检索结果-内蒙古大学图书馆

茶树NAC转录因子基因CsNAC79和CsNAC9鉴定及其对非生物胁迫的响应

西北植物学报 2024年第4期44卷 572-581页

作者：孔洁玙杨妮罗微胡志航王雅慧庄静南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室南京210095 南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室南京210095

【目的】鉴定茶树NAC转录因子基因CsNAC79和CsNAC9,并分析它们在干旱、盐、高温、低温、外施ABA和外施GA3胁迫下的表达模式,为进一步解析CsNAC79和CsNAC9转录因子的生物学功能提供参考。【方法】以茶树‘龙井43’为材料,用RT-PCR扩增NA... 详细信息

【目的】鉴定茶树NAC转录因子基因CsNAC79和CsNAC9,并分析它们在干旱、盐、高温、低温、外施ABA和外施GA3胁迫下的表达模式,为进一步解析CsNAC79和CsNAC9转录因子的生物学功能提供参考。【方法】以茶树‘龙井43’为材料,用RT-PCR扩增NAC转录因子家族基因CsNAC79和CsNAC9,并进行生物信息学分析;用qRT-PCR检测CsNAC79和CsNAC9在茶树6种非生物胁迫下的相对表达量。【结果】(1)CsNAC79和CsNAC9分别编码409个和282个氨基酸,且分别在15—150氨基酸位点、11—134氨基酸位点含有NAC家族成员典型的NAM保守结构域。(2)CsNAC79蛋白与中华猕猴桃、柿、洋蓟亲缘关系较近,CsNAC9蛋白与桃、荔枝、榴莲亲缘关系较近;2个NAC转录因子均是亲水性蛋白,皆不含信号肽和跨膜结构;CsNAC79和CsNAC9的启动子区域都含有非生物胁迫响应元件;蛋白质空间结构分析显示,CsNAC79和CsNAC9蛋白主要是由不规则卷曲和α-螺旋组成。(3)表达分析表明:CsNAC79和CsNAC9基因在6种不同非生物胁迫下均上调表达。【结论】茶树CsNAC79和CsNAC9基因响应多种非生物胁迫。

关键词：茶树 NAC转录因子 ABA GA_(3) 非生物胁迫表达分析

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茄科植物PMI基因进化研究及辣椒CaPMI基因克隆和表达分析

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南京农业大学学报 2025年

作者：唐凯黄志楠刘同坤刘燕飞夏玲孙小川段伟科淮阴工学院生命科学与食品工程学院南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室/园艺学院

[目的]本研究旨在鉴定茄科及辣椒磷酸甘露糖异构酶（phosphomannose isomerase，PMI）基因，探究其进化过程，并系统解析辣椒CaPMI基因在非生物胁迫及激素处理下的表达调控网络，为阐明CaPMI基因功能机制及指导辣椒抗逆育种提供理论支撑... 详细信息

[目的]本研究旨在鉴定茄科及辣椒磷酸甘露糖异构酶（phosphomannose isomerase，PMI）基因，探究其进化过程，并系统解析辣椒CaPMI基因在非生物胁迫及激素处理下的表达调控网络，为阐明CaPMI基因功能机制及指导辣椒抗逆育种提供理论支撑。[方法]通过生物信息学与分子克隆技术解析PMI基因家族特征，分析转录组数据阐明茄科PMI在器官发育与果实成熟中的表达特征，利用RT-qPCR技术检测CaPMI在多重胁迫下的表达模式。[结果] PMI基因在进化过程中受到强纯化选择(Ka/Ks<1)，形成3个独立分支，不同物种发生了特异性保留。辣椒基因组中鉴定到3个CaPMI基因，茄科PMI基因启动子区中富集生长发育、逆境响应及激素调控相关元件，但数量与组合模式差异明显。茄科PMI基因具有组织表达特异性，其中CaPMI1高表达于各器官，CaPMI3特异性富集于花器官。克隆获得CaPMI1（1299 bp/432 aa）和CaPMI2（1326 bp/441 aa）基因，均为酸性蛋白（pI 4.83～4.91）。CaPMI1显著激活于低温、高温及GA3处理；CaPMI2和CaPMI3则对低温、高温、干旱、GA3和SA胁迫快速响应。[结论]本研究揭示了茄科PMI基因在进化中的保守性与功能，辣椒CaPMI基因家族通过亚功能化形成了CaPMI1、CaPMI2和CaPMI3协作互补的胁迫响应模块，增强了辣椒对复杂环境压力的适应性，为辣椒抗逆种质创制提供了基因资源与理论支撑。

关键词：辣椒磷酸甘露糖异构酶(PMI) 进化关系表达分析非生物胁迫响应

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辣椒NRT基因家族的系统鉴定、进化与表达分析

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南京农业大学学报 2024年第4期47卷 653-664页

作者：牛佳斌唐凯夏迎萌刘同坤孙小川段伟科黄志楠淮阴工学院生命科学与食品工程学院江苏淮安223003 南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室/园艺学院江苏南京210095

[目的]本研究旨在鉴定辣椒硝酸盐转运蛋白(NRT)基因家族成员,分析其基本性质、染色体定位、进化关系以及在不同组织、不同果实发育阶段和不同非生物胁迫下的表达特征。[方法]利用生物信息学方法在辣椒‘遵辣1号’基因组中鉴定NRT基因家... 详细信息

[目的]本研究旨在鉴定辣椒硝酸盐转运蛋白(NRT)基因家族成员,分析其基本性质、染色体定位、进化关系以及在不同组织、不同果实发育阶段和不同非生物胁迫下的表达特征。[方法]利用生物信息学方法在辣椒‘遵辣1号’基因组中鉴定NRT基因家族并分析其理化性质、基因结构、染色体定位、共线性、顺式作用元件分布和进化关系等;利用转录组数据分析辣椒NRT(CaNRT)基因在不同组织和不同果实发育阶段中的表达特征,并利用RT-qPCR技术分析在不同非生物胁迫下的表达模式。[结果]辣椒中共包含73个CaNRT基因,不均匀分布在10条染色体上。系统进化分析表明,CaNRT基因可分为3个亚家族,同一亚家族具有相似基因结构和保守基序。顺式作用元件分析结果表明CaNRT可能受光、激素、逆境胁迫等多种因素调控。CaNRT1亚家族成员主要在根、茎、叶中表达量较高,CaNRT2亚家族在任何时期表达量都较低,CaNRT3亚家族存在组织表达差异性,主要在根中高表达。逆境胁迫数据表明,CaNRT1.18、CaNRT3.3、CaNRT3.1、CaNRT2.1、CaNRT1.23在低温、高温、干旱、盐和氧化处理下明显响应,所有CaNRT基因在低温处理时均有不同程度的正向响应。[结论]在辣椒基因组中共鉴定获得73个CaNRT基因,筛选出多个在辣椒生长发育和逆境胁迫中具有重要作用的关键基因。

关键词：辣椒硝酸盐转运蛋白(NRT) 系统进化表达分析非生物胁迫

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胡萝卜光合特性昼夜节律及生物钟基因DcRVEa和DcRVEb响应光周期分析

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植物生理学报 2023年第11期59卷 2018-2026页

作者：张楠胡志航周建华刘慧王雅慧张雨晴王荟茹徐志胜熊爱生南京农业大学园艺学院南京210095 作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室南京210095 郑州市蔬菜研究所郑州450001

为了解胡萝卜生物钟相关基因REVEILLEs (RVEs)在昼夜节律中的分子调控机制,从胡萝卜基因组中检索获得DcRVEa和DcRVEb基因。对两个光周期不同时间点胡萝卜叶片进行光合参数测定,利用实时荧光定量PCR技术对DcRVEa和DcRVEb基因表达量进行... 详细信息

为了解胡萝卜生物钟相关基因REVEILLEs (RVEs)在昼夜节律中的分子调控机制,从胡萝卜基因组中检索获得DcRVEa和DcRVEb基因。对两个光周期不同时间点胡萝卜叶片进行光合参数测定,利用实时荧光定量PCR技术对DcRVEa和DcRVEb基因表达量进行检测与分析。结果显示:DcRVEa和DcRVEb分别含有304和307个氨基酸,均为亲水性蛋白;二级结构以α-螺旋和随机卷曲为主。胡萝卜RVE蛋白序列与其他物种同源性序列相似度为66.69%;DcRVEa与莲(Nelumbo nucifera)进化关系较近, DcRVEb与橡胶树(Hevea brasiliensis)进化关系较近。蛋白互作网络分析结果显示,胡萝卜DcRVEa和DcRVEb与LNK1、LNK2、CCA1、TOC1等生物钟核心元件具有较直接的作用。在两个光周期(48 h)中,胡萝卜叶片净光合速率(P_(n))、气孔导度(G_(s))和蒸腾速率(T_(r))在白天处于较高水平,胞间CO_(2)浓度(Ci)则相反。实时荧光定量PCR结果显示,在两个光周期(48 h)中, DcRVEa和DcRVEb的相对表达量均在黑暗条件下达到峰值。DcRVEa和DcRVEb的表达趋势相似,均响应昼夜节律的变化。本文研究结果为进一步研究胡萝卜生物钟基因DcRVEa和DcRVEb的分子机制提供参考。

关键词：胡萝卜生物钟 REVEILLE 转录因子表达分析光合特性

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代谢组学分析萝卜肉质根地上和地下部分纤维素和木质素差异

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植物生理学报 2025年第4期61卷 526-538页

作者：刘佩卓孟歌雍明丽王雅慧段奥其谭杉杉张紫悦熊爱生苏小俊南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室南京210095 江苏省农业科学院蔬菜研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室南京210014

木质素和纤维素对植物性食品的质地有重要影响,萝卜(Raphanus sativus)肉质根地上和地下部分的质地存在明显差异。本研究发现‘如皋白萝卜’肉质根地下部分木质素含量显著高于地上部分,‘竹镇青萝卜’木质素含量无明显差异,而两种萝卜... 详细信息

木质素和纤维素对植物性食品的质地有重要影响,萝卜(Raphanus sativus)肉质根地上和地下部分的质地存在明显差异。本研究发现‘如皋白萝卜’肉质根地下部分木质素含量显著高于地上部分,‘竹镇青萝卜’木质素含量无明显差异,而两种萝卜肉质根不同部分纤维素含量均无明显差异。‘如皋白萝卜’木质素合成上游莽草酸途径中预苯酸和L-苯丙氨酸在肉质根地下部分的积累显著高于地上部分,与木质素的差异积累有关。‘竹镇青萝卜’肉质根地下部分参与苯丙烷类生物合成途径的芥子醛和芥子醇含量显著高于地上部分,并有多种差异代谢物富集在苯丙氨酸代谢、组氨酸和嘌呤生物碱生物合成等氨基酸代谢途径,多种氨基酸参与糖类代谢的调控进而影响肉质根中木质素的积累。

关键词：萝卜肉质根质地木质素纤维素代谢组学

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菊花CmHB15-1基因克隆及调控木质素合成功能分析

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南京农业大学学报 2023年第3期46卷 473-481页

作者：甘好李菲蒋甲福宋爱萍丁莲陈发棣陈素梅南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部花卉生物学与种质创制重点实验室(南方)/国家林业与草原局华东地区花卉生物学重点实验室/钟山生物育种实验室/园艺学院江苏南京210095

[目的]本文旨在探究菊花CmHB15-1基因调控木质素合成的功能。[方法]通过同源克隆,以菊花‘神马’cDNA为模板克隆CmHB15-1基因,利用DNAMAN 8.0软件对其进行序列分析,构建pORE-R4-CmHB15-1-GFP载体并导入烟草叶片中进行亚细胞定位分析;利... 详细信息

[目的]本文旨在探究菊花CmHB15-1基因调控木质素合成的功能。[方法]通过同源克隆,以菊花‘神马’cDNA为模板克隆CmHB15-1基因,利用DNAMAN 8.0软件对其进行序列分析,构建pORE-R4-CmHB15-1-GFP载体并导入烟草叶片中进行亚细胞定位分析;利用酵母杂交试验分析其转录激活活性;利用RT-qPCR技术对CmHB15-1基因进行组织特异性表达分析及潜在下游基因分析,并通过遗传转化拟南芥分析其对木质素合成的影响。[结果]CmHB15-1基因的开放阅读框为2520 bp,编码839个氨基酸,预测蛋白相对分子质量为92.44×10^(3),等电点为6.46。CmHB15-1蛋白具有Homeobox、bZIP、START、MEKHLA结构域,与除虫菊TcATHB-15亲缘关系最近。亚细胞定位显示CmHB15-1蛋白定位在细胞核上,有转录激活活性。CmHB15-1基因在茎中的表达量最高,且其表达量从茎顶端向基部节间逐渐增加,在茎基部节间表达量最高。CmHB15-1转基因拟南芥植株OE-20、OE-23木质素含量比野生型分别增加了15.98%和17.99%,且转基因拟南芥植株中木质素合成相关基因苯丙氨酸解氨酶基因(PAL1)、肉桂酸-4-羟基化酶基因(C4H)、4-香豆酰辅酶A连接酶基因(4CL1)、咖啡酰辅酶A甲基转移酶基因(CCoAOMT1)、阿魏酸-5-羟基化酶基因(F5H)表达量均显著上调。[结论]CmHB15-1基因参与调控木质素生物合成。

关键词：菊花 CmHB15-1基因木质素合成

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37份菊花近缘种的抗旱性评价

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南京农业大学学报 2023年第6期46卷 1060-1068页

作者：周迎雪李沛曈苏江硕王海滨房伟民陈发棣张飞南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部花卉生物学与种质创制重点实验室(南方)/国家林业和草原局华东地区花卉生物学重点实验室/钟山生物育种实验室/园艺学院江苏南京210095

[目的]本文旨在通过测定干旱胁迫下植物形态学指标,对37份菊花近缘种的抗旱性进行综合评价,挖掘优异抗旱性菊花近缘种,为菊花抗旱新品种培育提供重要亲本材料。[方法]利用盆栽控水法对37份菊花近缘种进行干旱胁迫处理,测定其地上和地下... 详细信息

[目的]本文旨在通过测定干旱胁迫下植物形态学指标,对37份菊花近缘种的抗旱性进行综合评价,挖掘优异抗旱性菊花近缘种,为菊花抗旱新品种培育提供重要亲本材料。[方法]利用盆栽控水法对37份菊花近缘种进行干旱胁迫处理,测定其地上和地下部鲜干重、株高、根长、萎蔫指数、鲜重根冠比等9个抗旱相关性状,研究菊花近缘种对干旱胁迫的表型可塑性响应模式;结合主成成分分析,采用隶属函数法和聚类分析对不同材料的抗旱性进行综合评价并分类。[结果]干旱处理组与对照组(正常浇水)各性状存在极显著差异,9个性状干旱胁迫指数的变异系数为12.79%~72.00%,表型可塑性指数为0.37~0.90。基于抗旱性综合评价和聚类分析将供试材料分为强抗旱、抗旱、低抗旱和不抗旱4类,平均综合抗旱指数D值依次为0.80、0.54、0.42和0.26。[结论]干旱胁迫显著影响菊花近缘种的生长,从37份菊花近缘种中筛选出云台山野菊、伏牛山野菊、毛华菊和萨摩野菊4份强抗旱种质,可为菊花抗旱性遗传改良提供重要亲本材料。

关键词：菊花种质资源干旱胁迫抗旱性综合评价

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茶树捕光色素蛋白复合体基因CsLhcb2的鉴定及低温响应分析

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茶叶科学 2023年第2期43卷 183-193页

作者：胡志航秦志远李静文杨妮陈益李彤庄静南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室江苏南京210095 南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室江苏南京210095

茶树是我国重要的经济作物之一,其生长和发育过程中会遭受不同逆境影响,导致茶叶产量和品质下降。捕光色素蛋白复合体(Light-harvesting chlorophyll-protein complex)主要影响植物光合效率,在植物适应环境胁迫方面也发挥着重要作用。... 详细信息

茶树是我国重要的经济作物之一,其生长和发育过程中会遭受不同逆境影响,导致茶叶产量和品质下降。捕光色素蛋白复合体(Light-harvesting chlorophyll-protein complex)主要影响植物光合效率,在植物适应环境胁迫方面也发挥着重要作用。为研究茶树捕光色素蛋白复合体的特性,从龙井43克隆获得编码捕光色素蛋白复合体基因CsLhcb2,分析该基因编码蛋白序列特征、进化树、理化性质、亚细胞定位、二级结构、三级结构及其在4℃低温处理的表达情况。结果表明,CsLhcb2开放阅读框为798 bp,共编码265个氨基酸;该基因含有典型的Chloroa-b-bind保守结构域;与15种植物的LHCB2氨基酸序列进行多重比对,氨基酸序列的相似度达91.32%。进化树分析显示,CsLHCB2与曼陀罗、东南景天、葡萄亲缘关系较近,与麻竹和毛竹亲缘关系较远。CsLHCB2分子量为28 662.77,理论等电点为5.69,属于亲水性蛋白;亚细胞定位预测结果显示CsLHCB2主要定位在叶绿体中。荧光定量结果显示,CsLhcb2可能参与茶树低温胁迫的过程。常温处理条件下,一个光周期(24 h)内CsLhcb2的相对表达量呈现先上升,后下降趋势,龙井43和舒茶早在光照处理1 h达峰值,白叶1号在光照处理6 h达峰值;4℃低温条件下,3个茶树品种中CsLhcb2的表达均在光照处理12 h达到峰值,舒茶早中CsLhcb2表达量较高,分别为龙井43和白叶1号的1.18倍和1.98倍。研究结果为进一步研究茶树捕光色素蛋白复合体在茶树低温响应中的作用提供了参考。

关键词：茶树捕光色素蛋白复合体低温胁迫表达分析

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不结球白菜GRAS基因家族鉴定及其在低温胁迫下的表达分析

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分子植物育种 2024年

作者：卢宏杰侯喜林南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室/园艺作物种质创新与利用教育部工程研究中心南京苏曼等离子工程研究院有限公司

通过对不结球白菜(Brassica campestris ssp. chinensis)GRAS基因(BcGRAS)家族成员进行全基因组的研究和鉴定，对其理化属性、保守序列、演化历程、启动子顺式作用元件以及染色体的位置进行了探讨，并利用已发表的RNA-Seq数据分析BcGRA... 详细信息

通过对不结球白菜(Brassica campestris ssp. chinensis)GRAS基因(BcGRAS)家族成员进行全基因组的研究和鉴定，对其理化属性、保守序列、演化历程、启动子顺式作用元件以及染色体的位置进行了探讨，并利用已发表的RNA-Seq数据分析BcGRAS在低温胁迫应答中的表达情况。结果表明：从不结球白菜基因组中鉴定出47个GRAS家族基因成员。系统进化树分析将不结球白菜GRAS家族基因分为8个组(LISCL， SHR， PAT1， HAM， SCR， SCL4/7， SCL3， DELLA)。对其基因结构分析发现，同一组中各成员的基因结构和蛋白功能域高度保守。除此之外，大多数成员只有少量内含子，且在10条染色体上分布不均。共线性分析显示，不结球白菜BcGRAS与拟南芥AtGRAS在进化过程中较为保守，同时两者具有较高的同源性。对启动子顺式作用元件的分析揭示，47个BcGRAS家族基因中有19个成员具有对低温的响应元件(CCGAAA)。转录组数据和qRT-PCR分析结果，BcGRAS3、BcGRAS7、BcGRAS19、BcGRAS22和BcGRAS24在受到低温胁迫后表达量显著上升，说明在不结球白菜响应低温胁迫的过程中这些基因可能起到重要作用。

关键词：不结球白菜 GRAS基因家族低温胁迫

来源：评论

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‘滁菊’回交BC1株系的遗传变异与综合评价

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南京农业大学学报 2023年第4期46卷 658-668页

作者：李嘉伟赵立民张飞苏江硕房伟民王海滨陈素梅陈发棣管志勇南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部景观农业重点实验室/华东地区花卉生物学国家林业和草原局重点实验室江苏南京210095

[目的]本文旨在通过回交创制优质稳产的茶用菊新种质,并对获得的BC1群体进行遗传分析和评价,以筛选综合性状优良或特定性状突出的优异材料应用于进一步的育种改良。[方法]将‘苏菊14号’(‘滁菊’杂交1代)与‘滁菊’回交获得BC1株系群... 详细信息

[目的]本文旨在通过回交创制优质稳产的茶用菊新种质,并对获得的BC1群体进行遗传分析和评价,以筛选综合性状优良或特定性状突出的优异材料应用于进一步的育种改良。[方法]将‘苏菊14号’(‘滁菊’杂交1代)与‘滁菊’回交获得BC1株系群体。对102个BC1扩繁株系的12个相关产量、外观性状以及绿原酸、木犀草苷、3,5-O-双咖啡酰基奎宁酸和总黄酮4种功能性成分含量进行测定和分析,再运用灰色关联度分析法对BC1群体进行综合评价。[结果]大多数BC1群体花朵分布特征和田间适应性表现优异且遗传稳定。着花部位为偏母性遗传,花期茎枝直立程度、田间生长势、花期3个性状为偏父性遗传。12个性状的灰色关联分析权重值以田间适应性、花朵分布特征的权重值最大。利用评价结果结合聚类分析将102个回交BC1株系分为优、良、中、差4个级别。BC1群体中4种功能性成分含量均达到药用菊花规定的株系有8个,占比为7.84%,可作为茶、药兼用种质。通过综合评价,共筛选出4个优良株系,其中BC1-97的功能性成分含量水平优于‘滁菊’,其余3个株系接近‘滁菊’的功能性成分含量水平。[结论]本研究通过遗传分析、灰色关联度分析和功能性成分测定,在对‘苏菊14号’与‘滁菊’回交BC1群体综合评价的基础上,共筛选出4个优良株系,为‘滁菊’的进一步回交改良提供了中间种质和理论依据。

关键词：滁菊回交遗传分析综合评价功能性成分

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