检索结果-内蒙古大学图书馆

第二十届中国作物学会学术年会

作者：甘祥超南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室

现有的临床医学和农业领域研究表明,结构变异是大量的人类疾病和作物表型分化的遗传因素,并对基因组进化、基因表达调控具有重要影响。但是其群体遗传学研究目前还非常有限。本报告将介绍基于二代或三代测序的结构变异检测方法,探讨利...

现有的临床医学和农业领域研究表明,结构变异是大量的人类疾病和作物表型分化的遗传因素,并对基因组进化、基因表达调控具有重要影响。但是其群体遗传学研究目前还非常有限。本报告将介绍基于二代或三代测序的结构变异检测方法,探讨利用结构变异的关联分析,并展示其在水稻大群体中的初步分析结果及优势。

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基于表型性状构建传统菊花核心种质

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中国农业科学 2021年第16期54卷 3514-3526页

作者：李嘉伟苏江硕张飞房伟民管志勇陈素梅陈发棣南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室/农业农村部景观农业重点实验室

【目的】探讨构建传统菊花品种核心种质的最优取样方法并构建核心种质,以便于传统菊花种质资源的收集与保存。【方法】以《中国菊花》专著中记载的2 249份传统菊花品种为材料,依据舌状花花色分为8组,采用逐步聚类法基于4种总体取样规模... 详细信息

【目的】探讨构建传统菊花品种核心种质的最优取样方法并构建核心种质,以便于传统菊花种质资源的收集与保存。【方法】以《中国菊花》专著中记载的2 249份传统菊花品种为材料,依据舌状花花色分为8组,采用逐步聚类法基于4种总体取样规模(5%、10%、15%、20%)和4种组内取样比例方法(简单比例、对数比例、平方根比例、多样性比例)构建了传统菊花备选核心种质16个,探讨最优的取样策略。筛选出最优取样策略后进一步比较2种组内取样方法(随机和聚类)的构建效果。对最优方法下建立的核心种质代表性进行检验,利用多个特征值(最小值、最大值、均值、标准差、变异系数、Shannon-Weaver遗传多样性指数)和评价参数(均值差异百分率(MD)、方差差异百分率(VD)、极差符合率(CR)、变异系数变化率(VR)和表型保留比例(RPR))综合地评价核心种质。【结果】传统菊花按照花色进行分组,各组品种呈现正态分布,能够确保取样的均匀性;对数比例法和多样性比例法都能够使每组的取样份数更加均衡,起到良好的修正作用,对数比例法下构建的核心种质各项参数值达到最大,是最优取样比例法;随着总体取样规模的增加,遗传多样性指数呈现先增大再减小的趋势,变异系数变化率不断减小,极差符合率和表型保留比例不断增大;当取样规模大于10%时,遗传多样性指数和变异系数变化率减小,而极差符合率和表型保留比例的升幅并不大,因此,构建传统菊花核心种质最适宜的总体取样规模为10%;聚类取样构建的备选核心种质各项参数值均大于随机取样构建的对应备选核心种质的参数值,以聚类取样方法构建的核心种质变异的丰富性和均匀程度更好。核心种质各特征值与原始种质表现一致,多个评价参数值表明核心种质的均度和丰度较好,充分体现了表型的遗传多样性。通过补充聚类丢失的"追抱"1个花抱性状和对花序高度、外层瓣长2个性状的完善,最终构建得到228个传统菊花品种的核心种质,占原始材料的10.14%。【结论】本研究基于2 249份传统菊花品种材料的15个表型性状,系统地比较了多种总体取样规模、组内取样比例方法、组内取样方法构建的备选核心种质后,确定了最佳的核心种质构建方法,并对核心种质的代表性进行了分析和验证,各特征值和评价参数表明本研究构建的核心种质是有效的,核心种质充分地代表了传统菊花原始种质的遗传多样性。

关键词：传统菊花表型性状核心种质取样策略评价参数

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远缘杂交结合胚培养法获得厚皮甜瓜阿鲁斯达令双单倍体

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江苏农业学报 2022年第3期38卷 775-781页

作者：孙博文黄耀孙亚亭刘麒郑莉娜孙沛钱春桃南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室江苏南京210095 南京农业大学新农村发展研究院江苏苏州215500

旨在系统地研究通过远缘杂交结合胚培养获得甜瓜双单倍体的方法,以拓宽甜瓜双单倍体获得路径。以西印度瓜(Cucumis anguria L.)为远缘花粉供体,对厚皮甜瓜阿鲁斯达令进行授粉,并结合胚培养方法进行研究,以期获得厚皮甜瓜阿鲁斯达令的双... 详细信息

旨在系统地研究通过远缘杂交结合胚培养获得甜瓜双单倍体的方法,以拓宽甜瓜双单倍体获得路径。以西印度瓜(Cucumis anguria L.)为远缘花粉供体,对厚皮甜瓜阿鲁斯达令进行授粉,并结合胚培养方法进行研究,以期获得厚皮甜瓜阿鲁斯达令的双单倍体。结果表明,对阿鲁斯达令甜瓜进行远缘授粉后如果不作处理,子房会全部败育,而对子房表面涂抹坐果灵后坐果率可达73.33%;授粉28 d后,共采收22个远缘杂交果实,累计获得359粒种子;胚培养后获得4株再生植株,再生植株占比为1.11%;通过流式细胞仪鉴定得出,再生植株有二倍体、混倍体2种类型。对比二倍体再生植株和母本阿鲁斯达令发现,二倍体再生苗的叶、花较小,植株长势较弱,果实较圆,平均花粉活力较低。对二倍体再生植株R3、母本阿鲁斯达令自交1代(S_(1)代)群体形态学性状进行遗传变异系数比较发现,R3 S_(1)代群体各项指标的遗传变异系数均远低于母本阿鲁斯达令S_(1)代群体。利用筛选出的2对在阿鲁斯达令基因组中具有多态性的简单重复序列(SSR)引物CMATN240、CMCTN71对R3 S_(1)代群体进行基因型分析,结果表明,20株R3 S_(1)代群体均为纯合带型。通过形态学鉴定、SSR分子标记鉴定分析发现,获得的再生植株R3为双单倍体。由研究结果可知,通过远缘杂交结合胚培养获得了甜瓜再生植株,通过细胞流式仪倍性鉴定、SSR标记分析与S_(1)代群体性状遗传变异系数鉴定得出,再生植株为双单倍体。

关键词：厚皮甜瓜远缘杂交胚培养双单倍体

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几种果实表面积的三维激光扫描测定

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园艺学报 2022年第9期49卷 1998-2006页

作者：蒙小玉穆悦胡杨吴潇朱辰王慧敏陶书田张绍铃殷豪南京农业大学梨工程技术研究中心南京210095 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室南京210095 南京农业大学作物表型组学交叉研究中心江苏省现代作物生产协同创新中心现代作物生产省部共建协同创新中心南京210095

利用三维激光扫描测量臂测量果实表面积的新方法,以标准块和乒乓球为对照,精确测定了梨(Pyrus)、苹果(Malus×domestica)、橙(Citrus)、枣(Ziziphus jujuba)、番茄(Solanum lycopersicum)、香蕉(Musa nana)和葫芦(Lagenaria siceraria)7种果实的表面积。与传统公式法相比较,该方法速度快、效率高、稳定性强,适宜应用于园艺作物果实表面积的精确测量。

关键词：果实表面积三维激光扫描测量臂

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InDel分子标记WC656的开发及其在鉴别小麦-簇毛麦5VS纯合易位中的应用

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麦类作物学报 2023年第9期43卷 1115-1124页

作者：郭江涛吕远大赵姝楠周淼平姚金保杨学明江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省农业生物学重点实验室江苏南京210014 江苏省农业科学院卓越创新中心江苏南京210014 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室江苏南京210095

簇毛麦是小麦品种改良重要的遗传资源,其5VS上含有硬度基因Dina/Dinb、抗白粉病基因Pm55和抗条锈病基因Yr5V,创制普通小麦-簇毛麦5VS易位系新种质,对于高效利用5VS上的有益基因进行小麦品种遗传改良具有重要意义。为了便于鉴别普通小麦... 详细信息

簇毛麦是小麦品种改良重要的遗传资源,其5VS上含有硬度基因Dina/Dinb、抗白粉病基因Pm55和抗条锈病基因Yr5V,创制普通小麦-簇毛麦5VS易位系新种质,对于高效利用5VS上的有益基因进行小麦品种遗传改良具有重要意义。为了便于鉴别普通小麦-簇毛麦5VS纯合易位,本研究以mInDel软件分析普通小麦中国春基因组序列,开发了小麦第5同源群短臂的InDel特异分子标记WC656,对小麦品种以及普通小麦-簇毛麦5VS.5AL和5VS.5DL易位系及其衍生后代进行PCR扩增,根据扩增片段大小来区分5AS、5BS、5DS染色体臂以及5VS易位系。结果表明,在21个普通小麦品种、小麦-簇毛麦5VS回交F 2代中杂合易位单株,均扩增出379 bp(5AS)、471 bp(5BS)、422 bp(5DS)3条带。在T5VS.5AL高代品系、回交F 2代中纯合易位单株扩增出471 bp(5BS)、422 bp(5DS)2条带,379 bp(5AS)条带缺失。T5VS.5DL高代品系、回交F 2代中纯合易位单株扩增出379 bp(5AS)、471 bp(5BS)2条带,422 bp(5DS)条带缺失。WC656鉴别的5VS纯合易位结果与顺序FISH-GISH分析结果一致。T5VS.5AL、T5VS.5DL具有抗白粉病、籽粒硬度指数低等优良特性。因此,利用InDel分子标记WC656可以鉴别普通小麦-簇毛麦T5VS.5AL、T5VS.5DL衍生后代中的纯合易位,PCR扩增实验操作相对简便,可以为分子标记辅助选育携有5VS纯合易位的软质弱筋小麦提供帮助。

关键词：小麦簇毛麦 5VS纯合易位 InDel分子标记

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不结球白菜耐热相关基因BcNAC036的克隆、亚细胞定位及功能分析

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南京农业大学学报 2022年第4期45卷 647-655页

作者：刘路平刘高峰蒋程侯喜林南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室/园艺作物种质创新与利用教育部工程研究中心/南京苏曼等离子工程研究院江苏南京210095

[目的]本文旨在研究不结球白菜基因BcNAC 036的亚细胞定位及高温胁迫下的表达分析,并探索其功能及调控机制。[方法]以不结球白菜‘苏州青’为试验材料,提取叶片总RNA并且反转录成cDNA,同源克隆BcNAC 036的全长基因序列,运用在线软件工... 详细信息

[目的]本文旨在研究不结球白菜基因BcNAC 036的亚细胞定位及高温胁迫下的表达分析,并探索其功能及调控机制。[方法]以不结球白菜‘苏州青’为试验材料,提取叶片总RNA并且反转录成cDNA,同源克隆BcNAC 036的全长基因序列,运用在线软件工具对其进行生物信息学分析。采用同源重组的方法构建过表达载体pCAMBIA1302-BcNAC 036-GFP,农杆菌介导法将构建的过表达载体注射入本氏烟草叶片背面,通过激光共聚焦显微镜观察其亚细胞表达部位。采用RT-qPCR技术检测高温处理下不结球白菜耐高温品种‘苏州青’和热敏感品种‘矮脚黄’以及转基因拟南芥体内BcNAC 036基因的表达量。对转基因拟南芥进行高温处理并统计其成活率。[结果]同源克隆的方法获得BcNAC 036基因,其开放阅读框(ORF)为840 bp,编码279个氨基酸,相对分子质量为32154.83,等电点是8.96。氨基酸序列比对以及同源进化树分析结果显示,BcNAC036蛋白与芜菁、甘蓝型油菜NAC036蛋白同源关系较近。亚细胞定位结果显示,BcNAC036的亚细胞定位表达在细胞核。RT-qPCR表明,BcNAC 036在耐高温和热敏感品种中表达差异较大且表达量均呈明显下降趋势。转基因拟南芥与野生型相比,其成活率较低。[结论]BcNAC036蛋白在细胞核表达,BcNAC 036基因与不结球白菜耐高温性呈负相关。

关键词：不结球白菜 BcNAC036基因亚细胞定位耐高温过表达植株

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蜂窝型切花菊观赏性状综合评价与筛选

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园艺学报 2021年第1期48卷 107-116页

作者：李仙梅陈发棣张飞陈素梅管志勇房伟民南京农业大学园艺学院作物遗传与种质创新国家重点实验室农业农村部景观农业重点实验室南京210095

对54个大花蜂窝型切花菊株系,以株高、节间长、茎粗、茎充实度、叶长、叶宽、叶柄角度、花径、花高/花径、舌状花数和管状花数共11个观赏性状作为评价因子,利用层次分析法建立综合评价体系,并开展株系的筛选。研究确定了各性状的权重值... 详细信息

对54个大花蜂窝型切花菊株系,以株高、节间长、茎粗、茎充实度、叶长、叶宽、叶柄角度、花径、花高/花径、舌状花数和管状花数共11个观赏性状作为评价因子,利用层次分析法建立综合评价体系,并开展株系的筛选。研究确定了各性状的权重值,其中花高/花径影响最大,权重为0.241,其次是舌状花数和管状花数,权重为0.155和0.111。通过K-Means聚类分析将54个株系分为3个等级,优13个,占24.07%;良30个,占55.56%;差11个,占20.37%。通过层次分析法及K-Means聚类分析可以有效地对蜂窝型切花菊株系观赏性状进行综合评价,并选出符合育种目标的优良后代,为新品种选育提供重要材料。

关键词：菊切花菊杂种F1代层次分析法形态性状综合评价

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切花小菊品种花枝性状综合评价

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园艺学报 2021年第6期48卷 1150-1162页

作者：聂洧洁王晨赫马婉茹苏江硕张飞房伟民陈素梅陈发棣管志勇南京农业大学园艺学院作物遗传与种质创新国家重点实验室/农业农村部景观农业重点实验室南京210095

选取188个切花小菊(Chrysanthemummorifolium)商业品种,对其主茎长整齐度、主茎强度、主茎充实度、花枝角度、花枝曲直、花朵垂直分布、花朵水平聚拢程度和花枝韧性等8个与枝性相关的质量性状进行观测、分级,采用灰色关联度分析进行综... 详细信息

选取188个切花小菊(Chrysanthemummorifolium)商业品种,对其主茎长整齐度、主茎强度、主茎充实度、花枝角度、花枝曲直、花朵垂直分布、花朵水平聚拢程度和花枝韧性等8个与枝性相关的质量性状进行观测、分级,采用灰色关联度分析进行综合评价。结果表明,利用灰色关联度分析计算出的8个性状权重值中,花朵水平聚拢程度、主茎强度的权重值最大,分别为0.1524和0.1430,其次是花枝韧性和花枝曲直,权重为0.1312和0.1261,说明这4个指标对菊花品种综合评价影响较大;筛选出‘ZQ2-83’、‘Q6-12’、‘Q3-8’、‘Q1-31’和‘Q4-13’5个花枝性状优良品种,加权关联度均为0.8000以上。通过系统聚类分析将188个品种分成花枝性状优、良、中、差4个级别,分别占评价整体的9.04%、26.06%、50.00%、14.89%。

关键词：切花菊花枝性状评价质量性状灰色关联度分析聚类分析

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同源四倍体不结球白菜‘五月慢’新材料的创制及其特性

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南京农业大学学报 2022年第3期45卷 474-482页

作者：张咪宋莹王夏刘金平张昌伟李英侯喜林柳李旺刘同坤南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室/园艺学院江苏南京210095 南京市蔬菜花卉科学研究所江苏南京211155

[目的]本文旨在创制高产抗病的四倍体不结球白菜‘五月慢’新材料。[方法]利用2 g·L^(-1)秋水仙素溶液处理不结球白菜‘五月慢’二倍体幼苗子叶生长点,通过形态学、细胞学、解剖学、流式细胞仪分析等方法鉴定筛选出同源四倍体植株... 详细信息

[目的]本文旨在创制高产抗病的四倍体不结球白菜‘五月慢’新材料。[方法]利用2 g·L^(-1)秋水仙素溶液处理不结球白菜‘五月慢’二倍体幼苗子叶生长点,通过形态学、细胞学、解剖学、流式细胞仪分析等方法鉴定筛选出同源四倍体植株,并对二、四倍体植株的形态学指标、农艺性状、营养品质、光合特性、抗病能力等方面进行比较分析。[结果]与二倍体相比,四倍体植株开展度降低,叶片的长宽比明显变小,叶型扁圆形,叶柄显著增厚,种子、花器官、种荚等明显增大;叶片气孔变大,气孔密度减小;花粉粒呈现矩形、菱形等不规则形状;细胞染色体数目和DNA荧光强度为二倍体的2倍;可溶性糖、纤维素含量显著性提高,硝态氮、叶绿素含量显著减少,可溶性蛋白、有机酸含量无显著变化;光饱和点、光补偿点、暗呼吸速率分别增加了13.47%、24.02%、12.12%,光合能力更强;相同培养条件下灰霉菌表达量更低,抗病性更强。[结论]获得了具有高产、抗病潜力的同源四倍体不结球白菜‘五月慢’新材料。

关键词：不结球白菜五月慢同源四倍体光合特性抗病性

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苹果和梨远缘杂种后代的鉴定

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农业生物技术学报 2021年第2期29卷 393-401页

作者：李胜男张明月李晓龙齐开杰张绍铃薛蕾李甲明吴俊南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室

种间远源杂交是创制果树新种质的方法之一,但是如何检测真正的种间杂交种一直缺乏高效、可靠的技术手段。本研究在基因组学研究的基础上,通过苹果(Malus)和梨(Pyrus)的全基因组序列比较分析,基于两者间的插入缺失位点,设计InDel特异性... 详细信息

种间远源杂交是创制果树新种质的方法之一,但是如何检测真正的种间杂交种一直缺乏高效、可靠的技术手段。本研究在基因组学研究的基础上,通过苹果(Malus)和梨(Pyrus)的全基因组序列比较分析,基于两者间的插入缺失位点,设计InDel特异性分子标记,结合PCR检测,筛选出6对特异性高、重复性好且扩增条带清晰的特异性分子标记。其中,3对标记引物来自梨基因组,3对标记引物来自苹果基因组,可有效检测两者间差异。利用上述6对特异分子标记对3组苹果和梨属间杂交后代的311株个体进行鉴定,结果表明7株后代可同时扩增出苹果和梨特异条带,确定为属间杂交种,占总杂交后代的2.3%。其中,’红星’(Malus domestica cv.’Starking’)×’考密斯’(’Comice’)杂种后代1株;’金冠’(’Golden Delicious’)×’砀山酥梨’(’Dangshansuli’)杂种后代3株;’富士’(’Fuji’)×’考密斯’(’Comice’)杂种后代3株。开发的6对梨和苹果的属间特异性引物可应用于远缘杂种的苗期鉴定。本研究开发的利用基因组特异性分子标记对梨属和苹果属的属间杂交进行鉴定的方法,不仅为苹果和梨的属间远缘杂交提供了高效、准确的检测标记,也为其他果树的属间杂交种鉴定提供了有价值的参考。

关键词：苹果梨远缘杂交基因特异性分子标记杂交种鉴定

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