检索结果-内蒙古大学图书馆

土壤 2021年第1期53卷 72-79页

作者：张晨阳滕齐辉曹滢崔中利李顺鹏曹慧南京农业大学生命科学学院/农业农村部农业环境微生物工程重点实验室南京210095

为了解有机肥施用对于红壤中反硝化细菌群落结构的影响,设置了4个处理:CK(不施肥)、LM(低量有机肥)、ML(高量有机肥+石灰)和HM(高量有机肥)进行研究,并通过末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)和克隆文库的DNA测序估计了nirK基因的多样性... 详细信息

为了解有机肥施用对于红壤中反硝化细菌群落结构的影响,设置了4个处理:CK(不施肥)、LM(低量有机肥)、ML(高量有机肥+石灰)和HM(高量有机肥)进行研究,并通过末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)和克隆文库的DNA测序估计了nirK基因的多样性。结果表明:各处理分别挑选的288个阳性克隆子可分为78个类型,各处理nirK文库中的优势类群属于同一种类型,在CK处理中的占比为51%,在其他3个处理中的占比依次为33%、32%和27%。4个文库之间两两的相似性在37.50%~45.34%,系统进化树分析表明,51个OTUs测序结果中6个OTUs与苍白杆菌属的相似性最高,占测序总数的11.8%;其余45个OTUs属于未培养类型,占测序总数的88.2%。有机肥添加有助于提高nirK基因的多样性,并且出现了红壤原始环境中未出现的反硝化细菌类型。

关键词：反硝化细菌 nirK基因 RFLP分析红壤有机肥施加

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哈尼梯田稻鲤共作与单养模式下福瑞鲤肠道菌群结构比较研究

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微生物学报 2022年第4期62卷 1473-1484页

作者：聂志娟徐钢春邵乃麟王保战高建操徐跑何健南京农业大学生命科学学院农业农村部农业环境微生物工程重点开放实验室江苏南京210095 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214128

【目的】分析不同养殖模式的福瑞鲤肠道菌群结构组成和群落特征。【方法】通过16S rRNA高通量测序技术,分析比较哈尼梯田稻鲤共作、传统池单养、水泥池单养模式下的福瑞鲤肠道菌群的结构组成和丰度差异。【结果】梯田稻鲤组(RCIC)、传... 详细信息

【目的】分析不同养殖模式的福瑞鲤肠道菌群结构组成和群落特征。【方法】通过16S rRNA高通量测序技术,分析比较哈尼梯田稻鲤共作、传统池单养、水泥池单养模式下的福瑞鲤肠道菌群的结构组成和丰度差异。【结果】梯田稻鲤组(RCIC)、传统池鲤组(YPIC)和水泥池鲤组(HPIC)分别获得了2345、238和118个OTU。RCIC组的Sobs指数及PD指数最高,显著高于YPIC组(P<0.05),极其显著高于HPIC组(P<0.01);池塘单养模式下,两组之间多样性指数也存在显著差异,YPIC组大于HPIC组(P<0.05)。含量大于10%优势菌门:RCIC组主要为变形菌门(39.39%)、梭杆菌门(38.55%)和厚壁菌门(15.4%);YPIC组为变形菌门(21.87%)、梭杆菌门(58.27%);HPIC组为变形菌门(46.63%)、梭杆菌门(53.14%)。变形菌和梭杆菌为3组福瑞鲤肠道样品的优势菌群,其中的鲸杆菌属(Cetobacterium)、气单胞菌属(Aeromonas)为核心优势菌属。LEfSe线性判别分析(LDA>3)显示17个具有差异的标记菌属,其中Romboutsia、Clostridium_sensu_stricto_1、Enterobacter、Paraclostridium、Methylobacterium、norank_f__norank_o__Chloroplast、Edwardsiella、Epulopiscium为RCIC组具有的差异标记菌属。【结论】不同养殖模式的福瑞鲤既有固有菌群,也塑造差异显著的肠道菌群组成结构。稻梯田鲤肠道菌群丰富度和多样性显著增加,且具有更多的有益差异标记菌属,获得更健康的肠道菌群群落特征。

关键词：哈尼梯田稻-鲤综合种养菌群结构肠道高通量测序

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赭曲霉毒素A降解菌株的筛选及脱毒酰胺水解酶的基因克隆和表达

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微生物学通报 2023年第7期50卷 2837-2847页

作者：刘斌全思语张豪宋卓琳黄明珠何健陈雪岚江西师范大学生命科学学院江西南昌330022 江西师范大学国家淡水鱼加工技术研发专业中心江西南昌330022 南京农业大学生命科学学院农业农村部农业环境微生物工程重点开放实验室江苏南京210095

【背景】赭曲霉毒素A (ochratoxin A, OTA)是一种可以致癌的真菌毒素,其污染严重影响食品安全,危害人类健康。生物降解法去除OTA污染是近些年的研究热点,发掘高效的OTA降解脱毒酶资源具有重要的意义。【目的】筛选高效的OTA降解菌株并... 详细信息

【背景】赭曲霉毒素A (ochratoxin A, OTA)是一种可以致癌的真菌毒素,其污染严重影响食品安全,危害人类健康。生物降解法去除OTA污染是近些年的研究热点,发掘高效的OTA降解脱毒酶资源具有重要的意义。【目的】筛选高效的OTA降解菌株并从中克隆降解基因,为生物脱毒方法的开发提供基因和酶资源。【方法】利用OTA为唯一碳源的筛选培养基从土壤中筛选纯化OTA降解菌株,通过16SrRNA基因序列分析确定其分类地位,利用高效液相色谱(high performanceliquidchromatography,HPLC)分析其降解产物。通过同源序列比对的方法克隆降解基因并与载体pET-29a(+)相连,然后在大肠杆菌BL21(DE3)中表达。利用Ni2+亲和层析对表达产物进行纯化,研究其对OTA的降解活性和酶学特征。【结果】筛选到一株高效的OTA降解菌株,在12h内能够完全降解1μg/mL的OTA;初步鉴定该菌株属于Niastella,编号为JX-6;菌株JX-6通过酰胺键断裂途径降解OTA生成无毒的OTα;从菌株JX-6中鉴定了一个OTA酰胺水解酶,命名为NcOTase;NcOTase与已报道的OTA酰胺水解酶序列相似性较低,仅为31%–53%;纯化的NcOTase具有OTA水解活性,比酶活为60.3U/mg,活性显著高于大部分已报道的OTA降解酶。【结论】NcOTase是一个高效的OTA降解脱毒酶,在去除食品和饲料中OTA污染方面具有很好的应用前景。

关键词：真菌毒素赭曲霉毒素A 生物降解酰胺水解酶酶活性

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水稻田常用除草剂的微生物降解研究进展

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应用与环境生物学报 2021年第6期27卷 1694-1705页

作者：唐露龙中儿曹敏何健陈青黄运红倪海燕江西师范大学生命科学学院南昌330022 南京农业大学生命科学学院农业部农业环境微生物生物工程重点实验室南京210095 枣庄学院生命科学学院枣庄277100

水稻是中国乃至世界最重要的粮食作物之一,除草剂是保障水稻产量的一个重要因素.然而除草剂的长期大量使用带来了严重的环境残留问题,致使除草剂成为一类环境污染物,威胁到水稻与生态环境的安全和人类健康.微生物降解代谢是消除环境残... 详细信息

水稻是中国乃至世界最重要的粮食作物之一,除草剂是保障水稻产量的一个重要因素.然而除草剂的长期大量使用带来了严重的环境残留问题,致使除草剂成为一类环境污染物,威胁到水稻与生态环境的安全和人类健康.微生物降解代谢是消除环境残留除草剂最有力的方式.围绕水稻田中常用的10种除草剂(二氯喹啉酸、乙草胺、丁草胺、苄嘧磺隆、吡嘧磺隆、氯嘧磺隆、五氟磺草胺、氰氟草酯、草甘膦、二甲四氯)的微生物降解展开综述,总结分离到的各种除草剂的高效降解菌株、归纳除草剂的降解代谢途径以及克隆到的降解关键酶基因.现阶段水稻田常用的这10种除草剂降解研究更多集中于降解纯品系菌株的筛选,并根据分析化学方法鉴定的中间代谢产物结构进行代谢途径的分析,以及基于代谢途径的研究克隆到部分参与降解过程的关键酶基因.但是目前分离到的除草剂高效降解菌株不多,尤其是五氟磺草胺的降解菌株更是鲜见报道,此外代谢途径的研究往往停滞于降解过程的前几步,多数除草剂的完整代谢通路以及参与其中的基因和酶还未得到阐明.建议未来充分利用生物信息学技术挖掘高效的降解菌株和降解基因新资源,为解决除草剂稻田环境污染问题提供优良资源和理论基础.

关键词：水稻田除草剂微生物降解降解资源

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3D生物打印技术在微生物修复中的应用（英文）

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生物工程学报 2021年第10期37卷 3475-3486页

作者：柯壮 Osagie Obamwonyi Boris Kolvenbach 季荣刘双江蒋建东 Philippe F.-X.Corvini 南京农业大学生命科学学院农业部农业环境微生物重点实验室 Institute for Ecopreneurship University of Applied Sciences and Arts Northwestern Switzerland (FHNW)School of Life Sciences 南京大学环境学院污染控制与资源化利用国家重点实验室中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室

排放到环境中的各种农药、多环芳烃、卤代芳烃等有机污染物以及阻燃剂等新兴污染物,对环境污染、农产品质量和环境安全造成了沉重负担。因此,有效去除环境中的有机污染物已成为迫在眉睫的挑战。3D生物打印技术已经在医学材料、制药等行... 详细信息

排放到环境中的各种农药、多环芳烃、卤代芳烃等有机污染物以及阻燃剂等新兴污染物,对环境污染、农产品质量和环境安全造成了沉重负担。因此,有效去除环境中的有机污染物已成为迫在眉睫的挑战。3D生物打印技术已经在医学材料、制药等行业中发挥着重要作用。现在,越来越多的微生物被确定适合通过3D生物打印生产具有复杂结构和功能的生物材料。微生物的3D生物打印越来越受到环境微生物学家和生物技术专家的关注。本文综述了用于污染物微生物去除的不同3D生物打印技术的原理和优缺点,及用于微生物生物修复技术的可行性,并指出了可能遇到的限制和挑战。

关键词：有机污染物微生物修复技术 3D生物打印技术多细胞3D生物打印

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不同固体微生物菌剂对砒砂岩土壤性质和紫花苜蓿生长的影响

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农业工程学报 2020年第8期36卷 96-102页

作者：王涛杨怡钧邓琳何琳燕许铭纹杨才千梁止水东南大学土木工程学院南京211189 农业部农业环境微生物重点实验室南京农业大学生命科学学院南京210095

为研制改良砒砂岩土壤、强化植物生长的微生物菌剂,该研究以嗜盐芽孢杆菌Bacillus halotolerans P75、苜蓿中华根瘤菌Sinorhizobium meliloti D10、巨大芽孢杆菌Bacillus megaterium H3和枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis HB01为原料,利... 详细信息

为研制改良砒砂岩土壤、强化植物生长的微生物菌剂,该研究以嗜盐芽孢杆菌Bacillus halotolerans P75、苜蓿中华根瘤菌Sinorhizobium meliloti D10、巨大芽孢杆菌Bacillus megaterium H3和枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis HB01为原料,利用生物基材吸附混合,制备4种单一固体微生物菌剂和多种复合固体微生物菌剂。通过分析pH值、有机质含量、有效氮磷钾含量、酶活性和细菌数量等指标来研究添加微生物菌剂对砒砂岩土壤性质和紫花苜蓿幼苗生长的影响。结果表明,与不添加微生物菌剂的对照组相比,微生物菌剂能够使砒砂岩土壤pH值降到中性附近,促使土壤有机质、碱解氮、速效磷、速效钾含量显著增加,提高了土壤蔗糖酶和脲酶活性,增加了土壤细菌数量,同时促进了紫花苜蓿幼苗生长,其中以含菌株P75、D10和H3以及含菌株P75、D10、H3和HB01的复合菌剂的效果最佳。该试验研究可以为微生物菌剂在砒砂岩区土壤改良和植被恢复方面的应用提供试验基础和参考。

关键词：土壤微生物育苗砒砂岩微生物菌剂土壤改良

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定向进化提高磺酰脲类除草剂脱毒酯酶SulE的活性

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应用与环境生物学报 2020年第5期26卷 1075-1080页

作者：刘斌杨洲刘军委陈乐彭乾何健南京农业大学生命科学学院农业部农业环境微生物工程重点开放实验室南京210095

磺酰脲除草剂脱毒酯酶SulE对噻磺隆活性极高,但对其他磺酰脲类除草剂活性很低,这限制了在磺酰脲除草剂残留污染生物修复和抗磺酰脲除草剂作物培育中的应用价值.利用Escherichiacoli DH10B (ilvG+)对甲磺隆的敏感性为筛选标记,从sulE基... 详细信息

磺酰脲除草剂脱毒酯酶SulE对噻磺隆活性极高,但对其他磺酰脲类除草剂活性很低,这限制了在磺酰脲除草剂残留污染生物修复和抗磺酰脲除草剂作物培育中的应用价值.利用Escherichiacoli DH10B (ilvG+)对甲磺隆的敏感性为筛选标记,从sulE基因随机突变库中筛选获得了一个酶活性显著提高的突变体mSulE.与野生型相比,突变体mSulE对甲磺隆、甲嘧磺隆、苯磺隆和胺苯磺隆的比酶活分别提高了8.29、8.61、1.50和4.04倍.测序结果表明,突变体mSulE氨基酸序列发生了2处替换,分别为Y81T和S178N.三维结构模拟表明,2个突变位点都在酶活性中心附近,突变体mSulE酶活提高的原因可能是Y81突变为T增加了催化口袋的面积,以及S178突变为N增加了氨基酸残基之间的氢键作用力.综上所述,突变体mSulE对大部分磺酰脲除草剂的活性要高于野生型,在磺酰脲除草剂残留污染生物修复和抗除草剂转基因工程中具有很好的应用前景.(图6表1参30)

关键词：磺酰脲类除草剂酯酶SulE 定向进化酶活性同源建模

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微生物菌剂对砒砂岩土壤的改良作用

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中国环境科学 2020年第2期40卷 764-770页

作者：王涛邓琳何琳燕杨才千梁止水东南大学土木工程学院江苏南京211189 南京农业大学生命科学学院农业部农业环境微生物重点实验室江苏南京210095

为了研究微生物菌剂改良砒砂岩土壤特性的效果,以植物促生细菌Bacillus halotolerans P75、Sinorhizobium meliloti D10、Bacillus megaterium H3和Bacillus subtilis HB01为原料制备4种液体单一菌剂和1种复合菌剂CB,分别按5%(体积质量比)接种到砒砂岩土壤中,种植紫花苜蓿和柠条,进行盆栽试验.通过分析植物生物量、土壤pH值、有机质、氮磷钾含量、酶活性和水稳性团聚体等指标来评价微生物菌剂对砒砂岩土壤的改良效果.结果表明,与不接菌的对照组相比,接菌处理能使紫花苜蓿显著增产18.6%~45.6%、柠条显著增产24.1%~46.7%,降低土壤pH值,促使土壤中的有机质、铵态氮、硝酸盐氮、速效磷、速效钾含量不同程度的增加,提高了土壤团聚体的水稳性,且接种复合菌对砒砂岩土壤的改善效果要优于单一菌株的效果.接种供试菌株能够改善砒砂岩的土壤质量,同时促进植物生长,其中复合菌对砒砂岩土壤的改良效果更为突出.

关键词：微生物菌剂砒砂岩土壤特性改良

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腐殖酸和植物促生芽孢杆菌对黑麦草抗逆性及砒砂岩土壤性状的影响

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水土保持通报 2021年第2期41卷 208-214,266页

作者：曾仟徐雪婷张亚见邓琳何琳燕农业农村部农业环境微生物重点实验室南京农业大学生命科学学院江苏南京210095 东南大学土木工程学院江苏南京211189

[目的]探究微生物在砒砂岩土壤修复工程中的作用,为微生物强化植物改良砒砂岩土壤的科学设想提供新思路。[方法]以黑麦草作为供试作物,通过室内盆栽模拟试验的方法,研究接种植物促生芽孢杆菌Bacillus halotolerans P75,施用腐殖酸肥料... 详细信息

[目的]探究微生物在砒砂岩土壤修复工程中的作用,为微生物强化植物改良砒砂岩土壤的科学设想提供新思路。[方法]以黑麦草作为供试作物,通过室内盆栽模拟试验的方法,研究接种植物促生芽孢杆菌Bacillus halotolerans P75,施用腐殖酸肥料以及不同的菌肥搭配对水土流失严重的砒砂岩土壤理化性质及黑麦草生长和抗逆性指标的影响。[结果]与对照相比,Bacillus hallotolerans P75发酵液与腐殖酸协同处理显著提高了黑麦草叶片中SOD活性(229.7%)、POD活性(83.6%)和脯氨酸含量(119.3%),显著增加砒砂岩土壤中多糖、有机质、速效磷和速效钾含量,且土壤渗水率明显降低。[结论]植物促生芽孢杆菌Bacillus hallotolerans P75发酵液与腐殖酸肥料协同作用能够显著改善砒砂岩土壤的水分、养分流失问题,提高黑麦草的抗逆性,强化植物对砒砂岩土壤的改良和修复。

关键词：黑麦草植物促生芽孢杆菌腐殖酸砒砂岩土壤改良

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Bacillus thuringiensis P34与海泡石联合阻控蔬菜积累铅和改良土壤的作用

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农业环境科学学报 2019年第6期38卷 1240-1247页

作者：贺卓殷涂童葛占标盛下放何琳燕农业部农业环境微生物重点实验室南京农业大学生命科学学院

本研究为建立微生物-吸附剂联合钝化修复技术,以期为重金属污染农田的修复和蔬菜安全生产提供试验依据。在南京市栖霞区某矿区周边农田开展田间试验,探究了Bacillus thuringiensis P34及海泡石(S)对辣椒(苏椒五号)和茄子(苏琦一号)的生... 详细信息

本研究为建立微生物-吸附剂联合钝化修复技术,以期为重金属污染农田的修复和蔬菜安全生产提供试验依据。在南京市栖霞区某矿区周边农田开展田间试验,探究了Bacillus thuringiensis P34及海泡石(S)对辣椒(苏椒五号)和茄子(苏琦一号)的生长、Pb积累和营养品质的影响,评估复配处理(P34+S)改良蔬菜根际土壤理化性质的作用。结果表明,与对照相比,海泡石可显著降低蔬菜果实Pb含量,菌株P34和海泡石复配可进一步显著降低辣椒和茄子果实Pb含量(58%和26%)。与对照相比,复配处理可显著使辣椒果实生物量增加1.5倍,改善蔬菜的营养品质,还能提高根际土壤pH、芽孢细菌数量、蔗糖酶和脲酶活性,显著降低根际土壤DTPA提取态Pb含量,并显著增加>1 mm团聚体的比例、显著减少<0.25 mm团聚体的比例。将B. thuringiensis P34与海泡石联合施用于Pb污染土壤,可显著阻控茄果类蔬菜积累Pb并提高其营养品质,显著改善根际土壤的理化性质,具有修复Pb污染土壤、保障蔬菜安全生产的潜力。

关键词：芽孢杆菌海泡石复配菌剂蔬菜铅田间试验

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