检索结果-内蒙古大学图书馆

西北林学院学报 2025年第1期40卷 1-10页

作者：钱文陆鑫云挺朱正礼南京林业大学信息科学技术学、人工智能学院江苏南京210037 南京林业大学林草学院、水土保持学院江苏南京210037

光合有效辐射是作物生产力模型、陆地生态系统模型和生物地化模型的一个重要参量,研究光合有效辐射对植物生长有重要意义。在如今,不同类型的模型可以模拟树林的激光雷达波形,即使用计算机模型来生成再树林中使用激光雷达时可观测到的波... 详细信息

光合有效辐射是作物生产力模型、陆地生态系统模型和生物地化模型的一个重要参量,研究光合有效辐射对植物生长有重要意义。在如今,不同类型的模型可以模拟树林的激光雷达波形,即使用计算机模型来生成再树林中使用激光雷达时可观测到的波形,而半经验模型和几何模型精确度不够高。蒙特卡洛射线追踪(MCRT)模型虽有较高的精确度,但对计算需求很高。本研究提出了一种新的LiDAR光线追踪模型,基于在离散各向异性辐射传输(DART)模型中引入准蒙特卡洛射线跟踪方法。以实现了“盒方法”和“射线卡罗方法”这2种新方法的结合。在离散辐射传输中,加入模拟光子对光能的微小样本进行模拟;将俄罗斯轮盘赌思想加入蒙特卡洛射线追踪中,以便在达到精度要求的同时减少大量的计算需求;同时对场景模型进行网格化剖分,更加准确地对光线进行追踪。结果表明,6月中旬至7月期间,地表太阳辐射估计值与实际测量值的平均相对误差为3.8%~4.2%,光合有效辐射的估计值与实际测量值的平均相对误差为3.5%~3.9%,估算效果较好,其精确度相较于传统的蒙特卡洛算法提高了1.6%。对比实际测量与该算法模拟的拦截效率,得出误差率在1.66%~2.72%,精确度较高。试验结果对于研究植物生理过程具有重要意义。

关键词：光合有效辐射盒方法射线卡罗方法射线追踪蒙特卡洛

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重要林木樟科植物全基因组测序研究进展

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植物学报 2024年第2期59卷 302-318页

作者：杨智杨永南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037 南京林业大学生物与环境学院南京210037 南京林业大学国家林业和草原局亚热带森林生物多样性保护重点实验室南京210037

近年来,随着测序技术的革新、测序成本的降低和生物信息学软件的开发,植物全基因组研究蓬勃发展。樟科(Lauraceae)隶属被子植物木兰类,泛热带分布,物种多样性高,其中很多物种具有重要的经济和生态价值,目前已发表包括8个物种的13个基因... 详细信息

近年来,随着测序技术的革新、测序成本的降低和生物信息学软件的开发,植物全基因组研究蓬勃发展。樟科(Lauraceae)隶属被子植物木兰类,泛热带分布,物种多样性高,其中很多物种具有重要的经济和生态价值,目前已发表包括8个物种的13个基因组。该文从樟科全基因组研究现状、基因组特征、起源和进化以及功能基因和基因家族4个方面进行综述,着重介绍基于组学数据的木兰类及樟科的系统发生、樟科经历的多倍化事件以及与樟科花器官进化和代谢产物相关的基因鉴定。结合研究现状展望了樟科基因组研究的发展方向,建议通过增加测序基因组分支的代表性并关注具有特殊价值的物种,及研究物种特异性功能基因以加深对该家族基因功能和进化的理解。

关键词：樟科演化核基因组功能基因系统发生

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水肥胁迫对基于时间序列图像的苗木表型信息的影响

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林业科学 2023年第5期59卷 61-70页

作者：杨琨琪张慧春张萌边黎明南京林业大学机械电子工程学院南京210037 南京林业大学林学院、南方现代林业协同创新中心、林木遗传与生物技术教育部重点实验室南京210037

【目的】构建多视角植物表型信息采集平台,以固定时间间隔获取水肥胁迫处理下苗木图像,从形态变化中提取表征簸箕柳苗木水肥胁迫的应激反应表型参数,为苗木栽培和精确水肥管理提供参考。【方法】构建一套多视角表型信息采集平台,探讨一... 详细信息

【目的】构建多视角植物表型信息采集平台,以固定时间间隔获取水肥胁迫处理下苗木图像,从形态变化中提取表征簸箕柳苗木水肥胁迫的应激反应表型参数,为苗木栽培和精确水肥管理提供参考。【方法】构建一套多视角表型信息采集平台,探讨一种基于时间序列图像的苗木表型信息提取方法,采用近似拼接算法将局部植株图像有效拼接成完整植株图像,基于多视角图像提出株高、主茎直径等表型信息的提取算法及株高可视化算法。以簸箕柳为研究对象开展水肥胁迫试验,设置水分因素和氮肥因素,包括正常水分处理与干旱胁迫处理2个水平以及6个氮肥水平,对比观察时间序列下簸箕柳株高和主茎直径的变化情况。【结果】1)图像近似拼接算法相较于传统直接拼接算法和暴力拼接算法在多视角表型信息采集平台上具有更好适应性,能够很好消除拼接痕迹,实现图像无缝拼接。2)多视角下株高提取算法的决定系数(R^(2))为0.96、主茎直径提取算法的R^(2)为0.74,能够解决单视角下因植物叶片遮挡导致的株高测量不准确和主茎直径无法测量等问题。3)整个生长周期时间序列下,簸箕柳苗木平均株高和主茎直径随时间的变化受不同水分处理显著影响,正常水分处理簸箕柳苗木平均株高和主茎直径分别为33.6 cm和2.49 mm,干旱胁迫处理簸箕柳苗木平均株高和主茎直径分别为22.8 cm和2.25 mm,正常水分处理簸箕柳苗木平均株高和主茎直径相比干旱胁迫处理高47.4%和10.7%。4)整个生长周期时间序列下,簸箕柳苗木平均株高和主茎直径在6个氮肥水平呈现出显著差异性,随氮肥含量增加呈先增加后降低趋势。正常水分处理下,除T5处理组外,其他组平均株高和主茎直径均高于CK处理组,其中T2处理组生长速率最高,速率分别为1.92 cm·d^(-1)和0.075 mm·d^(-1);干旱胁迫处理下,T1、T2处理组平均株高高于CK处理组,其中T2处理组平均生长速率最高,平均株高和主茎直径生长速率分别为1.05 cm·d^(-1)和0.035 mm·d^(-1)。【结论】基于连续图像序列的分析处理方法在监测苗木表型信息中具有可靠性和实用性。当氮肥含量不足时,植物生长速度放缓,当氮肥含量过量时,会抑制植物生长速度甚至出现烧苗等情况。综合株高与主茎直径,正常水分处理下T2处理组(尿素每盆0.1 g,扦插种植第40天再施加尿素每盆0.1 g)为最佳施肥指标。

关键词：表型信息时间序列图像株高主茎直径水肥胁迫

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南京地区簸箕柳雌、雄花序建成动态观察

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南京林业大学学报(自然科学版) 2023年第1期47卷 154-162页

作者：向丽尹佟明陈赢男南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京林业大学林学院南方现代林业协同创新中心

【目的】柳树雌株性成熟后会产生严重的飞絮污染，阐明其性别分化的分子机制是控制飞絮污染的关键。研究柳树雌、雄花芽分化以及花序建成的关键时期，为性别分化分子调控机理研究奠定基础。【方法】以木本植物簸箕柳(Salix suchowensis... 详细信息

【目的】柳树雌株性成熟后会产生严重的飞絮污染，阐明其性别分化的分子机制是控制飞絮污染的关键。研究柳树雌、雄花芽分化以及花序建成的关键时期，为性别分化分子调控机理研究奠定基础。【方法】以木本植物簸箕柳(Salix suchowensis)雌株和雄株花芽及花序为材料，从当年6月至翌年2月分别在17个时间点采集样品，利用石蜡切片技术对其雌、雄花芽分化及花序建成过程进行观察，分析不同发育阶段的相关特征。【结果】簸箕柳花序建成初期为6月中旬至7月初，小花原基分化期在7月中旬至8月下旬，雌、雄蕊分化期在9月上旬至11月初，11月中旬至翌年2月初雌雄花序进入休眠期，翌年2月中旬至3月为大小孢子发生及雌雄配子体发育期，随后雌雄花序开放。研究表明，花序外观形态变化与内部解剖结构变化之间具有一定的相关性。【结论】簸箕柳雌、雄花均为单性花。花序生长趋势总体呈“S”形上升趋势，在整个发育过程中，雄花序比雌花序外形稍大。簸箕柳花序外观形态可以用于判断花发育的关键时期。研究结果为全面了解簸箕柳花芽分化以及花序建成的完整过程提供了详细信息，为进一步阐明不同关键发育阶段的分子调控机制奠定了基础。

关键词：簸箕柳花芽分化花序建成外部形态解剖结构

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山皂荚GjCYP71D1基因表达分析及在三萜合成中的功能鉴定

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植物生理学报 2023年第11期59卷 2085-2094页

作者：董明张玉琦李影武文博王硕孟春雨刘梦轻尹静东北林业大学东北盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室哈尔滨150040 东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040

皂荚树含有重要的五环三萜化合物,因其广泛的药理活性而具有重要价值。本研究以山皂荚组培苗叶片为材料,通过RT-PCR方法克隆了一个CYP450新基因,并对其进行一系列生物信息学分析;采用qRT-PCR方法检测该CYP450基因、GjLus(羽扇豆醇合酶)... 详细信息

皂荚树含有重要的五环三萜化合物,因其广泛的药理活性而具有重要价值。本研究以山皂荚组培苗叶片为材料,通过RT-PCR方法克隆了一个CYP450新基因,并对其进行一系列生物信息学分析;采用qRT-PCR方法检测该CYP450基因、GjLus(羽扇豆醇合酶)基因在不同处理下(10μmol·L^(-1)ABA、100mg·L^(-1)GA3、50 mg·L^(-1)SA、100μmol·L^(-1)MeJA、5μmol·L^(-1)乙烯利和机械伤害)及不同组织部位的表达模式。研究结果表明,该CYP450为新基因,基因开放阅读框(ORF)为1533 bp,编码含有510个氨基酸,与决明(Senna tora)CYP71D10的相似度最高,为75.8%,暂命名为GjCYP71D1。GjCYP71D1的表达具有组织特异性,该基因在茎中和叶中表达量分别是根中的87.0%和89.9%。GjCYP71D1和GjLus响应不同生长调节物质的诱导,在MeJA、SA、GA3、ABA、乙烯利和机械伤害诱导下,均表现出相似的表达模式。通过瞬时侵染本氏烟草(Nicotiana benthamiana)发现GjCYP71D1具有催化白桦脂醇合成的功能,为山皂荚CYP450基因功能挖掘及鉴定奠定基础。

关键词：山皂荚 CYP450 三萜化合物表达特性基因功能

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白桦BpGRFs基因鉴定与功能初步分析

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植物研究 2025年第2期45卷 191-201页

作者：孙子腾王新宇侯丽丽刘月影郑志民东北林业大学林学院林木遗传育种全国重点实验室哈尔滨150040

生长调节因子(GROWTH-REGULATING FACTOR,GRF)是一种植物中广泛存在的特异性转录因子,在植物的生长发育和胁迫响应过程中发挥着重要作用。该研究对白桦(Betula platyphylla)GRF基因家族进行生物信息学分析发现,白桦中包含9个GRF基因家... 详细信息

生长调节因子(GROWTH-REGULATING FACTOR,GRF)是一种植物中广泛存在的特异性转录因子,在植物的生长发育和胁迫响应过程中发挥着重要作用。该研究对白桦(Betula platyphylla)GRF基因家族进行生物信息学分析发现,白桦中包含9个GRF基因家族成员,均具有保守的WRC和QLQ结构域,启动子顺式作用元件预测分析发现,BpGRFs家族基因的启动子区域包含丰富的响应生长发育、激素代谢和胁迫反应等的相关元件。qRT-PCR结果表明,BpGRF4在白桦的各组织中均呈现高水平表达,进而通过农杆菌介导法获得了白桦过表达BpGRF4株系(OE-1、OE-2、OE-3),用以探究BpGRF4在白桦发育过程中的作用,过表达BpGRF4株系在株高、地径、节间长度、分枝长度均显著提升。另外,OE-3株系的皮层、韧皮部和髓心面积显著增大,叶片表皮细胞较野生型增大约51.6%。综上,过表达BpGRF4的白桦植株生长发育受到了积极调控作用,该结果为解析GRF基因家族在白桦生长发育过程中发挥的功能提供了一定理论依据。

关键词：白桦生长调节因子生物信息学生长发育

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鸡嗉子榕传粉榕小蜂表皮碳氢化合物的性二型及季节变化

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生物多样性 2024年第6期32卷 36-46页

作者：谢华杨培李宗波西南林业大学林学院昆明650224 云南中医药大学研究生处昆明650500 西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室昆明650224

生存与繁殖对生物体维持和延续种群数量稳定至关重要。表皮碳氢化合物具有维持昆虫水分平衡和信息通讯的双重功能,目前对于昆虫在不同气候条件下如何权衡防脱水与保持化学信号可靠性的潜在冲突尚不清楚。本文以寄生于鸡嗉子榕(Ficus sem... 详细信息

生存与繁殖对生物体维持和延续种群数量稳定至关重要。表皮碳氢化合物具有维持昆虫水分平衡和信息通讯的双重功能,目前对于昆虫在不同气候条件下如何权衡防脱水与保持化学信号可靠性的潜在冲突尚不清楚。本文以寄生于鸡嗉子榕(Ficus semicordata)雄花期果内的传粉榕小蜂窝榕小蜂(Ceratosolen gravelyi)为研究对象,利用气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)解析雨季、雾凉季和干热季中雌、雄成虫表皮碳氢化合物的种类及含量,运用非度量多维尺度排序、相似性分析、置换多元方差分析和随机森林等方法分析了窝榕小蜂表皮碳氢化合物对不同季节变化的响应机制。结果表明:(1)窝榕小蜂表皮碳氢化合物由34种C7–C44的化合物组成,包括正链烷烃、甲基烷烃、烯烃和甲基烯烃;其中角鲨烯(squalene)、2-甲基二十八烷(2-Me-C28)、正三十四烷(n-C34)、正三十六烷(n-C36)和正四十四烷(n-C44)为主要成分(>5%)。(2)不同性别窝榕小蜂表皮碳氢化合物的组成及含量存在显著差异,正四十二烷(n-C42)、17-三十五烯(17-C35:1)、1-二十九烯(C29:1)、2-Me-C28和角鲨烯是造成两性差异的重要贡献量化合物。(3)雌、雄成虫表皮碳氢化合物均具有明显的季节变化:在干热季中,雌蜂正链烷烃(n-C34、n-C36和n-C44)的比例及碳氢化合物的总绝对含量增加,2-Me-C28和角鲨烯的比例降低;雄蜂甲基烯烃的比例增加,正链烷烃和甲基烷烃的比例降低,碳氢化合物总绝对含量无明显变化。本研究发现窝榕小蜂表皮碳氢化合物具有明显的性二型和强烈的季节可塑性,2-Me-C28和角鲨烯可作为雄蜂配偶识别时的候选性信息素;雌、雄成虫在适应高温和/或干燥的气候条件时存在差异化响应,表明窝榕小蜂两性表皮碳氢化合物在不同季节变化中采取不同的适应性策略。本研究揭示了榕小蜂应对不同气候环境的化学适应机制,为研究昆虫双重性状和理解生态适应与物种形成之间的功能联系奠定了化学基础。

关键词：鸡嗉子榕传粉榕小蜂表皮碳氢化合物性二型季节适应性

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84K杨HD2-型组蛋白去乙酰化酶基因的表达

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东北林业大学学报 2025年第4期53卷 1-11页

作者：马文晗张超马旭俊林木遗传育种全国重点实验室(东北林业大学) 哈尔滨150040

为了研究84K杨组蛋白去乙酰化酶(HDAC)家族中HD2亚家族成员在逆境胁迫应答中的表达模式,从84K杨中克隆得到PagHDT901、PagHDT902和PagHDT903基因的cDNA编码序列。生物信息学分析表明,这3种蛋白属于亲水蛋白,都具有NPL结构域。亚细胞定... 详细信息

为了研究84K杨组蛋白去乙酰化酶(HDAC)家族中HD2亚家族成员在逆境胁迫应答中的表达模式,从84K杨中克隆得到PagHDT901、PagHDT902和PagHDT903基因的cDNA编码序列。生物信息学分析表明,这3种蛋白属于亲水蛋白,都具有NPL结构域。亚细胞定位发现,这3种蛋白均定位在细胞核中。84K杨HD2亚家族基因的表达具有组织特异性,在叶片中表达量最高。设计干旱、盐、寒冷的模拟逆境,通过Real-time PCR方法,分析了84K杨HD2亚家族基因在不同逆境条件下的表达模式。研究结果表明,84K杨HD2亚家族基因积极响应逆境胁迫,推断该家族基因可能参与84K杨的抗逆防御调节过程。

关键词： 84K杨 HD2家族干旱胁迫盐胁迫冷胁迫

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白桦BpTT2基因的遗传转化及耐盐功能研究

白桦BpTT2基因的遗传转化及耐盐功能研究

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作者：刘涛东北林业大学

学位级别：硕士

实验室前期通过盆栽控盐的方法,提取白桦根尖伸长区总RNA制备转录组文库,明确盐胁迫应答基因,并构建级联调控网络,其中Bp TT2基因正处于网络调控关键位置,与多个关键家族基因在盐胁迫调控中有密不可分的联系,是枢纽基因。本文以白桦(Bet... 详细信息

实验室前期通过盆栽控盐的方法,提取白桦根尖伸长区总RNA制备转录组文库,明确盐胁迫应答基因,并构建级联调控网络,其中Bp TT2基因正处于网络调控关键位置,与多个关键家族基因在盐胁迫调控中有密不可分的联系,是枢纽基因。本文以白桦(Betula platyphylla)为试材,构建白桦Bp TT2基因植物表达载体,优化白桦遗传体系,将白桦Bp TT2基因导入到白桦中,并对其进行分子检测,对筛选的转基因植株进行初步盐胁迫功能分析。研究结果如下:(1)从白桦c DNA文库中克隆出Bp TT2基因,构建p BI121-Bp TT2-GFP表达载体。通过生物学信息学分析,全长789 bp,编码262个氨基酸,具有植物MYB转录因子家族的特异性结构域SANT MYB DNA结合结构域,属于R2R3-MYB家族。通过对Bp TT2基因进行多序列比对和进化树的构建,发现与亮叶桦Bl MYB3基因具有96.56%的同源性。(2)优化了白桦野生型组织培养再生体系,选取白桦叶片为实验材料,经过愈伤组织诱导、再分化、壮苗培养以及植株生根,形成再生植株,确定了各阶段最适合培养基、激素种类和浓度。当激素浓度为0.2 mg/L NAA+1 mg/L 6-BA,愈伤组织诱导率达到96.6%;当激素浓度为0.02 mg/L NAA+1.0 mg/L 6-BA,分化率最高,可达99.5%;当使用激素浓度为0.2 mg/L NAA时,生根率最高可达100%。(3)以白桦愈伤组织为试材,用转入植物表达载体p BI121-Bp TT2-GFP的根癌农杆菌GV3101进行瞬时转化。通过分析不同侵染时间、不同菌液浓度及激素配比对转化效率的影响,检测GFP绿色荧光蛋白72 h内荧光表达信号,研究影响瞬时转化的最佳条件,完善瞬时转化白桦愈伤组织体系,为该基因稳定遗传转化奠定实验基础。(4)在已优化的组织培养再生体系基础上,以白桦叶片和茎段为受体,利用农杆菌介导法开展稳定遗传转化研究,成功获得过表达Bp TT2基因白桦植株,建立以白桦叶片和茎段为基础的稳定转化体系。在DNA层面和RNA层面,使用特异性引物和GFP引物,通过PCR鉴定表明,Bp TT2基因已经成功整合到白桦基因组中。(5)正常生长条件下,过表达植株和野生型植株生长状况没有显著差别。通过盐胁迫实验发现,过表达植株和野生型植株生长均受到严重抑制,叶片发黄脱落。生理指标测定结果表明,过表达植株POD活性都略高于野生型,说明过表达植株能清除植物体内氧自由基,能够减少植物所受的伤害;过表达植株MDA含量都低于野生型,降低了盐胁迫对于细胞膜的损伤,减少细胞的损伤和死亡,进而提高过表达植株的耐盐能力。综上所述,表明Bp TT2基因参与白桦生长发育,提高了白桦清除活性氧的能力,保护细胞膜的稳定性,提高白桦抗盐胁迫能力。

关键词：白桦 BpTT2基因遗传转化耐盐性

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基于UHF RFID的活立木含水率预测方法研究

基于UHF RFID的活立木含水率预测方法研究

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作者：张成武南京林业大学

学位级别：硕士

近年来,森林资源的利用和保护变得越来越重要,如何有效管理森林资源是全世界共同研究的课题。其中,活立木含水率测量在活立树木的监测和管理中起到至关重要的作用,其测量精度对林业信息化产业的发展具有重要意义。目前有很多技术手段被... 详细信息

近年来,森林资源的利用和保护变得越来越重要,如何有效管理森林资源是全世界共同研究的课题。其中,活立木含水率测量在活立树木的监测和管理中起到至关重要的作用,其测量精度对林业信息化产业的发展具有重要意义。目前有很多技术手段被运用在木材含水率的检测中,但是检测过程及结果中存在的高能耗、低适用性、低预测精度等问题还需要进一步解决。本课题针对活立木水分生理研究和林业信息化技术的发展需求,以活立木含水率的无损检测和高效识别为目标,开展了基于无源超高频射频识别技术（UHF RFID）的活立木含水率研究。论文的主要思路为:基于低功耗的射频识别技术获取射频信号数据,同时采集测量环境中关键环境参数的数据;接着改进和集成先进的机器学习技术,建立最佳的活立木含水率预测模型,实现对各类木材的含水率无损检测;最后通过大量实验验证了该在线预测模型,结果证明所提出的方案具有准确、无损、实用、低功耗的优点,满足目前林业物联网领域的含水率检测需求。论文的具体研究内容如下:（1）总结了国内外相关研究现状和无源超高频射频识别技术的特点,基于UHF RFID技术设计了一种超低成本的活立木含水率检测方案。在校园林站中建立了一个高效的数据采集系统,设计了上位机程序进行长期的数据采集操作,获取了反向散射信号中的接收信号强度指数（RSSI）和相位等信息并采集了其它关键环境参数数据,对数据进行预处理并基于改进支持度函数的数据加权融合策略对多标签数据进行了同构数据融合,验证了由RSSI和相位反演活立木含水率的可行性。（2）基于UHF RFID传感器,优化现有识别机制,提出了一种改进的在线序列并行极限学习机算法（OS-PELM）。OS-PELM对传统在线序列极限学习机（OS-ELM）中的隐藏层网络结构进行优化,通过探路者算法进行初始参数优化并使用在线神经元调整的策略调节模型参数,根据改进算法建立了预测模型并用于含水率预测系统。（3）基于实验室和室外活立木中采集到的大量数据,使用基于OS-PELM算法的含水率预测模型进行了活立木实测分析,实验结果表明OS-PELM算法的性能与传统的OS-ELM算法相比有显著提升,在四种不同种类的树木上（水杉、杨树、松树、山毛榉）都具有更高的准确率。通过鲁棒性实验证明了所提出的活立木含水率无损检测系统具有准确率高、稳定性好、鲁棒性强等优点,可以为目前林业物联网行业提供切实可行的方案。对于所有采集样本,所提出模型的预测值与实际值之间的MAE为0.224,RMSE为0.252,R2系数为0.9629。将基于OS-PELM算法的预测模型与其它四种算法（DE-OSELM、WE-OSELM、GSA-PELM、OLSPELM）进行比较,采取的优化策略在预测准确率上具有显著优势。综上所述,论文为实时、准确地预测活立木含水率提供了强有力的设计思路和技术支持,在国家林草局精准林业的示范推广中具有极为广阔的应用前景。

关键词：含水率活立木射频识别极限学习机

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