检索结果-内蒙古大学图书馆

中国畜牧兽医 2025年第4期52卷 1455-1467页

作者：苗娜乔嘉坤杨慧韩萍萍许方军车兆轩代翔毓徐明航龙志伟朱猛进华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070 华中农业大学生猪健康养殖协同创新中心武汉430070

【目的】猪是重要的农业动物,其免疫性状的解析对于提高生产效率和抗病能力至关重要。本研究旨在鉴别与杜洛克猪×二花脸猪F2代杂交猪免疫性状相关的候选基因,为猪抗病育种提供重要的候选基因信息。【方法】采集294头杜洛克猪×... 详细信息

【目的】猪是重要的农业动物,其免疫性状的解析对于提高生产效率和抗病能力至关重要。本研究旨在鉴别与杜洛克猪×二花脸猪F2代杂交猪免疫性状相关的候选基因,为猪抗病育种提供重要的候选基因信息。【方法】采集294头杜洛克猪×二花脸猪F2代杂交猪出生后24 h内的耳、尾组织样本,提取基因组DNA,并在35日龄时采集血液样本用于细胞因子检测。通过对杜洛克猪×二花脸猪F2代杂交猪资源群体的细胞因子(IFN-α、IFN-γ、IGG、IL8、IL10)相关免疫性状进行全基因组关联分析(GWAS),识别与性状相关的单核苷酸多态性(SNP)位点,使用IFN-γ/IL10值(IFNGIL10)进一步鉴定影响猪免疫性状的相关SNP位点与候选基因,对鉴定的相关基因进行GO功能与KEGG通路富集分析,并对候选基因编码蛋白进行蛋白互作(PPI)分析。【结果】GWAS共鉴定出10个SNPs,这些SNPs定位到21个与免疫性状相关的候选基因:CH25H、LIPA、SIGMAR1、PIP5KIC、PLCZ1、PIK3C2G、CNTFR、IL11RA、SAP30、HMGB2、CCL21、CCL19、CCL27、GNA11、GNA15、DSCC1、TERF2IP、FZR1、ENPP2、CACTIN和FAS。GO功能富集结果显示,候选基因显著富集在趋化因子活性、细胞对白细胞介素-1的反应和炎症反应等条目。KEGG通路富集结果显示,候选基因显著富集在细胞因子与受体结合通路、肌醇磷酸代谢、钙信号通路等通路。PPI分析共构建了12个子网络,表明这些候选基因之间存在潜在联系,在同一通路上进行显著富集,并共同参与生物过程以发挥其生物功能。【结论】本研究共发现10个与猪免疫性状关联的SNPs位点,结合富集分析与PPI网络筛选到21个目标性状候选基因。本研究结果不仅加深了对猪免疫特性分子基础的理解,也为猪的抗病育种提供了理论依据。

关键词：猪细胞因子免疫性状全基因组关联分析候选基因

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淮南猪肌肉组织不同发育阶段的甲基化差异基因筛选

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华中农业大学学报 2025年第1期44卷 183-190页

作者：陈俊峰王璟靳玮柴进张家庆任巧玲邢宝松河南省畜禽繁育及营养调控重点实验室/河南省农业科学院畜牧兽医研究所郑州450002 农业农村部猪遗传育种重点开放实验室/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/华中农业大学动物科技学院武汉430070

为进一步开展淮南猪分子选育,提升其生长速度和瘦肉率等经济性状,选取淮南猪胚胎期(days post coitus, dpc)第38、58、78天和出生后第21天4个发育阶段的淮南公猪背最长肌,开展全基因组甲基化测序并通过信号通路富集分析筛选调控肌肉发... 详细信息

为进一步开展淮南猪分子选育,提升其生长速度和瘦肉率等经济性状,选取淮南猪胚胎期(days post coitus, dpc)第38、58、78天和出生后第21天4个发育阶段的淮南公猪背最长肌,开展全基因组甲基化测序并通过信号通路富集分析筛选调控肌肉发育的甲基化差异的候选基因。结果显示,基因主体的CpG甲基化程度高于基因上下游2 kb序列的CpG甲基化,基因组元件中内含子、3'UTR和重复序列等甲基化程度最高。随着发育时间的增加,基因主体的CpG甲基化水平逐渐下降,上下游2 kb则是下降-上升-下降趋势。基因组元件中内含子区、3'UTR区和重复序列的甲基化水平都逐渐下降,启动子区则为下降-上升-下降趋势。信号通路富集分析显示,在淮南猪相邻的发育阶段38~58 dpc、58~78 dpc、78 dpc~21 d三者间的差异化均达到极显著水平,黏着斑信号通路存在CpG甲基化差异基因,且达到极显著水平(P值分别为0.000 9、0.000 4、0.000 1),细胞黏附连接信号通路存在CHH甲基化差异基因,且分别达到显著或极显著水平(P值分别为0.013 2、0.012 8、0.000 5),生物信息学分析结果显示,在2个信号通路中筛选到辅肌动蛋白Α4基因(actinin-4, ACTN4)和成纤维细胞生长因子受体(fibroblast growth factor receptor, FGFR1)基因。ACTN4基因调节肌动蛋白结合过程,在4个发育阶段的甲基化水平分别为55.75%、11.18%、10.18%、59.75%,FGFR1基因和肌肉细胞分化相关,在4个发育阶段的甲基化水平分别为0.81%、0.78%、7.52%、0.44%。以上结果表明,在淮南猪肌肉组织不同发育阶段筛选到的2个甲基化差异基因ACTN4和FGFR1可作为淮南猪肌肉发育候选基因进行分子育种。

关键词：淮南猪甲基化差异基因肌肉组织肌肉发育

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棉花野生种质资源的育种应用研究与前景

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生物技术通报 2025年第04期41卷 21-32页

作者：牛若宇高瞻熊显鹏祝德罗皓天马学远胡冠菁中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心) 华中农业大学植物科学技术学院中国农业科学院棉花研究所棉花生物育种与综合利用全国重点实验室农业农村部棉花生物学与遗传育种重点实验室

驯化和长期育种导致的遗传瓶颈效应显著降低了栽培棉花的遗传多样性，限制了其新品种开发和适应未来挑战的潜力。野生种质资源则作为重要的基因库，为改良栽培棉提供了丰富的遗传多样性。本文系统综述了棉花野生种质资源在遗传多样性研... 详细信息

驯化和长期育种导致的遗传瓶颈效应显著降低了栽培棉花的遗传多样性，限制了其新品种开发和适应未来挑战的潜力。野生种质资源则作为重要的基因库，为改良栽培棉提供了丰富的遗传多样性。本文系统综述了棉花野生种质资源在遗传多样性研究、优异耐逆资源挖掘、控制复杂农艺性状的异源四倍体重复基因挖掘，以及杂交育种材料创制中的最新进展与挑战，并靶定了4个亟待解决的关键科学问题，作为推动野生棉资源高效利用和育种创新的重要方向。未来研究将进一步利用野生种质资源的优异基因，联合基因组学、转录组学、表观组学等多组学技术，揭示关键功能基因及其调控机制，破解光周期敏感性机制，并结合基因编辑技术，推动优异基因向栽培种快速导入，实现棉花育种的创新发展。

关键词：棉花野生近缘种耐盐碱种质资源挖掘重复基因调控光周期敏感性多倍体

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基于智能手机识别的薄层色谱法快速检测油菜籽中的叶绿素

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中国油料作物学报 2025年第1期47卷 217-225页

作者：郭梦帅李泽一肖华明吕昕梅德圣王丹姚旋郭亮胡琼陈洪魏芳中国农业科学院油料作物研究所农业农村部油料加工重点实验室湖北省油料脂质化学与营养重点实验室湖北武汉430062 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室湖北武汉430070 农业农村部油料作物生物学与遗传育种重点实验室湖北武汉430062 湖北洪山实验室湖北武汉430070

为高效鉴定油菜籽品质,建立一种操作简单、成本低、耗时短的油菜籽中叶绿素含量的快速检测方法。采用乙醇(95%)提取样品中的叶绿素,以石油醚(60~90℃)-丙酮-甲苯(体积比2∶1.5∶2)为展开剂,紫外线分析仪(365 nm)激发叶绿素荧光显色,用... 详细信息

为高效鉴定油菜籽品质,建立一种操作简单、成本低、耗时短的油菜籽中叶绿素含量的快速检测方法。采用乙醇(95%)提取样品中的叶绿素,以石油醚(60~90℃)-丙酮-甲苯(体积比2∶1.5∶2)为展开剂,紫外线分析仪(365 nm)激发叶绿素荧光显色,用智能手机采集荧光斑点图像,Image J软件进行荧光斑点自动识别,得到斑点面积,实现叶绿素a和叶绿素b的快速定性定量分析。该方法定量检测叶绿素a和b的线性范围为0.04~1.00 mg/m L,叶绿素a的决定系数R^(2)为0.9965,日内精密度为5.9%,日间精密度为8.6%。叶绿素b的决定系数R^(2)为0.9925,日内精密度为6.1%,日间精密度为5.6%。油菜籽中叶绿素a和叶绿素b的加标回收率分别为90.00%~91.67%和92.00%~113.00%。结果表明该方法线性关系较好,准确度良好,能快速测定油菜籽中叶绿素含量。

关键词：叶绿素薄层色谱法 Image J 智能手机定量分析

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团头鲂myomaker基因的鉴定及其在肌纤维发育中的功能

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华中农业大学学报 2025年第1期44卷 201-210页

作者：邹雪刘起周佳佳吴天宇刘露莎高泽霞华中农业大学水产学院/农业农村部淡水生物繁育重点实验室/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070 长江经济带大宗水生生物产业绿色发展教育部工程研究中心/湖北省名优鱼育种与健康养殖工程技术研究中心武汉430070

为探究myomaker基因在团头鲂(Megalobrama amblycephala)肌纤维发育中的调控作用,通过石蜡切片和HE染色方法分析不同日龄团头鲂肌纤维发育特征,采用RT-PCR及qRT-PCR技术鉴定myomaker基因的cDNA序列,并探讨该基因在团头鲂不同发育阶段及... 详细信息

为探究myomaker基因在团头鲂(Megalobrama amblycephala)肌纤维发育中的调控作用,通过石蜡切片和HE染色方法分析不同日龄团头鲂肌纤维发育特征,采用RT-PCR及qRT-PCR技术鉴定myomaker基因的cDNA序列,并探讨该基因在团头鲂不同发育阶段及不同组织部位的时空表达模式。石蜡切片结果显示团头鲂肌纤维直径在20~60 d持续递增,其中在40、50和60 d均显著递增(P<0.05),且在40~50 d时其肌纤维直径递增最快。基因结构分析发现团头鲂myomaker基因全长4 693 bp,包含5个外显子和4个内含子,开放阅读框为663 bp,共编码220个氨基酸,其编码蛋白为7次跨膜蛋白。氨基酸相似度比对显示myomaker基因保守性较高;系统进化树分析显示,团头鲂myomaker基因与鲤等鲤科鱼类的myomaker基因聚为一支,具有最近的亲缘关系。荧光定量结果显示,myomaker在1月龄团头鲂肌肉组织中表达量极其显著高于其他组织(P<0.000 1),同时myomaker在团头鲂出膜后15~30 d表达量逐渐上升,在30 d表达量最高(P<0.05)。基于形态学和基因表达特征,推测myomaker基因在团头鲂30 d后肌纤维的融合中发挥重要的调控作用,从而促进肌纤维的肥大。

关键词：肌纤维直径团头鲂 myomaker基因基因表达肌纤维发育

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一种面向功能基因挖掘的动物多组学数据集

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农业大数据学报 2025年第1期7卷 96-106页

作者：刘洪窦婧文王越廖勇刘小磊李新云赵书红付玉华农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室华中农业大学动物科学技术学院武汉430070 湖北洪山实验室武汉430070

单一的组学数据难以全面揭示基因调控性状的复杂分子机制,整合不同类型和层次的生物组学数据对于理解生物体内复杂的分子网络具有重要的意义。本数据集提供了包含21个动物物种的61191个个体水平组学数据(WGS、RNA-Seq、ChIP-Seq和ATAC-S... 详细信息

单一的组学数据难以全面揭示基因调控性状的复杂分子机制,整合不同类型和层次的生物组学数据对于理解生物体内复杂的分子网络具有重要的意义。本数据集提供了包含21个动物物种的61191个个体水平组学数据(WGS、RNA-Seq、ChIP-Seq和ATAC-Seq)和基因组注释信息,有效数据规模为2.8 TB。此外,本数据集还收录了基于深度学习算法得到的基因与表型实体识别数据。总的来说,该多组学数据集可用于农业重要性状的基因发掘和功能验证,能够为跨物种比较研究提供有价值的资源,也可更好地服务于动物经济性状关键基因识别模型构建以及算法研究。

关键词：多组学数据跨物种功能基因挖掘个体水平深度学习

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SP1/IGF2BP3轴对猪骨骼肌卫星细胞增殖的调控作用

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河南农业科学 2025年第3期54卷 129-138页

作者：黄雨馨王伟李一星唐中林广西大学广西南宁530004 中国农业科学院农业基因组研究所广东深圳518000 佛山鲲鹏现代农业研究院广东佛山528226 农业农村部畜禽生物组学重点实验室广东深圳518000 华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/农业农村部猪遗传育种重点实验室湖北武汉430070

为了探究胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白3(IGF2BP3)对猪骨骼肌生长发育的影响,并解析其生物学功能和表达调控机制,为猪的遗传改良提供理论依据和候选基因,以猪骨骼肌卫星细胞为试验材料,通过RT-qPCR和蛋白质印迹检测细胞增殖标志基因P... 详细信息

为了探究胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白3(IGF2BP3)对猪骨骼肌生长发育的影响,并解析其生物学功能和表达调控机制,为猪的遗传改良提供理论依据和候选基因,以猪骨骼肌卫星细胞为试验材料,通过RT-qPCR和蛋白质印迹检测细胞增殖标志基因PCNA、CDK4、Cyclin A2和MKI67的表达,采用EdU和CCK-8检测细胞增殖活力和速率,通过突变IGF2BP3基因启动子区SP1结合位点的双荧光素酶试验和ChIP试验探索转录因子SP1对IGF2BP3基因的表达调控机制。结果表明,在猪骨骼肌卫星细胞中敲低IGF2BP3后,细胞增殖标志基因的表达均明显上调,EdU阳性细胞比例增加,细胞增殖速率在48、72 h均明显提高。SP1结合位点的突变使双荧光素酶活性明显降低,而过表达SP1使双荧光素酶活性明显增强。SP1可与IGF2BP3基因启动子区结合。干扰SP1后IGF2BP3表达降低,而过表达SP1后IGF2BP3表达增加。过表达SP1能部分消除敲低IGF2BP3促进猪骨骼肌卫星细胞增殖的表型。综上,转录因子SP1与IGF2BP3基因相互作用,共同调控猪骨骼肌卫星细胞增殖。

关键词：猪骨骼肌 IGF2BP3 SP1 猪骨骼肌卫星细胞增殖

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陆地棉种质资源黄萎病发病率的关联分析

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安徽农业科学 2025年第4期53卷 1-4,39页

作者：周小凤曹阳何良荣董承光王新李娟林忠旭余渝新疆农垦科学院棉花研究所/农业农村部西北内陆棉区棉花生物学与遗传育种重点实验室新疆石河子832000 新疆生产建设兵团第五师农业科学研究所新疆双河833408 塔里木大学新疆阿拉尔843300 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室湖北武汉430070

近年来,棉花黄萎病在新疆蔓延,已成为制约当地棉花生产的重要因素之一。运用高通量SNP芯片对344份具有代表性的棉花种质资源进行基因型分析,考察群体在4个环境(2年2个试验点)中的黄萎病发病率表型,并利用混合线性模型(mixed linear mode... 详细信息

近年来,棉花黄萎病在新疆蔓延,已成为制约当地棉花生产的重要因素之一。运用高通量SNP芯片对344份具有代表性的棉花种质资源进行基因型分析,考察群体在4个环境(2年2个试验点)中的黄萎病发病率表型,并利用混合线性模型(mixed linear model,MLM)进行全基因组关联分析。结果表明,棉花黄萎病发病率与产量、纤维品质存在负相关性。该群体在4个环境中黄萎病发病率的广义遗传力为40.10%。群体结构分析表明,该群体可分为2个亚群。MLM模型检测到18个显著位点,分布在A03、A05、A10、A12、D02、D11和D13。研究结果有助于解析棉花黄萎病抗性的遗传基础,为研究棉花黄萎病的致病机制以及指导黄萎病抗性的遗传改良提供理论参考。

关键词：陆地棉种质资源黄萎病发病率关联分析

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IGF2基因PCR-RFLP多态性与脂肪沉积相关性状的关联分析

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Acta Genetica Sinica 2003年第12期30卷 1107-1112页

作者：刘桂兰蒋思文熊远郑嵘屈彦纯华中农业大学农业部猪遗传育种重点开放实验室

胰岛素样生长因子 2在胎儿生长发育、肿瘤细胞增殖、肌肉生长等方面具有重要的调控作用 ,是影响猪瘦肉量的主要候选基因。采用PCR RFLP技术 ,分析了IGF2基因第 8内含子部分片段在猪资源家系群体中的NciⅠ酶切片段多态性分布。IGF2基因... 详细信息

胰岛素样生长因子 2在胎儿生长发育、肿瘤细胞增殖、肌肉生长等方面具有重要的调控作用 ,是影响猪瘦肉量的主要候选基因。采用PCR RFLP技术 ,分析了IGF2基因第 8内含子部分片段在猪资源家系群体中的NciⅠ酶切片段多态性分布。IGF2基因该片段具有两个NciⅠ酶切位点 (切点位于第 8内含子 ,分别记录为位点A和位点B) ,两位点在资源家系中均具有多态性。IGF2基因B位点酶切未突变个体均比酶切突变的个体背膘薄 18 2 8% (P<0 0 1) ,肥肉率低 2 2 4 3% (P <0 0 1) ,瘦肉率高 8 71% (P <0 0 1) ,位点A具有相同的影响趋势。在该研究群体中 ,IGF2基因发挥作用的方式主要为加性效应。

关键词： IGF2基因 PCR-RFLP 背膘厚猪

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猪ATF4基因多态性与生产性状的关联及基因表达分析

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遗传 2011年第12期33卷 1347-1352页

作者：陈超吴望军熊远华中农业大学农业部猪遗传育种重点开放实验室武汉430070

为进一步了解和认识ATF4基因的功能,揭示ATF4对猪脂肪代谢的影响,寻找与肉质性状相关联的分子标记,文章采用PCR方法扩增了ATF4基因部分序列,通过序列比对发现在翻译起始密码子ATG下游159 bp处存在A159G转换,通过PCR-AluⅠ-RFLP对大白猪... 详细信息

为进一步了解和认识ATF4基因的功能,揭示ATF4对猪脂肪代谢的影响,寻找与肉质性状相关联的分子标记,文章采用PCR方法扩增了ATF4基因部分序列,通过序列比对发现在翻译起始密码子ATG下游159 bp处存在A159G转换,通过PCR-AluⅠ-RFLP对大白猪、长白猪、梅山猪和通城猪进行酶切分型,发现在大白猪和长白猪中均为AA基因型,在梅山猪和通城猪中均为GG基因型。进一步对大白猪×梅山F2群体资源家系进行了酶切分型,并分析该位点的多态性与生产性状的关系。结果表明,ATF4的多态性与臀部平均膘厚存在极显著相关(P<0.01),与胸腰椎间膘厚、平均膘厚、眼肌高、眼肌面积存在显著相关(P<0.05)。采用Real-time PCR分析了ATF4基因在大白猪与梅山猪背最长肌不同发育阶段的表达模式。结果表明,ATF4基因在大白猪和梅山猪胚胎期65 d和出生后3 d中的表达水平相对都比较低,且在两品种间无明显差异;而在出生后60 d和120 d,ATF4基因在大白猪中与梅山猪均出现了上调表达,并且在梅山猪中的相对表达水平要显著高于大白猪。研究结果为进一步深入研究猪ATF4基因在脂肪代谢中的分子机理奠定了基础。

关键词：猪 ATF4 PCR-RFLP 关联分析表达模式分析

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