拷贝数变异(copy number variations,CNVs)是基因组重排引起大于1 kb DNA片段的获得或丢失而造成的结构变异。其最初在人类基因组中发现,与许多复杂性疾病相关,常被用于人类疾病的预防与临床诊断。CNVs也于植物基因组中广泛存在,如拟南...
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拷贝数变异(copy number variations,CNVs)是基因组重排引起大于1 kb DNA片段的获得或丢失而造成的结构变异。其最初在人类基因组中发现,与许多复杂性疾病相关,常被用于人类疾病的预防与临床诊断。CNVs也于植物基因组中广泛存在,如拟南芥、水稻、玉米、大豆、小麦、黄瓜等,目前研究表明:CNVs呈不均匀方式分布在染色体上,且与染色体长度无相关性;位于CNVs区域内的基因,或与CNVs重叠的基因多与细胞死亡、防御反应、生物和非生物逆境胁迫响应等特异生物功能密切相关;CNVs自身的缺失或获得可以改变基因剂量和基因表达,可引起植株高度、开花时间与种子休眠等重要表型性状的变异。在此基础上,本文对CNVs在群体遗传变异、全基因组关联分析以及未来可能在林木遗传研究中的应用进行了展望。
以玉米基础自交系(AS-9)及其化学诱变自交系M4为实验材料进行耐盐性鉴定,同时利用44对可能与根系性状有关联的SSR引物进行遗传变异分析。结果表明,诱变M4幼苗经200和250 mmol·L-1 Na Cl盐胁迫处理7 d后,IV400、IV1600根数比AS-9对...
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以玉米基础自交系(AS-9)及其化学诱变自交系M4为实验材料进行耐盐性鉴定,同时利用44对可能与根系性状有关联的SSR引物进行遗传变异分析。结果表明,诱变M4幼苗经200和250 mmol·L-1 Na Cl盐胁迫处理7 d后,IV400、IV1600根数比AS-9对照分别增加23.1%、19.1%,诱变IV1600初生根1、2、3根长分别为对照的1.33、1.70、2.15倍;同时在M4玉米试材中扩增出多态性条带的引物25对,占引物总数的56.82%;诱变自交系M4与AS-9的遗传相似系数平均值为0.6563,遗传相似系数中心化后,数据在-0.04处可把材料分为三个类群,基础材料AS-9为Ⅰ类,M4代IV1400、IV1600、IV2000聚为Ⅲ类,其余诱变系为Ⅱ类。此外,6对引物的SSR-PCR产物进行序列差异检测,结果产生新的基元和基元重复次数变化,说明系列化学诱变已使玉米自交系AS-9产生了显著的遗传变异。
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