检索结果-内蒙古大学图书馆

中华疾病控制杂志 2024年第1期28卷 117-121页

作者：黄婷刘晋成李会琳吴怡雯郁尔季锴唐少文赵杨戴俊程易洪刚南京医科大学公共卫生学院生物统计学系南京211166 南京医科大学公共卫生学院流行病学系南京211166 南京医科大学生物医学大数据重点实验室肿瘤个体化医学协同创新中心南京211166

目的探讨单效应汇总(sum of single effects,SuSiE)回归模型在多组学数据共定位分析中的应用。方法以多组学模拟数据为例,介绍单效应汇总回归模型的基本原理和R软件分析。结果SuSiE回归模型通过利用单核苷酸多态性(single nucleotide po... 详细信息

目的探讨单效应汇总(sum of single effects,SuSiE)回归模型在多组学数据共定位分析中的应用。方法以多组学模拟数据为例,介绍单效应汇总回归模型的基本原理和R软件分析。结果SuSiE回归模型通过利用单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNPs)位点之间因连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)产生的相关性,允许在有多个因果变异的情况下,正确识别两个组学数据与表型相关的共定位点。结论相对于传统方法,SuSiE回归模型拓展了单一因果变异假设这一适用条件,且计算效率较高,从而有助于利用多组学数据检测多个潜在与疾病相关联位点。

关键词：多组学共定位近似贝叶斯因子因果变异

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尿失禁与抑郁症和焦虑症发病风险的前瞻性关联研究

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中国卫生统计 2023年第1期40卷 6-8,14页

作者：潘璐璐赵杨尤东方南京医科大学公共卫生学院生物统计学系 211166 南京医科大学现代毒理学教育部重点实验室南京医科大学生物医学大数据中心和医学大数据研究与应用重点实验室

目的分析尿失禁与抑郁症和焦虑症的发病风险之间的关联。方法本研究基于英国大型队列研究(UK Biobank),排除了基线患有及随访1年以内确诊抑郁症或焦虑症的样本,最终495398人被纳入分析。采用Cox比例风险回归模型估计基线是否患有尿失禁... 详细信息

目的分析尿失禁与抑郁症和焦虑症的发病风险之间的关联。方法本研究基于英国大型队列研究(UK Biobank),排除了基线患有及随访1年以内确诊抑郁症或焦虑症的样本,最终495398人被纳入分析。采用Cox比例风险回归模型估计基线是否患有尿失禁与抑郁症和焦虑症的风险比(hazard ratio,HR)及其95%置信区间(confidence interval,CI)。结果在中位随访时间11.55年间,共记录了新发抑郁症患者22569例(发病率39.5例/万人年),新发焦虑症患者18949例(发病率33.2例/万人年)。调整基线混杂因素后,与未患尿失禁的人相比,患尿失禁的人群发生抑郁症和焦虑症的风险分别提高了92%和55%(抑郁症:HR=1.92,95%CI=1.77~2.08,P=4.72×10^(-55);焦虑症:HR=1.55,95%CI=1.40~1.70,P=1.80×10^(-18))。在年龄<50岁的人群中,与未患尿失禁的人相比,尿失禁患者发生抑郁症或焦虑症的风险增加了134%和90%(抑郁症:HR=2.34,95%CI=1.98~2.76,P=2.2×10^(-23);焦虑症:HR=1.90,95%CI=1.53~2.36,P=5.4×10^(-9))。结论尿失禁会增加抑郁症和焦虑症的发病风险。年轻群体相比老年群体抑郁症和焦虑症的发病风险更高。

关键词：尿失禁抑郁症焦虑症队列研究英国生物银行

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多重并行中介分析方法的比较研究

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中华流行病学杂志 2022年第5期43卷 739-746页

作者：于洋仇沁晓尤东方赵杨南京医科大学公共卫生学院生物统计学系南京211166 南京医科大学生物医学大数据重点实验室/肿瘤个体化医学协同创新中心南京211166

目的介绍4种多重并行中介模型的分析方法,包括纯回归法、逆概率加权法、扩展的自然效应模型和基于权重的填补法,并对其进行探讨和比较。方法针对多重并行中介模型,通过3种情境的模拟试验比较不同方法在不同情境下估计直接效应和间接效... 详细信息

目的介绍4种多重并行中介模型的分析方法,包括纯回归法、逆概率加权法、扩展的自然效应模型和基于权重的填补法,并对其进行探讨和比较。方法针对多重并行中介模型,通过3种情境的模拟试验比较不同方法在不同情境下估计直接效应和间接效应的表现,并应用英国生物样本库的数据集进行实例分析。结果模拟试验和实例分析结果显示纯回归法和逆概率加权法对各效应的估计偏倚较小,扩展的自然效应模型次之,基于权重的填补法与另外3种的估计结果差异较大。结论不同的多重并行中介分析方法有不同的适用情境以及各自的优缺点,纯回归法更适用于连续中介的情形,逆概率加权法更适用于二分类中介的情形,扩展的自然效应模型在用于两个并行中介的残差呈正相关且相关程度较小时更佳,而基于权重的填补法可能并不适用于并行中介的情形,因而实际应用时应根据具体情境选择合适的方法。

关键词：多重并行中介分析并行中介效应逆概率加权法

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存在时依性混杂时的G方法

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中华疾病控制杂志 2021年第6期25卷 625-631页

作者：仇沁晓尤东方赵杨南京医科大学公共卫生学院生物统计学系南京211166 南京医科大学生物医学大数据重点实验室肿瘤个体化医学协同创新中心南京211166

目的介绍处理时依性混杂的G方法,并对不同G方法进行探讨和比较。方法通过4个情境的模拟试验验证不同G方法在不同情境下对时依性混杂的处理效果,并应用英国生物样本库(UK Biobank)的数据集进行实例分析。结果模拟试验和实例分析结果均显... 详细信息

目的介绍处理时依性混杂的G方法,并对不同G方法进行探讨和比较。方法通过4个情境的模拟试验验证不同G方法在不同情境下对时依性混杂的处理效果,并应用英国生物样本库(UK Biobank)的数据集进行实例分析。结果模拟试验和实例分析结果均显示G方法能有效处理时依性混杂。模拟试验显示3种方法效果类似,G-computation易受G-null paradox的影响。随着时依性混杂因素数量增加,相比于G-computation和G-estimation,逆概率加权法(inverse probability of treatment weighting,IPTW)的效果波动较大。结论不同G方法都能适当地处理时依性混杂,降低统计分析过程中的偏倚大小。

关键词：时依性混杂碰撞偏倚 G方法

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利用因果森林估计异质性人群下个体的处理效应

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中华流行病学杂志 2019年第6期40卷 707-712页

作者：何文静尤东方张汝阳于浩陈峰胡志斌赵杨南京医科大学公共卫生学院生物统计学系 211166 南京医科大学现代毒理学教育部重点实验室 211166 南京医科大学-哈佛大学公共卫生学院健康与风险评估联合实验室 211166 南京医科大学生物医学大数据重点实验室 211166 南京医科大学公共卫生学院流行病学系 211166 江苏省恶性肿瘤生物标志物与防治重点实验室南京211166 肿瘤个体化医学协同创新中心南京211166

目的探讨因果森林在异质性人群中估计个体处理效应的有效性及如何应用于实例数据以挖掘异质性人群特征。方法设计4种模拟方案,通过模拟试验验证因果森林在不同处理效应环境设置下对个体处理效应进行估计的效果,并应用于右心导管插入术... 详细信息

目的探讨因果森林在异质性人群中估计个体处理效应的有效性及如何应用于实例数据以挖掘异质性人群特征。方法设计4种模拟方案,通过模拟试验验证因果森林在不同处理效应环境设置下对个体处理效应进行估计的效果,并应用于右心导管插入术实例数据集进行分析。结果模拟试验结果表明,在4种不同效应值设置下,用因果森林方法所估计的个体处理效应值都能与总体效应相吻合,符合预期分布;实例数据分析结果显示绝大多数患者个体处理效应为正值,使用RHC会导致该样本人群180d死亡率增高,2月生存模型估计概率和白蛋白含量偏低的患者在使用RHC后更倾向于有较低的死亡风险。结论因果森林能够有效地估计个体处理效应,为个体是否接受某种处理提供建议。

关键词：因果森林异质性个体处理效应

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观察性研究中针对未测量混杂干扰的敏感性分析方法

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中华流行病学杂志 2019年第11期40卷 1470-1475页

作者：王丹华尤东方黄丽红赵杨南京医科大学公共卫生学院生物统计学系 211166 南京医科大学现代毒理学教育部重点实验室 211166 复旦大学附属中山医院生物统计室上海200032 江苏省恶性肿瘤生物标志物与防治重点实验室南京211166 肿瘤个体化医学协同创新中心南京211166 南京医科大学生物医学大数据重点实验室 211166

目的介绍敏感性分析方法,并对不同方法进行探讨和比较.方法通过模拟试验和实例比较混杂函数敏感性分析法和边界因子敏感性分析方法在观察性研究中校正未测量混杂因素准确性的差异.结果模拟试验与实际例子研究结果均显示,当暴露(X)与... 详细信息

目的介绍敏感性分析方法,并对不同方法进行探讨和比较.方法通过模拟试验和实例比较混杂函数敏感性分析法和边界因子敏感性分析方法在观察性研究中校正未测量混杂因素准确性的差异.结果模拟试验与实际例子研究结果均显示,当暴露(X)与结局(Y)之间存在未测量混杂情况下,混杂函数法和边界因子相比,在分析未测量混杂因素的效应至少达到多大强度才能导致观测效应值大小和方向彻底改变的问题上,混杂函数和边界因子分析结果相似.但混杂函数法在完全解释观测效应值时所需的混杂效应强度小于边界因子做出同样解释所需的混杂效应值.边界因子分析中设置两个参数,而混杂函数中只有一个参数,混杂函数法在分析计算过程中较边界因子法简便灵敏.结论对于真实世界观察性研究数据,分析暴露(X)与结局(Y)之间的因果效应时,敏感性分析过程必不可少,从计算过程和结果解释上,混杂函数敏感性分析方法是一个值得推荐的方法.

关键词：观察性研究因果推断未测量混杂因素敏感性分析

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随机森林在基因调控网络推断上的比较与应用

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中国卫生统计 2019年第6期36卷 951-954页

作者：张铭智尤东方何文静张汝阳陈峰胡志斌赵杨南京医科大学公共卫生学院生物统计学系 211166 南京医科大学现代毒理学教育部重点实验室南京医科大学环境与人类健康国际联合研究中心南京医科大学-哈佛大学公共卫生学院健康与风险评估联合实验室南京医科大学公共卫生学院流行病学系江苏省恶性肿瘤生物标志物与防治重点实验室南京医科大学生物医学大数据重点实验室

基因调控网络(gene regulatory network,GRN)是当前功能基因组学所研究的重要内容之一,作为一种描述基因间相互作用关系的方式,在推断复杂疾病的致病原理过程中发挥着重要的作用。通过对基因调控网络的分析,我们能够更加深入地了解各基... 详细信息

基因调控网络(gene regulatory network,GRN)是当前功能基因组学所研究的重要内容之一,作为一种描述基因间相互作用关系的方式,在推断复杂疾病的致病原理过程中发挥着重要的作用。通过对基因调控网络的分析,我们能够更加深入地了解各基因的生物学功能、理解基因间的调控机理并推断出未知基因的功能,这对疾病诊断、临床实践、药物研发等方面有指导性的意义。

关键词：基因调控网络随机森林疾病诊断药物研发功能基因组学临床实践复杂疾病未知基因

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一种基于条件把握度法和EM算法相结合的样本量再估计

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中国卫生统计 2018年第1期35卷 33-37,42页

作者：程建成柏建岭黄丽红赵杨于浩陈峰南京医科大学公共卫生学院生物统计学系 211166 南京医科大学生物医学大数据重点实验室

目的探索期中分析时正态分布资料的样本量再估计。方法通过模拟试验比较揭盲状态下样本量再估计的条件把握度法及盲态下样本量再估计的EM算法,进而探索将两者相结合的应用策略。结果均数差异大于初始值时越早使用条件把握度的方法,再估... 详细信息

目的探索期中分析时正态分布资料的样本量再估计。方法通过模拟试验比较揭盲状态下样本量再估计的条件把握度法及盲态下样本量再估计的EM算法,进而探索将两者相结合的应用策略。结果均数差异大于初始值时越早使用条件把握度的方法,再估计之效能越高。结论先用EM算法进行样本量再估计,如果再估计样本量大于初始样本量1.5倍,采用揭盲状态下的条件把握度法进行样本量再估计,可以尽量保持盲态和试验完整性并获得较高的把握度,同时也能减少一部分假阴性的发生以及临床资源的浪费。

关键词：临床试验期中分析条件把握度 EM算法样本含量

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存在混杂时高维数据的随机森林分析

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南京医科大学学报（自然科学版） 2018年第7期38卷 978-982页

作者：尤东方魏永越张汝阳陈峰赵杨南京医科大学公共卫生学院生物统计学系生物医学大数据重点实验室江苏南京211166

目的:探讨存在混杂因素时高维数据中随机森林(random forest,RF)的分析方法。方法:通过模拟实验和实例数据分析对单纯随机森林分析、增加节点候选变量为最大值以及基于广义线性模型的残差校正混杂因素的结果进行比较,以重要变量的重要... 详细信息

目的:探讨存在混杂因素时高维数据中随机森林(random forest,RF)的分析方法。方法:通过模拟实验和实例数据分析对单纯随机森林分析、增加节点候选变量为最大值以及基于广义线性模型的残差校正混杂因素的结果进行比较,以重要变量的重要性评分排序情况进行评价。结果:模拟实验表明,增加节点候选变量的方法对混杂因素的校正效果不明显,而基于广义线性模型残差的方法能有效校正混杂效应;实际数据分析结果显示单纯随机森林分析rs3754686和rs2322660分别排在第一和第二位。增加节点候选变量后rs3754686排序变化较小,而基于残差的方法校正人群分层后这两个单核苷酸多态位点(SNPs)的排序大幅度降低,从而打破乳糖酶(LCT)基因与身高之间的虚假关联。结论:随机森林分析需要考虑混杂因素问题,基于广义线性模型的残差能有效校正混杂因素,适用于高维数据的变量筛选。

关键词：随机森林混杂因素残差人群分层

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眼科影像标记系统在见习教学中的应用效果研究

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医学教育研究与实践 2019年第2期27卷 349-352页

作者：谢瞻杜牧龙黄军龙刘庆淮范雯南京医科大学第一附属医院眼科/第一临床医学院眼科学教研室江苏南京210009 南京医科大学公共卫生学院生物统计学系/生物医学大数据重点实验室江苏南京211166

目的探讨眼科光学相干断层扫描(OCT)影像标记系统在临床见习教学中的应用效果。方法采用实验对照研究方法,随机选取南京医科大学2013和2014级临床医学专业252名学生为研究对象,按国籍分为中国学生组(180人)及留学生组(72人),中国学生组... 详细信息

目的探讨眼科光学相干断层扫描(OCT)影像标记系统在临床见习教学中的应用效果。方法采用实验对照研究方法,随机选取南京医科大学2013和2014级临床医学专业252名学生为研究对象,按国籍分为中国学生组(180人)及留学生组(72人),中国学生组和留学生组组内随机分为实验组和对照组。实验组采用眼科OCT影像标记系统进行临床见习教学,对照组采用传统PPT讲授教学方法。课程结束后进行期末测试和教学效果反馈问卷调查,比较学生的成绩及对教学效果的主观评价。结果实验组期末成绩优于对照组,对教学效果主观评价亦优于对照组(均P<0.05)。结论在临床见习教学中使用眼科OCT影像标记系统,可取得较为显著的教学效果。

关键词：眼科影像标记系统眼科学光学相干断层扫描见习教学医学教学

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