法,定量的反映出各层因素间的相互关系,解决了辐射抛投装置多个指标方案优选中的相互影响性问题,实现了对抛投装置的综合评价,并验证了该模型在最优抛投装置选择中的可行性。

关键词：辐射探测器抛投装置模糊层次分析法(FAHP) 熵值法(EWM) 灰色综合关联分析(GRA)

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利用CRISPR/Cas9系统建立长链非编码RNA SNHG1基因敲除细胞系并研究其功能

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军事医学 2023年第9期47卷 668-673页

作者：王田田台福敏葛常辉郑晓飞付汉江军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所放射生物学北京市重点实验室北京100850

目的利用CRISPR/Cas9介导的同源定向修复机制构建长链非编码RNA(lncRNA)核仁小分子RNA宿主基因1(SNHG1)稳定敲除的A549细胞系,并进行功能研究。方法设计靶向SNHG1基因的小向导RNA(sgRNA),将其克隆到LentiCRISPR v2质粒中,构建Cas9‐sgSN... 详细信息

目的利用CRISPR/Cas9介导的同源定向修复机制构建长链非编码RNA(lncRNA)核仁小分子RNA宿主基因1(SNHG1)稳定敲除的A549细胞系,并进行功能研究。方法设计靶向SNHG1基因的小向导RNA(sgRNA),将其克隆到LentiCRISPR v2质粒中,构建Cas9‐sgSNHG1质粒。以A549细胞基因组DNA为模板,PCR扩增5′同源臂(5′Arm)和3′同源臂(3′Arm)序列,以pEGFP‐Blast质粒为模板,PCR扩增pEGFP‐Blast‐polyA序列;利用重叠PCR将3个序列连接为5′Arm‐pEGFP‐Blast‐polyA‐3′Arm,通过Gibson克隆将其连接到pUC18质粒上,构建SNHG1同源重组模板质粒。将构建成功的两个重组质粒共转染A549细胞,用杀稻瘟菌素(Blast)筛选稳定插入pEGFP‐Blast‐polyA的细胞株,挑取单克隆。实时荧光定量PCR(qPCR)检测敲除效率,CCK‐8法和克隆形成实验检测细胞增殖活力及克隆形成能力。结果成功构建Cas9‐sgSNHG1及SNHG1同源重组模板质粒,筛选获得敲除效率较高的A549细胞系,发现敲除SNHG1可抑制A549细胞增殖活力及克隆形成能力。结论SNHG1稳定敲除的A549细胞系构建成功,SNHG1的癌基因功能受到显著抑制。CRISPR/Cas9介导的同源定向修复可有效抑制长链非编码RNA的表达,是长链非编码RNA功能研究的重要工具。

关键词：核仁小分子RNA宿主基因1 长链非编码RNA CRISPR/Cas9 基因敲除细胞增殖

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miR-375-3p抑制DNA双链断裂的同源重组修复增强结直肠癌细胞放射敏感性的研究

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中华放射医学与防护杂志 2022年第3期42卷 168-174页

作者：李长泳贾萌王琪彦林军王治东戚振华军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所北京市放射生物学重点实验室北京100850 解放军总医院京西医疗区综合内科北京100144

目的探究miR-375-3p调控结直肠癌细胞放射敏感性的作用和机制。方法在结直肠癌细胞HCT116及HT29中过表达miR-375-3p,利用CCK-8法检测细胞增殖能力,利用克隆形成实验检测细胞克隆形成能力,利用Annexin V-FITC/PI双染法流式细胞术检测细... 详细信息

目的探究miR-375-3p调控结直肠癌细胞放射敏感性的作用和机制。方法在结直肠癌细胞HCT116及HT29中过表达miR-375-3p,利用CCK-8法检测细胞增殖能力,利用克隆形成实验检测细胞克隆形成能力,利用Annexin V-FITC/PI双染法流式细胞术检测细胞凋亡,利用流式细胞术检测细胞周期分布。过表达miR-375-3p后,检测γ-H2AX foci形成点数量、同源重组(HR)及非同源性末端连接(NHEJ)修复效率,分析miR-375-3p表达对DNA双链断裂(DSBs)以及其修复效率的影响;利用生物信息学预测miR-375-3p在HR修复通路中的下游靶基因,利用双荧光素酶报告基因法进一步验证miR-375-3p表达对靶基因重组蛋白A(RAD51)表达调控作用。最后,利用荧光定量PCR技术检测经^(60)Coγ射线2、6 Gy照射后HCT116细胞miR-375-3p的表达量;抑制miR-375-3p表达,经0、1、2、4、6 Gy不同剂量照射后,分析miR-375-3p表达变化对结直肠癌细胞HCT116放射敏感性的影响。结果过表达miR-375-3p显著抑制了结直肠癌细胞HCT116及HT29的增殖及克隆形成能力,诱发其细胞凋亡、G1期周期阻滞和DSBs损伤,下调了Rad51表达,显著降低了HR修复效率[miR-375-3p(3.55±0.30)%,miR-nc(1.97±0.15)%;t=10.055,P<0.05];双荧光素酶报告基因实验显示miR-375-3p能够靶向Rad513′UTR区域结合(t=5.013,P<0.05);电离辐射能诱导miR-375-3p表达,抑制其表达显著降低了结直肠癌细胞放射敏感性(t=6.460、5.619、10.150,P<0.05)。结论miR-375-3p能够靶向抑制Rad51表达,下调DSBs的HR修复效率,增强结直肠癌细胞的放射敏感性。

关键词：结直肠癌 miR-375-3p 同源重组修复 RAD51 放射敏感性

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TAB182维持RPA2 mRNA稳定性促进DNA同源重组修复的研究

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中华放射医学与防护杂志 2022年第4期42卷 241-247页

作者：李刚赖淑婷韩阳白琛俊关华高山山周平坤南华大学公共卫生学院衡阳421001 军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所北京市放射生物学重点实验室北京100850

目的探讨TAB182促进同源重组(HR)修复的相关调控分子及机制。方法利用shRNA敲低人乳腺癌MCF-7细胞中的TAB182基因,TAB182敲低的MCF-7细胞为沉默组,使用shRNA阴性对照物的MCF-7细胞为TAB182阴性对照组。通过RNA测序分析,筛选与TAB182相... 详细信息

目的探讨TAB182促进同源重组(HR)修复的相关调控分子及机制。方法利用shRNA敲低人乳腺癌MCF-7细胞中的TAB182基因,TAB182敲低的MCF-7细胞为沉默组,使用shRNA阴性对照物的MCF-7细胞为TAB182阴性对照组。通过RNA测序分析,筛选与TAB182相关差异表达的HR修复基因。qRT-PCR验证相关基因的mRNA表达,Western blot验证相关蛋白的表达。RAD51和BrdU免疫荧光检测DNA断裂末端形成的3′单链DNA(ssDNA);流式细胞术检测细胞周期阻滞和细胞凋亡;集落形成实验检测细胞的放射敏感性。结果RNA测序分析和qRT-PCR验证结果一致,TAB182沉默组细胞中RPA2的mRNA表达降低(t=17.97,P<0.05)。相比于TAB182阴性对照组细胞,TAB182沉默组细胞RPA2在蛋白水平也显著减少。相比于TAB182阴性对照组,TAB182沉默组细胞中RAD51焦点(foci)的表达显著降低;3′ssDNA结合蛋白标志物BrdU在TAB182沉默组细胞的细胞核中foci形成显著减少。在放射菌素D作用后的第4、8、12 h,相比于TAB182阴性对照组,TAB182沉默组细胞RPA2 mRNA的衰减加快(t=5.37、3.79、3.69,P<0.05)。相比于TAB182阴性对照组,TAB182沉默组细胞放射敏感性增加(t=3.48,P<0.05);且TAB182沉默组放射诱发的凋亡率显著增加(t=11.05,P<0.05)、照射后24 h的周期阻滞时间延长(t=8.40,P<0.01)。结论TAB182通过维持RPA2 mRNA的稳定性,促进RPA2的表达,在DSBs的同源重组修复通路中发挥作用。TAB182的缺失可增强肿瘤细胞的放射敏感性。

关键词： TAB182 RPA2 DNA双链断裂同源重组修复放射敏感性

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辐射诱导的染色质拓扑关联结构域层级变化及其在细胞辐射响应中的作用

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中国生物化学与分子生物学报 2022年第3期38卷 298-307页

作者：陶欢伯晓晨陈河兵郑晓飞军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所放射生物学北京市重点实验室北京100850 军事科学院军事医学研究院卫生勤务与血液研究所北京100850

基因组三维结构在基因表达调控中发挥重要作用,染色质拓扑关联结构域(topologically associated domain,TAD)是DNA复制和基因转录的基本功能单位,也是DNA损伤修复的功能单元,在辐射诱导的DNA损伤修复中发挥重要作用。近期研究表明,TAD... 详细信息

基因组三维结构在基因表达调控中发挥重要作用,染色质拓扑关联结构域(topologically associated domain,TAD)是DNA复制和基因转录的基本功能单位,也是DNA损伤修复的功能单元,在辐射诱导的DNA损伤修复中发挥重要作用。近期研究表明,TAD并非是完全独立的结构单元,其内部常呈现多层级结构,对基因表达具有重要调控作用。为探究TAD多层级结构在细胞辐射响应中的作用,本研究使用TAD层级结构识别算法OnTAD对Gene expression omnibus数据库中5Gy X射线照射的淋巴细胞、成纤维细胞和毛细血管扩张性共济失调突变(ataxia telangiectasia mutated,ATM)基因缺陷的成纤维细胞,共26个样本的Hi-C(high-through chromosome conformation capture,Hi-C)数据进行分析,发现辐射后细胞的TAD层级结构出现规律性变化,高层级TAD缺失较多,低层级TAD相对保守;辐射诱导的TAD层级结构变化通过调节基因表达参与细胞辐射响应;ATM是辐射诱导TAD层级结构变化和恢复的重要因子。本研究为从TAD多层级结构角度理解基因组三维结构在细胞辐射响应中的作用提供了新思路。

关键词：拓扑关联结构域多层级结构细胞辐射响应毛细血管扩张性共济失调突变基因 DNA损伤修复

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我国室内氡致肺癌的疾病负担估算

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中华放射医学与防护杂志 2024年第12期44卷 1069-1076页

作者：苗晓翔苏垠平武云云王晨冉卓维海孙全富中国疾病预防控制中心辐射防护与核安全医学所辐射防护与核应急中国疾病预防控制中心重点实验室北京100088 国家癌症中心癌症早诊早治办公室中国医学科学院肿瘤医院北京100021 复旦大学放射医学研究所上海200032

目的估算我国室内氡暴露导致的居民肺癌疾病负担水平,为完善防氡控氡政策措施提供科学依据。方法基于我国室内氡浓度监测调查数据和室内氡致肺癌风险归因研究结果,以及人口、吸烟等基础数据,利用归因疾病负担计算方法,估算我国室内氡致... 详细信息

目的估算我国室内氡暴露导致的居民肺癌疾病负担水平,为完善防氡控氡政策措施提供科学依据。方法基于我国室内氡浓度监测调查数据和室内氡致肺癌风险归因研究结果,以及人口、吸烟等基础数据,利用归因疾病负担计算方法,估算我国室内氡致肺癌的疾病负担。结果估计2018年我国室内氡暴露致全人群肺癌的早死寿命损失年(YLL)为510.93万人年,伤残健康寿命损失年(YLD)为5.26万人年,伤残调整寿命年(DALY)为516.19万人年。50~54岁年龄组人群的DALY最高。吸烟男性的室内氡致肺癌归因疾病负担超过吸烟女性的9倍,不吸烟女性的肺癌归因疾病负担超过不吸烟男性的5倍,吸烟与室内氡致肺癌的疾病负担关系密切。结论我国室内氡暴露是与肺癌疾病负担相关的主要环境危险因素,室内氡的健康危害亟需引起更多关注并完善相应政策措施来应对这一挑战。

关键词：室内氡氡致肺癌疾病负担估算政策措施

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新型二合一PiggyBac转座系统的构建及功能验证

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中国生物工程杂志 2022年第6期42卷 39-46页

作者：张尧仓彭玉丁可昕台福敏郑晓飞秦宜德付汉江安徽医科大学基础医学院合肥230032 军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所放射生物学北京市重点实验室北京100850

目的:PiggyBac(PB)转座子是一种可移动的遗传元件,采用“剪切和粘贴”机制在载体和染色体之间进行转座;通过将转座子元件和转座酶表达框整合到一个表达载体中,构建简便易用的二合一PB转座系统。方法:通过聚合酶链式反应(polymerase chai... 详细信息

目的:PiggyBac(PB)转座子是一种可移动的遗传元件,采用“剪切和粘贴”机制在载体和染色体之间进行转座;通过将转座子元件和转座酶表达框整合到一个表达载体中,构建简便易用的二合一PB转座系统。方法:通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)获取PiggyBac转座系统所需转座子元件和转座酶表达框,利用T4 DNA连接酶将转座酶表达框插入到pUC18载体上,再利用Gibson同源重组技术将转座子元件与重组载体结合构建二合一PB转座系统;使用该系统携带的增强型绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,EGFP)以及功能性损伤抑制蛋白(damage-suppressing protein,DSUP)检测其有效性及可靠性。结果:在所有筛选获得的嘌呤霉素抗性细胞中,EGFP都是明亮可见;利用此二合一PB转座系统成功获得了可高效表达功能性损伤抑制蛋白的稳定细胞系,证明外源基因可被有效整合到基因组DNA中并表达。结论:成功构建了新型二合一PB转座系统,使稳定表达细胞系的建立更加经济简便。

关键词： PiggyBac转座子稳定转染 EGFP

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