检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2023年第12期21卷 3898-3906页

作者：李健刘家福徐宏蔚刘晓王艳徐吉臣北京林业大学林木育种国家工程实验室北京100083 山东省果树研究所泰安271000

本研究拟探讨杨树基因家族的密码子特征,为深入解析杨树基因家族的进化规律并为分子育种奠定基础。本研究基于测序的毛果杨基因组,鉴定扩展蛋白(Expansin)、肌动蛋白(Actin)、纤维素合酶(Cellulose synthase,Ces)、果胶甲酯酶(pectin me... 详细信息

本研究拟探讨杨树基因家族的密码子特征,为深入解析杨树基因家族的进化规律并为分子育种奠定基础。本研究基于测序的毛果杨基因组,鉴定扩展蛋白(Expansin)、肌动蛋白(Actin)、纤维素合酶(Cellulose synthase,Ces)、果胶甲酯酶(pectin methylesterase,Pmes)和木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,Xth)5个基因家族序列,并利用CodonW等软件分析5个家族基因密码子的碱基组成特征。结果显示,毛果杨5个基因家族密码子的GC含量、有效密码子数(ENC)相似,密码子第三位碱基都偏好使用碱基T,具有一定的物种特征。不同基因家族也存在一定程度的特异性,分别含有9(Actin)、9(Ces)、5(Pmes)、6(Expansin)、4(Xth)个高频密码子,以及22(Actin)、9(Ces)、14(Pmes)、19(Expansin)、16(Xth)个最优密码子。毛果杨基因密码子使用偏性较弱,不同基因家族进化的方向和速率存在一定的差异。

关键词：毛果杨基因家族密码子偏性基因表达

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利用异速生长模型和博弈论解析藏川杨主干动态生长的遗传调控机制

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北京林业大学学报 2024年第6期46卷 154-164页

作者：危学达王玉丁孟东吴双梁丹叶梅霞邬荣领生物科学与技术学院计算生物学中心林木育种国家工程实验室林木、花卉遗传育种教育部重点实验室树木花卉育种生物工程国家林业和草原局重点实验室北京林业大学生物学院北京100083

【目的】高度与直径是树木生命历程中的2个重要生长性状,本文通过量化藏川杨主干高度和直径之间的相互作用,探究这2个性状的生长过程和生长模式,揭示藏川杨主干动态生长的遗传调控机制。【方法】基于异速生长模型和博弈论构建藏川杨高... 详细信息

【目的】高度与直径是树木生命历程中的2个重要生长性状,本文通过量化藏川杨主干高度和直径之间的相互作用,探究这2个性状的生长过程和生长模式,揭示藏川杨主干动态生长的遗传调控机制。【方法】基于异速生长模型和博弈论构建藏川杨高度与直径性状的动态生长互作微分方程,利用系统作图构建藏川杨主干生长遗传解析的统计模型。进一步以藏川杨自然群体作为研究材料,调查其在温室内的生长动态数据,结合本群体的高通量分子标记数据,开展藏川杨的全基因组基因定位工作。【结果】藏川杨主干高度和直径的整体生长曲线符合Logistic生长曲线,拆分整体生长曲线发现,藏川杨主干的直径生长对高度生长具有抑制作用,而高度生长对直径生长具有促进作用。所有藏川杨高度和直径的个体拟合优度> 0.90,且2个性状拟合的残差均服从随机分布,说明使用广义Lotka-Volterra微分方程来拟合藏川杨高度和直径效果很好。基于功能作图方法共定位到78个显著位点,可注释到52个候选基因。以2号染色体上最显著的SNP为例,对藏川杨高度和直径进行遗传解析,发现该SNP的3种基因型(AA、AC、CC)具有相似的高度–直径相互作用模式。该SNP对整体生长、独立生长和依赖生长发挥了不同方式的遗传效应。对定位到的显著位点进行功能注释,可将这些位点所在的基因分为:与木质素/细胞壁合成相关基因、与生长发育相关基因、与抗病抗逆性相关基因、与光合作用相关基因这4类。【结论】结合异速生长模型和博弈理论的基因定位模型,可检测基因如何通过合作或竞争策略来调控藏川杨主干的大小,识别树干动态生长的过程和模式,相关模型也可为其他物种重要性状之间的深层次遗传解析提供借鉴。

关键词：藏川杨博弈论异速生长模型高度直径数量性状位点

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珍稀树种庙台槭不同组织DNA高效提取方法分析

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分子植物育种 2019年第4期17卷 1228-1237页

作者：李萌李翔庞晓明李颖岳北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室林木与花卉育种教育部重点实验室北京100083

为探讨庙台槭不同组织DNA的高效提取方法,分别以叶片和果实为材料,以完全随机区组试验设计,设置不同浓度的β-巯基乙醇和不同浓度的PVP作为预处理,采用试剂盒法提取基因组DNA,提取后对基因组DNA进行浓度、分光光度值的测定以及PCR扩增,... 详细信息

为探讨庙台槭不同组织DNA的高效提取方法,分别以叶片和果实为材料,以完全随机区组试验设计,设置不同浓度的β-巯基乙醇和不同浓度的PVP作为预处理,采用试剂盒法提取基因组DNA,提取后对基因组DNA进行浓度、分光光度值的测定以及PCR扩增,综合各项指标选择出效果最好的预处理方法,并进一步以CTAB法进行验证,之后应用于不同个体庙台槭的DNA提取中。结果发现:以庙台槭果实为材料,不需要预处理,提取的DNA即可满足下游实验需要;以叶片为材料,用0.5%β-巯基乙醇和1%PVP预处理能有效提高提取的DNA浓度和质量,经验证发现该预处理方法适用于CTAB法,且能够极显著地提高DNA提取的浓度和质量;进一步应用于所有132个庙台槭个体的总DNA提取,获得的DNA均能满足后续实验要求。本研究为进一步研究庙台槭遗传多样性等工作提供帮助,同时也能够为槭属其他植物的相关研究提供参考。

关键词：庙台槭多酚组织 DNA提取

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欧美杨与藏川杨杂交子代苗期性状QTLs定位分析

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西南林业大学学报（自然科学） 2016年第5期36卷 10-15页

作者：李娟郭斌安新民北京林业大学林木育种国家工程实验室北京100083 山西省林业科学研究院山西太原030012

以欧美杨I-108和藏川杨为亲本杂交得到427个子代为试材,对其进行苗期性状遗传图谱分析,并构建了1张总长度969.1 c M,标记间平均距离25.14 c M的杂交杨树遗传图谱。结果表明:该图谱包含6个连锁群,连锁群上标记数量37个,用Genemap软件绘... 详细信息

以欧美杨I-108和藏川杨为亲本杂交得到427个子代为试材,对其进行苗期性状遗传图谱分析,并构建了1张总长度969.1 c M,标记间平均距离25.14 c M的杂交杨树遗传图谱。结果表明:该图谱包含6个连锁群,连锁群上标记数量37个,用Genemap软件绘制标记连锁图谱;检测到株高(h_s)、单叶光合速率(P_n)、胞间CO_2浓度(C_i)、蒸腾速率(T_r)4个表型指标符合正态分布。利用MAPMAKER软件的区间作图法进行QTL定位和效应估计,共检测到8个与苗期生长和光合性状相关的QTL,包括3个与h_s相关的QTL,贡献率分别为16.4%、20.1%和17.8%;2个与P_n相关的QTL,贡献率分别为10.2%和13.7%;2个与C_i相关的QTL,贡献率分别为6.7%和8.3%;1个与T_r相关的QTL,贡献率9.7%。

关键词：藏川杨欧美杨杂交遗传图谱 QTL定位苗期性状

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菊花新品种‘伏看繁星’

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园艺学报 2019年第S02期46卷 2842-2843页

作者：袁存权张启翔北京林业大学园林学院花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室国家花卉工程技术研究中心城乡生态环境北京实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室北京100083 北京林业大学林木分子设计育种高精尖创新中心北京100083

地被菊(Chrysanthemum morifolium)‘伏看繁星’是以‘红贵’为母本,以‘15-2OP优6’为父本,杂交选育出的低矮紧凑型新品种。株高32~40 cm,冠幅45~53 cm,分枝多且紧凑,株形圆整,自然生长呈半球状。舌状小花内侧主要颜色为淡黄色(Yellow ... 详细信息

地被菊(Chrysanthemum morifolium)‘伏看繁星’是以‘红贵’为母本,以‘15-2OP优6’为父本,杂交选育出的低矮紧凑型新品种。株高32~40 cm,冠幅45~53 cm,分枝多且紧凑,株形圆整,自然生长呈半球状。舌状小花内侧主要颜色为淡黄色(Yellow group 11B),有红紫色(Red purple 67C)斑点和条纹分布。抗倒伏能力强,着花繁密,整个生长期均未出现冠幅中心表土裸露现象。自然花期在10月初至10月下旬。适合华北地区大部、西北地区中部及辽宁南部等区域栽培应用。

关键词：菊花杂交抗倒伏品种

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欧美杨细菌性溃疡病菌基因组测序与分析

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基因组学与应用生物学 2022年第2期41卷 331-343页

作者：张立春肖丹丹付田田王延伟北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室林木分子设计育种高精尖创新中心北京100083

欧美杨细菌性溃疡病菌(Lonsdalea populi)是引起杨树溃疡病的主要病原菌,它可引起树干形成层的破坏和树皮的局部坏死。为挖掘其致病基因,本研究利用二代和三代测序技术对欧美杨细菌性溃疡病菌N-5-1进行了全基因组测序。结果表明:该病菌... 详细信息

欧美杨细菌性溃疡病菌(Lonsdalea populi)是引起杨树溃疡病的主要病原菌,它可引起树干形成层的破坏和树皮的局部坏死。为挖掘其致病基因,本研究利用二代和三代测序技术对欧美杨细菌性溃疡病菌N-5-1进行了全基因组测序。结果表明:该病菌菌株染色体和质粒大小分别为3832567 bp和11289 bp,GC含量分别为55.42%和56.32%。通过对基因组的分析,共预测到3556个基因,在GO、KEGG和COG数据库分别注释到2348个、2785个和2374个基因。进一步利用Ⅲ型分泌系统数据库注释到501个编码分泌蛋白的基因,在病原互作数据库中注释到了427个病原与宿主互作的基因,其中13个为效应子基因。通过与Lonsdalea属的其他病原菌的基因组进一步比较发现,菌株Lonsdalea populi N-5-1的基因组与Lonsdalea iberica LMG 26264和Lonsdalea populi L2-3的基因组存在良好的共线性关系,且与Lonsdalea populi L2-3的亲缘关系更近。本研究为解析欧美杨细菌性溃疡病菌的基因组结构、功能及亲缘关系提供了科学基础,并为后续深入研究其致病基因及开展树木抗病分子育种提供了基因组信息和基因资源。

关键词：欧美杨细菌性溃疡病菌全基因组测序比较基因组学杨树溃疡病

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樟子松SSR反应体系优化

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基因组学与应用生物学 2013年第3期32卷 413-419页

作者：方攀张运城袁虎威刘玉林李伟林木育种国家工程实验室北京林业大学生物科学与技术学院北京100083

从模板DNA、Taq酶含量、dNTP浓度、引物浓度、退火温度、循环次数6个方面,分别设置单因素多水平试验,观察条带的亮度及清晰度,以确定合适的反应体系。然后利用L16(45)正交试验,对DNA模板浓度、Taq酶含量、dNTP浓度、引物浓度这4个因素在... 详细信息

从模板DNA、Taq酶含量、dNTP浓度、引物浓度、退火温度、循环次数6个方面,分别设置单因素多水平试验,观察条带的亮度及清晰度,以确定合适的反应体系。然后利用L16(45)正交试验,对DNA模板浓度、Taq酶含量、dNTP浓度、引物浓度这4个因素在4个水平上做进一步优化。建立了樟子松SSR最佳反应体系:25μL的反应体系中包含模板DNA50ng,Taq酶1.0U,dNTP0.3mmol/L,引物0.15μmol/L,10×TaqBuffer(含Mg2+)2.5μL。樟子松SSR反应体系的优化,有助于对樟子松SSR分子标记的研究,为分析樟子松天然群体和人工群体的遗传结构多样性,构建遗传图谱和定位功能基因奠定了基础。

关键词：樟子松 SSR反应体系正交试验

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高吸水树脂改良煤矸石基质水分特性

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北京林业大学学报 2024年第2期46卷 105-113页

作者：孙智龙杨建英史常青李成李睿杰杨春艳王小展邓莫楠北京林业大学水土保持学院北京100083 北京林业大学林业生态工程教育部工程研究中心北京100083 北京林业大学国家林业和草原局水土保持重点实验室北京100083 林木资源高效生产全国重点实验室北京100083

【目的】探究不同质量分数的高吸水树脂(SAP)对矿区煤矸石基质容重、孔隙度、毛管水运移规律和保水性等方面的改善状况,阐明SAP最佳使用量下煤矸石基质的水分运移规律,为无土矿区煤矸石基质水分条件改善提供依据,实现矿区煤矸石固废资... 详细信息

【目的】探究不同质量分数的高吸水树脂(SAP)对矿区煤矸石基质容重、孔隙度、毛管水运移规律和保水性等方面的改善状况,阐明SAP最佳使用量下煤矸石基质的水分运移规律,为无土矿区煤矸石基质水分条件改善提供依据,实现矿区煤矸石固废资源化利用,为植被生长提供适宜条件。【方法】通过室内土柱试验模拟质量分数0%、0.1%、0.2%、0.3%和0.4%的SAP对煤矸石基质水分运移规律的影响。【结果】(1)SAP可以改善煤矸石基质物理性质,随SAP使用量的增加,煤矸石基质容重呈下降趋势,总孔隙度与毛管孔隙度呈上升趋势;(2)SAP会极显著抑制煤矸石毛管水上升高度,且质量分数在0%~0.4%范围内,随SAP使用量的增加抑制效果逐渐增强,但当SAP质量分数为0.4%时,对煤矸石毛管水抑制程度较0.3%差异不显著;(3)最小显著差异法拟合分析得到:煤矸石毛管水上升高度随时间变化呈幂函数增加趋势(P<0.01),上升速率与时间变化呈对数函数下降趋势;(4)在室内通风条件下,72 h内不同SAP质量分数的煤矸石基质含水率持续降低,纯煤矸石(SAP质量分数0%)基质含水率下降趋势最大,水分损失率为15.96%,SAP质量分数为0.3%与0.4%下降趋势较小,水分损失率分别为3.90%和3.52%,差异不显著,且作用时间越长,SAP的保水性能表现越突出。【结论】SAP可以改善煤矸石基质水分条件,且在一定范围内,含量越高改善效果越显著。因此从经济和效果两方面考虑,首选质量分数为0.3%的SAP应用于无土矿区煤矸石基质中,为植被生长提供适宜的水气条件。

关键词：煤矸石毛管水运移高吸水树脂固废资源化利用保水性孔隙度

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黑杨花粉活力和柱头可授性研究

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安徽农业科学 2010年第20期38卷 10550-10552,10640页

作者：张双双奚晓军张金凤北京林业大学林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室树木花卉育种与生物工程国家林业局重点开放实验室北京100083

[目的]测定黑杨的花粉活力和柱头可授性,为黑杨派树种有性繁殖的研究提供参考。[方法]以黑杨派树种钻天杨、欧美杨109、山海关杨雄株为材料,采用离体萌发法测定花粉活力。采用联苯胺-过氧化氢法测定山海关杨、欧美杨108雌株柱头的可授性... 详细信息

[目的]测定黑杨的花粉活力和柱头可授性,为黑杨派树种有性繁殖的研究提供参考。[方法]以黑杨派树种钻天杨、欧美杨109、山海关杨雄株为材料,采用离体萌发法测定花粉活力。采用联苯胺-过氧化氢法测定山海关杨、欧美杨108雌株柱头的可授性。[结果]在温室水培条件下,黑杨派树种雄花的散粉期为0.5～2.0d,其中钻天杨的较长,为27h;山海关杨的散粉期最短,仅有6h。花粉活力以欧美杨109的最强,为23.4%～30.9%;山海关杨的活力为11.3%～17.3%。黑杨派树种雌花可授期为3～4d,其中山海关杨花期较长,为4d;欧美杨108的为3d。黑杨雌花的柱头从开花到萎蔫一直保持可授性,其中山海关杨在第3天可授性最强,欧美杨108在第2～3天可授性最强。山海关杨的柱头可授性最强时,张开的角度为150°～180°,欧美杨108整个花期柱头形态未有大的变化。[结论]不同黑杨派树种间在花粉活力和柱头可授性方面都表现出较大的差异。

关键词：黑杨花粉活力柱头可授性

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派间杂种黑白杨组织培养和再生系统的建立

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安徽农业科学 2010年第20期38卷 10981-10984页

作者：杨蔚然许雯婷张金凤北京林业大学林木育种国家工程实验室林木、花卉遗传育种教育部重点实验室树木花卉育种与生物工程国家林业局重点开放实验室北京100083

[目的]优化派间杂种黑白杨的再生和遗传转化体系。[方法]以黑白杨3种不同基因型组培苗叶片及茎段为材料,采用正交试验研究了不同激素配比、基因型及外植体状态对其生根、侧芽生长及愈伤组织再生的影响。[结果]1/2MS+IBA0.4mg/L+NAA0.1m... 详细信息

[目的]优化派间杂种黑白杨的再生和遗传转化体系。[方法]以黑白杨3种不同基因型组培苗叶片及茎段为材料,采用正交试验研究了不同激素配比、基因型及外植体状态对其生根、侧芽生长及愈伤组织再生的影响。[结果]1/2MS+IBA0.4mg/L+NAA0.1mg/L对黑白杨的4号基因型是最优的生根培养基;MS+6-BA0.8mg/L+NAA0.2mg/L是诱导黑白杨茎段侧芽生长的最优培养基;MS+6-BA1.0mg/L+NAA0.1mg/L是诱导黑白杨叶片再生不定芽生成的最适培养基。[结论]建立了完整的黑白杨再生体系。

关键词：黑白杨组织培养激素再生体系

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