检索结果-内蒙古大学图书馆

东北林业大学学报 2024年第12期52卷 161-168页

作者：梁冠军贾含琪李丹蕾王峰黑龙江省外来林木病虫害监测与防控重点实验室(东北林业大学) 哈尔滨150040

转录组测序筛选并克隆了叶状枝节丛孢丝氨酸蛋白酶基因ALP1,并通过生物信息学分析揭示了其对松材线虫捕食效率的影响。结果表明:ALP1编码的蛋白质是一个409个氨基酸残基的分泌性蛋白,分子质量为41.89 ku,等电点为6.45,表现出稳定且亲水... 详细信息

转录组测序筛选并克隆了叶状枝节丛孢丝氨酸蛋白酶基因ALP1,并通过生物信息学分析揭示了其对松材线虫捕食效率的影响。结果表明:ALP1编码的蛋白质是一个409个氨基酸残基的分泌性蛋白,分子质量为41.89 ku,等电点为6.45,表现出稳定且亲水的蛋白质特性。ALP1蛋白无跨膜螺旋,含有信号肽,预测的切割位点位于第21至22个氨基酸残基间。ALP1蛋白含有丝氨酸蛋白酶家族的保守基序,其二级结构主要由α螺旋、无规卷曲和β-折叠组成,与Drechslerella coelobrocha丝氨酸蛋白酶基因具有高度同源性。实时定量PCR(RT-qPCR)结果表明,ALP1基因表达水平与叶状枝节丛孢的捕食效率呈正相关,尤其在28℃时表达显著上调。在18~32℃梯度范围内,以28℃为叶状枝节丛孢捕食效率最优温度条件。GO分类和通路富集分析进一步确认了ALP1在叶状枝节丛孢适应环境和捕食过程中的核心作用。ALP1基因在叶状枝节丛孢适应温度变化和提高捕食效率中起到关键调控功能,还为松材线虫病的生物防治提供了新的策略和基因资源。

关键词：转录组松材线虫捕食线虫真菌叶状枝节丛孢捕食率

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应用改进的全乘比例分析多目标优化方法对胶合木-混凝土装配式建筑经济性评价

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东北林业大学学报 2022年第4期50卷 117-121页

作者：殷志伟王海飙徐文静东北林业大学哈尔滨150040

以黑龙江地区胶合木-混凝土装配式建筑、砖混结构建筑、普通装配式建筑、框剪结构建筑为研究对象,从经济效益、社会效益、环境效益3个角度,遴选9个影响因素,构建了评价指标体系;在概率犹豫费马(Fermatean)模糊环境下,应用改进的全乘比... 详细信息

以黑龙江地区胶合木-混凝土装配式建筑、砖混结构建筑、普通装配式建筑、框剪结构建筑为研究对象,从经济效益、社会效益、环境效益3个角度,遴选9个影响因素,构建了评价指标体系;在概率犹豫费马(Fermatean)模糊环境下,应用改进的全乘比例多目标优化(MULTIMOORA(IM))方法构建了胶合木-混凝土建筑经济性评价模型;依据采集的已知定量数据和评价信息,采用绍凯(Choquet)积分几何算子聚合各类指标值;利用改进的全乘比例多目标优化方法对评价的建筑进行经济性综合排序,比较不同结构建筑的经济性差异。结果表明:胶合木-混凝土组合结构建筑的经济性优于其它结构建筑的经济性;经稳健性检验、有效性检验和比较,验证了构建的模型的可行性和有效性。

关键词：胶合木-混凝土装配式建筑经济性评价多目标优化

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角果碱蓬响应干旱胁迫的转录组分析

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植物生理学报 2023年第1期59卷 89-100页

作者：张婷茹苗荣庆臧威庞秋颖张爱琴东北林业大学生命科学学院东北盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室哈尔滨150040

角果碱蓬(Suaeda corniculata)是一种特殊逆境适生植物,目前其应答干旱胁迫的调节机制仍不清楚。本研究针对角果碱蓬的耐旱特性,通过模拟干旱胁迫,测定了角果碱蓬幼苗光合参数与相对含水量,系统分析响应干旱胁迫的基因表达谱,以期挖掘... 详细信息

角果碱蓬(Suaeda corniculata)是一种特殊逆境适生植物,目前其应答干旱胁迫的调节机制仍不清楚。本研究针对角果碱蓬的耐旱特性,通过模拟干旱胁迫,测定了角果碱蓬幼苗光合参数与相对含水量,系统分析响应干旱胁迫的基因表达谱,以期挖掘角果碱蓬响应干旱胁迫的关键调节基因。结果表明,角果碱蓬对干旱胁迫有一定的耐受能力,尽管干旱处理降低了光合作用效率和相对含水量,但胁迫状态解除后能够很快恢复到正常水平。转录组分析共鉴定到720个基因在干旱胁迫下发生差异表达,其中上调表达基因426个,下调表达基因294个,它们主要富集在细胞代谢、遗传信息处理和环境适应等生物学过程。对差异表达基因进一步筛选,获得了转录因子基因(***_c2和***_c1)以及ABA激素信号基因(***_c0和***_c0)等潜在的干旱耐受相关调节因子。研究结果为角果碱蓬干旱适生生理机制解析提供了新的证据,并为其抗旱性研究提供了分子基础。

关键词：角果碱蓬干旱胁迫光合作用转录组

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PsnHB13与PsnHB15在小黑杨中的遗传转化与功能分析

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植物研究 2023年第3期43卷 340-350页

作者：郑占敏商玉冰周广波肖迪刘轶由香玲莘县国有马西林场聊城252400 国家林业和草原局重点国有林区森林资源监测中心加格达奇165000 林木遗传育种全国重点实验室(东北林业大学) 哈尔滨150040 东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040

PsnHB13与PsnHB15为小黑杨(Populus simonii×***)周期蛋白PsnCycD1;1过表达株系转录组差异基因。为探究PsnHB13与PsnHB15基因功能,使用InterPro工具对PsnHB13与PsnHB15保守结构域进行分析,通过STRING数据库对PsnHB13和PsnHB15蛋白质关联网络分析,酵母双杂交验证互作蛋白,统计转基因植株叶片长宽比、叶片和茎部干质量与鲜质量比值,并对PsnHB13过表达小黑杨进行转录组分析。结果显示PsnHB13与PsnHB15分属于2个不同亚家族,PsnHB13主要包含HDZipⅠ结构域,PsnHB15主要包含HDZipⅢ结构域。PsnHB13和PsnHB15蛋白质关联网络分析,均筛选到10条互作蛋白,且PsnHB15对家族蛋白具有较高的互作概率。酵母双杂交结果显示PsnHB15与PsnHB13互作,PsnHB13与PsnCycD1;1互作。PsnHB13与PsnHB15过表达小黑杨株系在幼苗初期叶片长宽比均明显增加。PsnHB13过表达株系茎部干质量与鲜质量比值显著增加(P<0.05)。PsnHB13过表达小黑杨转录组分析显示,差异基因GO富集主要集中在对化学物质的反应、对有机物的反应、调节RNA代谢过程等方面。KEGG富集在转录因子、植物激素信号转导、细胞色素P450等通路。差异基因主要集中在MADS-box、MYBP、ERF1、GH3、SAUR等家族。PsnHB13与PsnHB15在小黑杨的生长发育中发挥着重要的功能,是探究植物的生长规律、揭示细胞周期与生长调节之间的关键基因。

关键词： PsnHB13 PsnHB15 小黑杨生物信息学转录组分析

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CYP74A2在白粉菌诱导月季对甜菜夜蛾产生抗性中的功能及其生物信息学分析

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江苏农业科学 2023年第11期51卷 119-127页

作者：杨琦刘思琪李云仙杨发忠西南地区林业生物质资源高效利用国家林业与草原局重点实验室/西南林业大学云南昆明650233

为明确CYP74A2基因在白粉菌诱导月季产生对甜菜夜蛾的抗性过程中的功能,并对CYP74A2作生物信息学分析,利用转录组测序获得的差异表达基因进行功能富集分析。结果表明,α-亚麻酸代谢产生的茉莉酸是白粉菌诱导月季产生对甜菜夜蛾抗性的主... 详细信息

为明确CYP74A2基因在白粉菌诱导月季产生对甜菜夜蛾的抗性过程中的功能,并对CYP74A2作生物信息学分析,利用转录组测序获得的差异表达基因进行功能富集分析。结果表明,α-亚麻酸代谢产生的茉莉酸是白粉菌诱导月季产生对甜菜夜蛾抗性的主要挥发性成分之一,发现该通路中共有5个CYP74A2差异表达基因,分别是LOC112173678、LOC112172343、LOC112172188、LOC112173396和LOC112169957。采用qRT-PCR验证CYP74A2基因的功能,利用NCBI、KEGG等数据库找到CYP74A2同源蛋白并结合ExPASy-ProtParam、TMHMM、SignalP6.1、MEME、SOPMA、SWISS-MODEL、MEGA11等在线工具或软件对CYP74A2进行生物信息学分析。通过ExPASy-Protparam分析发现,CYP74A2蛋白分子量都在54.3ku左右,是一种稳定的亲水性蛋白。该类蛋白无跨膜结构和信号肽,亚细胞定位于细胞质和叶绿体中,少量分布于质膜和细胞核内。SOPMA预测结果表明该类蛋白以α-螺旋为主,SWISSMODEL对CYP74A2蛋白三维建模的结果与SOPMA预测结果一致。系统发育分析结果表明,月季CYP74A2蛋白与草莓CYP74A2蛋白亲缘性最近。MEME对蛋白的保守基序分析结果表明,CYP74A2蛋白具有底物识别位点SRS-1、P450s的保守序列、血红素结合域以及血红素结合域的Ⅰ型螺旋。研究结果为探明CYP74A2基因的生物学功能及白粉菌诱导月季产生对甜菜夜蛾抗性的生物分子学机制提供了依据。

关键词：月季白粉菌甜菜夜蛾 CYP74A2 茉莉酸生物信息学

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三种针叶树种节子属性通用方程的构建

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应用生态学报 2023年第11期34卷 2907-2918页

作者：李泽霖贾炜玮郭昊天敖子琦赵阳东北林业大学林学院/森林生态系统可持续经营教育部重点实验室哈尔滨150040

以2020年在黑龙江省林口林业局与孟家岗林场选取的3种典型针叶树种红松、长白落叶松、樟子松为研究对象,对节子直径、疏松节长度、健全节长度3种属性构建基础模型、哑变量模型和混合模型,分析不同树种节子属性的差异,简化模型的建模工... 详细信息

以2020年在黑龙江省林口林业局与孟家岗林场选取的3种典型针叶树种红松、长白落叶松、樟子松为研究对象,对节子直径、疏松节长度、健全节长度3种属性构建基础模型、哑变量模型和混合模型,分析不同树种节子属性的差异,简化模型的建模工作。首先通过剖析法收集相关节子属性数据,结合相关文献,转换模型形式以及替换相关变量,构建基础模型;将树种作为定性因子,转化为哑变量,引入基础模型中,构建相关属性的哑变量模型;在构建混合模型时,引入样木与样地水平的随机效应,通过比较赤池信息准则(AIC)、贝叶斯信息准则(BIC)等评价指标,选出拟合效果最佳的混合模型。之后对基础模型、哑变量模型、混合模型的拟合精度进行对比,选出最优的通用方程。结果表明:3种模型中,哑变量模型与混合模型的拟合精度均大于基础模型。AIC、BIC等评价指标显示,混合模型对节子属性的拟合效果优于哑变量模型。模型对比结果中,健全节长度、疏松节长度、节子直径混合模型的R~2相较于基础模型分别提升了13.2%、84.8%、40.3%。不同树种3种节子属性基础模型的预测精度均大于90%,哑变量模型与混合模型的预测精度均在94%以上,说明构建的模型能够对节子相关属性进行较好的预测。3个树种健全节长度、节子直径、疏松节长度大小均为樟子松>红松>长白落叶松。哑变量模型与混合模型的拟合结果较基础模型更佳,精度更高。

关键词：针叶树节子直径健全节长度疏松节长度哑变量模型混合模型

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兴安落叶松林火烧迹地土壤有效磷与土壤微生物生物量磷时空演变特征

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生态学报 2023年第12期43卷 5027-5037页

作者：杨光李兆国石炳东东北林业大学林学院森林生态系统可持续经营教育部重点实验室哈尔滨150040

野火是大兴安岭活跃的生态干扰因子,显著影响火烧迹地土壤有效磷(AP,Available Phosphorus)和土壤微生物生物量磷(MBP,Microbial Biomass Phosphorus),本文旨在了解兴安落叶松林火烧迹地AP、MBP的时空演变特征,并在此基础上探究两者间... 详细信息

野火是大兴安岭活跃的生态干扰因子,显著影响火烧迹地土壤有效磷(AP,Available Phosphorus)和土壤微生物生物量磷(MBP,Microbial Biomass Phosphorus),本文旨在了解兴安落叶松林火烧迹地AP、MBP的时空演变特征,并在此基础上探究两者间的偶联机制。采用“以空间换时间”的研究方法,于大兴安岭塔河地区兴安落叶松林火烧迹地选取实验样地,于未过火兴安落叶松林选取对照样地,踏查每个样地的海拔、坡度、坡向、坡位信息,测定火烧迹地土壤AP、MBP含量,分析兴安落叶松林火烧迹地AP与MBP的时空演变特征。火干扰后,火烧迹地土壤AP、MBP含量均随恢复时间表现出先减少后增加的趋势,恢复初期火烧迹地MBP含量显著低于未过火样地,AP含量显著高于未过火样地(P<0.05);不同海拔火烧迹地AP、MBP含量差异显著(P<0.05),不同海拔未过火样地AP、MBP含量均无显著差异(P>0.05)。火烧迹地土壤MBP、AP的随机森林回归模型的模型总解释度约为84%,而未过火样地的模型总解释度约为60%,两个模型均达到了极显著水平(P<0.001),在对照样地随机森林回归模型中,坡位达到了显著水平(P<0.05),坡向、坡度、海拔三个地形因子达到了极显著水平(P<0.01),在火烧迹地随机森林回归模型中,所有解释变量均达到了极显著水平(P<0.01)。火干扰对土壤微生物的影响是一个长期过程,相较于AP,MBP对火干扰的响应更为敏感。火干扰会显著加强地形因子对AP、MBP的影响力,并改变地形因子对AP、MBP影响力的相对重要性。

关键词：火烧迹地地形因子土壤微生物生物量磷土壤有效磷时空演变特征

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长白落叶松半同胞家系生长和木材性状遗传变异与联合选择

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植物研究 2022年第3期42卷 383-393页

作者：周雪燕王璧莹郝雪峰胡兴国吴江涛郎凯胡钦波赵曦阳林木遗传育种国家重点实验室东北林业大学哈尔滨150040 吉林省汪清林业局汪清133200

长白落叶松(Larix olgensis)是我国东北重要的用材树种,根据生长和木材性状对其进行综合选择至关重要。本研究以吉林省延边自治区汪清林业局32年生的49个长白落叶松半同胞家系为材料,对其9个生长性状(树高、地径、胸径、3 m径、材积、... 详细信息

长白落叶松(Larix olgensis)是我国东北重要的用材树种,根据生长和木材性状对其进行综合选择至关重要。本研究以吉林省延边自治区汪清林业局32年生的49个长白落叶松半同胞家系为材料,对其9个生长性状(树高、地径、胸径、3 m径、材积、尖削度、冠幅、分枝角和通直度)和4个木材性状(木材基本密度、管胞长度、管胞宽度和管胞长宽比)进行测定与分析。结果表明:不同变异来源间所有性状差异均达极显著水平(P<0.01);各性状家系遗传力均较高(0.51~0.96);表型变异系数为3.04%(分枝角)~23.15%(冠幅);各性状相关系数为-0.367(管胞宽度与管胞长宽比)~0.994(胸径与材积);主成分分析结果表明,4个主成分的累计贡献率达到78.46%,包含了家系生长性状和木材性状的大部分信息;分别以生长和木材性状对家系进行综合评价,初步筛选出5个生长性状优良家系(S78、S81、S80、S84和S83)和5个木材性状优良家系(S37、S51、S6、S30和S19),结合生长和木材性状初步筛选出5个优良家系(S89、S74、S76、S82和S83)。本研究初选的材料可以为良种选育提供基础,亲本可以为改良种子园营建提供材料。

关键词：长白落叶松生长性状木材性状遗传变异联合分析

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基于RNAi技术解析美国白蛾HcAnk1和HcAnk2基因功能及对HcNPV的敏感性（英文）

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南京林业大学学报(自然科学版) 2024年第3期48卷 181-190页

作者：彭萌萌吴红渠张佳雯闫丽琼曹传旺孙丽丽东北林业大学森林生态系统可持续经营教育部重点实验室湖北省生物农药工程研究中心

【目的】锚定蛋白是连接细胞骨架与质膜的衔接蛋白家族。但昆虫中关于锚定蛋白基因功能研究甚少。笔者克隆美国白蛾(Hyphantria cunea)锚定蛋白基因，阐明该基因在其各发育期和组织中的表达特征及对美国白蛾核型多角体病毒(Hyphantria c... 详细信息

【目的】锚定蛋白是连接细胞骨架与质膜的衔接蛋白家族。但昆虫中关于锚定蛋白基因功能研究甚少。笔者克隆美国白蛾(Hyphantria cunea)锚定蛋白基因，阐明该基因在其各发育期和组织中的表达特征及对美国白蛾核型多角体病毒(Hyphantria cunea nucleopolyhedrosisvirus, HcNPV)的敏感性，为进一步开发HcNPV增效剂提供理论依据。【方法】通过转录组文库筛选出Ankyrin1(HcAnk1)和Ankyrin2(HcAnk2)基因，利用生物信息学分析基因特性，采用qRT-PCR检测不同发育阶段、不同组织以及不同HcNPV浓度胁迫下HcAnks的表达量，通过RNAi技术研究HcAnks基因沉默后美国白蛾对HcNPV的敏感性。【结果】HcAnk1和HcAnk2基因开放阅读框依次为1 392和1 866 bp,分别编码463和621个氨基酸，蛋白质分子质量分别为59.18和69.19 ku,理论等电点分别为5.74和8.66;进化树分析显示HcAnk1与粉纹夜蛾(Trichoplusia ni)亲缘关系最近而聚为一类。HcAnks在各个发育阶段均有表达，卵期表达量最高，6龄表达量最低；HcAnks分别在中肠和后肠中表达量最高；在卵巢和精巢中未检测到HcAnk1,而HcAnk2主要在中肠和精巢中表达。在不同浓度HcNPV胁迫下，HcAnks转录水平表现为低浓度诱导，高浓度抑制。沉默HcAnks美国白蛾4龄幼虫的相对生长率(RGR)和食物转化效率(ECD)显著降低。此外，沉默HcAnks的美国白蛾4龄幼虫对HcNPV敏感性显著增加。【结论】HcAnks在抵抗HcNPV侵染过程中发挥重要作用，HcAnks可作为HcNPV增效剂，用于美国白蛾无公害防治。

关键词：美国白蛾锚定蛋白美国白蛾核型多角体病毒 RNAi

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干旱胁迫下外源ABA对香樟R2R3-MYB亚家族转录因子表达的影响

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西北林学院学报 2025年第2期40卷 51-63页

作者：关信郑洋群张亚东王毅郑元西南林业大学林学院云南昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

R2R3-MYB亚家族转录因子与植物生长发育和抗逆性相关,其通过与下游靶基因特异性结合增强植物的抗逆能力。本研究基于香樟全基因组数据,鉴定了90个R2R3-MYB亚家族成员(CcMYB1~CcMYB90),并对其生物信息学及外源ABA调控干旱胁迫下的表达模... 详细信息

R2R3-MYB亚家族转录因子与植物生长发育和抗逆性相关,其通过与下游靶基因特异性结合增强植物的抗逆能力。本研究基于香樟全基因组数据,鉴定了90个R2R3-MYB亚家族成员(CcMYB1~CcMYB90),并对其生物信息学及外源ABA调控干旱胁迫下的表达模式进行分析。结果表明,R2R3-MYB亚家族基因结构相似,功能多样,大多数基因与抗旱通路和植物激素反应相关;基于转录组数据基因表达谱分析,在干旱胁迫下CcMYB2、CcMYB9、CcMYB21、CcMYB46、CcMYB63、CcMYB84等通过正调控参与香樟抗旱物质的合成;结合顺式作用元件中参与涉及干旱诱导性的MYB结合位点,CcMYB16、CcMYB51、CcMYB52可能通过ABA信号通路中的去磷酸化过程,参与干旱胁迫调控,CcMYB2、CcMYB21、CcMYB22、CcMYB61、CcMYB63可能与干旱胁迫下ABA介导的气孔运动相关。

关键词：香樟外源ABA 干旱胁迫 R2R3-MYB亚家族转录因子基因表达

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