检索结果-内蒙古大学图书馆

中国动物传染病学报 2022年第2期30卷 27-33页

作者：张悦艾伟诚王斐梁婉谢思思华琳李春辉彭忠吴斌华中农业大学动物医学院农业微生物学国家重点实验室生猪健康养殖协同创新中心武汉430070 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所农业农村部畜禽细菌病防治制剂创制重点实验室武汉430070 中南大学湘雅医院感染与控制中心长沙410008

为了了解我国猪源艰难梭菌(Clostridioides difficile,CD)的病原学及分子生物学特征,本研究收集湖北和广东地区疑似患有肠炎的病猪粪便样品,提取基因组DNA,利用已经报道的5重PCR方法对艰难梭菌的16S rDNA基因、毒素A的编码基因tcdA、毒... 详细信息

为了了解我国猪源艰难梭菌(Clostridioides difficile,CD)的病原学及分子生物学特征,本研究收集湖北和广东地区疑似患有肠炎的病猪粪便样品,提取基因组DNA,利用已经报道的5重PCR方法对艰难梭菌的16S rDNA基因、毒素A的编码基因tcdA、毒素B的编码基因tcdB以及二元毒素编码基因cdtA和cdtB进行检测,同时采用厌氧培养法,对PCR检测毒素编码基因为阳性的粪便样品进行艰难梭菌的分离培养,并对所分离到的菌株进行药物敏感性测试和全基因组重测序。结果发现:本研究所采集到的97份粪便样品经PCR检测显示有80份样品为16S rDNA阳性,其中仅有2份样品为tcdA和tcdB阳性。从这两份样品中分离出一株tcdA和tcdB阳性的艰难梭菌,命名为HuB01。药敏试验发现,HuB01对头孢菌素(FOX)、氯霉素(CHL)、克林霉素(CLI)、氨苄西林(AMP)、头孢曲松钠(CRO)耐药,对莫西沙星(MXF)和万古霉素(VAN)表现出中度耐药,而对利福西明(RFX)、甲硝哒唑(MTZ)、非达霉素(FDX)敏感。全基因组重测序发现HuB01的全基因组大小为3.93 Mb,平均GC含量为28.31%,编码3691个蛋白基因及63个tRNA和10个rRNA;3691个基因中含有31个耐药基因和164个毒力相关基因。多序列位点分型(MLST)结果显示HuB01为ST11。由于目前国内对于艰难梭菌的研究大多集中在人医领域,因此本研究可为兽医领域艰难梭菌的相关研究奠定基础。

关键词：艰难梭菌分离鉴定 PCR检测药敏试验全基因组重测序

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国际基因工程机器大赛中的生物资源宝库

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生物资源 2022年第4期44卷 355-361页

作者：朱灵逸孙明华中农业大学生命科学技术学院/农业微生物学国家重点实验室湖北武汉430070 上海交通大学生命科学技术学院/微生物代谢国家重点实验室上海200240

国际基因工程机器大赛(international Genetically Engineered Machine competition,iGEM)是面向世界范围的大学生科技赛事,该比赛旨在推广合成生物学,各个参赛队伍通过使用原始元件和自己设计的新元件来构建新的生物系统,并在活细胞中... 详细信息

国际基因工程机器大赛(international Genetically Engineered Machine competition,iGEM)是面向世界范围的大学生科技赛事,该比赛旨在推广合成生物学,各个参赛队伍通过使用原始元件和自己设计的新元件来构建新的生物系统,并在活细胞中表达,令其行使某种既定功能。每年的参赛队伍会设计许多新的生物元件(biological part),其长期积累为生物系统的构建提供了便利与创新,其本质上也是生物资源不断丰富的体现。本文从生物资源的角度,重点阐述iGEM比赛生物元件库的发展、分类与特点,让更多人了解生物元件的特征,并在基因工程操作中参考使用,推动元件库的扩充与发展。

关键词：国际基因工程机器大赛生物元件生物积块生物资源竞赛资源

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基于屠宰场淘汰成年奶牛牛结核病患病率的研究

基于屠宰场淘汰成年奶牛牛结核病患病率的研究

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中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第十九次全国学术研讨会

作者：朱小洁闫钰王子健章恺伦陈颖钰郭爱珍农业微生物学国家重点实验室华中农业大学

引言牛结核病(bTB)是由牛分枝杆菌引起的一种慢性、消耗性人兽共患传染病。根据OIE发布的2019牛结核病流行病学调查报告,欧洲地区的发病率保持在较低且稳定的水平(每年不超过100个风险畜群);而在亚洲和非洲等地区,牛结核病的群发病率呈...

引言牛结核病(bTB)是由牛分枝杆菌引起的一种慢性、消耗性人兽共患传染病。根据OIE发布的2019牛结核病流行病学调查报告,欧洲地区的发病率保持在较低且稳定的水平(每年不超过100个风险畜群);而在亚洲和非洲等地区,牛结核病的群发病率呈上升趋势[1]。一项对中国14个省的奶牛牛结核病的调查结果显示,奶牛结核病个体水平的流行率为22.96%(95%CI:22.0-24.0),群体水平流行率为61.62%(114/185)(95%CI:54.2-68.7),且略有上升趋势[2]。

关键词：

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基于武汉某屠宰场的关于淘汰成年奶牛沙门氏菌粪便携带率和ESBL相关耐药性的研究

基于武汉某屠宰场的关于淘汰成年奶牛沙门氏菌粪便携带率和ESBL相...

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中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第十九次全国学术研讨会

作者：王杰朱小洁彭清洁陈颖钰 Ian D.Robertson 李翔郭爱珍 Joshua Aleri 农业微生物学国家重点实验室华中农业大学

引言沙门氏菌病是一种细菌性人畜共患病,可影响多种家畜包括鸡、猪、牛以及人类,对公共卫生具有潜在威胁。在引起人类致病的沙门氏菌中,除伤寒和副伤寒沙门氏菌外,其他沙门氏菌被称为非伤寒沙门氏菌(NTS),主要存在于动物宿主中[1]。美...

引言沙门氏菌病是一种细菌性人畜共患病,可影响多种家畜包括鸡、猪、牛以及人类,对公共卫生具有潜在威胁。在引起人类致病的沙门氏菌中,除伤寒和副伤寒沙门氏菌外,其他沙门氏菌被称为非伤寒沙门氏菌(NTS),主要存在于动物宿主中[1]。美国疾病控制和预防中心(CDC)的数据显示,非伤寒沙门氏菌是美国最常见的食源性细菌病原体,每年引起超过100万人感染[2]。

关键词：

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丁酸梭菌清液发酵高密度培养工艺研究

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饲料工业 2021年第11期42卷 53-59页

作者：邹孟琳高麒笙薛梦涵程娜付彪夏险胡远亮湖北师范大学生命科学学院食用野生植物保育与利用湖北省重点实验室湖北黄石435002 华中农业大学农业微生物学国家重点实验室湖北武汉430070

丁酸梭菌是一种专性厌氧菌,具有极强的整肠作用,在动物养殖等行业中应用前景广阔。然而,丁酸梭菌培养难度大,培养物活菌数低,限制了其应用。通过单因素试验研究了5种碳源及9种氮源对丁酸梭菌生长的影响,结果表明最佳碳源为葡萄糖,3种最... 详细信息

丁酸梭菌是一种专性厌氧菌,具有极强的整肠作用,在动物养殖等行业中应用前景广阔。然而,丁酸梭菌培养难度大,培养物活菌数低,限制了其应用。通过单因素试验研究了5种碳源及9种氮源对丁酸梭菌生长的影响,结果表明最佳碳源为葡萄糖,3种最佳氮源依次为酵母浸粉、牛肉浸粉和胰蛋白胨;采用正交试验设计优化3种最佳氮源组合及添加量,单因素试验优化接种量和培养温度。得到优化培养基及培养条件:葡萄糖3%,酵母浸粉1.5%,胰蛋白胨2.0%,牛肉浸粉3.0%,(NH4)2SO_(4)0.1%,NaHCO_(3)0.124%,玉米浆粉0.7%,MnSO_(4)·H_(2)O 0.05%,MgSO_(4)·7H_(2)O 0.05%,CaCl_(2)0.1%,初始pH 7.5,培养温度37℃,接种量3%。采用5 L自控发酵罐进一步优化培养条件,得出以碳酸氢钠作为中和剂,控制pH 6.5,在第12 h流加3%的葡萄糖,发酵液芽孢含量大幅提高,培养36 h芽孢数量达1.32×10^(9) CFU/mL。

关键词：丁酸梭菌芽孢数量单因素试验正交试验清液发酵

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壳寡糖对水稻幼苗生长及抗逆性影响

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生物学杂志 2021年第1期38卷 77-80页

作者：尹雅洁张宗杰夏险汪劲松梁运祥胡远亮湖北师范大学生命科学学院食用野生植物保育与利用湖北省重点实验室黄石435002 华中农业大学农业微生物学国家重点实验室武汉430070

通过喷施分子量浓度为2000~3000壳寡糖溶液,分别研究低温、干旱和盐胁迫条件对水稻幼苗生长及抗逆性的影响。水稻幼苗分成1个正常对照组和8个处理组,其中,处理组分别喷施0、5、12.5、25、50、125、250和500 mg/L的壳寡糖溶液并进行逆境... 详细信息

通过喷施分子量浓度为2000~3000壳寡糖溶液,分别研究低温、干旱和盐胁迫条件对水稻幼苗生长及抗逆性的影响。水稻幼苗分成1个正常对照组和8个处理组,其中,处理组分别喷施0、5、12.5、25、50、125、250和500 mg/L的壳寡糖溶液并进行逆境处理,定期采集叶片样本,测定抗逆生理指标。结果表明:施加壳寡糖浓度为25和50 mg/L时,低温下水稻的相对电导率较低,恢复正常条件24 h叶片相对电导率显著下降,恢复72 h幼苗茎高分别增加19.85%和24.40%,主根长分别提高49.50%和42.30%;恢复24 h,50 mg/L处理组叶片MDA含量显著下降。测定相对电导率结果表明,干旱和盐胁迫对水稻幼苗影响较大,12.5、25、50和25 mg/L处理组可降低干旱胁迫对水稻叶片的伤害,而25和50 mg/L浓度能缓解盐胁迫对水稻生长的不良影响。壳寡糖可提高水稻幼苗抗逆性并促进作物生长。

关键词：水稻幼苗壳寡糖非生物胁迫抗逆性生长

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ASFV和PRRSV多重TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立与初步应用

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中国兽医科学 2023年第6期53卷 671-678页

作者：赵硕陈忠伟肖婷何颖张宁覃国喜卢冰霞段振华秦毅斌张胜斌段群棚赵武韦明宇广西壮族自治区兽医研究所广西兽医生物技术重点实验室农业农村部中国(广西)-东盟跨境动物疫病防控重点实验室广西南宁530001 华中农业大学农业微生物学国家重点实验室湖北武汉430070 广西农垦永新畜牧集团金光有限公司广西南宁530042 玉林市动物疫病预防控制中心广西玉林537000 广西农垦永新畜牧集团西江有限公司广西贵港537100 广西农垦永新畜牧集团有限公司广西南宁530022

为了建立一种可同时精准、快捷鉴别检测非洲猪瘟病毒(ASFV)和猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的方法,本研究选择猪源β-actin为内参基因,根据ASFV的P72基因及PRRSV的ORF6基因设计特异性引物及TaqMan探针,通过优化反应条件,建立了ASFV和PR... 详细信息

为了建立一种可同时精准、快捷鉴别检测非洲猪瘟病毒(ASFV)和猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的方法,本研究选择猪源β-actin为内参基因,根据ASFV的P72基因及PRRSV的ORF6基因设计特异性引物及TaqMan探针,通过优化反应条件,建立了ASFV和PRRSV多重TaqMan荧光定量PCR检测方法,对该方法的特异性、敏感性、重复性进行验证,并初步应用于临床样品的检测。结果显示,该方法可在45 min内完成对ASFV、PRRSV及猪源β-actin基因的特异性扩增;对ASFV、PRRSV及猪源β-actin标准品模板的最低检测拷贝数分别为7.87×101 copies/μL、1.19×102 copies/μL和5.99×103 copies/μL,同一模板的3次重复试验的组内及组间变异系数均小于2%;用该方法检测92份临床样品,未检出ASFV,检出19份PRRSV阳性样品。结果表明,本研究建立了一种可快速鉴别检测ASFV及PRRSV的多重荧光定量PCR方法,较普通PCR敏感性高103倍,可应用于ASFV和PRRSV的快速鉴别诊断及流行病学调查。

关键词：非洲猪瘟病毒猪繁殖与呼吸综合征病毒多重TaqMan荧光定量PCR

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猪塞内卡谷病毒VP1蛋白原核表达及多克隆抗体制备

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南方农业学报 2023年第7期54卷 2175-2183页

作者：莫红芳石宗承陆晶山何东贤杨延辉梁淑芳俸祥仁钱平韦巧燕广西农业职业技术大学动物科技学院广西南宁530007 华中农业大学农业微生物学国家重点实验室湖北武汉430070 广西大学动物科学技术学院广西南宁530004 广西壮族自治区柳州种畜场广西柳州545003 武宣县金兴生猪养殖专业合作社广西来宾545902 重庆三峡职业学院动物科技学院重庆404155

【目的】原核表达猪塞内卡谷病毒(Seneca valley virus,SVV)VP1蛋白,制备SVV-CH-HB2016 VP1蛋白多克隆抗体并分析其抗原性,为进一步研发SVV病毒诊断试剂盒和亚单位疫苗提供参考依据。【方法】对SVV-CHHB2016 VP1基因序列进行密码子优化... 详细信息

【目的】原核表达猪塞内卡谷病毒(Seneca valley virus,SVV)VP1蛋白,制备SVV-CH-HB2016 VP1蛋白多克隆抗体并分析其抗原性,为进一步研发SVV病毒诊断试剂盒和亚单位疫苗提供参考依据。【方法】对SVV-CHHB2016 VP1基因序列进行密码子优化,构建质粒pUCK/VP1-opt,双酶切后连接至pET-28a(+)载体,构建原核表达质粒pET-28a-VP1。将重组质粒pET-28a-VP1转化大肠杆菌BL21(DE3)分子伴侣感受态细胞,经IPTG诱导表达获得重组VP1蛋白。采用Western blotting方法分析VP1蛋白的反应原性,并以包涵体变性和复性方式纯化。随后将VP1蛋白免疫新西兰白兔,分离血清获得重组VP1蛋白的多克隆抗体。以间接酶联免疫吸附试验(ELISA)法测定抗体的效价水平,以Protein A+G Agarose抗体纯化试剂盒纯化多克隆抗体。通过Western blotting和间接免疫荧光抗体试验(IFA)法验证多克隆抗体与SVV-CH-HB2016毒株反应的特异性。【结果】成功构建原核表达质粒pET-28a-VP1,在IPTG终浓度为0.1 mmol/L、37℃诱导4 h条件下,重组VP1蛋白成功表达并主要以包涵体形式存在;Western blotting分析结果显示,重组VP1蛋白可与His-Tag Mouse mAb发生特异性结合,具有良好的反应原性;经变性和复性纯化的重组包涵体蛋白纯度和浓度均较高;采用间接ELISA法检测多克隆抗体的效价为1∶32000;纯化后的抗体无明显杂带,纯度大于90.0%;Western blotting和IFA鉴定结果表明,多克隆抗体可特异性识别SVV-CH-HB2016毒株,重组VP1蛋白具有较好的免疫原性。【结论】通过原核表达SVV VP1蛋白获得的重组VP1蛋白具有较好的抗原性,制备的多克隆抗体特异性良好,可作为诊断试剂盒及亚单位疫苗研制的候选抗原。

关键词：猪塞内卡谷病毒 VP1蛋白原核表达多克隆抗体

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蒺藜苜蓿紫色酸性磷酸酶MtPAP3基因在共生固氮中的功能

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华中农业大学学报 2020年第4期39卷 29-37页

作者：崔智强谢丽萍李友国林会农业微生物学国家重点实验室/华中农业大学生命科学技术学院武汉430070

利用启动子组织表达定位、超表达及CRISPR/Cas9基因敲除等方法对蒺藜苜蓿酸性磷酸酶MtPAP3基因的功能进行研究。结果显示:MtPAP3在蒺藜苜蓿根和根瘤的维管束组织以及根瘤的分生区和侵染区中表达,在低磷胁迫和根瘤中均表现为特异性诱导... 详细信息

利用启动子组织表达定位、超表达及CRISPR/Cas9基因敲除等方法对蒺藜苜蓿酸性磷酸酶MtPAP3基因的功能进行研究。结果显示:MtPAP3在蒺藜苜蓿根和根瘤的维管束组织以及根瘤的分生区和侵染区中表达,在低磷胁迫和根瘤中均表现为特异性诱导后的高效表达;超表达MtPAP3能够显著提高蒺藜苜蓿的结瘤数及根瘤固氮酶活,敲除MtPAP3基因能显著抑制根瘤的发育及固氮酶活。结果表明:MtPAP3参与低磷胁迫条件下根瘤中的磷代谢及共生固氮过程。

关键词：根瘤菌蒺藜苜蓿酸性磷酸酶低磷胁迫共生固氮

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小柴旦盐湖脱硫棒状菌属的环境适应性机制分析

小柴旦盐湖脱硫棒状菌属的环境适应性机制分析

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中国微生物学会第十一届地质微生物学学术研讨会

作者：曾健雄常利草胡文哲刘俊蒋宏忱方云武汉工程大学环境生态与生物工程学院教育部绿色化工过程重点实验室湖北武汉430205 华中农业大学农业微生物学国家重点实验室湖北武汉430070 中国地质大学(武汉)生物地质与环境地质国家重点实验室湖北武汉430074

[目的]青藏高原小柴旦盐湖富含硫酸盐卤水,宏基因组学分析揭示该生境蕴藏着丰富的具有耐盐、固碳和脱硫功能的微生物.本研究拟通过生物信息学分析揭示潜在的固碳脱硫微生物脱硫棒状菌(Desulfotignum)的代谢多样性和环境适应性机制.[方法... 详细信息

[目的]青藏高原小柴旦盐湖富含硫酸盐卤水,宏基因组学分析揭示该生境蕴藏着丰富的具有耐盐、固碳和脱硫功能的微生物.本研究拟通过生物信息学分析揭示潜在的固碳脱硫微生物脱硫棒状菌(Desulfotignum)的代谢多样性和环境适应性机制.[方法]利用宏基因组分箱分析和公共数据库下载获得小柴旦盐湖脱硫棒状菌属的基因组,通过文献跟踪和16S rRNA基因数据库检索揭示脱硫棒状菌的全球生境分布,基于基因组分类数据库(genome taxonomy database,GTDB)中120个细菌标记蛋白的系统发育树对脱硫棒状菌属的亚群进行分类,通过重构脱硫棒状菌属不同亚群的生理代谢潜能以及基因组比较分析来解析其环境适应机制和代谢多样性.[结果]脱硫棒状菌属全球分布广泛且主要栖息在高盐生境.小柴旦盐湖沉积物中共得到了 9个脱硫棒状菌基因组,结合公共数据库中2个基因组,根据基因组系统发育分析、平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)和平均氨基酸一致性(average amino acid identity,AAI)分析将这11个脱硫棒状菌基因组分为了2个亚群(G1和G2).脱硫棒状菌属的代谢通路重构显示其存在 Wood-Ljungdahl(WL)途径和还原甘氨酸(reductive rglycine,rGly)途径2条潜在固碳途径,其中G1亚群可利用亚硝酸盐、硫酸盐、氧气作为电子受体,还可进行乳酸发酵、硫代硫酸盐歧化以及通过鞭毛进行趋化运动;而G2亚群参与部分硝化作用,可利用硫酸盐和氧气作为电子受体,或进行硫代硫酸盐歧化以及通过菌毛扭动方式来运动.这代表脱硫棒状菌属可能是混合营养型微生物,同时利用有机碳和无机碳作为碳源来生长.G1和G2亚群均通过Trk系统摄入K+来对抗高盐环境.[结论]本研究扩展了脱硫棒状菌属的物种多样性,率先揭示了该属的生理代谢潜能和潜在的环境适应机制.

关键词：宏基因组学小柴旦盐湖脱硫棒状菌属代谢通路

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