检索结果-内蒙古大学图书馆

畜牧与兽医 2016年第7期48卷 128-131页

作者：崔璐陈星周颖张淑君华中农业大学动物科学技术学院/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室湖北武汉430070

综述了脂肪酸结合蛋白(fatty acid-binding protein,FABP)的类型、分布。对肝脏型(Live fatty acid binding protein,L-FABP)、肠型(Intestinal fatty acid binding protein,I-FABP)、心脏型(Hear fatty acid binding protein,H-FABP)、脂肪细胞型(Adipocyte fatty acid binding protein,A-FABP)基因结构类型、基因多态性等相关研究进展进行了阐述,为利用FABPs基因改良和提高家畜产品数量和品质提供参考。

关键词：脂肪酸结合蛋白(FABPs) 结构研究进展基因多态性

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猪MKRN3基因启动子区CpG岛在胚胎心脏组织甲基化模式分析

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华中农业大学学报 2018年第6期37卷 75-81页

作者：汪龙梅朱哲坤王栋刘玉兰付书林邓昌彦郭玲武汉轻工大学动物营养与饲料科学湖北省重点实验室武汉430023 华中农业大学动物科学技术学院/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070

以梅山猪-大白猪正反交为模型,以65日龄和100日龄的胚胎心脏组织为研究材料,对MKRN3基因启动子区CpG岛进行预测,根据预测的CpG岛设计引物,采用重亚硫酸盐测序法(BSP法),分析MKRN3基因启动子区CpG岛在胚胎心脏组织的甲基化程度。结果显示... 详细信息

以梅山猪-大白猪正反交为模型,以65日龄和100日龄的胚胎心脏组织为研究材料,对MKRN3基因启动子区CpG岛进行预测,根据预测的CpG岛设计引物,采用重亚硫酸盐测序法(BSP法),分析MKRN3基因启动子区CpG岛在胚胎心脏组织的甲基化程度。结果显示:对于65日龄胚胎,猪MKRN3基因启动子区CpG岛在大白×梅山和梅山×大白杂交后代的胚胎心脏组织中均表现高度甲基化(75.6%、76.4%);对于100日龄的胚胎,大白×梅山杂交后代的胚胎心脏组织表现高度甲基化(80%),而梅山×大白杂交后代的胚胎心脏组织呈现低甲基化(35.6%)。由此可见,猪MKRN3基因启动子区CpG岛的甲基化模式随着正反交、胚胎发育时期不同而呈现出一定变化,即在胚胎发育65日龄时,正反交子代均具有高度甲基化;而在胚胎发育至100日龄,正交子代呈现高度甲基化,反交子代呈现低甲基化,说明在胚胎发育晚期父本或母本等位基因可能会发生明显的去甲基化。

关键词：猪胚胎 MKRN3 CpG岛 DNA甲基化重亚硫酸盐测序法

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猪肺泡巨噬细胞极化的异质性与可逆性

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农业生物技术学报 2021年第4期29卷 619-630页

作者：吴雅兰王圳玥王道远张伟李新云赵书红朱猛进华中农业大学动物科学技术学院华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室生猪健康养殖省部共建协同创新中心

猪肺泡巨噬细胞(porcine alveolar macrophages, PAMs)是机体先天免疫第一防线的重要成员,其强可塑性为猪(Sus scrofa)的免疫调控机制解析提供了重要细胞模型。为建立猪肺泡巨噬细胞不同极化亚型及比较两种不同形式的PAMs与3D4/21细胞... 详细信息

猪肺泡巨噬细胞(porcine alveolar macrophages, PAMs)是机体先天免疫第一防线的重要成员,其强可塑性为猪(Sus scrofa)的免疫调控机制解析提供了重要细胞模型。为建立猪肺泡巨噬细胞不同极化亚型及比较两种不同形式的PAMs与3D4/21细胞系极化的异质性与可逆性,本研究以30日龄健康大白仔猪分离的原代PAMs和商业化3D4/21细胞系为实验材料,利用脂多糖(lipopolysaccharide, LPS)加γ干扰素(interferon gamma, IFN-γ)组合和白介素4 (interleukin 4, IL-4)进行极化诱导,分别构建M1和M2细胞模型。PCR和qRT-PCR相对定量结果显示,M1型标志基因IL-1β、趋化因子配体10 (CXC chemokine ligand10, CXCL10)、肿瘤坏死因子(tumour necrosis factor, TNF)、IL-6、IL-12B在PAMs和3D4/21细胞系M1型中的表达水平均显著高于在对照组(M0)和M2型中的表达水平(P<0.05)。M2型标志基因精氨酸酶1(arginase-1, Arg1)、过氧化物酶体增殖剂激活受体γ(peroxisome proliferators-activated receptorγ, PPARγ)、IL-10和几丁质酶3样蛋白3 (chitinase 3-like 3, Chi3L3或Ym-1)在3D4/21细胞系M2型中的表达水平显著高于在M0和M1型中的表达水平(P<0.05);而在PAMs中,Arg1、PPARγ和Ym-1在M0和M2型中的表达水平显著高于在M1型中的表达水平(P<0.05)。Western blot结果显示,两类细胞Arg1蛋白表达变化与qRT-PCR相对定量结果相符。同时,对PAMs和3D4/21细胞系极化的可逆性实验结果表明,PAMs极化的可逆性强于3D4/21细胞系,且PAMs由M2型向M1型转换的能力强于由M1型向M2型转换的能力。本研究为进一步探索猪肺泡巨噬细胞极化机制及猪的抗病育种提供了基础资料。

关键词：猪肺泡巨噬细胞 M1型 M2型极化异质性可逆性

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增强子功能鉴定及其在农业动物中的研究进展

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中国细胞生物学学报 2019年第7期41卷 1395-1400页

作者：谢骏辉孙艳王昇田小欢曹建华华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070 华中农业大学动物科学技术学院武汉430070

真核生物的基因转录受多种元件共同调控,其中增强子是重要的顺式作用元件,能够极大促进基因的转录。增强子的功能与细胞、组织、个体的特异性功能或表型密切相关,其异常功能往往导致性状改变和疾病发生。因此,研究增强子的功能对于揭示... 详细信息

真核生物的基因转录受多种元件共同调控,其中增强子是重要的顺式作用元件,能够极大促进基因的转录。增强子的功能与细胞、组织、个体的特异性功能或表型密切相关,其异常功能往往导致性状改变和疾病发生。因此,研究增强子的功能对于揭示表型背后的分子机理具有十分重要的生物学意义,对于农业动物科学显得尤为重要。本文就增强子的特性、鉴定方法、活性检测以及在农业动物研究中的进展进行综述,以期能够对增强子的相关研究提供依据和参考。

关键词：增强子功能鉴定农业动物

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表观基因组学在猪遗传育种中的研究进展

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中国畜牧杂志 2024年第3期60卷 26-32页

作者：简耀邦李京津李新云齐晓龙付亮亮华中农业大学动物科学技术学院湖北武汉430070 农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室湖北武汉430070

生猪产业是我国畜牧业的支柱产业,我国的生猪养殖和猪肉消费量均占全球50%以上,但种猪性能与国外差距较大。因此,培育拥有自主知识产权、性状优良的种猪是保障我国生猪养殖业可持续健康发展的关键,而揭示重要经济性状的遗传机制是猪遗... 详细信息

生猪产业是我国畜牧业的支柱产业,我国的生猪养殖和猪肉消费量均占全球50%以上,但种猪性能与国外差距较大。因此,培育拥有自主知识产权、性状优良的种猪是保障我国生猪养殖业可持续健康发展的关键,而揭示重要经济性状的遗传机制是猪遗传改良的基础。表观基因组学是在核苷酸序列不发生改变的情况下,研究基因组上的化学修饰和空间结构变化影响基因表达调控和功能的一门学科,近年来在猪遗传育种领域逐步得到广泛应用。表观基因组学在解释分子功能机制、挖掘功能靶点、探究进化过程方面有着突出优势,为研究猪复杂性状和环境适应的生物分子调控机制提供新思路。本文分析和总结了表观基因组学在猪遗传育种领域的研究现状和发展趋势,为阐明猪重要经济性状形成机制提供参考。

关键词：猪表观基因组学基因表达调控遗传育种

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基于元共祖的基因组选择一步法理论及研究进展

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中国畜牧杂志 2021年第5期57卷 1-6页

作者：付川珂赵书红李新云项韬华中农业大学动物科学技术学院湖北武汉430070 农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室湖北武汉430070

基因组选择作为重要的畜禽遗传评估方法被广泛应用在生产中。其中,一步法是目前各大猪育种集团的标准遗传评估方法,但该方法存在基础群个体基因型频率无法估计、系谱亲缘关系矩阵与基因型亲缘关系矩阵的不完全兼容等问题。为解决这些问... 详细信息

基因组选择作为重要的畜禽遗传评估方法被广泛应用在生产中。其中,一步法是目前各大猪育种集团的标准遗传评估方法,但该方法存在基础群个体基因型频率无法估计、系谱亲缘关系矩阵与基因型亲缘关系矩阵的不完全兼容等问题。为解决这些问题,元共祖概念作为一步法发展的新思路被提出。元共祖的应用不仅可以解决现行一步法中的问题,还将应用范围拓展至多群体,以满足跨群体联合育种的需要。目前,基于元共祖的基因组选择一步法准确性已被证明不低于常规的一步法,且其在杂交育种、系谱部分缺失及跨群体育种等方面具有巨大的应用潜力。本文介绍了元共祖概念和原理,并综述基于元共祖的基因组选择一步法方法的应用及前景。

关键词：基因组选择遗传评估元共祖一步法

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基于机器学习方法的母猪高低产分类模型研究

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华中农业大学学报 2021年第3期40卷 221-229页

作者：李喜阳李信颉赵志超李长春刘向东华中农业大学动物科学技术学院/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070 农业农村部生猪健康养殖重点实验室/广西扬翔股份有限公司贵港537100

为帮助猪场管理者更好地对母猪进行繁殖管理、预测母猪的高低产、及时淘汰低产母猪,收集和整理包含出生场地、分娩栏位、品种和不同胎次、初生窝重信息的3个母猪群体的生产数据集,制定母猪高低产的分类标准,使用R软件中的Boruta包筛选... 详细信息

为帮助猪场管理者更好地对母猪进行繁殖管理、预测母猪的高低产、及时淘汰低产母猪,收集和整理包含出生场地、分娩栏位、品种和不同胎次、初生窝重信息的3个母猪群体的生产数据集,制定母猪高低产的分类标准,使用R软件中的Boruta包筛选出影响母猪高低产的重要特征,使用4种不同的机器学习方法——逻辑回归(logistic regression,LOG)、决策树(decision tree,DT)、随机森林(random forest,RF)和支持向量机(support vector machine,SVM)构建母猪高低产的分类模型,并进行决策树视图分析探究影响母猪最高产的相关因素。结果显示:4种机器学习方法构建母猪高产分类模型的分类准确率均在71%左右,最高可达84%,并且发现SVM作为最佳建模方法在所有数据集和不同分类标准下出现的频率最高,其次是LOG和DT。决策树视图显示出生场地、品种和初生窝重是划分最高产母猪的重要叶节点,利用这些特征预测最高产母猪准确率可达73%~82%。以上结果表明在未来的养猪生产中,利用机器学习方法实现母猪高低产的早期预测将会是一个不错的选择。

关键词：机器学习方法精准养猪母猪早期选育决策树随机森林支持向量机繁殖性能产仔数早期预测高繁殖力分类模型

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基于机器学习方法预测母猪产仔数性状

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华中农业大学学报 2020年第4期39卷 63-68页

作者：李信颉王海燕蒋贝加王超赵志超李长春刘向东华中农业大学动物科学技术学院/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070 华中农业大学信息学院武汉430070 农业农村部生猪健康养殖重点实验室/广西扬翔股份有限公司贵港537100

为指导养猪生产者更好地预测母猪的产仔数性状,尽早淘汰繁殖力较差的母猪,提升母猪群体的繁殖潜力,对记录了母猪总产仔数、产活仔数、健仔数、5日龄仔猪数和1 kg以上仔猪数的生产数据进行处理和描述统计,使用R软件中的Boruta包筛选出影... 详细信息

为指导养猪生产者更好地预测母猪的产仔数性状,尽早淘汰繁殖力较差的母猪,提升母猪群体的繁殖潜力,对记录了母猪总产仔数、产活仔数、健仔数、5日龄仔猪数和1 kg以上仔猪数的生产数据进行处理和描述统计,使用R软件中的Boruta包筛选出影响母猪产仔数性状的重要特征如品种、胎次、配种季节等,利用传统回归分析方法(LR)和不同机器学习方法—决策树(decision tree,DT)、K近邻(K-nearest neighbor,KNN)、支持向量机(support vector machine,SVM)对产仔数性状进行回归分析,最后比较机器学习方法与传统回归方法建模的优劣。结果显示,母猪总产仔数、产活仔数、健仔数、5日龄仔猪数和1 kg以上仔猪数不同回归分析方法的R^2均达到0.71以上(0.71~0.88),体现了特征选择的正确性;在预测母猪总产仔数、产活仔数、健仔数、5日龄仔猪数和1 kg以上仔猪数中SVM模型均显著优于其他机器学习模型(P<0.05)并且要优于传统回归方法,而且在以上模型中预测1 kg以上仔猪数的SVM模型最优。因此,在今后的养猪生产中机器学习方法可能会成为养猪生产者早期选育高繁殖力母猪的一种新途径。

关键词：机器学习模型决策树 K近邻支持向量机母猪产仔数性状

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猪FTO的转录调控研究

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畜牧与兽医 2012年第S1期44卷 191-192页

作者：牛丛丛周磊安超强甘莉杨在清华中农业大学生命科学技术学院农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室湖北武汉430070

肥胖是世界上最普遍的非流行性疾病之一,由于其与胰岛素抵抗、II型糖尿病、心血管疾病和某些癌症有关而被列为公共健康的一大杀手。FTO就是通过全基因组关联分析发现的一个与体重指数和肥胖有关的肥胖候选基因。本实验克隆了猪FTO基因... 详细信息

肥胖是世界上最普遍的非流行性疾病之一,由于其与胰岛素抵抗、II型糖尿病、心血管疾病和某些癌症有关而被列为公共健康的一大杀手。FTO就是通过全基因组关联分析发现的一个与体重指数和肥胖有关的肥胖候选基因。本实验克隆了猪FTO基因的启动子序列和全长CDS序列。

关键词：候选基因转录调控 FTO 胰岛素抵抗心血管疾病子序列启动子活性检测系统公共健康脂肪沉积

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C/EBPα对脂滴相关蛋白LSDP5转录活性的调控

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畜牧与兽医 2012年第S1期44卷 157-158页

作者：张立杰周磊甘莉牛丛丛雷朋余安杨在清华中农业大学生命科学技术学院农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室湖北武汉430070

脂滴是细胞内储藏中性脂质的场所,动物中被称为脂肪滴或脂滴,植物中被叫做油体,酵母中被叫做脂肪微体。成熟的脂滴由中性的疏水核和包裹在外的亲水磷脂单层膜组成,磷脂膜上募集了多种蛋白质被称为脂滴相关蛋白,这些蛋白质与脂滴的生成... 详细信息

脂滴是细胞内储藏中性脂质的场所,动物中被称为脂肪滴或脂滴,植物中被叫做油体,酵母中被叫做脂肪微体。成熟的脂滴由中性的疏水核和包裹在外的亲水磷脂单层膜组成,磷脂膜上募集了多种蛋白质被称为脂滴相关蛋白,这些蛋白质与脂滴的生成、转运和降解有关。作为脂滴表面的重要物质,脂滴相关蛋白有着重要的功能与意义。脂滴相关蛋白有多种。

关键词：脂滴 C/EBP LSDP5 磷脂单层膜磷脂膜微体转录活性脂肪滴启动子活性启动子调控

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