检索结果-内蒙古大学图书馆

基于三维点云的江南私家园林叠山皴法的识别与分析研究——以苏州四大名园为例

中国园林 2022年第10期38卷 133-138页

作者：董芊里张青萍南京林业大学风景园林学院南京林业大学江南园林遗产保护与活化江苏省文化和旅游重点实验室南京210037

皴法作为中国山水画及叠山所独有的技巧,同时也是连接山水画与叠山的桥梁,具有重要的研究意义。然而传统的绘画与拍照等记录方式均不能很好地适配叠山皴法,点云能够不受光影效果及透视关系的影响,对假山表面的物理信息进行识别与记录。... 详细信息

皴法作为中国山水画及叠山所独有的技巧,同时也是连接山水画与叠山的桥梁,具有重要的研究意义。然而传统的绘画与拍照等记录方式均不能很好地适配叠山皴法,点云能够不受光影效果及透视关系的影响,对假山表面的物理信息进行识别与记录。因此使用三维点云的记录方式,对苏州四大名园进行叠山皴法的扫描与识别分析研究,提供了一种较为科学的叠山皴法研究与记录方式。最终发现狮子林能够识别的叠山皴法仅为3种,并且其皴法均以曲线型为主,过度强调石头本身,而使整体假山丢失山意。拙政园与沧浪亭均能识别出4种皴法,以直线型为主,并能配合周边环境,营造出较好的园林意境。留园是四大名园中识别出皴法种类最多的园林,共计5种,并且与建筑、植物、水体相互配合,营造出了四大名园中山意最好的假山。

关键词：风景园林叠山皴法山水画点云苏州四大名园

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楚雄腮扁叶蜂雌虫头部交配响应转录组表达分析

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福建农林大学学报（自然科学版） 2023年第5期52卷 617-627页

作者：俞虹付达英徐进叶辉李永和西南林业大学云南生物多样性研究院云南昆明650224 西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室云南昆明650224 云南大学生态与环境学院云南昆明650091

为明确楚雄腮扁叶蜂雌虫头部交配响应相关基因表达情况,取交配后1、6和24 h(交配后24 h开始产卵)以及未交配的雌虫头部进行转录组分析,通过基因功能注释和富集分析明确头部交配响应基因表达情况,并预测可能涉及的生物学过程。结果表明,... 详细信息

为明确楚雄腮扁叶蜂雌虫头部交配响应相关基因表达情况,取交配后1、6和24 h(交配后24 h开始产卵)以及未交配的雌虫头部进行转录组分析,通过基因功能注释和富集分析明确头部交配响应基因表达情况,并预测可能涉及的生物学过程。结果表明,与未交配组相比,交配组在交配后1、6和24 h分别有621(448个上调、173个下调)、918(389个上调、529个下调)和172个(124个上调、48个下调)差异表达基因(DEGs)。交配后1 h上调DEGs共富集到115条GO(基因本体)术语/KEGG(京都基因与基因组百科全书)通路,多涉及物质和能量代谢,如氨基酸和脂类的合成与分解等;交配后6和24 h上调DEGs共富集到35条GO术语/KEGG通路,涉及范围较广,包括环境信号、细胞凋亡、生长发育及消化系统等。交配后1、6和24 h下调DEGs共富集到89条GO术语/KEGG通路,所涉及的范围更广,如疾病、循环系统、寿命、免疫和环境信号等。此外还找到31个神经肽/神经肽受体编码基因[包括1个DH⁃PBAN(与滞育和性信息素合成有关)同源序列]、78个OBPs(气味结合蛋白)以及1个SPR(性肽受体),但其中除了2个OBPs相关基因在交配后6 h显著下调表达外,其余基因的表达并未受到交配的影响。采用荧光定量PCR方法对15个DEGs的表达进行验证,结果与RNAseq分析的结果相一致。由此可见,交配引起了楚雄腮扁叶蜂雌虫头部基因表达的快速响应。

关键词：楚雄腮扁叶蜂头部组织转录组交配响应生殖-生存权衡

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山新杨FLA家族基因生物信息学分析及其组织表达

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东北林业大学学报 2022年第10期50卷 1-9页

作者：贺有超赵超于颖周美琪赵磊飞石鑫鑫石晶静和玉婷赵鑫王瑞王超林木遗传育种国家重点实验室(东北林业大学) 哈尔滨150040

成束状阿拉伯半乳糖蛋白(FLAs)在木质部发育过程中起重要调控作用,对山新杨(Populus davidiana×*** ***)FLA基因进行生物信息学及其在山新杨不同组织中的表达模式进行了分析,筛选与木质部发育相关的FLA基因,为鉴定其调控山新杨材... 详细信息

成束状阿拉伯半乳糖蛋白(FLAs)在木质部发育过程中起重要调控作用,对山新杨(Populus davidiana×*** ***)FLA基因进行生物信息学及其在山新杨不同组织中的表达模式进行了分析,筛选与木质部发育相关的FLA基因,为鉴定其调控山新杨材性形成的调控机制及分子改良奠定基础。利用拟南芥FLA家族蛋白序列在山新杨基因组序列中进行比对,共获得11条PdbFLAs,编码区长度为540至1 440 bp。对其蛋白理化性质、高级结构、系统进化、基序分布、启动子元件等进行分析。结果表明:蛋白结构和基序分析可将PdbFLAs分为3个亚类,每个亚类的蛋白结构和基序组成较为保守;系统进化分析可将PdbFLAs分为4组,这其中PdbFLA1、PdbFLA2、PdbFLA4、PdbFLA9与毛果杨、拟南芥中调控本质部发育相关基因聚为一组,推测该组内的PdbFLAs也具有类似功能;在PdbFLAs启动子中发现了与光、脱落酸(ABA)、胁迫响应和次生壁形成相关的重要顺式元件。对人工弯曲处理的山新杨木质部表型进行分析,发现树干出现偏心生长,应拉木组织被染成绿色,显示其纤维素质量分数高于对应木和直立木,木质化程度有所降低。利用荧光定量RT-PCR对PdbFLAs在根、茎、叶以及应拉木、对应木和直立木不同组织的表达模式进行分析,结果显示:PdbFLA1在茎和应拉木中高度表达,说明在山新杨木质部发育过程中PdbFLA1具有重要的调控作用。

关键词： PbpFLA 应拉木生物信息学荧光定量RT-PCR

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油茶IDD基因家族鉴定与生物信息学分析

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热带作物学报 2024年第2期45卷 247-258页

作者：陈健鑫吴峰婧琳魏玉倩杨娅琳马焕成杨红玉伍建榕西南林业大学生物多样性保护学院/云南省高校森林灾害预警控制重点实验室云南昆明650224 西南林业大学林学院/西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室云南昆明650224 昆明学院农学与生命科学学院云南昆明650214

油茶(Camellia oleifera)是山茶科(Theaceae)的一种特有的油料植物,具有重要的观赏价值和经济价值,随着油茶的集约化种植,病虫害大量发生,加之良种选育滞后,严重制约着油茶产业的发展。INDETERMINATE DOMAIN(IDD)家族是高等植物中一类... 详细信息

油茶(Camellia oleifera)是山茶科(Theaceae)的一种特有的油料植物,具有重要的观赏价值和经济价值,随着油茶的集约化种植,病虫害大量发生,加之良种选育滞后,严重制约着油茶产业的发展。INDETERMINATE DOMAIN(IDD)家族是高等植物中一类保守的转录因子,通过介导植物内源激素进而调控植物的基础免疫反应。为鉴定油茶中IDD基因家族成员,本研究以油茶全基因组信息为参考,通过IDD基因家族保守结构域鉴定了29个油茶CoIDD基因家族成员,进一步明确了各基因的结构、理化性质、系统进化关系、亚细胞定位。通过RT-PCR克隆到1个与AtIDD4/5/6同源的CoIDD4基因,明确了其理化性质、表达模式及核定位信号,同时分析了其启动区顺式作用元件的类型。研究结果表明,29个CoIDD基因家族成员分为4个亚组,平均亲水系数均小于0,属于亲水性蛋白,且亚细胞定位均位于细胞核内;克隆到CoIDD4基因的全长ORF框包含1620bp碱基,编码539个氨基酸,主要在叶片和花器官中表达;该基因启动子区顺式作用元件主要是参与光响应和植物激素响应元件两大种类。综上所述,本研究在油茶中鉴定了29个IDD基因家族成员,其中CoIDD4基因与AtIDD4/5/6亲缘关系较近,推测其可能参与油茶激素信号转导和基础免疫反应调节等进程,为油茶IDD转录因子功能解析提供理论基础,也为油茶的抗性优良品种选育及分子育种提供参考依据。

关键词：油茶 IDD基因家族生物信息学分析植物激素抗性调控

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昆明市西山林场森林火环境研究

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西南林业大学学报（自然科学） 2024年第4期44卷 166-173页

作者：曹恒茂王劲王秋华洪瑞成方向阳马诚朱熙隆西南林业大学土木工程学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650233 昆明市林火防控和林草信息中心云南昆明650506

基于2003—2022年昆明地区的月值气象数据和1991—2020年西山林场的火灾历史数据,结合林场地形条件、可燃物类型特征等相关资料,分析昆明市西山林场森林火环境特征。结果表明:2003—2022年昆明地区气候变化特征明显,平均温度、最高温度... 详细信息

基于2003—2022年昆明地区的月值气象数据和1991—2020年西山林场的火灾历史数据,结合林场地形条件、可燃物类型特征等相关资料,分析昆明市西山林场森林火环境特征。结果表明:2003—2022年昆明地区气候变化特征明显,平均温度、最高温度、降水量、平均相对湿度整体呈上升趋势,平均风速呈下降趋势,并呈现不同程度的波动变化特点;林场的海拔相对高差588 m,坡度多集中在6°~25°,森林火灾多发于阳坡面的缓坡、斜坡地域,集中发生于海拔2000~2300 m;林场主要针叶树种为云南松和华山松,属于易燃烧树种,林下可燃物较多且干燥易燃,加之周边风景名胜区众多,人员活动频繁,火源管控难度大,易发生森林火灾。研究结果可为当地林火管理提供参考。

关键词：森林火灾可燃物气象地形火环境西山林场

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马尾松分布格局对未来气候变化的响应

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南京林业大学学报(自然科学版) 2022年第2期46卷 196-204页

作者：吴帆朱沛煌季孔庶南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南方现代林业协同创新中心

【目的】分析并预测未来气候变化对马尾松适宜分布范围，探讨影响马尾松潜在地理分布的主要气候因子，为马尾松潜在分布区种质资源管理和保护提供参考与指导。【方法】以中国数字植物标本馆记录的马尾松分布数据为基础，利用MaxEnt模型... 详细信息

【目的】分析并预测未来气候变化对马尾松适宜分布范围，探讨影响马尾松潜在地理分布的主要气候因子，为马尾松潜在分布区种质资源管理和保护提供参考与指导。【方法】以中国数字植物标本馆记录的马尾松分布数据为基础，利用MaxEnt模型及地理信息系统ArcGIS 10.3软件探讨马尾松当前地理分布特征及其潜在分布区，并针对代表性浓度路径(RCP) 2.6及RCP 8.5两种气候情景下未来(2050年和2070年)马尾松适宜分布范围及主要气候因子进行分析。【结果】当前马尾松高适生区覆盖的地区主要分布于秦岭—淮河线以南。浙江、福建、江西、湖北西南部、湖南、重庆、四川东南部、贵州北部、广西中部、广东北部等地区为马尾松主要分布区，海南、云南及台湾等地为零星分布区。在未来气候情景下，马尾松适生区向我国北部地区迁移，包括河南西部、山东半岛、辽东半岛、河北东部、山西南部等地区，而在云南南部零星地区不会再有马尾松自然分布。在未来两种气候情景4个条件中，相同RCP情景下，不同年限各适生区之间的差异并不明显，变化趋势大致相同；但相同年限的不同RCP情景对应的各适生区面积变化存在明显区别，RCP 8.5的影响要高于RCP 2.6。影响马尾松地理分布的主导生物气候变量为年均降水量、最干月降水量及平均气温日较差，且降水较温度的影响更大。【结论】未来气候变化将导致马尾松分布范围进一步扩大，新增分布区主要集中于当前分布区北部。应以当前马尾松适生环境为基础，针对当地气候类型、土壤条件等环境因素合理建立保护区，以便马尾松能够顺利适应新环境。

关键词：马尾松气候变化 MaxEnt模型代表性浓度路径潜在地理分布主导生物气候因子

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休眠解除前后紫荆种子差异蛋白质组分析

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南京林业大学学报(自然科学版) 2024年

作者：孙永莲高云鹏侯静王文武吴雪莲李淑娴南京林业大学林木遗传育种全国重点实验室南方现代林业协同创新中心林木遗传与生物技术教育部重点实验室江苏省林木遗传和高效培育重点实验室襄阳市林业科学技术推广站

【目的】探究紫荆种子休眠解除前后蛋白质组的变化，进一步了解紫荆种子休眠与萌发的内在机制。【方法】以成熟紫荆种子为材料，基于非标记（Label-free）定量技术和液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）技术，分别对休眠种子和经过45 d低温... 详细信息

【目的】探究紫荆种子休眠解除前后蛋白质组的变化，进一步了解紫荆种子休眠与萌发的内在机制。【方法】以成熟紫荆种子为材料，基于非标记（Label-free）定量技术和液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）技术，分别对休眠种子和经过45 d低温层积后解除休眠的种子进行蛋白质组定量和定性分析，利用生物信息学分析紫荆种子休眠解除前后差异蛋白质的功能。【结果】筛选获得1 031个差异表达蛋白，显著上调779个，显著下调252个。差异表达蛋白被GO功能注释到生物进程、细胞组分和分子功能3大类49个亚类，注释的差异蛋白与代谢过程、酶催化活性、细胞组分合成、应激反应等密切相关。KEGG代谢通路注释结果表明，共有1 012个差异蛋白被注释，涉及264条通路，差异蛋白主要集中在碳代谢、多糖分解、蛋白质过程等，显著富集在7条通路，主要参与激素合成、次生代谢产物合成、脂质代谢等。差异倍数较高的蛋白质中，可能与紫荆种子休眠解除相关的有β-葡萄糖苷酶活性相关蛋白、泛醌和其他萜醌生物等次生代谢相关蛋白、乙醛酸循环相关蛋白等。【结论】紫荆种子休眠解除是较为复杂的生物学过程，涉及细胞形态变化、酶的催化、多糖分解及激素信号转导等，多条代谢途径相互作用构成了较为复杂的休眠解除调控机制。

关键词：紫荆种子休眠蛋白质组代谢通路

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基于生长与木材性状的红松优良种源评价选择

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北京林业大学学报 2022年第3期44卷 12-23页

作者：魏嘉彤陈思琪芦贤博张非凡潘振海柳妍如葛丽丽赵曦阳东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室黑龙江哈尔滨150400 吉林省临江林业局吉林临江134600

【目的】通过对红松种源评价选择,为红松遗传改良提供理论基础。【方法】本研究以黑龙江帽儿山实验林场的26个红松种源为材料,对其生长性状(树高、胸径、地径、通直度、分枝角、冠幅、材积)和木材性状(木材密度、纤维长、纤维宽、含碳... 详细信息

【目的】通过对红松种源评价选择,为红松遗传改良提供理论基础。【方法】本研究以黑龙江帽儿山实验林场的26个红松种源为材料,对其生长性状(树高、胸径、地径、通直度、分枝角、冠幅、材积)和木材性状(木材密度、纤维长、纤维宽、含碳量以及纤维素、半纤维素、木质素、灰分质量分数)进行测定和分析。【结果】(1)方差分析结果表明:各性状在种源间的差异均达到极显著水平(P<0.01);除木材密度、纤维长和纤维素、半纤维素、灰分质量分数外,其他性状的区组效应均达到极显著差异水平(P<0.01);除木材密度外,其他性状的区组×种源互作效应均存在极显著差异水平(P<0.01)。(2)各性状的表型变异系数的变化范围为2.53%~33.47%;各性状的遗传力较高,变化范围为0.617~0.975。(3)相关性分析结果表明,各生长性状间相关性均达显著水平,而木材性状间以及生长性状与木材性状之间的相关性较弱。(4)主成分分析结果表明,前5个主成分累计贡献率为80.16%,结合主成分分析中主成分Ⅰ和主成分Ⅱ结果,利用多性状综合评价法对26个红松种源进行筛选,以8%的入选率,初步选择出2个生长性状优良的种源,各生长指标遗传增益范围为12.52%~35.93%;初步选择出木材性状良好的2个优良种源,各木材性状遗传增益范围为−7.21%~11.55%,其中木质素质量分数的遗传增益为−7.21%。【结论】本研究基于红松的生长和木材性状,评价选择出4个优良种源,可为红松的推广使用提供基础,研究方法可为红松及其他树种良种选育提供参考。

关键词：红松种源生长性状木材性状遗传增益评价选择

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中华猕猴桃蛋白磷酸酶PP2C75基因的生物信息学分析

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分子植物育种 2022年第4期20卷 1119-1126页

作者：杨彦萍邓茹友魏卓师万源奚登贤叶琴霞张汉尧西南林业大学国家林业局西南地区生物多样性保育重点实验室昆明650224 西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室昆明650224

蛋白磷酸酶PP2C是一类重要的信号分子,广泛参与ABA的信号转导途径,包括ABA调控对干旱等逆境胁迫的响应。为了探究PP2C基因在中华猕猴桃这类不耐旱型果树中的功能,本研究使用同源分析法对转录组中的中华猕猴桃蛋白磷酸酶PP2C75基因序列... 详细信息

蛋白磷酸酶PP2C是一类重要的信号分子,广泛参与ABA的信号转导途径,包括ABA调控对干旱等逆境胁迫的响应。为了探究PP2C基因在中华猕猴桃这类不耐旱型果树中的功能,本研究使用同源分析法对转录组中的中华猕猴桃蛋白磷酸酶PP2C75基因序列进行分析,利用网上在线分析工具分析其编码蛋白质的结构并预测其功能。研究结果表明,该核苷酸序列的开放阅读框为1206 bp,编码401个氨基酸。其编码蛋白质属于亲水性蛋白,无信号肽,未形成跨膜结构域,具有一个完整且保守的PP2C催化结构域。通过三级结构建模和保守元件比较分析,发现PP2C75与其他响应干旱的PP2C基因有相同的保守元件,相似率达57%,与PP2C16的序列一致度最高,达48.66%。初步推测PP2C75参与ABA的信号转导途径且可能与猕猴桃的干旱胁迫相关。该研究结果可为后续的基因功能确证以及中华猕猴桃品种改良提供参考依据。

关键词：中华猕猴桃 PP2C75 生物信息学分析

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云南野生牛肝菌中重金属的生物有效性及健康风险评估

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食品科学 2021年第23期42卷 162-169页

作者：李梦莹王坤保欣晨马娇阳田稳于淼郭磊向萍西南林业大学生态与环境学院云南昆明 650224 西南林业大学生命科学学院云南昆明 650224

为研究牛肝菌中重金属对人体的健康风险及毒性效应,本研究采集了云南主产区(楚雄、曲靖、大理和普洱)不同野生干牛肝菌(按颜色分为白牛肝菌、黑牛肝菌、红牛肝菌和黄牛肝菌),测定了其镉(Cd)、铅(Pb)和铬(Cr)的含量,结合体外胃肠模拟法和... 详细信息

为研究牛肝菌中重金属对人体的健康风险及毒性效应,本研究采集了云南主产区(楚雄、曲靖、大理和普洱)不同野生干牛肝菌(按颜色分为白牛肝菌、黑牛肝菌、红牛肝菌和黄牛肝菌),测定了其镉(Cd)、铅(Pb)和铬(Cr)的含量,结合体外胃肠模拟法和Caco-2细胞模型,分析了3种重金属的生物可给性含量和生物有效性含量,并探究食用重金属含量高的牛肝菌对人体肠道的健康风险,即牛肝菌经模拟胃肠液消化后对Caco-2细胞炎症因子白细胞介素-8 (interleukin-8,IL-8)基因表达量的影响.结果表明,干牛肝菌中Cd的平均含量约是我国食品安全标准(GB 2762-2017)中食品污染物限量值的20倍.Cr、Cd和Pb的生物可给性在模拟胃液中分别为18.2％、3.1％和17.0％,在模拟肠液中分别下降到15.3％、0.6％、5.5％,而在Caco-2细胞中只有Cd被吸收,平均生物有效性含量为1.10 μg/mg.基于干牛肝菌的重金属总含量、生物可给性含量和生物有效性含量分别计算其估计每日摄入量,发现基于干牛肝菌重金属总含量的评估结果提示其具有较大的人体健康风险,而基于生物可给性含量和生物有效性含量的数据结果表明均无明显的健康风险.此外,还发现重金属含量高的牛肝菌暴露Caco-2细胞后也不会诱发炎症因子IL-8 mRNA的上调.综上,基于牛肝菌中重金属总量的健康风险评估模型可能会高估其健康风险,建立基于人体生物有效性的健康风险评估方法将更为准确.

关键词：于牛肝菌重金属体外胃肠模拟 Caco-2细胞健康风险

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