检索结果-内蒙古大学图书馆

南京医科大学学报（自然科学版） 2010年第7期30卷 951-956页

作者：徐酩吕京澴孙玉洁南京医科大学江苏省人类功能基因组学重点实验室江苏南京210029 南京医科大学细胞生物学与医学遗传学系江苏南京210029

目的:寻找简单、可靠、经济并适合大批量检测肿瘤组织标本和肿瘤细胞系中Alu甲基化水平的实验方法。方法:用对甲基化敏感的限制性内切酶联合定量PCR(methylation-sensitive restriction endonuclease digestion and quantitative PCR,MS... 详细信息

目的:寻找简单、可靠、经济并适合大批量检测肿瘤组织标本和肿瘤细胞系中Alu甲基化水平的实验方法。方法:用对甲基化敏感的限制性内切酶联合定量PCR(methylation-sensitive restriction endonuclease digestion and quantitative PCR,MSRE-qPCR)法检测乳腺癌细胞系MCF-7中Alu序列的甲基化水平,并与常用的亚硫酸氢盐修饰结合测序法(bisulfite-sequencing PCR,BSP)进行比较。结果:MSRE-qPCR显示Alu甲基化水平在BstUⅠ酶切位点约为33.7%,在HpaⅡ酶切位点约为56.1%,与BSP法比较,两种方法都显示BstUⅠ位点甲基化水平较低,而HpaⅡ位点甲基化水平较高,趋势一致,并提示MCF-7细胞的Alu甲基化水平明显低于正常细胞(84.6%或者更高)。结论:MSRE-qPCR法简单、可靠、经济,适合用于大批量检测Alu甲基化水平。

关键词： MCF-7 Alu甲基化 MSRE-qPCR

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表观基因组学研究方法进展与评价

引用

遗传 2009年第1期31卷 3-12页

作者：谭建新孙玉洁南京医科大学江苏省人类功能基因组学重点实验室南京医科大学基础医学院细胞生物学与医学遗传学系南京210029

表观遗传学是指基于非基因序列改变所致基因表达水平的变化,如DNA甲基化和组蛋白修饰等;表观基因组学则是在基因组水平上对表观遗传学改变的研究。DNA甲基化已经成为表观遗传学和表观基因组学的重要研究内容,人类表观基因组计划的最终... 详细信息

表观遗传学是指基于非基因序列改变所致基因表达水平的变化,如DNA甲基化和组蛋白修饰等;表观基因组学则是在基因组水平上对表观遗传学改变的研究。DNA甲基化已经成为表观遗传学和表观基因组学的重要研究内容,人类表观基因组计划的最终目标是绘制出人类基因组中甲基化可变位点图谱。随着研究的不断深入,各种研究方法被开发出来以满足不同类型研究的需要。文章主要介绍目前已有的表观基因组学研究方法,并对其进行简要分析和总结。

关键词：表观遗传学表观基因组学 DNA甲基化研究方法

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Alu序列甲基化水平与两种乳腺癌细胞系转移能力高度相关

引用

医学分子生物学杂志 2009年第4期6卷 317-321页

作者：吕京澴徐酩谭建新王宗丹韩晓孙玉洁南京医科大学江苏省人类功能基因组学重点实验室南京市210029 南京医科大学细胞生物与医学遗传学系南京市210029

目的探讨Alu序列甲基化与乳腺癌转移潜能的关系。方法用亚硫酸氢盐修饰联合限制性内切酶分析法（combined bisulfite restriction analysis，COBRA）、亚硫酸氢盐修饰结合直接测序法（bisulfite sequencing，BSP）检测两株转移能力不同... 详细信息

目的探讨Alu序列甲基化与乳腺癌转移潜能的关系。方法用亚硫酸氢盐修饰联合限制性内切酶分析法（combined bisulfite restriction analysis，COBRA）、亚硫酸氢盐修饰结合直接测序法（bisulfite sequencing，BSP）检测两株转移能力不同的乳腺癌细胞系MCF7和MDA—MB-435S中Alu甲基化状态，每个样品挑取10个克隆测序。结果MCF7和MDA—MB-435S中Alu甲基化水平均明显低于报道的正常人体细胞Alu甲基化水平，但MCF7中Alu的甲基化水平明显高于MDA-MB-435S。同时，Alu甲基化位点在基因组中分布不均匀。结论乳腺癌的转移潜能可能与Alu序列的去甲基化以及去甲基化位点的分布相关，值得进一步探讨。

关键词： Alu序列甲基化乳腺癌肿瘤转移

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表观基因组学研究方法进展与评价

表观基因组学研究方法进展与评价

引用

江苏省遗传学会第七届二次代表大会暨学术研讨会

作者：谭建新孙玉洁南京医科大学江苏省人类功能基因组学重点实验室南京医科大学基础医学院细胞生物学与医学遗传学系

表观遗传学是指基于非基因序列改变所致基因表达水平的变化,如DNA甲基化和组蛋白修饰等;表观基因组学则是在基因组水平上对表观遗传学改变的研究。DNA甲基化已经