检索结果-内蒙古大学图书馆

西北植物学报 2024年第11期44卷 1725-1734页

作者：陈益杨妮罗微李静文刘慧庄静南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室南京210095 南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室南京210095

【目的】鉴定茶树BRX家族基因,分析其在不同组织和逆境下的表达模式,为探究BRX基因功能奠定基础。【方法】基于茶树基因组数据库及TBtools等软件对BRX基因进行鉴定分析;以‘舒茶早’为材料,对其进行不同时间的盐、干旱、高温、低温及外... 详细信息

【目的】鉴定茶树BRX家族基因,分析其在不同组织和逆境下的表达模式,为探究BRX基因功能奠定基础。【方法】基于茶树基因组数据库及TBtools等软件对BRX基因进行鉴定分析;以‘舒茶早’为材料,对其进行不同时间的盐、干旱、高温、低温及外源GA3处理;用RT-qPCR检测CsBRXs基因在不同组织和处理下的转录水平。【结果】共鉴定到5个CsBRXs基因,其编码蛋白由313~370个氨基酸组成,该家族基因结构相似且高度保守,启动子区域含激素和逆境响应元件,根据进化关系BRX蛋白被分为4个亚族。CsBRX1、CsBRX3和CsBRX5在嫩叶中均有表达,CsBRX4仅在老叶中表达;盐胁迫12 h时,CsBRX1、CsBRX2和CsBRX4的转录水平最高;Cs-BRX2快速响应低温胁迫,在1 h时表达量达峰值;CsBRX2对外源GA信号积极响应,在24 h时表达量最高。【结论】CsBRXs基因在茶树中的表达具有组织特异性,并差异化响应多种逆境胁迫和GA信号,为研究其抗逆机制提供指导。

关键词：茶树 BRX基因家族生物信息学组织特异性非生物胁迫表达分析

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不结球白菜BcAP1的克隆及其启动子分析

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南京农业大学学报 2024年

作者：米闵渠天慧徐新凤李英侯喜林王建军刘同坤南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室/园艺作物种质创新与利用教育部工程研究中心/园艺学院南京农业大学三亚研究院

[目的] 本文旨在探究BcAP1基因在不结球白菜早、晚开花品种中是否存在结构和表达差异。[方法] 以早开花品种‘菜心’以及晚开花品种‘五月慢’为试验材料，通过同源克隆2个品种中的BcAP1基因和启动子序列，对2个品种的氨基酸序列进行比... 详细信息

[目的] 本文旨在探究BcAP1基因在不结球白菜早、晚开花品种中是否存在结构和表达差异。[方法] 以早开花品种‘菜心’以及晚开花品种‘五月慢’为试验材料，通过同源克隆2个品种中的BcAP1基因和启动子序列，对2个品种的氨基酸序列进行比对和系统进化分析；利用亚细胞定位技术研究BcAP1基因的空间表达；利用实时荧光定量PCR（RT-qPCR）分别对2个品种花蕾期和开花期BcAP1的表达量进行分析；通过双荧光素酶试验对2个品种中BcAP1启动子的活性进行分析；此外对转基因拟南芥进行β-D-葡糖醛酸酶(GUS)染色以及利用PlantCARE 在线软件预测了‘菜心’BcAP1启动子插入片段结构域。[结果] ‘菜心’和‘五月慢’BcAP1 CDS序列仅有1个碱基不同，但两端序列翻译所得氨基酸序列完全一致。系统进化分析表明，BcAP1与拟南芥之间同源性最高。亚细胞定位显示其表达位置在细胞核上。定量结果显示，在花蕾期和开花期，早抽薹品种‘菜心’中的BcAP1基因表达量显著高于同期的晚抽薹品种‘五月慢’。2个品种的BcAP1基因启动子序列上存在较大差异且‘菜心’的启动子序列存在896 bp插入序列。双荧光素酶试验结果表明，‘菜心’BcAP1启动子的活性远高于‘五月慢’BcAP1启动子的活性。GUS染色结果显示，GUS蛋白在pCXBcAP1-BcAP1-GUS转基因拟南芥表达更强。‘菜心’BcAP1启动子插入片段结构域分析发现BcAP1启动子插入片段有参与生物钟调控的顺式作用元件和赤霉素反应因子。[结论] 克隆的BcAP1基因定位于细胞核，与拟南芥的同源性最高，‘菜心’BcAP1启动子比‘五月慢’BcAP1启动子多一段长度为896 bp插入序列，插入片段中有与开花相关的元件，且‘菜心’BcAP1启动子活性比‘五月慢’高。

关键词：不结球白菜 BcAP1基因克隆启动子分析

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不结球白菜BcGR2.1基因的功能验证及响应光氧化胁迫研究

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南京农业大学学报 2023年第5期46卷 841-851页

作者：陶瑜李燕柏艾梅虞章红侯喜林李英南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室/园艺作物种质创新与利用教育部工程研究中心/园艺学院江苏南京210095

[目的]本文旨在研究不结球白菜BcGR2.1基因在光氧化胁迫下的表达模式,并探索过表达或沉默该基因对植物抗光氧化胁迫的影响,以明确基因的功能。[方法]从不结球白菜中克隆了BcGR2.1基因CDS序列,对其编码的氨基酸序列进行进化树和保守区域... 详细信息

[目的]本文旨在研究不结球白菜BcGR2.1基因在光氧化胁迫下的表达模式,并探索过表达或沉默该基因对植物抗光氧化胁迫的影响,以明确基因的功能。[方法]从不结球白菜中克隆了BcGR2.1基因CDS序列,对其编码的氨基酸序列进行进化树和保守区域分析;采用RT-qPCR技术,对BcGR2.1基因在光氧化胁迫处理下的表达水平进行分析;利用农杆菌介导的蘸花法和病毒诱导的基因沉默(VIGS)技术分别获得BcGR2.1过表达拟南芥和BcGR2.1沉默不结球白菜植株,并验证过表达或沉默BcGR2.1基因对植物抗光氧化胁迫能力的影响。[结果]不结球白菜BcGR2.1基因ORF全长1626 bp,与芜菁GR2蛋白进化关系最近。在甲基紫精(MV)处理诱导的光氧化胁迫下,该基因一定时间内表达量上调,随后下调。过表达转基因拟南芥中抗坏血酸(AsA)含量上升,而沉默植株中AsA含量下降。光氧化胁迫条件下,过表达转基因拟南芥中的H_(2)O_(2)含量显著低于野生型,而BcGR2.1沉默植株中H_(2)O_(2)含量显著高于PTY空载植株;此外,过表达BcGR2.1拟南芥中相关叶绿素荧光动力学参数F v/F m、Y(Ⅱ)、ETR以及qP均显著高于野生型。[结论]在拟南芥和不结球白菜中BcGR2.1正调控AsA含量,抑制光氧化胁迫处理下植株体内H_(2)O_(2)的爆发,一定程度上维护了植株叶绿素荧光参数的正常状态,提高了植物对光氧化胁迫的耐受性。

关键词：不结球白菜 BcGR2.1 光氧化胁迫抗坏血酸(AsA) 叶绿素荧光参数

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胡萝卜光合特性昼夜节律及生物钟基因DcRVEa和DcRVEb响应光周期分析

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植物生理学报 2023年第11期59卷 2018-2026页

作者：张楠胡志航周建华刘慧王雅慧张雨晴王荟茹徐志胜熊爱生南京农业大学园艺学院南京210095 作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室南京210095 郑州市蔬菜研究所郑州450001

为了解胡萝卜生物钟相关基因REVEILLEs (RVEs)在昼夜节律中的分子调控机制,从胡萝卜基因组中检索获得DcRVEa和DcRVEb基因。对两个光周期不同时间点胡萝卜叶片进行光合参数测定,利用实时荧光定量PCR技术对DcRVEa和DcRVEb基因表达量进行... 详细信息

为了解胡萝卜生物钟相关基因REVEILLEs (RVEs)在昼夜节律中的分子调控机制,从胡萝卜基因组中检索获得DcRVEa和DcRVEb基因。对两个光周期不同时间点胡萝卜叶片进行光合参数测定,利用实时荧光定量PCR技术对DcRVEa和DcRVEb基因表达量进行检测与分析。结果显示:DcRVEa和DcRVEb分别含有304和307个氨基酸,均为亲水性蛋白;二级结构以α-螺旋和随机卷曲为主。胡萝卜RVE蛋白序列与其他物种同源性序列相似度为66.69%;DcRVEa与莲(Nelumbo nucifera)进化关系较近, DcRVEb与橡胶树(Hevea brasiliensis)进化关系较近。蛋白互作网络分析结果显示,胡萝卜DcRVEa和DcRVEb与LNK1、LNK2、CCA1、TOC1等生物钟核心元件具有较直接的作用。在两个光周期(48 h)中,胡萝卜叶片净光合速率(P_(n))、气孔导度(G_(s))和蒸腾速率(T_(r))在白天处于较高水平,胞间CO_(2)浓度(Ci)则相反。实时荧光定量PCR结果显示,在两个光周期(48 h)中, DcRVEa和DcRVEb的相对表达量均在黑暗条件下达到峰值。DcRVEa和DcRVEb的表达趋势相似,均响应昼夜节律的变化。本文研究结果为进一步研究胡萝卜生物钟基因DcRVEa和DcRVEb的分子机制提供参考。

关键词：胡萝卜生物钟 REVEILLE 转录因子表达分析光合特性

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代谢组学分析萝卜肉质根地上和地下部分纤维素和木质素差异

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植物生理学报 2025年第4期61卷 526-538页

作者：刘佩卓孟歌雍明丽王雅慧段奥其谭杉杉张紫悦熊爱生苏小俊南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室南京210095 江苏省农业科学院蔬菜研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室南京210014

木质素和纤维素对植物性食品的质地有重要影响,萝卜(Raphanus sativus)肉质根地上和地下部分的质地存在明显差异。本研究发现‘如皋白萝卜’肉质根地下部分木质素含量显著高于地上部分,‘竹镇青萝卜’木质素含量无明显差异,而两种萝卜... 详细信息

木质素和纤维素对植物性食品的质地有重要影响,萝卜(Raphanus sativus)肉质根地上和地下部分的质地存在明显差异。本研究发现‘如皋白萝卜’肉质根地下部分木质素含量显著高于地上部分,‘竹镇青萝卜’木质素含量无明显差异,而两种萝卜肉质根不同部分纤维素含量均无明显差异。‘如皋白萝卜’木质素合成上游莽草酸途径中预苯酸和L-苯丙氨酸在肉质根地下部分的积累显著高于地上部分,与木质素的差异积累有关。‘竹镇青萝卜’肉质根地下部分参与苯丙烷类生物合成途径的芥子醛和芥子醇含量显著高于地上部分,并有多种差异代谢物富集在苯丙氨酸代谢、组氨酸和嘌呤生物碱生物合成等氨基酸代谢途径,多种氨基酸参与糖类代谢的调控进而影响肉质根中木质素的积累。

关键词：萝卜肉质根质地木质素纤维素代谢组学

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茄科植物PMI基因进化研究及辣椒CaPMI基因克隆和表达分析

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南京农业大学学报 2025年

作者：唐凯黄志楠刘同坤刘燕飞夏玲孙小川段伟科淮阴工学院生命科学与食品工程学院南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室/园艺学院

[目的]本研究旨在鉴定茄科及辣椒磷酸甘露糖异构酶（phosphomannose isomerase，PMI）基因，探究其进化过程，并系统解析辣椒CaPMI基因在非生物胁迫及激素处理下的表达调控网络，为阐明CaPMI基因功能机制及指导辣椒抗逆育种提供理论支撑... 详细信息

[目的]本研究旨在鉴定茄科及辣椒磷酸甘露糖异构酶（phosphomannose isomerase，PMI）基因，探究其进化过程，并系统解析辣椒CaPMI基因在非生物胁迫及激素处理下的表达调控网络，为阐明CaPMI基因功能机制及指导辣椒抗逆育种提供理论支撑。[方法]通过生物信息学与分子克隆技术解析PMI基因家族特征，分析转录组数据阐明茄科PMI在器官发育与果实成熟中的表达特征，利用RT-qPCR技术检测CaPMI在多重胁迫下的表达模式。[结果] PMI基因在进化过程中受到强纯化选择(Ka/Ks<1)，形成3个独立分支，不同物种发生了特异性保留。辣椒基因组中鉴定到3个CaPMI基因，茄科PMI基因启动子区中富集生长发育、逆境响应及激素调控相关元件，但数量与组合模式差异明显。茄科PMI基因具有组织表达特异性，其中CaPMI1高表达于各器官，CaPMI3特异性富集于花器官。克隆获得CaPMI1（1299 bp/432 aa）和CaPMI2（1326 bp/441 aa）基因，均为酸性蛋白（pI 4.83～4.91）。CaPMI1显著激活于低温、高温及GA3处理；CaPMI2和CaPMI3则对低温、高温、干旱、GA3和SA胁迫快速响应。[结论]本研究揭示了茄科PMI基因在进化中的保守性与功能，辣椒CaPMI基因家族通过亚功能化形成了CaPMI1、CaPMI2和CaPMI3协作互补的胁迫响应模块，增强了辣椒对复杂环境压力的适应性，为辣椒抗逆种质创制提供了基因资源与理论支撑。

关键词：辣椒磷酸甘露糖异构酶(PMI) 进化关系表达分析非生物胁迫响应

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不同生态区、生产季节及不同品种切花菊茎秆充实度比较及其对瓶插品质的影响

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南京农业大学学报 2025年

作者：钟之红吴瑜斐马亚爽陶然王利凯陈素梅赵爽陈发棣张飞张涛刘敏荣薛建平房伟民管志勇南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部景观农业重点实验室/农业农村部花卉生物学与种质创制重点实验室/华东地区花卉生物学国家林业和草原局重点实验室南京绘美生物科技有限公司开远天华生物产业有限公司

[目的]基于茎秆质量对切花采后品质的潜在影响，对切花菊品种资源开展评价并初步探索影响切花菊茎秆中空的因素及其对采后品质的影响，为切花菊品质优化提供科学依据。[方法]调查不同生态区、不同季节生产的切花菊不同品种的茎秆充实度... 详细信息

[目的]基于茎秆质量对切花采后品质的潜在影响，对切花菊品种资源开展评价并初步探索影响切花菊茎秆中空的因素及其对采后品质的影响，为切花菊品质优化提供科学依据。[方法]调查不同生态区、不同季节生产的切花菊不同品种的茎秆充实度，初步分析不同地区及不同生产季节的温度条件对其影响；并探究茎秆充实度对瓶插品质的影响。[结果]对144份切花菊样本的茎秆充实度进行全面评估后发现，19.44%的品种茎秆纵向与横向充实度均不佳，37.50%的品种茎秆纵向与横向呈现中等的充实度，而27.08%的品种则展现出好的茎秆充实度。此外，10.42%的品种表现为茎秆横向充实度优于纵向充实度，而仅有5.56%的品种表现为纵向充实度优于横向充实度。云南开远地区不同季节生产的切花菊茎秆充实度差异显著，3个季节中秋季茎秆充实度最佳，冬季次之，夏季充实度最差。南京与云南开远地区夏季出花的26个切花菊品种比较中，‘南农丹心’等10个品种的茎秆充实度表现为南京优于开远的，‘南农万花筒’等5个品种茎秆充实度表现为南京的微优于开远，‘南农冰洁’等11个品种茎秆充实度表现为开远的优于南京。此外，‘南农红蕊’‘秦淮青茶’等36个自育品种的茎秆充实度普遍优于‘福白’‘汉城’等57个国外育种商品种。在生长期温度为20～29 ℃时，切花菊茎秆相对较为充实；茎秆形成期间的持续高温和极端变温会加剧茎秆中空化。此外，茎秆中空对瓶插品质具有负面作用，且茎秆纵向充实度较横向充实度对瓶插品质影响更为显著，采后冷藏处理不会消除茎秆中空的发生。[结论]切花菊茎秆中空对瓶插品质不利，茎秆形成期间稳定的适温利于茎秆充实度的提升。

关键词：切花菊茎秆充实度瓶插品质温度

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辣椒NRT基因家族的系统鉴定、进化与表达分析

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南京农业大学学报 2024年第4期47卷 653-664页

作者：牛佳斌唐凯夏迎萌刘同坤孙小川段伟科黄志楠淮阴工学院生命科学与食品工程学院江苏淮安223003 南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室/园艺学院江苏南京210095

[目的]本研究旨在鉴定辣椒硝酸盐转运蛋白(NRT)基因家族成员,分析其基本性质、染色体定位、进化关系以及在不同组织、不同果实发育阶段和不同非生物胁迫下的表达特征。[方法]利用生物信息学方法在辣椒‘遵辣1号’基因组中鉴定NRT基因家... 详细信息

[目的]本研究旨在鉴定辣椒硝酸盐转运蛋白(NRT)基因家族成员,分析其基本性质、染色体定位、进化关系以及在不同组织、不同果实发育阶段和不同非生物胁迫下的表达特征。[方法]利用生物信息学方法在辣椒‘遵辣1号’基因组中鉴定NRT基因家族并分析其理化性质、基因结构、染色体定位、共线性、顺式作用元件分布和进化关系等;利用转录组数据分析辣椒NRT(CaNRT)基因在不同组织和不同果实发育阶段中的表达特征,并利用RT-qPCR技术分析在不同非生物胁迫下的表达模式。[结果]辣椒中共包含73个CaNRT基因,不均匀分布在10条染色体上。系统进化分析表明,CaNRT基因可分为3个亚家族,同一亚家族具有相似基因结构和保守基序。顺式作用元件分析结果表明CaNRT可能受光、激素、逆境胁迫等多种因素调控。CaNRT1亚家族成员主要在根、茎、叶中表达量较高,CaNRT2亚家族在任何时期表达量都较低,CaNRT3亚家族存在组织表达差异性,主要在根中高表达。逆境胁迫数据表明,CaNRT1.18、CaNRT3.3、CaNRT3.1、CaNRT2.1、CaNRT1.23在低温、高温、干旱、盐和氧化处理下明显响应,所有CaNRT基因在低温处理时均有不同程度的正向响应。[结论]在辣椒基因组中共鉴定获得73个CaNRT基因,筛选出多个在辣椒生长发育和逆境胁迫中具有重要作用的关键基因。

关键词：辣椒硝酸盐转运蛋白(NRT) 系统进化表达分析非生物胁迫

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茶树捕光色素蛋白复合体基因CsLhcb2的鉴定及低温响应分析

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茶叶科学 2023年第2期43卷 183-193页

作者：胡志航秦志远李静文杨妮陈益李彤庄静南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室江苏南京210095 南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室江苏南京210095

茶树是我国重要的经济作物之一,其生长和发育过程中会遭受不同逆境影响,导致茶叶产量和品质下降。捕光色素蛋白复合体(Light-harvesting chlorophyll-protein complex)主要影响植物光合效率,在植物适应环境胁迫方面也发挥着重要作用。... 详细信息

茶树是我国重要的经济作物之一,其生长和发育过程中会遭受不同逆境影响,导致茶叶产量和品质下降。捕光色素蛋白复合体(Light-harvesting chlorophyll-protein complex)主要影响植物光合效率,在植物适应环境胁迫方面也发挥着重要作用。为研究茶树捕光色素蛋白复合体的特性,从龙井43克隆获得编码捕光色素蛋白复合体基因CsLhcb2,分析该基因编码蛋白序列特征、进化树、理化性质、亚细胞定位、二级结构、三级结构及其在4℃低温处理的表达情况。结果表明,CsLhcb2开放阅读框为798 bp,共编码265个氨基酸;该基因含有典型的Chloroa-b-bind保守结构域;与15种植物的LHCB2氨基酸序列进行多重比对,氨基酸序列的相似度达91.32%。进化树分析显示,CsLHCB2与曼陀罗、东南景天、葡萄亲缘关系较近,与麻竹和毛竹亲缘关系较远。CsLHCB2分子量为28 662.77,理论等电点为5.69,属于亲水性蛋白;亚细胞定位预测结果显示CsLHCB2主要定位在叶绿体中。荧光定量结果显示,CsLhcb2可能参与茶树低温胁迫的过程。常温处理条件下,一个光周期(24 h)内CsLhcb2的相对表达量呈现先上升,后下降趋势,龙井43和舒茶早在光照处理1 h达峰值,白叶1号在光照处理6 h达峰值;4℃低温条件下,3个茶树品种中CsLhcb2的表达均在光照处理12 h达到峰值,舒茶早中CsLhcb2表达量较高,分别为龙井43和白叶1号的1.18倍和1.98倍。研究结果为进一步研究茶树捕光色素蛋白复合体在茶树低温响应中的作用提供了参考。

关键词：茶树捕光色素蛋白复合体低温胁迫表达分析

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菊花CmHB15-1基因克隆及调控木质素合成功能分析

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南京农业大学学报 2023年第3期46卷 473-481页

作者：甘好李菲蒋甲福宋爱萍丁莲陈发棣陈素梅南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/农业农村部花卉生物学与种质创制重点实验室(南方)/国家林业与草原局华东地区花卉生物学重点实验室/钟山生物育种实验室/园艺学院江苏南京210095

[目的]本文旨在探究菊花CmHB15-1基因调控木质素合成的功能。[方法]通过同源克隆,以菊花‘神马’cDNA为模板克隆CmHB15-1基因,利用DNAMAN 8.0软件对其进行序列分析,构建pORE-R4-CmHB15-1-GFP载体并导入烟草叶片中进行亚细胞定位分析;利... 详细信息

[目的]本文旨在探究菊花CmHB15-1基因调控木质素合成的功能。[方法]通过同源克隆,以菊花‘神马’cDNA为模板克隆CmHB15-1基因,利用DNAMAN 8.0软件对其进行序列分析,构建pORE-R4-CmHB15-1-GFP载体并导入烟草叶片中进行亚细胞定位分析;利用酵母杂交试验分析其转录激活活性;利用RT-qPCR技术对CmHB15-1基因进行组织特异性表达分析及潜在下游基因分析,并通过遗传转化拟南芥分析其对木质素合成的影响。[结果]CmHB15-1基因的开放阅读框为2520 bp,编码839个氨基酸,预测蛋白相对分子质量为92.44×10^(3),等电点为6.46。CmHB15-1蛋白具有Homeobox、bZIP、START、MEKHLA结构域,与除虫菊TcATHB-15亲缘关系最近。亚细胞定位显示CmHB15-1蛋白定位在细胞核上,有转录激活活性。CmHB15-1基因在茎中的表达量最高,且其表达量从茎顶端向基部节间逐渐增加,在茎基部节间表达量最高。CmHB15-1转基因拟南芥植株OE-20、OE-23木质素含量比野生型分别增加了15.98%和17.99%,且转基因拟南芥植株中木质素合成相关基因苯丙氨酸解氨酶基因(PAL1)、肉桂酸-4-羟基化酶基因(C4H)、4-香豆酰辅酶A连接酶基因(4CL1)、咖啡酰辅酶A甲基转移酶基因(CCoAOMT1)、阿魏酸-5-羟基化酶基因(F5H)表达量均显著上调。[结论]CmHB15-1基因参与调控木质素生物合成。

关键词：菊花 CmHB15-1基因木质素合成

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