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基于泛癌Bulk RNA-Seq探索不同五运六气气化体质人群肿瘤的生物学特征

中国中药杂志 2024年第11期49卷 3095-3112页

作者：唐心浩储博文李辰天一王映菲夏仲卉李梓墨田心语王聪颖陈琪郝帅陶维王建明吴勉华郑晓红南京中医药大学第一临床医学院江苏南京210023 江苏省老龄事业发展研究会老年康养与中医药研究专委会江苏南京210024 皖南医学院微生物与免疫教研室安徽芜湖241002 国家癌症中心分子肿瘤学国家重点实验室北京100021 江汉大学医学部药学系湖北武汉430056 南京中医药大学中医药文献研究所江苏南京210023 南京大学医学院附属金陵医院江苏南京210000 南京中医药大学附属南京中医院江苏南京210022 南京中医药大学太仓附属医院江苏太仓215400 南京中医药大学中医学院江苏南京210023

中医五运六气气化理论认为先天气化体质是决定后天疾病发病特征的关键因素。既往研究表明,五运六气气化体质(以下简称体质)特征与多种肿瘤的发生发展密切相关,基于中医五运六气气化理论的肿瘤分型可反映肿瘤人群的预后风险。五运六气气... 详细信息

中医五运六气气化理论认为先天气化体质是决定后天疾病发病特征的关键因素。既往研究表明,五运六气气化体质(以下简称体质)特征与多种肿瘤的发生发展密切相关,基于中医五运六气气化理论的肿瘤分型可反映肿瘤人群的预后风险。五运六气气化理论具有较高的应用于指导肿瘤精准医疗策略构建的潜力,然而目前尚未有学者对五运六气气化理论指导肿瘤分子分型与精准医疗策略构建进行研究。为揭示不同体质肿瘤人群的生物学特征差异,筛选适用于各体质人群的潜在抗肿瘤药物,助力构建源自中医原创思维的肿瘤中西医协同精准医疗策略。该研究从UCSC Xena获得了泛癌Bulk RNASeq数据,从英国生物库获得了GWAS队列数据,从eQ TLGen和GTEx V8获得了cis-eQTLs数据。研究基于泛癌Bulk RNASeq,利用机器学习法筛选各体质人群的特征表达基因,利用生物信息学手段探索各体质人群的生物学特征差异,利用孟德尔随机化进行药物靶点筛选,通过分子对接筛选适用于各体质人群的潜在抗肿瘤中药单体,并预测中药单体成药性。结果显示,泛癌队列中不同体质人群在无进展间隔期、生物学功能、免疫细胞丰度、肿瘤药物敏感性、免疫疗法响应程度等方面存在显著差异,提示五运六气气化理论可应用于指导肿瘤分子分型与肿瘤精准医疗策略制定。泛癌队列中不同体质人群的生物学功能特征,一定程度上诠释了五运六气气化理论等中医理论的生物学内涵,并为中医肿瘤临床治疗提供新思路。DMKN等5个特征基因被作为虚拟药物筛选受体,通过分子对接与类药性预测后筛选得到17-beta-estradiol、serotonine、trans-resveratrol、leinoleic acid等潜在抗肿瘤药物。以转录组测序为代表的组学技术将是揭示中医理论科学内涵的有力工具。在各类肿瘤人群中阐释不同体质的多组学特征,是五运六气气化理论应用于肿瘤分子分型与肿瘤精准医疗策略制定的基础。

关键词：泛癌五运六气肿瘤分子分型中西医结合药物虚拟筛选

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lncRNA JPX靶向miR-378参与丹参酮ⅡA对结肠癌SW620细胞增殖、克隆、凋亡的影响

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第三军医大学学报 2021年第9期43卷 837-844页

作者：钱峻曹宜李灵常余佳霖霍介格南京中医药大学中医学院中西医结合学院中医诊断教研室南京210001 南京中医药大学中医药文献研究所本草文献研究室南京210023 南京中医药大学附属中西医结合医院肿瘤科南京210028

目的研究lncRNA JPX靶向miR-378参与丹参酮ⅡA对结肠癌SW620细胞增殖、克隆、凋亡的影响及机制。方法结肠癌SW620细胞分成对照组、丹参酮ⅡA组(丹参酮ⅡA处理)、vector组(转染阴性对照载体)、JPX组(转染pcDNA-JPX)、丹参酮ⅡA+vector组... 详细信息

目的研究lncRNA JPX靶向miR-378参与丹参酮ⅡA对结肠癌SW620细胞增殖、克隆、凋亡的影响及机制。方法结肠癌SW620细胞分成对照组、丹参酮ⅡA组(丹参酮ⅡA处理)、vector组(转染阴性对照载体)、JPX组(转染pcDNA-JPX)、丹参酮ⅡA+vector组(转染阴性对照载体,然后给予丹参酮ⅡA处理)、丹参酮ⅡA+JPX组(转染pcDNA-JPX,然后给予丹参酮ⅡA处理)、丹参酮ⅡA+JPX+miR-NC组(共转染pcDNA-JPX、mimics control,然后给予丹参酮ⅡA处理)、丹参酮ⅡA+JPX+miR-378组(共转染pcDNA-JPX、miR-378 mimics,然后给予丹参酮ⅡA处理)、丹参酮ⅡA+Anti-NC组(转染inhibitor control,然后给予丹参酮ⅡA处理)、丹参酮ⅡA+Anti-miR-378组(转染miR-378 inhibitor,然后给予丹参酮ⅡA处理)。CCK-8检测细胞增殖,平板克隆实验检测细胞克隆形成能力,流式细胞术检测细胞凋亡。荧光素酶报告系统检测定JPX和miR-378的靶向关系。结果与对照组比较,丹参酮ⅡA组结肠癌SW620细胞存活率、克隆形成数目均降低,凋亡率升高(P<0.05)。与vector组比较,JPX组结肠癌SW620细胞存活率、克隆形成数目均升高,凋亡率降低(P<0.05)。与丹参酮ⅡA+vector组比较,丹参酮ⅡA+JPX组结肠癌SW620细胞存活率、克隆形成数目均升高,凋亡率降低(P<0.05)。与丹参酮ⅡA+Anti-NC组比较,丹参酮ⅡA+Anti-miR-378组结肠癌SW620细胞存活率、克隆形成数目均升高,凋亡率降低(P<0.05)。与丹参酮ⅡA+JPX+miR-NC组比较,丹参酮ⅡA+JPX+miR-378组结肠癌SW620细胞存活率、克隆形成数目均降低,细胞凋亡率升高(P<0.05)。JPX靶向促进miR-378表达。结论丹参酮ⅡA通过下调JPX靶向miR-378诱导结肠癌SW620细胞凋亡。

关键词：丹参酮ⅡA 结肠癌 miR-378 JPX 凋亡

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古今肺系疫病方配伍特点对比研究

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中医药信息 2018年第4期35卷 73-76页

作者：张稚鲲王若尧陈仁寿南京中医药大学图书馆文献检索教研室江苏南京210023 复旦大学信息科学与工程学院上海200433 南京中医药大学中医药文献研究所江苏南京210023

在收集整理古今肺系疫病临床文献的基础上,利用数据挖掘方法了解古今疫病组方特点,发现临床文献中的隐性信息,为现代临床诊疗提供参考。结果发现,古今肺系疫病组方用药有相似之处,如均以清热药使用最多,并常配伍解表药、化痰药、理气药... 详细信息

在收集整理古今肺系疫病临床文献的基础上,利用数据挖掘方法了解古今疫病组方特点,发现临床文献中的隐性信息,为现代临床诊疗提供参考。结果发现,古今肺系疫病组方用药有相似之处,如均以清热药使用最多,并常配伍解表药、化痰药、理气药、泻下药、活血药、止血药、补气药等。提示高热、疫毒瘀滞、痰凝气阻、血瘀血滞、迫血妄行、耗气伤阴等在肺系疫病中最为普遍,但古代方辛散之药更为多用,散邪治疫特点突出,而现代方清热药使用最多,更侧重清泻热邪。

关键词：呼吸系统疫病配伍规律古今对比

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丹参对体外培养大鼠成纤维样滑膜细胞bcl-2和bax表达的影响

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解放军医药杂志 2014年第9期26卷 13-16页

作者：任威铭张葆花吴承艳佟书娟南京中医药大学基础医学院南京210023 石家庄市中医院风湿科石家庄050051 南京中医药大学文献研究所南京210023 南京中医药大学微生物教研室南京210023

目的探讨丹参对体外培养大鼠成纤维样滑膜细胞增殖及bax、bcl-2表达的影响。方法取浓度为1.5×10-5个/ml的RSC-364成纤维样滑膜细胞悬液100μl加入细胞培养板,培养24 h,加入含不同浓度丹参的培养液,采用MTT法分析丹参对成纤维样滑... 详细信息

目的探讨丹参对体外培养大鼠成纤维样滑膜细胞增殖及bax、bcl-2表达的影响。方法取浓度为1.5×10-5个/ml的RSC-364成纤维样滑膜细胞悬液100μl加入细胞培养板,培养24 h,加入含不同浓度丹参的培养液,采用MTT法分析丹参对成纤维样滑膜细胞增殖抑制作用及其时效关系;免疫组化法检测bcl-2、bax表达情况。结果丹参可明显抑制大鼠成纤维样滑膜细胞增殖,并显示出一定的量效和时效关系。丹参可显著上调大鼠成纤维样滑膜细胞bax表达,下调bcl-2表达,与空白对照组比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论丹参对体外培养大鼠成纤维样滑膜细胞的增殖具有抑制效应,其作用机制可能与调控bax、bcl-2表达有关。

关键词：丹参成纤维细胞细胞增殖大鼠

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中医院校文检课教学现状及未来发展的思索

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教育教学论坛 2013年第12期 111-113页

作者：郝桂荣张稚鲲杜友桃南京中医药大学文献检索教研室江苏南京210046

采用访问网站结合电话咨询和E-mail咨询的方法,对国内14所中医药大学的文献检索课程进行调查分析,指出其在教学工作中存在的问题,并针对性提出合理解决办法。

关键词：中医院校文献检索课调查研究现状对策

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中医药院校大学生信息素养培养与文献检索课教学——以湖北中医药大学文献检索课教学为例

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科技信息 2013年第5期 142-143页

作者：李旺湖北中医药大学图书馆文献检索教研室湖北武汉430065

从湖北中医药大学文献检索课教学实践出发,着重探讨了信息时代下如何培养中医药人才的信息素养,并指出了中医药院校文献检索课发展现状以及亟待解决的问题。

关键词：文献检索信息素养中医药院校图书馆大学生

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中医科学性及其发展问题的再思考

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医学与哲学（A） 2012年第11期33卷 69-71页

作者：张稚鲲张宗明南京中医药大学中医药文献检索教研室江苏南京210046 南京中医药大学人文学院江苏南京210046

中医的科学属性是长期争论的焦点,目前仍无统一的认识。随着人们对"科学"的认识的不断深入,中医的科学性不应再被怀疑,目前面临的中医西化、中西医结合等问题,是挑战,也是机遇,关键是统一认识、脚踏实地,在当前环境下重视中... 详细信息

中医的科学属性是长期争论的焦点,目前仍无统一的认识。随着人们对"科学"的认识的不断深入,中医的科学性不应再被怀疑,目前面临的中医西化、中西医结合等问题,是挑战,也是机遇,关键是统一认识、脚踏实地,在当前环境下重视中医特色,解决具体问题,以抓住机遇、创造未来。

关键词：中医科学属性中西医结合中医教育

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全蝎成分抗肿瘤作用研究新进展

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医学与哲学（B） 2012年第3期33卷 49-50页

作者：李洋严令耕杜文东南京中医药大学基础医学院医药文献教研室江苏南京210046 南京中医药大学图书馆文献检索中心江苏南京210046

对近年来国内外全蝎成分抗肿瘤作用的研究文献进行分析综述,认为抗肿瘤作用机制可能与影响肿瘤细胞的粘附穿膜和降解基底膜能力、抗凝血作用、直接抑制肿瘤细胞的生长与增殖、促进细胞的凋亡等有关,深入研究全蝎成分抗肿瘤作用,有助于... 详细信息

对近年来国内外全蝎成分抗肿瘤作用的研究文献进行分析综述,认为抗肿瘤作用机制可能与影响肿瘤细胞的粘附穿膜和降解基底膜能力、抗凝血作用、直接抑制肿瘤细胞的生长与增殖、促进细胞的凋亡等有关,深入研究全蝎成分抗肿瘤作用,有助于指导其在临床中的运用。

关键词：全蝎成分抗肿瘤抗凝血临床

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文献检索实践教学模式设计与实践

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中医教育 2011年第4期30卷 37-39页

作者：田淑芹刘洋郭妍黑龙江中医药大学文献检索与利用教研室哈尔滨150040

实践教学改革一直是教师关注的重点。从文献检索实践教学改革入手,总结了本学科实践教学课程在实习形式、内容、方法以及作业交送方式上进行的改革尝试,旨在探讨利用实践教学培养大学生创新能力和科研能力的方法。实践已证明,采用此种... 详细信息

实践教学改革一直是教师关注的重点。从文献检索实践教学改革入手,总结了本学科实践教学课程在实习形式、内容、方法以及作业交送方式上进行的改革尝试,旨在探讨利用实践教学培养大学生创新能力和科研能力的方法。实践已证明,采用此种教学形式培养出来的学生在课题检索方案设计和检索操作能力上有显著提高。

关键词：文献检索实践教学模式设计

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基于现状调查探讨高等中医药院校信息素质教育

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中医教育 2010年第2期29卷 25-28页

作者：周满英上海中医药大学文献检索教研室上海201203

为适应信息化社会,高等中医药院校的学生必须具备相应的信息素质。基于对学生信息素质所做的问卷调查进行统计分析,并结合相关高等中医药院校信息素质调查文献研究,对大学生信息素质现状进行分析,并针对高等中医药院校信息素质教育的现... 详细信息

为适应信息化社会,高等中医药院校的学生必须具备相应的信息素质。基于对学生信息素质所做的问卷调查进行统计分析,并结合相关高等中医药院校信息素质调查文献研究,对大学生信息素质现状进行分析,并针对高等中医药院校信息素质教育的现状提出加强图书馆建设、开设和改革中医信息检索课、将信息素质教育与中医学科教学有机结合、提高教师和图书馆员信息素质的4点建议。

关键词：高等中医药院校信息素质教育现状调查

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