检索结果-内蒙古大学图书馆

北京林业大学学报 2025年第1期47卷 72-84页

作者：张波卢凯燕张晓宇邬荣领北京林业大学理学院北京100083 北京林业大学生物科学与技术学院计算生物学中心北京100083

【目的】探究胡杨主根分别在正常和盐胁迫条件下的生长适应性模式,有效定位影响胡杨根系表型性状的显著数量性状座位(QTL),将遗传调控网络可视化,进一步探究胡杨根系表型性状在盐胁迫下的遗传调控机制。【方法】基于胡杨在正常和盐胁迫... 详细信息

【目的】探究胡杨主根分别在正常和盐胁迫条件下的生长适应性模式,有效定位影响胡杨根系表型性状的显著数量性状座位(QTL),将遗传调控网络可视化,进一步探究胡杨根系表型性状在盐胁迫下的遗传调控机制。【方法】基于胡杨在正常和盐胁迫条件下的表型与基因型数据,运用主成分分析、方差分析和动态模型拟合等统计方法分析表型变化规律,采用功能作图方法定位显著QTL,将根系在盐胁迫下表型性状的遗传调控网络可视化。【结果】(1)相关性分析表明,胡杨根系性状在正常条件下表现出高度协同作用,而在盐胁迫下通过减少根数量来增加平均根长;基于主成分分析确定了主根长、主根表面积和主根数量作为研究的主要表型性状;与正常条件相比,盐胁迫对主根长、主根表面积和主根数量3种表型性状产生了抑制作用。比较拟合优度R2发现,相较于Logistic、Richards和Weibull生长方程,Gompertz模型表现最优。(2)在正常条件下,分别定位到100、89、85个调控主根长、主根表面积、主根数量的显著QTLs,主要分布于连锁群1、4、5、14和15;在盐胁迫下,分别定位到91、85、87个调控以上3个性状的显著QTLs,集中分布于2、3、5、13和18连锁群。(3)遗传效应分析显示,两种条件下影响主根长度的显著QTLs遗传效应均随时间持续上升;影响主根数量的显著QTLs主要表现为持续上升,部分位点表现为先升后降或先降后升的趋势;影响主根表面积的显著QTLs在正常条件下呈现3种模式—先升后降、持续波动上升和先升后降再升,而在盐胁迫下大多持续上升。(4)正常条件下,分别注释到影响主根长、主根表面积、主根数量表型性状的21、14、14个候选基因,主要集中于基本的代谢过程、生长素转运、染色体分离等;盐胁迫下分别注释到19、17、15个候选基因,主要富集于胁迫响应、氧化还原平衡、铁离子运输和tRNA修饰等。(5)可视化遗传网络发现,枢纽基因(LOC105114908)和(LOC105120566)可能参与胡杨盐胁迫响应。【结论】盐胁迫显著影响了胡杨根系的生长发育。运用多种统计模型,本研究定位到影响根系生长的显著QTLs,揭示了其遗传效应随环境变化的动态特征。研究结果为理解胡杨适应盐胁迫的遗传调控基础提供了新见解,并为林木遗传改良研究提供了方法支持。

关键词：胡杨盐胁迫功能作图遗传效应遗传网络数量性状基因座位主根性状

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规模化畜禽养殖粪便中接合型耐药质粒污染及耐药基因赋存特征

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环境科学 2025年第2期46卷 1245-1254页

作者：李莹申磊高浩泽郭雅杰王旭明赵国柱仇天雷北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 北京市农林科学院生物技术研究所北京100097 廊坊师范学院生命科学学院廊坊065000

近年来,细菌病原体中抗生素耐药性的出现和传播对公众健康构成严重的威胁.为了解规模化养殖畜禽粪便中质粒介导的可移动抗生素耐药基因(ARGs)的赋存情况和转移特征,对北京、河北和宁夏等地区的蛋鸡、肉鸡和生猪规模化养殖场粪便进行耐... 详细信息

近年来,细菌病原体中抗生素耐药性的出现和传播对公众健康构成严重的威胁.为了解规模化养殖畜禽粪便中质粒介导的可移动抗生素耐药基因(ARGs)的赋存情况和转移特征,对北京、河北和宁夏等地区的蛋鸡、肉鸡和生猪规模化养殖场粪便进行耐药接合型质粒(CARP)的捕获与分析.采用滤膜接合法对养殖场畜禽粪便中的CARP进行捕获并计算转移频率和流行率.通过接合子基因组二代测序获得质粒携带ARGs信息,比对PlasimidFinder数据库鉴定耐药质粒的复制子类型.利用药敏纸片扩散法(Kirby-Bauer法)对接合子进行耐药表型测定.结果表明,35个规模化养殖场捕获了125个CARP,共携带13类65种ARGs,最常见的ARGs为floR、aac(6')-lb7和TEM-150.不同养殖动物粪便中CARP流行情况有一定差异,其中蛋鸡粪中CARP具有更高的转移能力和流行率,但其多重耐药程度要弱于肉鸡和猪粪.共检出49种共有的ARGs,其中64%属于氨基糖苷类、 β-内酰胺类、氟喹诺酮类和甲氧苄啶类.64株典型接合子的耐药表型也有类似特点,主要对β-内酰胺类(95.31%)、四环素类(89.06%)、氨基糖苷类(87.5%)和氟喹诺酮类(68.75%)抗生素耐药率较高.猪粪中检出IncH型、IncN型和IncR型这3种广宿主范围质粒,猪场中12.5%接合子携带5个及以上高风险ARGs,比例高于其他养殖场.研究表明,畜禽粪便中CARP普遍携带多种类型的ARGs,使宿主菌具有多种抗生素耐药能力;高风险ARGs被广宿主范围接合型质粒所携带,增加了其由养殖场向周边环境传播的风险.

关键词：畜禽养殖接合型质粒抗生素耐药基因(ARGs) 表型复制子

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纳米膜覆盖与芽孢杆菌菌剂施用对畜禽粪便好氧堆肥中细菌群落结构、关键集群及物质转化过程的影响

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环境科学 2025年第3期46卷 1915-1923页

作者：卜正国龙捷杨涛彭霞薇李永双万龙吴秀芹白志辉北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 北京林业大学水土保持学院北京100083 北京林业大学云南建水荒漠生态系统国家定位观测研究站北京100083 中国科学院生态环境研究中心北京100085

芽孢杆菌(Bacillus)具有较好的纤维素酶分泌功能、耐热性和良好的环境适应性,在好氧堆肥过程中起着关键作用.好氧堆肥过程中纳米膜覆盖能提供适宜的微气候,但是否能更好地促进接种芽孢杆菌在好氧堆肥体系发挥功能尚不清楚.本研究通过设... 详细信息

芽孢杆菌(Bacillus)具有较好的纤维素酶分泌功能、耐热性和良好的环境适应性,在好氧堆肥过程中起着关键作用.好氧堆肥过程中纳米膜覆盖能提供适宜的微气候,但是否能更好地促进接种芽孢杆菌在好氧堆肥体系发挥功能尚不清楚.本研究通过设置槽式好氧堆肥发酵实验,共设置对照(CK)、单独接种芽孢杆菌(CB)、纳米膜覆盖(CM)以及纳米膜覆盖联合芽孢杆菌接种(BM)这4个好氧堆肥处理组,探讨了纳米膜覆盖和芽孢杆菌接种对好氧堆肥的影响,通过冗余分析与细菌生态网络分析微生物群落结构对好氧堆肥微生物代谢活力的影响.结果表明,纳米膜覆盖与芽孢杆菌接种联合施用可促进有机质降解,提高堆体温度.添加芽孢杆菌后,CM处理的酶活性变化比CK大.与有机质代谢相关的Firmicutes和Actinobacteria等在纳米膜覆盖和联合芽孢杆菌接种(BM)作用下的相对丰度更为丰富.同时,核心细菌集群3相对丰度与好氧堆肥物质转化能力呈现显著的正相关关系,并发现集群3的相对丰度整体上在BM处理组的中丰度高于其他处理组.

关键词：芽孢杆菌纳米膜好氧堆肥胞外酶活细菌群落生态网络

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中药萜类成分合成中法尼基二磷酸合成酶基因的克隆及功能表征

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中国实验方剂学杂志 2025年第3期31卷 175-183页

作者：张悦张烽张越刘超越张柏林刘佳王彩霞中国中医科学院中药研究所北京100700 北京林业大学生物科学与技术学院北京100083

目的:通过异源表达不同植物来源的法尼基二磷酸合成酶(FPS)编码基因,提高酿酒酵母中法尼基焦磷酸(FPP)的合成效率,进而提高工程酵母合成萜类化合物的产量。方法:采用柱色谱法提取拟南芥、玫瑰、青蒿、积雪草、啤酒花、苜蓿和人参7种的... 详细信息

目的:通过异源表达不同植物来源的法尼基二磷酸合成酶(FPS)编码基因,提高酿酒酵母中法尼基焦磷酸(FPP)的合成效率,进而提高工程酵母合成萜类化合物的产量。方法:采用柱色谱法提取拟南芥、玫瑰、青蒿、积雪草、啤酒花、苜蓿和人参7种的植物根、茎、叶混样RNA,并反转录为互补DNA(cDNA)第一链,基于该7种植物的转录组数据,设计CaFPS、RrFPS、MsFPS、HiFPS、PgFPS、AtFPS和AaFPS基因序列特异性引物,克隆基因全长,对这些基因进行生物信息分析,构建pESC酵母穿梭载体。利用实验室构建的产β-榄香烯酿酒酵母为底盘菌株,异源表达7种不同植物来源的FPS,以β-榄香烯的产量作为评估标准,在实验室先前构建的高产β-榄香烯的酿酒酵母菌株中进行验证。结果:7种基因获得编码区域序列长均为1021 bp,编码301个氨基酸,均与酿酒酵母内源的FPS编码基因ERG20具有相近的亲缘关系。通过在酿酒酵母中异源表达7种基因,筛选出催化异戊烯焦磷酸酯(IPP)和二甲基烯丙基二磷酸(DMAPP)合成FPP效果最佳的基因为RrFPS,过表达RrFPS酿酒酵母菌株YB-1-Rr和YB-3-Rr的β-榄香烯产量分别比对照菌株YB-1和YB-3高231.25%和189.3%。结论:通过比较7种不同植物来源的FPS编码基因的功能,确定了来自玫瑰中的RrFPS基因所编码的蛋白具有最佳的催化能力。该研究为构建高产萜类化合物的工程酵母菌株构建提供了关键基因元件。

关键词：酿酒酵母倍半萜 β-榄香烯基因克隆法尼基焦磷酸(FPP) 法尼基二磷酸合成酶(FPS)

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空间转录组技术在植物研究中的应用及前景

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植物研究 2025年第1期45卷 3-14页

作者：梅曼王晨璨蔺宏霞张玉倩丁文静赵媛媛北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 北京林业大学生物科学与技术学院林木遗传育种全国重点实验室北京100083 北京林业大学树木与基因编辑研究院北京100083 北京林业大学林木育种与生态修复国家工程研究中心北京100083 河北省农林科学院植物保护研究所保定071000

空间转录组(spatial transcriptomics,ST)是一种用于从空间层面上解析RNA-seq数据的技术,利用该技术解析单个组织切片中的所有mRNA。空间条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着,使得在mRNA样品处理和后续测序过程中编... 详细信息

空间转录组(spatial transcriptomics,ST)是一种用于从空间层面上解析RNA-seq数据的技术,利用该技术解析单个组织切片中的所有mRNA。空间条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着,使得在mRNA样品处理和后续测序过程中编码和获取位置信息成为可能。与传统的转录组技术相比,空间转录组技术能获得细胞在组织原位环境下真实的基因表达特征,以及与微环境的关系,为基因表达提供高精度、高分辨率原位的空间信息。近年来,空间转录组技术取得了重要进展,检测的细胞通量、转录本数量和质量不断提高,空间定位信息更加准确全面,并已在拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)、杨树(Populus)等植物中展开研究。该文阐述了空间转录组技术在植物动态发育轨迹、不同组织和细胞类型差异分析、解码植物与微生物群相互作用等研究中的成功应用,讨论了空间转录组测序在植物组织原位测序中存在的问题和挑战,揭示了其在植物研究中的巨大潜力,为相关领域的进一步研究和应用提供了新的视角。

关键词：空间转录组技术空间分布模式发育谱系细胞类型鉴定细胞间相互作用

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过表达胡杨PEPKR2负调控拟南芥的镉耐受性

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北京林业大学学报 2025年第4期47卷 21-36页

作者：刘艺殷可欣冯冰闫彩霞赵紫焱董凯悦赵瑞陈少良北京林业大学生物科学与技术学院林木资源高效生产全国重点实验室北京100083

【目的】磷酸烯醇丙酮酸羧化酶激酶相关激酶(PEPKRs)是植物特有的CDPK/SnRK超家族成员,但其在胡杨响应重金属胁迫中的调控机制尚不清楚。本文通过研究胡杨PEPKR2在镉胁迫过程中的作用,旨在进一步揭示植物响应镉胁迫的生理与分子调控机... 详细信息

【目的】磷酸烯醇丙酮酸羧化酶激酶相关激酶(PEPKRs)是植物特有的CDPK/SnRK超家族成员,但其在胡杨响应重金属胁迫中的调控机制尚不清楚。本文通过研究胡杨PEPKR2在镉胁迫过程中的作用,旨在进一步揭示植物响应镉胁迫的生理与分子调控机制。【方法】克隆胡杨PEPKR2基因,利用DNAMAN进行同源氨基酸序列比对,并用Mega 7软件构建进化树。以野生型(WT)、转空载体对照(VC)和过表达PePEPKR2拟南芥(PePEPKR2-OE1、PePEPKR2-OE7和PePEPKR2-OE11)株系为实验材料,对各株系拟南芥进行不同浓度的镉处理,从生理和分子水平探究PePEPKR2在植物响应镉胁迫中的作用机制。【结果】(1)胡杨PEPKR2氨基酸序列与毛果杨PEPKR2相似度最高,亲缘关系最近;镉胁迫处理之后,胡杨根、茎、叶中PEPKR2表达量均发生了显著性变化;PePEPKR2蛋白定位于细胞核中。(2)在镉胁迫条件下,过表达PePEPKR2的拟南芥株系的根长、存活率和鲜质量均低于WT和VC,而相对电导率显著高于WT和VC,表明过表达株系对镉胁迫更敏感。(3)镉胁迫处理后,相较于WT和VC,过表达拟南芥株系的幼苗根尖Cd^(2+)内流速度显著加快,Cd^(2+)含量也显著升高;土培条件下,过表达株系的根和叶中Cd^(2+)含量均显著高于WT和VC。(4)镉胁迫处理后,过表达拟南芥株系的超氧化物歧化酶和过氧化氢酶活性的升高幅度均低于WT和VC,过氧化物酶活性的降低幅度均高于WT和VC,抗氧化酶相关基因的转录水平变化与酶活性的变化趋势一致;最终导致过表达拟南芥株系根尖的H2O2含量显著高于WT和VC。(5)土培条件下,经镉胁迫处理后,过表达拟南芥株系的叶绿素相对含量、最大光化学效率、实际光化学效率、电子传递速率、净光合速率、蒸腾速率、气孔导度均低于WT和VC,而细胞间CO_(2)浓度则高于WT和VC。【结论】过表达PePEPKR2增加了Cd^(2+)在拟南芥中的积累,削弱了活性氧清除能力,进而使光合系统功能紊乱,最终负调控拟南芥的镉耐受性。本研究为利用基因工程改良杨树的镉修复能力提供了理论支持。

关键词：胡杨蛋白激酶 PePEPKR2 镉胁迫活性氧光合作用转基因

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植物细胞骨架中间纤维研究进展

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热带亚热带植物学报 2025年第2期33卷 229-240页

作者：毕筱瑞葛博浩陈玉珍卢存福北京林业大学生物科学与技术学院林木资源高效生产全国重点实验室北京100083

中间纤维(IFs)是一种表观直径在10 nm左右,介于微管(25 nm)和微丝(5~7 nm)之间的细胞骨架蛋白纤维,目前已发现其能在不同的组织中形成多种类型的蛋白,并且在生物体发育过程中呈组织特异性表达。在动物细胞中,IFs提供了机械稳定性,并维... 详细信息

中间纤维(IFs)是一种表观直径在10 nm左右,介于微管(25 nm)和微丝(5~7 nm)之间的细胞骨架蛋白纤维,目前已发现其能在不同的组织中形成多种类型的蛋白,并且在生物体发育过程中呈组织特异性表达。在动物细胞中,IFs提供了机械稳定性,并维持了细胞和组织的形态,许多IF蛋白编码基因已经在动物中鉴定出来。在植物细胞中,最早的研究始于20世纪80年代,最初从一些免疫学方面的证据证明了植物中存在中间纤维蛋白。近些年来,在植物中陆续发现了许多中间纤维蛋白,与动物中的功能相同。中间纤维可通过调控核纤层-染色质网络以调控基因的表达。该文综述了植物细胞中间纤维的研究进展,对细胞骨架功能探究具有重要意义。

关键词：植物中间纤维角蛋白核纤层蛋白

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麻栎种子和胚方脱水敏感性及其低温贮藏技术

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林业科学 2025年第4期61卷 129-139页

作者：张铭佳仝伯强曲凯咸洋崔程程王永正臧一村韩彪北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 暖温带林草种质资源保存与利用国家林业和草原局重点实验室、山东省林草种质资源中心济南250000 山东农业大学林学院泰安271000

【目的】研究麻栎种子和胚方的脱水敏感性特征与临界含水量,探索麻栎种子低温保存技术和胚方超低温保存技术,为麻栎等顽拗性种子的保存提供技术参考。【方法】以野生麻栎种子为试验材料,采用硅胶减重法快速脱水至目标含水量,测定不同含... 详细信息

【目的】研究麻栎种子和胚方的脱水敏感性特征与临界含水量,探索麻栎种子低温保存技术和胚方超低温保存技术,为麻栎等顽拗性种子的保存提供技术参考。【方法】以野生麻栎种子为试验材料,采用硅胶减重法快速脱水至目标含水量,测定不同含水量种子和胚方的萌发指标;利用差示扫描量热技术(DSC)测定不同含水量胚轴和子叶的热力学参数,根据含水量和对应热焓的关系测算胚方结晶临界含水量;应用低温密封保存法保存不同含水量的种子,运用玻璃化法在超低温环境中保存不同含水量的胚方。【结果】1)麻栎不同含水量种子和胚方萌发特征显示,二者分别从初始含水量34.90%和44.14%降至10.00%,萌发率从93.00%和90.00%降至5.00%和60.00%。2)不同含水量麻栎胚轴和子叶DSC结果显示,随着胚轴和子叶含水量降低,结晶起始温度、峰值温度和热焓均呈规律性下降趋势,与含水量显著正相关;不同含水量胚轴平均热焓高于子叶平均热焓,胚轴自由水含量高于子叶自由水含量,初步判定本批次麻栎胚方理论结晶临界含水量为11.72%。3)脱水对麻栎种子生理生化特性的影响结果显示,随着脱水程度加深,种子细胞超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化物酶(POD)活性、脯氨酸(PRO)和丙二醛(MDA)含量均呈先上升后下降趋势。4)麻栎种子低温保存结果显示,初始含水量种子在4℃下保存21天,萌发活力没有变化,重度脱水(10.00%~20.00%)种子能够忍受一定程度的低温伤害;不同含水量胚方超低温保存结果显示,含水量对超低温保存结果有显著影响,PVS2预处理30 min时10.00%和15.00%含水量麻栎胚方成活率分别为5.00%和3.00%,不同含水量胚方经预处理和超低温保存后,热力学特征发生改变,15.00%含水量麻栎胚方重新获得自由水。【结论】麻栎种子和胚方萌发率随含水量下降而降低,具有脱水敏感性特征,脱水对麻栎种子生理生化特性有显著影响;麻栎胚方理论结晶临界含水量为11.72%;超低温保存麻栎胚方具有可行性,但仍需完善保存方法,提高胚方超低温保存后恢复萌发率。

关键词：麻栎顽拗性种子脱水敏感性超低温保存差示扫描量热技术

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北京市同域分布中华斑羚与狍冬季食物及肠道微生物分析显示中华斑羚具有竞争优势

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中国科学:生命科学 2025年第4期55卷 790-805页

作者：李峥夏凡房新民马志红高福利韩莹莹鲍伟东北京林业大学林木育种与生态修复国家工程研究中心北京林业大学生物科学与技术学院北京市雾灵山自然保护区管理处

探究同域竞争与共存机理是增进物种间互作关系的理解、推动珍稀濒危物种保护的重要理论依据.本研究借助显微分析和高通量测序技术对北京市雾灵山自然保护区冬季中华斑羚(Naemorhedus griseus)与狍(Capreolus pygargus)的食物及肠道微生... 详细信息

探究同域竞争与共存机理是增进物种间互作关系的理解、推动珍稀濒危物种保护的重要理论依据.本研究借助显微分析和高通量测序技术对北京市雾灵山自然保护区冬季中华斑羚(Naemorhedus griseus)与狍(Capreolus pygargus)的食物及肠道微生物组成进行分析,探究二者对有限食物资源的竞争及分化适应.研究发现,中华斑羚与狍食物存在较大重叠度(81.54%),但二者肠道微生物结构存在显著差异(P<0.05),中华斑羚主要以变形菌门(55.56%)和拟杆菌门(24.99%)构成,狍肠道内主要由拟杆菌门(47.36%)和厚壁菌门(45.66%)构成.中华斑羚肠道微生物在碳水化合物代谢、氨基酸代谢、脂质代谢、能量代谢等方面极显著高于狍(P<0.001).较高的食物多样性和微生物代谢活性使中华斑羚在同域竞争中占据有利地位.

关键词：中华斑羚狍同域分布肠道微生物组共存适应

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微观尺度下乡村生态系统文化服务供需匹配特征——以宁德市廉村为例

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生态学报 2025年第5期45卷 2243-2254页

作者：李从治潘滢尹伟伦兰思仁福建农林大学风景园林与艺术学院福州350002 马来亚大学建筑环境学院吉隆坡506033 北京林业大学生物科学与技术学院北京100083

从微观尺度视角探究乡村生态系统文化服务供需关系,有助于乡村精准提升文化服务功能,对解决乡村资源错配问题,促进乡村高质量发展具有重要意义。以福建省廉村为研究对象,利用公众参与地理信息系统进行微观尺度的生态系统文化服务量化,... 详细信息

从微观尺度视角探究乡村生态系统文化服务供需关系,有助于乡村精准提升文化服务功能,对解决乡村资源错配问题,促进乡村高质量发展具有重要意义。以福建省廉村为研究对象,利用公众参与地理信息系统进行微观尺度的生态系统文化服务量化,建立乡村生态系统文化服务供需评价指标体系,进行耦合协调指数和空间自相关分析,确定廉村文化服务供需空间匹配特征。结果表明:(1)廉村三种文化服务类型中游憩休闲评分最高,美学体验次之,科教人文最低。在空间分布上,游憩休闲与美学体验空间分布相似,高值区域集中在古榕树及溪边,科学文化高值区域在宗祠及薛令之雕像区域。(2)文化服务供给区域集中在廉村聚落及其周边,其中以东侧城墙入口处以及南侧城墙入口处供给能力最强。需求区域相对分散,以廉村主入口区域需求最高,聚落内北部居民点、古官道、自助茶室以及沙洲处也出现高值点。(3)整体上供需耦合协调关系可分为两部分,一是聚落及周边区域处于较为协调状态,二是聚落外围区域供需关系稍显失调。其中濒临失调区域占比54.69%,轻度失调区域占比27.03%,协调区域占比18.28%。(4)根据供需匹配结果,将廉村空间分为四类,文化服务表现良好区、重点改进区、额外潜力区以及缓慢改进区。建议优先针对重点改进区,即沙洲东南区域和聚落北侧入口处,进行资源配置,能够实现资源效果收益最大化。总体来看,廉村内部空间中存在不同程度的文化服务供需错配,基于评估结果为廉村精准提升文化服务水平提供相应建议。

关键词：乡村生态系统生态系统文化服务供需匹配公众参与地理信息系统空间自相关分析耦合协调分析

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