检索结果-内蒙古大学图书馆

微生物学报 2024年第2期64卷 473-488页

作者：胡紫萌陈伟叶陈欣仪李培李敏周璐杜鸿刘玉庆张炜谈忠鸣南京农业大学动物医学院农业部动物细菌学重点实验室江苏南京210095 南京农业大学三亚研究所海南三亚572024 江苏省疾病预防控制中心急性传染病防制所江苏南京210009 苏州大学第二附属医院临床检验科江苏苏州215004 山东省农业科学院畜牧兽医研究所山东济南250100

【目的】铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)是一种重要的革兰氏阴性病原体,可以加重囊性纤维化患者的肺部感染,最终会导致患者的死亡。然而由于多重耐药(multi-drug resistant,MDR)和泛耐药(pan-drug resistant,PDR)铜绿假单胞菌菌... 详细信息

【目的】铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)是一种重要的革兰氏阴性病原体,可以加重囊性纤维化患者的肺部感染,最终会导致患者的死亡。然而由于多重耐药(multi-drug resistant,MDR)和泛耐药(pan-drug resistant,PDR)铜绿假单胞菌菌株的出现,使其防控变得更为严峻。【方法】从养殖场污水中分离能有效裂解多重耐药铜绿假单胞菌的噬菌体,研究其形态特征、生物学特性、宿主谱范围、基因组特征和体外抑菌能力等,并采用噬菌体和抗生素联用的方法进行生物被膜的抑制试验。【结果】透射电子显微镜的形态分析和基因组分析结合表明,该噬菌体属于Nankokuvirus病毒属。生物学特性试验表明,PH826具有广泛的温度稳定性(4-60℃)和pH稳定性(3.0-11.0)。宿主谱测试显示,PH826可以裂解13株铜绿假单胞菌(包括人源和动物源),体外抑菌试验显示,PH826在感染复数(multiplicity of infection,MOI)分别为10、1、0.1时对铜绿假单胞菌均有强烈的裂解作用。根据基因组分析,PH826噬菌体的基因组大小为87956 bp,G+C含量为54.70%,编码165个开放阅读框(open reading frames,ORFs),并预测携带有裂解酶。值得注意的是,在24 h和48 h内,PH826和环丙沙星联用在1×、2×、4×最小抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)的条件下都减少了80%以上的生物被膜的形成;PH826和美罗培南联用在24h和48h内,在2×MIC和4×MIC的条件下也减少了80%以上的生物被膜的形成。【结论】PH826可能是一种潜在的消毒剂和治疗剂,可以单独使用或与抗生素联合使用,用于预防和治疗致病性铜绿假单胞菌。

关键词：噬菌体铜绿假单胞菌生物被膜多重耐药性抗生素

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携带89K样毒力岛的猪链球菌ST665型与ST107型临床菌株的基因组及致病分析

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疾病监测 2024年第5期39卷 622-628页

作者：康娓铭王鸣柳王建平张西燕吴宗福郑翰中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206 广西壮族自治区疾病预防控制中心广西南宁530028 南京农业大学动物医学院农业部动物细菌学重点实验室江苏南京210095

目的明确89K样毒力岛(PAI)的基因组特征及其在猪链球菌致病及耐药传播方面的作用。方法通过生物信息学方法分析89K样PAIs的基因组特征;通过接合实验比较两种89K样PAIs的转移能力;采用最小抑菌浓度法测定临床分离株及接合子的耐药谱;通过... 详细信息

目的明确89K样毒力岛(PAI)的基因组特征及其在猪链球菌致病及耐药传播方面的作用。方法通过生物信息学方法分析89K样PAIs的基因组特征;通过接合实验比较两种89K样PAIs的转移能力;采用最小抑菌浓度法测定临床分离株及接合子的耐药谱;通过C57BL/6小鼠和斑马鱼感染模型分别评估两个临床菌株及其89K样PAIs的接合子的致病性。结果携带89K样PAIs的猪链球菌临床菌株GX54和GX82的序列型(ST)分别为ST665和ST107。菌株GX54携带的PAI大小为75Kb,在核苷酸水平上与ST7流行型菌株携带的89K PAI具有99.21%的相似性和79.00%的覆盖率,而菌株GX82携带的PAI大小为87Kb,与89K PAI具有98.80%的相似性和86.00%的覆盖率。这两个PAIs的插入位点与89K PAI相同,均位于rplL位点,且PAIs的两端均含有一段15 bp的att序列(5’-TTATTTAAGAGTAAC-3’)。此外,这两个PAIs均具有完整的模块化结构,包含完整的NisK-NisR样双组分信号转导系统和IV型分泌系统(T4SS)。而在SalR-SalK样双组分信号转导系统中,仅SalR基因保持完整,SalK基因发生错义突变。与89K PAI相比,本研究中的两个PAIs在基因组成上呈现出一定的差异。75K PAI插入了4个基因,包括两个假定蛋白基因和两个耐药基因tet(O)和erm(B)。而87K PAI则插入了12个基因,主要涉及编码与质粒相关的重组酶和假基因,以及与耐药相关的cat、tet(L)、erm(B)基因。此外,还包括编码转座酶、拓扑异构酶等基因。菌株GX54携带的75K PAI的转移频率为4.61×10−5,显著高于菌株GX82携带的87K PAI的转移频率8.46×10^(−6)。与受体菌P1/7RIF相比,两个89K样PAIs的接合子P1/7RIF-GX54与P1/7RIF-GX82的四环素类和大环内酯类抗生素的抗性水平,以及对斑马鱼的致病力均显著增加,且两接合子组间的致病力差异无统计学意义(P>0.05)。菌株GX54和菌株GX82感染C57BL/6小鼠后,菌株GX54感染组小鼠死亡率显著高于菌株GX82感染组(P<0.05)。攻毒8 h后,两感染组小鼠的外周血细菌载量无统计学意义(P>0.05),但菌株GX54感染组小鼠血清中的TNF-α水平显著高于菌株GX82感染组小鼠(P<0.05),而IL-6水平在两感染组间无统计学意义(P>0.05)。sly、mrp、epf,ofs,revS,nadR,SSU05_0473,neuB及neuC等在高致病型猪链球菌中常见的毒力基因在GX54与GX82也存在。结论本研究首次发现了猪链球菌ST665和ST107型临床菌株携带可移动的89K样PAIs。携带不同89K样PAIs的菌株毒力水平具有显著差异,该差异与菌株在感染早期诱导宿主产生TNF-α的水平密切相关,且并非由外周血中的细菌载量差异所引起。仅以包括89K样PAIs在内的已知毒力基因存在与否做为判断猪链球菌毒力水平的方法存在不足。

关键词：猪链球菌 89K样毒力岛接合耐药性致病

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我国部分地区屠宰生猪弓形虫和多杀性巴氏杆菌感染情况调查

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中国动物检疫 2023年第12期40卷 1-4页

作者：孙向东刘晓雷刘明远姚火春侯璐胥小辰赵娜许颖张海燕朱茜张旗中国动物卫生与流行病学中心山东青岛266032 吉林大学人兽共患病研究所人畜共患传染病重症诊治全国重点实验室/人兽共患病研究教育部重点实验室吉林长春130062 南京农业大学动物医学院江苏南京210095 兴安盟农牧业综合行政执法支队内蒙古乌兰浩特137499 兴安盟农牧局综合保障中心内蒙古乌兰浩特137499 兴安盟动物疫病预防控制中心内蒙古乌兰浩特137499 扎赉特旗农牧业综合行政执法大队内蒙古扎赉特旗137699 兴安盟农牧科学研究所内蒙古乌兰浩特137499

为了解我国屠宰生猪弓形虫和多杀性巴氏杆菌感染情况,在河北、内蒙古、广西、四川和贵州等5省份开展现场调查和样品检测。结果显示:屠宰生猪弓形虫抗体阳性率为15.2%(95%CI:7.0%~24.4%),病原学阳性率为7.0%(95%CI:1.7%~11.5%);多杀性巴... 详细信息

为了解我国屠宰生猪弓形虫和多杀性巴氏杆菌感染情况,在河北、内蒙古、广西、四川和贵州等5省份开展现场调查和样品检测。结果显示:屠宰生猪弓形虫抗体阳性率为15.2%(95%CI:7.0%~24.4%),病原学阳性率为7.0%(95%CI:1.7%~11.5%);多杀性巴氏杆菌病原学阳性率为6.4%(95%CI:1.6%~10.5%)。结果表明:我国屠宰生猪中存在弓形虫和多杀性巴氏杆菌感染,弓形虫感染率更高。部分地区屠宰环节检疫工作存在驻场官方兽医人数不足、外聘人员协检、实验室检测能力待加强等问题,建议尽快改善屠宰场实验室条件,提高屠宰检疫管理水平,明确屠宰场检疫能力建设标准,加快人工智能技术应用,以保障食品安全和公共卫生安全。

关键词：屠宰检疫弓形虫多杀性巴氏杆菌感染

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家禽细菌性疾病病原基因功能及致病机理研究

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中国家禽 2011年第13期33卷 37-39页

作者：王少辉熊丽平李求春董洪燕南京农业大学动物医学院扬州大学农业部畜禽传染病实验室扬州大学生物科学与技术学院扬州大学兽医学院

禽致病性大肠杆菌侵袭相关基因ibeA的致病机理研究肠道外致病性大肠杆菌(ExPEC),如尿源性大肠杆菌(UPEC)、新生儿脑膜炎大肠杆菌(NMEC)、禽致病性大肠杆菌(APEC)等,它们在基因组结构上很相似,且具有很高的同源性;在遗传进化和生态分布... 详细信息

禽致病性大肠杆菌侵袭相关基因ibeA的致病机理研究肠道外致病性大肠杆菌(ExPEC),如尿源性大肠杆菌(UPEC)、新生儿脑膜炎大肠杆菌(NMEC)、禽致病性大肠杆菌(APEC)等,它们在基因组结构上很相似,且具有很高的同源性;在遗传进化和生态分布中也有较高相似性.NMEC和APEC拥有许多共同的毒力基因,如毒力岛***和APEC都可引起相应宿主的脑膜炎症状.

关键词：禽细菌性疾病病原基因功能禽致病性大肠杆菌尿源性大肠杆菌侵袭相关基因脑膜炎 APEC 基因组结构遗传进化相似性生态分布机理研究毒力基因新生儿同源性毒力岛肠道外症状宿主

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单股正链RNA病毒3'非编码区的结构与功能研究进展

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畜牧与兽医 2011年第10期43卷 98-102页

作者：刘萍刘长龙陆嘉琦高飞尹杨姚火春袁世山南京农业大学动物医学院江苏南京210095 中国农业科学院上海兽医研究所/中国动物卫生与流行病学中心上海分中心猪传染病研究室/农业部动物寄生虫病重点实验室上海200241

单股正链RNA病毒基因组中的3'非编码区(3'UTR)可以形成二级或者高级结构,这些结构对维持病毒RNA的稳定性以及病毒的复制调控具有至关重要的作用。它不仅可以单独发挥作用,也可以与RNA或者蛋白相互作用调控病毒的复制、转录、翻... 详细信息

单股正链RNA病毒基因组中的3'非编码区(3'UTR)可以形成二级或者高级结构,这些结构对维持病毒RNA的稳定性以及病毒的复制调控具有至关重要的作用。它不仅可以单独发挥作用,也可以与RNA或者蛋白相互作用调控病毒的复制、转录、翻译和包装等各个过程。本文对RNA结构和功能研究的一般方法,以及一些单股正链RNA病毒代表种属的3'UTR的结构和功能进行了综述,并且就研究前景和一些存在的问题进行了探讨。

关键词：单股正链RNA病毒 3′UTR 结构与功能病毒复制

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PRRSV感染性克隆5′非翻译区序列缺失突变分析

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中国兽医学报 2009年第1期29卷 25-29页

作者：高飞姚火春王金勇余丹丹袁世山中国农业科学院上海兽医研究所／中国动物卫生与流行病学中心上海分中心动物传染病研究室农业部动物寄生虫病重点实验室上海200232 南京农业大学动物医学院江苏南京210095

在PRRSV感染性克隆pCBC2的基础上,通过突变PCR获得了病毒基因组5′UTR系列缺失的全长突变体克隆:pCBCM1、pCBCM3、pCBCM5、pCBCM7、pCBCM9、pCBCM45、pCBCM69、pCBCM100,随后将上述突变体体外转录成RNA之后转染MARC-145细胞,进行病毒感染性、复制和转录分析,以鉴定特定的缺失区的调控功能。结果显示,病毒5′UTR起始的第1个碱基是保持病毒感染性非必需的核苷酸;前45个碱基对病毒基因组的复制是非必需的。Northern-Blot结果显示pCBCM1亚基因组mRNA可以进行高效率的转录,而其余突变体的亚基因组转录受到严重抑制。由此证明,PRRSV 5′UTR的完整性对病毒意义重大,碱基的少量以及大部分缺失会对病毒产生极大的影响。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征感染性克隆体外转录缺失突变反向遗传系统

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不同动物源新城疫病毒感染不同种属细胞的病变观察

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中国家禽 2009年第23期31卷 18-21页

作者：高以明张敬友王水明柯家法李超美朱雪良张扬严继宁黄立业任晓进吴艳涛刘文博南京农业大学动物医学院江苏南京210095 南京出入境检验检疫局江苏南京210001 江苏出入境检验检疫局江苏南京210001 扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室江苏扬州225009

用10株不同动物源的新城疫病毒F48E8,LaSota、LaSota-GFP、ZJ1、ZJ1-GFP、JS-4-05-Go、GX-1-05-Ch、JS-1-07-Os、JS-1-07-Du、JS-1-07-Pi等毒株分别感染鸡胚、鹅胚、鸭胚成纤维细胞、PK-15、Dulac、FK81、MDCK、Vero、Hela多种不同动物来源的传代细胞系,通过对病毒感染细胞后病变的观察、ZJ1-GFP及LaSota-GFP两个病毒感染细胞后细胞中绿色荧光蛋白指示的病变,了解不同的毒株对不同细胞感染性的差别。结果表明,不同毒力、不同动物源的新城疫病毒致不同种属细胞病变的作用不同,产生病变的时间有差异,强毒F48E8等毒株感染细胞后48～72h可以引起几种禽源成纤维细胞全部裂解,而哺乳动物来源的细胞在60～120h细胞发生病变,且病变也不如禽源成纤维细胞严重,出现了细胞的圆缩。弱毒株在胰酶处理后感染细胞,72h以后出现明显细胞病变,引起的哺乳动物细胞病变不明显。受试毒株的动物种属来源与细胞的致病性没有明显相关性。

关键词：新城疫病毒成纤维细胞传代细胞系绿色荧光蛋白致病性感染性

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基因组RNA Poly(A)尾对猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒复制过程的影响

基因组RNA Poly(A)尾对猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒复制过程的影响

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第七届全国病毒学学术研讨会暨第二届武汉现代病毒学国际研讨会

作者：袁海峰高飞姚火春王金勇袁世山中国农业科学院上海兽医研究所/中国动物卫生与流行病学中心上海分中心动物传染病研究室农业部动物寄生虫病重点实验室南京农业大学动物医学院

许多单股正链 RNA 病毒的基因组末端含有 poly(A)尾,这对病毒基因组 RNA 的感染性起着非常重要的作用。对于猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒(PRRSV)基因组 poly(A)尾的研究甚少,仅有报道称将其缺失造成 PRRSV 基因组丧失感染性,

关键词：猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒复制过程 RNA Poly 基因组

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猪繁殖与呼吸综合征病毒5’非翻译区序列的反向遗传操作

猪繁殖与呼吸综合征病毒5’非翻译区序列的反向遗传操作

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中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第十二次学术研讨会

作者：高飞姚火春孙志王金勇袁世山中国农业科学院上海兽医研究所/中国动物卫生与流行病学中心上海分中心动物传染病研究室农业部动物寄生虫病重点实验室南京农业大学动物医学院

在猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)北美株感染性克隆pCBC2的基础上,利用突变PCR技术成功构建了在病毒基因组5端非编码区(5UTR)和ORF1起始密码子之间插入NdeⅠ的全长克隆pTLNd4,并在此基础上将北美株病毒的5UTR替换为欧洲株的5UTR,成功构... 详细信息

在猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)北美株感染性克隆pCBC2的基础上,利用突变PCR技术成功构建了在病毒基因组5端非编码区(5UTR)和ORF1起始密码子之间插入NdeⅠ的全长克隆pTLNd4,并在此基础上将北美株病毒的5UTR替换为欧洲株的5UTR,成功构建了全长克隆pTLV8。以体外转录的RNA转染MARC-145细胞,pTLNd4产生了细胞病变(CPE),pTLV8未产生。对这两株突变病毒进行RT-PCR和Northern Blot试验,分别对病毒基因组RNA复制和亚基因组mRNA转录水平进行分析;同时,还对产生CPE的pTLNd4进行了病毒学试验,结果表明它与亲本病毒无论从分子生物学水平或病毒学水平都无明显差异,而pTLV8虽未产生CPE,但用RT-PCR在病毒传代细胞中检测到了基因组RNA,说明替换欧洲型5UTR的突变病毒丧失了复制能力与感染性,但目前仍然能够提供病毒RNA合成所需要的顺式调控因子。本研究为进一步解析5UTR的调控机制奠定了基础。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF 亚基因组欧洲型感染性克隆 PRRSV 全长克隆反向遗传操作 UTR RNA 体外转录细胞病变病毒基因组非翻译区

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Poly(A)尾对猪繁殖与呼吸综合征病毒基因组感染性的影响

Poly(A)尾对猪繁殖与呼吸综合征病毒基因组感染性的影响

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中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第十二次学术研讨会

作者：袁海峰姚火春高飞王金勇袁世山中国农业科学院上海兽医研究所/中国动物卫生与流行病学中心上海分中心动物传染病研究室农业部动物寄生虫病重点实验室南京农业大学动物医学院

许多单股正链RNA病毒的基因组末端含有一段poly(A)尾,这对病毒基因组RNA的感染性起着非常重要的作用。本研究以猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染性克隆pCBC2为平台进行反向遗传操作,通过突变PCR获得poly(A)尾长度分别为0、5、8、9、10... 详细信息

许多单股正链RNA病毒的基因组末端含有一段poly(A)尾,这对病毒基因组RNA的感染性起着非常重要的作用。本研究以猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染性克隆pCBC2为平台进行反向遗传操作,通过突变PCR获得poly(A)尾长度分别为0、5、8、9、10、22、35的全长突变体克隆,经体外转录转染MARC-145细胞,观察细胞病变(CPE),对于能产生CPE的,抽提细胞上清中的病毒RNA,通过G-Tailing法鉴定子代病毒基因组的poly(A)尾长度。结果表明:***(A)尾影响PRRSV基因组的感染性,且最小长度为10;***基因组poly(A)尾在感染细胞过程中能被修复。

关键词：基因组 RNA 子代病毒感染性克隆 PRRSV 体外转录猪繁殖与呼吸综合征病毒

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