检索结果-内蒙古大学图书馆

作物学报 2023年第2期49卷 332-342页

作者：陈赛华彭盛尤仪雯张路遥王凯薛明杨远柱万建民江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室/植物功能基因组学教育部重点实验室/江苏省作物遗传生理重点实验室扬州大学农学院江苏扬州225009 南京农业大学/作物遗传与种质创新国家重点实验室/江苏省植物基因工程技术研究中心江苏南京210095 袁隆平农业高科技股份有限公司/农业农村部南方水稻品种创制重点实验室/抗病虫水稻育种湖南省工程实验室湖南长沙410128

湘陵628S是优质矮秆抗倒两系早稻不育系,所配组合米质优,且适宜轻简化、规模化和机械化种植,目前已有40个“陵两优”系列品种通过国家或省级审定,并大面积推广应用。测配中发现,湘陵628S与绝大多数中晚稻亲本配组感光性强,在长江流域不... 详细信息

湘陵628S是优质矮秆抗倒两系早稻不育系,所配组合米质优,且适宜轻简化、规模化和机械化种植,目前已有40个“陵两优”系列品种通过国家或省级审定,并大面积推广应用。测配中发现,湘陵628S与绝大多数中晚稻亲本配组感光性强,在长江流域不能正常抽穗,限制了其育种应用。为了探究湘陵628S及不同杂交组合感光性差异的遗传机制,本研究结合等位性测验与基因型分析,对湘陵628S及恢复系的关键感光基因进行分析。结果发现,湘陵628S携带有隐性等位基因e_(1)和Se-1^(e),显性等位基因Hd5^(k)、E_(2)、E_(3)和EF-1^(t),总体表现出弱感光性。恢复系携带的E_(1)(Ghd7)基因决定了不同组合的感光性强弱,所携带的Se-1(Hd1)和Hd5(DTH8)基因与感光性没有直接相关性。据此,我们开发了2个分子标记用于恢复系E_(1)、Se-1等位基因型的分子鉴定,以加快弱/不感光杂交组合的选育。本研究为湘陵628S及其他不育系在杂交育种上的利用提供了重要的理论和技术指导。

关键词：水稻不育系感光性基因分子标记

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基因聚合选育抗赤霉病小麦新品系百农4299

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作物学报 2022年第9期48卷 2221-2227页

作者：张一铎李国强孔忠新王玉泉李小利茹振钢贾海燕马正强南京农业大学作物基因组学与生物信息学中心/作物遗传与种质创新国家重点实验室江苏南京210095 河南科技学院小麦中心河南新乡453003

小麦赤霉病是一种严重危害小麦生产的真菌性病害,其抗性由多基因控制,抗性机制复杂。type Ⅰ(抗侵入)和type Ⅱ(抗扩展)是小麦抵御赤霉病侵害的2种最主要抗性类型。在抗赤霉病育种中兼顾2种抗性,对于保证生产上抗性的稳定和持久有着重... 详细信息

小麦赤霉病是一种严重危害小麦生产的真菌性病害,其抗性由多基因控制,抗性机制复杂。type Ⅰ(抗侵入)和type Ⅱ(抗扩展)是小麦抵御赤霉病侵害的2种最主要抗性类型。在抗赤霉病育种中兼顾2种抗性,对于保证生产上抗性的稳定和持久有着重要意义。在前期研究中,作者所在课题组从小麦地方品种望水白中克隆了抗赤霉病扩展的主效QTL Fhb1,精细定位了Fhb4和Fhb5,获得了功能性/紧密连锁的分子标记。本研究利用这些标记,以小麦品系NMAS022作为供体亲本,现代小麦品种百农4199作为受体亲本,通过分子标记辅助回交育种方法选育成了聚合望水白Fhb1、Fhb4、Fhb5的小麦新品系百农4299。与百农4199相比,百农4299在2年的田间试验中type Ⅰ抗性至少增加了73%~74%, type Ⅱ抗性至少增加了83%~88%(以病小穗数计),并且产量潜力也得到了提高。上述结果证明了通过分子标记辅助选择聚合不同类型抗赤霉病QTL以提高小麦赤霉病抗性的可行性。抗赤霉病小麦品系百农4299有望成为一个新的抗赤霉病小麦品种。

关键词：小麦赤霉病抗病基因聚合 MAS 百农4299

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环塔里木盆地2个芦笋品种的代谢组学分析

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新疆农业科学 2024年第10期61卷 2408-2416页

作者：庄红梅赵家芬王燕陈先知刘会芳韩宏伟克丽比努尔·开赛尔王强王浩新疆农业科学院园艺作物研究所/新疆蔬菜工程技术研究中心/省部共建干旱荒漠区作物抗逆遗传改良与种质创新国家重点实验室/新疆特色果蔬基因组研究与遗传改良重点实验室乌鲁木齐830091 和田地区农业技术推广中心新疆和田848000 南京农业大学园艺学院南京210095 温州科技职业学院浙江温州325006

【目的】芦笋是百合科天门冬属植物石刁柏(Asparagus officinalis)的食用嫩茎,分析2个芦笋品种转录途径和代谢组成分,为深度评估芦笋营养价值和芦笋种质资源开发利用和品种选育提供理论依据。【方法】利用UPLC-MS对哥兰德和翡翠明珠2个... 详细信息

【目的】芦笋是百合科天门冬属植物石刁柏(Asparagus officinalis)的食用嫩茎,分析2个芦笋品种转录途径和代谢组成分,为深度评估芦笋营养价值和芦笋种质资源开发利用和品种选育提供理论依据。【方法】利用UPLC-MS对哥兰德和翡翠明珠2个芦笋品种的嫩茎并进行代谢组学研究,比较代谢组成分的种类和含量,分析芦笋转录途径和代谢组成分。【结果】共筛选出差异代谢物235种,占全部代谢物的13.03%,其中包括黄酮53种,氨基酸及其衍生物39种,酚酸类34种,木脂素21种,生物碱20种,脂质12种,有机酸8种,核苷酸及其衍生物7种,萜类7种,维生素6种,甾体5种,糖类4种,香豆素3种,酮类2种,醌类1种,醛类1种,以及其它12种。翡翠明珠与哥兰德相比,翡翠明珠的矢车菊素-3-O-半乳糖苷、没食子儿茶素-(4α→8)-没食子儿茶素、丁香苷、芥子碱、2-乙酰基-5-甲基呋喃与槲皮素-3-O-桑布双糖苷含量较高;哥兰德的葡萄糖基5,8-二羟基-2,6-二甲基八碳-2,6-二烯酸,N-阿魏酰尸胺、毛蕊花糖苷、1-O-(6'-O-阿魏酰)葡萄糖苷-3-O-咖啡酰奎尼酸和知母皂苷A3-葡萄糖苷含量较高。【结论】通过富集235种代谢物,得到次生代谢物的生物合成途径主要有氨基酸、辅助因子与黄酮类化合物的生物合成途径。

关键词：芦笋 LC-MS 代谢转录途径

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芜菁硫代葡萄糖苷合成机制研究进展

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分子植物育种 2023年

作者：庄红梅陈先知韩宏伟刘会芳古力尼散木·莫沙王燕王强王浩新疆农业科学院园艺作物研究所新疆蔬菜工程技术研究中心省部共建干旱荒漠区作物抗逆遗传改良与种质创新国家重点实验室(新疆农业科学院园艺作物研究所) 新疆特色果蔬基因组研究与遗传改良重点实验室温州科技职业学院阿克苏地区新和县排先拜巴扎乡人民政府南京农业大学园艺学院

硫代葡萄糖苷是十字花科植物重要的次生代谢物，在植物保护、蔬菜风味、逆境生理、人类疾病预防等方面发挥重要作用，多种硫苷的水解产物已被证实具有抗癌、抗虫等作用。新疆芜菁具有丰富的硫苷，且总硫苷、总脂肪族硫苷和总吲哚族硫苷... 详细信息

硫代葡萄糖苷是十字花科植物重要的次生代谢物，在植物保护、蔬菜风味、逆境生理、人类疾病预防等方面发挥重要作用，多种硫苷的水解产物已被证实具有抗癌、抗虫等作用。新疆芜菁具有丰富的硫苷，且总硫苷、总脂肪族硫苷和总吲哚族硫苷含量也较高。目前，关于新疆芜菁硫苷的研究主要集中在营养成分的提取和鉴定、种质资源评价等方面，关于硫苷在新疆芜菁中的合成调控研究鲜有报道。因此，通过从生理、分子与代谢水平明确芜菁硫苷生物合成机制，对提升新疆芜菁品质，增强其抗生物胁迫具有重要意义。

关键词：芜菁硫苷合成机制进展

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江苏省植物细胞遗传学研究回顾与展望

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遗传 2021年第5期43卷 397-424页

作者：王海燕龚志云蒋甲福周宝良娄群峰曹清河席梦利陈佩度顾铭洪张天真陈发棣陈劲枫李宗芸王秀娥南京农业大学农学院作物遗传与种质创新国家重点实验室/JCIC-MCP南京210095 扬州大学农学院江苏省作物遗传生理重点实验室/植物功能基因组学教育部重点实验室/江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室扬州225009 江苏徐淮地区徐州农业科学研究所徐州221131 南京林业大学林学院南京210037 江苏师范大学生命科学学院徐州221116 浙江大学农业与生物技术学院杭州310058

20世纪初“遗传的染色体学说”的提出和证明标志着细胞遗传学交叉学科建立,伴随相关学科的发展,20世纪60年代末期细胞遗传学又与分子遗传学相结合,建立发展了分子细胞遗传学交叉学科。分子细胞遗传学以DNA分子原位杂交技术为核心,不断... 详细信息

20世纪初“遗传的染色体学说”的提出和证明标志着细胞遗传学交叉学科建立,伴随相关学科的发展,20世纪60年代末期细胞遗传学又与分子遗传学相结合,建立发展了分子细胞遗传学交叉学科。分子细胞遗传学以DNA分子原位杂交技术为核心,不断拓展应用领域,为生命科学研究提供了直观、高效的技术手段。原位杂交技术与基因组、细胞生物学等技术结合,被广泛应用于人类、动物、植物的起源、进化、驯化等基础研究和远缘杂交、染色体工程等应用研究。通过形象地展示DNA、RNA、蛋白质在细胞中的实际位置,揭示DNA序列之间的实际位置和顺序、亲缘物种间的进化关系和结构重排、基因组拼接序列的质量、转录水平RNA和翻译水平蛋白质的位置和数量变化等。江苏省遗传学会会员单位南京农业大学、扬州大学、南京林业大学、江苏师范大学、徐淮地区农科院等自20世纪中期开展细胞遗传学理论技术研究,伴随学科发展不断创新,建立了较完善的分子细胞遗传技术体系,并成功应用于开展植物系统进化、远缘杂交、染色体工程、基因组学等研究,取得了一批研究成果。本文将主要综述江苏省在该领域取得的重要进展,并展望未来发展方向。

关键词：江苏省遗传学会分子细胞遗传学 DNA分子原位杂交染色体工程基因组学

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新疆芜菁肉质根不同发育期代谢组成分鉴定与差异分析

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分子植物育种 2023年

作者：庄红梅王燕陈先知刘会芳韩宏伟李丽阿孜古丽·艾尼玩古力尼散木·莫沙王强王浩新疆农业科学院园艺作物研究所新疆蔬菜工程技术研究中心省部共建干旱荒漠区作物抗逆遗传改良与种质创新国家重点实验室(新疆农业科学院园艺作物研究所) 新疆特色果蔬基因组研究与遗传改良重点实验室南京农业大学园艺学院温州科技职业学院哈密市农业农机技术推广服务中心新和县农业技术推广站阿克苏地区新和县排先拜巴扎乡人民政府

新疆芜菁是一种药食同源草本植物，为了探究芜菁肉质根不同发育期的代谢产物，本研究通过广泛靶向代谢组学结合超高效液相色谱串联质谱(UPLC-MS/MS)技术与多元统计学的方法，对新疆芜菁肉质根不同发育期代谢物进行鉴定和分析。结果表明... 详细信息

新疆芜菁是一种药食同源草本植物，为了探究芜菁肉质根不同发育期的代谢产物，本研究通过广泛靶向代谢组学结合超高效液相色谱串联质谱(UPLC-MS/MS)技术与多元统计学的方法，对新疆芜菁肉质根不同发育期代谢物进行鉴定和分析。结果表明，芜菁不同发育期共检测到480种代谢物，其中差异代谢物252种，主要为酚酸类、氨基酸及其衍生物等。不同发育期的代谢物存在差异，幼苗期与肉质根生长盛期存在较多的差异代谢物：其中共有代谢物34种，幼苗期与膨大期相比，特有差异代谢物为22个，幼苗期与成熟期相比，特有差异代谢物为20个，膨大期与成熟期相比，特有差异代谢物为36个。通过富集480种差异代谢物，得到78条变化的代谢途径，主要为次生代谢产物的生物合成途径。本研究结果从组学的角度分析了芜菁代谢物的概况，揭示了芜菁不同发育期的特异代谢产物，为深入了解芜菁的营养价值提供了重要的理论基础，为芜菁副产品定向开发利用提供科学依据。

关键词：芜菁代谢组学 UPLC-MS/MS 多元统计学

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小麦基因组重组冷点区基因克隆策略探讨——以小麦脆杆基因TmBr1为例

小麦基因组重组冷点区基因克隆策略探讨——以小麦脆杆基因TmBr1...

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第十届全国小麦基因组学及分子育种大会

作者：邓清燕孔忠新武小霞马省伟袁阳贾海燕马正强应用植物基因组学实验室作物遗传与种质创新国家重点实验室南京农业大学

小麦是具有庞大基因组富含重复序列的重要粮食作物。在小麦基因组的着丝粒区、异染色质等区域存在一些重要基因,如位于5A着丝粒区域的赤霉病抗性QTL Fhb5、旗叶宽QTL TaFLW1、千粒重QTL ***-5A和雄性不育基因Ms3。由于这些染色质区域往... 详细信息

小麦是具有庞大基因组富含重复序列的重要粮食作物。在小麦基因组的着丝粒区、异染色质等区域存在一些重要基因,如位于5A着丝粒区域的赤霉病抗性QTL Fhb5、旗叶宽QTL TaFLW1、千粒重QTL ***-5A和雄性不育基因Ms3。由于这些染色质区域往往难以发生重组,通过传统的图位克隆方法克隆其中的基因十分困难。为了解决这一难题,不同学者提出了扩大定位群体数量和多样性、降低基因组复杂度的重测序如BSR-Seq、利用辐射等突变手段创造片段缺失突变等解决办法。以上方法或效果不一定好、或耗时费力、或存在假阳性。本研究提出以精细定位为基础,通过对RNA-Seq数据中在双亲或池间有多态的表达基因或表达有差异的基因进行与目标基因的电子位置匹配,确定候选基因,我们将其称为MapRseq。在该方法中,由于精细定位信息已知,候选基因目标明确,假阳性少,因此提高了基因克隆的效率。采用这一策略,我们克隆了小麦脆杆基因TmBr1。TmBr1位于5A染色体近着丝粒区域,物理距离与遗传距离的比值高达1.86Gb/cM。MapRseq不仅适用于重组冷点区的基因克隆,也适用于其他位置基因的克隆。

关键词：基因克隆 TmBr1 基因组重组策略探讨

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植物免疫研究与抗病虫绿色防控:进展、机遇与挑战

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中国科学：生命科学 2019年第11期49卷 1479-1507页

作者：张杰董莎萌王伟赵建华陈学伟郭惠珊何光存何祖华康振生李毅彭友良王国梁周雪平王源超周俭民中国科学院微生物研究所植物基因组学国家重点实验室中国科学院生物互作卓越创新中心北京100101 南京农业大学植物保护学院南京210095 中国科学院遗传与发育生物学研究所植物基因组学国家重点实验室中国科学院生物互作卓越创新中心北京100101 四川农业大学水稻研究所成都611130 武汉大学生命科学学院杂交水稻国家重点实验室武汉430072 中国科学院分子植物科学卓越创新中心/中国科学院植物生理生态研究所植物分子遗传国家重点实验室上海200032 西北农林科技大学植物保护学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室杨凌712100 北京大学生命科学学院蛋白质与植物基因研究国家重点实验室北京100871 中国农业大学植物保护学院农业部植物病理学重点实验室北京100193 中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室北京100193

植物免疫学是研究植物与病原生物互作的学科.同动物一样,植物也具有强大的先天免疫系统,其本质是通过对病毒、细菌、真菌、卵菌、线虫、昆虫、寄生植物等病原生物的识别激活防卫反应,拒阻病原生物的侵害;而病原生物则能够逃避或抑制宿... 详细信息

植物免疫学是研究植物与病原生物互作的学科.同动物一样,植物也具有强大的先天免疫系统,其本质是通过对病毒、细菌、真菌、卵菌、线虫、昆虫、寄生植物等病原生物的识别激活防卫反应,拒阻病原生物的侵害;而病原生物则能够逃避或抑制宿主植物的识别和防卫反应,在植物上引起病虫害.20年来,我国植物免疫研究取得巨大进步,与国际同行相比,在多个研究方向实现了并跑,在少数方向实现了领跑,为农作物病虫害绿色防控提供了理论支撑和新的技术手段.

关键词：抗病基因抗虫基因感病基因免疫受体激发子效应蛋白信号转导小RNA

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水稻全基因组赖氨酸巴豆酰化修饰特征解析

水稻全基因组赖氨酸巴豆酰化修饰特征解析

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江苏省遗传学会2017年学术研讨会——“技术创新与遗传学发展”

作者：刘帅薛超方圆陈刚周勇陈忱刘冠卿张文利吴玉峰龚志云扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室/教育部植物功能基因组学重点实验室南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室

在组蛋白修饰中,赖氨酸巴豆酰化(***)修饰是一种新型的蛋白翻译后修饰方式并首次在哺乳类动物中被发现。通过进一步的结构及基因组定位分析,研究人员证实Kcr修饰是一种进化高度保守,且在生物学功能上完全不同于组蛋白赖氨酸乙酰化(Kac)... 详细信息

在组蛋白修饰中,赖氨酸巴豆酰化(***)修饰是一种新型的蛋白翻译后修饰方式并首次在哺乳类动物中被发现。通过进一步的结构及基因组定位分析,研究人员证实Kcr修饰是一种进化高度保守,且在生物学功能上完全不同于组蛋白赖氨酸乙酰化(Kac)的蛋白质修饰方式。研究人员发现在人类体细胞和小鼠精子细胞基因组中,组蛋白Kcr分布于基因活性转录启动区域或增强子上。最新研究表明,乙酰化酶/去乙酰化酶具有调控Kcr的功能。说明Kcr可能具有与乙酰化存在一些相同的调控模式。这里,我们首次利用LC-MS/MS技术和生物信息学分析方法初步确定了水稻689个蛋白中存在1263个Kcr的修饰位点。亚细胞定位分析结果显示,有51%的巴豆酰化修饰蛋白定位在叶绿体上。其中,巴豆酰化修饰广泛富集在光合作用相关的蛋白上。此外,我们通过ChIP-seq对组蛋白Kcr结合DNA序列进行特征分析。在鉴定的10923个富集区域中,有87%的富集区位于基因上,尤其是外显子区域,并且组蛋白Kcr修饰的程度与基因表达成正相关。另外,特异位点H3K14cr同样与基因表达成正相关。进一步将Kcr和H3K14cr修饰与已公布的其他组蛋白修饰的数据进行比较,发现它们修饰的特征与活性基因相关的修饰(H3K9ac,H4K12ac,H3K4me2and H3K36me3)类似。同时,我们也发现有77%组蛋白修饰的位点与水稻基因间区上的DHSs重叠,但只有6%的修饰位点与IDEALPLANTARCHITECTURE1(IPA1)结合的活性增强子相关。我们的结果为植物中的赖氨酸巴豆酰化修饰提供了广泛的生物学功能的认识以及丰富的功能分析数据。

关键词：水稻赖氨酸巴豆酰化蛋白翻译后修饰转录调控

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水稻全基因组赖氨酸巴豆酰化修饰特征解析

水稻全基因组赖氨酸巴豆酰化修饰特征解析

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江苏省遗传学会2017年学术研讨会

作者：刘帅薛超方圆陈刚周勇陈忱刘冠卿张文利吴玉峰龚志云扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室/教育部植物功能基因组学重点实验室江苏扬州 225009 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室江苏南京210095

在组蛋白修饰中,赖氨酸巴豆酰化(lysine ***)修饰是一种新型的蛋白翻译后修饰方式并首次在哺乳类动物中被发现.通过进一步的结构及基因组定位分析,研究人员证实Kcr 修饰是一种进化高度保守,且在生物学功能上完全不同于组蛋白赖氨酸乙酰... 详细信息

在组蛋白修饰中,赖氨酸巴豆酰化(lysine ***)修饰是一种新型的蛋白翻译后修饰方式并首次在哺乳类动物中被发现.通过进一步的结构及基因组定位分析,研究人员证实Kcr 修饰是一种进化高度保守,且在生物学功能上完全不同于组蛋白赖氨酸乙酰化(Kac)的蛋白质修饰方式.研究人员发现在人类体细胞和小鼠精子细胞基因组中,组蛋白Kcr 分布于基因活性转录启动区域或增强子上.最新研究表明,乙酰化酶/去乙酰化酶具有调控Kcr 的功能.说明Kcr 可能具有与乙酰化存在一些相同的调控模式.这里,我们首次利用LC-MS/MS 技术和生物信息学分析方法初步确定了水稻689 个蛋白中存在1263 个Kcr 的修饰位点.亚细胞定位分析结果显示,有51％的巴豆酰化修饰蛋白定位在叶绿体上.其中,巴豆酰化修饰广泛富集在光合作用相关的蛋白上.此外,我们通过ChIP-seq 对组蛋白Kcr 结合DNA 序列进行特征分析.在鉴定的10923 个富集区域中,有87％的富集区位于基因上,尤其是外显子区域,并且组蛋白Kcr 修饰的程度与基因表达成正相关.另外,特异位点H3K14cr 同样与基因表达成正相关.进一步将Kcr 和H3K14cr 修饰与已公布的其他组蛋白修饰的数据进行比较,发现它们修饰的特征与活性基因相关的修饰(H3K9ac,H4K12ac,H3K4me2 and H3K36me3)类似.同时,我们也发现有77％组蛋白修饰的位点与水稻基因间区上的DHSs 重叠,但只有6％的修饰位点与IDEAL PLANT ARCHITECTURE1(IPA1)结合的活性增强子相关.我们的结果为植物中的赖氨酸巴豆酰化修饰提供了广泛的生物学功能的认识以及丰富的功能分析数据.

关键词：水稻赖氨酸巴豆酰化蛋白翻译后修饰转录调控

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