检索结果-内蒙古大学图书馆

应用数学学报 2024年第6期47卷 975-998页

作者：石仁祥胡宗海南京中医药大学数学教研室南京210023 安庆医药高等专科学校公共基础学院安庆246052

在本文中,我们研究一类带有恐惧效应时滞的捕食者-猎物系统的动力学.首先我们讨论解的正定性,有界性与持久性,其次基于中心流形定理与正规形,我们研究由恐惧效应时滞引起的Hopf分岔.进一步,我们讨论分岔周期解的全局存在性.最后给出数... 详细信息

在本文中,我们研究一类带有恐惧效应时滞的捕食者-猎物系统的动力学.首先我们讨论解的正定性,有界性与持久性,其次基于中心流形定理与正规形,我们研究由恐惧效应时滞引起的Hopf分岔.进一步,我们讨论分岔周期解的全局存在性.最后给出数值模拟以支持我们的结论.

关键词：恐惧效应时滞捕食者-猎物系统 Hopf分岔稳定性

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基于衰老视角的3种常见慢病共有机制与中药发现

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西安交通大学学报(医学版) 2025年第1期46卷 101-111页

作者：崔春利闫浩晨王敏王川孙继佳陕西中医药大学药学院陕西咸阳712046 西北大学数学学院陕西西安710127 陕西中医药大学第二附属医院心内一科陕西咸阳712000 上海中医药大学中药学院数理教研室上海201203

目的通过生物信息学分析、机器学习算法和分子对接等方法和技术探讨非酒精性脂肪肝(NAFLD)、2型糖尿病(T2DM)和动脉粥样硬化(AS)3种常见慢病和衰老基因相关的共有机制和潜在治疗药物。方法从AgingAtlas、CellAge、GenAge和MSigDB等数... 详细信息

目的通过生物信息学分析、机器学习算法和分子对接等方法和技术探讨非酒精性脂肪肝(NAFLD)、2型糖尿病(T2DM)和动脉粥样硬化(AS)3种常见慢病和衰老基因相关的共有机制和潜在治疗药物。方法从AgingAtlas、CellAge、GenAge和MSigDB等数据库中收集和整理与衰老相关的基因。将从CTD、DisGeNET、GeneCards、OMIM、PharmGKB和TTD等数据库中获得与NAFLD、T2DM、AS相关的基因和基于GEO差异基因分析得到的基因集取交集后,得到这3种常见慢性疾病的相关疾病基因集。利用clusterProfiler包对衰老基因集、3种疾病相关基因集进行KEGG通路富集分析并取交集。将筛选得到的KEGG通路上的富集基因合并后,导入STRING数据库并构建PPI网络,利用MCODE工具分析得到PPI网络中的核心子模块,计算其中每个节点、模块的重要值Nim和Cim。同时,采用Lasso回归模型、Boruta算法以及随机森林模型等3种机器学习模型进行特征基因筛选。利用HIT2.0数据库查找关键特征基因相关的靶向中药小分子。利用SwissADME和ADMETlab 3.0在线系统对小分子进行ADMET评价和分析。利用分子对接方法对关键作用靶点和筛选到的小分子进行对接。结果总共获得1 325、616、78、597个与衰老、NAFLD、T2DM、AS相关的基因。衰老和3种疾病的KEGG通路富集分析结果取交集后得到2条共有交集通路,共包含243个基因。构建PPI网络,3个核心子模块中Cluster 2的Cim值最高。根据特征基因筛选结果,结合PPI网络模块分析结果,找到4个与衰老相关的特征基因:CDK6、CDKN1A、MYC、PTEN。这4个靶点具有94个潜在中药小分子候选药物,其中,白藜芦醇(resveratrol, RSV)是这4个靶点共有的中药小分子。ADMET评价显示,其具有良好的成药性。PTEN靶点具有较高的Nim值,RSV与PTEN进行分子对接,显示有较好的结合稳定性。结论从衰老的角度来看,发现了一种潜在的中药小分子RSV,它可能通过调节关键基因PTEN来预防和治疗NAFLD、T2DM和AS这3种常见的慢性疾病。

关键词：衰老相关基因生物信息学分析老年慢性疾病机器学习算法

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基于网络药理学研究活血调脂方对糖尿病性脂肪肝糖脂代谢的作用

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中成药 2022年第6期44卷 1993-1999页

作者：周涛涛徐定昌平菁张春枚孙继佳王雨秾上海中医药大学基础医学院上海201203 上海中医药大学数学与物理教研室上海201203

目的基于网络药理学分析活血调脂方对糖尿病性脂肪肝的通路调节机制,并通过体外实验对关键通路进行验证。方法收集活血调脂方的化学成分并通过SwissADME筛选出有效成分,对有效成分进行靶点预测;从DisGeNET、DrugBank、OMIM、TTD获得... 详细信息

目的基于网络药理学分析活血调脂方对糖尿病性脂肪肝的通路调节机制,并通过体外实验对关键通路进行验证。方法收集活血调脂方的化学成分并通过SwissADME筛选出有效成分,对有效成分进行靶点预测;从DisGeNET、DrugBank、OMIM、TTD获得与糖尿病性脂肪肝有关的疾病基因;构建有效成分-靶点-疾病网络图,对靶点基因进行GO功能和KEGG富集分析,并对关键成分和靶点进行分子对接验证。基于靶点基因在通路中的分布,用活血调脂方干预HepG2细胞疾病模型进行体外验证。结果 KEGG富集得到的非酒精性脂肪性肝病、胰岛素抵抗、PPAR信号通路与疾病关系最密切。分子对接显示关键成分和靶点结合稳固。体外实验显示,与模型组比较,活血调脂方能增加细胞葡萄糖消耗(P<0.05),改善胰岛素敏感性(P<0.05),降低TG水平(P<0.05),减少脂质沉积,降低p-IRS-1、SREBP-1C、SOCS-3蛋白表达(P<0.05),升高p-Akt、p-GSK-3β、Adiponectin、PPARγ蛋白表达(P<0.05)。结论活血调脂方通过IRS-1/AKT/GSK-3β信号通路改善胰岛素信号传导,并且通过下调SREBP-1C、SOCS-3蛋白表达,上调Adiponectin、PPARγ蛋白表达调节糖脂代谢和改善胰岛素抵抗,进而达到治疗糖尿病性脂肪肝的作用。

关键词：活血调脂方糖尿病性脂肪肝网络药理学糖脂代谢胰岛素抵抗 IRS-1/AKT/GSK-3β信号通路

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公立中医医疗机构评价指标体系构建与云模型评价研究

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中华医院管理杂志 2023年第7期39卷 515-522页

作者：张安刘艺赵琨梁万年张静王岗刘跃华刘昭张帆孙继佳上海中医药大学公共健康学院上海201203 清华大学万科公共卫生与健康学院北京100084 上海中医药大学数学与物理教研室上海201203

目的实现我国公立中医医疗机构高质量发展,探讨设计具备可行性和适宜性的评价指标体系,并进行云模型评价。方法运用德尔菲法与层次分析法构建公立中医医疗机构评价指标体系及计算指标权重,然后运用云模型理论对指标体系进行综合评价。... 详细信息

目的实现我国公立中医医疗机构高质量发展,探讨设计具备可行性和适宜性的评价指标体系,并进行云模型评价。方法运用德尔菲法与层次分析法构建公立中医医疗机构评价指标体系及计算指标权重,然后运用云模型理论对指标体系进行综合评价。结果构建的中医医疗机构指标体系由含5个一级指标12个二级指标的"外部治理"模块和包含9个一级指标62个二级指标的"内部管理"模块构成。该指标体系的云模型为(4.608,1.022,0.151),云图等级在"很好"范围内。结论本研究构建的指标体系相对客观、科学、合理,在保证评价结果准确性和可信性的同时也增加了评价信息,对促进公立中医医疗机构高质量发展具有一定的指导意义。

关键词：医院公立云模型德尔菲法层次分析法

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乡村医生视角下上海市农村中医药服务发展问题的质性研究

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中国农村卫生事业管理 2025年第2期45卷 141-147页

作者：刘艺谢国群张安孙继佳张静王岗詹先林夏之晗上海中医药大学公共健康学院上海201203 上海中医药大学毕节中医药研究院上海中医药大学数学与物理教研室中国人民解放军海军特色医学中心

目的在乡村医生视角下,分析当前上海市农村中医药服务发展面临的主要问题。方法选取上海市4个社区卫生服务中心在职乡村医生(n=44)进行半结构化访谈调查,通过程序化扎根理论方法,利用开放性编码、主轴编码和选择性编码对访谈资料进行编... 详细信息

目的在乡村医生视角下,分析当前上海市农村中医药服务发展面临的主要问题。方法选取上海市4个社区卫生服务中心在职乡村医生(n=44)进行半结构化访谈调查,通过程序化扎根理论方法,利用开放性编码、主轴编码和选择性编码对访谈资料进行编码和分析。结果经开放性编码提取到初始概念99个,基本范畴15个;经主轴编码获得6个主范畴;经选择性编码形成人力资源限制、外部环境限制和内部管理限制3个核心范畴。结论乡村医生中医药服务工作发展由人力资源、外部环境限制和内部管理限制3个因素共同作用,其中,人力资源限制是限制乡村医生中医药服务工作的关键性因素,外部环境限制是限制乡村医生中医药服务工作的支持性因素,内部管理限制是限制乡村医生中医药服务工作的基础性因素。

关键词：乡村医生农村卫生服务中医药扎根理论质性研究

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黑树莓花青素联合奥沙利铂或喜树碱通过Akt信号通路协同增强结直肠癌化疗药物的治疗效果及作用机制研究

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中草药 2022年第16期53卷 5044-5051页

作者：刘月李鑫庞文倩杨哲陈丽莉张秋华李晓龙毕秀丽辽宁大学生命科学院辽宁沈阳110036 辽宁大学数学与统计学院辽宁沈阳110036 辽宁中医药大学基础药理教研室辽宁沈阳110847 深圳福山生物科技有限公司广东深圳518000

目的探究黑树莓花青素联合奥沙利铂或喜树碱在结直肠癌细胞和氧化偶氮甲烷(azoxymethane,AOM)诱导的结直肠癌模型小鼠中的协同作用。方法结直肠癌细胞系SW480和Caco-2给予黑树莓花青素、奥沙利铂或喜树碱进行干预,AOM诱导的结直肠癌模... 详细信息

目的探究黑树莓花青素联合奥沙利铂或喜树碱在结直肠癌细胞和氧化偶氮甲烷(azoxymethane,AOM)诱导的结直肠癌模型小鼠中的协同作用。方法结直肠癌细胞系SW480和Caco-2给予黑树莓花青素、奥沙利铂或喜树碱进行干预,AOM诱导的结直肠癌模型小鼠给予黑树莓花青素或奥沙利铂进行干预。采用MTT法检测黑树莓花青素联合奥沙利铂或喜树碱对结直肠癌细胞增殖的影响;采用Western blotting法检测结直肠癌细胞和小鼠肠上皮细胞中蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)信号通路相关蛋白表达;采用苏木素-伊红(HE)染色检测小鼠结肠组织病理变化。结果黑树莓花青素与奥沙利铂或喜树碱联合使用可显著抑制SW480和Caco-2细胞的增殖(P<0.05、0.01、0.001);黑树莓花青素与奥沙利铂联合使用显著改善结直肠癌模型小鼠的状态,增加小鼠体质量,减少肠道肿瘤数量(P<0.01);黑树莓花青素可能通过下调Akt信号通路相关蛋白的表达进而增强化疗药物的治疗效果(P<0.01、0.001)。结论黑树莓花青素可以协同增加奥沙利铂或喜树碱的抗肿瘤作用。

关键词：黑树莓花青素结直肠癌化疗药物协同作用 Akt信号通路

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基于通路扰动相似性建模的抗类风湿关节炎药对分子协同组合发现及机制分析

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世界科学技术-中医药现代化 2021年第6期23卷 2023-2035页

作者：孙继佳王睿瑞张磊刘保成吕爱平上海中医药大学中医健康协同创新中心上海201203 上海中医药大学数学与物理教研室上海201203 上海中医药大学中西医结合研究院上海201203 香港浸会大学中医药学院中国香港999077

目的类风湿关节炎(Rheumatoid Arthritis,RA)是一种发生在滑膜关节及其他器官系统的慢性进行性自身免疫性疾病,中医药治疗类风湿关节炎历史悠久,积累了丰富的临床应用经验,药对是中医临床遣药组方常用的配伍形式,如何从分子机制角度深... 详细信息

目的类风湿关节炎(Rheumatoid Arthritis,RA)是一种发生在滑膜关节及其他器官系统的慢性进行性自身免疫性疾病,中医药治疗类风湿关节炎历史悠久,积累了丰富的临床应用经验,药对是中医临床遣药组方常用的配伍形式,如何从分子机制角度深入探索和发现药对中的不同成分之间的协同组合机制,目前还没有较为有效的定量研究方法。方法通过GEO差异基因分析筛选RA关键基因,并整合已知RA疾病相关靶点信息,利用STRING构建RA疾病PPI网络;选取两种经典药对:独活-桑寄生、黄柏-苍术,使用TCMID、ETCM数据库收集并整理两种药对的主要化学成分,预测并识别出药对中所有成分作用的潜在RA靶点;同时,提出基于通络扰动相似性的建模方法,挖掘药对中具有协同治疗作用的中药小分子组合,并对所作用靶点集进行GO功能注释与KEGG通路富集分析。结果通过GEO差异基因分析及TTD、DrugBank数据库收集与整理,共得到555个与RA相关的靶点基因;通过靶点预测与识别,获得独活-桑寄生药对53个成分及其作用的52个潜在RA靶点,黄柏-苍术药对得到32个成分及28个靶点;利用基于通路扰动相似性的计算方法,发现了独活-桑寄生中15对、黄柏-苍术中17对具有协同性的小分子组合。结论本文提出的基于通路扰动相似性的计算方法,能够阐明有效中药成分在治疗RA中存在的通路协同组合特征,从一个全新角度揭示了中药药对配伍的内在机制和规律,为后续深入研究打下扎实的基础。

关键词：类风湿关节炎中药药对差异基因分析 PPI网络分子指纹 GO功能 KEGG通路富集

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框架表示下的压缩感知问题研究