检索结果-内蒙古大学图书馆

农业机械学报 2024年第8期55卷 312-321页

作者：严煜盛哲雅谷月衡一帆周昊博王树才华中农业大学工学院武汉430070 华中农业大学动物科学技术学院动物医学院武汉430070 农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070

针对笼养条件下蛋鸡核心温度测量工作效率低下的问题,提出了一种利用红外热图像结合深度学习的蛋鸡核心温度检测方法。首先通过采集172只蛋鸡的10994幅红外热图像制作数据集,利用目标检测网络YOLO v8s提取作为感兴趣区域(Region of inte... 详细信息

针对笼养条件下蛋鸡核心温度测量工作效率低下的问题,提出了一种利用红外热图像结合深度学习的蛋鸡核心温度检测方法。首先通过采集172只蛋鸡的10994幅红外热图像制作数据集,利用目标检测网络YOLO v8s提取作为感兴趣区域(Region of interest,ROI)的鸡脸图像;再利用改进的深度卷积神经网络对提取的蛋鸡ROI图像以及实时采集的蛋鸡泄殖腔温度进行回归预测。实验显示,目标检测算法的检测准确率达到99.38%,平均精度均值达到99.9%,召回率达到99.87%,3项评价指标均高于YOLO v4s、YOLO v5s、YOLO v7、YOLOX-s目标检测算法;在深度卷积神经网络算法上,同时将MobileNetV3、GhostNet、ShuffleNetV2、RegNet、ConvNeXt、Res2Net以及MobileVIT共7种分类模型修改为回归模型,利用蛋鸡ROI图像进行训练,其中,Res2Net模型对蛋鸡核心体温估测拟合效果最好,在测试集上估测的决定系数R^(2)为0.9565、调整后决定系数R^(2)_(adj)为0.95631,均高于其他回归模型;为进一步提高预测精度,在Res2Net50回归模型的Bottle2block结构之后分别插入SE(Squeeze-and-excitation)模块、CBAM(Convolutional block attention module)模块、CA(Coordinate attention)模块、ECA(Efficient channel attention)模块,其中利用CA模块改进后的算法在测试集上的R^(2)为0.97364、R^(2)_(adj)为0.97352,均高于其他改进方法;利用目标检测网络和回归网络搭建蛋鸡核心体温估测模型,对9只蛋鸡进行体温估测试验,结果显示ROI均能完整找出,且估测体温平均绝对误差(Mean absolute error,MAE)为0.153℃。因此,本研究提出的目标检测+深度神经网络模型为红外热图像下蛋鸡核心温度预测提供了较好的自动化检测方法。

关键词：笼养蛋鸡核心体温 YOLO v8s-Res2Net50 红外热成像

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基于全长转录组测序的牛脂肪组织可变剪接事件分析

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华中农业大学学报 2022年第6期41卷 176-183页

作者：夏晗李凡彭玲伟杜玉琴郭爱珍杨利国周扬华中农业大学动物科学技术学院、动物医学院/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070

为探究可变剪接影响下更为复杂的脂肪沉积调控网络,明晰可变剪接事件的发生对脂肪沉积调控机制的影响,本研究基于PacBio测序平台的第三代测序技术,对夷陵黄牛腹腔脂肪、皮下脂肪、肌间脂肪进行全长转录组测序分析。共发现15445个基因检... 详细信息

为探究可变剪接影响下更为复杂的脂肪沉积调控网络,明晰可变剪接事件的发生对脂肪沉积调控机制的影响,本研究基于PacBio测序平台的第三代测序技术,对夷陵黄牛腹腔脂肪、皮下脂肪、肌间脂肪进行全长转录组测序分析。共发现15445个基因检测到50520个可变剪接,占牛全部基因的33.4%。对这些基因进行富集分析发现,83个GO条目显著富集,这些显著富集的通路可能参与脂肪沉积网络的调控,其中16个与脂质合成及代谢相关,27条KEGG通路显著富集,其中15条与脂质合成及代谢相关。使用KOG、KEGG、NR、Swiss Prot、GO数据库对测序序列进行注释,80756条序列共注释到69259个基因,94458条CDS序列及对应的pep序列。其中GO分析中15039条序列富集到507个生物学过程条目,7907条序列富集到214个细胞组分条目,30672条序列富集到559个分子功能条目。KEGG数据分析富集到34条通路共49710条序列,其中7002条序列参与信号转导途径。以上结果表明,牛脂肪组织存在大量可变剪接事件,并且这些发生可变剪接事件的基因对脂肪沉积的调控发挥重要作用,这可从基因可变剪接角度为解析脂肪沉积的调控网络提供必要的资源和理论依据。

关键词：脂肪沉积功能注释可变剪接全长转录组夷陵黄牛

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基于YOLO v8s-Res2Net50的笼养蛋鸡核心体温估测方法

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农业机械学报 2024年

作者：严煜盛哲雅谷月衡一帆周昊博王树才华中农业大学工学院华中农业大学动物科学技术学院动物医学院农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室

针对笼养条件下蛋鸡核心温度测量工作效率低下的问题，提出了一种利用红外热图像结合深度学习的蛋鸡核心温度预测方法。首先通过采集172只蛋鸡的10994幅红外热图像制作数据集，利用目标检测网络YOLO v8s提取作为感兴趣区域(Region of in... 详细信息

针对笼养条件下蛋鸡核心温度测量工作效率低下的问题，提出了一种利用红外热图像结合深度学习的蛋鸡核心温度预测方法。首先通过采集172只蛋鸡的10994幅红外热图像制作数据集，利用目标检测网络YOLO v8s提取作为感兴趣区域(Region of interest， ROI)的鸡脸图像；再利用改进的深度卷积神经网络对提取的蛋鸡ROI图像以及实时采集的蛋鸡泄殖腔温度进行回归预测。试验显示，目标检测算法的检测准确率达到99.38%，平均精度均值达到了99.9%，召回率达到了99.87%，3项评价指标均高于YOLO v4s、YOLO v5s、YOLO v7、YOLO Xs目标检测算法；在深度卷积神经网络算法上，同时将MobileNetV3、GhostNet、ShuffleNetV2、RegNet、ConvNeXt、Res2Net以及MobileVIT共7种分类模型修改为回归模型，利用蛋鸡ROI图像进行训练，其中，Res2Net模型对蛋鸡核心体温估测拟合效果最好，在测试集上估测的决定系数R2为0.9565、调整后决定系数■为0.95631，均高于其他回归模型；为进一步提高预测精度，在Res2Net50回归模型的Bottle2block结构之后分别插入SE(Squeeze-and-excitation)模块、CBAM(Convolutional block attention module)模块、CA(Coordinate attention)、ECA(Efficient channel attention)模块，其中利用CA模块改进后的算法在测试集上的R2为0.97364、■为0.97352，均高于其他改进方法；利用目标检测网络和回归网络搭建蛋鸡核心体温估测模型，对9只蛋鸡进行体温估测试验，结果显示ROI均能完整找出，且估测体温的平均绝对误差(Mean absolute error， MAE)为0.153℃。因此，本研究提出的目标检测+深度卷积网络模型为红外热图像下蛋鸡的核心温度预测提供了较好的自动化检测方法。

关键词：笼养蛋鸡核心体温深度学习红外热成像

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全基因组关联分析方法的研究进展

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畜牧兽医学报 2016年第2期47卷 213-217页

作者：郝兴杰胡林张淑君华中农业大学动物科学技术学院/动物医学院动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070

全基因组关联分析目前已经成为研究复杂性状和疾病遗传变异的有效方法,但是由于群体结构的存在,导致分析结果出现虚假关联。经过数十年的发展,各种新方法不断出现和完善,用于减少群体结构对分析的影响。本综述将对在全基因组关联分析中... 详细信息

全基因组关联分析目前已经成为研究复杂性状和疾病遗传变异的有效方法,但是由于群体结构的存在,导致分析结果出现虚假关联。经过数十年的发展,各种新方法不断出现和完善,用于减少群体结构对分析的影响。本综述将对在全基因组关联分析中能够处理群体结构的方法进行介绍,以期为进一步选择GWAS方法准确揭示各种性状的遗传背景提供参考。

关键词：全基因关联分析群体结构虚假关联

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猪精液冻融技术及其影响因素研究进展

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华中农业大学学报 2024年第5期43卷 157-166页

作者：范振港刘鑫苗义良张霞华中农业大学动物科学技术学院、动物医学院/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070 动物育种与健康养殖教育部前沿科学中心武汉430070

养猪业是我国畜牧产业的重要组成部分。国内生猪养殖主要采用自繁自养模式,配种所使用的精液多采用鲜精或常温稀释保存精液,而精液冻融技术可实现猪精液的长期保存,但与牛、小鼠等物种相比较,猪精液冻融技术还有待于进一步优化改善。为... 详细信息

养猪业是我国畜牧产业的重要组成部分。国内生猪养殖主要采用自繁自养模式,配种所使用的精液多采用鲜精或常温稀释保存精液,而精液冻融技术可实现猪精液的长期保存,但与牛、小鼠等物种相比较,猪精液冻融技术还有待于进一步优化改善。为进一步改进猪精液冷冻技术并实现在生产上大规模应用,本文主要综述了猪精液冻融技术发展概况、主要技术流程,影响猪精液冻融后精子活力的关键因素,包括精液的采集、冷冻前降温平衡、冷冻保护剂添加和冷冻方法等,以及精子冻融过程中的理化性质变化,包括物理结构损伤、功能性损伤、精子抗冻机制等,最后总结、展望了能够提高猪精液冻融效果的新方法。

关键词：猪精液冻融冷冻保护剂冻精解冻剂精液理化性质

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P58IPK通过PERK/eIF2α通路调控猪圆环病毒2型所诱导的细胞自噬

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畜牧兽医学报 2017年第11期48卷 2125-2134页

作者：杨了寒王凯许苏童张敏胡林何启盖张淑君华中农业大学动物科学技术学院农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070 华中农业大学动物医学院农业微生物学国家重点实验室武汉430070

旨在研究猪圆环病毒2型(PCV2)感染激活的PERK/eIF2α通路是否与细胞自噬相关,以及过表达分子伴侣蛋白P58IPK在其中的作用。首先通过PERK特异性抑制剂GSK2606414和siRNA及蛋白免疫印迹检测磷酸化eIF2α(p-eIF2α)、LC3-Ⅱ和ATG5-ATG12蛋... 详细信息

旨在研究猪圆环病毒2型(PCV2)感染激活的PERK/eIF2α通路是否与细胞自噬相关,以及过表达分子伴侣蛋白P58IPK在其中的作用。首先通过PERK特异性抑制剂GSK2606414和siRNA及蛋白免疫印迹检测磷酸化eIF2α(p-eIF2α)、LC3-Ⅱ和ATG5-ATG12蛋白表达,研究PCV2感染PK-15细胞24h后PERK/eIF2α通路与细胞自噬的关系;然后通过构建和瞬时转染P58IPK真核过表达质粒及蛋白免疫印迹研究过表达P58IPK对PCV2感染PK-15诱导的PERK/eIF2α通路及细胞自噬的影响。结果显示,PERK特异性抑制剂GSK2606414和siRNA干扰PERK可极显著抑制PCV2诱导的p-eIF2α(P<0.01)和LC3-Ⅱ(P<0.01)表达;而过表达P58IPK同样可以极显著下调PCV2诱导的p-eIF2α(P<0.01)、ATG5-ATG12(P<0.01)及LC3-Ⅱ(P<0.01),且能极显著下调PCV2拷贝数(P<0.01)。结果表明,PCV2感染PK-15通过激活PERK/eIF2α通路诱导细胞自噬,过表达P58IPK通过抑制PERK通路抑制PCV2诱导的细胞自噬,从而抑制病毒复制。

关键词： P58IPK 内质网应激细胞自噬 PERK PCV2 ATG12

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猪Beclin1基因调控伪狂犬病病毒诱导细胞自噬和凋亡的机制分析

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畜牧兽医学报 2018年第6期49卷 1274-1281页

作者：胡林南良康张敏许苏童杨了寒李帅峰王凯刘正飞张淑君华中农业大学动物科学技术学院农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070 华中农业大学动物医学院农业微生物学国家重点实验室武汉430070

旨在研究伪狂犬病病毒(PRV)感染后细胞自噬和凋亡情况,进一步分析鉴定PRV感染条件下与Beclin1互作的猪宿主凋亡家族蛋白。利用免疫印迹(WB)方法检测PRV感染细胞的自噬水平;利用流式细胞术探讨凋亡水平;最后利用免疫共沉淀试验分析PRV感... 详细信息

旨在研究伪狂犬病病毒(PRV)感染后细胞自噬和凋亡情况,进一步分析鉴定PRV感染条件下与Beclin1互作的猪宿主凋亡家族蛋白。利用免疫印迹(WB)方法检测PRV感染细胞的自噬水平;利用流式细胞术探讨凋亡水平;最后利用免疫共沉淀试验分析PRV感染PK-15细胞中Beclin1与Bcl-2和Bcl-xL的结合水平。结果显示,PRV感染导致LC3-Ⅱ的表达明显增多,而P62显著下降,且AKT(S473)磷酸化水平显著减少;其次,PRV感染诱导细胞凋亡且显著上调剪切型Caspase-9/8的表达水平;最后,免疫共沉淀结果显示PRV感染条件下Beclin1能与Bcl-2和Bcl-xL结合,但结合的水平明显降低。PRV感染诱导的细胞自噬可能依赖于PI3K-Ⅰ/AKT信号通路,PRV感染可能同时激活了线粒体凋亡途经和死亡受体途经从而诱导细胞凋亡,而PRV感染诱导的细胞自噬和细胞凋亡可能通过抑制Beclin1和Bcl-2、Bcl-xL结合而相互关联。

关键词： PRV 细胞自噬细胞凋亡 Beclin1

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外泌体调控哺乳动物妊娠作用的研究进展

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中国畜牧杂志 2020年第9期56卷 16-20页

作者：华仁武雷明刚华中农业大学动物科学技术学院、动物医学院湖北武汉430070 农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室湖北武汉430070 农业部猪遗传育种重点实验室湖北武汉430070

外泌体可以携带蛋白质、mRNA、非编码RNA等生物学信息,并传递信息到其他细胞来影响受体细胞功能。在人、鼠、牛、羊、猪等动物的妊娠期间,外泌体可以介导胚胎与母体之间的交流,在妊娠识别、胚胎附植、免疫调控、胚胎发育、分娩等过程中... 详细信息

外泌体可以携带蛋白质、mRNA、非编码RNA等生物学信息,并传递信息到其他细胞来影响受体细胞功能。在人、鼠、牛、羊、猪等动物的妊娠期间,外泌体可以介导胚胎与母体之间的交流,在妊娠识别、胚胎附植、免疫调控、胚胎发育、分娩等过程中发挥重要作用。本文主要针对外泌体的特性及其在哺乳动物妊娠过程中的功能及其调控机制进行综述,有利于更全面了解哺乳动物妊娠过程中复杂的调控机制。

关键词：外泌体妊娠胚胎附植妊娠识别胚胎发育分娩

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多杀性巴氏杆菌分子分型方法简述

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微生物学报 2016年第10期56卷 1521-1529页

作者：彭忠梁婉吴斌华中农业大学动物医学院农业微生物学国家重点实验室生猪健康养殖协同创新中心湖北武汉430070 华中农业大学动物科学技术学院农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室生猪健康养殖协同创新中心湖北武汉430070

多杀性巴氏杆菌是一种能感染多种动物甚至是人的重要革兰氏阴性病原菌。目前临床上用于多杀性巴氏杆菌诊断的分型方法主要包括血清学分型方法和分子分型方法。其中血清学分型方法主要基于免疫学实验技术建立,操作过程繁琐,技术要求高,... 详细信息

多杀性巴氏杆菌是一种能感染多种动物甚至是人的重要革兰氏阴性病原菌。目前临床上用于多杀性巴氏杆菌诊断的分型方法主要包括血清学分型方法和分子分型方法。其中血清学分型方法主要基于免疫学实验技术建立,操作过程繁琐,技术要求高,工作量大,不适用于临床上大规模快速开展多杀性巴氏杆菌流行病学调查的需要;而基于分子生物学手段建立的分子分型方法相对于传统的血清学分型方法而言具有快速、简单、灵敏、灵活等特点,特别是某些分子分型方法与传统的分型方法形成了较为精确的对应关系,因而在临床上得到了广泛的应用。目前适用于临床上开展多杀性巴氏杆菌分离鉴定的分子分型方法主要包括多重PCR方法及多位点序列分型法(MLST),其中多重PCR方法又包括基于荚膜编码区及脂多糖外核编码簇建立的PCR方法。本文将重点就这3种常用的多杀性巴氏杆菌分子分型方法进行综述,介绍其建立原理、实现手段以及各自的优缺点,为临床上开展多杀性巴氏杆菌的流行病学调查特别是分子流行病学调查提供参考。

关键词：多杀性巴氏杆菌分子分型方法多重PCR 多位点序列分型

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猪圆环病毒2型对小鼠淋巴细胞发育的抑制作用

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畜牧兽医学报 2015年第8期46卷 1400-1408页

作者：吴斌肖惠胡林杨了寒叶十一何启盖蔡双双张淑君华中农业大学动物科技学院动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070 华中农业大学动物医学院农业微生物学国家重点实验室武汉430070 湖北三峡职业技术学院宜昌443000

猪圆环病毒2型(PCV2)是引起仔猪断奶多系统衰竭综合征的病原微生物,该病毒可以降低免疫反应引起严重的免疫抑制,直接导致体内淋巴细胞的凋亡和耗竭。为研究PCV2对发育中淋巴细胞的影响,本文以小鼠为试验模型,用免疫荧光法统计骨髓、胸... 详细信息

猪圆环病毒2型(PCV2)是引起仔猪断奶多系统衰竭综合征的病原微生物,该病毒可以降低免疫反应引起严重的免疫抑制,直接导致体内淋巴细胞的凋亡和耗竭。为研究PCV2对发育中淋巴细胞的影响,本文以小鼠为试验模型,用免疫荧光法统计骨髓、胸腺、脾CD3、CD19阳性淋巴细胞数,qPCR定量分析淋巴细胞发育相关基因转录水平,MTT法检测体外培养淋巴细胞增殖能力。结果表明:(1)PCV2造成感染早期小鼠外周血淋巴细胞不同程度减少,并抑制体外培养淋巴细胞的增殖;(2)PCV2导致骨髓和脾CD19阳性B淋巴细胞极显著降低(P<0.01),并抑制淋巴细胞发育相关基因的转录;(3)PCV2对发育中淋巴细胞的凋亡也有一定促进作用。因此,PCV2抑制早期淋巴细胞的发育和促进发育中淋巴细胞凋亡可能是导致体内淋巴细胞大量耗竭的原因之一。

关键词： PCV2 T淋巴细胞 B淋巴细胞细胞发育

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