检索结果-内蒙古大学图书馆

华南农业大学学报 2024年第4期45卷 457-468页

作者：罗欣欣郑虎高美娟杨化强华南农业大学动物科学学院/国家生猪种业工程技术中心广东广州510642

[目的]伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)属甲型疱疹病毒科,是一种嗜神经性病毒,通过接触传播感染造成神经和呼吸系统疾病。猪是PRV的自然宿主,PRV的感染和流行对养猪业造成巨大经济损失。PRV侵染宿主中枢神经系统后,引发神经肽S(Ne... 详细信息

[目的]伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)属甲型疱疹病毒科,是一种嗜神经性病毒,通过接触传播感染造成神经和呼吸系统疾病。猪是PRV的自然宿主,PRV的感染和流行对养猪业造成巨大经济损失。PRV侵染宿主中枢神经系统后,引发神经肽S(Neuropeptide S,NPS)系统表达水平的改变。NPS是一种神经肽物质,作为神经内分泌系统的关键成员在中枢神经系统中广泛分布,与慢性疾病相关联,NPS通过神经肽S受体(Neuropeptide S receptor,NPSR)介导多样化的生理功能,在机体内以NPS/NPSR系统形式共同参与神经内分泌-免疫网络调节。本研究探讨了NPS/NPSR系统在PRV感染宿主细胞中的作用,以期待开发新的抗PRV靶点。[方法]通过CRISPR/Cas9构建NPS和NPSR敲除的PK15细胞系,利用qPCR、免疫荧光、Western blot、免疫共沉淀(CO-IP)等方法检测感染PRV病毒后细胞系的抗病毒能力及NPSR与病毒表面糖蛋白的结合能力。[结果]NPSR敲除能减弱PRV对PK15细胞的感染能力,而NPS基因敲除增强了PRV对PK15细胞的感染能力。NPSR敲除细胞在PRV吸附过程中能减少病毒的侵入量,因此NPSR是潜在的PRV入侵受体。CO-IP试验证明,NPSR与病毒包膜蛋白gB和gD存在相互作用。[结论]NPSR通过与病毒表面糖蛋白结合促进PRV感染,NPSR可能是PRV感染神经系统的受体因子之一。NPSR敲除能显著抑制PRV对PK15细胞的感染。NPSR可为开发PRV防控药物和治疗策略提供新的研究靶点。

关键词：神经肽S受体伪狂犬病病毒病毒受体宿主病毒相互作用

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供体细胞代谢重编程和表观遗传修饰对犬-猪异种克隆胚胎发育效率的影响

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遗传 2025年

作者：闫艳霞张雨涵吴珍芳李紫聪华南农业大学动物科学学院国家生猪种业工程技术研究中心

为了探索能提高体细胞克隆效率的新方法，本研究比较了糖酵解促进剂PS48和表观遗传修饰剂（DNA甲基化酶抑制剂RG108和组蛋白去乙酰化酶抑制剂Scriptaid）的不同处理浓度和时间对犬-猪异种体细胞核移植（interspecies somatic cell nucle... 详细信息

为了探索能提高体细胞克隆效率的新方法，本研究比较了糖酵解促进剂PS48和表观遗传修饰剂（DNA甲基化酶抑制剂RG108和组蛋白去乙酰化酶抑制剂Scriptaid）的不同处理浓度和时间对犬-猪异种体细胞核移植（interspecies somatic cell nuclear transfer，iSCNT）胚胎发育效率的影响。结果显示：（1）5 μmol/L PS48处理犬耳成纤维细胞（canine ear fibroblasts，cEFs）和脂肪间充质干细胞（canine adipose tissue-derived mesenchymal stem cells，cAd-MSCs）24 h显著增强了其后续iSCNT胚胎的发育能力。PS48处理cEFs组的iSCNT胚胎的卵裂率、4-细胞期率和8-细胞期率均显著高于对照组（46.90%±1.64% vs 13.30%±1.61%，32.30%±1.55% vs 8.26%±0.88%，10.62%±1.68% vs 5.50%±0.84%，P＜0.05）；PS48处理cAd-MSCs组的iSCNT胚胎的卵裂率和4-细胞期率显著高于对照组（49.51%±3.00% vs 31.25%±2.73%，26.21%±2.08% vs 15.18%±1.58%，P＜0.05）。（2）20 μmol/L RG108处理cEFs和cAd-MSCs 48 h对iSCNT胚胎发育效率无显著影响；400 nmol/L、500 nmol/L和600 nmol/L Scriptaid分别处理cEFs和cAd-MSCs 24 h对iSCNT胚胎发育效率无显著影响。（3）20 μmol/L RG108处理两种供体细胞来源iSCNT胚胎对其发育有显著促进作用（P＜0.05）。500 nmol/L Scriptaid处理cEFs来源的iSCNT胚胎16 h可显著提高其卵裂率和4-细胞期率（23.08%±2.94% vs 9.47%±1.70%，18.68%±3.25% vs 6.32%±1.07%，P＜0.05）。本研究建立了几种能显著提高犬体细胞核移植胚胎发育效率的新方法，有助于促进犬体细胞克隆技术的应用和发展。

关键词：供体细胞代谢表观遗传修饰犬克隆体细胞核移植 PS48 RG108 Scriptaid

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基于神经辐射场的RGB图像点云重建多肉植物及尺寸测量研究

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农业机械学报 2024年第9期55卷 316-326页

作者：尹令陈招达蓝善贵杨杰张素敏黄琼华南农业大学数学与信息学院广州510642 华南农业大学国家生猪种业工程技术研究中心广州510642 华南农业大学动物科学学院广州510642 华南农业大学猪禽种业全国重点实验室广州510640

以多肉植物盆栽为研究对象,使用手持式RGB相机采集11个多肉植物盆栽的视频数据,通过将视频转换为图像帧、选取优质清晰图像帧、计算相机位姿得到含丰富信息的RGB图像数据。提出一种改进神经辐射场的多肉植物三维重建方法,根据实际场景... 详细信息

以多肉植物盆栽为研究对象,使用手持式RGB相机采集11个多肉植物盆栽的视频数据,通过将视频转换为图像帧、选取优质清晰图像帧、计算相机位姿得到含丰富信息的RGB图像数据。提出一种改进神经辐射场的多肉植物三维重建方法,根据实际场景提出新的射线采样策略,同时引入改进的图像修复模块与隐式模型重建点云方法,并根据点云重建结果提取多肉植株的叶片数、株高、冠围、凸包体积、叶长、叶宽和叶色共7个表型参数。最后选取具有代表性、易测量的叶片数、株高、冠围、叶长和叶宽5个表型参数进行精度评估与误差原因分析,平均绝对百分比误差(MAPE)分别为2.32%、3.95%、4.95%、5.59%和9.55%,均方根误差(RMSE)分别为0.86片和1.95、17.54、1.87、1.27 mm,决定系数(R^(2))分别为0.99、0.99、0.86、0.91和0.89。精度评估结果表明,所提取的表型参数能够准确、高效地反映多肉植株生长状态,充分发挥RGB图像新视角合成技术、图像处理技术与三维点云重建技术的优势,实现多肉植株盆栽的表型参数高精度、非破坏性提取,能够为多肉植物的种植和养育以及为非固定、多视角的RGB数据获取研究提供重要的技术支持。

关键词：神经辐射场三维重建多肉植物尺寸测量植物表型 RGB图像

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面向边缘计算的轻量级母猪分娩识别模型

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农业工程学报 2024年第17期40卷 205-215页

作者：尹令蒋圣政叶诚至吴珍芳杨杰张素敏蔡更元华南农业大学数学与信息学院广州510642 华南农业大学动物科学学院广州510642 国家生猪种业工程技术研究中心广州510642 猪禽种业全国重点实验室广州510640

为实时监测母猪分娩过程并准确分析记录其完整产程的产仔数、产仔间隔和产程等信息,该研究运用知识蒸馏和剪枝,结合了ResNet50高准确率和MobileNetV3高检测效率的优势设计了一种轻量级网络。采用数据增强提高教师模型ResNet50对分娩特... 详细信息

为实时监测母猪分娩过程并准确分析记录其完整产程的产仔数、产仔间隔和产程等信息,该研究运用知识蒸馏和剪枝,结合了ResNet50高准确率和MobileNetV3高检测效率的优势设计了一种轻量级网络。采用数据增强提高教师模型ResNet50对分娩特征的提取能力,通过掩模生成蒸馏(maskedgenerativedistillation,MGD)提高学生模型MobileNetV3-S对分娩关键区域的表达能力,并通过依赖关系图(dependency graph)显式建模学生网络层间的依赖关系,结合分组耦合参数对学生模型进行剪枝。剪枝得到的MobileNetV3-S(MGD)_Prune参数量为0.74 M,在DELL OptiPlex微型机上检测速度为83.10帧/s,单栏视角测试准确度为91.48%,相比于ResNet50的检测速度提升了67.13帧/s,测试准确度下降0.98个百分点。试验结果表明,单栏视角对监测母猪分娩更为有效,模型对于产仔平均间隔的检测误差为0.31 s,仔猪出生事件的平均持续时长检测误差为0.02 s,能够高效监测母猪分娩全过程。

关键词：母猪分娩监测图像分类知识蒸馏结构剪枝

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基于目标检测仔猪乳头计数及乳房形态评估方法

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农业工程学报 2024年第3期40卷 156-164页

作者：李熙雅尹令黄文杰吴珍芳蔡更元田绪红华南农业大学数学与信息学院广州510642 华南农业大学动物科学学院广州510642 国家生猪种业工程技术研究中心广州510642 猪禽种业全国重点实验室广州510640

母猪乳头数量是生猪选育中重要参考指标之一,也是生猪繁殖表型数据的组成部分。成年母猪其腹部视频较难获取,且容易受污渍干扰,乳头自动点数实现难度较大,人工计数母猪乳头数工作量大、强度高、效率低、容易产生人为误差。鉴于猪仔从出... 详细信息

母猪乳头数量是生猪选育中重要参考指标之一,也是生猪繁殖表型数据的组成部分。成年母猪其腹部视频较难获取,且容易受污渍干扰,乳头自动点数实现难度较大,人工计数母猪乳头数工作量大、强度高、效率低、容易产生人为误差。鉴于猪仔从出生到成年乳头数量保持一致性,该研究提出了一种基于仔猪腹部视频的深度学习乳头计数及乳房形态评估方法。通过架设在仔猪初生护理平台上的相机拍摄仔猪腹部视频,根据清晰度筛选出细节清晰的帧序列图像集,经过数据预处理再使用改进Pignip-YOLOv5s目标检测网络对仔猪乳头进行自动计数。为提高计数准确率,帧序列图像集的乳头计数使用滑动窗口取众数得到最终计数结果。试验结果表明,改进的Pignip-YOLOv5s平均精度值(mean average precision, mAP)高达0.97,较YOLOv5原模型具备更高的鲁棒性。该研究方案在113段仔猪腹部视频数据集上测试得到仔猪乳头计数方法准确率达90.26%。同时该研究提出仔猪乳房形态评估参数乳头成对数、乳头间距,从而量化仔猪乳头形态表型特征,构建了母猪乳房外在形态指标,可为母猪选育和繁殖工作提供重要的参考依据。

关键词：模型深度学习视频计数 YOLOv5s 乳头计数乳房形态评估

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2022—2023年广东省猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5和Nsp2基因的遗传变异分析

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黑龙江畜牧兽医 2025年第4期 86-94,102页

作者：彭家为李康张歆明吴寿堂王爽云刘燕玲张乐宜宋长绪华南农业大学国家生猪种业工程技术研究中心/动物科学学院广州510642

为了初步了解我国广东省猪场中猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的流行特点和遗传变异情况,试验于2022年2月份——2023年10月份采集广东省11个地区(广州市、肇庆市、河源市、江门市... 详细信息

为了初步了解我国广东省猪场中猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的流行特点和遗传变异情况,试验于2022年2月份——2023年10月份采集广东省11个地区(广州市、肇庆市、河源市、江门市、茂名市、云浮市、韶关市、清远市、珠海市、湛江市、汕头市)27家猪场共241份疑似患猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)病猪的肺脏组织和血液样本并采用RT-PCR方法进行PRRSV检测,根据检测结果选取不同地区猪场的10份阳性样本病毒核酸对ORF5和Nsp2基因进行测序及序列遗传变异分析。结果表明:241份肺脏组织和血液样本的总阳性率为21.99%;不同地区阳性率在9.90%~42.86%之间,其中阳性率最高的地区为广州市,最低的地区为云浮市;肺脏组织样本阳性率为14.28%,血液样本阳性率为24.32%。从基于PRRSV ORF5基因构建的遗传进化树中可见,选取的10株PRRSV毒株中有1株(GDZH)位于以JXA1和CH-1a为代表的Lineage8.7亚群分支上,有5株(GDJM、GDKP、GDHY、GDMM、GDST)位于以NADC30为代表的Lineage1亚群分支上,有4株(GDGZ、GDGZ-2、GDZJ、GDGY)位于Lineage3亚群分支上。选取的10株PRRSV毒株ORF5基因之间的核苷酸序列相似性为80.1%~99.3%,其中GDGZ、GDZJ、GDGY和GDGZ-2的ORF5基因与Lineage3亚群毒株QYYZ(登录号为JQ308798.1)的核苷酸序列相似性最高,分别为90.2%、89.4%、93.7%、90.0%;GDJM、GDKP、GDHY、GDST和GDMM的ORF5基因与Lineage1亚群毒株NADC30(登录号为MH500776.1)的核苷酸序列相似性最高,分别为91.0%、92.2%、90.8%、85.7%、91.7%,GDZH的ORF5基因与Lineage8.7亚群高致病性毒株JXA1(登录号为EF11244.5)的核苷酸序列相似性最高,为96.2%。从基于PRRSV Nsp2基因构建的遗传进化树中可见,选取的10株PRRSV毒株中有5株(GDZH、GDGZ、GDGZ-2、GDZJ、GDGY)位于以JXA1和CH-1a为代表的Lineage8.7亚群分支上,有5株(GDJM、GDHY、GDST、GDMM、GDKP)位于以NADC30为代表的Lineage1亚群分支上。选取的10株PRRSV毒株Nsp2基因之间的核苷酸序列相似性为31.6%~96.6%。其中GDZH、GDGZ、GDGZ-2、GDZJ和GDGY的Nsp2基因与Lineage8.7亚群高致病性毒株JXA1(登录号为EF11244.5)的核苷酸序列相似性最高,分别为97.1%、98.1%、96.8%、91.3%、94.2%,GDJM、GDKP、GDST、GDMM、GDHY的Nsp2基因与Lineage1亚群毒株NADC30(登录号为MH500776.1)的核苷酸序列相似性最高,分别为67.6%、83.6%、82.2%、82.8%、80.3%。说明广东省猪场中流行的PRRSV毒株呈现多样性,Lineage3、Lineage1和Lineage8.7为主要流行的亚群。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF5基因 Nsp2基因遗传变异广东省

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特异性敲除肠道miR-146a对小鼠肠道菌群的影响

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华南农业大学学报 2023年第2期44卷 197-204页

作者：邢利鹏朱嘉豪胡芳馨陈婷罗君谊孙加节张永亮习欠云华南农业大学动物科学学院/国家生猪种业工程技术中心/广东省动物营养调控重点实验室广东广州510642

【目的】miR-146a作为抑炎因子,仍然不清楚其是否参与宿主与微生物间的互作,进而影响肠道稳态,因此本文旨在研究miR-146a对小鼠肠道菌群的影响。【方法】以肠道miR-146a特异性敲除小鼠(CKO鼠)及对照小鼠(Flox鼠)为研究对象,利用16S rRN... 详细信息

【目的】miR-146a作为抑炎因子,仍然不清楚其是否参与宿主与微生物间的互作,进而影响肠道稳态,因此本文旨在研究miR-146a对小鼠肠道菌群的影响。【方法】以肠道miR-146a特异性敲除小鼠(CKO鼠)及对照小鼠(Flox鼠)为研究对象,利用16S rRNA高通量测序法检测2组空肠段的微生物菌群分布。【结果】测序共获得1134个用于物种分类的OTUs,包括37门、80纲、161目、198科、261属、117种的细菌;Flox组和CKO组小鼠的空肠微生物中共有46个相同的OTUs;各组肠道微生物中厚壁菌门Firmicutes、拟杆菌门Bacteroidota、疣微菌门Verrucomicrobiota、变形菌门Proteobacteria和脱硫杆菌门Desulfobacterota是优势菌门;2组肠道微生物群落组成整体相似,但CKO组梭状芽孢杆菌纲Clostridia的平均相对丰度高于Flox组(P=0.067),毛螺菌目Lachnospirales平均相对丰度显著高于Flox组(P<0.05),其他层级组成无显著差异。【结论】miR-146a敲除可改变宿主肠道梭状芽孢杆菌纲和毛螺菌目微生物的含量,为研究miR-146a通过改变宿主肠道微生物丰度来影响肠道健康状况提供参考。

关键词： miR-146a 小鼠肠道特异性敲除微生物

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非编码RNAs调控猪胚胎附植和胎盘发育的研究进展

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中国畜牧杂志 2025年第1期61卷 23-29,35页

作者：黄慧君谭宝华肖丽窈杨玉铭洪林君黄思秀徐铮顾婷华南农业大学动物科学学院国家生猪种业工程技术研究中心广东广州510642

非编码RNA(Non-coding RNAs,ncRNAs)是由基因组转录形成的不编码蛋白质的一类RNA分子,根据其片段长度和结构可分为长链非编码RNA(lncRNA)、microRNA(miRNA)和环状RNA(circRNA)等,对基因的转录和翻译过程具有重要调控作用。随着高通量RN... 详细信息

非编码RNA(Non-coding RNAs,ncRNAs)是由基因组转录形成的不编码蛋白质的一类RNA分子,根据其片段长度和结构可分为长链非编码RNA(lncRNA)、microRNA(miRNA)和环状RNA(circRNA)等,对基因的转录和翻译过程具有重要调控作用。随着高通量RNA测序(RNA-seq)等技术的发展,部分与胚胎附植和胎盘发育相关的非编码RNAs的生物学功能不断被揭示。本文综述了lncRNA、miRNA和circRNA等ncRNAs在猪胚胎附植和胎盘发育过程中的研究现状,以期为应用ncRNAs提高我国母猪的繁殖性能提供重要参考。

关键词：非编码RNA 胎盘胚胎附植胎盘褶皱胎盘发育

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CD 163基因敲除猪对胸膜肺炎放线杆菌、猪链球菌和副猪嗜血杆菌的易感性研究

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畜牧兽医学报 2024年第12期55卷 5478-5488页

作者：梁国濠胡丹丹钟海文张健杨德鸿吴珍芳杨化强张献伟华南农业大学动物科学学院/国家生猪种业工程技术中心广州510642 温氏食品集团股份有限公司云浮527400

旨在探究在CD 163基因的SRCR5区域插入1个碱基的CD 163基因敲除(CD 163 gene knockout,CD 163-KO)型猪对3种关键细菌的易感性相较于野生型(wild-type,WT)猪是否会有所变化,评估CD 163-KO型猪的生物安全性。本研究选用均为50日龄、体重... 详细信息

旨在探究在CD 163基因的SRCR5区域插入1个碱基的CD 163基因敲除(CD 163 gene knockout,CD 163-KO)型猪对3种关键细菌的易感性相较于野生型(wild-type,WT)猪是否会有所变化,评估CD 163-KO型猪的生物安全性。本研究选用均为50日龄、体重与健康状况等相似的17头CD 163-KO型大白猪和17头WT型大白猪,其中2头CD 163-KO型大白猪和2头WT型大白猪作为空白对照,不做任何感染处理。试验猪只均无胸膜肺炎放线杆菌(Actinobacillus pleuropneumoniae,APP)、猪链球菌(Streptococcus suis,SS)及副猪嗜血杆菌(Haemophlius parasuis,HPS)感染史与接种史。试验猪只随机分为3组,每组均有5头CD 163-KO型猪和WT型猪,A组接种APP1型菌株、B组接种SS2型菌株、C组接种HPS13型菌株。连续观察8 d,记录猪只临床症状表现与死亡情况;试验猪只死亡后及时解剖,观察心脏、胸腔、肺部等重要部位病变情况;采集肺样并提取肺部中的细菌DNA,用于定量PCR检测并统计分析与对比CD 163-KO型与WT型死亡大白猪肺中3种细菌分别的相对DNA拷贝量。依据试验猪只临床症状表现可得,各组试验猪只均成功感染相应的细菌,且各组内的CD 163-KO型猪与WT型猪的存活率均无显著差异(P>0.05);依据死亡猪只肺部病变情况及细菌定量PCR检测结果可得,CD 163-KO型死亡猪肺与WT型死亡猪肺中APP1型、SS2型及HPS13型菌株的相对DNA拷贝量均无显著差异(P>0.05)。本研究的结果是CD 163-KO型大白猪生物安全性的有力证据,证明CD 163基因敲除后没有提高猪只对APP、SS和HPS的易感性,不会显著影响猪只抵抗细菌的能力,为CD 163-KO型猪的生物安全性评估提供强有力的支持。

关键词： CD 163 基因敲除大白猪猪繁殖与呼吸综合征病毒胸膜肺炎放线杆菌猪链球菌副猪嗜血杆菌生物安全评估

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超级增强子在骨骼肌发育过程中的研究进展

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中国畜牧杂志 2024年第8期60卷 1-6页

作者：黄慧君谭宝华肖丽窈杨玉铭洪林君黄思秀蔡更元顾婷华南农业大学动物科学学院国家生猪种业工程技术研究中心广东广州510642

超级增强子(Super Enhancers,SEs)是基因组中一类长度在8~20 kb之间、具有超强转录激活特性的顺式作用元件,SEs中富集高密度的关键转录因子(Master Transcription Factors)、转录共激活因子溴结构域蛋白4(Bromodomain Containing Protei... 详细信息

超级增强子(Super Enhancers,SEs)是基因组中一类长度在8~20 kb之间、具有超强转录激活特性的顺式作用元件,SEs中富集高密度的关键转录因子(Master Transcription Factors)、转录共激活因子溴结构域蛋白4(Bromodomain Containing Protein4,BRD4)、中介粘连蛋白(Mediator Cohesin)及H3K27ac和H3Kme1等组蛋白修饰(Histone Modification Marks)。SEs在调控肌细胞分化、骨骼肌细胞生长发育和维持肌肉细胞身份命运等方面发挥着关键作用。因此,本文总结了SEs在骨骼肌发育过程中的作用和调控机制,为深入解析SEs等顺式调控元件在调控骨骼肌发育过程中的机制及在肌肉疾病的治疗和应用等方面的作用提供理论参考。

关键词：超级增强子超级增强子RNA 骨骼肌发育转录因子肌肉疾病

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