检索结果-内蒙古大学图书馆

中华肿瘤防治杂志 2023年第6期30卷 360-367页

作者：左丙丽余以珊孙雅文山东省肿瘤防治研究院山东省肿瘤医院人力资源部山东第一医科大学(山东省医学科学院)山东济南250117 山东省肿瘤防治研究院放疗科山东第一医科大学(山东省医学科学院)山东济南250117 山东省肿瘤防治研究院临床流行病与生物统计教研室山东第一医科大学(山东省医学科学院)山东济南250117

目的建立与局限期小细胞肺癌(SCLC)患者无进展生存(PFS)和总生存(OS)预测模型。方法招募山东省肿瘤医院2012-01-01-2017-12-31接受根治性化疗放疗的局限期SCLC患者516例,收集基线肿瘤生物标志物,包括细胞角蛋白亚基19片段(Cyfra21-1)、... 详细信息

目的建立与局限期小细胞肺癌(SCLC)患者无进展生存(PFS)和总生存(OS)预测模型。方法招募山东省肿瘤医院2012-01-01-2017-12-31接受根治性化疗放疗的局限期SCLC患者516例,收集基线肿瘤生物标志物,包括细胞角蛋白亚基19片段(Cyfra21-1)、神经元特异性烯醇化酶(NSE)和癌胚抗原(CEA)资料。研究终点为PFS和OS。所有患者的中位随访时间为36个月。患者信息按随机数生成法分为训练数据集(n=258)和验证数据集(n=258)。在训练数据集中建立传统预测模型及联合生物标志物的预测模型,采用一致性指数(C-index)评价模型的一致性。结果训练数据分析发现,基线CEA与PFS(随着每1μg/L的增加,HR=1.03,95%CI:1.02~1.04,P<0.001)和OS(随着每1μg/L的增加,HR=1.02,95%CI:1.01~1.03,P=0.004)均有统计学意义的关联,而NSE和Cyfra21-1与PFS及OS无统计学意义的关联。与常规模型(PFS预测C-index=0.659或OS预测C-index=0.652)相比,加入CEA后的新的联合预测模型的准确性有一定的提高(PFS预测C-index=0.677,OS预测C-index=0.663)。在验证集进一步验证,加入CEA后,C-index也有所提高。所建立的预测模型均显示出合理的区分度和校准度。结论基线CEA可预测局限期SCLC患者的PFS和OS,但与仅考虑临床因素的常规模型相比,结合CEA的新模型对PFS和OS显示对C-index有一定的提升作用。

关键词：局限期小细胞肺癌无进展生存总生存预测模型癌胚抗原

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测序数据罕见遗传变异关联性分析方法评价

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中国卫生统计 2020年第5期37卷 649-653页

作者：夏德润沃红梅顾珩汪凯张曼婷唐少文赵杨易洪刚南京医科大学公共卫生学院生物统计学系 210029 南京医科大学医政学院社会保障教研室 210029 南京医科大学公共卫生学院流行病学系 210029

目的评价常见罕见变异统计分析方法的统计学性质,包括一类错误和检验效能,从而为分析罕见遗传变异资料的统计方法选择提供理论依据。方法通过计算机模拟试验的方法,对SKAT(sequence kernel association test)和FPCA(functional principa... 详细信息

目的评价常见罕见变异统计分析方法的统计学性质,包括一类错误和检验效能,从而为分析罕见遗传变异资料的统计方法选择提供理论依据。方法通过计算机模拟试验的方法,对SKAT(sequence kernel association test)和FPCA(functional principal component analysis)等方法从一类错误和检验效能等方面进行统计学性质评价。结果SKAT方法在各种检验水准下,第一类错误率均控制在检验水准附近,且其检验效能均高于其它方法,其中SKATO(optimal unified association test)的检验效能最高。结论在罕见遗传变异统计方法中,SKATO是一种效能较高的罕见变异资料的关联分析方法。

关键词：罕见变异关联性序列核函数关联性检验泛函主成分分析

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气温对山东省四城市卒中死亡影响归因风险评估

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中国预防医学杂志 2024年第12期25卷 1543-1549页

作者：何芬芬赵珂董意麟刘超刘成榕张珮瑶刘浩宇郭晓雷薛付忠贾贤杰蚌埠医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室安徽蚌埠233030 山东省疾病预防控制中心山东大学齐鲁医学院公共卫生学院生物统计学系国家健康医疗大数据研究院

目的探讨山东省中部地区不同温度暴露对卒中及亚型死亡的相对和归因贡献。方法收集山东省中部地区四区(县)2013—2019年逐日卒中死亡、气象和空气污染资料。应用基于quasi-Poisson回归的分布滞后非线性模型定量分析各区县温度对卒中死... 详细信息

目的探讨山东省中部地区不同温度暴露对卒中及亚型死亡的相对和归因贡献。方法收集山东省中部地区四区(县)2013—2019年逐日卒中死亡、气象和空气污染资料。应用基于quasi-Poisson回归的分布滞后非线性模型定量分析各区县温度对卒中死亡影响的滞后与累积相对风险(relative risks,RRs)。采用随机效应模型结合极大似然估计合并效应值并进行最佳线性无偏预测;定量估算不同温度区间造成的人群归因分数(attributable fraction,AF),并按性别和年龄分层,以确定敏感人群。结果2013—2019年山东省中部地区4区县因卒中死亡30721例,其中缺血性卒中(ischemic stroke,IS)19594例(63.78%),出血性卒中(hemorrhagic stroke,HS)11127例(26.22%)。日均气温与卒中及亚型死亡均呈非线性关系,并存在一定滞后性;以最低死亡风险温度为参照,极冷与极热对HS死亡无显著影响;而极热对卒中和IS死亡的累积效应在Lag 0~7 d达最高值,RR分别为1.54(95%CI:1.24~1.91)和1.87(95%CI:1.46~2.40),尚未发现极冷对两者的影响;在Lag 0~14 d卒中和IS死亡归因于非适宜温度暴露的AF分别为19.78%(95%CI:6.44%~20.20%)和24.56%(95%CI:7.47%~34.95%);中冷造成大部分卒中死亡负担(AF=15.42%,95%eCI:3.19%~23.44%)。分层结果显示,男性和<65岁人群对极冷更敏感,在Lag 0~21 d时RR分别为2.09(95%CI:1.02~4.30)和2.71(95%CI:1.06~6.90),女性和≥65岁人群对极热更敏感,在Lag 0~7 d时RR分别为2.28(95%CI:1.55~3.63)和1.64(95%CI:1.27~2.11);与极冷相比,中冷对男性影响更大,在Lag 0~14 d时AF为24.98%(95%CI:14.62%~31.92%)。结论低温和高温均可增加卒中死亡负担,但两者滞后模式不同;与其他温度范围相比,中等低温效应的可归因比例最高,男性更易受到低温影响,而高温对老年人影响更大,应予以适时重点预防。

关键词：温度缺血性卒中出血性卒中死亡率人群归因分数

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新疆出血热病毒基因组抗原表位及其实验室检测价值的评价

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中华检验医学杂志 2023年第2期46卷 127-136页

作者：张花花赵国玉李阳史深安冉袁江玲刘东亮窦景锐雒涛孙素荣张渝疆新疆医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室乌鲁木齐830054 新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心消毒与感染控制中心乌鲁木齐830002 乌鲁木齐市妇幼保健院乌鲁木齐830001 新疆大学生命科学与技术学院新疆生物资源与基因工程重点实验室乌鲁木齐830046

目的掌握克里米亚-刚果出血热病毒(CCHFV)核蛋白(NP)和糖蛋白(GP)片段的精细抗原表位谱分布,明确优势抗原表位在克里米亚-刚果出血热(CCHF)实验室检测中的价值。方法2014—2021年在新疆大学生命科学院实验室将CCHFV YL04057株采用改良... 详细信息

目的掌握克里米亚-刚果出血热病毒(CCHFV)核蛋白(NP)和糖蛋白(GP)片段的精细抗原表位谱分布,明确优势抗原表位在克里米亚-刚果出血热(CCHF)实验室检测中的价值。方法2014—2021年在新疆大学生命科学院实验室将CCHFV YL04057株采用改良生物肽合成方法分段表达出由8个氨基酸组成的最小合成短肽,以CCHFV多克隆抗体或单克隆抗体14B7(IgM)或CCHFV阳性羊血清为抗体,用免疫印迹方法鉴定出NP和GP片段上具有抗原活性的最小抗原表位(BCE),并采用邻接法将获得的具有序列多态性的BCE与不同地区的CCHFV进行空间聚类,确定BCE组合方式与地理区域分布的相关性,探讨其在建立血清学诊断中的应用价值。采用原核表达质粒(pET-32a、pGEX-KG)和带有不完整谷胱甘肽(GST188)标签的原核表达质粒(pXXGST-ST-1)构建和表达NP片段上6个不同肽段长度的优势抗原表位,建立间接酶联免疫吸附测定(ELISA)检测方法,以经免疫荧光法(IFA)鉴定的CCHF羊血清为对照,统计分析不同肽段长度的抗原表位重组蛋白与IFA检测结果的特异度、敏感度和总符合率。结果CCHFV NP和GP片段共有30个具有抗原活性的BCE,其中NP片段抗原表位集中的核心中间片段NP_(2)(aa 170~305)有6个BCE,两端的NP1(aa 1~200)和NP3(aa 286~482)有9个BCE;GP片段的Gc(aa 1~558)和Gn(aa 533~708)片段有14个BCE和1个包含15个氨基酸的长抗原肽(AP),NP片段BCE氨基酸序列的同源性为97.1%,GP片段对应的同源性为89.1%。在GP片段9个具有序列多态性的BCE中,由GnEc1、GnE2、GnE4、GcE3、GcE6和GcAP-4(Ap)6个组合BCE可将15株来自全球不同地区的CCHFV聚类成亚洲Ⅰ、亚洲Ⅱ、非洲Ⅰ、非洲Ⅱ和欧洲5个地理类群。构建表达的PET-32a-NP(全长)、PGEX-KG-NP_(2)(aa 170~305)、pGEX-KG-NP_(2-1)(aa 235~275)、PGEX-KG-NP_(2-1-1)(aa 237~256)、pXXGST-1-NP_(2-1-2)(aa 250~265)和PGEX-KG-NP_(2-1-3)(aa 260~276)6个重组蛋白CCHFV NP兔多克隆抗血清(pAb)免疫印迹反应阳性,以33份经IFA CCHF检测的羊血清为参照,以NP_(2)和NP_(2-1)2个片段构建的重组蛋白为抗原建立的间接ELISA检测方法检测敏感度、特异度和总符合率最好,敏感度分别为73.4%(11/15)和66.7%(10/15),特异度分别为100%(18/18)和94.4%(17/18),总符合率分别为87.9%(29/33)和81.8%(27/33)。结论CCHFV NP和GP上分布着数量较多的具有抗原免疫活性的BCE,其中,优势抗原表位在CCHF实验室血清学诊断中具有较高的应用价值。

关键词：出血热病毒,克里米亚-刚果表位酶联免疫吸附测定核蛋白糖蛋白

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基于概率校准的弥漫性大B细胞淋巴瘤患者死亡风险预测

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中国卫生统计 2021年第5期38卷 670-674页

作者：范双龙赵志强余红梅王蕾郑楚楚黄雪倩阳桢寰邢蒙吕庆罗艳虹山西医科大学公共卫生学院卫生统计教研室 030001 重大疾病风险评估山西省重点实验室山西省肿瘤医院血液科密歇根州立大学流行病与生物统计系

目的基于概率校准,预测弥漫性大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma, DLBCL)患者两年内的死亡风险,为医生决策和临床治疗提供参考。方法使用Cox回归筛选DLBCL患者两年内死亡的影响因素。选择logistic回归(logistic regression, ... 详细信息

目的基于概率校准,预测弥漫性大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma, DLBCL)患者两年内的死亡风险,为医生决策和临床治疗提供参考。方法使用Cox回归筛选DLBCL患者两年内死亡的影响因素。选择logistic回归(logistic regression, logit)、随机森林(random forest, RF)、支持向量机(support vector machines, SVM)、前馈神经网络(feedforward neural network, FNN)构建风险预测模型。同时,使用三种概率校准方法对上述模型进行校准:platt scaling(Platt)、isotonic regression(IsoReg)、shape-restricted polynomial regression(RPR)。使用ROC曲线下的面积(AUC)评价模型的区分性能,使用Hosmer-Lemeshow(H-L)goodness-of-fit test、expected calibration error(ECE)、maximum calibration error(MCE)评价模型的校准性能。结果 logit和FNN能够提供准确的概率估计,校准后其预测性能无提升;RF和SVM的预测概率与真实概率的差异具有统计学意义。除SVM-IsoReg外,三种概率校准方法都能对有偏预测进行良好的校准,且RPR校准效果最好。结论 logit和FNN具有良好的校准性能,而RF和SVM校准性能较差,概率校准能够有效降低它们的预测误差。基于概率校准所构建的风险预测模型达到预期效果。

关键词：弥漫性大B细胞淋巴瘤风险预测概率校准区分度校准度

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现实世界研究生态圈的构建与发展

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中国临床医学 2021年第5期28卷 723-731页

作者：邱婧君王斯悦李晨夏结来陈峰黄丽红王陵赵杨北京复星医药科技开发有限公司北京100005 北京大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系北京100191 空军军医大学军事预防医学系军队卫生统计学教研室西安710032 南京医科大学公共卫生学院生物统计学系南京211166 复旦大学附属中山医院生物统计室上海200032 CSCO生物统计学专家委员会RWE项目组

现实世界证据(real-world evidence,RWE)由现实世界数据(real-world data,RWD)产生,经现实世界研究(real-world study,RWS)转化而来。科学的RWE可为决策提供参考依据,其产生有赖于系统性地构建和发展良性生态圈。本文梳理了RWD、RWS在产... 详细信息

现实世界证据(real-world evidence,RWE)由现实世界数据(real-world data,RWD)产生,经现实世界研究(real-world study,RWS)转化而来。科学的RWE可为决策提供参考依据,其产生有赖于系统性地构建和发展良性生态圈。本文梳理了RWD、RWS在产生RWE中的角色及转化机制,试图探讨构建现实世界研究良性生态系统的必要性及构成要素,并简要展望生态圈的发展趋势、机遇及挑战。

关键词：现实世界证据现实世界研究现实世界数据生态圈生态系统

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基于SARIMA模型的南京地区蚊虫侵害的预测研究

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南京医科大学学报（自然科学版） 2022年第1期42卷 108-111页

作者：孙燕群张守刚陆墨原张艳潘衍宇王冲吴起新姚美雪李成国南京市疾病预防控制中心南京医科大学附属南京疾病预防控制中心江苏南京210003 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 东南大学公共卫生学院江苏南京210009 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206 徐州医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系江苏徐州221004

目的:基于南京地区蚊虫侵害密度,建立季节性差分自回归移动平均模型预测方法,为进一步防控蚊媒病和开展爱国卫生运动提供新的思路和方法。方法:应用季节性差分自回归移动平均模型对2019年蚊虫密度进行预测。结果:拟合后的预测模型为ARIM... 详细信息

目的:基于南京地区蚊虫侵害密度,建立季节性差分自回归移动平均模型预测方法,为进一步防控蚊媒病和开展爱国卫生运动提供新的思路和方法。方法:应用季节性差分自回归移动平均模型对2019年蚊虫密度进行预测。结果:拟合后的预测模型为ARIMA(2,1,0)(1,1,0)_(12),模型残差序列为白噪声,模型预测拟合后R^(2)=0.907。结论:模型预测的拟合效果较好,说明ARIMA模型适用于开展蚊虫侵害预测研究。

关键词：蚊虫侵害季节性差分自回归移动平均预测

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2011—2021年南宁市丙类传染病时空趋势分析

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职业与健康 2024年第3期40卷 370-374页

作者：刘昊晖农皓唐咸艳张洁广西医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室广西南宁530021 南宁市疾病预防控制中心应急办公室广西南宁530011 南宁市疾病预防控制中心微生物检验科广西南宁530011

目的对2011—2021年南宁市各医疗机构报告的丙类传染病进行时空趋势分析,了解南宁市丙类传染病流行特征,为科学制定防控政策提供依据。方法采用描述流行病学方法和地理信息系统(geographic information system,GIS)空间分析法,掌握2011... 详细信息

目的对2011—2021年南宁市各医疗机构报告的丙类传染病进行时空趋势分析,了解南宁市丙类传染病流行特征,为科学制定防控政策提供依据。方法采用描述流行病学方法和地理信息系统(geographic information system,GIS)空间分析法,掌握2011—2021年南宁市丙类传染病及几种主要传染病的流行特点。结果2011—2021年南宁市共报告丙类传染病10种714533例,占同期全市法定传染病报告数的73.29%,年均发病率873.57/10万;报告死亡66例,年均死亡率0.0807/10万;历年发病趋势呈“横向”波动(P<0.05),4—7月和9—10月是发病高峰,城市发病率高于乡镇,差异有统计学意义(P<0.05)。主要发病年龄是0~<5岁,占81.64%;职业以散居儿童为主,占62.31%,其次是幼托儿童,占24.45%。发病的主要病种依次为手足口病、其他感染性腹泻、流行性腮腺炎和流行性感冒,年均发病率分别为642.83/10万、123.74/10万、49.52/10万和44.67/10万。结论南宁市丙类传染病需要重点防控手足口病,其次是其他感染性腹泻病,0~3岁儿童是防控的重点对象,幼托机构、中小学校是防控的重点场所。

关键词：丙类传染病流行特征发病率

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基于PATRIC公共数据库不同标本来源的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌基因组特征比较

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中国感染控制杂志 2023年第1期22卷 14-22页

作者：张娜孟标金美玲陈佳丽杨晓静刘芳妮秦世宇刘雄王长军陈勇中国医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室辽宁沈阳110122 中国人民解放军疾病预防控制中心应急处置大队北京100071 安徽医科大学公共卫生学院流行病与统计学系安徽合肥230032 中国人民解放军疾病预防控制中心有害生物防制科北京100071 郑州大学公共卫生学院河南郑州450001 中国人民解放军疾病预防控制中心信息科北京100071 中国人民解放军疾病预防控制中心卫勤部北京100071

目的了解不同标本来源的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)在耐药基因、毒力基因和质粒携带数量等方面是否存在差异,为CRKP感染的预防控制提供参考。方法从Pathosystems Resource Integration Center(PATRIC)公共数据库中下载2011—2020... 详细信息

目的了解不同标本来源的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)在耐药基因、毒力基因和质粒携带数量等方面是否存在差异,为CRKP感染的预防控制提供参考。方法从Pathosystems Resource Integration Center(PATRIC)公共数据库中下载2011—2020年不同标本来源CRKP的全基因组测序数据,使用生物信息学分析软件进行耐药基因、毒力基因、质粒等鉴定分析,使用IBM SPSS 23.0和R v4.2.0软件进行比较。结果共纳入2356个CRKP全基因组数据,CRKP菌株携带耐药基因、质粒和毒力基因数量的中位数(四分位数间距)分别为18(16,20)、4(3,5)、60(57,68),不同标本来源的CRKP携带毒力基因、质粒以及关键毒力基因(iut A、iuc A、iuc B、iuc C、iuc D、rmp A、rmp A2、iro B、iro C、iro D、iro N)的数量差异均有统计学意义(均P<0.05)。粪便来源的CRKP菌株携带耐药基因、质粒和毒力基因的数量较多,其中位数(四分位数间距)分别为19(16,21)、5(3,6)、63(61,69);导管附着体液来源的CRKP携带iut A和iuc(iuc A、iuc B、iuc C、iuc D)的比率较高(19.0%,4/21);rmp A和rmp A2在肺泡灌洗液来源的CRKP中携带率最高,分别占7.9%(3/38)、15.8%(6/38);无菌体液来源的CRKP携带iro(iro B、iro C、iro D、iro N)基因的比率(6.5%,4/62)高于其他标本类型CRKP(比率范围:0~4.9%)。血标本来源的CRKP比其他标本来源CRKP携带更多的毒力基因(P=0.004)。结论血标本来源的CRKP菌株携带的毒力基因比其他标本类型来源的CRKP更多,可能与其临床高死亡率有关,建议高度关注血标本中CRKP菌株向高毒力菌株进化,通过加强医院感染控制措施,降低CRKP血流感染的发病率。

关键词：耐碳青霉烯类药肺炎克雷伯菌标本类型基因组毒力基因 PATRIC

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基于SEIAQR动力学模型预测湖北省武汉市新型冠状病毒肺炎疫情趋势

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中国卫生统计 2020年第3期37卷 327-330,334页

作者：丁中兴宋文煜方欣玉王凯鲍倡俊陈峰沈洪兵武鸣彭志行南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系 211166 新疆医科大学医学工程技术学院数学教研室江苏省疾病预防控制中心

目的基于新型冠状病毒传播特点,使用实际数据拟合并预测武汉市疫情发展趋势。方法考虑新型冠状病毒肺炎传播规律及采取的隔离措施,构建SEIAQR动力学模型;研究使用2020年1月10日至1月31日武汉市累积发病人数及死亡人数数据对模型进行拟合... 详细信息

目的基于新型冠状病毒传播特点,使用实际数据拟合并预测武汉市疫情发展趋势。方法考虑新型冠状病毒肺炎传播规律及采取的隔离措施,构建SEIAQR动力学模型;研究使用2020年1月10日至1月31日武汉市累积发病人数及死亡人数数据对模型进行拟合,并使用2月1日至2月10日的实时数据对模型结果进行验证;最后,研究通过模型拟合结果评价现有抗疫防控措施的效果。结果武汉市发病人数在2月4日左右达到峰值,随后持续下降,2月14日至2月16日出现一个短暂的反弹期,直至5月疫情将基本结束流行。防控措施不变的情况下,疫情结束时预计50780人感染,2449人死亡,粗死亡率约为4.82%;及时有效的防控措施降低了75.08%的感染率和72.40%的因病死亡率;模型拟合偏差约为4.08%。结论 SEIAQR模型拟合效果良好,可以较为准确地预测疾病流行趋势。

关键词：新型冠状病毒肺炎传染病动力学模型疫情预测

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