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首届全国有机废弃物生物转化机制及资源化利用研讨会

作者：平磊郑龙玉张吉斌喻子牛农业微生物学国家重点实验室农业部农业微生物资源利用重点实验室微生物农药国家工程研究中心华中农业大学生命科学技术学院武汉430070

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深海枝芽胞杆菌A493产生的新活性物质Z11的抗菌机理

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化学与生物工程 2013年第2期30卷 20-23页

作者：黄典陈莉邵宗泽孙风琴张少博林达张鼎楠喻子牛张吉斌华中农业大学农业微生物学国家重点实验室生命科学技术学院微生物农药国家工程研究中心湖北武汉430070 国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

以一株抗菌谱窄的深海枝芽胞杆菌(Virgibacillus dokdonensis)A493为研究对象,对其产生的新的氨基糖苷类抗菌活性物质Z11抑制水稻黄单胞菌的浓度范围和抗菌作用机理进行了研究。结果表明Z11抑制水稻黄单胞菌的浓度范围为14～56μg·... 详细信息

以一株抗菌谱窄的深海枝芽胞杆菌(Virgibacillus dokdonensis)A493为研究对象,对其产生的新的氨基糖苷类抗菌活性物质Z11抑制水稻黄单胞菌的浓度范围和抗菌作用机理进行了研究。结果表明Z11抑制水稻黄单胞菌的浓度范围为14～56μg·mL-1;机理研究显示Z11不改变水稻黄单胞菌细胞膜的通透性,但能影响其蛋白质的合成及细胞壁合成关键酶N-乙酰葡糖胺-1-磷酸尿苷酰转移酶(GlmU)的活性。

关键词：深海枝芽胞杆菌A493 水稻黄单胞菌活性物质抗菌机制

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苏云金芽胞杆菌YBT-1520中SigL及其增强子结合蛋白的结构与功能分析

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应用与环境生物学报 2012年第2期18卷 315-319页

作者：王丽丽王阶平艾绪露周航喻子牛何进华中农业大学生命科学技术学院农业微生物学国家重点实验室微生物农药国家工程研究中心武汉430070

为揭示SigL及其增强子结合蛋白(EBPs)在苏云金芽胞杆菌(Bt)中的调控功能,在全基因组测序的基础上,采用生物信息学方法,对YBT-1520菌株的SigL及其EBPs的结构和功能进行深入分析.结果表明,YBT-1520基因组中存在1个SigL和6个EBPs,而且EBPs... 详细信息

为揭示SigL及其增强子结合蛋白(EBPs)在苏云金芽胞杆菌(Bt)中的调控功能,在全基因组测序的基础上,采用生物信息学方法,对YBT-1520菌株的SigL及其EBPs的结构和功能进行深入分析.结果表明,YBT-1520基因组中存在1个SigL和6个EBPs,而且EBPs在结构上具有丰富的多样性,包含了EBPs的所有可能的结构域组织类型.SigL所调控的基因涉及11个假定的COG代谢途径,其中包括能量代谢、氨基酸代谢、翻译与细胞周期等.根据EBPs在基因组的位置推测,YBT-1520的EBPs参与γ-氨基丁酸代谢途径、精氨酸代谢途径、支链脂肪酸降解途径、多糖分解代谢等代谢途径的调控.本研究将为揭示Bt杀虫晶体蛋白大量表达的调控机制提供新的思路.

关键词：苏云金芽胞杆菌增强子结合蛋白 SigL 代谢途径功能分析生物信息学表达调控

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成簇的规律间隔的短回文重复序列CRISPR的研究进展

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微生物学报 2011年第8期51卷 1007-1013页

作者：王丽丽何进王阶平华中农业大学生命科学技术学院农业微生物学国家重点实验室微生物农药国家工程研究中心武汉430070

最近发现,在细菌和古菌中广泛存在的成簇的规律间隔的短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)及其相关蛋白是针对噬菌体、质粒等外源DNA的获得性和可遗传的免疫系统。本文综述了CRISPR系统... 详细信息

最近发现,在细菌和古菌中广泛存在的成簇的规律间隔的短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)及其相关蛋白是针对噬菌体、质粒等外源DNA的获得性和可遗传的免疫系统。本文综述了CRISPR系统的基本结构、多样性、作用机理及其区分自我与非我的机制,并对CRISPR研究和应用前景进行了展望。

关键词：成簇的规律间隔的短回文重复序列多样性作用机理 RNA干扰

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蜡状芽孢杆菌群中规律成簇间隔短回文重复序列的生物信息学分析

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中国生物工程杂志 2011年第7期31卷 72-78页

作者：王琰喻婵王阶平邱宁何进孙明张青叶农业微生物学国家重点实验室微生物农药国家工程研究中心华中农业大学生命科学技术学院武汉430070 华中农业大学理学院武汉430070

规律成簇间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)是最近发现针对噬菌体等外源遗传物质的获得性和可遗传性的新型原核生物防御系统。通过BLAST、多序列比对、RNA二级结构预测等生物信息... 详细信息

规律成簇间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)是最近发现针对噬菌体等外源遗传物质的获得性和可遗传性的新型原核生物防御系统。通过BLAST、多序列比对、RNA二级结构预测等生物信息学方法对已经完成全基因组测序的蜡状芽孢杆菌群24个菌株进行CRISPR的系统分析,结果表明:42%的菌株含有该结构;8个CRISPR座位的正向重复序列可以形成RNA二级结构,提示正向重复序列可能介导外源DNA或RNA与CAS编码蛋白的相互作用;31%的间区序列与噬菌体、质粒、蜡状芽孢杆菌群基因组序列具有同源性,进一步验证间区序列很可能来源于外源可移动遗传因子。由于大部分蜡状芽孢杆菌群菌株含有多个前噬菌体和质粒,通过对蜡状芽孢杆菌群CRISPR的分析,为揭示其对宿主菌与噬菌体,以及宿主菌与质粒间的关系奠定基础。

关键词：蜡状芽孢杆菌群规律成簇间隔短回文重复序列前导序列重复序列间区序列

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耐高温产乙醇酿酒酵母菌S-13的特性研究

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化学与生物工程 2011年第6期28卷 63-67页

作者：宋丹喻子牛蔡皓农业微生物学国家重点实验室微生物农药国家工程研究中心华中农业大学生命科学技术学院湖北武汉430070

以耐高温产乙醇酿酒酵母菌S-13为出发菌株,在优化的培养条件下,通过连续传代转接实验对其性能进行研究。结果表明,菌株S-13种子液的最佳培养时间为12~14 h,最佳发酵时间为48 h;其遗传稳定性在20代之内相对较好,每相邻2代的乙醇浓度相对... 详细信息

以耐高温产乙醇酿酒酵母菌S-13为出发菌株,在优化的培养条件下,通过连续传代转接实验对其性能进行研究。结果表明,菌株S-13种子液的最佳培养时间为12~14 h,最佳发酵时间为48 h;其遗传稳定性在20代之内相对较好,每相邻2代的乙醇浓度相对误差小于5%;对乙醇的耐受能力为14%（体积分数）;热致死温度为66~67℃;对葡萄糖的耐受能力为60%（质量分数）;对NaCl的耐受能力为15%（质量分数）;在pH值为2.0~9.0的环境中生长良好。为连续发酵生产乙醇提供了依据。

关键词：耐高温酿酒酵母特性乙醇浓度

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苏云金芽胞杆菌新基因资源的发掘策略

苏云金芽胞杆菌新基因资源的发掘策略

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第三届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会

作者：喻子牛孟盈孙明何进李明顺郑世学农业微生物学国家重点实验室微生物农药国家工程研究中心农业部微生物资源及利用综合实验室华中农业大学生命科学技术学院

苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)是一类在生态环境中广泛分布、能形成芽胞和伴胞晶体的G+细菌,在胞内或胞外能产生蛋白质、核苷类、氨基多元醇等生物活性物质。已发现芽胞和伴胞晶体对节肢动物门9个目中600多种昆虫,以及对线

关键词：杀虫晶体蛋白基因伴胞晶体甘薯茎线虫高毒力双效菌素欧文氏菌基因资源协同增效作用双翅目编码蛋白

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2-甲基异茨醇降解菌阴沟肠杆菌Z5的分离鉴定及BAC文库的构建

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华中农业大学学报 2010年第1期29卷 55-58页

作者：么敬静赵有文邹霞崔翠何进喻子牛华中农业大学生命科学技术学院/农业微生物学国家重点实验室/微生物农药国家工程研究中心武汉430070

从采集到的污水样品中分离得到1株高效降解2-甲基异茨醇(2-methylisoborneol,2-MIB)的菌株Z5,通过16S rDNA序列分析,鉴定为阴沟肠杆菌(Enterobactercloacae)。该菌在以2-MIB为唯一碳源的培养基中能正常生长代谢。经气相色谱-质谱分析,... 详细信息

从采集到的污水样品中分离得到1株高效降解2-甲基异茨醇(2-methylisoborneol,2-MIB)的菌株Z5,通过16S rDNA序列分析,鉴定为阴沟肠杆菌(Enterobactercloacae)。该菌在以2-MIB为唯一碳源的培养基中能正常生长代谢。经气相色谱-质谱分析,发现该菌对2-MIB的降解率高达89.7%。同时,测定了Z5在不同质量浓度2-MIB中的生长情况,结果表明:当2-MIB质量浓度为16μg/L时,其生长状况与在LB中最为接近。为了克隆降解2-MIB关键酶的编码基因并进一步研究其降解途径,本研究构建了***5的全基因组BAC文库,该文库覆盖了大约8倍的基因组,共计810个转化子,外源片段平均大小为40 kb。

关键词： 2-甲基异茨醇(2-MIB) 阴沟肠杆菌生物降解 BAC文库气相色谱-质谱联用

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深海盐单胞菌产生的微生物絮凝剂HBF-3对刚果红模拟染料废水脱色的研究

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华中农业大学学报 2010年第2期29卷 181-184页

作者：邹娟赵妮张吉斌邵宗泽刘子铎喻子牛华中农业大学生命科学技术学院/农业微生物学国家重点实验室/微生物农药国家工程研究中心武汉430070 国家海洋局第三海洋研究所厦门361000

以深海盐单胞菌V3a′(Halomonas sp.V3a′)合成的新型微生物絮凝剂HBF-3对刚果红模拟染料废水进行脱色试验,探讨HBF-3加入量、溶液pH、温度对脱色效果的影响,并与活性炭和壳聚糖对刚果红染料的脱色效果进行对比。结果表明:增加HBF-3的... 详细信息

以深海盐单胞菌V3a′(Halomonas sp.V3a′)合成的新型微生物絮凝剂HBF-3对刚果红模拟染料废水进行脱色试验,探讨HBF-3加入量、溶液pH、温度对脱色效果的影响,并与活性炭和壳聚糖对刚果红染料的脱色效果进行对比。结果表明:增加HBF-3的加入量可以提高对刚果红溶液的脱色效果,HBF-3质量浓度为100mg/L时对200mg/L刚果红的去除率达83.7%;HBF-3对染料废水脱色效果受pH值的影响大,pH值在5.0～6.0时,HBF-3对刚果红溶液的脱色效果较弱,为41.1%左右;pH值在7.0～9.0之间变化时,脱色率稳定在88.7%左右;在10～70℃范围内絮凝率随温度变化而改变的幅度小。

关键词：深海微生物盐单胞菌微生物絮凝剂刚果红脱色

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桑粒肩天牛肠道木质纤维素分解细菌的分离和鉴定

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化学与生物工程 2010年第7期27卷 66-68,91页

作者：刘晨娟蔡皓李庆喻子牛华中农业大学生命科学技术学院农业微生物学国家重点实验室微生物农药国家工程研究中心湖北武汉430070 华中农业大学理学院湖北武汉430070

利用纤维素-刚果红选择培养基和苯胺蓝培养基从桑粒肩天牛肠道中筛选出一株同时具有纤维素酶活和木质素酶活的细菌。通过形态学观察和生理生化鉴定,确定为枯草芽孢杆菌。该菌在纤维素发酵培养基中,最高活力为0.51 ***-1;在木质素发酵培... 详细信息

利用纤维素-刚果红选择培养基和苯胺蓝培养基从桑粒肩天牛肠道中筛选出一株同时具有纤维素酶活和木质素酶活的细菌。通过形态学观察和生理生化鉴定,确定为枯草芽孢杆菌。该菌在纤维素发酵培养基中,最高活力为0.51 ***-1;在木质素发酵培养基中,锰过氧化物酶(Mnp)和漆酶(Lac)活力分别为0.1841 ***-1(96 h)、0.0633 ***-1(48 h),没有检测到过氧化物酶(Lip)活力。

关键词：桑粒肩天牛筛选纤维素木质素

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