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山西省2009-2020年手足口病流行特征及时空聚集性分析

中华流行病学杂志 2022年第11期43卷 1753-1760页

作者：任浩刘元王旭春李美晨全帝臣饶华祥罗天娥赵晋芳李国华仇丽霞山西医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室太原030001 山西省疾病预防控制中心太原030012 长治医学院公共卫生与预防医学系长治046000

目的:分析山西省手足口病流行特征及时空聚集性特征。方法:资料来源于中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统2009-2020年山西省手足口病数据,运用描述流行病学方法、Joinpoint 回归、空间自相关分析和时空扫描对山西省手足口... 详细信息

目的:分析山西省手足口病流行特征及时空聚集性特征。方法:资料来源于中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统2009-2020年山西省手足口病数据,运用描述流行病学方法、Joinpoint 回归、空间自相关分析和时空扫描对山西省手足口病进行分析。结果:山西省2009-2020年共报告手足口病病例293 477例,年均报告发病率为67.64/10万(293 477/433 867 454),重症率为5.36/10万(2 326/433 867 454),重症比例为0.79%(2 326/293 477),死亡率为0.015/10万(66/433 867 454),病死率为22.49/10万(66/293 477)。手足口病报告发病率、重症率、死亡率和病死率均呈下降趋势。主要的高发人群为0~5岁散居儿童和托幼儿童。手足口病发病存在明显的季节性变化,每年有两个发病高峰,主高峰为6-7月,次高峰为9-11月,高发期为4-11月。实验室共确诊病例13 942例,确诊率为4.75%(13 942/293 477),其中肠道病毒A71型(EV-A71)阳性4 438例(35.11%,4 438/293 477),柯萨奇病毒A16型(CV-A16)阳性4 609例(33.06%,4 609/293 477),其他肠道病毒阳性4 895例(31.83%,4 895/293 477)。山西省手足口病存在空间正自相关(Moran's I值介于0.12~0.58,均 P<0.05)即存在空间聚集性,高值聚集区主要分布在山西省中部太原市、南部临汾市、运城市和晋东南地区长治市。时空扫描探测到1个一类聚集区和8个二类聚集区,其中一类聚集区( RR=2.65, LLR=22 387.42, P<0.001)位于山西省太原市和晋中市,包括12个县(区),聚集时间为2009年4月1日至2018年11月30日。结论:山西省2009-2020年手足口病存在明显的时空聚集性,疫情总体呈下降趋势,重点区域为地级市的市中心所在区及与其相邻县(区),应加强对手足口病其他肠道病毒监测及型别区分。

关键词：手足口病流行病学特征时空分布

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基于joinpoint回归分析浸润性乳腺癌治疗质量变化趋势

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中国医院统计 2022年第5期29卷 325-330页

作者：郭瑞泽王超栗景坤魏丽侯爽刘美娜哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室黑龙江哈尔滨150081

目的利用joinpoint回归分析浸润性乳腺癌治疗质量变化趋势,为规范医疗实践行为、制定乳腺癌治疗质量改善措施提供参考依据。方法收集浸润性乳腺癌患者数据,基于浸润性乳腺癌治疗质量评价指标计算指标使用率,分母权重法计算综合得分;利用... 详细信息

目的利用joinpoint回归分析浸润性乳腺癌治疗质量变化趋势,为规范医疗实践行为、制定乳腺癌治疗质量改善措施提供参考依据。方法收集浸润性乳腺癌患者数据,基于浸润性乳腺癌治疗质量评价指标计算指标使用率,分母权重法计算综合得分;利用joinpoint回归分析医院水平浸润性乳腺癌治疗质量变化趋势。结果收集2011—2013年6家医院、2349名浸润性乳腺癌患者信息;诊断检查与腋窝淋巴结清扫相关指标使用率前3位为术前钼靶或超声检查全身(99.16%)、术后未出现并发症(98.38%)、病理报告记录肿瘤直径(98.28%),而全切术后给予放疗的使用率最低(33.33%);综合得分最高的医院为E医院(0.94),最低为F医院(0.77)。趋势分析结果显示浸润性乳腺癌治疗质量总趋势缓慢上升(MPC=0.12,P=0.003),不同医院的变化趋势略有不同,其中C医院治疗质量逐月升高(MPC=0.10,P=0.031)、D医院于2012年11月前逐月升高(MPC=0.91,P=0.001)、E医院于2011年10月前逐月下降(MPC=-2.05,P=0.004)。结论与传统回归方法相比,joinpoint回归可以更详细地评价不同时间段内浸润性乳腺癌治疗质量的趋势特征,发现治疗质量下降的关键节点,结合单指标使用率及医院综合得分,深入剖析治疗质量呈现不良趋势的原因,为规范医疗实践行为,改善治疗质量提供依据。

关键词：乳腺癌治疗质量综合得分 joinpoint回归趋势

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基于竞争风险模型的浸润性乳腺癌全乳切除预后影响因素分析

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中国医院统计 2022年第6期29卷 410-418页

作者：李倩妮徐灵燕李健刘美娜哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室黑龙江哈尔滨150081

目的利用竞争风险模型分析浸润性乳腺癌(IBC)全乳切除患者的预后影响因素,绘制列线图进行患者生存率的个体化预测。方法提取SEER数据库中诊断为IBC并行全乳切除手术患者的临床资料,基于竞争风险模型的单因素及多因素分析预后影响因素,... 详细信息

目的利用竞争风险模型分析浸润性乳腺癌(IBC)全乳切除患者的预后影响因素,绘制列线图进行患者生存率的个体化预测。方法提取SEER数据库中诊断为IBC并行全乳切除手术患者的临床资料,基于竞争风险模型的单因素及多因素分析预后影响因素,绘制列线图预测患者术后3年及5年的生存率,采用C-index、ROC曲线及校准曲线验证预测能力。结果纳入全乳切除手术的IBC患者129808例;多因素分析结果显示,年龄、种族、婚姻状况、组织学分级、T分期、N分期、M分期、ER状态、PR状态、分子亚型、放疗及化疗为患者独立的预后影响因素;利用预后影响因素绘制列线图,3年、5年的C-index分别为0.853、0.823,ROC曲线AUC值分别为0.821、0.818,校准曲线显示预测与实际情况拟合良好。结论竞争风险模型能够有效识别IBC全乳切除患者的预后影响因素,以此为依据绘制的列线图具有良好的预测性能,可为临床医生评估患者预后及制定个体化治疗方案提供依据。

关键词：浸润性乳腺癌 SEER数据库竞争风险模型列线图

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基于单细胞RNA测序技术的肝癌手术前后外周血B细胞基因表达谱研究

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中国癌症防治杂志 2024年第4期16卷 433-442页

作者：梁思盛勇红刘顺刘美良杨钰雷蕾巫丽丽曾小云广西医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室南宁530021 广西医科大学公共卫生学院儿少卫生与妇幼保健医学教研室南宁530021 广西医科大学护理学院临床内科护理学教研室南宁530021 广西医科大学附属肿瘤医院内分泌代谢肾病内科南宁530021

目的探索肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者手术前后外周血B细胞基因表达谱的变化。方法收集2022年9月在广西医科大学附属肿瘤医院行肝切除术治疗的3例HCC患者手术前及手术后的外周血样本,提取外周血单个核细胞(peripheral bl... 详细信息

目的探索肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者手术前后外周血B细胞基因表达谱的变化。方法收集2022年9月在广西医科大学附属肿瘤医院行肝切除术治疗的3例HCC患者手术前及手术后的外周血样本,提取外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)并进行单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)。根据测序数据进行B细胞数量分析、上下调基因差异分析、KEGG分析、GSEA-KEGG及GSEA-GO分析和细胞通讯分析,比较手术前后B细胞的动态改变。结果PBMC经scRNA-seq分析识别出了标记基因为MS4A1、CD79A的细胞簇,即B细胞群。B细胞群重新聚类分析后可分为记忆B(memory B)细胞、初始B(naive B)细胞和浆母细胞(plasmablasts)共3个细胞亚群。与术前组相比,术后组naive B和plasmablasts细胞占比升高,memory B细胞占比降低。手术前后B细胞中共筛选出285个显著差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),其中S100A8、S100A9、IL1R2、MALAT1等152个基因在手术后显著上调(P<0.05),RPS27A、RPS3A、RPS12、RPS3等133个基因在手术后显著下调(P<0.05)。KEGG分析发现手术后B细胞中显著下调的DEGs主要富集到核糖体、抗原处理和提呈通路。GSEA-KEGG分析发现手术后B细胞中表达上调的基因集显著富集于癌症中的转录失调、P53信号通路,表达下调的基因集显著富集于核糖体、抗原处理和提呈通路;GSEA-GO分析发现手术后B细胞中表达上调的基因集显著富集于环氧化酶P450途径、信号模式识别受体活性,表达下调的基因集显著富集于免疫球蛋白复合物、T细胞受体复合物。手术后B细胞与T细胞之间的通讯增强,且手术后配体-受体对CD22-PTPRC在B细胞与B细胞、B细胞与Mono细胞之间的通讯概率上调(P<0.01)。无论是手术前还是手术后,CD22信号通路对B细胞与T细胞之间的通讯均具有较强调控能力。结论HCC患者外周血B细胞基因表达谱在手术前后发生动态变化且与外周血B细胞免疫功能相关,可为研究外周血B细胞的抗肿瘤免疫作用提供新的参考依据。

关键词：单细胞RNA测序 B细胞肝癌基因表达谱

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MIPE在临床试验转组研究中的应用

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中国卫生统计 2021年第2期38卷 193-197,203页

作者：宋佳丽孙凤宇卢宇红王策王萌李康侯艳哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081 国家药品监督管理局药品审评中心

目的本文介绍一种新的处理临床试验转组数据的统计学方法——校正迭代参数法(MIPE),并通过模拟试验在不同情形下比较MIPE、IPE、意向性分析(ITT)三种方法对治疗效果估计的准确性。方法通过模拟数据探讨不同的治疗效应真值、潜在预后、... 详细信息

目的本文介绍一种新的处理临床试验转组数据的统计学方法——校正迭代参数法(MIPE),并通过模拟试验在不同情形下比较MIPE、IPE、意向性分析(ITT)三种方法对治疗效果估计的准确性。方法通过模拟数据探讨不同的治疗效应真值、潜在预后、转组率等24个假设场景中试验药疗效估计值的差异,并将MIPE、IPE、ITT方法应用于每个场景下进行效果比较。结果当试验药与安慰剂组疗效存在差异时,ITT和IPE方法得出的治疗效应估计均有偏,这种有偏估计与不同的治疗效应真值、潜在预后和转组率等因素相关,而MIPE方法不受上述因素影响,估计结果较为准确且稳定。结论 MIPE方法不受实际治疗效应、潜在预后、转组率等因素的影响,在各场景中治疗效应估计值的均值较为稳定,与其他方法相比,更接近真实值,在临床试验评价中使用更为可靠。

关键词：临床试验转组加速失效时间模型等级结构保留失效时间算法迭代参数估计算法

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基于MIMIC-Ⅲ数据库的急性心肌梗死危重患者中短期预后列线图模型的构建

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哈尔滨医科大学学报 2023年第2期57卷 141-148,159页

作者：贾广生李岩刘怡歌胡洲张秋菊户宏艳哈尔滨医科大学附属第二医院CT诊断科哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室哈尔滨医科大学附属第二医院科研科黑龙江哈尔滨150081

目的构建并验证急性心肌梗死危重患者中短期预后的列线图模型,为临床制定个性化治疗建议和随访策略提供参考。方法从重症监护医学信息数据库(Medical Information Mart for Intensive CareⅢ,MIMIC-Ⅲ)v1.4中提取急性心肌梗死(acute myo... 详细信息

目的构建并验证急性心肌梗死危重患者中短期预后的列线图模型,为临床制定个性化治疗建议和随访策略提供参考。方法从重症监护医学信息数据库(Medical Information Mart for Intensive CareⅢ,MIMIC-Ⅲ)v1.4中提取急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)患者的临床资料。用Cox比例风险模型确定独立预后因素。在多因素分析的基础上,构建AMI危重患者中短期生存概率的预测模型。根据一致性指数和标准曲线,评价多因素分析的识别能力和准确性。结果将2463例AMI患者纳入分析,并随机分为一个训练集(n=1641)和一个验证集(n=822)。受试者操作特征曲线(receiver operator characteristic curve,ROC曲线)的曲线下面积(area under the curve,AUC)显示,列线图在预测AMI患者的3月、6月、12月生存率方面表现良好,校准曲线和标准曲线表现出高度的一致性,表明预测结果与实际情况高度一致,并且预测结果相当可靠(P<0.001)。结论本研究构建的列线图模型可以准确预测AMI危重患者的中短期生存概率,为临床决策提供可靠的参考。

关键词：急性心肌梗死 MIMIC-Ⅲ数据库死亡风险预测预后模型列线图

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不同年龄段人群外周动脉硬化与幽门螺杆菌感染的关系分析

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中外医药研究 2023年第29期2卷 63-65页

作者：徐剑春曹煜贺励梁娟郭晓涛万昱含皮娟贵州医科大学流行病学与卫生统计学教研室贵州贵阳550000 贵阳市第六医院贵州贵阳550003

目的:分析幽门螺杆菌(Hp)感染与不同年龄段人群外周动脉硬化的关系。方法:选取2022年9—12月在贵阳市第六医院行^(14)C-尿素呼气试验及踝肱指数(ABI)、臂踝脉搏波传导速度(baPWV)检测的150例体检者作为对象,根据年龄分成青年组(<45岁... 详细信息

目的:分析幽门螺杆菌(Hp)感染与不同年龄段人群外周动脉硬化的关系。方法:选取2022年9—12月在贵阳市第六医院行^(14)C-尿素呼气试验及踝肱指数(ABI)、臂踝脉搏波传导速度(baPWV)检测的150例体检者作为对象,根据年龄分成青年组(<45岁,n=45)、中年组(45~59岁,n=53)与老年组(≥60岁,n=52)。测定其ABI、baPWV,评估外周动脉僵硬度,开展^(14)C-尿素呼气试验,检查Hp感染情况。结果:青年组和老年组,Hp阴性者ABI分层低于Hp阳性者,差异有统计学意义(P<0.05)。中年组,Hp阴性者ABI分层、baPWV分层低于Hp阳性者,差异有统计学意义(P<0.05)。三组ABI与Hp感染呈负相关,baPWV与Hp感染呈正相关(P<0.05)。结论:不同年龄段人群外周动脉硬化与Hp感染均存在相关性,且ABI与Hp感染呈负相关,baPWV与Hp感染呈正相关,临床应予以关注。

关键词：外周动脉硬化幽门螺杆菌年龄

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新冠肺炎感染者不同生物样本核酸和抗体检测结果分析

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中国公共卫生 2022年第8期38卷 1007-1010页

作者：徐霖陈榕洪韵林春文张泽武丁元林钟庆杨张巧利于海兵广东医科大学流行病与卫生统计学教研室广东东莞523808 东莞市疾病预防控制中心东莞市第九人民医院东莞市卫生健康局

目的探讨新冠肺炎患者不同生物标本核酸和抗体的结果变化特征。方法于2020年1月23日—2020年10月9日,收集广东省东莞市101例新冠肺炎(COVID-19)确诊病例和35例无症状感染者各种生物样品,进行RT-PCR核酸检测和IgM、IgG抗体检测,并分析... 详细信息

目的探讨新冠肺炎患者不同生物标本核酸和抗体的结果变化特征。方法于2020年1月23日—2020年10月9日,收集广东省东莞市101例新冠肺炎(COVID-19)确诊病例和35例无症状感染者各种生物样品,进行RT-PCR核酸检测和IgM、IgG抗体检测,并分析其结果。结果新冠病毒(SARS-CoV-2)核酸阳性持续中位时间为7.00 d(0.00~27.00 d)。在COVID-19确诊患者发病0~7 d内,咽拭子核酸检测样本阳性率为48.21%(121/251),肛拭子核酸检测阳性率为36.00%(9/25),鼻咽拭子核酸检测阳性率为31.82%(7/22)。尿液样本在整个病程阶段均未检出新冠病毒样本核酸阳性。无症状感染者的咽拭子、肛拭子及鼻咽拭子核酸检测均有检出阳性,痰、粪便样本核酸检测未检出阳性。结论随着新冠肺炎病程的不断推进,咽拭子、肛拭子及鼻咽拭子核酸阳性检出率随之降低,而血清中IgG抗体阳性检出率随之升高。

关键词：新冠肺炎 SARS-CoV-2 生物样本

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帕金森病患者心理弹性与生命质量的相关性分析

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中国实用护理杂志 2021年第36期37卷 2826-2830页

作者：张婷婷尹安春宋桂荣姜迎君曲晓彤梁战华大连医科大学附属第一医院神经内科二病房 116100 大连医科大学卫生统计学教研室 116044

目的调查帕金森病患者的心理弹性与生命质量的相关性,为关注该群体的心理健康提供依据。方法选取2019年4—7月于大连医科大学附属第一医院住院的190例帕金森病患者作为研究对象,采用一般资料调查表、心理弹性量表及39项帕金森病生命质... 详细信息

目的调查帕金森病患者的心理弹性与生命质量的相关性,为关注该群体的心理健康提供依据。方法选取2019年4—7月于大连医科大学附属第一医院住院的190例帕金森病患者作为研究对象,采用一般资料调查表、心理弹性量表及39项帕金森病生命质量调查问卷对其进行问卷调查。结果帕金森病患者的心理弹性得分为48.0(29.8,62.2)分,生命质量得分为56.0(27.8,82.0)分,心理弹性得分与生命质量得分呈负相关(r值为-0.538,P<0.01)。多因素线性回归分析显示,随着心理弹性得分的增加,生命质量得分降低(b值为-0.002,P<0.001)。结论帕金森病患者的心理弹性与生命质量水平均为较低水平,心理弹性水平的提高有利于改善其生命质量。

关键词：帕金森病心理弹性生活质量相关性

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图卷积神经网络在组学数据分类预测中的应用

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中国卫生统计 2021年第4期38卷 533-535页

作者：张刘超荣志炜赵薇薇李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081 默沙东研发(中国)有限公司生物统计和研究决策科学部

目的探讨图卷积神经网络(graph convolutional neural network,GCNN)利用PPI网络对组学数据的分类预测效能。方法通过模拟实验和实例研究,对GCNN、随机森林、支持向量机和多层感知机共四种方法的分类效果进行比较。结果模拟实验结果显示... 详细信息

目的探讨图卷积神经网络(graph convolutional neural network,GCNN)利用PPI网络对组学数据的分类预测效能。方法通过模拟实验和实例研究,对GCNN、随机森林、支持向量机和多层感知机共四种方法的分类效果进行比较。结果模拟实验结果显示,即便在样本量和网络中节点数量较少时,GCNN的分类效能也明显优于其他三种方法,并且随着节点数量的增加而不断提高。实例研究表明,利用STRING网络,GCNN的分类效能最优。结论GCNN在组学数据的研究中极具潜力,值得进一步研究。

关键词：图卷积神经网络深度学习高维组学分类预测

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