检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2024年

作者：卢宏杰侯喜林南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室/园艺作物种质创新与利用教育部工程研究中心南京苏曼等离子工程研究院有限公司

通过对不结球白菜(Brassica campestris ssp. chinensis)GRAS基因(BcGRAS)家族成员进行全基因组的研究和鉴定，对其理化属性、保守序列、演化历程、启动子顺式作用元件以及染色体的位置进行了探讨，并利用已发表的RNA-Seq数据分析BcGRA... 详细信息

通过对不结球白菜(Brassica campestris ssp. chinensis)GRAS基因(BcGRAS)家族成员进行全基因组的研究和鉴定，对其理化属性、保守序列、演化历程、启动子顺式作用元件以及染色体的位置进行了探讨，并利用已发表的RNA-Seq数据分析BcGRAS在低温胁迫应答中的表达情况。结果表明：从不结球白菜基因组中鉴定出47个GRAS家族基因成员。系统进化树分析将不结球白菜GRAS家族基因分为8个组(LISCL， SHR， PAT1， HAM， SCR， SCL4/7， SCL3， DELLA)。对其基因结构分析发现，同一组中各成员的基因结构和蛋白功能域高度保守。除此之外，大多数成员只有少量内含子，且在10条染色体上分布不均。共线性分析显示，不结球白菜BcGRAS与拟南芥AtGRAS在进化过程中较为保守，同时两者具有较高的同源性。对启动子顺式作用元件的分析揭示，47个BcGRAS家族基因中有19个成员具有对低温的响应元件(CCGAAA)。转录组数据和qRT-PCR分析结果，BcGRAS3、BcGRAS7、BcGRAS19、BcGRAS22和BcGRAS24在受到低温胁迫后表达量显著上升，说明在不结球白菜响应低温胁迫的过程中这些基因可能起到重要作用。

关键词：不结球白菜 GRAS基因家族低温胁迫

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番茄生物钟基因SlLNK1、SlEID1和SlELF3光周期响应分析

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园艺学报 2023年第10期50卷 2079-2090页

作者：刘慧黄婷陶建平张佳琪张榕蓉宋刘霞赵统敏游雄熊爱生南京农业大学园艺学院作物遗传与种质创新利用国家重点实验室农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室南京210095 南京农业大学理学院南京210095 江苏省农业科学院蔬菜研究所南京210014

利用BLAST同源比对的方法鉴定获得番茄生物钟基因LNK1(night light-inducible and clock-regulated 1)、EID1(eia-like inhibitor of differentiation 1)和ELF3(early flowering 3)在35个物种中的直系同源基因,系统进化分析发现LNK1、EID1和ELF3起源于陆地植物。通过qRT-PCR证明三者均响应光周期和不同光照强度,光照显著诱导SlLNK1表达,抑制EID1和ELF3的表达。在2个光周期(48 h)中,番茄叶片净光合速率、胞间CO_(2)浓度、气孔导度和蒸腾速率呈节律变化。通过转录组分析3个基因的时空表达模式发现,它们在不同组织中呈现差异:SlLNK1在叶片、茎和花中高表达,SlEID1和SlELF3在根和果实中特异性表达。

关键词：番茄生物钟基因光照强度表达分析光合特性

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多裂叶水芹线粒体特征及雄性不育候选基因的鉴定

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南京农业大学学报 2024年

作者：谭国飞李梦瑶罗庆钟秀来朱顺华王堃熊爱生贵州省农业科学院园艺研究所/贵州省园艺工程技术研究中心/农业农村部喀斯特山区作物基因资源与种质创新重点实验室四川农业大学园艺学院南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室

[目的]水芹花小、花多及花发育不一致，种子难发芽，生产以根茎繁殖为主等特点，限制了水芹杂交育种的利用。[方法]以多裂叶水芹不育株系（命名为：OtBY002）及对应的可育株系（命名为：OtKY002）为材料，分别对线粒体基因组进行测序和... 详细信息

[目的]水芹花小、花多及花发育不一致，种子难发芽，生产以根茎繁殖为主等特点，限制了水芹杂交育种的利用。[方法]以多裂叶水芹不育株系（命名为：OtBY002）及对应的可育株系（命名为：OtKY002）为材料，分别对线粒体基因组进行测序和组装。[结果] OtBY002和OtKY002均含有1个大环和1个小环线粒体基因组，均含有75个基因；其中，OtBY002和OtKY002大环线粒体基因组长度分别为336 668 bp（NCBI登录号：PP693295.1）和336 731 bp（NCBI登录号：PP693297.1），二者小环线粒体基因组大小一致且长度均为48 051 bp（NCBI登录号分别为PP693296.1和PP693298.1）。进一步分析表明，ccmFN基因序列长度在OtBY002和OtKY002中具有显著差别，分别为1 050 bp和1 740 bp，其中OtBY002该基因在921 bp位置上发生突变导致其不育，以及进化上OtBY002和OtKY002的ccmFN具有一定的进化距离，不在同一分枝上。[结论]ccmFN基因序列发生突变是导致OtBY002产生不育的潜在原因，为水芹雄性不育杂交育种和理论研究提供参考。

关键词：多裂叶水芹雄性不育线粒体基因组 ccmFN

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空心与实心溧阳白芹OjG8H基因克隆及功能分析

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南方农业学报 2025年第2期56卷 622-632页

作者：张新圻朱顺华钟秀来王堃罗庆熊爱生谭国飞贵州大学农学院贵州贵阳550025 贵州省农业科学院园艺研究所/贵州园艺工程技术中心贵州贵阳550006 农业农村部喀斯特山区作物基因资源与种质创新重点实验室贵州贵阳550006 南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室江苏南京210095

【目的】克隆获得溧阳白芹组织中的编码香叶醇-8羟化酶(Geraniol 8-hydroxylase,G8H)基因OjG8H并对其功能进行初步分析,为进一步研究OjG8H基因在纤维素、木质素和类黄酮生物合成过程中的潜在功能及溧阳白芹品种改良提供参考。【方法】... 详细信息

【目的】克隆获得溧阳白芹组织中的编码香叶醇-8羟化酶(Geraniol 8-hydroxylase,G8H)基因OjG8H并对其功能进行初步分析,为进一步研究OjG8H基因在纤维素、木质素和类黄酮生物合成过程中的潜在功能及溧阳白芹品种改良提供参考。【方法】以空心溧阳白芹及其突变体实心溧阳白芹为试验材料,测定纤维素、木质素和类黄酮含量,克隆OjG8H基因并对其序列以及编码的蛋白进行生物信息学分析,运用实时荧光定量PCR检测OjG8H基因在空心与实心溧阳白芹茎、叶柄和叶中的相对表达量,分析其组织中纤维素、木质素和类黄酮含量与OjG8H基因相对表达量的相关性。【结果】空心与实心溧阳白芹茎和叶柄剖面存在明显差异;2种溧阳白芹叶中纤维素和类黄酮含量显著高于茎和叶柄(P<0.05,下同),空心溧阳白芹茎和叶柄中木质素含量显著高于叶,实心溧阳白芹叶柄中木质素含量显著高于茎和叶;2种溧阳白芹OjG8H基因全长均为1494 bp,于75和416号2个位点存在差异:75号位点,空心溧阳白芹的碱基为腺嘌呤(A),实心溧阳白芹为胸腺嘧啶(T);416号位点,空心溧阳白芹的碱基为T,实心溧阳白芹为A;空心和实心溧阳白芹OjG8H基因CDS序列均编码497个氨基酸残基,C端第25位氨基酸在空心溧阳白芹中为谷氨酰胺(Gluta‐mine,Q),实心溧阳白芹中为组氨酸(Histidine,H);第139位氨基酸在空心溧阳白芹中为缬氨酸(Valine,V),实心溧阳白芹中为天冬氨酸(Aspartic acid,D)。OjG8H蛋白为稳定的亲水性蛋白,亚细胞定位于内质网中,存在1个跨膜区;OjG8H蛋白与同属伞形科的胡萝卜的G8H亲缘关系较近;空心溧阳白芹叶柄中OjG8H基因相对表达量显著高于茎和叶,实心溧阳白芹茎和叶中OjG8H基因的相对表达水平显著高于空心溧阳白芹,在叶柄中相反;溧阳白芹OjG8H基因的相对表达量与木质素含量呈显著正相关。【结论】OjG8H基因编码的蛋白属于CYP超蛋白家族成员,具有组织特异性,该基因可能参与溧阳白芹中木质素的合成。

关键词：溧阳白芹 OjG8H 基因克隆纤维素木质素

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不同浓度EMS诱变不结球白菜的效果分析

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中国蔬菜 2024年第7期 42-49页

作者：周玉彩肖栋李英何盈侯喜林南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室园艺作物种质创新与利用教育部工程研究中心江苏南京210095 南京苏曼等离子工程研究院有限公司江苏南京211162

为创制不结球白菜新种质,发掘新基因,探索不同浓度甲基磺酸乙酯(ethyl methane sulfonate,EMS)对不结球白菜的诱变效应。采用浓度为0.4%、0.6%和0.8%的EMS溶液对4个不结球白菜品种[黑塌菜(HTC)、香青菜(XQC)、JP241、XWZ]进行种子诱变处... 详细信息

为创制不结球白菜新种质,发掘新基因,探索不同浓度甲基磺酸乙酯(ethyl methane sulfonate,EMS)对不结球白菜的诱变效应。采用浓度为0.4%、0.6%和0.8%的EMS溶液对4个不结球白菜品种[黑塌菜(HTC)、香青菜(XQC)、JP241、XWZ]进行种子诱变处理,调查种子发芽情况与田间植株农艺性状表现。结果表明:4个不结球白菜品种的种子发芽势、发芽率和相对成苗率均随着EMS浓度的升高而逐渐降低,且处理间差异显著。EMS诱变可以引起不结球白菜叶色、叶形、株型、花器官等性状发生变异。不同品种不结球白菜的EMS诱变半致死剂量有所不同,产生的变异种类和变异频率也有所不同,HTC的半致死剂量为0.8%,相对变异频率为23.83%;XQC的半致死剂量为0.8%,相对变异频率为17.61%;JP241的半致死剂量为0.6%,相对变异频率为38.45%;XWZ的半致死剂量为0.6%,相对变异频率16.69%。EMS的浓度越高,诱变的不结球白菜始花开放时间越晚,莲座叶叶片数越少,雄性不育率越高。

关键词：不结球白菜 EMS 变异频率变异类型

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胡萝卜开花抑制子基因DcFLC的克隆与表达模式

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江苏农业学报 2024年第9期40卷 1731-1738页

作者：刘珊珊段奥其谭杉杉邓元杰王广龙刘慧孙淼徐志胜熊爱生南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室江苏南京210095 淮阴工学院生命科学与食品工程学院江苏淮安223003 盐城师范学院海洋与生物工程学院江苏盐城224002

开花是植物由营养生长向生殖生长转变的重要标志。开花抑制子基因FLC是植物春化作用的关键调节基因。为了探明FLC基因在胡萝卜花发育过程中的作用,本研究以黑田五寸胡萝卜为试验材料,克隆得到胡萝卜DcFLC基因的编码序列(CDS),并利用实... 详细信息

开花是植物由营养生长向生殖生长转变的重要标志。开花抑制子基因FLC是植物春化作用的关键调节基因。为了探明FLC基因在胡萝卜花发育过程中的作用,本研究以黑田五寸胡萝卜为试验材料,克隆得到胡萝卜DcFLC基因的编码序列(CDS),并利用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)分析盛花期黑田五寸胡萝卜各组织及不同发育状态花中DcFLC基因的相对表达量。结果表明,DcFLC基因的开放阅读框(ORF)长度为660 bp,编码219个氨基酸。DcFLC的相对分子量为2.454×10^(4),理论等电点为9.15,是一个亲水性蛋白质。基于FLC编码的蛋白质氨基酸序列,胡萝卜与拟南芥、结球白菜、油菜、萝卜、杧果、白桦、可可、龙眼、葡萄、核桃等物种的遗传距离较远。盛花期胡萝卜肉质根、叶片和叶柄中DcFLC基因的表达量高于茎和花中DcFLC基因的表达量;花中开花抑制子基因DcFLC的相对表达量随着花的发育呈现先上升后下降再上升的变化趋势。本研究结果为胡萝卜FLC基因的利用和耐抽薹胡萝卜品种选育提供依据。

关键词：胡萝卜开花抑制子基因DcFLC 表达分析花发育

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大蒜类钙调蛋白基因AsCML15和AsCML42的分离及其在渗透胁迫中的功能分析

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华北农学报 2024年第4期39卷 80-86页

作者：王广龙许吴俊陈洋洋胡珍珠孙敏熊爱生淮阴工学院生命科学与食品工程学院江苏淮安223003 江苏省农业绿色低碳生产技术工程研究中心江苏淮安223003 淮阴工学院应用技术学院江苏淮安223003 南京农业大学园艺学院作物遗传与种质创新利用全国重点实验室农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室江苏南京210095

类钙调素蛋白(CMLs)是植物中的Ca 2+感受器之一,参与植物的生长发育和适应环境变化的过程。为了解大蒜CML的序列特征及其对渗透胁迫的响应,从大蒜品种苍山四六瓣中克隆得到AsCML15和AsCML42基因,并对其在干旱以及盐胁迫条件下的表达模... 详细信息

类钙调素蛋白(CMLs)是植物中的Ca 2+感受器之一,参与植物的生长发育和适应环境变化的过程。为了解大蒜CML的序列特征及其对渗透胁迫的响应,从大蒜品种苍山四六瓣中克隆得到AsCML15和AsCML42基因,并对其在干旱以及盐胁迫条件下的表达模式进行了分析。结果表明,AsCML15和AsCML42基因开放阅读框长度分别为498,543 bp,编码165,180个氨基酸残基。AsCML15和AsCML42分别含有4,3个EF-hand结构域。AsCML42与拟南芥AtCML42和AtCML43在进化关系上更为接近,而AsCML15与拟南芥AtCML15、AtCML16亲缘关系较近。荧光定量PCR结果表明,AsCML15和AsCML42在鳞茎、叶片、根都有表达,且均能被200 mmol/L NaCl和15%PEG6000所诱导。AsCML15和AsCML42基因可能参与了大蒜抵御盐胁迫和干旱胁迫的过程,可进一步鉴定其生物学功能。

关键词：大蒜类钙调蛋白基因克隆表达分析渗透胁迫

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发根农杆菌介导的芜菁高效遗传转化体系建立

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园艺学报 2025年

作者：马曦张金睿庄红梅陈巍张蜜袁晓琪易小芳王聪聪王海云王燕南京农业大学园艺学院作物遗传与种质创新利用全国重点实验室农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室新疆维吾尔自治区农业科学院果蔬研究所(国家果树种质资源轮台果树资源圃)新疆蔬菜工程技术研究中心江苏农林职业技术学院江苏现代园艺工程技术中心

芜菁（Brassica rapa var. rapa L.）存在再生困难、转化效率低等问题。以新疆柯坪白皮芜菁为试材，对外植体类型、菌液侵染浓度、侵染与共培养时间及乙酰丁香酮（AS）浓度等进行筛选，建立发根农杆菌介导的芜菁毛状根转化体系。以6 d... 详细信息

芜菁（Brassica rapa var. rapa L.）存在再生困难、转化效率低等问题。以新疆柯坪白皮芜菁为试材，对外植体类型、菌液侵染浓度、侵染与共培养时间及乙酰丁香酮（AS）浓度等进行筛选，建立发根农杆菌介导的芜菁毛状根转化体系。以6 d苗龄的芜菁无根苗为外植体，采用添加200μmol·L-1AS，菌液浓度OD600值为0.4时侵染12min，共培养36h后再转入含有400mg·L-1羧苄青霉素（Carb）的MS抑菌培养基的转化效率最高，并将可视化标记RUBY应用于转基因阳性毛状根高效筛选。基于该体系结合生长发育调节因子（DRs）成功获得稳定的阳性转基因芜菁植株，阳性转化效率可达10.61%，从种子萌发、芽再生到生根整个过程可以在3个月内完成。

关键词：芜菁发根农杆菌毛状根 RUBY 发育调节因子

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叶面施氮对芹菜叶绿素含量及代谢有关基因表达的影响

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植物生理学报 2023年第8期59卷 1533-1542页

作者：陈晨陈雪琼陈月珍冯顾城束胜王俐翔陶建平谭国飞陈姝妍刘佩卓王雅慧熊爱生南京农业大学园艺学院作物遗传与种质创新利用全国重点实验室农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室南京210095 南京市溧水区华成蔬菜专业合作社南京211200 淮安市蔬菜科学研究所江苏淮安223021 宿迁市设施园艺研究院(南京农业大学宿迁研究院) 江苏宿迁223800 贵州省农业科学院园艺研究所贵阳550006

芹菜(Apium graveolens)是我国重要的绿叶类蔬菜,营养丰富,品种多样。芹菜食用部位的叶绿素含量是衡量其品质的重要指标之一。为研究叶面喷施不同浓度氮肥对芹菜叶绿素含量及代谢相关基因表达的影响,本文以‘紫衣仙子’‘赛雪’‘四季... 详细信息

芹菜(Apium graveolens)是我国重要的绿叶类蔬菜,营养丰富,品种多样。芹菜食用部位的叶绿素含量是衡量其品质的重要指标之一。为研究叶面喷施不同浓度氮肥对芹菜叶绿素含量及代谢相关基因表达的影响,本文以‘紫衣仙子’‘赛雪’‘四季西芹’‘黄太极’‘宁芹1号’五个品种的芹菜为材料,开展不同浓度氮肥叶面喷施处理试验。通过比较分析各组芹菜植株表型差异,测定芹菜叶片中叶绿素a、叶绿素b、总叶绿素含量及叶绿素代谢相关基因表达量,发现:5、20和50 g·L^(-1)的氮肥处理分别促进了芹菜叶片中叶绿素a、总叶绿素及叶绿素b的积累,且20 g·L^(-1)氮肥处理提升了各试验芹菜品种中叶绿素含量。氮肥喷施对各品种芹菜中叶绿素含量的影响存在一定差异,‘赛雪’在20 g·L^(-1)氮肥喷施后叶绿素含量显著提高。5 g·L^(-1)氮肥可促进叶绿素代谢相关基因表达;20 g·L^(-1)氮肥喷施主要提高叶绿素合成相关基因Agglt X、Ag HEML、Ag HEMA的表达量,显著增加芹菜叶绿素含量;50 g·L^(-1)氮肥对叶绿素降解相关基因Ag HCAR、Ag PAO表达下调作用更明显,且能促进叶绿素a含量/叶绿素b含量比值提升。研究对促进芹菜叶绿素含量的最适氮肥处理浓度的结果进行了分析,并结合叶绿素代谢相关基因表达对其分子机制进行了探讨。

关键词：芹菜氮肥叶面喷施叶绿素代谢基因表达

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不结球白菜抗坏血酸相关基因BcMDHAR2功能验证

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南京农业大学学报 2021年第4期44卷 628-636页

作者：周颖李燕陶瑜王建军侯喜林李英南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室/园艺作物种质创新与利用教育部工程研究中心/园艺学院江苏南京210095

[目的]本文旨在验证单脱氢抗坏血酸还原酶(MDHAR)多基因家族中MDHAR2基因的功能,以探索其对不结球白菜抗坏血酸(AsA)含量的影响。[方法]以不结球白菜‘苏州青’cDNA为模板,扩增BcMDHAR2基因的ORF全长,利用生物信息学分析其氨基酸序列;... 详细信息

[目的]本文旨在验证单脱氢抗坏血酸还原酶(MDHAR)多基因家族中MDHAR2基因的功能,以探索其对不结球白菜抗坏血酸(AsA)含量的影响。[方法]以不结球白菜‘苏州青’cDNA为模板,扩增BcMDHAR2基因的ORF全长,利用生物信息学分析其氨基酸序列;通过亚细胞定位研究BcMDHAR2在细胞中的表达位置,采用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)检测非生物胁迫和激素处理下BcMDHAR2基因的表达量;通过病毒诱导的基因沉默(VIGS)验证该基因对抗坏血酸含量的影响。[结果]BcMDHAR2基因包含1个1308 bp的开放式阅读框(ORF),编码435个氨基酸。进化树分析表明,BcMDHAR2蛋白与芜菁的进化关系最近。亚细胞定位显示,BcMDHAR2定位于细胞核和细胞质、细胞膜上。RT-qPCR表明,低温、盐胁迫、重金属离子以及外源激素处理下,在一定时间内BcMDHAR2表达量上调,随后下调。该基因对光周期有一定的响应,随着光照时间变长,表达量上调,黑暗后,BcMDHAR2表达量下调。BcMDHAR2基因沉默后植株中AsA含量降低,AsA循环中相关基因的表达量发生了一定变化,而植株中SOD活性升高。[结论]BcMDHAR2表达量随外界条件变化而变化,响应不同的激素诱导和胁迫,在不结球白菜中该基因正调控AsA含量。

关键词：不结球白菜抗坏血酸 BcMDHAR2 非生物胁迫病毒诱导基因沉默

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