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江苏农业学报 2025年第1期41卷 41-50页

作者：李明瑾霍建飞韩长志姚玉荣贲海燕郝永娟王万立西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224 天津市农业科学院植物保护研究所天津300384

由辣椒炭疽病病原菌引起的辣椒炭疽病严重危害着中国辣椒产业的健康发展。分泌蛋白作为炭疽病病原菌中重要的致病因子,能帮助病原菌侵入寄主组织、分解寄主细胞壁,为病原菌生存和繁殖提供条件。然而,学术界尚缺乏对辣椒炭疽病病原菌中... 详细信息

由辣椒炭疽病病原菌引起的辣椒炭疽病严重危害着中国辣椒产业的健康发展。分泌蛋白作为炭疽病病原菌中重要的致病因子,能帮助病原菌侵入寄主组织、分解寄主细胞壁,为病原菌生存和繁殖提供条件。然而,学术界尚缺乏对辣椒炭疽病病原菌中分泌蛋白的深入解析和研究。本研究基于前期获得的辣椒炭疽病病原菌强致病菌株TJNH1全基因组序列,充分利用SignalP、ProtComp等生物信息学分泌蛋白预测软件,对该病菌中13 419条蛋白质氨基酸序列进行预测,同时,基于转录组测序数据,对上述分泌蛋白的功能及特性展开研究。结果表明,辣椒炭疽病病原菌菌株TJNH1中含有388个分泌蛋白,占总蛋白质数量的2.89%,分泌蛋白氨基酸序列长度介于55 aa至730 aa,非极性氨基酸丙氨酸(Ala)在分泌蛋白里使用频率最高,分泌蛋白信号肽长度集中于17 aa至21 aa,信号肽切割位点为A-X-A型。分泌蛋白均为亲水性蛋白,高亲水性氨基酸和高疏水性氨基酸数量最多的分别是天冬酰胺(Asn)和丙氨酸(Ala),分泌蛋白大多为稳定、酸性蛋白。同时运用SMART、eggNOG、STRING V11.5等软件对上述分泌蛋白的保守结构域、COG功能分类、蛋白质互作关系等进行分析,有152个分泌蛋白具有明显的保守结构域,163个分泌蛋白获得了功能注释,32个分泌蛋白存在互作关系。该研究结果为明确分泌蛋白的功能和辣椒炭疽病病原菌的致病机理提供了理论支撑,也为筛选以分泌蛋白为靶标的新型农药和辣椒炭疽病绿色防控提供了理论依据。

关键词：辣椒炭疽病病原菌分泌蛋白生物信息学分析

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基于蛋白质组学的胃腺癌患者预后标志物筛选

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中国卫生统计 2025年第1期42卷 18-25,32页

作者：刘佳璐韩鑫浩魏孝礼陈璐程丽霞陈英东王文晗张秋菊哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 150081 哈尔滨医科大学附属肿瘤医院消化内科

目的利用TCPA及UCSC Xena数据库获取样本信息,构建胃腺癌预后相关蛋白的预测模型,并检验其应用价值,以期为临床治疗与相关机制研究提供参考。方法利用R语言软件,通过单因素Cox分析和LASSO-Cox回归分析筛选与胃腺癌预后有关的蛋白质,并... 详细信息

目的利用TCPA及UCSC Xena数据库获取样本信息,构建胃腺癌预后相关蛋白的预测模型,并检验其应用价值,以期为临床治疗与相关机制研究提供参考。方法利用R语言软件,通过单因素Cox分析和LASSO-Cox回归分析筛选与胃腺癌预后有关的蛋白质,并计算风险评分,根据风险评分结果将患者划分为高风险组和低风险组开展生存分析。同时绘制风险评分的ROC曲线、蛋白质热图等,用以评估这些蛋白质的预测能力。然后,将风险评分与患者其他临床表型数据结合,进行多因素回归分析,建立预后模型,并绘制列线图。通过C-index指标、ROC曲线、决策曲线等评估预后模型建立的准确性。进行GO富集分析与KEGG富集分析,探索相关蛋白所参与的生物学过程。结果通过单因素Cox分析及LASSO-Cox分析筛选出15个差异蛋白质(CKIT、CHK1、CLAUDIN7、COLLAGENVI、DVL3、EGFR_pY1173、ERALPHA_pS11、NFKBP65_pS536、SYK、ETS1、MYOSINIIA_pS1943、P21、P90RSK、RAPTOR、XBP1),用于计算蛋白质风险评分。通过多因素回归分析,筛选出年龄、性别、M分期、N分期、风险评分这5种因素,构建预后模型。生存分析结果认为,蛋白质风险评分划分的高低风险组之间的总生存率有显著差异(P<0.0001)。列线图可以用来预测患者3年、5年的生存率,并认为具有较好的预测价值(C-index=0.7257)。ROC曲线显示模型在预测中表现出稳定的灵敏度和特异度(AUC=0.77和0.86)。结论胃腺癌预后相关蛋白质的预测模型可用来预测患者的临床预后,研究结果可为个性化治疗和管理提供参考。

关键词：胃腺癌预测模型预后

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居家养老场景下辅助站立沙发椅用户研究与设计实践

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家具 2025年第1期46卷 29-32,114页

作者：唐晨晗黎洋周橙旻南京林业大学家居与工业设计学院南京210037

为提高居家老年人生活质量并辅助解决站立困难问题,设计面向居家老年群体的辅助站立沙发椅系统。通过对用户行为的定量和定性研究,利用专业科学的数据分析平台(SPSSPRO,SPSS)进行数据分析。首先,对问卷数据进行信度检验以确定回答的可靠... 详细信息

为提高居家老年人生活质量并辅助解决站立困难问题,设计面向居家老年群体的辅助站立沙发椅系统。通过对用户行为的定量和定性研究,利用专业科学的数据分析平台(SPSSPRO,SPSS)进行数据分析。首先,对问卷数据进行信度检验以确定回答的可靠性;其次,进行因子有效性测试;最后,通过因子载荷矩阵热力图分析主成分中的隐变量,从而确定辅助站立沙发椅重要度测量的问卷填写可靠性。使用熵值法确定座椅各部位重要度优先级,并在用户访谈定性研究中应用福格行为模型(Fogg Behavior Model,Fogg)理解用户行为发生机制。研究表明,53.60%的老年人倾向使用带助起功能的沙发和辅助设备,扶手、靠背和座面三部分相互关联,影响座椅舒适度与起身。通过用户研究,构建了产品层次系统,并对产品信息层、技术层、功能层和目标层进行定位,设计并实现了沙发椅硬件部分及与其匹配的移动端应用原型,显著提升了居家养老群体的用户体验。

关键词：用户研究沙发椅设计辅助站立居家场景

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白桦BpHsfA4a基因克隆及生物信息学分析

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现代农业科技 2025年第2期 175-178,182页

作者：宋雨瞧东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室黑龙江哈尔滨150040

白桦(Betula platyphylla Suk.)是生长速度较快的落叶乔木树种,具有较强的耐寒性和环境适应性,通过发掘白桦抗逆基因来揭示其抗逆机制,有助于改良白桦的抗逆性。热应激转录因子(heat stress transcription factors,HSFs)是广泛存在于植... 详细信息

白桦(Betula platyphylla Suk.)是生长速度较快的落叶乔木树种,具有较强的耐寒性和环境适应性,通过发掘白桦抗逆基因来揭示其抗逆机制,有助于改良白桦的抗逆性。热应激转录因子(heat stress transcription factors,HSFs)是广泛存在于植物细胞内的一类转录因子,用以响应植物应对逆境胁迫的机制。在对白桦进行盆栽控盐的基础上,提取白桦总RNA制备转录组文库,构建级联调控网络,其中BpHsfA4a基因调控植物耐盐的效果明显。基于这一表现,利用生物信息学分析软件对BpHsfA4a基因的基本理化性质进行分析,对BpHsfA4a基因编码蛋白的保守结构域、亲水性/疏水性、跨膜结构、亚细胞定位和多重序列比对情况等进行推断。结果表明,BpHsfA4a蛋白分子质量为44.14 kD,编码序列长度为1170 bp,等电点为5.14,编码氨基酸389个,亚细胞定位显示位于细胞核。多重序列比对及系统进化分析表明,BpHsfA4a与其他植物的HsfA4a有较高的一致性,与大叶栎的一致性最高。这为进一步揭示BpHsfA4a的功能提供了初步的分子基础。

关键词：白桦 BpHsfA4a 基因克隆生物信息学分析逆境胁迫

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基于SAR图像的小目标检测算法

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计算机工程与设计 2025年第2期46卷 570-577页

作者：许峻滔王卓薇赵艮平广东工业大学计算机学院广东广州510006 广东工业大学信息物理融合系统重点实验室广东广州510006

针对SAR图像上的小目标难以被检测的问题,提出一种STSAR-YOLOv5目标检测算法。在YOLOv5基础上增加一层检测头捕捉小目标;在骨干网络部分加入BoTNet模块,其具有全局信息获取能力,能够在高度密集场景下定位小目标。在自主构建的SSAD数据... 详细信息

针对SAR图像上的小目标难以被检测的问题,提出一种STSAR-YOLOv5目标检测算法。在YOLOv5基础上增加一层检测头捕捉小目标;在骨干网络部分加入BoTNet模块,其具有全局信息获取能力,能够在高度密集场景下定位小目标。在自主构建的SSAD数据集上进行对比实验,实验结果表明,STSAR-YOLOv5的检测效果较YOLOv5有明显提升,该方法平均检测精度(mAP_0.5:0.95)提高了7.8%。相比YOLOv5算法,该算法对SAR图像中的小目标表现出较好的检测性能和鲁棒性。

关键词：合成孔径雷达目标检测小目标遥感图像深度学习 YOLO模型计算机视觉

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基于TLS的长白落叶松人工林树冠体积模型

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中南林业科技大学学报 2025年第4期 65-75页

作者：沈玉曦田栋元姜立春东北林业大学林学院东北林业大学森林生态系统可持续经营教育部重点实验室

【目的】树冠是衡量树木活力的重要指标，开发树冠体积模型可为林分冠层结构的管理和优化提供理论依据。【方法】以长白落叶松Larix olgensis人工近成熟林为研究对象，使用地基激光扫描技术（Terrestrial laser scanning,TLS）获取的点... 详细信息

【目的】树冠是衡量树木活力的重要指标，开发树冠体积模型可为林分冠层结构的管理和优化提供理论依据。【方法】以长白落叶松Larix olgensis人工近成熟林为研究对象，使用地基激光扫描技术（Terrestrial laser scanning,TLS）获取的点云数据提取单木信息，包括胸径、树高、冠幅、冠长和树冠体积，使用K-means聚类分析将样地内林木划分为优势木、平均木和被压木3个等级并将其设置为哑变量引入树冠体积预测模型中，通过再参数化方法纳入协变量，构建广义树冠体积模型，并模拟树冠体积随树冠尺寸、竞争强度和结构多样性梯度变化的响应。【结果】K-means聚类分析法能够客观地描述不同生长优势的林层间树冠体积的差异；十折交叉检验的结果表明以林木分级作为哑变量，包含单木和林分变量的落叶松树冠体积模型具有稳健的预测能力，精度满足林业工作适用标准；落叶松的树冠体积随着冠幅和冠长的增加而增加，随着林分密度和基尼系数的增加而减小。【结论】通过建立树冠体积模型，揭示了树木大小、树冠因子、林分结构多样性和种内竞争与树冠体积之间的关系，可为人工林冠层优化管理提供参考。

关键词：长白落叶松人工林树冠体积模型哑变量林木分级林分结构多样性地基激光扫描

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文冠果BZR1基因家族鉴定及功能分析

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南京林业大学学报(自然科学版) 2025年第2期49卷 12-22页

作者：许慧慧班卓王晨雪毕泉鑫刘肖娟王利兵中国林业科学研究院林业研究所国家林业和草原局林木培育重点实验室林木遗传育种全国重点实验室

【目的】探究文冠果(Xanthoceras sorbifolium)BrassinazoleResistance1(BZR1)基因家族成员的特征及其在非生物胁迫响应中的作用，为文冠果XsBZR1基因功能的研究和抗逆新品种的选育提供理论参考。【方法】利用生物信息学方法鉴定并系统... 详细信息

【目的】探究文冠果(Xanthoceras sorbifolium)BrassinazoleResistance1(BZR1)基因家族成员的特征及其在非生物胁迫响应中的作用，为文冠果XsBZR1基因功能的研究和抗逆新品种的选育提供理论参考。【方法】利用生物信息学方法鉴定并系统分析文冠果XsBZR1基因家族；构建35S::XsBZR1-eYFP融合蛋白，对XsBZR1进行亚细胞定位分析；通过实时荧光定量PCR技术分析XsBZR1基因在非生物胁迫下的表达模式；构建XsBZR1-9基因的过表达载体并转化到拟南芥(Arabidopsis thaliana)中，观察转基因株系与野生型植株在盐胁迫处理下的生长情况。【结果】(1)在文冠果基因组中共鉴定出9个BZR1基因，分别命名为XsBZR1-1—XsBZR1-9,这些基因不均匀地分布在6条染色体上。(2)系统进化和共线性分析表明，XsBZR1蛋白与双子叶植物的BZR 1转录因子亲缘关系更为密切。(3)XsBZR1基因的启动子区域具有大量的光响应、激素响应元件以及胁迫应答响应元件。(4)亚细胞定位结果和预测结果一致，9个XsBZR1均定位于细胞核。(5)qRT-PCR分析表明，9个XsBZR1基因在不同的非生物胁迫下表现出不同的表达模式。除XsBZR1-7外，其余XsBZR1基因在低温胁迫下3 h时迅速上调表达；盐胁迫下XsBZR1的表达量呈现较大的差异性，XsBZR1-3/4/5/7的表达受到盐胁迫的显著抑制，而XsBZR1-1和XsBZR1-9在盐胁迫处理9 h时表达量提高到约20倍；XsBZR1-3/7/8/9在干旱处理9 h时表达量提高到2倍以上，而其余XsBZR1在干旱处理下的表达水平变化不大；9个XsBZR1均受到ABA的诱导表达，其中XsBZR1-8在ABA处理9 h时表达量提高到35倍。(6)在拟南芥中过表达XsBZR1-9发现，转基因植株在盐胁迫处理后的主根长度显著高于野生型植株。【结论】XsBZR1家族成员参与了文冠果非生物胁迫响应，过表达XsBZR1-9显著提高植物对盐胁迫的耐受性，这为进一步分析XsBZR1基因在文冠果抗逆机制中的作用奠定了基础。

关键词：文冠果 BZR1转录因子非生物胁迫基因过表达盐胁迫响应 XsBZR1-9

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基于无人机的柠条锦鸡儿生物量遥感估测

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林业科学 2025年

作者：吴家敏王亚欣孙斌马志杰孙维娜洪亮云南师范大学地理学部中国林业科学研究院资源信息研究所国家林业和草原局林业遥感与信息技术重点实验室鄂尔多斯市林业和草原局鄂尔多斯市国际荒漠化防治技术创新中心

目的】运用无人机数据与机器学习算法，实现单株柠条锦鸡儿的高精度提取及生物量精准估测，为干旱区灌木生物量估测提供新方法，减少对生态环境的破坏。【方法】本研究综合利用无人机载多光谱和激光雷达数据，融合光谱和垂直结构信息，... 详细信息

目的】运用无人机数据与机器学习算法，实现单株柠条锦鸡儿的高精度提取及生物量精准估测，为干旱区灌木生物量估测提供新方法，减少对生态环境的破坏。【方法】本研究综合利用无人机载多光谱和激光雷达数据，融合光谱和垂直结构信息，基于面向对象方法开展单株柠条锦鸡儿高精度提取研究。在此基础上，通过对比随机森林（RF）、支持向量回归（SVR）和极端梯度提升决策树（XGBoost） 3种机器学习算法，开展生物量的遥感精准估测。【结果】1)利用无人机获取的超高分辨率影像数据，通过L SMS分割算法和S VM分类器能够实现单株柠条锦鸡儿的高精度识别，各样方柠条锦鸡儿的分割准确率在8 6%以上，总样方准确率在9 0%以上，欠分割和过分割误差在6%以下，总体分类精度达到9 1.51%;2)基于支持向量机的递归特征消除（SVM-RFE）方法筛选出对生物量建模贡献度高的1 7个变量，其中包括2个平面特征和15个高度变量，高度变量对生物量的累计贡献度显著高于平面特征（8.7 vs.1.39）;3)与R F和S VR模型相比，XGBoost模型对柠条锦鸡儿的生物量具有更高的估测结果(R2=0.95,RMSE=259.57 g.m-2,MAE=157.51g.m-2)，尤其在生物量低于2000 g·m-2时效果最佳；4)通过U AV-LiDAR提取的多个植被垂直结构信息，从侧面反映出植被内部生长的多样性和垂直复杂性，有助于提升生物量估测精度。此外，综合考虑包括高度的平均绝对偏差、变异系数、方差、高度百分位数等多维度高度变量进行生物量预测，相比单一的最大值高度变量指标更具优势。【结论】利用L SMS分割和S VM分类方法提取单株灌木，为单株植被的识别提供了技术参考；引入了多维度的点云高度指标参与生物量估测中，弥补了单一多光谱数据对柠条锦鸡儿垂直结构信息的缺失，提高了生物量估测精度；X GBoost模型为干旱区小尺度的灌木生物量估测提供新的视角和工具；基于无人机数据获取的高分辨率影像和点云数据，避免了对当地生态环境造成破坏，尤其是在脆弱的沙地区

关键词：柠条锦鸡儿无人机生物量极端梯度提升决策树激光雷达数据

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大兴安岭北部多年冻土现状及变化特征

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冰川冻土 2025年第1期47卷 126-138页

作者：常晓丽肖苓海金会军李晓英何瑞霞余田霞湖南科技大学地球科学与空间信息工程学院湖南湘潭411201 东北林业大学土木工程学院黑龙江哈尔滨150040 中国科学院西北生态环境资源研究院冰冻圈科学与冻土工程全国重点实验室甘肃兰州730000

冻土作为冰冻圈重要的组成部分,其存在分布及水热状态受到多种因素的影响。除了纬度、海拔等,局地因素如植被类型、积雪、土壤水分等也在很大程度上影响冻土的变化。特别是位于欧亚大陆多年冻土南缘的兴安-贝加尔型多年冻土,其发育、保... 详细信息

冻土作为冰冻圈重要的组成部分,其存在分布及水热状态受到多种因素的影响。除了纬度、海拔等,局地因素如植被类型、积雪、土壤水分等也在很大程度上影响冻土的变化。特别是位于欧亚大陆多年冻土南缘的兴安-贝加尔型多年冻土,其发育、保存和分布等状态特征与局地因素密不可分。本文结合40多个钻孔资料和现有研究成果,分析得出目前大兴安岭多年冻土温度和厚度总体上受纬度影响,由南往北随年平均气温降低,冻土温度由0℃降到-2.83℃,但局地因素的影响可使地温最低达-3.6℃;厚度范围为29~130 m,其中地温低、厚度大的多年冻土主要发育在谷底的塔头灌丛湿地区域。满归、根河、伊图里河、新林等地的监测数据表明,自2009年开始,大部分钻孔温度显示该区活动层减薄,浅层多年冻土地温降低,融区最大冻结深度加深,而深层多年冻土却呈升温趋势,零地温变化率位置则各不相同,推测这种情况与全球变暖间隙以及植被、积雪和人类活动等局地因素有关。本研究对理解高纬度多年冻土区的地温变化过程以及这些变化的驱动因素具有重要的科学价值,也会对区域经济可持续发展及应对冻土退化带来的问题起到积极作用。

关键词：冻土退化冻土温度活动层减薄零地温变化率大兴安岭

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基于Trans-Attention的飞行区航空器监视数据融合方法

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北京航空航天大学学报 2025年第4期51卷 1215-1223页

作者：王兴隆尹昊丁俊峰中国民航大学飞联网重点实验室天津300300 南京莱斯信息技术股份有限公司南京210001

针对飞行区航空器单一监视源存在监视精度低、位置跳变的问题,提出一种基于Transformer和注意力机制的航空器监视数据融合方法。利用Transformer的编码器结构分别对各监视源数据进行特征提取,通过注意力机制对不同监视源赋予权重值,经... 详细信息

针对飞行区航空器单一监视源存在监视精度低、位置跳变的问题,提出一种基于Transformer和注意力机制的航空器监视数据融合方法。利用Transformer的编码器结构分别对各监视源数据进行特征提取,通过注意力机制对不同监视源赋予权重值,经过全连接网络进行回归计算,获得最终的融合结果。选取场面监视雷达(SMR)和广播式自动相关监视(ADS-B)系统的监视数据作为融合源,多点定位(MLAT)数据作为真实标签,实验结果表明:所提方法有效降低了单一监视源的监视误差,且融合效果优于基于注意力机制的长短期记忆网络、循环神经网络和扩展卡尔曼滤波融合方法,平均绝对误差分别提升了2.81%、16.73%和35.80%。

关键词：数据融合 Transformer 注意力机制场面监视雷达广播式自动相关监视

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